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        RNA結(jié)合蛋白Rbm24的功能研究進展

        2018-12-25 08:05:40孔淑慧成海建姜富貴王亞芳張清峰宋恩亮
        草食家畜 2018年6期
        關(guān)鍵詞:肌細胞骨骼肌分化

        孔淑慧 ,成海建 ,姜富貴 ,王亞芳 ,張清峰 ,宋恩亮 *

        (1.山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,濟南 250100;2.山東省畜禽疫病防治與繁育重點實驗室,濟南 250100;3.山東省畜禽健康養(yǎng)殖工程技術(shù)中心,濟南 250100)

        RNA結(jié)合蛋白(RBPs)可以結(jié)合單鏈或者雙鏈RNAs,對調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄后基因的表達和組織特異性可變剪接有重要作用[1]。Rbm24作為RBPs家族一員,在不同脊椎動物中的氨基酸序列十分保守,且高度保守地表達在心臟、體節(jié)、晶狀體和耳囊中[2]。研究發(fā)現(xiàn),Rbm24在心臟和骨骼肌發(fā)育和分化過程中是必不可少的:通過與靶基因RNA的3’UTR或5’UTR結(jié)合調(diào)節(jié)mRNA的穩(wěn)定性,或者調(diào)控靶基因的可變剪接產(chǎn)生不同的剪接變體,以保證細胞的正常形成和功能[2-5]。近來的研究發(fā)現(xiàn),Rbm24在抗癌癥[6]、抗巨腸癥[7]和調(diào)控病毒復(fù)制[8,9]方面也發(fā)揮重要作用。本文就RNA結(jié)合蛋白Rbm24的功能研究進展予以綜述。

        1 Rbm24的結(jié)構(gòu)

        RBPs參與RNA的轉(zhuǎn)錄、編輯、剪接、運輸和定位、穩(wěn)定性與翻譯等生物學(xué)過程[1]。伴隨RNA結(jié)合蛋白轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制的廣泛報道,越來越多的學(xué)者專注于其功能的探究。證據(jù)表明,RBPs與多種人類疾病相關(guān)[10]。心臟特異的RBPs是導(dǎo)致心臟疾病的主要致病因子之一,如Rbm20,是最早發(fā)現(xiàn)的與心臟疾病相關(guān)的RBPs,主要參與調(diào)控Titin轉(zhuǎn)錄后mRNA的可變剪接,Titin可變剪接異常與人類的擴張型心肌病和心臟衰竭相關(guān)[11-14]。研究發(fā)現(xiàn),心臟特異的可變剪接因子Rbm24也參心臟病的發(fā)生。

        RNPs與單鏈或雙鏈RNAs的結(jié)合是通過其RNA結(jié)合域 (RBDs),RBDs包括RRM、KH結(jié)構(gòu)域和鋅指結(jié)構(gòu)域等。Rbm24的N末端有一個高度保守的RRM,RRM是最常見并且最典型的RBDs。Rbm24的RRM由RNP1和RNP2兩個亞基構(gòu)成[15],且從線蟲到人都高度的保守[16],暗示Rbm24在不同物種中發(fā)揮功能的保守性。

        由于基因倍增的緣故,斑馬魚中有兩個Rbm24基因,分別是位于19號染色體的Rbm24a和位于16號染色體的Rbm24b。在斑馬魚中,Rbm24a是母源表達基因[3]。從受精后10 h開始,Rbm24a和rbm24b在心臟原基和新形成的體節(jié)中逐漸表達;從受精后20 h起,Rbm24a在晶狀體中表達,而Rbm24b在晶狀體中沒有表達[3,17]。因此,斑馬魚的Rbm24a基因與小鼠、非洲爪蛙等其他脊椎動物的rbm24基因的表達圖式是高度保守的[2-4,16]。通過DNAMAN等生物信息學(xué)軟件分析表明,不同物種Rbm24氨基酸序列高度保守:不僅在小鼠和人中保守,在豬、牛等家畜中也非常的保守,尤其是在RRM區(qū)域(如圖1)。氨基酸序列比對分析表明,小鼠Rbm24與人、豬、牛、雞、非洲爪蛙、斑馬魚和馬Rbm24同源性依次為:98.73%、98.31%、98.31%、91.56%、89.50%、82.28%、77.12%。其氨基酸序列的保守性暗示其在不同物種中的功能也相對保守。對于Rbm24功能的研究,目前主要集中在調(diào)控骨骼肌和心肌細胞發(fā)育和分化方面,對肌節(jié)組裝和心臟收縮具有重要作用[2-5]。

        圖1 小鼠與其他物種Rbm24氨基酸序列比較分析

        2 Rbm24的功能

        2.1 Rbm24與心臟的分化和發(fā)育

        研究發(fā)現(xiàn),RNA剪接是心臟功能正常的基礎(chǔ),心臟關(guān)鍵基因的可變剪接異常可導(dǎo)致心臟疾病的發(fā)生和惡化[18-20]。已有多個RBPs引發(fā)的可變剪接異常被證明在心臟疾病的發(fā)生和惡化過程中起著關(guān)鍵作用,例如RBM20突變體能引發(fā)多個心臟基因,如Titin、CamkIIδ和RyR2等的錯誤剪接導(dǎo)致早發(fā)性擴張型心肌病[11]。最近研究發(fā)現(xiàn),Rbm24在心肌細胞分化[21,22]、形成[3,4]、增殖[23]、纖維化[24]等環(huán)節(jié)起更加重要作用。Rbm24通過將胚胎干細胞多能性剪接變體向組織特異性剪接變體的轉(zhuǎn)變,降低胚胎干細胞的多能性,促進細胞向特異方向的分化,從而誘導(dǎo)心肌細胞形成[21,22]。在小鼠的心臟發(fā)育過程中,Rbm24調(diào)控了至少68種可變剪接事件,其中Naca、Fxr1和Abcc9的可變剪接已被證明是心臟發(fā)育、肌節(jié)形成和心肌病的基礎(chǔ)[4],可見Rbm24在心臟分化和發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用。

        2.2 Rbm24與骨骼肌分化和發(fā)育

        骨骼肌是一個具有大量可變剪接事件的組織,肌肉特異蛋白剪接變體的表達對肌肉的發(fā)育和功能是必須的[25,26]。在骨骼肌的分化過程中,基因的表達在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平受到嚴格的調(diào)控。Rbm24在骨骼肌肌細胞的分化[2,27,28]、形成和再生[29-31]過程中發(fā)揮重要作用。敲低Rbm24后,阻礙非洲爪蛙肌細胞的形成[5],導(dǎo)致斑馬魚體節(jié)發(fā)育異常[17],在小鼠中條件性敲除Rbm24后則導(dǎo)致肌小節(jié)M帶的缺失[4]。以上結(jié)果表明,Rbm24在骨骼肌分化和發(fā)育過程中具有重要作用。

        2.3 Rbm24與鼻咽癌

        鼻咽癌(NPC)是一種高度惡性的腫瘤,經(jīng)常侵入鄰近區(qū)域并轉(zhuǎn)移到局部淋巴結(jié)和比較遠的器官。盡管鼻咽癌早期可以進行放射性治療,但是治療結(jié)果并不可觀[32,33]。轉(zhuǎn)移相關(guān)的肺腫瘤轉(zhuǎn)錄因子MALAT1在多種人類腫瘤中高度表達,能夠促進CNE-1細胞的增殖、遷移和入侵[34],其下調(diào)則起到相反的效果[35]。在NPC中,Rbm24作為一個新的NPC腫瘤抑制因子,通過上調(diào)miR-25促進靶基因MALAT1通過依賴Argonaute2(Ago2)的方式降解,抑制腫瘤發(fā)生和入侵[6]。

        2.4 Rbm24與巨結(jié)腸癥

        先天性巨結(jié)腸癥(HSCR)是出生時腸神經(jīng)系統(tǒng)紊亂最常見的疾病,發(fā)病率為五千分之一到二千分之一,這種神經(jīng)發(fā)育性出生缺陷是由于腸基層和包括不同胃腸道區(qū)域的粘膜下叢缺乏壁內(nèi)神經(jīng)節(jié)細胞所致[36]。因此,任何腸神經(jīng)脊細胞(ENCCs)的存活、增殖或遷移異常都會導(dǎo)致遠端腸道神經(jīng)節(jié)細胞缺乏癥[37]。研究發(fā)現(xiàn),在HSCR患者中,MIR143HG表達上調(diào),上調(diào)MIR143HG則促進Rbm24的表達,過表達的Rbm24將更多的富集在細胞核;然而,Rbm24在細胞核中既可與MIR143HG mRNA結(jié)合通過降低其轉(zhuǎn)錄本的半衰期降低其穩(wěn)定性,又可促進Ago2介導(dǎo)的RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)與MIR143HG mRNA的結(jié)合促進其降解。因此MIR143HG與Rbm24形成一個負反饋環(huán)調(diào)控HSCR[7],以維持細胞的內(nèi)穩(wěn)態(tài)[38]。

        2.5 Rbm24與肝炎

        丙型肝炎病毒(HCV)的基因組RNA釋放進入細胞質(zhì)后,首先作為模板進行蛋白質(zhì)的合成,蛋白質(zhì)合成結(jié)束后則進行RNA的復(fù)制,RNA的復(fù)制起始于基因組RNA作為模板合成的反義RNA鏈。但是,這種從翻譯向復(fù)制的協(xié)調(diào)轉(zhuǎn)換機制并不清楚。基因系列分析發(fā)現(xiàn),感染丙型肝炎病毒(HCV)后,Rbm24表達上調(diào),其通過與HCV 5’UTR結(jié)合抑制60S核糖體的招募,影響80S核糖體的組裝,進而抑制HCV的翻譯;同時,Rbm24通過連接HCV的 5’UTR和3’UTR促進HCV的復(fù)制。敲低Rbm24的表達則增強和延長HCV的翻譯,并使從翻譯向復(fù)制的開關(guān)延遲。以上結(jié)果表明,Rbm24抑制HCV的翻譯,促進復(fù)制,并在調(diào)控病毒從翻譯到復(fù)制的開關(guān)方面具有重要作用[8]。在感染HBV病毒的肝癌細胞系中的研究發(fā)現(xiàn),合適的Rbm24水平是HBV正常復(fù)制的必須,敲低或者過表達Rbm24均降低HBV的復(fù)制。究其原因,一方面是Rbm24主要通過其RNP1和RNP2與乙型肝炎病毒RNA的3’UTR相互作用增強乙型肝炎病毒RNA的穩(wěn)定性;另一方面是Rbm24主要通過其RRM與乙型肝炎病毒前基因組RNA(pgRNA)的5’UTR相互作用阻礙pgRNA上80S核糖體的組裝進而抑制核心蛋白的翻譯[9]。以上結(jié)果表明Rbm24是調(diào)控病毒復(fù)制與翻譯的重要宿主基因,盡管其調(diào)控機制尚不清晰。

        3 Rbm24的可能調(diào)控機制

        3.1 調(diào)控mRNA的穩(wěn)定性

        Rbm24對mRNA穩(wěn)定性的調(diào)控主要是通過其RRM與mRNA的3’UTR結(jié)合,延長或縮短mRNA的半衰期:如在骨骼肌發(fā)育方面,Rbm24結(jié)合肌細胞分化因子Myogenin成熟mRNA的3’UTR,通過延長其半衰期增強其穩(wěn)定性和促進骨骼肌細胞的分化[2,27,28]。另外,Rbm24也通過類似的原理調(diào)控p21和p63的表達:增強p21 mRNA的穩(wěn)定性上調(diào)p21的表達[15],降低p63 mRNA的穩(wěn)定性下調(diào)p63的表達[39]。Rbm24在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性方面,除結(jié)合mRNA的3’UTR之外,還可以結(jié)合CDS區(qū),如在心臟發(fā)育方面,Rbm24可與chrm2 mRNA的CDS結(jié)合降低其穩(wěn)定性[40]。

        3.2 調(diào)控mRNA的可變剪接

        在心臟分化和發(fā)育過程中,Rbm24作為可變剪接調(diào)控因子調(diào)控多個基因的可變剪接,且大部分是促進肌肉特異外顯子的包含,如胚胎期小鼠基因Naca、Fxr1、Abcc9[4],成年小鼠心臟基因Pln、Pdlim5和Ttn[41],以及enh1[23],其可變剪接異常均可導(dǎo)致不同程度的心臟疾病。研究發(fā)現(xiàn),Rbm24對心臟基因可變剪接調(diào)控可能是依賴于Stk38對Rbm24的磷酸化和穩(wěn)定性的調(diào)控,敲低Stk38的表達則降低心肌細胞中Rbm24的蛋白水平和依賴于Rbm24的可變剪接事件,導(dǎo)致肌節(jié)蛋白的下調(diào)和肌節(jié)組裝異常[42]。在骨骼肌分化和發(fā)育過程中,Rbm24同樣調(diào)控了多個基因的可變剪接事件,如Coro6、Fxr1和NACA,其可變剪接異常則影響肌細胞的正常形成和發(fā)育[4]。Rbm24對骨骼肌基因的可變剪接調(diào)控是受控于miR-222的,miR-222可以結(jié)合Rbm24 mRNA 3’UTR中的結(jié)合位點Rb-1和Rb-2,進而調(diào)控Rbm24的表達[43]。過表達miR-222則下調(diào)Rbm24的表達,影響肌細胞的融合和肌細胞中Coro6、Fxr1和NACA的可變剪接[43]。

        4 總 結(jié)

        Rbm24作為一個轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子,通過多種途徑在心臟和骨骼肌分化和發(fā)育、抗癌癥、抗巨結(jié)腸癥和調(diào)控病毒復(fù)制和翻譯方面發(fā)揮重要作用。目前對于其在心臟和骨骼肌分化和發(fā)育方面的功能研究比較深入,主要是調(diào)控靶基因mRNA的穩(wěn)定性或前體RNA的可變剪接。盡管Rbm24在牛、羊、馬等家畜中研究甚少,但其氨基酸序列和在脊椎動物中調(diào)控肌細胞分化和發(fā)育的保守性暗示其對提升家畜肉質(zhì)和增加肉產(chǎn)量具有潛在的價值,而其在病毒復(fù)制和翻譯方面的研究也將為畜禽疫病的防治提供參考依據(jù)。

        Rbm24還可結(jié)合大量參與調(diào)控細胞骨架、泛素化調(diào)節(jié)的蛋白質(zhì)水解、癌癥和黏著斑等相關(guān)基因,但相關(guān)的研究還比較少。在脊椎動物中,Rbm24除了保守地表達在心臟和骨骼肌外,還特異地表達在晶狀體和耳囊中。但是,Rbm24在晶狀體和耳囊的發(fā)生和發(fā)育方面的功能卻鮮有報道,其是否也作為組織特異性可變剪接因子調(diào)控相關(guān)基因的可變剪接,還是通過調(diào)控相關(guān)基因mRNA的穩(wěn)定性調(diào)控表達,亦或有其他新的調(diào)控機制,還有待相關(guān)研究。

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