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        白樺APETALA2基因啟動子的克隆及其表達分析

        2018-07-24 00:52:22胡曉晴朱德財辛琪琪劉雪梅
        植物研究 2018年4期
        關鍵詞:培苗白樺著色

        趙 桐 胡曉晴 朱德財 田 晶 辛琪琪 劉雪梅

        (東北林業(yè)大學生命科學學院,哈爾濱 150040)

        APETALA2/ethylene-responsive element binding protein(AP2/EREBP)轉錄因子家族普遍存在于所有植物中,參與植株的生長發(fā)育、脅迫應答和多種生理生化反應的信號轉導。近年來,在動物中也已經發(fā)現其家族成員[1]。該家族中的AP2轉錄因子亞家族參與調控花、胚珠和種子的發(fā)育。APETALA2(AP2)基因是AP2亞家族的成員,作為花發(fā)育模型中的A類基因,參與植物花器官的發(fā)育過程,控制萼片和花瓣的生長[2]。AP2基因與其他花發(fā)育基因不同,具有獨特的AP2結構域[3],該結構域能識別DNA并結合。近年來的研究發(fā)現,矮牽?;?Petuniahybrida)的AP2類基因對花的發(fā)育產生影響[4],在擬南芥(Arabidopsisthaliana)中過表達挪威云杉(Piceaabies)的PaAP2L2基因會阻礙植株生長[5],在雜交落葉松(Larix×marschlinsii)中發(fā)現的AP2同源類似物LmAP2L1和LmAP2L2,直接影響其體細胞的胚胎發(fā)生和萌發(fā)[6],蘋果(Maluspumila)的MAP2A基因,被發(fā)現在其多種組織中表達[7],而玉米(ZeamaysL.)的AP2-like基因在18種組織中均表達[8],水稻(Oryzasativa)的OsAP2-1基因在花和根中有較高表達[9],不同植物中AP2基因的功能不盡相同,為研究AP2基因對白樺(BetulaplatyphyllaSuk.)生長發(fā)育過程的影響,本試驗通過克隆其特異性啟動子展開對其表達模式的研究。

        白樺是我國東北地區(qū)重要的闊葉樹種,是國家科技支撐計劃研究的重點樹種之一,具有極高的研究和利用價值。因其具有纖維素含量高而木質素含量低的優(yōu)良纖維性狀,白樺成為優(yōu)良的造紙原材料,其光滑細致的削面和富有韌性抗沖擊的特點,又使其成為極受歡迎的板材。白樺生長周期和有性生殖周期較長,雌雄花均為不完全花,且花器官退化為兩輪,花發(fā)育的關鍵階段歷時短,胚胎學上已對白樺生殖發(fā)育的研究有部分報道[10~13],但對其內在的分子機制還是研究甚少。本實驗室先期已進行了部分白樺花發(fā)育過程涉及的其他相關基因的克隆與研究,本試驗在此基礎上,構建BpAP2特異啟動子驅動的GUS表達載體,通過農桿菌介導轉化法,研究其組織表達模式,為后續(xù)更深入探究BpAP2基因在白樺生長發(fā)育過程中的功能、分析白樺生殖發(fā)育機制、改良白樺遺傳育種奠定了基礎。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        轉化材料為白樺四周齡組培苗第二和第三片葉、成年白樺的雌雄花及哥倫比亞擬南芥實生苗。DNA提取材料為白樺四周齡組培苗葉片,取材后液氮處理,隨即置于-80℃冰箱保存。

        1.2 試劑

        植物基因組DNA提取試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒以及普通質粒小提試劑盒購自北京天根公司。KOD FX Neo酶購自TOYOBO公司、核酸分子量標準(DNAmarker ladder)、T4-DNA連接酶、限制性內切酶ClaⅠ和XbaⅠ等購自NEB公司。GUS(β-葡萄糖苷酶,β-glucuronidase)組織化學染色底物5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D葡萄糖苷酸酯(X-Gluc)購自Sigma公司。

        1.3 方法

        1.3.1 白樺BpAP2基因啟動子的克隆和元件分析

        根據已知的BpAP2基因序列(圖4),與白樺基因組數據庫進行比對,得到啟動子序列,命名為proBpAP2,設計含酶切位點的全長引物F(CCATCGATTAGACGGAATAGACGCACTT,下劃線處為酶切位點ClaⅠ)和R(CGTCTAGAACGAGAACCCGAACAACT,下劃線處為酶切位點XbaⅠ)。以白樺組培苗葉片基因組為模板擴增全長啟動子序列,PCR反應程序參照TOYOBO KOD FX Neo說明書:94℃,2 min;98℃,10 s;65℃,30 s,每循環(huán)降低0.5℃;68℃,35 s,共15次循環(huán);98℃,10 s;50℃,30 s;68℃,35 s;共15次循環(huán);68℃,7 min??寺≈帘磉_載體pBI121-35S::GUS后測序鑒定,命名為pBI121-proBpAP2::GUS質粒,利用PLACE(http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html)和PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線分析軟件進行啟動子元件分析。

        1.3.2 農桿菌滲透法轉化白樺及擬南芥

        將構建好的pBI121-proBpAP2::GUS質粒用液氮法轉入農桿菌EHA105菌株。參照李萌等[14]的方法侵染白樺,程序如下:培養(yǎng)菌液至OD600=0.5,用1/2MS液體培養(yǎng)基重懸菌體至OD600=0.8,將白樺組培苗葉片放入,25℃ 120 r·min-1培養(yǎng)2 d,每16 h更換1次新鮮1/2MS液體培養(yǎng)基。

        擬南芥的轉化參照郭勇等[15]的方法,當菌液OD600為0.6~0.7時,5 000 r·min-1離心7 min收集菌體。將擬南芥置于25%蔗糖質量分數的1/4MS高滲溶液中25℃下浸泡15 min,轉入OD600=1.0的侵染液中,25℃搖床內120 r·min-1培養(yǎng)2.5 h,500 mmol·L-1甘露醇洗3 min,取出后置于共培養(yǎng)培養(yǎng)基上,放在(23±2)℃培養(yǎng)條件下培養(yǎng)72 h。

        1.3.3 GUS染色

        X-GLUC染色液配制和染色參照郭勇等[15]的方法,染液配方:200 mmol·L-1的磷酸緩沖液50 mL(pH=7.0);100 mmol·L-1的Na2EDTA溶液10 mL,5 mmol·L-1的K3[Fe(CN)6]10 mL,5 mmol·L-1的K4[Fe(CN)6]10 mL,100% Triton-100 10 μL,X-GLUC 60 mg。將侵染后的擬南芥和白樺苗放入含有染液的50 mL離心管中,37℃黑暗染色過夜,卡諾固定液脫色1~3 h,觀察拍照,每個實驗重復3次。

        2 結果與分析

        2.1 白樺AP2啟動子的獲得及表達載體構建

        以白樺組培苗DNA為模板PCR擴增獲得長度為2 308 bp的單一條帶(圖1),測序后確認為白樺AP2基因的啟動子序列proBpAP2,將其與植物表達載體pBI121-35S::GUS重組后獲得proBpAP2特異啟動子驅動的植物表達載體,命名為pBI121-proBpAP2::GUS(圖2)。

        圖1 proBpAP2啟動子片段的擴增Fig.1 Amplification of proBpAP2 fragment M.DL5000 marker

        圖2 proBpAP2-pBI121-GUS表達載體構建示意圖Fig.2 pBI121-BpAP2::GUS expression vector construction diagram

        2.2 白樺proBpAP2啟動子序列分析及順式元件預測

        利用PLACE和Plantcare在線軟件分析,發(fā)現proBpAP2啟動子序列除含有大多數高等植物啟動子共有的TATA Box和CAAT Box保守元件外,還包含大量光調控元件如3-AF1 binding site、Box4、BoxⅠ、CATT-motif、GA-motif、GAG-motif、GT1-motif、SP1、TCCC-motif、BoxⅡ、as-2-box、chs-CMA2b,另外還有涉及ABA響應的CE3和ABRE,MeJA響應的TGACG-motif和CGTCA-motif,GA3響應的GARE-motif,低溫響應的LTR元件,SA響應的TCA-element,生長素響應的TGA-element(表1)及高轉錄水平作用元件。除上述響應元件外,proBpAP2還具有節(jié)律調節(jié)元件,分生組織和胚乳表達元件以及厭氧誘導必需元件,因此,BpAP2可能具有多種生物學功能,參與復雜的植物發(fā)育過程。

        2.3 白樺proBpAP2啟動子活性分析

        2.3.1 proBpAP2在擬南芥中的轉錄活性

        將構建好的pBI121-BpAP2::GUS融合表達載體及pBI121-35S::GUS在擬南芥中進行農桿菌侵染后,經GUS組織化學染色結果顯示,野生型擬南芥未著色,而被proBpAP2和35S啟動子驅動的GUS基因在轉基因擬南芥整株苗中均有轉錄活性(圖3A),35S啟動子驅動的GUS片段轉化后著色程度比proBpAP2更深,說明proBpAP2啟動子可在擬南芥多種組織中驅動轉錄。另外,proBpAP2在花器官如花瓣、雄蕊和心皮中均有轉錄活性(圖3C),在柱頭、心皮底端與花柄連接處著色更深,花藥和花絲的著色程度基本一致(圖3D),在角果維管組織中也有較深著色(圖3E)??梢?,白樺BpAP2基因可能參與營養(yǎng)器官和生殖器官的發(fā)育。

        2.3.2 proBpAP2在白樺中的轉錄活性

        為進一步驗證proBpAP2在同源表達系統中的活性,將其進行白樺轉化,野生型未著色,而被35S和proBpAP2啟動子驅動的GUS基因在轉基因白樺葉片中均有表達,但在proBpAP2驅動下在葉脈處著色更明顯,說明proBpAP2啟動子在同源表達系統中同樣具有一定程度的啟動活性。另外,對白樺組培苗的腋芽、根、莖進行了轉化和活性分析,發(fā)現在整個根部的顏色都較深(圖3G),在腋芽頂部著色較深,(圖3F),在莖中著色較淺(圖3H)。除了營養(yǎng)器官,在花器官和果實中也有一定轉錄活性。在種翅、退化的柱頭頂端(圖I)和雌花花柄(圖J)中的著色較深,而在成熟花藥中則很低(圖K)。以上結果進一步證明,白樺AP2基因啟動子proBpAP2在營養(yǎng)器官和生殖器官中都具有一定活性。

        表1 proBpAP2啟動子序列元件分析Table 1 Analysis of proBpAP2 promoter sequence elements

        圖3 proBpAP2在擬南芥和白樺中的活性分析 A.擬南芥;B.白樺葉片;C~E.擬南芥組織。C.花;D.雌蕊;E.角果;F~K.白樺組織。F.腋芽;G.根;H.莖段;I.雌花翅果;J.雌花花柄;K(i/ii).花藥Fig.3 Activity analysis of proBpAP2 in A.thaliana and B.platyphylla A. A.thaliana; B. B.platyphylla leaves; C-E. A.thaliana tissues(C. Flower; D. Pistil; E. Silique); F-K. B.platyphylla tissues(F. Axillary bud; G. Root; H. Stem segment; I. Samara of female flower; J. Floral shoot of female flower; K(i/ii). Anther)

        圖4 BpAP2基因序列 起始密碼子和終止密碼子Fig.4 The sequence of the BpAP2 indicates the start codon and the stop codon

        3 討論

        高等植物的開花過程受到光周期途徑、春化途徑、自主調節(jié)途徑、GA途徑和年齡途徑這五種開花途徑調控。轉錄因子AP2和SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN-LIKE(SPL)與miR172共同作用,參與年齡調控途徑[16~18]。在本研究的白樺AP2啟動子GUS活性檢測過程中發(fā)現,衰老葉片不易染色(未附圖),這與相關文獻中描述的AP2基因會隨植物年齡的增長而表達量下降相似[19]。proBpAP2驅動的GUS基因在萼片、花瓣以及雌、雄蕊中均表達,說明BpAP2基因可能不僅參與前兩輪花器官的發(fā)育[20~23],也影響第三、四輪花器官的發(fā)育及開花時間[5,22]。而在擬南芥角果中的表達說明該基因可能與種子的發(fā)育也息息相關[24]。張妍等研究表明[25],AP2基因在白樺的莖、葉、花序中都有表達,這與本實驗中proBpAP2在白樺雌花、葉、莖等組織中表達的結果一致。另外,proBpAP2在白樺的成熟花藥中的啟動活性較低,不同于在擬南芥中的異源轉化,因此,還需進一步深入驗證。

        基因特異啟動子對于基因功能的分析非常重要,白樺AP2基因啟動子具有高等植物啟動子的典型特征,能驅動GUS基因在轉基因白樺和擬南芥中特異表達。該序列除了具有TATA-box、CAAT-box等真核生物的基本轉錄起始元件,還包括多種光響應元件、參與各種激素調節(jié)的元件以及與植物生長發(fā)育有關的元件如參與分生組織表達的CAT-box,胚乳表達的GCN4、Skn-1等,可見該啟動子元件具有豐富的多樣性,可能涉及多種生長發(fā)育和激素響應過程,為后續(xù)構建外源基因的高效表達載體提供了重要的表達元件參考,也為進一步研究BpAP2在白樺中的表達特點和功能機理奠定了基礎。此外,該啟動子下游所包含的5′UTR區(qū),對基因的表達調控也起著重要作用[26~29]。

        4 結論

        本研究克隆了白樺AP2基因啟動子,命名為proBpAP2,其序列中存在大量的光響應元件、激素響應元件和低溫響應元件等。該啟動子在同源表達系統和異源表達系統中都具有表達活性,在擬南芥和白樺的營養(yǎng)器官和生殖器官中均有不同程度的轉錄活性,為后續(xù)進一步研究AP2基因在白樺花發(fā)育和營養(yǎng)生長中的作用、白樺退化花器官的形成機制以及縮短白樺生殖發(fā)育時間和改良白樺的遺傳育種奠定了基礎,并為提高或改進外源基因在不同表達系統中的表達效率提供可能。

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