1979年，曹文軒開(kāi)始發(fā)表文學(xué)作品，其中短篇小說(shuō)《弓》和《啞?！贩謩e獲得1982年《兒童文學(xué)》、《少年文藝》優(yōu)秀作品獎(jiǎng)。

1988年4月，他的短篇小說(shuō)《再見(jiàn)了，我的小星星》獲得第一屆全國(guó)優(yōu)秀兒童文學(xué)獎(jiǎng)。1988年5月，憑借學(xué)術(shù)著作《中國(guó)八十年代文學(xué)現(xiàn)象研究》獲北京大學(xué)首屆青年優(yōu)秀科研成果一等獎(jiǎng)；同年10月，獲中國(guó)當(dāng)代文學(xué)研究會(huì)第二屆文學(xué)評(píng)論科研獎(jiǎng)。

1992年12月，曹文軒憑借長(zhǎng)篇小說(shuō)《山羊不吃天堂草》獲第三屆宋慶齡兒童文學(xué)獎(jiǎng)金獎(jiǎng)，并于次年2月獲中國(guó)作家協(xié)會(huì)全國(guó)兒童文學(xué)作品集評(píng)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)；1993年11月，短篇小說(shuō)《藍(lán)花》獲冰心兒童文學(xué)獎(jiǎng)新作獎(jiǎng)。1995年2月，短篇小說(shuō)集《紅葫蘆》獲中國(guó)臺(tái)灣《中國(guó)時(shí)報(bào)》1994年度十大童書(shū)獎(jiǎng)及“好書(shū)大家讀”年度短篇小說(shuō)類創(chuàng)作最佳獎(jiǎng)，《山羊不吃天堂草》獲“好書(shū)大家讀”年度長(zhǎng)篇小說(shuō)類創(chuàng)作最佳獎(jiǎng)。

1998年2月，中短篇小說(shuō)《三角地》獲“好書(shū)大家讀”年度最佳少年兒童讀物獎(jiǎng)，長(zhǎng)篇小說(shuō)《草房子》獲“好書(shū)大家讀”年度最佳少年兒童讀物獎(jiǎng)，同年8月《草房子》獲第九屆冰心文學(xué)獎(jiǎng)大獎(jiǎng)，次年10月獲第四屆國(guó)家圖書(shū)獎(jiǎng)；1999年10月，憑借長(zhǎng)篇小說(shuō)《紅瓦》獲第四屆國(guó)家圖書(shū)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)；1999年6月，憑借改編電影《草房子》獲第八屆中國(guó)電影童牛獎(jiǎng)優(yōu)秀編劇獎(jiǎng)，同年10月，獲得第十九屆中國(guó)電影金雞獎(jiǎng)最佳劇本獎(jiǎng)。

2000年5月，長(zhǎng)篇小說(shuō)《草房子》再獲第四屆全國(guó)優(yōu)秀兒童文學(xué)獎(jiǎng)及第五屆宋慶齡兒童文學(xué)獎(jiǎng)小說(shuō)類金獎(jiǎng)；同年電影《草房子》獲得第十四屆德黑蘭國(guó)際電影節(jié)評(píng)審團(tuán)特別大獎(jiǎng)“金蝴蝶獎(jiǎng)”。

2002年9月，任中國(guó)作家協(xié)會(huì)兒童文學(xué)委員會(huì)委員。

2003年9月，當(dāng)選為北京作家協(xié)會(huì)副主席。

2003年10月，長(zhǎng)篇小說(shuō)《根鳥(niǎo)》獲第六屆宋慶齡兒童文學(xué)獎(jiǎng)佳作獎(jiǎng)；2004年2月，提名中國(guó)安徒生獎(jiǎng)；同年5月，獲得國(guó)際安徒生獎(jiǎng)提名[12]；同年10月，長(zhǎng)篇小說(shuō)《細(xì)米》獲中國(guó)作家協(xié)會(huì)第六屆全國(guó)兒童文學(xué)獎(jiǎng)；2005年12月，長(zhǎng)篇小說(shuō)《青銅葵花》獲中國(guó)臺(tái)灣《中國(guó)時(shí)報(bào)》2005年十大好書(shū)，于次年3月獲“好書(shū)大家讀”年度長(zhǎng)篇小說(shuō)類創(chuàng)作最佳獎(jiǎng)。《青銅葵花》還獲了“五個(gè)一工程”獎(jiǎng)、國(guó)家圖書(shū)獎(jiǎng)、第七屆中國(guó)作協(xié)全國(guó)優(yōu)秀兒童文學(xué)獎(jiǎng)、冰心文學(xué)大獎(jiǎng)。

2007年5月，成為中國(guó)作家協(xié)會(huì)第六屆全國(guó)委員會(huì)委員。

2010年11月，小說(shuō)《黃琉璃》獲第八屆全國(guó)優(yōu)秀兒童文學(xué)獎(jiǎng)獎(jiǎng)。

2016年4月4日，曹文軒摘得國(guó)際兒童讀物聯(lián)盟（IBBY）2016年度“國(guó)際安徒生獎(jiǎng)”；同年5月，他在《人民文學(xué)》雜志6月刊上全文發(fā)表長(zhǎng)篇小說(shuō)《蜻蜓眼》，該作于2017年12月獲得首屆“吳承恩長(zhǎng)篇小說(shuō)獎(jiǎng)”。