陳家輝，鄧濤，張代貴，樂霽培，周卓，孫露，李彥波，李文慶，史鳴明，孫航

1.中國科學(xué)院昆明植物研究所，中國科學(xué)院東亞植物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南昆明 650201

2.吉首大學(xué)，生物資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院，湖南吉首 416000

數(shù)據(jù)庫（集）基本信息簡介

數(shù)據(jù)服務(wù)系統(tǒng)網(wǎng)址基金項(xiàng)目數(shù)據(jù)庫（集）組成images/BZ_21_1113_317_1781_361.png云南省環(huán)境保護(hù)廳（2016年），云南生物物種名錄審核，530007081508006；中國科學(xué)院昆明植物研究所特色研究所服務(wù)項(xiàng)目（iFlora與綜合服務(wù)）；中國科學(xué)院昆明植物研究所自主部署重大專項(xiàng)（2016–2017年），植物全息數(shù)據(jù)庫與iFlora，KIB2016005。數(shù)據(jù)集包括云南省種子植物253科2 392屬16 064種（含種下等級(jí)）。其中，云南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級(jí)），被子植物244科2 367屬15 951種（含種下等級(jí)）。數(shù)據(jù)內(nèi)容由4部分?jǐn)?shù)據(jù)組成，分別為拉丁科名、中文科名、學(xué)名、中文名。

引 言

云南獨(dú)特的地理位置、復(fù)雜的地形地貌和多樣的生態(tài)環(huán)境為不同生態(tài)需求的植物提供了廣袤的生存空間，其素有“植物王國”的美譽(yù)，被認(rèn)為是世界三個(gè)生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)即喜馬拉雅地區(qū)、中國西南山地、印度—馬來的交匯帶，受到世界極大關(guān)注[1-3]。依據(jù)萬本太等[4]提出的生物多樣性綜合評價(jià)等級(jí)，云南當(dāng)之無愧位列“優(yōu)級(jí)”。就全國范圍而言，云南省的生物多樣性編目工作走在了前列，持續(xù)受到國內(nèi)外植物學(xué)家和環(huán)境保護(hù)工作者的高度關(guān)注[5]。隨著近年來云南省生物多樣性調(diào)查和研究的深入，大量的新分類群被發(fā)現(xiàn)并發(fā)表，其中大部分為新種，部分為新屬，甚至還有通過研究提升為新科的類群，如節(jié)蒴木科（Borthwickiaceae）[6]。據(jù)我們的不完全統(tǒng)計(jì)，近年來，在云南每年約有20個(gè)新物種被發(fā)現(xiàn)或描述。

近20年來，植物分類學(xué)和系統(tǒng)學(xué)研究不斷取得新的進(jìn)展，基于分子系統(tǒng)學(xué)研究的被子植物APG系統(tǒng)（I-IV）被提出并不斷完善，Christenhusz等人提出了一個(gè)裸子植物的新系統(tǒng)（簡稱“克氏系統(tǒng)”）[7-8]。但對于分類系統(tǒng)以分子證據(jù)為主還是以形態(tài)證據(jù)為主的爭議并沒有停止。同時(shí)，生物多樣性編目研究的深入，包括《云南植物志》等志書記載的大量科、屬和種范圍界定和系統(tǒng)位置發(fā)生變化，小科屬的合并、大科屬的拆分，以及種在科屬間的轉(zhuǎn)移、歸并等，導(dǎo)致各類志書、多樣性編目專著及科考報(bào)告等因各自所采用的分類系統(tǒng)不同，其科、屬和種級(jí)范疇的界定更是五花八門。顯然，各類植物分類學(xué)專著和志書的不同分類處理APG等新系統(tǒng)所導(dǎo)致的分類系統(tǒng)和分類處理的不一致給生命科學(xué)及農(nóng)業(yè)、林業(yè)、醫(yī)藥和環(huán)境科學(xué)研究與保護(hù)以及政府管理工作者對植物名稱的使用帶來了不便甚至混亂。因此，綜合最新的植物分類學(xué)和系統(tǒng)學(xué)研究成果文獻(xiàn)以及APG等新系統(tǒng)，系統(tǒng)地整理云南種子植物名錄顯得十分迫切，這項(xiàng)工作不僅是植物系統(tǒng)學(xué)學(xué)科發(fā)展的需要，也是生態(tài)學(xué)、生物多樣性與保護(hù)和生物地理學(xué)等學(xué)科進(jìn)一步研究的基石。

本數(shù)據(jù)集在參考《云南植物志》《Flora of China》等資料的基礎(chǔ)上，對云南的種子植物科、屬、種進(jìn)行系統(tǒng)而全面的收錄和匯總，盡可能地整合最新的研究成果，同時(shí)聽取各類群專家意見，整理出了一套完整的《云南省種子植物物種名錄》（以下簡稱“《名錄》”）。

1 數(shù)據(jù)采集和處理方法

1.1 數(shù)據(jù)來源

本數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)主要來源于《云南植物志》各卷冊和《云南種子植物名錄》，同時(shí)補(bǔ)充了以下幾方面的內(nèi)容：①《中國植物志》《Flora of China》《中國種子植物科屬詞典》等志書記載的云南有分布的物種名稱。②最新發(fā)表的分類修訂、分子系統(tǒng)發(fā)育和云南發(fā)現(xiàn)和發(fā)表的新類群和新記錄物種等期刊文獻(xiàn)中記錄的名稱。其中，云南新種和新記錄文獻(xiàn)收集自1984年后迄今。③出版的云南省境內(nèi)的地方植物志、保護(hù)區(qū)科考報(bào)告、區(qū)域性生物多樣性專著（如《橫斷山高山冰緣帶種子植物》）等記錄的物種名稱。④中國科學(xué)院昆明植物研究所標(biāo)本館（KUN）、中國科學(xué)院植物研究所標(biāo)本館（PE）、中科院成都生物研究所標(biāo)本館（CDBI）、四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物標(biāo)本館（SZ）、中國科學(xué)院西北高原生物研究所青藏高原生物標(biāo)本館（HNWP）、西雙版納植物園標(biāo)本館（HITBC）、云南大學(xué)標(biāo)本館（YUKU）、西南林業(yè)大學(xué)標(biāo)本館（SWFC）等標(biāo)本館，以及中國數(shù)字植物標(biāo)本館（CVH，http://www.cvh.org.cn）、國家標(biāo)本平臺(tái)（NSII，http://www.nsii.org.cn/2017/home.php）、中國自然標(biāo)本館（CFH，http://www.nature-museum.net）等網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)中記錄的云南分布的物種名稱。⑤最后，我們還整合了我們近年的野外考察成果和專家建議的觀點(diǎn)。對于歷史上曾經(jīng)出現(xiàn)過的，但在《云南植物志》《中國植物志》《Flora of China》中未提及或處理為異名的屬種名稱，如《科屬詞典》《中國被子植物科屬綜論》及國內(nèi)分類學(xué)相關(guān)期刊中出現(xiàn)的名稱，我們也盡可能地加以收錄，并作為原始數(shù)據(jù)。同時(shí)，我們也盡可能地收集了過去錯(cuò)誤記載的云南產(chǎn)和非云南產(chǎn)名稱。此外，我們還糾正了存在名稱拼寫錯(cuò)誤（主要見于《云南植物志》《中國植物志》《Flora of China》及地方植物志或?qū)Ｖ┑奈锓N，如豨薟屬（Sigesbeckia）被錯(cuò)誤拼寫為“Siegesbeckia”等。收錄以上所有物種名稱信息數(shù)據(jù)以便于后續(xù)處理。

1.2 數(shù)據(jù)審核方法、標(biāo)準(zhǔn)

（1）通過異名庫對所有名稱進(jìn)行初步異名處理

通過 Tropicos（http://www.tropicos.org）、The Plant List（http://www.theplantlist.org/）、物種2000（http://www.sp2000.cn/joaen/index.php）、Flora of China（http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2）等數(shù)據(jù)庫平臺(tái)進(jìn)行初步異名匹配和處理。再由工作人員對所有的異名和無法匹配的名稱逐一進(jìn)行初審。據(jù)此整理出《云南種子植物名錄》的學(xué)名列表及處理意見，以提交專家審核。

（2）參照最新的分子系統(tǒng)學(xué)和分類學(xué)成果決定啟用的名稱和系統(tǒng)位置

我們對科、屬范疇的界定盡量參照最新的分類學(xué)和系統(tǒng)學(xué)研究成果，裸子植物系統(tǒng)采用《Flora of China》系統(tǒng)，被子植物系統(tǒng)采用APG Ⅳ系統(tǒng)[9]。

（3）優(yōu)先采用相應(yīng)類群的分類學(xué)專家的審核意見

考慮到不同的植物分類學(xué)家對其所研究的植物類群在分類學(xué)、系統(tǒng)學(xué)以及最新的研究進(jìn)展等的掌握往往要遠(yuǎn)多于非該類群的分類學(xué)家，對其所研究的植物類群往往具有更深的理解。故我們優(yōu)先采用類群專家的意見，但專家對于我們所提出的處理意見如有不同意見，需要提供理由。

（4）《云南植物志》發(fā)表的新物種處理原則

《云南植物志》在編寫時(shí)命名了部分新物種。對于這部分名稱，我們通過查閱《云南植物志》的原始描述，視其描述的情況作刪除或保留處理。所有被列入不合格發(fā)表的新物種，在本數(shù)據(jù)集中一律不予采納。

（5）種下等級(jí)處理原則

為了更加精細(xì)化體現(xiàn)云南植物多樣性，我們采用變種或亞種的概念。并且，當(dāng)一個(gè)種的種下有2個(gè)以上的亞種或變種，若僅僅是某變種／亞種（包括原變種／亞種）分布于云南，則我們僅收錄該變種／亞種。但是在做物種統(tǒng)計(jì)時(shí)，若該物種僅有變種／亞種分布于云南而其原變種/原亞種不分布于云南時(shí)，我們將其作為種來統(tǒng)計(jì)。

（6）選用科屬種中文名的主要原則

選用的類群中文名優(yōu)先依據(jù)2015年由環(huán)保部和中國科學(xué)院聯(lián)合發(fā)布的《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》中的中文名稱，但有所修訂。對于《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》因各種原因沒有記載或者無法匹配時(shí)，我們依次優(yōu)先采用《云南植物志》和《Flora of China》所記載的中文名。對于發(fā)表在英文期刊的新種和中國新記錄種沒有中文名的，我們根據(jù)種加詞的譯意新擬中文名。

1.3 審核流程

《名錄》審核分為工作組初審、專家會(huì)審和函評、終審三個(gè)流程。

（1）工作組初審

初審主要由工作組完成，即根據(jù)以上原則對云南省記錄的所有物種名稱進(jìn)行逐一審核。

（2）專家審核采用“會(huì)議評審”和“函評審核”兩種形式

會(huì)議評審：邀請?jiān)颇鲜?nèi)外有關(guān)植物分類學(xué)專家在中科院昆明植物所進(jìn)行2次《名錄》專家審核會(huì)。專家組成員提出質(zhì)疑，由工作組成員根據(jù)專家意見進(jìn)行審核和修改。

函評審核：對因故不能參會(huì)的專家，以及一些?？茖俚膶＜遥ㄟ^電子郵件的方式邀請專家對相應(yīng)的科屬進(jìn)行審核。由專家出具書面審核意見和建議。工作組據(jù)此進(jìn)行修改、調(diào)整和完善。

（3）終審

所有審核意見匯總并修改完善后，工作組再根據(jù)專家的意見對所有名錄進(jìn)行逐一核實(shí)、審校和完善，對名錄進(jìn)行去除重復(fù)等處理，排除編輯和排版中出現(xiàn)的錯(cuò)誤，最終擬定《名錄》初稿；同時(shí)完善審核依據(jù)，在提供每個(gè)物種的原始資料和信息的基礎(chǔ)上，形成最終評估報(bào)告，最后遞交專家委員會(huì)審定。

2 數(shù)據(jù)樣本描述

數(shù)據(jù)集包括云南省種子植物253科2 392屬16 064種（含種下等級(jí)，不含種下等級(jí)的物種數(shù)為14 538種）。其中，云南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級(jí)，不含種下等級(jí)的物種數(shù)為105種）；被子植物244科2 367屬15 951種（含種下等級(jí)，不含種下等級(jí)的物種數(shù)為14 433種）。數(shù)據(jù)內(nèi)容由4部分?jǐn)?shù)據(jù)組成，分別為拉丁科名、中文科名、學(xué)名、中文名。

圖1 云南省裸子植物數(shù)據(jù)集

圖2 云南省被子植物數(shù)據(jù)集

3 數(shù)據(jù)質(zhì)量控制和評估

為了保證數(shù)據(jù)的質(zhì)量，在對云南省種子植物評價(jià)和審核的過程中組建了顧問委員會(huì)、核心專家組、工作組。

顧問委員會(huì)：由中華人民共和國瀕危物種科學(xué)委員會(huì)、云南瀕危物種科學(xué)委員會(huì)、中國科學(xué)院、云南省環(huán)境保護(hù)廳、云南省林業(yè)廳和云南大學(xué)等高校的15位專家組成。其中，院士6位，對評估過程進(jìn)行指導(dǎo)，并形成長效機(jī)制。

核心專家組：由國內(nèi)外11個(gè)科研院所及高校的28位資深專家組成。其中，國際專家1人，具高級(jí)職稱24人。

工作組：由中國科學(xué)院昆明植物研究所和吉首大學(xué)研究人員組成。

4 數(shù)據(jù)價(jià)值

本數(shù)據(jù)集是迄今為止云南省最權(quán)威、最準(zhǔn)確的種子植物物種名錄，為今后開展云南省種子植物的物種研究，生物多樣性的保護(hù)、科學(xué)利用、各級(jí)政府部門生物多樣性相關(guān)管理和決策提供了科學(xué)依據(jù)。

5 數(shù)據(jù)使用方法和建議

本數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu)較為簡單，包含 4個(gè)字段的信息，在 Science Data Bank的鏈接地址為http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/489。如對名錄有超出數(shù)據(jù)集及所包含信息的需求，請聯(lián)系本文通訊作者陳家輝或?qū)O航，郵箱：chenjh@mail.kib.ac.cn，sunhang@mail.kib.ac.cn。目前本數(shù)據(jù)集已建成專題數(shù)據(jù)庫（http://bio360.kun.ac.cn/index/special），本數(shù)據(jù)庫將持續(xù)進(jìn)行數(shù)據(jù)更新和功能完善，以建成云南生物物種名錄的信息服務(wù)平臺(tái)。