袁 遠(yuǎn) ,曹 喆 ,杜 飛,何鵬飛,何月秋 ,吳毅歆
(1.云南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,云南 昆明 650201;2.云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650201)
由蕓薹根腫病菌(Plasmoliophora brassicae Woronin)侵染所致的十字花科蔬菜根腫病是十字花科蔬菜的世界性病害之一。該病害導(dǎo)致十字花科蔬菜產(chǎn)量下降,甚至絕收,是一種常見且危害嚴(yán)重的真菌病害[1-5]。該病在我國境內(nèi)十字花科作物上均有發(fā)生,發(fā)病面積約67萬hm2,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,已經(jīng)嚴(yán)重影響我國十字花科作物生產(chǎn)。該病的病原菌是一種土傳性活體寄生菌,專性寄生于十字花科植物,不能進(jìn)行人工培養(yǎng),病菌從休眠孢子囊萌發(fā)產(chǎn)生游動(dòng)孢子侵入根部,經(jīng)10 d左右致根系形成腫瘤,游動(dòng)孢子是該病傳播的主要危害[7]。根腫病的發(fā)生受溫度、濕度、土壤pH、光照、土壤含水量和病原菌數(shù)量的影響,帶菌水傳播也是根腫病迅速傳播的主要原因之一[8]。對根腫菌生活史的研究國外比國內(nèi)早,基本上大部分實(shí)驗(yàn)室都是在明確生活史的前提下通過雙重培養(yǎng)技術(shù)和懸浮細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)來研究十字花科植物根腫病的發(fā)病全過程。在我國這方面的報(bào)告還很少,處于啟蒙階段[9]。國內(nèi)外對根腫病的研究一直都很重視,通過不懈的努力在致病機(jī)理、病原菌生理小種鑒定、根腫菌防治、病原體離體技術(shù)等方面均取得了突破性進(jìn)展[9-18]。目前對于休眠孢子的萌發(fā)環(huán)境及侵染能力之間互作關(guān)系的研究還不是太多。為了更好地防治根腫病的發(fā)生,對影響根腫病休眠孢子萌發(fā)的生物及非生物因子的研究十分必要[19-20]。本研究通過對不同溫度水體根腫菌存活情況和水中微生物活動(dòng)及各項(xiàng)水體指標(biāo)的檢測結(jié)果,為研究根腫病休眠孢子萌發(fā)的生物及非生物因子和環(huán)境及侵染能力之間的互作關(guān)系提供依據(jù),為根腫病的田間防治提供理論基礎(chǔ)。
供試根腫病菌于2017年1月采自昆明市周邊白菜種植大棚的病變白菜根腫組織。
水體根腫菌孢子檢測方法采用趙瑋琦等[10]方法稍作修改檢測,并建立熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線。
使用0.22 μm濾膜抽濾樣本水體富集水體微生物,抽濾20~150 mL水體樣本,直至濾膜堵塞難以抽濾,記錄所抽濾水體體積。將濾膜剪碎分裝入2 mL離心管中,依據(jù)DNA Water Kit(OMEGA公司)的說明書提取DNA,用于熒光定量PCR檢測。結(jié)果對照標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算DNA濃度,帶入所抽濾水體體積,計(jì)算原水體根腫菌孢子濃度。
取100 g白菜根腫組織與200 mL純凈水打碎成勻漿狀,四層紗布過濾分裝入50 mL離心管中,2 500 g/min 離心20 min,棄上清液,沉淀重懸于50 mL純凈水中,該步驟重復(fù)3~4次;加入5 mL 50%蔗糖溶液懸浮,2 500 g/min離心20 min;將上清液移入一新的離心管中加入45 mL純凈水,2 500 g/min離心20min,棄上清;沉淀溶于5 mL純凈水中,保存于4℃冰箱中。
試驗(yàn)設(shè)4個(gè)溫度梯度16、19、22、25℃,將4個(gè)光照培養(yǎng)箱調(diào)節(jié)至上述4個(gè)溫度,每個(gè)溫度下放置3個(gè)模擬水體樣品作為3個(gè)重復(fù),另設(shè)一個(gè)2 L不含孢子的無菌蒸餾水樣品作為空白對照。
使用血球計(jì)數(shù)板于顯微鏡下計(jì)算孢子懸浮液中孢子濃度。制備12個(gè)模擬水體樣品,每個(gè)樣品在一個(gè)塑料桶中加入1 990 mL純凈水,加入10 mL稀釋后的孢子懸浮液,將樣品的孢子濃度調(diào)節(jié)至1×106CFU/mL。使用0.1 mol/L HCl溶液將樣品pH值調(diào)節(jié)至5.5;使用電導(dǎo)率儀檢測測水體電導(dǎo)率,0.1 mol/L NaCl溶液將樣品鹽度調(diào)到統(tǒng)一值。定期提取各個(gè)樣品的DNA用于熒光定量PCR檢測計(jì)算樣品水體,同時(shí)測量各處理的化學(xué)需氧量(COD)和溶解氧含量(DO)。
將模板 DNA 稀釋為 1×107、1×106、1x105、1×104、1×103、1×102、1×101拷貝 /μL 7 個(gè)不同梯度用于進(jìn)行熒光定量PCR。以模板DNA起始濃度的對數(shù)值(x)為橫坐標(biāo),以Ct值(y)為縱坐標(biāo)作熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線,如圖1所示。標(biāo)準(zhǔn)曲線為y=-3.101x+34.594,擴(kuò)增效率97%,R2=0.9995。從圖2擴(kuò)增曲線上可發(fā)現(xiàn)該對引物的精確度為10拷貝/μL,陰性對照信號出現(xiàn)在30~35個(gè)Ct值范圍內(nèi),超過30個(gè)Ct的信號默認(rèn)為是陰性信號,該信號由引物二聚體所產(chǎn)生。根據(jù)所得的熔解曲線(圖 3)可知,在熔解溫度 Tm=84.5℃出現(xiàn)單一峰形,未見其他峰值,說明擴(kuò)增效率和熔解溫度均一,擴(kuò)增產(chǎn)物特異性好,以此為基礎(chǔ)進(jìn)行定量是可靠。
圖1 根腫菌質(zhì)粒DNA梯度稀釋后繪制的標(biāo)準(zhǔn)曲線
圖2 不同濃度梯度質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增曲線
圖3 不同濃度梯度質(zhì)粒溶解曲線
在4個(gè)水體溫度梯度16、19、22、25℃,分別接種濃度為3×106CFU/mL根腫菌孢子。水溫在16~25℃區(qū)間內(nèi),隨著溫度的提高,根腫菌孢子下降的速率變緩,在25℃時(shí)最為緩慢,處理30 d達(dá)1.88×106CFU/mL,并在處理60 d后相對穩(wěn)定,說明根腫菌在25℃下較其他溫度更容易存活(表1)。
表1 不同時(shí)期各處理孢子濃度
電導(dǎo)率與溶液中離子的含量成比例關(guān)系,可間接判斷水中溶解物質(zhì)的含量。從表2可見,隨時(shí)間的延長,各處理電導(dǎo)率都呈緩慢增大。說明處理中根腫菌呈增長趨勢。
表2 不同處理水體電導(dǎo)率變化情況(103μS/cm)
溶氧量是衡量生物在水中生存的重要指標(biāo)。氧在水中的含量因有機(jī)物分解及生物呼吸把氧消耗掉而使水中溶氧量經(jīng)常會(huì)改變。從表3可見,不同時(shí)期各溫度處理的溶氧量隨處理時(shí)間增長出現(xiàn)不規(guī)律的浮動(dòng),說明微生物活動(dòng)頻繁。
表3 不同處理水體溶氧量變化情況(mg/L)
COD作為衡量水中有機(jī)物質(zhì)含量的指標(biāo),化學(xué)需氧量越大,說明水體中有機(jī)物的數(shù)量多。從表4可見,不同時(shí)期各處理的COD隨時(shí)間增長呈現(xiàn)普遍上升的趨勢,且不具有規(guī)律性。COD值越高說明水中根腫菌的數(shù)量越多。
表4 不同處理水體化學(xué)需氧量變化情況(mg/L)
根腫病的發(fā)生受溫度、濕度、土壤的pH值、光照、土壤含水量和土壤中病原菌數(shù)量的影響。根腫病發(fā)生的最主要條件是土壤中大量存在的根腫菌休眠孢子[21]。根腫菌休眠孢子可以通過很多途徑進(jìn)行傳播。帶菌水傳播也是根腫病迅速傳播的主要原因之一[8]。在根腫病發(fā)生區(qū),不僅地塊之間灌溉水漫灌和串灌現(xiàn)象普遍,而且種植戶常在公共水源中清洗蔬菜,隨意丟棄病株或?qū)Р〉氖卟速u給養(yǎng)魚戶喂魚,再用這些被污染了的池塘、水庫中的水灌溉農(nóng)田,從而加速了病菌擴(kuò)散與蔓延,使病害發(fā)生面積逐年擴(kuò)大。根腫病菌傳播,且孢子量越多,感病率越高。研究作物根腫病的傳播途徑,對規(guī)?;绾凸喔人幚砜刂撇『τ兄匾饬x。灌溉水?dāng)y帶病原傳播植物病害是影響農(nóng)作物產(chǎn)量的重要原因,水池育苗能加快病害的蔓延速度,尤其在可利用水較少、降雨量偏少、水分有限時(shí),這種狀況更為嚴(yán)重。灌溉水中含有根腫菌曾有報(bào)道[8,12],但已有的研究并未能詳細(xì)闡述灌溉水中所含根腫菌的數(shù)量與其致病性和病害傳播流行之間的關(guān)系[17-18]。
本研究利用實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)首創(chuàng)的水體中根腫菌孢子熒光定量 PCR 檢測體系[10],建立QPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線來檢測根腫菌的孢子數(shù)量,對不同溫度水體根腫菌存活的情況進(jìn)行檢測,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明在16~25℃區(qū)間內(nèi),隨著溫度的提高,根腫菌孢子下降的速率變緩,在25℃時(shí)相對最為緩慢,這與過去的研究中認(rèn)為根腫菌最適宜的發(fā)病溫度在20~25℃區(qū)間內(nèi)的結(jié)論相一致。試驗(yàn)中孢子濃度隨著時(shí)間的推移可以下降到原濃度的1 000倍以下,但是通過對判斷水體中生物活動(dòng)的主要指標(biāo)電導(dǎo)率、溶氧量及化學(xué)需氧量指標(biāo)的檢測可以發(fā)現(xiàn)在此期間水中的微生物數(shù)量呈上升趨勢且活動(dòng)十分的劇烈,這與孢子濃度隨水溫升高而增加的結(jié)果測定結(jié)果相吻合,說明隨溫度的增高孢子濃度不斷增加,隨著時(shí)間推移水體中孢子濃度降低但根腫病數(shù)量呈上升趨勢且活動(dòng)十分的劇烈。但是與田間環(huán)境可能存在較大的差異,這是否會(huì)對試驗(yàn)的結(jié)果造成影響還有待進(jìn)一步的研究。除此之外,光照、pH、有機(jī)質(zhì)含量等因素也會(huì)對根腫菌孢子的存活造成一定的影響,還需要更進(jìn)一步的研究闡明這些因素與水體中根腫菌存活能力存在著怎樣的聯(lián)系。