亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        玉米赤霉烯酮降解酶ZHD795編碼基因克隆及降解活性研究

        2018-12-06 13:00:08柴成梁常曉嬌王楠希孫長(zhǎng)坡
        關(guān)鍵詞:毒素基因組測(cè)序

        柴成梁, 常曉嬌, 王楠希, 孫 晶, 孫長(zhǎng)坡

        (國(guó)家糧食和物質(zhì)儲(chǔ)備局科學(xué)研究院, 北京 100037)

        玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEN)是世界上污染范圍最廣的一種鐮刀菌毒素,具有強(qiáng)烈的雌性激素毒性及致癌性,嚴(yán)重威脅著人和動(dòng)物的健康[1-3],其主要污染的糧食作物包括玉米、大麥、小麥、高粱和黑麥等[4-6]。

        ZEN的化學(xué)名稱為6-(10-羥基-6氧基-十一碳烯基)β-雷鎖酸內(nèi)酯。ZEN能引起人畜中毒的原因是其結(jié)構(gòu)與雌性激素雌二醇(estradiol)的結(jié)構(gòu)相似,能競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合動(dòng)物細(xì)胞膜上的雌激素受體(estrogen receptor,ER)[7-10]。此生物活性主要是由ZEN的內(nèi)酯鍵結(jié)構(gòu)及4位碳原子的羥基引起[11],因此,破壞這些結(jié)構(gòu)可視為對(duì)ZEN的有效脫毒[12]。粉紅粘帚霉IFO 7063被發(fā)現(xiàn)可催化打開(kāi)ZEN的內(nèi)酯鍵[13],并且,負(fù)責(zé)此催化反應(yīng)的內(nèi)酯酶基因ZHD101被成功克隆[14]。目前,ZHD101蛋白的三維結(jié)構(gòu)已經(jīng)解析出,明確了ZHD101與ZEN分子的結(jié)合方式[15],為ZHD101在消減糧食中的ZEN污染提供了重要基礎(chǔ)。然而,應(yīng)用ZHD101水解酶降解糧食中的ZEN毒素,常涉及高溫、高鹽、強(qiáng)酸等條件,在如此苛刻的工業(yè)環(huán)境下,ZHD101酶活性極低甚至消失,無(wú)法消除糧油食品中的ZEN污染。因此,需要發(fā)掘新的ZEN降解微生物以及降解酶,明確此類降解酶的催化機(jī)理,提高酶的催化活性及在工業(yè)條件下的適應(yīng)性,為有效消除糧食中的ZEN污染提供基礎(chǔ)。本研究旨在開(kāi)發(fā)新的ZEN高效降解酶,并試圖理解此類降解酶的催化反應(yīng)機(jī)理,為消減ZEN提供理論依據(jù)。

        1 實(shí)驗(yàn)部分

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        1.1.1樣品采集

        篩選ZEN降解菌的樣品是采集于四川省的小麥麩皮,樣品采集后置于4℃冰箱中保存、備用;篩選ZEN降解菌用的毒素管為含有10 μg ZEN毒素標(biāo)準(zhǔn)品的2 mL EP管。

        1.1.2試劑及培養(yǎng)基

        用于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的引物由金唯智生物科技有限公司合成;用于分子克隆的酶購(gòu)買(mǎi)于Invitrogen公司;ZEN標(biāo)準(zhǔn)品購(gòu)買(mǎi)于Sigma公司;培養(yǎng)基及其他生化試劑購(gòu)自中科天銳(北京)科技有限公司。

        無(wú)機(jī)鹽培養(yǎng)基(MSM):MgSO4·7H2O 0.2 g,(NH4)2SO40.5 g,CaCl2·2H2O 0.066 g,Na2HPO4·12H2O 6.15 g,KH2PO41.52 g,加去離子水定容至1 L,調(diào)pH值至6.8。

        LB培養(yǎng)基:酵母提取物5 g,胰蛋白胨10 g,NaCl 10 g,加去離子水定容至1 L,于121 ℃滅菌20 min,固體培養(yǎng)基加1.5%的瓊脂粉。

        馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基:稱取200 g馬鈴薯切成小塊,加水煮沸20~30 min,用6層紗布過(guò)濾,加入葡萄糖,攪拌均勻,稍冷卻后再補(bǔ)足水分至1000 mL,分裝, 115 ℃滅菌20 min。

        1.2 儀器與設(shè)備

        高速離心機(jī),美國(guó)貝克曼公司;e2695型高效液相色譜儀、2475型熒光檢測(cè)器、xbridge C18型色譜柱,美國(guó)Waters公司; 6510型Q-TOF LC/MS,美國(guó)Agilent公司;親和層析柱,中科天銳(北京)科技有限公司;核酸蛋白電泳儀及凝膠成像儀,美國(guó)Bio-Rad公司;PCR儀,美國(guó)ABI公司;恒溫?fù)u床,上海知楚儀器有限公司;紫外可見(jiàn)分光光度計(jì),賽默飛世爾公司。

        1.3 實(shí)驗(yàn)方法

        1.3.1ZEN降解菌的篩選

        稱取小米麩皮樣品5 g,加到離心管(50 mL)中,加入30 mL無(wú)菌水振蕩混勻,使樣品中的微生物充分懸浮于水中,放于離心管架上靜置1 h;在超凈工作臺(tái)中吸取上清液100 μL于ZEN毒素管中,加入400 μL MSM培養(yǎng)基,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)15 d后,吸取100 μL菌液于新的ZEN毒素管中,再培養(yǎng)15 d,如此富集培養(yǎng)3次。吸10 μL培養(yǎng)的菌液,涂布MSM平板,30 ℃培養(yǎng);挑取平板上長(zhǎng)出的單菌落于ZEN毒素管中培養(yǎng)15 d,用高效液相色譜(HPLC)檢測(cè)菌株對(duì)ZEN的降解效果。

        1.3.2ZEN降解菌株的基因組測(cè)序

        采用第三代納米孔單分子測(cè)序技術(shù)(測(cè)序平臺(tái): Pacific Biosciences RS II),對(duì)降解菌株的全基因序列信息進(jìn)行測(cè)定,通過(guò)對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)結(jié)果的組裝與注釋,得到了該降解菌株的基因組編碼序列信息。以ZHD101序列為模板,與測(cè)序得到的基因組編碼序列進(jìn)行序列比對(duì)。

        1.3.3ZHD795重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建

        委托上海英濰捷基生物公司對(duì)ZHD795基因進(jìn)行化學(xué)全合成。以合成的ZHD795基因?yàn)槟0?,進(jìn)行PCR體外擴(kuò)增。利用核酸瓊脂糖凝膠電泳回收Z(yǔ)HD795基因,經(jīng)限制性內(nèi)切酶雙酶切后連入PET30a載體,并轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,篩選得到陽(yáng)性重組子。

        1.3.4ZHD795重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及純化

        擴(kuò)大培養(yǎng)ZHD795重組子,經(jīng)IPTG誘導(dǎo),過(guò)夜表達(dá)ZHD795蛋白。高速離心收集菌體,加入重懸液后超聲破碎,高速離心后去除菌體,上清液利用親和層析純化ZHD795蛋白,并用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)進(jìn)行ZHD795蛋白的表達(dá)純化分析。

        1.3.5ZEN降解酶活性測(cè)定

        取純化后的ZHD795蛋白,加入到ZEN毒素管中,放入37 ℃培養(yǎng)箱中,反應(yīng)3 h后,終止反應(yīng),用高效液相色譜檢測(cè),根據(jù)ZEN色譜峰的變化來(lái)判斷ZHD795蛋白對(duì)ZEN是否具有降解活性;同時(shí),以水代替ZHD795蛋白作為反應(yīng)對(duì)照。經(jīng)由HPLC檢測(cè),對(duì)照樣品與反應(yīng)樣品的ZEN色譜峰面積之差,即為由ZHD795蛋白催化反應(yīng)掉的ZEN分子。

        1.3.6ZHD795與ZHD101對(duì)ZEN降解活性的比較

        將表達(dá)純化的ZHD795與ZHD101降解酶稀釋至相同濃度,按照已構(gòu)建好的酶活反應(yīng)體系進(jìn)行催化降解反應(yīng);經(jīng)由HPLC檢測(cè),比較2個(gè)蛋白酶對(duì)ZEN的降解活性高低。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ZEN降解菌株活性分析

        從四川省采集的小麥麩皮樣品,在以ZEN為碳源的無(wú)機(jī)鹽培養(yǎng)基中富集培養(yǎng),經(jīng)HPLC檢測(cè),得到一株ZEN降解菌,如圖1。

        圖1 篩選得到的ZEN降解菌株Fig.1 Screening of microorganism degrading ZEN

        2.2 ZEN降解菌株基因組序列分析

        通過(guò)對(duì)降解菌株的全基因組測(cè)序,組裝得到了38.98 Mb的序列信息,注釋得到12 555個(gè)編碼基因序列;將此基因組序列信息與ZHD101進(jìn)行比對(duì),得到了同源性為62%的同源蛋白ZHD795。

        2.3 ZHD795蛋白酶的表達(dá)純化分析

        ZHD795基因通過(guò)PCR方法擴(kuò)增后,運(yùn)用核酸瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離回收,結(jié)果如圖2。

        1泳道是目的基因ZHD;M為DNA Marker。圖2 ZHD795基因瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.2 Agarose gel electrophoresis of ZHD795 gene

        將ZHD795基因轉(zhuǎn)入大腸桿菌BL21進(jìn)行ZHD795蛋白表達(dá),運(yùn)用親和層析法純化目的蛋白,并用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)進(jìn)行ZHD795蛋白的表達(dá)純化分析,結(jié)果如圖3。

        1泳道是表達(dá)ZHD795蛋白的菌體超聲破碎后的樣品;2泳道是高速離心后的上清樣品;3、4泳道是從Ni-NTA親和柱上洗脫下來(lái)的樣品;M是Protein Marker。圖3 ZHD795蛋白聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig.3 SDS-PAGE of ZHD795 protein

        2.4 ZHD795蛋白對(duì)ZEN的降解活性分析

        取ZHD795蛋白液100 μL,加入到ZEN毒素管中作為反應(yīng)組,以水代替ZHD795蛋白加入ZEN毒素管作為對(duì)照組,在37 ℃培養(yǎng)箱反應(yīng)6 h后,終止反應(yīng)。HPLC檢測(cè)結(jié)果如圖4。圖4中對(duì)照組樣品在保留時(shí)間為8.715 min處有強(qiáng)吸收峰,而反應(yīng)組樣品基本無(wú)ZEN目標(biāo)峰檢出。

        在保留時(shí)間8.715 min處,無(wú)吸收峰的是反應(yīng)組樣品,有吸收峰的是對(duì)照組樣品。圖4 HPLC檢測(cè)ZHD795對(duì)ZEN的降解活性Fig.4 Detection of degradation activity of ZHD795 to ZEN determined by HPLC

        將ZHD795蛋白和ZHD101蛋白均稀釋至質(zhì)量濃度為2.0×10-3mg/mL,加入ZEN毒素管中反應(yīng)30 min后終止反應(yīng)。HPLC檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖5。經(jīng)吸收峰面積計(jì)算,在30 min內(nèi),ZHD795對(duì)ZEN的降解率為96%,而ZHD101對(duì)ZEN的降解率為37%;ZHD795對(duì)ZEN的降解酶活為ZHD101的2.5倍。

        圖5 ZHD795與ZHD101對(duì)ZEN降解活性比較Fig.5 Comparation of degradation activity of ZEN by ZHD795 and ZHD101

        3 結(jié) 論

        ZEN降解酶ZHD101能催化打開(kāi)ZEN分子的內(nèi)酯鍵,降解產(chǎn)物無(wú)毒性,是具有應(yīng)用前景的ZEN降解酶。如何提高ZEN降解酶的催化活性及在工業(yè)條件下的適應(yīng)性,是需要解決的問(wèn)題。

        本研究通過(guò)大量的篩選工作,在小麥麩皮樣品中篩選得到一株能高效降解ZEN毒素的微生物菌株;通過(guò)第三代納米孔單分子測(cè)序技術(shù)進(jìn)行該菌株的全基因組測(cè)序,得到了該菌株的全基因組序列信息;通過(guò)與ZEN降解酶ZHD101進(jìn)行序列比對(duì),得到了一個(gè)同源性為62%的基因ZHD795,通過(guò)構(gòu)建ZHD795基因原核表達(dá)體系,重組表達(dá)純化得到ZHD795蛋白。構(gòu)建ZHD795蛋白對(duì)ZEN的降解活性檢測(cè)體系,檢測(cè)結(jié)果表明ZHD795蛋白可降解ZEN毒素分子。通過(guò)ZHD795與ZHD101對(duì)ZEN的降解活性比較,明確了ZHD795對(duì)ZEN的降解酶活為ZHD101的2.5倍,從而得到了一個(gè)高效的ZEN降解酶。

        ZHD101屬于α/β水解酶家族,其活性中心包含α/β水解酶典型的催化三聯(lián)體——酸- 堿- 親核三聯(lián)體,即Ser102- His242- Glu126,此催化三聯(lián)體殘基在一級(jí)序列中離得很遠(yuǎn),但在三維結(jié)構(gòu)中它們折疊到一起,發(fā)揮催化活性。通過(guò)一級(jí)序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),ZHD795也存在此催化三聯(lián)體,下一步工作要解析ZHD795蛋白酶的三維結(jié)構(gòu),解析其催化反應(yīng)機(jī)理,并與ZHD101進(jìn)行結(jié)構(gòu)比對(duì),揭示造成2個(gè)降解酶對(duì)ZEN分子降解活性存在高低差異的原因,明確此類降解酶與ZEN的結(jié)合方式和催化特點(diǎn),進(jìn)一步通過(guò)分子改造提高此類降解酶對(duì)ZEN的催化活性及工業(yè)條件的適應(yīng)性,為消減糧食及其副產(chǎn)物中的ZEN污染提供切實(shí)可行的技術(shù)支撐。

        猜你喜歡
        毒素基因組測(cè)序
        杰 Sir 帶你認(rèn)識(shí)宏基因二代測(cè)序(mNGS)
        新民周刊(2022年27期)2022-08-01 07:04:49
        What Makes You Tired
        牛參考基因組中發(fā)現(xiàn)被忽視基因
        二代測(cè)序協(xié)助診斷AIDS合并馬爾尼菲籃狀菌腦膜炎1例
        傳染病信息(2021年6期)2021-02-12 01:52:58
        一類具有毒素的非均勻chemostat模型正解的存在性和唯一性
        毒蘑菇中毒素的研究進(jìn)展
        嚴(yán)苛標(biāo)準(zhǔn)方能清洗校園“毒素”
        基因捕獲測(cè)序診斷血癌
        單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展
        基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化
        遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:58:49
        国产精品国产三级厂七| 欧美一区二区三区久久综| 新视觉亚洲三区二区一区理伦 | 国产午夜视频高清在线观看| 伊人久久大香线蕉av不变影院| 国产精品久久三级精品| 亚洲毛片免费观看视频| 日韩精品视频在线观看无| 综合偷自拍亚洲乱中文字幕| 久久精品国产精油按摩| 草草浮力影院| 国产精品99久久精品爆乳| 白白色发布在线播放国产| 日韩精品极品视频在线免费| av中文字幕在线直播| 国产在线视频一区二区天美蜜桃 | 日本精品熟妇一区二区三区| 免费人成网站在线视频| 成年丰满熟妇午夜免费视频| 我把护士日出水了视频90分钟 | 亚洲中国精品精华液| 久久综合九色综合97欧美| 亚洲欧美精品aaaaaa片| 国产免费久久精品99re丫y| 中文字幕一二区中文字幕| 综合久久加勒比天然素人| 国产麻豆精品传媒av在线| 中国人妻与老外黑人| 亚洲av无码一区二区二三区| 无码av在线a∨天堂毛片| 女优免费中文字幕在线| 中文字幕女同人妖熟女| 欧美做受又硬又粗又大视频| 狠狠色成人综合网| 久久国产精99精产国高潮| 色噜噜精品一区二区三区| 婷婷色精品一区二区激情| 五月丁香六月综合缴清无码| 无遮挡又黄又刺激又爽的视频| 99精品成人片免费毛片无码| 精品黑人一区二区三区|