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        我國科學(xué)家首次揭示西瓜與甜瓜“甜蜜基因”

        2019-01-05 12:18:59
        世界熱帶農(nóng)業(yè)信息 2019年11期
        關(guān)鍵詞:基因組研究西甜瓜中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院

        作為甜蜜美味的世界性水果,西瓜與甜瓜同屬于葫蘆科植物。在沒有被人類馴化以前,絕大多數(shù)甜瓜與西瓜并不甜,西甜瓜的味道、外觀和果肉顏色與現(xiàn)在西甜瓜相差甚遠(yuǎn)。最近,我國科學(xué)家揭示了西瓜與甜瓜的“甜蜜基因”。

        北京時(shí)間11 月2 日零點(diǎn),《自然-遺傳學(xué)》以兩篇長文形式在線發(fā)表了2 項(xiàng)由我國科學(xué)家主導(dǎo)的瓜類作物基因組研究成果,并同時(shí)刊發(fā)了相應(yīng)的專評和社評。兩項(xiàng)研究分別構(gòu)建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實(shí)品質(zhì)的遺傳分子機(jī)制。據(jù)介紹,上述兩項(xiàng)研究是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所、北京市農(nóng)林科學(xué)院及中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所協(xié)同創(chuàng)新的成果。

        中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所徐永陽研究員介紹,其所在團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國農(nóng)科院(深圳)農(nóng)業(yè)基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心、青島農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)科院蔬菜花卉研究所、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、美國康奈爾大學(xué)、法國農(nóng)業(yè)科學(xué)院等19 個(gè)國內(nèi)外科研機(jī)構(gòu),歷時(shí)5 年,共同構(gòu)建了世界第一個(gè)甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統(tǒng)闡釋了甜瓜的復(fù)雜馴化歷史及重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。

        甜瓜研究團(tuán)隊(duì)分析了千余份甜瓜種質(zhì)資源的基因組變異,共鑒定了560 萬個(gè)SNP。群體結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),甜瓜至少經(jīng)歷過3 次獨(dú)立的馴化事件(兩次發(fā)生在印度,一次發(fā)生在非洲)。厚皮甜瓜和薄皮甜瓜亞種分別是從印度不同的野生群體馴化而來的。3 次獨(dú)立馴化有著“ 異曲同工”之處,都導(dǎo)致野生甜瓜苦味和酸味的喪失、甜味的出現(xiàn)。此外,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析等手段,定位了200 余個(gè)與甜瓜苦味、酸味、果實(shí)大小、果肉顏色等性狀相關(guān)的候選基因和位點(diǎn)。

        北京市農(nóng)林科學(xué)院許勇團(tuán)隊(duì)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹所劉文革團(tuán)隊(duì)、美國康奈爾大學(xué)Boyce Thompson 研究所費(fèi)章君團(tuán)隊(duì)和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所黃三文團(tuán)隊(duì)等組成聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì),采用單分子測序、光學(xué)圖譜與Hi-C 三維基因組聯(lián)合分析,完成了全新一代西瓜基因組高質(zhì)量精細(xì)圖譜繪制。這是迄今為止最高質(zhì)量的西瓜基因組序列圖譜。

        西瓜攻關(guān)團(tuán)隊(duì)繼而對400 多份種質(zhì)資源開展了基因組變異分析,共鑒定2 000 萬個(gè)SNP。在此基礎(chǔ)上,首次明確了西瓜7 個(gè)種之間的進(jìn)化關(guān)系,發(fā)現(xiàn)野生黏籽西瓜是與現(xiàn)代栽培西瓜親緣關(guān)系最近的種群,也發(fā)現(xiàn)了利用野生西瓜進(jìn)行抗性改良的基因組痕跡。此外,鑒定獲得了與果實(shí)含糖量、瓤色、形狀等性狀關(guān)聯(lián)的43個(gè)信號位點(diǎn),提供了關(guān)鍵候選基因。

        我國是西瓜與甜瓜的生產(chǎn)大國,同時(shí)也是消費(fèi)大國。國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家、北京市農(nóng)林科學(xué)院許勇研究員表示,技術(shù)革新必將催生農(nóng)產(chǎn)品新品種的誕生并推動(dòng)西瓜與甜瓜產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。

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