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        染色體微陣列技術(shù)在復(fù)發(fā)性流產(chǎn)病因診斷中的應(yīng)用*

        2018-11-15 07:32:44熊佳麗王晶董一善劉建兵虞斌顧建東
        關(guān)鍵詞:三體數(shù)目絨毛

        熊佳麗,王晶,董一善,劉建兵,虞斌,顧建東

        (南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州婦幼保健院1.婦產(chǎn)科,2.實(shí)驗(yàn)室,江蘇 常州 213000)

        自然流產(chǎn)在妊娠人群中的發(fā)生率達(dá)10%~15%[1],多為妊娠12周前的早期流產(chǎn)。復(fù)發(fā)性流產(chǎn)指同一性伴侶連續(xù)發(fā)生3次及3次以上的自然流產(chǎn)。復(fù)發(fā)性流產(chǎn)患者隨著流產(chǎn)次數(shù)的增加,月經(jīng)失調(diào)、宮腔粘連、繼發(fā)不孕的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)不斷增加,患者及其家庭的悲傷、焦慮等不良情緒顯著增加,故目前普遍認(rèn)為連續(xù)發(fā)生2次流產(chǎn)即應(yīng)當(dāng)重視并進(jìn)行評(píng)估。自然流產(chǎn)常見(jiàn)的原因包括胚胎染色體異常、免疫失衡、內(nèi)分泌異常、血栓形成傾向、生殖道畸形或發(fā)育不良、生殖道感染及宮頸機(jī)能不全等,其中胚胎染色體異常率在早期自然流產(chǎn)中約占50%~60%[2-3]。因此,胚胎或絨毛組織的染色體檢測(cè)分析對(duì)本次自然流產(chǎn)的病因診斷具有重要意義,為今后的生育指導(dǎo)提供重要信息。

        染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis, CMA)是一項(xiàng)新興的以微陣列為基礎(chǔ)的染色體分析技術(shù),對(duì)全基因組進(jìn)行掃描,可檢出拷貝數(shù)變異(copy number variation, CNV)<1 kb的微缺失和微重復(fù),突破了以往的細(xì)胞核型分析只能發(fā)現(xiàn)5 mb以上遺傳物質(zhì)改變的技術(shù)局限性,且無(wú)需組織或細(xì)胞培養(yǎng),避免母體污染,故而將CMA技術(shù)應(yīng)用在自然流產(chǎn)的病因診斷中是很有指導(dǎo)意義的。本研究采用CytoScan 750K基因芯片(美國(guó)Affymetrix公司)對(duì)61例自然流產(chǎn)患者(流產(chǎn)次數(shù)≥2次)的胚胎絨毛組織進(jìn)行CMA檢測(cè)分析,探討CMA技術(shù)在復(fù)發(fā)性流產(chǎn)病因診斷中的臨床應(yīng)用價(jià)值,并對(duì)夫妻雙方再次生育進(jìn)行遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和指導(dǎo),現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 資料與方法

        1.1 研究對(duì)象

        選取2015年9月-2017年6月南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州婦幼保健院婦科就診,自然流產(chǎn)次數(shù)≥2次,經(jīng)陰道超聲確認(rèn)胚胎停止發(fā)育需行清宮術(shù)的孕婦61例,選取無(wú)菌清宮術(shù)取出的胚胎絨毛組織進(jìn)行CMA(芯片)檢測(cè)?;颊吣挲g22~42歲,平均29.9歲;孕周6.43~13周,平均8.86周;流產(chǎn)次數(shù)2~4次。所有患者均簽署CMA(芯片)檢測(cè)知情同意書(shū)。

        1.2 材料與試劑

        人類(lèi)組織DNA提取試劑盒(德國(guó)Qiagen公司),NspⅠ酶、T4連接酶、PCR純化試劑盒、片段化及標(biāo)記試劑盒、CytoScan 750K(55萬(wàn)個(gè)CNV探針+20萬(wàn)個(gè)SNP探針)芯片試劑盒(美國(guó)Affymetrix公司),PCR擴(kuò)增試劑盒(美國(guó)Clontech公司)。

        1.3 儀器與設(shè)備

        雜交儀Genechip hybridization oven 645、洗滌工作 站GeneChip?Fluidics Station、 掃 描 儀GeneChip?Scanner GCS 3000Dx v.2 System均采用美國(guó)Affymetrix公司生產(chǎn)。

        1.4 實(shí)驗(yàn)方法

        無(wú)菌清宮術(shù)中獲取的新鮮胚胎組織,經(jīng)生理鹽水沖洗后,用清潔、鋒利的手術(shù)剪剪取絨毛組織約20~100 mg,置于裝有生理鹽水的1.5 ml離心管中,并于1 h內(nèi)送實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。所有胚胎絨毛組織采用人類(lèi)組織DNA提取試劑盒提取全基因組DNA。CMA檢測(cè)均嚴(yán)格按照Affymetrix公司提供的標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行,具體步驟簡(jiǎn)列如下:取250 ng胚胎絨毛組織DNA經(jīng)Nsp I酶消化為短片段,將NspⅠ消化產(chǎn)物末端補(bǔ)齊后經(jīng)T4連接酶連接上共同引物,并進(jìn)行PCR擴(kuò)增、純化,經(jīng)片段化及標(biāo)記后與雜交液混合均勻,變性后加載于Cyto Scan 750K芯片并置于雜交儀中50℃ 60 r/min,雜交16~18 h;經(jīng)洗滌工作站洗脫染色后用掃描儀捕獲圖像,獲取原始數(shù)據(jù)。

        1.5 結(jié)果判讀

        CMA獲得的原始數(shù)據(jù)應(yīng)用Affymetrix Chromosome Analysis Suite Software 進(jìn)行分析。參照國(guó)際基因組CNV多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)DGV(http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home)、OMIM(http://www.omim.org)、DECIPHER(http://decipher.sanger.ac.uk)、ISCA(http://clinicalgenome.org)等數(shù)據(jù)庫(kù)以及相關(guān)文獻(xiàn)判讀CNVs。CMA結(jié)果解讀報(bào)告嚴(yán)格按照美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)會(huì)對(duì)基因芯片拷貝數(shù)變異結(jié)果解讀指南[5],將CNV分為3個(gè)等級(jí):①致病性CNV;②不確定臨床意義的CNV;③非致病性CNV。

        1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        數(shù)據(jù)分析采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件,計(jì)數(shù)資料采用頻數(shù)及率表示,比較采用χ2檢驗(yàn)或者Fisher確切概率法,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 染色體異常的類(lèi)型及各類(lèi)型分布

        篩選入組的61例自然流產(chǎn)患者胚胎絨毛組織樣本進(jìn)行CMA檢測(cè),均獲得診斷結(jié)果,檢測(cè)成功率為100%,其中36例樣本CMA檢測(cè)發(fā)現(xiàn)異常結(jié)果,陽(yáng)性率59.0%,包括染色體數(shù)目異常31例(86.1%),染色體結(jié)構(gòu)異常4例(11.1%),整套染色體單親二倍體1例(2.7%)。首先,在31例染色體數(shù)目異常結(jié)果中發(fā)現(xiàn)常染色體三體23例、性染色體數(shù)目異常3例、嵌合體3例及三倍體2例。本研究中發(fā)現(xiàn)的常染色體數(shù)目異常中以16三體最為多見(jiàn),其次為9三體、21三體及22三體;3例性染色體數(shù)目異常均為X單體。其次,本研究中發(fā)現(xiàn)4例染色體結(jié)構(gòu)異常,包括貓叫綜合征1例、Y染色體微缺失1例及2P24.3微重復(fù)1例,另有1例12q微重復(fù)(780 kb)經(jīng)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢(xún)臨床意義不確定,該例患者共自然流產(chǎn)3次,前兩次孕2個(gè)月經(jīng)陰道B超均未探及胎心。見(jiàn)表1。

        表1 36例自然流產(chǎn)患者胚胎絨毛組織CMA檢測(cè)異常結(jié)果

        2.2 染色體異常在不同孕周中的分布情況

        61例樣本中,以8周前的復(fù)發(fā)性流產(chǎn)最為多見(jiàn),占34.4%,經(jīng)CMA檢測(cè),其異常率也最高,達(dá)85.7%。同時(shí),流產(chǎn)時(shí)間發(fā)生越早,胎兒染色體異常率呈增高的趨勢(shì)。見(jiàn)表2。

        2.3 不同年齡階段的染色異常情況

        高齡婦女流產(chǎn)組織染色體數(shù)目異常率高達(dá)81.8%,高于低齡婦女(81.8% vs 26.0%)(P<0.05)。見(jiàn)表3。

        2.4 流產(chǎn)次數(shù)與染色體異常分布情況

        61例樣本中,流產(chǎn)次數(shù)為2次的患者共46例、3次為13例、4次為2例。其中以2次流產(chǎn)中出現(xiàn)染色體異常最為多見(jiàn),異常率達(dá)60.9%,隨著流產(chǎn)次數(shù)的增加,異常率呈逐漸下降趨勢(shì)。見(jiàn)表4。

        表2 不同孕周染色體異常分布情況

        表3 不同年齡階段染色體異常比較

        表4 不同流產(chǎn)次數(shù)與染色體核型異常分布情況

        3 討論

        CMA這一遺傳學(xué)診斷技術(shù),最大特點(diǎn)的就是一次檢測(cè)即能夠?qū)φ麄€(gè)基因組拷貝數(shù)進(jìn)行高通量、高分辨率、高敏感性?huà)呙韬头治?,能夠精確定位變異區(qū)段的位置、清除顯示該區(qū)段的內(nèi)的基因含量,并能夠?qū)蜻M(jìn)行分析,在基因水平上解釋患者的臨床表現(xiàn),并評(píng)估預(yù)后,故CMA 能夠較其他染色體分析技術(shù),能更有效地檢出由于染色體導(dǎo)致的流產(chǎn),并通過(guò)對(duì)夫妻雙方相應(yīng)位點(diǎn)的檢測(cè),對(duì)再次生育進(jìn)行遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,具有其他染色體分析技術(shù)所無(wú)法比擬的優(yōu)越性[6]。

        本研究對(duì)61例流產(chǎn)樣本進(jìn)行了CMA檢測(cè),成功率達(dá)100%。發(fā)現(xiàn)染色體異常36例,陽(yáng)性率為59.0%,其中數(shù)目異常31例,占86.1%,是導(dǎo)致胚胎流產(chǎn)的主要原因。絕大多數(shù)染色體非整倍體為胚胎期致死性,其中16三體所占比例最高,其次為T(mén)urner綜合征,9、22和21三體也占較大的比例,而其他染色體三體所占比例較低。非整倍體多數(shù)在孕早期發(fā)生流產(chǎn),16三體一般在孕早期流產(chǎn),少數(shù)9、21三體及Turner綜合征病例流產(chǎn)可發(fā)生于孕中期甚至晚期[2-3,7]。若流產(chǎn)胚胎存在非整倍異常,那么這將是導(dǎo)致流產(chǎn)的根本原因。絕大多數(shù)染色體非整倍體為新發(fā)或者偶發(fā),因此建議患者自然妊娠,做好常規(guī)檢查、早中孕篩查、產(chǎn)前診斷。而13、15號(hào)染色體和21、22號(hào)染色體有發(fā)生羅伯遜易位的可能,再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)高,故建議夫妻雙方做核型分析,以排除羅伯遜易位,對(duì)再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估[8]。孕婦年齡常為染色體數(shù)目異常的高危因素,而本組患者年齡>35歲發(fā)生染色體數(shù)目異常共21例。因此對(duì)染色體數(shù)目異常的篩查不應(yīng)該僅僅關(guān)注高齡人群,因?yàn)檫@些異常應(yīng)該是由于非年齡因素所致。

        本研究共檢出4例染色體結(jié)構(gòu)異常,占13.8%,遠(yuǎn)高于以往研究6%的結(jié)論[9],其原因?yàn)楹诵头治龇直媛实?,?duì)染色體結(jié)構(gòu)異常的檢出率遠(yuǎn)低于CMA。2例樣本在染色體發(fā)生部分缺失和(或)重復(fù)。其中1例檢測(cè)結(jié)果顯示:①arr[hg19]5p15.33p15.2(113 576-10 720 924)×110 607 kb致病性變異;②arr[hg19]11p15.5p15.4(230 680-9 273 889)×39 043 kb 致病性變異。該患者染色體在5p15.33p15.2區(qū)段有10 607 kb片段缺失,內(nèi)含8個(gè)致病基因,11p15.5p15.4區(qū)段有9 043 kb片段重復(fù)。其臨床表現(xiàn)為:出生后尖銳的貓叫樣哭聲,智力低下,整體發(fā)育遲緩,小頭畸形及異常面容,語(yǔ)言發(fā)育遲緩,生長(zhǎng)發(fā)育遲緩,并可能伴有先天性心臟病、神經(jīng)及腎臟相關(guān)的異常和畸形[10-11]。針對(duì)此類(lèi)患者,考慮為流產(chǎn)兒父母雙方一方可能為4號(hào)、9號(hào)染色體的平衡易位的攜帶者。故建議雙方均需行染色體檢查,以此來(lái)確認(rèn)胎兒異常的來(lái)源并為再次妊娠提供產(chǎn)前診斷依據(jù)。

        綜上所述,CMA技術(shù)用于自然流產(chǎn)胚胎組織的染色體分析成功率高,分辨率高,>5 Mb的CNV亦能檢測(cè)出,在常規(guī)染色體核型分析中很難或不能被發(fā)現(xiàn)而導(dǎo)致漏診;其次CMA檢測(cè)對(duì)標(biāo)本取材要求遠(yuǎn)低于傳統(tǒng)染色體核型分析技術(shù),不需要活細(xì)胞,可以直接提取流產(chǎn)絨毛及死胎組織,能夠提供快速、準(zhǔn)確的流產(chǎn)物全基因組分析,能夠檢測(cè)染色體數(shù)目異常、結(jié)構(gòu)異常、嵌合體等,且無(wú)需標(biāo)本培養(yǎng)。其有效克服了現(xiàn)有其他染色診斷技術(shù)的缺點(diǎn),準(zhǔn)確地檢驗(yàn)出常規(guī)核型能發(fā)現(xiàn)的非平衡染色體變異,以后核型技術(shù)無(wú)法檢測(cè)到的拷貝數(shù)變異,將染色體的診斷水平提高到基因水平,在遺傳學(xué)分析中表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(shì),可以讓那些發(fā)生復(fù)發(fā)性流產(chǎn)的患者減少不必要的檢查和治療,為流產(chǎn)病因分析和對(duì)夫妻雙方再次生育指導(dǎo)提供更有價(jià)值的信息。

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