段輝宏 龔 敬 王麗嘉 李鑫宇 聶生東
(上海理工大學(xué)醫(yī)療器械與食品學(xué)院,上海 200082)
肺部氣管是人體重要的組織器官,同時(shí)也是與外界環(huán)境進(jìn)行氣體交換的重要場(chǎng)所。由于肺部氣管長(zhǎng)時(shí)間暴露于外界環(huán)境中,受輻射污染、化學(xué)污染以及空氣污染等外界因素的影響,肺部呼吸道系統(tǒng)疾病的發(fā)病率呈現(xiàn)出逐年上升的趨勢(shì),慢性阻塞性肺疾病等慢性呼吸系統(tǒng)疾病,已經(jīng)成為僅次于惡性腫瘤的主要疾病死因[1-2]。因此,探究呼吸道系統(tǒng)相關(guān)疾病的成因及其后續(xù)影響,對(duì)于預(yù)防和診斷肺部疾病有著重要的意義。
肺部氣管由結(jié)締組織、肌肉組織以及環(huán)狀軟骨組成,它們彼此相互連接從而形成中空管狀腔體。從咽喉部的主氣管開(kāi)始至末端支氣管,肺部氣管樹約分為17級(jí),且隨著氣管級(jí)數(shù)升高,對(duì)應(yīng)的氣管半徑與氣管長(zhǎng)度也隨之減小。最終末端氣管與肺泡組織相連,從而在肺泡內(nèi)完成氣體交換。由于肺部氣管特殊的解剖結(jié)構(gòu)和生理功能,肺部疾病與肺部氣管的病變有著密切的聯(lián)系[3-4]。而肺部氣管的病變往往伴隨著氣管解剖結(jié)構(gòu)的改變,因此肺部氣管的解剖結(jié)構(gòu)信息,常被用于肺部疾病的診斷以及治療效果的評(píng)估[5-7]。
計(jì)算機(jī)斷層掃描(computed tomography,CT)圖像因具有良好的空間分辨率和成像質(zhì)量,被廣泛運(yùn)用于肺部疾病的診斷。但由于CT圖像的切層數(shù)較多且肺部氣管樹的結(jié)構(gòu)復(fù)雜,通過(guò)人工閱片的方式對(duì)病變組織進(jìn)行篩查或分割,往往費(fèi)時(shí)費(fèi)力[8]。同時(shí),人工閱片的主觀性較強(qiáng),長(zhǎng)時(shí)間地閱片也容易導(dǎo)致錯(cuò)誤的判斷。因此,基于肺部CT圖像的氣管樹自動(dòng)鑒別與病理分析能夠極大地減少臨床工作量,為臨床診斷提供定量參考的同時(shí)也降低了誤診率。其中肺部氣管樹的自動(dòng)分割與獲取是定量分析與自動(dòng)診斷的前提[9],同時(shí)也是虛擬支氣管鏡、手術(shù)模擬導(dǎo)航等技術(shù)的基礎(chǔ)[10-11]。
肺部氣管樹分割技術(shù)始于20世紀(jì)90年代末,CT圖像技術(shù)的發(fā)展與進(jìn)步,使得氣管分割成為可能。在CT圖像中,氣管壁與管腔內(nèi)部區(qū)域的灰度值相差較大,且氣管各級(jí)分枝之間的連通性較好。同時(shí),各級(jí)氣管分枝被氣管壁所包圍,形成封閉的管狀區(qū)域。但由于噪聲、運(yùn)動(dòng)偽影以及病變組織的影響,氣管壁會(huì)出現(xiàn)模糊或斷裂,進(jìn)而容易在分割過(guò)程中造成分割泄漏,導(dǎo)致氣管被肺實(shí)質(zhì)區(qū)域包裹,使分割結(jié)果失去臨床意義。圖1為本研究利用傳統(tǒng)三維區(qū)域生長(zhǎng)方法所獲取的分割泄漏結(jié)果,展示了分割泄漏對(duì)分割結(jié)果的影響。而針對(duì)這一難題,不同的分割方法與分割策略被提出。
圖1 肺部氣管分割泄漏結(jié)果。(a)傳統(tǒng)三維區(qū)域生長(zhǎng)方法獲取的結(jié)果;(b)冠狀位二維CT圖像,其中紅色區(qū)域表示對(duì)應(yīng)的分割結(jié)果Fig.1 The segmentation result of airway with leakage. (a)The result obtained by using traditional 3D region-growing;(b) A CT slice in the coronal planes, in which the segmentation result is marked as red
本研究總結(jié)了多年來(lái)國(guó)內(nèi)外肺部氣管樹的分割方法,對(duì)其研究現(xiàn)狀進(jìn)行了綜述,同時(shí)依據(jù)方法的主要技術(shù)路線將這些方法劃分為:傳統(tǒng)方法、基于管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)的方法以及基于機(jī)器學(xué)習(xí)的方法。
由于肺部氣管具有良好的連通性、相對(duì)較好的封閉性以及有規(guī)律的結(jié)構(gòu)先驗(yàn)知識(shí),使得基于區(qū)域生長(zhǎng)的方法[12-20]、基于形態(tài)學(xué)的方法[21-32]以及基于規(guī)則和模糊邏輯的方法[8,33-39]成為了較為常見(jiàn)的肺部氣管樹分割方法。其中基于區(qū)域生長(zhǎng)的方法,通過(guò)設(shè)定一定的區(qū)域生長(zhǎng)規(guī)則,從自動(dòng)或手動(dòng)確定的種子點(diǎn)出發(fā),對(duì)肺部氣管樹進(jìn)行分割。因此區(qū)域生長(zhǎng)的種子點(diǎn)選取與生長(zhǎng)規(guī)則的設(shè)定,決定了該算法的分割效果。與三維區(qū)域生長(zhǎng)類似的方法還有前向傳播法(front propagation method),該類方法通過(guò)檢測(cè)波面前端的傳播狀態(tài)從而控制分割過(guò)程,并依據(jù)波面半徑的大小判斷并阻止泄漏的發(fā)生[40-41]。
基于區(qū)域生長(zhǎng)與前向傳播法的肺部氣管樹分割方法對(duì)噪聲較為敏感,對(duì)氣管壁的完整性要求也較高,因此易發(fā)生分割泄漏并且不能有效地分割出細(xì)小氣管。后續(xù)的方法通常將三維區(qū)域生長(zhǎng)用于主支氣管的分割,然后結(jié)合其他的分割技術(shù),對(duì)肺部氣管樹的細(xì)小氣管進(jìn)行分割。
而基于形態(tài)學(xué)的方法,主要利用了氣管壁與氣管內(nèi)腔的結(jié)構(gòu)與灰度特性。即在CT圖像的二維切層中,成像較暗的管腔被較亮的氣管壁所包圍,從而形成局部極值區(qū)域。因此可以采用形態(tài)學(xué)的方法對(duì)局部極值區(qū)域進(jìn)行檢測(cè),從而標(biāo)記出潛在的氣管區(qū)域。
基于形態(tài)學(xué)的方法一般會(huì)與三維區(qū)域生長(zhǎng)相結(jié)合。通常會(huì)采用三維區(qū)域生長(zhǎng)獲取主支氣管,然后利用形態(tài)學(xué)方法標(biāo)記出細(xì)小氣管,最后利用標(biāo)記結(jié)果引導(dǎo)后續(xù)的精細(xì)分割。雖然較單一的三維區(qū)域生長(zhǎng)方法,基于形態(tài)學(xué)的方法能夠檢測(cè)出更多的氣管分枝數(shù),但該類方法并未利用氣管的三維管狀結(jié)構(gòu)特征。因此在噪聲較多的案例中,容易標(biāo)記出大量偽氣管區(qū)域,從而導(dǎo)致在提取細(xì)小氣管時(shí)發(fā)生局部泄漏。
基于規(guī)則與模糊邏輯的肺部氣管樹分割方法,主要利用了氣管樹的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)以及氣管樹與周圍鄰近組織的先驗(yàn)知識(shí),并以此對(duì)分類規(guī)則或模糊邏輯進(jìn)行設(shè)計(jì)。
基于規(guī)則和模糊邏輯的方法需要對(duì)分類規(guī)則、隸屬函數(shù)以及親和力函數(shù)進(jìn)行設(shè)計(jì)。因?yàn)橐肓四:壿嫷母拍睿^前兩類方法而言,其受噪聲和氣管壁斷裂的影響稍小。嚴(yán)格的限制條件雖然有效降低了泄漏發(fā)生的概率,但檢測(cè)出的氣管分枝數(shù)會(huì)因此受到影響。并且該類方法的初始分割結(jié)果為概率結(jié)果,需要采用適當(dāng)?shù)拈撝祷蚍椒ㄌ崛〕鲎罱K的氣管樹,因此閾值的設(shè)置和提取方法的選取同樣也會(huì)對(duì)最終結(jié)果產(chǎn)生較大影響。圖2分別列舉了上述3種傳統(tǒng)方法中,具有代表性方法的分割結(jié)果。
圖2 傳統(tǒng)方法的分割結(jié)果。(a)基于三維區(qū)域生長(zhǎng)分割方法所獲取的結(jié)果[15];(b)基于形態(tài)學(xué)分割方法所獲取的結(jié)果[25];(c)基于模糊邏輯分割方法所獲取的結(jié)果[35]Fig.2 The results obtained by using traditional methods. (a)The result obtained by using the method based on 3D region-growing[15];(b)The result obtained by using the method based on morphology[25];(c)The result obtained by using the method based on fuzzy logic [35]
上述傳統(tǒng)的氣管分割方法,雖然經(jīng)過(guò)改進(jìn)與結(jié)合,但分割結(jié)果依然容易受到噪聲以及圖像質(zhì)量的影響。因此,后續(xù)研究提出了基于管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)的氣管分割方法。管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)即指利用管狀結(jié)構(gòu)濾波器,在圖像中檢測(cè)出類似管狀結(jié)構(gòu)的物體。因?yàn)闅夤芴烊坏墓軤罱馄式Y(jié)構(gòu),可以依據(jù)氣管的局部或整體管狀結(jié)構(gòu)特征,先對(duì)圖像中的管狀結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢測(cè),然后再對(duì)檢測(cè)出的結(jié)果進(jìn)行精細(xì)分割,從而實(shí)現(xiàn)肺部氣管分割。程遠(yuǎn)熊等[42]利用多尺度Hessian矩陣對(duì)像素點(diǎn)的三維局部特征進(jìn)行分析,從而計(jì)算出像素點(diǎn)隸屬于管狀結(jié)構(gòu)的可能性大小。然后將計(jì)算結(jié)果用于構(gòu)建生長(zhǎng)條件,最后使用三維區(qū)域生長(zhǎng)對(duì)氣管樹進(jìn)行精細(xì)分割。程遠(yuǎn)熊等定義的管狀結(jié)構(gòu)特征為
(1)
式中,λ1、λ2以及λ3分別為Hessian矩陣的3個(gè)特征值。
依據(jù)Hessian矩陣特征值與三維圖像特征對(duì)應(yīng)關(guān)系可知,若一個(gè)像素點(diǎn)屬于氣管區(qū)域,則對(duì)應(yīng)的Hessian矩陣?yán)硐胩卣髦店P(guān)系為0←λ1?λ2≈λ3。即特征值λ1、λ2以及λ3的大小都應(yīng)大于零,并且應(yīng)滿足λ1趨近于零而λ2約等于λ3,同時(shí)λ2與λ3又遠(yuǎn)大于λ1。程遠(yuǎn)熊等利用了上述理論,通過(guò)Hessian矩陣特征值的大小關(guān)系判斷像素點(diǎn)是否屬于氣管區(qū)域,然后通過(guò)閾值常數(shù)δ2剔除偽氣管區(qū)域。該分割方法雖然運(yùn)用了氣管的管狀結(jié)構(gòu)特征,但特征判斷公式較為單一,閾值常數(shù)δ2對(duì)檢測(cè)結(jié)果影響較大,δ2取值過(guò)小則檢出的氣管區(qū)域?qū)p少,反之則假陽(yáng)性率將上升。此外,由于利用了像素點(diǎn)的二階導(dǎo)數(shù)信息,基于Hessian矩陣分析的肺部氣管分割方法往往對(duì)圖像中的噪聲較為敏感。同時(shí)利用基于高斯濾波的多尺度Hessian矩陣分析方法,會(huì)造成氣管壁模糊,使得細(xì)小氣管腔內(nèi)與氣管壁的對(duì)比度下降,從而導(dǎo)致部分細(xì)小氣管被漏檢。因此,針對(duì)上述問(wèn)題,Bauer等在文獻(xiàn)[43]與文獻(xiàn)[44]中提出了改進(jìn)方法。Bauer等的主要分割思想是將氣管整體看作連通的管狀結(jié)構(gòu),采用Krissian等提出的管狀區(qū)域檢測(cè)方法[45],對(duì)潛在的肺部氣管區(qū)域進(jìn)行提取。文獻(xiàn)[43]與文獻(xiàn)[44]的共同之處在于,Bauer等均采用了Krissian等在文獻(xiàn)[45]中提出的管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)算法。該檢測(cè)算法利用像素點(diǎn)Hessian矩陣的特征值與特征向量,構(gòu)建出以該像素點(diǎn)為圓心的一系列圓周點(diǎn),然后通過(guò)插值計(jì)算求出對(duì)應(yīng)圓周點(diǎn)的平均響應(yīng)值,并以此作為該像素點(diǎn)的響應(yīng)值。最后通過(guò)多尺度分析,取該像素點(diǎn)在多尺度空間中的最大響應(yīng)值,以此判定該像素點(diǎn)是否屬于氣管區(qū)域。Krissian等提出的管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)算子為
(2)
式中:I表示原始圖像,R+(x,σ,θ)表示點(diǎn)x在尺度σ下的管狀響應(yīng)值;bi表示在尺度σ下第i個(gè)圓周點(diǎn)在x+θσVai處的響應(yīng)值,其中θ為尺度σ與檢測(cè)半徑的比例值;bi表示該點(diǎn)屬于邊界點(diǎn)的可能性大小,即該點(diǎn)屬于氣管壁區(qū)域的可能性大??;Vai=cos(ai)V1+sin(ai)V2表示第i個(gè)圓周點(diǎn)對(duì)應(yīng)的旋轉(zhuǎn)相量(rotating phasor),用于估算圓周點(diǎn)的位置;V1和V2分別表示Hessian矩陣主曲率方向?qū)?yīng)的兩個(gè)特征向量,對(duì)應(yīng)的特征值關(guān)系為|λ1|>|λ2|。αi=2πi/N代表第i個(gè)圓周點(diǎn)的離散相量角,其中N=[2πσ+1]表示離散圓周點(diǎn)的個(gè)數(shù)。
文獻(xiàn)[43]與文獻(xiàn)[44]的不同之處在于,文獻(xiàn)[43]中Bauer等直接將結(jié)構(gòu)檢測(cè)算子運(yùn)用于原始CT圖像,從而獲取潛在管狀結(jié)構(gòu),然后提取出管狀結(jié)構(gòu)區(qū)域的中軸線。最后以中軸線為基礎(chǔ),通過(guò)角度與半徑限制連接各氣管分枝,從而獲取最終的氣管樹。在文獻(xiàn)[44]中,為了解決高斯濾波在多尺度分析中存在的問(wèn)題,Bauer等首先利用梯度矢量流(gradient vector flow,GVF)的方法[46]獲取氣管壁的GVF幅值場(chǎng),然后再將管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)算子運(yùn)用于GVF幅值場(chǎng),從而獲取潛在的氣管區(qū)域,之后潛在氣管區(qū)域的中軸線被提取。最后以中軸線為基礎(chǔ),Bauer等提出了反向追蹤GVF幅值場(chǎng)的方法分割氣管。在GVF幅值場(chǎng)中氣管壁區(qū)域的幅值最大,向氣管中心與背景區(qū)域延伸的過(guò)程中幅值逐漸減少,最后趨近于零。因此可利用GVF場(chǎng)的幅值由氣管中心區(qū)域向氣管壁區(qū)域遞增的特性,從中軸線上的像素點(diǎn)開(kāi)始,逐步納入像素點(diǎn),從而獲取最終的氣管樹。同時(shí)在GVF幅值場(chǎng)中,不同尺度大小的氣管壁梯度幅值,在指向氣管中心區(qū)域的方向上都得到了延伸。因此可用GVF幅值場(chǎng)代替基于高斯濾波的多尺度分析過(guò)程,避免了高斯濾波帶來(lái)的邊界模糊,同時(shí)也消除了噪聲的影響。文獻(xiàn)[44]中的方法較文獻(xiàn)[43]中的方法,平均氣管分枝數(shù)由146.8上升至152.1,而假陽(yáng)性率由2.44%下降至1.44%。通過(guò)對(duì)比分析可知,管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)算子主要利用了氣管壁的平均梯度信息,受氣管壁斷裂的影響較小,所以兩個(gè)方法均取得了較好的分割結(jié)果。但原始圖像中的噪聲會(huì)對(duì)管狀結(jié)構(gòu)算子的檢測(cè)精度造成影響,造成假陽(yáng)性率上升,同時(shí)高斯濾波也會(huì)造成細(xì)小氣管被漏檢。因此,文獻(xiàn)[44]中Bauer等利用GVF算子有效減少了噪聲與高斯模糊的影響,從而取得了更好的分割結(jié)果。
不同于采用Hessian矩陣分析高階信息的方法,Graham等[47]以及李艷波等[48]將分析重點(diǎn)側(cè)重于氣管影像的二維形狀結(jié)構(gòu)特征。該類方法依舊采用三維區(qū)域生長(zhǎng)方法獲取主支氣管,并對(duì)原始CT圖像利用閾值法獲取包含細(xì)小氣管的初始區(qū)域I,然后通過(guò)判定函數(shù)f(Ai)篩選氣管區(qū)域。最后選取由f(Ai)函數(shù)得到的潛在氣管區(qū)域的3層連續(xù)切層{Ai-1,Ai,Ai+1},計(jì)算由每層氣管區(qū)域質(zhì)心組成的回歸線。接著分別將3個(gè)切層中潛在的氣管區(qū)域投影至回歸線的法平面,依據(jù)3個(gè)投影的區(qū)域重合度以及中心重合度對(duì)潛在氣管進(jìn)行篩選,并最終將提取篩選出的細(xì)小氣管與主支氣管結(jié)合,從而得到最終的氣管樹。用于確定潛在氣管區(qū)域函數(shù)f(Ai)的公式為
(I(x,y,zj)≤-600)
(3)
式中,f(Ai)為判斷函數(shù),I(x,y,zj)代表第j層CT圖像中點(diǎn)(x,y,zj)處的CT值,Ai表示第j層CT圖像中第i個(gè)四連通區(qū)域,而?Ai與|Ai|則分別表示第i個(gè)四連通區(qū)域的邊界與像素點(diǎn)數(shù)目。
式(3)通過(guò)判斷連通域邊界最小CT值與連通域平均CT值的差值大小,篩選出潛在氣管區(qū)域。若f(Ai)>0,則將此四連通區(qū)域判定為有效的潛在氣管區(qū)域。該方法雖然利用了氣管區(qū)域的局部灰度、形狀以及中心點(diǎn)特征,進(jìn)一步提高了氣管的分割效果,但計(jì)算量較大,并且若細(xì)小氣管壁斷裂,細(xì)小氣管區(qū)域?qū)o(wú)法通過(guò)閾值法與肺實(shí)質(zhì)有效的分離,從而導(dǎo)致f(Ai)函數(shù)無(wú)法提取細(xì)小氣管區(qū)域。
基于Hessian矩陣與局部圖像特征的分割方法,都是在圖像域中對(duì)肺部氣管進(jìn)行提取與分割。而Pu等[49]則采用了一種新穎的方式對(duì)肺部氣管進(jìn)行分割。與傳統(tǒng)方法的不同之處在于,Pu等將氣管分割問(wèn)題轉(zhuǎn)換到了幾何空間域,通過(guò)分析不同組織結(jié)構(gòu)的幾何特性對(duì)肺部氣管樹進(jìn)行分割。該方法首先通過(guò)移動(dòng)立方體法(marching cubes algorithm)構(gòu)建肺部的幾何結(jié)構(gòu)模型,即將肺部組織器官轉(zhuǎn)化為三角面片結(jié)構(gòu),然后通過(guò)計(jì)算各三角面片頂點(diǎn)的主曲率和主方向,從肺部幾何結(jié)構(gòu)模型中篩選出氣管區(qū)域。該方法不需要追蹤氣管路徑,幾乎不受氣管壁斷裂以及氣管內(nèi)腔連通性的影響。同時(shí)只需設(shè)置多個(gè)等值面提取閾值,便能構(gòu)建出不同尺度大小的氣管幾何結(jié)構(gòu)模型,所以該方法發(fā)生分割泄漏的情況極少。但從分割結(jié)果可看出,氣管分枝之間存在較明顯的斷裂,分枝間的連通性較差。
基于管狀結(jié)構(gòu)分析的方法主要利用了氣管的局部結(jié)構(gòu)特征與幾何特征,因此較以往的方法具有更好的適用性,能夠依據(jù)分割案例的實(shí)際管狀結(jié)構(gòu)對(duì)氣管進(jìn)行分割。與傳統(tǒng)的方法相比,適應(yīng)性更強(qiáng),發(fā)生泄漏的情況更少,同時(shí)檢測(cè)出的氣管分枝數(shù)也進(jìn)一步提高了。但在圖像分辨率較低,噪聲較多的分割案例中,該類方法會(huì)導(dǎo)致部分細(xì)小氣管被漏檢,并且只利用幾何結(jié)構(gòu)特征對(duì)氣管樹進(jìn)行分割,容易造成氣管分枝間的斷裂。圖3列舉了文獻(xiàn)[44]與文獻(xiàn)[49]中所獲取的部分分割結(jié)果。
圖3 基于管狀結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法獲取的肺部氣管樹分割結(jié)果。(a)文獻(xiàn)[44]中的實(shí)驗(yàn)結(jié)果;(b)文獻(xiàn)[49]中的實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.3 The results obtained by using the method based on detection of tube structure. (a) The result in Ref[44];(b)The result in Ref [49]
基于機(jī)器學(xué)習(xí)的肺部氣管樹分割方法是近年來(lái)的研究重點(diǎn),也是目前為止肺部氣管分割效果最好,假陽(yáng)性率最低的分割方法。研究者主要利用氣管的結(jié)構(gòu)以及灰度等特征,將機(jī)器學(xué)習(xí)的方法運(yùn)用于氣管分割步驟或者泄漏消除步驟。具有代表性的方法為L(zhǎng)o等在文獻(xiàn)[50]中提出的方法。該方法首先利用三維區(qū)域生長(zhǎng)獲取未泄漏與發(fā)生泄漏的分割結(jié)果,然后將兩個(gè)結(jié)果用于訓(xùn)練K最鄰近分類器(k-nearest neighbor,KNN)[51]。同時(shí)采用多尺度Hessian矩陣分析提取分割案例的氣管樹及血管樹軸向方向。最后依據(jù)局部氣管與血管的方向差值,以及分類器的分類結(jié)果分割出最終的氣管樹。因此Lo等提出的分類函數(shù)表達(dá)式為
(4)
圖5 文獻(xiàn)[56]中,氣管分割方法與泄漏剔除方法相結(jié)合的算法示意(Ci表示通過(guò)參數(shù)調(diào)整獲取的第i個(gè)氣管樹;氣管樹中藍(lán)色部分表示氣管區(qū)域,紅色部分代表泄漏區(qū)域;CiΓ表示氣管樹Ci經(jīng)過(guò)泄漏剔除后得到的氣管樹,表示取氣管樹的并集)Fig.5 The overview of the method combined airway segmentation and leakage elimination method in Ref [56] (The stands for the i th airway tree obtained by varying parameters; The airway region is marked in blue and the leakage is marked in red; The is the leakage reduced segmentation, and the indicates the union of all
基于機(jī)器學(xué)習(xí)的方法因?yàn)橐肓擞?xùn)練與學(xué)習(xí)的概念,使得算法能進(jìn)行自主學(xué)習(xí),并對(duì)氣管區(qū)域與非氣管區(qū)域進(jìn)行有效地分類,進(jìn)而能夠有效地剔除分割泄漏。但用于訓(xùn)練分類器的特征以及訓(xùn)練集的選取會(huì)對(duì)分類結(jié)果造成較大的影響,并且目前還未出現(xiàn)特征選取與優(yōu)化問(wèn)題對(duì)氣管分割結(jié)果影響的文獻(xiàn)和報(bào)道。同時(shí),利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法獲取的分割結(jié)果,雖然有最低的假陽(yáng)性率,但檢測(cè)出的氣管分枝數(shù)與氣管長(zhǎng)度還有待進(jìn)一步提升。
筆者依據(jù)主要技術(shù)路線,對(duì)國(guó)內(nèi)外的氣管樹分割方法進(jìn)形了總結(jié)和歸納。為了更好地突出各方法的特性,在表1中進(jìn)一步列舉并對(duì)比了部分具有代表性的方法。
表1代表方法信息統(tǒng)計(jì)
Tab.1Summaryandcomparisonofseveralairwaysegmentationmethod
作者案例數(shù)采用方法分割結(jié)果Kitasaka [17]3ROI劃分區(qū)域生長(zhǎng)6級(jí)氣管Schlathoelter[40]1前向傳播法25%的6級(jí)氣管Bartz [41]22區(qū)域生長(zhǎng)前向傳播法模板匹配法敏感性85%(5級(jí)氣管)敏感性58%(6級(jí)氣管)陽(yáng)性率90%以上Aykac [25]8區(qū)域生長(zhǎng)形態(tài)學(xué)重建閉空間膨脹最高檢測(cè)出10級(jí)氣管全部檢測(cè)出7級(jí)氣管Tschirren [34]22ROI劃分模糊連接度敏感性76.5%Pu [49]75微分幾何法最高分割至11級(jí)氣管Lo [50]15機(jī)器學(xué)習(xí)區(qū)域生長(zhǎng)平均分枝數(shù)12351.2%探測(cè)率Meng [52]50管狀檢測(cè)SVM圖割法平均探測(cè)率為79.1%
從表1中可看出,各方法采用不同的評(píng)價(jià)指標(biāo)對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行了定量分析,其中主要包括氣管分枝數(shù)、氣管級(jí)數(shù)、敏感性以及假陽(yáng)性率等指標(biāo)。因?yàn)闅夤芙馄式Y(jié)構(gòu)復(fù)雜,分枝數(shù)眾多,手動(dòng)分割的金標(biāo)準(zhǔn)難以獲取。因此,在肺部氣管分割技術(shù)的發(fā)展初期,沒(méi)有統(tǒng)一全面的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。采用的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)也各不相同,所以對(duì)各方法進(jìn)行定量比較是十分困難的。但值得一提的是,Lo等在2009年舉辦的EXACT09氣管分割競(jìng)賽中,首次提供了20組訓(xùn)練數(shù)據(jù)以及20組測(cè)試數(shù)據(jù)用于氣管分割[57]。20組測(cè)試數(shù)據(jù)不僅涵蓋了臨床中常見(jiàn)的肺部疾病,用于圖像采集的參數(shù)與機(jī)器也各不相同。同時(shí)EXACT09競(jìng)賽還提出了較為全面的評(píng)價(jià)指標(biāo),包括了氣管總分枝數(shù)、氣管總長(zhǎng)度、泄漏體積以及假陽(yáng)性率。在競(jìng)賽中也涌現(xiàn)出了較多的方法,這些方法以及評(píng)價(jià)指標(biāo)對(duì)后續(xù)的研究產(chǎn)生了較大的影響。通過(guò)對(duì)多年來(lái)國(guó)內(nèi)外的肺部氣管分割方法對(duì)比研究發(fā)現(xiàn),氣管分割方法逐漸從簡(jiǎn)單的灰度分析向管狀結(jié)構(gòu)分析方向發(fā)展,并且正在逐步地引入機(jī)器學(xué)習(xí)的方法。同時(shí),分割結(jié)果的分枝數(shù)與氣管長(zhǎng)度得到了大幅度提升,假陽(yáng)性率也大幅度降低,而且分割結(jié)果的評(píng)價(jià)指標(biāo)也得到了完善。最后,通過(guò)總結(jié)分析發(fā)現(xiàn),限制分割泄漏與更高的氣管探測(cè)率往往是相互矛盾的。因?yàn)閲?yán)格的分割條件雖然限制了泄漏的發(fā)生,但也丟失了潛在的氣管區(qū)域,反之泄漏發(fā)生的概率又將加大。因此,如何在保證假陽(yáng)性率較低的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步提升氣管樹的分割效果,成為了制約肺部氣管樹分割技術(shù)發(fā)展的瓶頸。
基于上述分析可以發(fā)現(xiàn),傳統(tǒng)的分割思想在分割過(guò)程中兼顧氣管分割與泄漏檢測(cè),即在氣管分割過(guò)程中同時(shí)檢測(cè)并防止泄漏的發(fā)生。這樣的分割思想往往會(huì)摒棄許多潛在的氣管區(qū)域,從而造成檢測(cè)出的氣管分枝數(shù)較少。Charbonnier等利用基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方法,對(duì)EXACT09的參賽結(jié)果進(jìn)行泄漏檢測(cè)和消除[56]。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法能夠很好地消除各種類型的泄漏,大大降低了分割結(jié)果的假陽(yáng)性率。實(shí)驗(yàn)證明,泄漏剔除方法可以獨(dú)立于氣管分割方法,且將氣管分割方法與獨(dú)立的泄漏剔除方法相結(jié)合,先進(jìn)行氣管分割再進(jìn)行泄漏剔除,能夠在降低假陽(yáng)性率的同時(shí),使氣管的分割效果進(jìn)一步提高。文獻(xiàn)[56]中泄漏剔除算法的效果如圖6所示。
圖6 文獻(xiàn)[56]中泄漏剔除算法的效果。(a)分割發(fā)生大量泄漏的結(jié)果;(b)剔除泄漏后的氣管樹,紅色箭頭指向區(qū)域?qū)?yīng)(a)中的泄漏區(qū)域Fig.6 The result obtained by using the leakage elimination method in Ref [56]. (a) The leakages in a given airway segmentation; (b) The leakage reduced result, in which the red arrows indicate the corresponding leakages in (a)
因此后續(xù)的氣管分割方法,可以將氣管分割與泄漏檢測(cè)劃分為兩個(gè)相互獨(dú)立的步驟,然后將兩個(gè)獨(dú)立的方法進(jìn)行結(jié)合。即在氣管分割步驟中盡可能多地分割出潛在的氣管區(qū)域,然后再通過(guò)泄漏剔除算法對(duì)分割步驟中產(chǎn)生的泄漏進(jìn)行消除,從而進(jìn)一步提升肺部氣管分割算法的效果。此外,上述分割思想還能適用于低劑量CT的氣管分割。在低劑量CT圖像中噪聲較多且分辨率低,傳統(tǒng)的方法很難在保證敏感性的同時(shí)防止泄漏。因此采用上述分割思想,即便在分割步驟中產(chǎn)生了如圖6所示的大量泄漏,泄漏剔除步驟也會(huì)將大部分典型的泄漏清除。綜上所述,該分割思想保證了敏感性的同時(shí),也降低了分割結(jié)果的假陽(yáng)性率,且能夠適用于各類臨床數(shù)據(jù)。
此外,為進(jìn)一步發(fā)展肺部氣管分割技術(shù),還可結(jié)合以下領(lǐng)域進(jìn)行研究:一是結(jié)合血管分割領(lǐng)域的方法,將新的管狀結(jié)構(gòu)提取與增強(qiáng)方法運(yùn)用于氣管分割;二是將深度學(xué)習(xí)進(jìn)一步運(yùn)用于氣管的分割和泄漏檢測(cè)步驟中,同時(shí)研究氣管特征的提取以及特征的篩選與優(yōu)化,從而進(jìn)一步提高分類結(jié)果的準(zhǔn)確性;三是建立肺部氣管樹金標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù),為比較研究氣管分割方法提供便利。