DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和mRNA中的N6-甲基腺苷(m6A)的修飾形式,通常會(huì)攜帶用于調(diào)控基因表達(dá)的信息,之前研究表明,DNA的5mC參與了果實(shí)成熟的調(diào)節(jié),而mRNA的m6A修飾在該過(guò)程中的功能以及5mC和m6A之間的相互作用,仍然知之甚少!
2019年8月6日,《Genome Biology》在線發(fā)表了來(lái)自中國(guó)科學(xué)院植物研究所題為“RNA methylomes reveal the m6A-mediated regulation of DNA demethylase geneSlDML2in tomato fruit ripening”的研究論文,該研究揭示了mRNA中m6A甲基化在番茄果實(shí)成熟期間表現(xiàn)出類似于DNA甲基化的動(dòng)態(tài)變化。
該研究通過(guò)RNA甲基化組分析顯示m6A甲基化是番茄果實(shí)mRNA中的普遍修飾,并且m6A位點(diǎn)在終止密碼子周圍和3'非翻譯區(qū)內(nèi)富集。成熟缺陷的Cnr突變體果實(shí)中m6A甲基化的總體增加與RNA去甲基酶基因SlALKBH2的表達(dá)降低相關(guān)。該研究表明DNA甲基化通過(guò)靶向甲基酶基因SlALKBH2影響mRNA的m6A甲基化,而SlALKBH2又通過(guò)反饋環(huán)作用于SlDML2(番茄果實(shí)成熟所需的DNA去甲基化酶基因)以調(diào)節(jié)果實(shí)成熟。
該研究確定了關(guān)鍵成熟基因的一個(gè)新的基因調(diào)控層,并在果實(shí)成熟過(guò)程中建立了DNA甲基化和mRNA m6A甲基化之間的聯(lián)系。