嚴(yán) 靜,劉啟榆,周 瑩,張順源,劉知貴
(1.西南科技大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,四川 綿陽 621010;2.綿陽市中心醫(yī)院放射科,四川 綿陽 621000)
心血管疾病(cardiovascular diseases,CVDs)作為人類三大致死疾病之首,一直是世界衛(wèi)生組織關(guān)注的重點(diǎn)。據(jù)《中國心血管病報(bào)告2016》推算,現(xiàn)心血管病患者人數(shù)為2.9億,其中腦卒中患者高達(dá)1 300萬[1]。腦卒中即中風(fēng),是全球最常見也是最為嚴(yán)重的神經(jīng)疾病之一。大約85%的中風(fēng)是由于局部缺血引起的。腦動(dòng)脈血栓會(huì)引發(fā)腦血管阻塞,最終導(dǎo)致局部腦梗死[2]。動(dòng)脈粥樣硬化是造成腦動(dòng)脈血栓的主要原因。粥樣硬化斑塊是粥樣硬化的一種表現(xiàn)形式。
大量研究表明,相較于傳統(tǒng)的動(dòng)脈血管影像技術(shù),高分辨率核磁共振成像(high-resolution magnetic resonance imaging,HRMRI)技術(shù)所獲得的圖像能夠更清晰地顯示動(dòng)脈血管壁的結(jié)構(gòu)和判定斑塊的位置,便于準(zhǔn)確分割斑塊和血管,并進(jìn)行三維重建,以輔助臨床治療[3]。該技術(shù)對(duì)于腦血管病的二級(jí)預(yù)防、個(gè)性化治療以及療效的評(píng)價(jià)都具有重要的意義[4]。
近年來,許多研究者著手于頸動(dòng)脈斑塊[5-6]、冠狀動(dòng)脈斑塊[7-8]與股動(dòng)脈斑塊的分割[9-10],顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊分割的相關(guān)研究比較少。顱內(nèi)動(dòng)脈血管彎曲、形狀復(fù)雜,易受毗鄰動(dòng)脈血管影響,難以實(shí)現(xiàn)病變動(dòng)脈血管的定位與分割。顱內(nèi)粥樣硬化斑塊結(jié)構(gòu)復(fù)雜、形狀多變,斑塊圖像存在弱邊界,導(dǎo)致斑塊分割較困難。幾何活動(dòng)輪廓模型將底層圖像信息與高層先驗(yàn)知識(shí)相結(jié)合,并具有較好的數(shù)學(xué)支撐,已廣泛應(yīng)用于復(fù)雜醫(yī)學(xué)圖像的處理。Wang等[11-12]提出了基于局部高斯分布擬合(local gaussian distribution fitting,LGDF)能量的活動(dòng)輪廓模型。該模型通過水平集演化和局部灰度均值與方差的計(jì)算來實(shí)現(xiàn)能量最小化,將局部灰度均值和方差看作空間變化的函數(shù),適用于灰度不均勻、有噪聲圖像的分割。
考慮到顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊形狀多變、存在弱邊界以及顱內(nèi)動(dòng)脈血管結(jié)構(gòu)復(fù)雜,以及分割結(jié)果易受毗鄰血管影響等問題,本文設(shè)計(jì)了一種新的顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊精準(zhǔn)分割的方法。該方法具有如下優(yōu)點(diǎn):①利用醫(yī)學(xué)圖像處理技術(shù)、實(shí)現(xiàn)顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的分割;②根據(jù)顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的特點(diǎn),利用閾值法和數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)實(shí)現(xiàn)斑塊的準(zhǔn)確定位與分割;③針對(duì)LGDF模型手動(dòng)初始化問題,提出利用斑塊的分割結(jié)果作為LGDF模型的初始輪廓,進(jìn)行病變動(dòng)脈血管的分割。該方法解決了動(dòng)脈血管對(duì)病變動(dòng)脈血管的影響問題,實(shí)現(xiàn)了動(dòng)脈血管的自動(dòng)分割,提高了分割精度,同時(shí)也減少了模型演化時(shí)間,為后期三維重建奠定了基礎(chǔ)。
HRMRI技術(shù)主要利用“黑血”和“亮血”兩種技術(shù)來分析血管狹窄問題。三維時(shí)間飛躍法磁共振血管成像(three dimensional time-of-flight,3D-TOF)是目前常用的“亮血”技術(shù)。該技術(shù)主要用于斑塊定位。采用“黑血”技術(shù)進(jìn)行狹窄處動(dòng)脈血管壁與斑塊成像。通過醫(yī)學(xué)圖像處理技術(shù)將粥樣硬化斑塊與動(dòng)脈血管可視化呈現(xiàn),對(duì)輔助臨床診斷、手術(shù)規(guī)劃及后期治療具有顯著意義。
本方法主要包括圖像預(yù)處理、斑塊定位與分割以及狹窄動(dòng)脈血管分割三部分。
由于成像設(shè)備及拍攝技術(shù)的限制,核磁共振(magnetic resonance,MR)圖像會(huì)存在一些噪聲,影響后續(xù)分割結(jié)果。圖像去噪是圖像處理中的重要環(huán)節(jié)[12]。非局部均值濾波算法(non-local means,NLM)依據(jù)不同像素鄰域灰度分布信息來計(jì)算權(quán)值,利用了圖像塊之間的相似性去噪,能夠降低相鄰的、灰度值相差較大的點(diǎn)之間的相互影響,達(dá)到很好的去噪保邊效果。
高分辨率核磁共振(high-resolution magnetic resonance,HRMR)圖像中斑塊出現(xiàn)弱邊界現(xiàn)象,對(duì)去噪后的圖像進(jìn)行邊緣增強(qiáng),使得斑塊邊緣更清晰地顯示,有助于提高斑塊的分割精度。本文使用Matlab自帶的imsharpen函數(shù),實(shí)現(xiàn)邊緣增強(qiáng)。
通過對(duì)大量圖像感興趣區(qū)域(region of interest,ROI)的灰度直方圖統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)斑塊的灰度值明顯高于周圍的其他組織,主體部分灰度值均在200以上。由于斑塊弱邊界的灰度值與顱內(nèi)其他組織相近,閾值法不能直接對(duì)斑塊作整體分割,但是可以先分割斑塊的主體,再采用數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)進(jìn)行細(xì)分割。本算法首先定位到灰度值在200以上的區(qū)域,將此區(qū)域作為斑塊預(yù)分割的結(jié)果。ROI灰度直方圖如圖1所示。
圖1 ROI灰度直方圖
斑塊的像素值高于動(dòng)脈血管,但是由于斑塊存在弱邊界,與動(dòng)脈血管連接處的斑塊邊界比較模糊。閾值法能將增強(qiáng)后的斑塊主體分割,其余的弱邊緣可以通過數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)中的膨脹操作來實(shí)現(xiàn)。膨脹的實(shí)現(xiàn)原理為:
(1)
式中:Sdilate為斑塊膨脹后的結(jié)果;S為圖像數(shù)據(jù)。
圖2 膨脹操作示意圖
LGDF模型[11]通過構(gòu)造圖像各像素點(diǎn)的能量函數(shù),利用能量函數(shù)的最小化來實(shí)現(xiàn)最優(yōu)分割。目標(biāo)區(qū)域分割可以通過最小化目標(biāo)函數(shù)實(shí)現(xiàn),目標(biāo)函數(shù)為:
(2)
(3)
假設(shè)區(qū)域被分成2個(gè)區(qū)域,分別代替水平集所包含的內(nèi)區(qū)域和外區(qū)域,使用Heaviside函數(shù)可以改寫為:
(4)
在實(shí)際應(yīng)用中,通常使用平滑函數(shù)Hε代替heaviside函數(shù):
(5)
式中:ε為常量。
(6)
(7)
最后,用梯度下降法對(duì)加入平滑項(xiàng)后的目標(biāo)函數(shù)求解,得到以下表達(dá)式:
(8)
式中:div(·)為散度算子;2為拉普拉斯算子;t為時(shí)間步長。
(9)
式中:δ(·)為狄拉克函數(shù)。
具體的算法實(shí)現(xiàn)步驟如下。
①圖像去噪與增強(qiáng)。
②利用閾值法定位斑塊并進(jìn)行預(yù)分割。
③利用形態(tài)學(xué)膨脹方法對(duì)斑塊進(jìn)行細(xì)分割。
④去除病變動(dòng)脈血管中的斑塊,完整呈現(xiàn)動(dòng)脈血管腔。
⑤將精分割所得的斑塊邊緣作為LGDF模型中水平集函數(shù)φ的初始輪廓。
⑦更新水平集函數(shù)φ;
⑧判斷φ收斂與否:如果收斂,則停止演化;如果未收斂,則返回步驟⑥。
本文采用戴斯相似系數(shù)、精確率、靈敏度和特異性四個(gè)指標(biāo)對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià),公式如下:
(10)
指標(biāo)參數(shù)如圖3所示。
圖3 指標(biāo)參數(shù)示意圖
本文所用的圖像數(shù)據(jù)由綿陽市中心醫(yī)院放射科提供,使用預(yù)飽和脈沖血流信號(hào)抑制技術(shù)獲得的T1加權(quán)像(T1-weighted imaging,TIWI),層厚為0.7 mm。成像系統(tǒng)為西門子MAGNETOM skyra 3.0T。本試驗(yàn)硬件配置為Intel(R) Core(TM) i5-4460 CPU 3.20 GHz,8 GB內(nèi)存,仿真環(huán)境為MATLAB R2016a。
本試驗(yàn)選取23組HRMR圖像進(jìn)行分割。經(jīng)過多次試驗(yàn),最終選擇的基本參數(shù)為:閾值T>200,σ=3.0,r=6.0,Δt=0.1,μ=1.0,v=0.001×255×255。
選擇23組數(shù)據(jù)中的部分典型患者的圖像預(yù)處理與分割結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析。顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的分割結(jié)果如圖4所示。
圖4 顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊分割結(jié)果
由圖4可以看出,經(jīng)過非局部均值濾波以及增強(qiáng)后的圖像在去除噪聲的同時(shí),又很好地保留了圖像邊緣的細(xì)節(jié)信息,圖像的對(duì)比度增加,斑塊主體明顯增強(qiáng);根據(jù)圖像灰度直方圖信息,統(tǒng)計(jì)出增強(qiáng)后的斑塊主體部分閾值均大于200,表明利用閾值法可以實(shí)現(xiàn)斑塊的準(zhǔn)確定位和預(yù)分割;針對(duì)斑塊的弱邊界,采用特定的結(jié)構(gòu)元素進(jìn)行膨脹;最后,完整地將斑塊分割。
圖5是去除斑塊后的顱內(nèi)動(dòng)脈血管MR分割結(jié)果。本試驗(yàn)共有四個(gè)患者圖像分割失敗。根據(jù)專家分析,失敗的原因與圖4中12號(hào)患者一樣,圖像中存在不完全顯影的斑塊。通過與腦動(dòng)脈血管專家手動(dòng)分割結(jié)果對(duì)比,統(tǒng)計(jì)正常顯影的斑塊分割結(jié)果的平均正確率為93.95%,病變動(dòng)脈血管分割結(jié)果的平均正確率為96.62%。
圖5 顱內(nèi)動(dòng)脈血管MR圖像分割結(jié)果
由圖5可以看出,對(duì)于去除斑塊干擾后的動(dòng)脈血管的分割,毗鄰動(dòng)脈血管較多,且管壁較薄,部分圖像管壁還存在不連續(xù)現(xiàn)象,導(dǎo)致動(dòng)脈血管的定位與分割難。原始的LGDF模型需要手動(dòng)初始化輪廓,試驗(yàn)過程中手動(dòng)初始化各種不同的輪廓曲線,并得到相應(yīng)的斑塊分割結(jié)果。通過大量試驗(yàn)、分析可知,只有當(dāng)初始輪廓面積夠小,且正好位于動(dòng)脈血管腔內(nèi),才能獲得較好的分割效果,手動(dòng)初始化輪廓存在效率低、分割精度差、分割失敗等問題。由于斑塊的灰度特征比較明顯,本文采用斑塊的分割結(jié)果作為病變動(dòng)脈血管的初始輪廓,實(shí)現(xiàn)了動(dòng)脈血管的自動(dòng)定位與分割。
斑塊分割結(jié)果比較、顱內(nèi)動(dòng)脈血管分割結(jié)果比較如表1、表2所示。
根據(jù)12號(hào)患者動(dòng)脈血管分割結(jié)果可知,未完全顯影斑塊的不準(zhǔn)確分割結(jié)果會(huì)直接影響動(dòng)脈血管的分割精度。本文在表1和表2中詳細(xì)列出了3類典型HRMR圖像使用不同方法所得到的戴斯相似系數(shù)、精確率、靈敏度和特異性,本文的方法對(duì)斑塊和顱內(nèi)動(dòng)脈血管具有較好的適用性。
表1 斑塊分割結(jié)果比較
表2 顱內(nèi)動(dòng)脈血管分割結(jié)果比較
根據(jù)12號(hào)患者動(dòng)脈血管分割結(jié)果可知,未完全顯影斑塊的不準(zhǔn)確分割結(jié)果會(huì)直接影響動(dòng)脈血管的分割精度。本文在表1和表2中詳細(xì)列出了3類典型HRMR圖像使用不同方法所得到的戴斯相似系數(shù)、精確率、靈敏度和特異性。本文的方法對(duì)斑塊和顱內(nèi)動(dòng)脈血管具有較好的適用性。
針對(duì)顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊HRMR圖像分割難問題,本文提出了一種基于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)與LGDF模型的分割方法。首先利用閾值法對(duì)斑塊進(jìn)行預(yù)分割,然后通過數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)方法對(duì)其進(jìn)行細(xì)分割,并將細(xì)分割結(jié)果作為LGDF模型的初始化輪廓。該方法避免了毗鄰動(dòng)脈血管對(duì)LGDF分割結(jié)果的影響,實(shí)現(xiàn)了對(duì)病變動(dòng)脈血管的準(zhǔn)確分割。通過與專家手動(dòng)分割圖像對(duì)比計(jì)算,該方法對(duì)正常顯影斑塊的平均分割精度為93.95%、對(duì)動(dòng)脈血管的平均分割精度為96.62%,能準(zhǔn)確分割出顯影斑塊。同時(shí),相較于單一的LGDF模型,該方法不僅提高了顱內(nèi)動(dòng)脈血管的分割精度,而且提高了其分割速度,具有很好的魯棒性。
但是,由于部分患者的斑塊組成成分原因,未能完全顯影,導(dǎo)致分割結(jié)果不太理想。這也是后續(xù)需要重點(diǎn)研究的問題。未來將利用顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的分割結(jié)果進(jìn)行三維重建,通過可視化技術(shù),透過動(dòng)脈血管壁觀察三維斑塊形態(tài)結(jié)構(gòu),對(duì)其進(jìn)行定量分析,最終輔助顱內(nèi)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的介入治療。