吳 翔,甘炳成*,唐 亞,譚 昊,黃忠乾,謝麗源,彭衛(wèi)紅,唐 杰,周 潔,陳 影
1. 四川省農(nóng)業(yè)科學院土壤肥料研究所 農(nóng)業(yè)部西南區(qū)域農(nóng)業(yè)微生物資源利用科學觀測實驗站/農(nóng)業(yè)部西南山地農(nóng)業(yè)環(huán)境重點實驗室,成都市外東獅子山路4 號 610066
2. 四川大學建筑與環(huán)境學院,成都市一環(huán)路南一段24 號 610065
植物根際促生菌(Plant growth-promoting rhizobacteria,PGPR)是指定殖于根系,能直接或間接促進植物生長的微生物[1]。雖然根際促生菌的促生機制尚不明確,但它具有產(chǎn)吲哚乙酸(Indole-3-acetic acid, IAA)[2-3]、產(chǎn)鐵載體[4-6]、產(chǎn)氰化物[7-10]、溶磷[11-14]及抑制病原菌生長[15-16]的功能。目前,PGPR 的研究主要集中在小麥[7,9]、水稻[17]、玉米[18]等主要糧食作物上,其他作物研究較少。植物生長素IAA 被當作篩選PGPR 的重要指標,根際促生菌通過分泌IAA 來促進植物合成生長調(diào)節(jié)物質(zhì),從而促進植物的生長發(fā)育[19-20]。
煙草是我國重要的經(jīng)濟作物,種植廣泛。攀枝花市、宜賓市、瀘州市、涼山州和廣元市是四川省5 大煙草種植區(qū)。目前,四川省煙草主栽區(qū)根際土壤促生菌的研究鮮見報道。為此,從四川省5大煙草種植區(qū)采集煙草根際土壤,從中分離、篩選高效的促生菌,旨在豐富促生菌資源,為煙草促生生物肥料的研發(fā)提供基礎。
去除植株根際約5 cm 厚的表層土壤后,采集1 kg 土壤樣品,立即帶回實驗室進行微生物分離。微生物分離采用稀釋平板法[21],培養(yǎng)基為牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基、高氏1 號和PDA 培養(yǎng)基。對分離到的菌株進行編號,編號規(guī)則:①細菌編號,樣品編號-B-菌株號;②放線菌編號,樣品編號-A-菌株號;③真菌編號,樣品編號-F-菌株編號。每個菌株接種到3 支試管中,4 ℃冰箱保藏,用于功能菌株的篩選。
表1 樣品采集信息Tab.1 Basic sample information
牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉浸膏3.0 g,蛋白胨5.0 g,NaCl 5.0 g,瓊脂20.0 g,蒸餾水1 L,pH 6.8~7.2。
高氏1號 :KNO31.00 g,K2HPO40.50 g,MgSO4·7H2O 0.50 g,NaCl 0.50 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g,可溶性淀粉20.00 g,瓊脂20.00 g,蒸餾水1.00 L,pH 7.2~7.4。
PDA 培養(yǎng)基:土豆200.0 g,葡萄糖20.0 g,瓊脂18.0 g,蒸餾水1.0 L,pH 自然。
參照席琳喬等[22]的方法對促生微生物進行IAA 初篩。取50 μL 菌懸液滴于白色陶瓷板上,同時 加50 μL Salkowski 比色液 。 以 加50 μL IAA(50 mg/L)溶液為陽性對照,以加LB 培養(yǎng)基為陰性對照。菌懸液變紅的程度高于陰性對照則表示微生物能夠產(chǎn)IAA,根據(jù)變紅的程度可初步判斷其產(chǎn)IAA 能力的大小。
Salkowski 比色液:35.0% HClO450.0 mL,0.5 mol/L FeCl31.0 mL。
LB 液體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10.0 g,酵母提取物5.0 g,NaCl 10.0 g,蒸餾水1 L,pH 7.4。
為把改進成果納入標準化,須把各種設計資料、圖紙整理存檔,納入本單位標準化管理工作中,制定《柱塞總成的操作規(guī)程與維護規(guī)定》,以文件形式下發(fā)到了各班組,并納入檢修規(guī)程中。同時重點要做好以下工作:
使用UVmini-1240 型分光光度計(日本島津公司)測定不同濃度IAA 溶液在530 nm 處的吸光值,以IAA 濃度為橫坐標,OD530為縱坐標,繪制標準曲線。將初篩菌株接種于LB 液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)24 h,4 000 r/min 離心15 min。取4 mL 上清液在530 nm 處進行吸光度測定,并計算IAA 產(chǎn)量,每個菌株重復3 次。標準曲線的制作和菌液中IAA 濃度的測定參照Glickmann 等[23]的方法。標準曲線的空白對照為蒸餾水∶Salkowski 比色液=1∶1 的混合液,菌液檢測的空白對照為LB 液體培養(yǎng)基∶Salkowski 比色液=1∶1 的混合液。
將初篩菌株接種于鐵載體檢測培養(yǎng)基,以不接菌的檢測培養(yǎng)基為空白對照。根據(jù)檢測培養(yǎng)基上菌落周圍是否產(chǎn)鐵載體暈圈判定其是否具有產(chǎn)鐵載體的能力[24]。鐵載體檢測培養(yǎng)基的配置:將無菌的50 mL 0.l mol/L 磷酸緩沖溶液、無菌的50 mL CAS 染液直接加入到1 L 鐵載體檢測基礎培養(yǎng)基中,混勻。
CAS 染液 :l.0 mmol/L 鉻天青S,0.1 mmol/L FeC13,4.0 mmol/L 十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)。
鐵載體檢測基礎培養(yǎng)基:0.5 g KCl,0.5 g MgSO4,4.0 g 葡萄糖,5.0 g 酪蛋白胨,15.0 g 瓊脂,1.0 L 蒸餾水,pH 7.0~7.2。
0.1 mol/L 磷酸緩沖液 :0.590 5 g NaH2PO4·2H2O,2.427 0 g Na2HPO4·12H2O,0.250 0 g NH4Cl,0.075 0 g KH2PO4,0.125 0 g NaCl,100.00 mL蒸餾水。
參 照Lorck[25]的方法檢測菌株產(chǎn)HCN的能力。將初篩菌株接種于添加4.4 g/L 甘氨酸的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基上后,再用浸過2%碳酸鈉、0.5%苦味酸溶液(2,4,6-三硝基苯酚)的Whatman1 號濾紙覆蓋,(28±2)℃培養(yǎng)4 d。濾紙顏色由橘黃色轉(zhuǎn)為紅色說明有HCN 產(chǎn)生,根據(jù)轉(zhuǎn)紅的程度判斷菌株產(chǎn)HCN的效果。以不接菌的培養(yǎng)基為空白對照。
將復篩后的促生菌株進行組合,不同組合的菌株接種到裝有LB 液體培養(yǎng)基的三角瓶中,30 ℃ 、180 r/min 培 養(yǎng)24 h。利用IAA測定方法(1.3 節(jié))檢測并計算各組合IAA 的產(chǎn)量,以不接菌的LB 液體培養(yǎng)基為對照,每個組合重復3 次。
參照細菌基因組DNA 提取試劑盒(杭州博日科技有限公司)的說明書提取細菌基因組DNA。參照張飛官等[26]的方法擴增菌株16S rDNA。PCR 產(chǎn)物在生工生物工程(上海)有限公司進行測序。將測得的16S rDNA 序列提交到GenBank,獲得各菌株的登錄號。參照張越己等[15]的方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
將促生菌株和構(gòu)建的促生菌系分別接入LB液體培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min 培養(yǎng)24 h。菌懸液的終濃度為107cfu/mL,以未接菌的LB 液體培養(yǎng)基為空白對照。挑選紅花大金元、MS 云煙85和MS 云煙87(由四川省煙草公司攀枝花市公司米易分公司惠贈)個體飽滿、大小一致的裸種,每個品種20 粒種子,均勻播于鋪有2 層濾紙的無菌培養(yǎng)皿中,每個品種3次重復。每個培養(yǎng)皿加入4 mL制備好的菌懸液和10-1倍濃度的LB 液體培養(yǎng)基,每種菌液3 次重復,置于人工智能氣候箱中培養(yǎng)。培養(yǎng)條件:光強70%、光照12 h、溫度25 ℃、相對濕度70%,每隔1 d 補充1 mL 無菌水,以確保種子正常萌發(fā),于第3、第7 天統(tǒng)計發(fā)芽率。
發(fā)芽率=(發(fā)芽種子數(shù)/檢測種子總數(shù))×100%
從不同地點、不同取樣時間的63 個土壤樣品中,共分離出923 株微生物,其中細菌583 株、放線菌234 株、真菌106 株,基本情況見表2。
表2 樣品微生物的分離情況Tab.2 Microorganism isolation results
從923 株菌株中,初篩到具有較好產(chǎn)IAA 能力的菌株66 株,包括62 株細菌,占比為93.94%,4 株放線菌,占比為6.06%。通過測定菌株IAA 的產(chǎn)量、是否產(chǎn)鐵載體和HCN 進行復篩。結(jié)果(表3)表明,初篩的66 株菌株IAA 的產(chǎn)量在2.65~42.99 μg/mL 之間,其中菌株L2-001-B-16 產(chǎn)IAA 的能力最強。IAA 產(chǎn)量排前10 的菌株:L2-001-B-16>MT-002-B-12>FY-001-B-9>YBT-003-B-5>YB-001-B-8>L2-001-B-14>L2-002-B-2>L2-006-B-16>L2-004-B-2>SC-118-B-1。對66 株菌株是否具有產(chǎn)鐵載體、HCN 的能力進行檢測發(fā)現(xiàn),24 株菌株具有產(chǎn)鐵載體能力(表3),11 株菌株具有較好產(chǎn)HCN的能力(表3)。以同時具有較好產(chǎn)IAA、鐵載體和HCN 能力的菌株為復篩菌株,包括L2-001-B-16、MT-002-B-12、FY-001-B-9、YBT-003-B-5、YB-001-B-8。
表3 初篩菌株促生能力的檢測Tab.3 Promoting ability results from first-screening strains
表3(續(xù))
將5 株復篩菌株進行組合,共31 個組合,測定這些組合產(chǎn)IAA 的能力(表4)。在2 個菌株的組合中,組合45 IAA 的產(chǎn)量最高;在3 個菌株的組合中,組合134 IAA 的產(chǎn)量最高。在31 個組合中,組合1345 產(chǎn)IAA 的能力最高,其IAA 的產(chǎn)量為51.27 μg/mL,極顯著優(yōu)于其他組合。因此,組合1345 為最優(yōu)促生菌系。
表4 促生菌系產(chǎn)IAA 能力的檢測①Tab.4 IAA yields of different growth-promoting rhizobacteria groups
進一步分析組合1345 的4 株菌株16S rDNA序列。菌株MT-002-B-12、FY-001-B-9 和YBT-003-B-5 的16S rDNA 序列長度分別為1 402、1 354、1 516 bp,在GenBank中的登錄號分別為KT119350、KT119349、KT223830。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育與菌株形態(tài)特征,判定菌株MT-002-B-12 屬于克雷伯氏菌屬的Klebsiella variicola,菌株FY-001-B-9 屬于腸桿菌屬的Enterobacter xiangfangensis,菌 株YBT-003-B-5 屬于芽孢桿菌屬的Bacillus tequilensis。
菌株L2-001-B-16 的16S rDNA 序列長度為1 510 bp。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果(圖1)表明,菌株L2-001-B-16 屬于腸桿菌科(Enterobacteriaceae),與Enterobacter cloacae subsp. Dissolvens 的發(fā)育關(guān)系最近,二者16S rDNA 序列相似性為92.2%;其次是Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae,16S rDNA序列相似性為91.9%;與腸桿菌科其他菌株的相似性均小于91.8%。因此,推測菌株L2-001-B-16 是腸桿菌科(Enterobacteriaceae)的新類群。
圖1 菌株L2-001-B-16 的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1 Phylogenetic tree of strain L2-001-B-16 based on 16S rDNA
由表5 可知,與對照相比,不同菌株處理下,3 個煙草品種種子第3 天的發(fā)芽率均極顯著升高。第7 天,菌株YBT-003-B-5 對紅花大金元種子、菌株MT-002-B-12 對MS 云煙87 種子發(fā)芽率的影響均不顯著;其余菌株處理下,3 個煙草品種種子的發(fā)芽率均極顯著升高。第3 天和第7 天,在組合1345 的處理下,3 個煙草品種種子的發(fā)芽率均高于其他菌株,促進煙草種子發(fā)芽的效果明顯。
表5 不同促生菌對煙草種子發(fā)芽率的影響Tab.5 Effects of different growth-promoting rhizobacteria on germinating rates of tobacco seeds
席琳喬等[22]從棉花根際土壤中分離到8 株根際促生固氮菌,其IAA 的產(chǎn)量在6.62~22.83 μg/mL之間;劉靜洋[27]篩選到29 株棉花根際細菌,其IAA的產(chǎn)量在0.15~22.87 mg/L 之間;徐明雙[28]發(fā)現(xiàn)31株內(nèi)生菌分泌IAA的產(chǎn)量為1.00~5.49 mg/L;鄭文波等[29]發(fā)現(xiàn)菌株ZH5 IAA的產(chǎn)量為43.18 mg/L。從四川省煙草主栽區(qū)的根際土壤中分離到5 株(YBT-003-B-5、YB-001-B-8、FY-001-B-9、MT-002-B-12、L2-001-B-16)促生菌,所構(gòu)建的促生菌系(MT-002-B-12、L2-001-B-16、FY-001-B-9 和YBT-003-B-5)IAA產(chǎn)量可達51.27 mg/L,高于已報道的促生菌產(chǎn)IAA 的能力[22,27-29],并且該促生菌系還能顯著提高煙草種子的發(fā)芽率。
促生菌系中的菌株MT-002-B-12、FY-001-B-9和YBT-003-B-5 分 別 屬 于Klebsiella variicola、Enterobacter xiangfangensi 和 Bacillus tequilensis。K. variicola 具有ACC 脫氨酶活性[30]、固氮[31-32]、解鉀[33]等促生功能;E. xiangfangensis 具有產(chǎn)組胺的能力[34];B. tequilensis 具有促生[35]、產(chǎn)拮抗病原菌活性物質(zhì)的能力[36-37]。但目前還沒有關(guān)于這3 種細菌產(chǎn)IAA、鐵載體和HCN 能力的報道。另外,菌株L2-001-B-16 可能屬于腸桿菌科(Enterobacteriaceae)的新類群。本研究中,獲得的促生菌株豐富了促生微生物的種類,為利用微生物研制煙草生物肥料提供了更多的選擇。
①從四川省5 個煙草主栽區(qū)的煙草根際土壤中分離到923 株微生物,其中細菌583 株、放線菌234 株、真菌106 株;②初篩篩選到具有較好產(chǎn)IAA能力的菌株66 株,復篩篩選出5 株具有較好產(chǎn)IAA、產(chǎn)鐵載體和產(chǎn)HCN 能力的菌株;③將菌株MT-002-B-12、L2-001-B-16、FY-001-B-9 和YBT-003-B-5 構(gòu)建成促生菌系,該促生菌系能極顯著促進3個煙草主栽品種種子的萌發(fā)。