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        牦牛miR-378前體克隆及組織表達(dá)分析

        2019-01-23 12:05:12紀(jì)會(huì)王會(huì)柴志欣王吉坤羅曉林姬秋梅信金偉鐘金城
        生物技術(shù)通報(bào) 2019年1期
        關(guān)鍵詞:卵母細(xì)胞孕酮牦牛

        紀(jì)會(huì) 王會(huì) 柴志欣 王吉坤 羅曉林 姬秋梅 信金偉 鐘金城

        (1. 西南民族大學(xué) 青藏高原動(dòng)物遺傳資源保護(hù)與利用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,成都 610041;2. 四川省草原科學(xué)研究院,成都 611731;3. 西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院 省部共建青稞和牦牛種質(zhì)資源與遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,拉薩 850009)

        microRNA(miRNA)是一類長(zhǎng)約20-25個(gè)核苷酸的非編碼小RNA,以互補(bǔ)配對(duì)的方式與靶基因轉(zhuǎn)錄出的mRNA結(jié)合,引導(dǎo)RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RICS)清除 mRNA[1]或抑制 mRNA 的翻譯[2],從而影響編碼蛋白基因的表達(dá)。miRNA 最先在秀麗線蟲(chóng)中被發(fā)現(xiàn)[3],廣泛存在于哺乳動(dòng)物、果蠅和植物等生物中。miRNA基因盡管不編碼蛋白,但在生物整個(gè)生命活動(dòng)中發(fā)揮著重要作用,參與細(xì)胞的分裂增殖、分化、生物發(fā)育及代謝等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程[4],并在疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程中扮演重要角色。

        miR-378最初在人白血病細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)[5],miR-378家族有許多成員,牛的miR-378(bta-miR-378)家族有3種高度同源的類型:bta-miR-378b(MIMAT0025535)和 bta-miR-378c(MIMAT0025551)、bta-miR-370d(MIMAT0036972)。研究表明,miR-378參與各種癌癥的多種生物學(xué)過(guò)程,在前列腺癌、結(jié)腸癌、肝癌的研究中miR-378可以抑制癌細(xì)胞的增殖和遷移[6-8],而對(duì)肺癌、宮頸癌的遷移和侵襲有促進(jìn)作用[9-12]。Chan等[13]研究發(fā)現(xiàn),與正常卵巢上皮細(xì)胞相比,miR-378在卵巢癌細(xì)胞和腫瘤中表達(dá)量顯著增加,通過(guò)調(diào)控與血管生成、細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期調(diào)節(jié)相關(guān)基因的表達(dá),從而促進(jìn)卵巢癌細(xì)胞的侵襲與遷移,可以作為卵巢癌中抗血管生成療法反應(yīng)的生物標(biāo)志物。miR-378在牛的卵泡發(fā)育過(guò)程中誘導(dǎo)顆粒細(xì)胞凋亡,可能參與調(diào)控卵泡閉鎖[14],且 miR-378 可以影響綿羊成肌細(xì)胞的增殖[15]。說(shuō)明miR-378在哺乳動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控功能具有多樣性和重要性。然而,miR-378在牦牛生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控作用及功能尚不清楚。牦牛與普通牛種相比,牦牛生長(zhǎng)速度慢、發(fā)情期晚、普遍繁殖性能低下,成為高原畜牧業(yè)發(fā)展及生態(tài)保護(hù)的主要瓶頸之一。

        因此,本實(shí)驗(yàn)旨在克隆牦牛miR-378的前體序列,與其它物種的前體序列進(jìn)行同源性比對(duì)和進(jìn)化分析,實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測(cè)miR-378在不同組織中的表達(dá)特性,基于牦牛和牛屬近源物種,結(jié)合bta-miR-378-3p靶基因的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)和分析,探索miR-378在牦牛卵巢發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控功能,旨為miR-378對(duì)牦牛繁殖性能的調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 試劑與儀器 普通PCR儀、CFX-96熒光定量PCR儀(Bio-Rad)、核酸/蛋白質(zhì)濃度測(cè)定儀(NANODROP2000)。

        pMD18-T載體,PrimeScriptTMRT逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、SYBR Premix Ex TaqTMⅡ試劑盒均購(gòu)自TaKaRa公司;Trizol、DNA提取試劑盒、感受態(tài)細(xì)胞DH5α和膠回收試劑盒均購(gòu)自天根生化科技有限公司;氯仿、異丙醇、75%乙醇(預(yù)冷)均購(gòu)自天津市致遠(yuǎn)化學(xué)試劑有限公司;無(wú)水乙醇購(gòu)自成都海興化工試劑廠。

        1.1.2 樣品采集 選用西藏自治區(qū)昌都市類烏齊縣3頭4.5歲健康的類烏齊牦牛,屠宰后采集耳組織樣品其裝入凍存管,并分別卵巢、肝臟、乳腺、大腦、臀脂、臀大肌等組織,DEPC沖洗,錫箔紙包裝迅速置于液氮保存,帶回實(shí)驗(yàn)備用。

        1.2 方法

        1.2.1 牦牛miR-378前體序列克隆 按照DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)提取類烏齊牦牛耳樣的DNA,參照GenBank中 牛 pre-miRNA-378序 列(NC_037334),利用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)PCR克隆引物(上游引物:5′ - AGGCTCCGAGAACCAG -3′;下游引物:5′ -TTACAGGAAGGACCAGACA -3′),用類烏齊牦牛耳樣的DNA作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,預(yù)期擴(kuò)增片段總長(zhǎng)度為378 bp。PCR反應(yīng)總體系為:2×Dream Taq Green PCR Master Mix 12.5 μL,模板DNA 1 μL,上、下 游引物各 1 μL,最后加水至 25 μL。PCR反應(yīng)條件:95℃ 預(yù)變性 4 min ;94℃ 變性 30 s,58℃退火 30 s,72℃延伸30s,30個(gè)循環(huán);72℃ 5 min;然后取15 μL PCR產(chǎn)物用1% 瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),切膠回收DNA片段。將產(chǎn)物與pMD-19T載體連接并轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,Amp+平板挑取陽(yáng)性菌落,提取質(zhì)粒后送英濰捷基(上海)生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

        1.2.2 miR-378序列保守性分析 利用blast將克隆得到的類烏齊牦牛miRNA-378前體序列與人(Homo sapiens,hsa)、小鼠(Mus musculus,mmu)、山羊(Capra hircus,chi)、豬(Sus scrofa,sus)、大猩猩(Gorilla gorilla,ggo)、牛(Bos taurus,bta)的前體序列進(jìn)行比對(duì),分析其保守性。

        1.2.3 牦牛miR-378組織表達(dá)譜

        1.2.3.1 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)miRbase數(shù)據(jù)庫(kù)公布miRNA序列,采用莖環(huán)引物法設(shè)計(jì)miR-378-3p特異性莖環(huán)引物用于反轉(zhuǎn)錄和熒光定量表達(dá)引物,U6為內(nèi)參基因(參照張陽(yáng)陽(yáng)[16]),引物由英濰捷基(上海)生物技術(shù)有限公司合成,具體引物見(jiàn)表1。

        表1 引物序列信息

        1.2.3.2 Real-time-PCR 按照PrimeScriptTMRT逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū),由total RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA后進(jìn)行Real-time PCR反應(yīng),反應(yīng)體系共10.0 μL,包含5 μL SYBR Premix Ex TaqTMⅡ、上下引物各0.4 μL(10 μmol/L)、1.0 μL cDNA 模板、3.2 μL R Nase-Free ddH2O。反應(yīng)條件:95℃變性30 s;95℃,5 s,60℃,30 s擴(kuò)增,39個(gè)循環(huán);每個(gè)樣品設(shè)3個(gè)重復(fù)。Real-time PCR結(jié)果中miR-378-3p的相對(duì)表達(dá)量采用2-△△Ct公式計(jì)算,并用SPSS 19.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,顯著性用One-Way ANOVA方差分析,進(jìn)行Duncan檢驗(yàn)。數(shù)據(jù)以x-±s表示,P<0.05為差異顯著。1.2.4 bta-miR-378-3p靶基因預(yù)測(cè)及生物學(xué)功能預(yù) 測(cè) 選 擇 TargetScan 7.1(http://www.targetscan.org/vert_71/)、PicTar(https://pictar.Mdc-berlin.de/)2個(gè)在線軟件預(yù)測(cè)bta-miR-378-3p靶基因,將兩者結(jié)果與 miRwalk 2.0(http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk2/index.html)上已驗(yàn)證的miR-378-3p靶基因結(jié)合作為深入分析的基因集合。將獲得靶基因集合導(dǎo)入DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)(https://david.ncifcrf.gov/)進(jìn)行Gene Ontology聚類分析及KEGG信號(hào)通路富集分析,以所有蛋白編碼基因作為背景基因,GO條目與KEGG信號(hào)通路均通過(guò)Fsiher Exact Test計(jì)算P值,以P<0.01為限制性閾值,分別得到相對(duì)于背景具有統(tǒng)計(jì)意義的高頻率注釋或信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。

        2 結(jié)果

        2.1 牦牛pre-miR-378克隆及保守性分析

        以類烏齊牦牛耳樣的DNA為模板經(jīng)PCR擴(kuò)增成功克隆了類烏齊牦牛pre-miRNA-378序列,擴(kuò)增片段總長(zhǎng)度為378 bp(圖1),其中135-200 bp為pre-miRNA-378序列,長(zhǎng)為66 bp。

        圖1 牦牛miR-378前體PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

        將其序列與人、小鼠、牛等6個(gè)物種的premiRNA-378及種子序列進(jìn)行同源性比對(duì),結(jié)果如表2所示,各物種間序列相似性很高,且各個(gè)物種之間miR-378-3p種子序列(CUGGACU)完全一致,說(shuō)明miRNA-378序列有很高的保守性。

        2.2 miR-378-3p在牦牛不同組織表達(dá)差異

        通過(guò)Real-time PCR方法檢測(cè)miR-378-3p在牦牛卵巢、乳腺、臀大肌、大腦、臀脂和肝臟中的相對(duì)表達(dá)量,結(jié)果(圖2)顯示miR-378-3p在各組織中均存在表達(dá),且在臀大肌中表達(dá)水平最高,顯著高于其他組織(P<0.01),在臀脂中的表達(dá)高于卵巢、大腦、乳腺和肝臟,在卵巢中表達(dá)水平最低。

        2.3 bta-miR-378-3p靶基因預(yù)測(cè)及生物學(xué)功能預(yù)測(cè)

        選擇TargetScan和PicTar 2種計(jì)算方法預(yù)測(cè)btamiR-378-3p的靶基因,合并已經(jīng)證實(shí)為miR-378-3p的18個(gè)來(lái)自miRwalk數(shù)據(jù)庫(kù)的靶基因,獲得共計(jì)316個(gè)靶基因作為后續(xù)GO和KEGG pathway分析的靶基因集合。其中272個(gè)基因具有GO分子注釋信息,結(jié)果(表3-表6)顯示bta-miR-378-3p的靶基因富集于細(xì)胞分化、細(xì)胞發(fā)育、大分子代謝及神經(jīng)元分化等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程中,具有與特異DNA序列結(jié)合及轉(zhuǎn)錄調(diào)控活動(dòng)的分子作用。

        在GO注釋分類的基礎(chǔ)上,利用已有生物通路數(shù)據(jù)對(duì)基因集合中的272個(gè)基因進(jìn)行生物通路富集分析。結(jié)果(圖3)顯示,bta-miR-378-3p預(yù)測(cè)靶基因主要參與孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟、促性腺激素釋放激素(Gonadotropin-releasing hormone,GnRH)信號(hào)通路(圖4)、長(zhǎng)期抑郁癥、癌癥途徑、Rap1信號(hào)通路等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。

        表2 牦牛與不同物種miR-378前體序列的比對(duì)結(jié)果

        圖2 牦牛miR-378-3p在不同組織中的相對(duì)表達(dá)量

        圖3是孕酮介導(dǎo)卵母細(xì)胞成熟的信號(hào)通路,在第一次減數(shù)分裂前期自然停滯的卵母細(xì)胞在孕酮誘導(dǎo)下停滯被破壞,卵母細(xì)胞恢復(fù)兩個(gè)減數(shù)分裂周期并發(fā)育成熟為可受精的卵子,此過(guò)程中胰島素、IGF1(胰島素樣生長(zhǎng)因子1)、MAPK(絲裂原激活蛋白激酶)、孕酮是主要的誘因。

        圖4為下丘腦分泌的GnRH(促性腺激素釋放激素)調(diào)節(jié)垂體產(chǎn)生和釋放促性腺激素的通路圖,此過(guò)程伴隨MAPK的激活。

        3 討論

        目前,miRbase(http://www.mirbase.org/)數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的 miRNA條目已達(dá)38 589條,數(shù)以萬(wàn)計(jì)的miRNA在人體各類細(xì)胞中發(fā)揮作用,同一miRNA靶向不同的基因促進(jìn)或抑制細(xì)胞增殖分化,因此,僅僅靠實(shí)驗(yàn)手段來(lái)研究miRNA已變得相當(dāng)困難。靶基因數(shù)量和種類較多,生物信息學(xué)軟件的應(yīng)用在miRNA的研究中必不可缺,TargetScan和 PicTar作為第二代預(yù)測(cè)算法,Target Scan首次引入假陽(yáng)性率來(lái)評(píng)價(jià)靶基因預(yù)測(cè)結(jié)果,要求miRNA種子序列(第2到第8位核苷酸)和mRNA 3′UTR完全互補(bǔ),該軟件的輸入要求是2個(gè)以上物種 UTR 比對(duì)后的序列作為輸入,由于其要求種子序列完全互補(bǔ),隨著物種數(shù)目的增多,其預(yù)測(cè)靶基因的數(shù)量相對(duì)減少,但和實(shí)驗(yàn)證實(shí)的靶基因集合吻合率相應(yīng)增高。所不同的是PicTar把種子序列分為“完全匹配的種子序列”和“不完全匹配的種子序列”分別進(jìn)行篩選,PicTar亦結(jié)合以前實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)對(duì)兩類種子序列對(duì)應(yīng)的 miRNA和靶基因二聚體結(jié)合能進(jìn)行了限制,有效降低假陽(yáng)性率[17]。且TargetScan數(shù)據(jù)庫(kù)中包含?;?,綜合miRwalk 數(shù)據(jù)庫(kù)(2014)中已驗(yàn)證靶標(biāo)作為靶基因集合進(jìn)行后續(xù)分析,減少假陽(yáng)性率,靶基因預(yù)測(cè)軟件基于miRNA種子序列與靶基因的3′-UTR進(jìn)行配對(duì),bta-miR-378-3p種子序列在各物種高度保守,從而保證了后續(xù)功能分析的全面和可靠性。

        表3 miR-378-3p靶基因參與的生物學(xué)過(guò)程(前20個(gè))

        表4 miR-378-3p靶基因參與的細(xì)胞組成分類

        表5 miR-378-3p靶基因參與分子功能分類

        表6 miR-378-3p靶基因參與的KEGG通路富集分析

        圖3 孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟信號(hào)通路

        目前研究已證實(shí)miR-378 在脂肪分化[18]、肌細(xì)胞增殖分化[15]、卵巢發(fā)育[14]、癌癥發(fā)生[13]等生物過(guò)程中都有重要的調(diào)控作用。本實(shí)驗(yàn)成功克隆牦牛pre-miRNA-378序列,與其它物種的前體序列進(jìn)行同源性比對(duì)顯示序列保守性較高,且牦牛與牛的pre-miR-378序列完全一致,牛是牦牛的近源物種,表明牛該miRNA的研究可為探究牦牛miR-378的調(diào)控方式提供參考。

        為了進(jìn)一步研究該基因?qū)︻悶觚R牦牛的調(diào)控功能,本實(shí)驗(yàn)利用qPCR方法檢測(cè)了miR-378-3p在類烏齊牦牛的6個(gè)組織中的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,miR-378-3p在臀大肌和臀脂中表達(dá)水平較高,在臀大肌中表達(dá)水平極顯著高于其他組織,推測(cè)其在類烏齊牦牛肌肉和脂肪中存在重要調(diào)控作用。miR-378-3p 靶基因GO分析結(jié)果顯示其與細(xì)胞分化、發(fā)育、大分子代謝等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程相關(guān),已有研究證實(shí)在牛骨骼肌發(fā)育中,miR-378具有抑制牛肌細(xì)胞增殖而促進(jìn)其分化的作用[19],達(dá)到促進(jìn)肌管形成的效果[4],牦牛體格健壯,肌肉組織極其發(fā)達(dá)可能與miR-378促進(jìn)肌細(xì)胞分化機(jī)制有密切聯(lián)系。過(guò)表達(dá)miR-378a-3p可以抑制MAPK1(絲裂原活化蛋白激酶1)的表達(dá)從而促進(jìn)牛脂肪形成[20-21],推測(cè)miR-378與牦牛肌纖維和脂肪形成有密切關(guān)系,從而對(duì)牦牛肉質(zhì)性狀和脂肪沉積產(chǎn)生影響。

        圖4 GnRH信號(hào)通路

        雌二醇是一種類固醇激素,不僅在卵巢卵泡發(fā)育中起重要作用,而且與許多生殖功能紊亂有關(guān),Xu 等[22]研究發(fā)現(xiàn)豬卵泡顆粒細(xì)胞中miR-378靶向結(jié)合芳香化酶3’UTR,降低芳香化酶蛋白表達(dá)和雌二醇釋放。在顆粒細(xì)胞中miRNA-378-3p通過(guò)靶向PGR(孕酮受體)降低其蛋白質(zhì)水平和mRNA水平[23]。綜合以上研究,表明miR-378對(duì)黃體發(fā)育、孕激素(孕酮等)和雌激素分泌(雌二醇等)有抑制作用。

        本實(shí)驗(yàn)中KEGG信號(hào)通路分析bta-miR-378-3p靶基因主要參與孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟信號(hào)通路、促性腺激素釋放激素(Gonadotropin-releasing hormone,GnRH)信號(hào)通路、長(zhǎng)期抑郁癥、癌癥途徑、Ras相關(guān)蛋白1(Ras-proximate-1,Rap1)信號(hào)通路。其中孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟信號(hào)通路、GnRH信號(hào)通路在卵巢發(fā)育和卵母細(xì)胞成熟中發(fā)揮重要功能,IGF1、MAPK1、PGR是主要的靶基因。

        然而miR-378-3p在本實(shí)驗(yàn)牦牛卵巢樣品中相對(duì)表達(dá)量最低,可能由于miRNA表達(dá)在實(shí)驗(yàn)樣品中呈現(xiàn)出時(shí)序特異性,牛黃體不同發(fā)育期miR-378有明顯表達(dá)差異[24]:在黃體形成時(shí)miR-378的表達(dá)量增加到正常水平的5倍,而在黃體退化階段,表達(dá)量迅速下降,豬大卵泡顆粒細(xì)胞的miR-378表達(dá)量顯著低于小卵泡顆粒細(xì)胞,表明miR-378在哺乳動(dòng)物卵巢發(fā)育過(guò)程中具有一定的調(diào)控作用,在母豬正常發(fā)情時(shí)卵巢miR-378表達(dá)量顯著低于不發(fā)情時(shí)期[25],已有研究證實(shí),miRNA參與調(diào)節(jié)牦牛卵巢發(fā)育過(guò)程[26],且miR-378在各物種間高度保守,實(shí)驗(yàn)樣品中3頭類烏齊牦牛正處于發(fā)情期,卵泡發(fā)育正常,故卵巢miR-378呈現(xiàn)低表達(dá)。根據(jù)bta-miR-378-3p功能預(yù)測(cè)結(jié)果繼續(xù)分析,為進(jìn)一步探索牦牛miR-378在卵巢組織的表達(dá)規(guī)律奠定理論基礎(chǔ)。

        IGFs(胰島素樣生長(zhǎng)因子)可啟動(dòng)卵裂,增加致密化和胚泡形成率,是胚胎發(fā)育和代謝的重要調(diào)節(jié)因子之一。IGF1通過(guò)調(diào)控?zé)嵝菘说鞍?09(HSP70)抑制牦牛卵丘細(xì)胞凋亡[27],李莉華等[28]研究miR-378對(duì)肝癌細(xì)胞生長(zhǎng)增殖的影響機(jī)制證實(shí)miR-378通過(guò)降低靶基因IGF1R(胰島素樣生長(zhǎng)因子1類受體)的表達(dá)發(fā)揮抑制作用。miR-378通過(guò)下調(diào)MAPK1抑制前列腺癌細(xì)胞生長(zhǎng)[2]。根據(jù)下丘腦-垂體-卵巢軸系統(tǒng):下丘腦通過(guò)分泌GnRH調(diào)節(jié)垂體促性腺激素的釋放,從而控制卵巢發(fā)育和性激素(孕酮、雌二醇)的分泌,同時(shí),孕酮和雌二醇對(duì)下丘腦和垂體具有反饋調(diào)節(jié)作用。綜合以上研究結(jié)果推測(cè)miR-378-3p可能通過(guò)降低靶基因IGF1、MAPK1、PGR的表達(dá)負(fù)調(diào)控牦牛的下丘腦-垂體-卵巢軸系統(tǒng),抑制卵巢發(fā)育和性激素(孕酮、雌二醇)的分泌等生物過(guò)程,負(fù)面影響母牦牛發(fā)情、求偶和接受交配、妊娠,進(jìn)而降低了母牦牛的繁殖性能。

        本實(shí)驗(yàn)為了探索miR-378在牦牛生長(zhǎng)發(fā)育中的調(diào)控作用,實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)miR-378-3p在各組織之間表達(dá)規(guī)律,結(jié)合生物信息學(xué)軟件基于btamiR-378-3p進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)和功能分析??傊?,本實(shí)驗(yàn)成功克隆牦牛pre-miRNA-378序列,與其它物種的前體序列比對(duì)顯示序列保守性較高,miR-378-3p在牦牛各組織中均存在表達(dá),且在臀大肌中表達(dá)水平最高,在臀脂中的表達(dá)高于大腦、乳腺和肝臟,推測(cè)miR-378-3p對(duì)牦牛肌肉、脂肪形成具有一定調(diào)控作用,挖掘出IGF1、MAPK1、PGR等關(guān)鍵靶基因以及孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟信號(hào)通路、GnRH信號(hào)通路等重要信號(hào)通路。本實(shí)驗(yàn)所得結(jié)果為研究miR-378在牦牛中的作用提供重要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),進(jìn)一步闡明其作用及分子機(jī)制仍需繼續(xù)進(jìn)行深入研究。

        4 結(jié)論

        本實(shí)驗(yàn)成功克隆了pre-miR-378,其與牛、小鼠和山羊pre-miR-378相似性較高,人和大猩猩次之,豬最低。生物信息學(xué)分析表明,miR-378-3p可能通過(guò)抑制孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟信號(hào)通路、GnRH信號(hào)通路中靶基因IGF1、MAPK1、PGR等的表達(dá)調(diào)控卵泡的發(fā)育、排卵及卵母細(xì)胞成熟過(guò)程,進(jìn)而影響母牦牛的繁殖性能,熒光定量PCR檢測(cè)miR-378在牦牛臀大肌和臀脂中表達(dá)水平最高,說(shuō)明miR-378還參與牦牛肌纖維和脂肪形成。

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