張成兵, 劉青利, 張先平, 李 云, 邢麗紅, 張 羽
(1.陜西省漢中市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,陜西漢中 723000; 2.陜西省渭南市臨渭區(qū)種子管理站,陜西渭南 714000;3.陜西理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,陜西漢中 723000)
條銹病是由條形柄銹菌小麥專化型(Pucciniastriiformisf. sp.tritici)引起的小麥葉部病害,是世界上小麥的主要真菌病害,也是我國小麥生產(chǎn)中重要的病害之一,在我國曾多次大流行[1]。防治小麥條銹病主要通過使用化學(xué)農(nóng)藥和種植抗性品種2種途徑,化學(xué)防治通常成本高、污染環(huán)境且殘留的成分危害人類健康。因此,發(fā)掘新的優(yōu)良抗條銹病基因及其緊密連鎖的分子標記,培育持久高抗病品種具有經(jīng)濟、有效、環(huán)保等重要意義。隨著DNA分子標記技術(shù)的發(fā)展,相繼開發(fā)了一些與條銹病抗性基因緊密連鎖的分子標記,利用已知抗條銹病基因的分子標記,可以從DNA水平上對育種材料進行快速、準確的檢測和評價,進而明確小麥品種中抗性基因的分布,為高效開展條銹病抗性基因聚合育種帶來了新的契機。Chen等篩選到了與抗性基因Yr5緊密連鎖的隨機擴增多態(tài)性DNA(random amplification polymorphism DNA,簡稱RAPD)和簡單序列重復(fù)(simple sequence repeat,簡稱SSR)標記[2]。Weng等篩選到了與Yr9緊密連鎖的SSR標記Xgwm582(3.7 cM)和Xgwm264(37.9 cM)[3]。邵映田等在Yr10的供體親本Moro中篩選到與Yr10緊密連鎖的擴增片段長度多態(tài)性(amplification fragment length polymorphism,簡稱AFLP)標記[4]。Peng等研究了與抗條銹病基因YrH52、Yr15連鎖的分子標記[5]。劉亞萍在小麥1BS上篩選到Y(jié)r24的SSR標記Xgwm11(6.1 cM)和Xgwm273(7.1 cM)[6]。嚴俊等在抗病材料H52中篩選到抗性連鎖的抗性基因類似物(resistance gene analogue,簡稱RGA)分子標記[7]。殷貴鴻等從小麥抗條銹病骨干親本周8425B中篩選得到與抗性基因緊密連鎖的片段長度為343 bp的抗病基因類似序列多態(tài)性分子標記技術(shù)(resistance gene analogue polymorphism,簡稱RGAP)標記Xrga-1[8]。李嘉從濟麥22/Avocet S和濟965261中分別找到了抗條銹病基因的連鎖SSR標記Xwmc658、Xgwm582[9]。朱曉娜等篩選到抗條中32號小種(CYR32)的特異RAPD標記S20[10]。目前,已有57個抗條銹病基因被正式命名,編號從Yr1到Y(jié)r54(其中有等位基因),以第1個抗條銹病基因Yr10為代表的數(shù)個基因被克隆。但生產(chǎn)中由于大面積種植單一小麥品種,致使條銹菌在定向的選擇壓力下迅速變異,并引起優(yōu)勢小種種群的增長和小麥條銹菌新小種的產(chǎn)生,進而導(dǎo)致一個抗銹品種在生產(chǎn)上能大面積應(yīng)用的時間較短,隨著其原有抗銹性的喪失而失去應(yīng)用價值,特別是新的條銹菌生理小種條中32(CYR32)和條中33(CYR33)的出現(xiàn)和蔓延,導(dǎo)致多數(shù)主栽品種失去抗性。目前,對CYR32和CYR33表現(xiàn)抗性的主效基因僅剩Yr5、Yr15、Yr24、Yr26(與Yr24等位)、YrH52、YrZH84等。李在峰用26個國內(nèi)外條銹菌生理小種對98個我國小麥品種(系)進行苗期基因推導(dǎo),發(fā)現(xiàn)攜帶Yr9基因的材料占43%,其次為Yr26基因[11]。伍玲等檢測了2004、2005年四川省小麥區(qū)域試驗72份材料中抗條銹基因Yr5、Yr10、Yr15的分布情況,攜帶Yr15基因的材料最多,占11.11%,其次為Yr5基因,占5.56%,再次為Yr10基因,占 1.34%[12]。李峰奇等對126份我國黃淮麥區(qū)重要的小麥品種(系)進行抗條銹病基因分子檢測,發(fā)現(xiàn)攜帶Yr9基因的小麥品種頻率最高,為41.6%,其次是Yr5、Yr10、Yr15、Yr26基因[13]。張勝利等用不同材料檢測抗性基因Yr5-156、Yr9-2、Yr24-1在不同材料中的分布情況,發(fā)現(xiàn)在感性材料中也能擴增出和抗病材料同樣的特異性目標條帶[14-16]。王欣等對青海省育成和引進的137份小麥品種進行Yr10、Yr15基因的特定序列擴增區(qū)域(sequence characterized amplified regions,簡稱SCAR)標記和SSR標記以及1BL/1RS易位的復(fù)合標記進行了檢測,結(jié)果顯示1BL/1RS易位占參試材料的16.1%,其次為Yr15基因,占13.9%,再次為Yr10基因,占2.9%[17]。薛文波等對74個主栽小麥品種進行了連續(xù)2年的成株期抗病性鑒定結(jié)合抗性基因檢測,攜帶Yr9基因的占32.43%,攜帶Yr26基因的占6.76%,攜帶Yr17基因的占5.41%,74個供試材料中未檢測到Y(jié)r5、Yr10、Yr15、Yr18基因[18]。張玉薇等利用Yr10、Yr18基因以及1BL/1RS易位的SCAR或STS標記在75份2006—2010年國家審定的小麥品種中的分子檢測顯示,攜帶Yr10基因的占17.33%,攜帶Yr18基因的占1.33%,1份材料中同時檢測到Y(jié)r10+Yr18基因組合,25份材料中含有 1BL/1RS 易位片段[19]。李敏州等對115份陜西省主栽和后備小麥品種(系)進行抗性基因檢測,結(jié)果顯示攜帶Yr9基因的占35.65%,攜帶Yr5基因的占2.61%,攜帶Yr18基因的占 2.61%,攜帶Yr26基因的占1.74%,115份材料中均不含Yr10基因[20]。徐琪等構(gòu)建了檢測Yr1、Yr2基因的分子標記gwm372和gwm382,并用此檢測來自我國各麥區(qū)的181份小麥高代系材料,結(jié)果顯示Yr1、Yr2基因在181份小麥高代系材料中占比較低[21]。陳天青等調(diào)查了140份2013—2014年西南地區(qū)主要的小麥種質(zhì)資源中幾個抗銹病基因的分布情況,顯示攜帶Yr26基因的占41.4%,其次為Yr9基因,占37.9%,Yr10、Yr15、Yr18基因占比較低,Yr9+Yr26基因組合出現(xiàn)的頻率較高[22]。孫建魯?shù)葘?00個小麥品種資源抗條銹病基因Yr5、Yr10、Yr15、Yr18、Yr24、Yr26的檢測結(jié)果顯示,攜帶Yr18基因的占19.00%,攜帶Yr10基因的占4.00%,攜帶Yr15基因的占2.00%,攜帶Yr5基因的占1.00%,供試材料中均不含Yr24、Yr26基因[23]。李北等對重慶地區(qū)的18份當?shù)刂髟云贩N和89份高代品系材料進行了7個已知抗條銹基因的分子檢測,供試材料中攜帶Yr26基因的最多,占 36.45%,其次為Yr9基因,占19.63%,攜帶Yr17基因的占15.89%,攜帶Yr18基因的占2.80%,沒有檢測到含Yr5、Yr10、Yr15基因的材料[24]。黃亮等對我國小麥主產(chǎn)區(qū)的79個小麥品種(系)進行抗條銹病基因檢測,結(jié)果表明供試小麥品種中1B/1R易位的占44.3%,攜帶Yr10基因的占10.1%,攜帶Yr5基因的占5.1%,攜帶Yr18基因的占3.8%,攜帶Yr26基因的占1.3%[25]。白微微等檢測46份新疆麥區(qū)小麥材料中Yr10基因及1BL/1RS易位的分子標記,發(fā)現(xiàn) 1BL/1RS 易位的占19.57%,攜帶Yr10基因的占2.20%[26]。我國小麥品種中抗條銹基因過于單一,在我國條銹病流行區(qū)主栽品種中,有效抗源主要集中在92R系列(攜帶Yr26)、貴農(nóng)系以及少數(shù)攜帶Yr24的國際玉米小麥改良中心(centro internacional de mejoramientode maizy trigo,簡稱CIMMYT)抗源種質(zhì)[27]。
本研究以陜西省漢中地區(qū)大面積種植品種漢麥5號(漢5)和漢麥6號(漢6)為母本,以抗源品種貴農(nóng)22中選出的一個品系為父本進行雜交,以多代定向選擇選育出的高代品系為供試材料,通過檢測與Yr5、Yr9、Yr15等基因連鎖的分子標記在供試材料中的分布情況,以期為新品種(系)的抗性遺傳基礎(chǔ)鑒定及持久抗性材料選育提供技術(shù)支撐。同時,選取與Yr9基因遺傳距離不同的2個連鎖分子標記進行檢測,以驗證分子標記與目標基因之間是否發(fā)生交換。
供試材料45份,其中陜西省漢中地區(qū)大面積種植品種6份(漢5、漢6、D002、川麥42、9503、川麥107),漢5與貴農(nóng)22雜交后選育的高代品系4份(漢5-1、漢5-2、漢5-3、漢 5-4),漢6與貴農(nóng)22雜交后選育的高代品系32份(漢6-1至漢6-32),育種材料2份[貴農(nóng)22-1、貴農(nóng)22(病圃)],抗銹性鑒定誘發(fā)品種1份(銘賢169),所有材料均由陜西省漢中市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所提供。
1.2.1 基因組DNA提取及PCR 小麥基因組DNA采用十二烷基苯磺酸鈉(SDS)法提取,并采用0.8%瓊脂糖凝膠檢測基因組DNA的質(zhì)量。PCR反應(yīng)體系:2×TaqMaster Mix 15 μL,10 μmol/L正反引物各1 μL,DNA模板1 μL,反應(yīng)總體積為30 μL,用ddH2O補足。反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性 5 min;94 ℃變性50 s,x℃(此溫度根據(jù)引物而定)退火50 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離PCR產(chǎn)物,用銀染法顯色拍照。
1.2.2 引物信息 抗性基因的引物信息如表1所示,引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
Yr5基因的特異引物Yr5-156擴增的目標帶大小在 156 bp 左右[2]。由圖1可知,以100 bp DNA Marker為對照,攜帶Yr5基因的材料在156 bp左右均能擴增出特征性條帶,反之則沒有條帶。
表1 引物信息
注:“?”代表遺傳距離不清楚。
由表2可知,在45份供試小麥材料中,42份材料檢測出Yr9-2基因,占93.33%;38份材料檢測出Yr5基因,占 84.44%;13份檢測出Yr10基因,占28.89%;16份檢測出YrH52基因,占35.56%;21份檢測出YrZH84基因,占 46.67%;17份材料檢測出Yr24基因,占37.78%;36份材料檢測出Yr9-1基因,占80.00%;26份材料檢測出YrJ22基因,占57.78%;18份材料檢測出S20標記,占40.00%。供試材料中,攜帶最多的為Yr9-2基因,其次為Yr5基因,所有材料中均不含Yr15基因。
由表3可知,與抗小麥條銹病有關(guān)的10個DNA分子標記檢測中,其中同時在1個材料中檢測到4個抗性DNA標記的最多,占22.22%;含有9個標記位點的材料只有漢6-31,占供試材料的2.2%;含有8個標記位點的材料有5份,分別為漢6、漢5-1、漢6-16、漢6-24、漢6-25,占供試材料的 11.1%。可見這些材料除不含對CYR32、CYR33表現(xiàn)抗性的主效基因Yr15外,其他基因如Yr5、Yr24、Yr26、YrH52、YrZH84等均存在,這些材料可以在育種及生產(chǎn)中廣泛推廣應(yīng)用,尤其是漢6-31,可以加大該主栽品種的推廣力度。
本研究采用與小麥抗條銹病基因連鎖的10個分子標記對45份陜西省漢中地區(qū)主要小麥種質(zhì)資源進行檢測,銘賢169在小麥抗條銹病基因的圖位克隆定位中常被用來作為感病品種,本研究檢測的10個分子標記在銘賢169中均沒有檢測到,可以看出試驗結(jié)果可信度較高。張勝利等用Yr5、Yr9基因抗性標記對小麥條銹病表現(xiàn)不同的抗感材料檢測時,在感性材料中發(fā)現(xiàn)也能擴增出和抗病材料同樣的特異性目標條帶,一方面暗示了抗病表型與基因關(guān)系的復(fù)雜性,不是簡單的一對一關(guān)系,另一方面可能由于標記與基因之間沒有達到完全的共分離程度,導(dǎo)致標記與目的基因之間發(fā)生了交換[14-15]。本研究利用與Yr9基因連鎖(Xgwm264-Xgwm582-Yr9)的遺傳距離不同的2個標記(Xgwm582、Xgwm264)同時檢測,從結(jié)果可以看出,用來檢測Yr9基因的2個分子標記結(jié)果有所差異,有的材料可能在Xgwm264與Yr9基因之間發(fā)生了交換。如果以與Yr9基因緊密連鎖的SSR標記Xgwm582為依據(jù),在45份供試小麥材料中,Yr5基因的檢出率最高,其次為Yr9-1(Xgwm582)基因,說明攜帶Yr5、Yr9基因的材料是目前陜西省漢中地區(qū)小麥種質(zhì)資源中的有效抗源,這與Yr9基因曾廣泛應(yīng)用于小麥抗條銹病育種有關(guān)。來源于野生二粒小麥的抗性基因Yr15、YrH52雖然都被定位在染色體1BS上,但本研究檢測Yr15、YrH52基因的不一致結(jié)果也與Peng等推測其為2個不同的基因[5]一致。貴農(nóng)22是陜西省漢中市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所在全國小麥品種抗病性變異觀察圃(漢中點)中選出的一個抗源材料,韓德俊等也曾報道,在目前我國條銹病流行區(qū)主栽品種中,有效抗源主要集中在92R系列(攜帶Yr26基因)、貴農(nóng)系和少數(shù)攜帶Yr24基因的CIMMYT抗源種質(zhì)[27]。貴農(nóng)22作為抗源材料之一, 與漢中麥區(qū)的主栽品種雜交,選育抗條銹病的小麥新品種與新材料具有很好的實踐意義,本研究的結(jié)果也印證了這一點,在選育的高代品系中含有8個及以上分子標記位點的材料有6份,這為以后的選育工作奠定了基礎(chǔ)。
表2 抗條銹病基因在供試材料中的分布情況
注:“+”代表檢測到特定條帶,“-”代表未檢測到特定條帶。
表3 供試材料攜帶的抗性標記位點數(shù)目
在小麥抗條銹病的分子標記開發(fā)中,很多標記是基于特定材料而構(gòu)建的,其變異位點不一定適合對所有小麥資源進行抗感檢測,在其功能標記未探明前,往往與目標基因有多個連鎖標記,在分子標記輔助育種進行選擇時應(yīng)選擇遺傳距離最小的標記,同時應(yīng)盡量把分子標記檢測與田間抗病性鑒定結(jié)合起來共同篩選抗性資源。另外,由于新的抗條銹病生理小種的出現(xiàn),在小麥抗條銹病育種中應(yīng)不斷發(fā)掘、擴增新的小麥條銹病抗源,以培育新的優(yōu)勢抗病品種。