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        基于SPSO與ISKPCA的RdR散點圖識別分類研究

        2018-12-04 02:14:02岳大超甘良志劉海寬余南南
        計算機工程與應(yīng)用 2018年23期
        關(guān)鍵詞:方法

        岳大超,甘良志,劉海寬,余南南

        江蘇師范大學(xué) 電氣工程及自動化學(xué)院,江蘇 徐州 221116

        1 引言

        長久以來,心血管疾病一直是威脅人類健康的主要問題。目前,心血管病死亡占城鄉(xiāng)居民總死亡原因的首位,預(yù)計到2030年大約要有2 330萬人死于心血管病[1]。面對這種趨勢,對心血管病的早期診斷與預(yù)防顯得尤為重要。

        傳統(tǒng)的診斷方法是患者到醫(yī)院,醫(yī)師對其進行心電圖檢查,進而給出診斷結(jié)果[2],任務(wù)繁重且需要醫(yī)師有豐富的臨床經(jīng)驗和專業(yè)知識。而稀缺的醫(yī)療資源,很難滿足數(shù)量龐大患者群體的要求。為了提高就診效率,方便性和快捷性,出現(xiàn)了自動化診斷技術(shù),輔助醫(yī)師進行診斷。

        心率變異是指心動間期之間的時間變異數(shù),其研究對象是心動間期。人的心率不是一成不變的,兩次心搏之間存在著微小的時間差異,計算心動間期的差異,即可了解心率變異性(Heart Rate Variability,HRV)。心率變異性可以評估心臟交感神經(jīng)與副交感神經(jīng)對心血管活動的影響,蘊含著心血管方面的大量信息[3-4]。臨床研究表明,心率變異性的降低是心肌梗死、高血壓、心絞痛等心血管疾病發(fā)病的癥狀。因此,心率變異性的研究,在評價心血管系統(tǒng)功能、預(yù)測心血管疾病的發(fā)作,以及為心血管疾病的早期診斷具有重要的意義[5-6]。

        Poincare散點圖是心率變異性一種重要的研究方法。通過使用連續(xù)的心搏間期在直角坐標(biāo)系中繪制圖形,反映相鄰心搏間期的變化,能顯示心搏間期的特征。Poincare散點圖有多種形態(tài),包括彗星狀、扇形等,不同的形狀反映不同的心臟狀態(tài)[7-8]。雖然Poincare散點圖是一種有效的心率變異性分析方法,但是并不能體現(xiàn)其隨時間變化的趨勢,對于某些心血管疾病、身體健康狀況等不能很好地體現(xiàn)其心率變異性性質(zhì)。于是,一些學(xué)者提出了改進策略,即一階差分散點圖,通過相鄰心搏間期的差值來繪制散點圖。然而,這種方法又丟失了原有的心搏間期絕對值信息。因此,在文獻[5]中,將二者結(jié)合起來,提出了一種RdR散點圖,以此來同時反映心搏間期及其變化。

        目前,對于心率變異性分析的研究很多[9-12]。但是,并沒有根據(jù)散點圖來有效識別、區(qū)分不同的心血管疾病,實現(xiàn)心電自動化診斷的研究。本文即是通過簡化粒子群算法(Simplified Particle Swarm Optimization,SPSO)與集成稀疏核主分量分析(Integration Sparse Kernel Principal Component Analysis,ISKPCA)方法來對RdR散點圖進行識別分類,為心電自動化診斷的實現(xiàn)提供一些基礎(chǔ)。

        2 簡化粒子群算法

        基本粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO)是一種智能優(yōu)化算法,算法首先在搜索范圍內(nèi)隨機初始化一群粒子,之后不斷迭代,迭代過程中更新兩個參數(shù):一是粒子自身的最優(yōu)位置;一是種群的最優(yōu)位置;直至達到終止條件[13]。

        胡旺等人把基本粒子群算法進行了簡化,稱為簡化粒子群算法(Simplified Particle Swarm Optimization,SPSO)。假設(shè)在D維搜索空間中,設(shè)置S個粒子,迭代T次,第i個粒子在d維的位置用Xid表示,用 pBestid記錄該粒子最好的位置,用gBestd記錄種群最好的位置。簡化后公式為:

        式(1)中,右邊第一項是“粒子慣性”,為個體歷史對現(xiàn)在的影響,利用慣性權(quán)重ω來調(diào)節(jié)影響;第二項是“自我認(rèn)知”,是粒子對自身的思考,c1是學(xué)習(xí)因子;第三項是“社會引導(dǎo)”,表示粒子對歷史上最優(yōu)粒子的模仿,c2是學(xué)習(xí)因子,r1,r2是服從U(0,1)分布的隨機數(shù)。該算法僅通過粒子的位置進行更新迭代,把方程從二階降為了一階,并通過理論和實驗證明了該方法的有效性、優(yōu)越性,這種改進使得整個過程變得更為簡單。

        3 集成稀疏核主分量分析

        主分量分析是一種典型的無監(jiān)督算法,常用于解決原始空間的線性問題[14-15],而為了在特征空間中用線性方法解決原始空間的非線性問題,B.Scholkopf等人提出了核主分量分析(Kernel Principal Component Analysis,KPCA)[16]。

        其中,矩陣K是N×N的矩陣,也稱核矩陣。則式(3)問題轉(zhuǎn)換為:

        過程可以直接在K上運算:

        本文選擇一種常用的核函數(shù),徑向基核函數(shù)來進行計算。當(dāng)選擇徑向基核函數(shù)時,會有明顯的過學(xué)習(xí)問題,主要是由于徑向基核函數(shù)對應(yīng)的特征空間是無限維的,通過該方法得出的主分量的次數(shù)與給定樣本的維數(shù)無關(guān),而與樣本數(shù)量有關(guān)。為解決這個問題,引入了稀疏化方法,即為稀疏核主分量分析(Sparse Kernel Principal Component Analysis,SKPCA)。

        在核主分量分析中,特征向量能用樣本{φ(x1),φ(x2),…,表示為 ,也就是說特征向量?是全部樣本的線性組合,這為特征向量的稀疏化提供了一種思路。通過近似基求解算法,來求{φ(x1),φ(x2),…,φ(xN)}的近似基,從而得到的稀疏化方法。

        近似基求解的具體步驟是:

        (1)建立集合Xl={φ(x1)}為近似最大無關(guān)組,XA=?。

        (3)如果得到極小值value≤ε,則把對應(yīng)的元素加到XA當(dāng)中,否則為Xl。ε是線性相關(guān)截尾誤差,在有限的樣本中求無限維空間的基幾乎沒有稀疏性,因此選擇近似計算。

        (4)返回步驟(2),直至完成所有的計算,計算結(jié)束。

        其中,步驟(2)中的求解過程如下,令

        可知式(11)是特征值與特征向量的問題,即

        推導(dǎo)得:

        其中,K(m,:)表示核矩陣K的第m行,K(:,n)表示第n列表示1行N 列的行向量。式(12)也就變成了:

        為典型的特征值與特征向量問題。

        雖然稀疏化可以控制學(xué)習(xí)機的學(xué)習(xí)能力,防止過學(xué)習(xí),但是稀疏化方法仍然可能會丟失數(shù)據(jù)集的某些重要特性,即欠學(xué)習(xí)問題。因此,有必要引入集成方法,稱為集成稀疏核主分量分析(Integration Sparse Kernel Principal Component Analysis,ISKPCA)。由于核主分量分析是一種無監(jiān)督學(xué)習(xí),不能從外部獲得指導(dǎo),即不能對某次學(xué)習(xí)結(jié)果進行獎賞或懲罰,所以,本文選擇簡單平均的方法。SKPCA的集成方法具體步驟流程如下:

        (1)設(shè)置重復(fù)的次數(shù)Re。(2)計算核矩陣K=ΦTΦ。

        4 Rd R散點圖

        令△RRn=RRn-RRn-1,RRn為第n個心搏間期。RRn為橫坐標(biāo),△RRn為縱坐標(biāo),逐次繪點,即得RdR散點圖。為驗證本文算法的有效性,使用的數(shù)據(jù)為MIT-BIH數(shù)據(jù)庫中的心電數(shù)據(jù)作為測試樣本,實驗過程中用到的數(shù)據(jù)編號如表1所示。

        實驗當(dāng)中,使用MATLAB繪制來繪制RdR散點圖,取編號100中的部分?jǐn)?shù)據(jù)來繪制RdR散點圖,示例如圖1所示。

        表1 本文使用的MIT-BIH數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)

        圖1 編號100的RdR散點圖

        5 實驗

        將ISKPCA用于RdR散點圖的分類識別,需要先建立ISKPCA模型,然后選擇控制指標(biāo)。平方預(yù)測誤差(Squared Prediction Error,SPE)是常用的控制指標(biāo)。

        對于第i個樣本Xi,假設(shè)經(jīng)過SKPCA求得其前n個主分量為t1,t2,…,tn,對應(yīng)的特征值為 λ1,λ2,…,λn。用表示特征空間N個主成分的重構(gòu)向量同理則樣本 X 的SPE定義為:

        接下來要獲取樣本,將表1中所示的23組數(shù)據(jù)使用MATLAB繪制成RdR散點圖。在每個散點圖中,選擇1 000個RR間期來繪制散點圖,即至少10分鐘的數(shù)據(jù),依據(jù)MIT-BIH的360 Hz采樣頻率計算,每幅散點圖大約需要使用216 000個心電數(shù)據(jù)點。為了盡可能多地獲得訓(xùn)練樣本,采用每次移動10個RR間期來繪制散點圖,共獲得樣本2 819例。算法具體步驟如下:

        (1)讀取圖像數(shù)據(jù),對圖像進行縮放到同一規(guī)格,轉(zhuǎn)成灰度圖,將一幅圖的多維矩陣數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成一維,并對樣本進行分類標(biāo)記,分別用1、2、3、4、5對應(yīng)著正常竇性心律、非偶聯(lián)早搏、二聯(lián)律早搏、三聯(lián)律早搏以及混合早搏。

        (2)對數(shù)據(jù)進行Z-score標(biāo)準(zhǔn)化處理。公式如下:

        其中,μ、σ分別是數(shù)據(jù)的均值與方差。

        (3)分別對每類樣本采樣,隨機抽取其中85%的數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練樣本,剩余的15%作為測試樣本。

        (4)使用簡化粒子群算法搜尋參數(shù),包括求解近似基的誤差參數(shù)ε、高斯核函數(shù)參數(shù)gamma以及核主分量分析控制限t的值,以準(zhǔn)確率為適應(yīng)度函數(shù),分別對每類樣本求解近似基、特征值、特征向量。

        (5)分別計算每個測試樣本的SPE,其值與某類樣本的SPE差值最小者為測試樣本的預(yù)測類別,與實際類別比較,計算準(zhǔn)確率,若滿足要求則步驟(6),反之返回步驟(4)。

        (6)使用所得分類模型,進行樣本交叉實驗,測試算法性能。

        本文分類模型參數(shù)最終選擇為:ε=250,高斯核函數(shù)參數(shù)gamma=600,主分量控制t=90%,集成個數(shù)Re=10。經(jīng)過多次樣本交叉驗證,使用KPCA平均識別率為72%,SKPCA的平均識別率約為91%,集成SKPCA的平均識別率為98.6%。與文獻[17]中使用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來實現(xiàn)3種心律識別的97%的正確率相比,本文算法準(zhǔn)確率有所提高。由此可以看出,RdR散點圖可以反映上述幾種心律的特征,另外,也體現(xiàn)了使用本文算法來進行RdR散點圖分類識別的有效性。

        本文使用簡化粒子群算法的參數(shù):種群規(guī)模是20,進化100代,搜索空間依據(jù)實驗測試設(shè)置在[0,1 000]。從測試樣本中隨機選擇某一類的心電數(shù)據(jù)樣本,如圖2選擇到實際類別為“3”的一些測試樣本集,將其分別與各個類別計算其SPE的差值,結(jié)果如圖2,可以看到其與類別為“3”的SPE差值最小,分類正確;圖3是隨機抽取部分樣本的預(yù)測結(jié)果與實際標(biāo)記樣本對比,可以看到全部分類正確。

        圖2 測試樣本與各類的SPE差值

        6 結(jié)束語

        圖3 部分預(yù)測結(jié)果與實際樣本對比

        核主分量分析存在著過學(xué)習(xí)的問題,根據(jù)統(tǒng)計學(xué)習(xí)理論可知,稀疏化方法可以控制學(xué)習(xí)機的學(xué)習(xí)能力,防止過學(xué)習(xí),而且通過稀疏化可以削減樣本數(shù)量,減少計算量,而為了應(yīng)對由于稀疏化使某些特征被遺漏的問題,即欠學(xué)習(xí),又引入了集成方法。本文用MIT-BIH中的心電數(shù)據(jù)來驗證本文算法的有效性,算法使用心電數(shù)據(jù)繪制RdR散點圖,通過簡化粒子群算法對集成稀疏核主分量分析的參數(shù)進行尋優(yōu),以正確識別率為適應(yīng)度函數(shù),并用所學(xué)習(xí)到的分類模型來對五種心律的RdR散點圖進行分類識別,實驗結(jié)果顯示,分類效果較好。但一方面,由于本文使用的數(shù)據(jù)樣本及類別相對于龐大的心血管疾病種類而言都較少,使得不能非常全面、客觀地反映所有問題;另一方面,本文所述方法,步驟較為繁瑣,計算周期長。接下來的研究重點是:收集更多的心電樣本數(shù)據(jù);尋找更簡單,更有效的方法、更高效的方法。為了實現(xiàn)心電自動化診斷還需要進一步的研究。

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