周恒君, 熊 艷, 龔 云, 戴勇琦, 張 俊, 徐常利, 呂立華, 吳學文
(1.湘潭大學 化工學院,湖南 湘潭 411105;2.株洲千金藥業(yè)股份有限公司,湖南 株洲 412003;3.邵陽學院 藥學院,湖南 邵陽 422000)
糖尿病是一種常見代謝性疾病,其并發(fā)癥如心臟、血管、腎臟、視網(wǎng)膜和神經(jīng)病變等,對人體有極大的危害,可引起心腦血管疾病、慢性腎病,甚至失明、截肢.糖尿病及其并發(fā)癥不僅危害患者身體健康,影響患者家庭生活質量,而且是加重社會負擔及制約國家經(jīng)濟發(fā)展的重要因素[1].據(jù)WHO統(tǒng)計,全球共有4.22億糖尿病患者,每年有120 萬人死于糖尿病相關疾病.據(jù)文獻報道,目前糖尿病病例90%以上屬于Ⅱ型糖尿病[2].西藥在短時間內降血糖可取得較好效果,但多局限于單靶點,長期使用存在嚴重不良反應,無法有效控制糖尿病并發(fā)癥.中藥雖然在降血糖方面短時間內效果不如西藥,但在治療中具有多成分、多靶點和多向性作用,不僅有降血糖作用,而且有控制糖尿病并發(fā)癥的能力[3].
目前,中醫(yī)治療糖尿病主要奉行“活血、益氣、養(yǎng)陰、清熱”[4].通過歸納、總結中醫(yī)治療Ⅱ型糖尿病用藥處方規(guī)律,發(fā)現(xiàn)高頻藥為補氣、活血化瘀、清熱藥,其中當歸、益母草出現(xiàn)頻率位居前十[5-6].故我們推測 “當歸-益母草”藥對具有抗Ⅱ型糖尿病作用,但其物質基礎和作用機理均不明確.“當歸-益母草”是經(jīng)典的氣血雙補藥對,具有獨特的配伍意義,沿用至今.該藥對來自《竹林寺女科密方》記載的益母丸,該方由益母草、當歸組成,是一種治療婦科疾病的傳統(tǒng)古方,具活血調經(jīng),氣血雙補,祛瘀生新作用.《本草綱目》云:“益母草行血養(yǎng)血,行血而不傷新血,養(yǎng)血而不滯瘀血,誠為血家之圣藥也.”當歸被稱為“補血要藥”,其補血作用得到歷代醫(yī)家公認,具補血活血、調經(jīng)止痛的功能[7].中醫(yī)婦科臨床經(jīng)典用藥如補血益母顆粒、八珍益母丸、四物益母丸等都以“當歸-益母草”藥對為基礎組方而成.因此研究“當歸-益母草”藥對抗Ⅱ型糖尿病物質基礎及作用機制對挖掘、開發(fā)含此藥對的中醫(yī)婦科經(jīng)典名方有重要意義.
近年來,網(wǎng)絡藥理學為新靶點、新機制的新藥發(fā)現(xiàn)提供了全新手段[8].同時,采用網(wǎng)絡藥理學方法如系統(tǒng)生物學、網(wǎng)絡分析等手段可預測傳統(tǒng)藥方藥理作用[9].本項研究中,我們以網(wǎng)絡藥理學手段,研究“當歸-益母草”經(jīng)典藥對抗Ⅱ型糖尿病的物質基礎及分子機制,并從整體的角度探討“當歸-益母草”與Ⅱ型糖尿病的生物網(wǎng)絡.
益母草(leonuri herba)、當歸(angelicae sinensis radix)化學成分均收集自文獻和公共數(shù)據(jù)庫:CSDB化學專業(yè)數(shù)據(jù)庫、PubChem數(shù)據(jù)庫、TCMSP數(shù)據(jù)庫和Drug數(shù)據(jù)庫,共計收集到170個化學成分.以 (OB)>30%[10]和 (DL)>0.04[11]為標準篩選候選化合物,共計135個化合物符合條件,包括黃酮類、苯丙素類、甾醇綠原酸類化合物等.其中從當歸中篩選到74個化學成分(M1~M74),益母草中有81個成分(M75~M135)符合標準.在數(shù)據(jù)庫中下載益母草、當歸所含化學成分分子結構.考慮到口服藥物,糖苷會在腸道內酶解脫糖[12],根據(jù)糖苷酶水解反應的規(guī)律,對其中含9個糖基化合物進行處理,得到4個新化學成分.
PharmMapper是利用藥效團映射方法識別潛在藥物靶標的WEB服務器[13].將藥對化學成分數(shù)據(jù)庫的結構信息輸入PharmMapper篩選相關蛋白質功能信息,其中,將蛋白質名稱與物種限制為“人類”,采用官方標志命名所采集的蛋白質,如P35354,O95433等.從RCSB蛋白數(shù)據(jù)庫和UniProtKB數(shù)據(jù)庫檢索候選靶點的晶體結構并下載蛋白質的結構;如無對應蛋白質晶體結構,則使用瑞士模式自動蛋白質建模服務器進行建模,并保存為PDB文件.經(jīng)過這一系列操作,最終構建靶點信息數(shù)據(jù)庫.
為進一步確認靶點的可靠性,采用Auto Dock軟件將活性成分和候選靶點模擬對接,其中參數(shù)默認設置及所有配體原子允許旋轉[14].采用Lamarckian遺傳算法評估分子-靶點相互作用[15],以對接分數(shù)<-5.0 kcal/mol為指標篩選潛在靶點,并進一步利用已知小分子配體的X射線結構驗證對接的可靠性.
采用網(wǎng)絡可視化軟件Cytoscape構建分子網(wǎng)絡,并分析“當歸-益母草”藥對“藥物-靶點”網(wǎng)絡(drug-target, D-T network)及“藥物-靶點-疾病”網(wǎng)絡(drug-target-disease, D-T-D network)[16].將藥對化學成分數(shù)據(jù)庫及“藥物-靶點”對接結果導入軟件以完成相關網(wǎng)絡構建,用“節(jié)點”(node)表示活性成分、靶點,用“邊”(edge)表示活性成分與靶點之間的關系;然后采用MCODE插件富集,以明確“當歸-益母草”藥對抗Ⅱ型糖尿病重要的活性成分和關鍵靶點,同時跟蹤文獻以分析其中的相互作用.
D-T network如圖1所示,根據(jù)“當歸-益母草”藥對候選活性成分數(shù)據(jù)庫及其潛在靶點構建“藥物-靶點”相互作用網(wǎng)絡圖(圖1),該網(wǎng)絡共由573個節(jié)點(135個候選化合物和438個候選靶點)和1 528個邊組成,其中三角形節(jié)點代表活性成分,圓形節(jié)點代表靶點,邊代表相互作用關系.外圍靶點表示與活性成分的相互作用小,圈內靶點表示和多個活性成分有關聯(lián),提示這些高頻靶點可能是關鍵靶點.
網(wǎng)絡藥理學研究中,“藥物-靶點-疾病” 網(wǎng)絡常用來揭示活性成分及作用機制.從I2D數(shù)據(jù)庫和TTD數(shù)據(jù)庫檢索與Ⅱ型糖尿病相關的靶點,使用MCODE插件從“藥物-靶點”網(wǎng)絡分析構建D-T-D網(wǎng)絡(圖2).該網(wǎng)絡由76個節(jié)點(32個候選化合物、43個候選靶點和疾病)和231個邊組成,其中三角形節(jié)點代表活性成分,圓形節(jié)點代表藥對共同作用的靶點,棱形代表益母草作用靶點,六邊形代表當歸的靶點,邊代表相互作用關系.
表1 “當歸-益母草”藥對的“藥物-靶點-疾病”網(wǎng)絡分子節(jié)點及其參數(shù)(分子節(jié)點degree≥5)
表2 “當歸-益母草”藥對的“藥物-靶點-疾病”網(wǎng)絡節(jié)點及其參數(shù)(靶點節(jié)點degree≥4)
1):a為當歸(angelicae sinensis radix),l為益母草(leonuri herba).
表1、表2中列出了關鍵靶點及重要活性成分的degree.表1顯示D-T-D網(wǎng)絡中共有17個關鍵活性成分(degree≥5),其中有6個黃酮類化合物,如槲皮素(M132)擁有17個靶點, 其次是芹菜素(M87)擁有14個靶點, 山奈酚(M123)擁有11個靶點, 大豆異黃酮(M78)擁有10個靶點,提示這些黃酮類化合物可能是抗Ⅱ型糖尿病物質基礎.如表2所示,D-T-D網(wǎng)絡中有15個關鍵靶點(degree≥4),如P35354(prostaglandin G/H synthase 2)受31種活性成分的調節(jié),P23219受31種化合物的調節(jié),P27338受20種化合物的調節(jié),P21397受13種化合物的調節(jié).有意思的是,極高頻靶點(degree≥10)除P27487只受控于益母草活性成分外,其余都同時由當歸-益母草藥對活性成分調節(jié).以上結果說明“當歸-益母草”藥對有抗Ⅱ型糖尿病物質基礎,且具多成分、多靶點協(xié)同作用的特征.
通過網(wǎng)絡藥理學方法構建的D-T-D網(wǎng)絡,發(fā)現(xiàn)該藥對活性成分和靶點與Ⅱ型糖尿病之間存在一定的聯(lián)系.Ⅱ型糖尿病是一種多器官多靶點慢性疾病,胰島素抵抗和胰島細胞功能減退是發(fā)病的兩個關鍵因素.Ⅱ型糖尿病易引發(fā)高血糖和高血壓等并發(fā)癥,多數(shù)患者存在脂代謝紊亂,表現(xiàn)為血清中膽固醇(TC)、三酰甘油(TG)增高的高血脂病癥等[17].在中藥診斷中主要表現(xiàn)為氣陰虧虛、熱盛傷津,同時還伴有淤血等癥狀.研究發(fā)現(xiàn),血脂異?;颊叱:喜⑻悄虿18],而且血脂水平越高,其血糖水平也越高,發(fā)生糖尿病的風險越高[19].
據(jù)報道,槲皮素(M132)能直接刺激INS-1細胞分泌胰島素(P01308)[20].槲皮素還能間接改善STZ糖尿病大鼠的高血糖、高甘油三酯血癥和高膽固醇癥狀[21],通過減輕Ⅱ型糖尿病小鼠的自由基和氧化應激反應改善高血糖[22].阿魏酸(M34)能激活前列腺素G/H合酶1(P23219)和前列腺素G/H合酶2 (P35354),增加前列腺素( PGI2 )的生物活性,使PGI2 /TXA2的值升高,從而抑制血小板凝聚.阿魏酸還可抑制肝合成膽固醇,降低血脂[23].TC、LDL 和 TG 與空腹血糖呈正相關,HDL與空腹血糖呈負相關[24],β-谷甾醇(M32)可明顯降低血清總膽固醇(TC)和低密度脂蛋白(LDL)水平[25],其作用機理是通過抑制膳食和膽汁中的膽固醇的吸收,從而達到降膽固醇的效果[26].動物實驗表明,β-谷甾醇明顯降低高血脂大鼠血清 TC、TG,抑制脂質過氧化,調節(jié)脂質代謝[27].黑猩猩實驗證實,β-谷甾醇降血脂優(yōu)于安妥明[28].漢黃芩素(M77)通過促進 AKT 的基因表達與蛋白活化,促進 GLUT4 的基因與蛋白表達,降低空腹血糖.此外,漢黃芩素可直接促進胰島素分泌[29].漢黃芩素可明顯降低總膽固醇(TC)和低密度脂蛋白(LDL),這一作用可能與調節(jié)脂酶活性和影響脂質合成與氧化基因相關[30].益母草堿(M135)通過降低空腹血糖水平,在一定程度上改善葡萄糖耐量和提高db/db小鼠的血漿胰島素濃度,降低血漿甘油三酯的濃度,同時升高HDL的濃度來預防II型糖尿病的發(fā)生[31-32].在胰島素缺乏癥的情況下,大豆異黃酮(M78)能促進葡萄糖攝取、Ampk磷酸化和GLUT 4易位,還可抑制db/db和KK-Ay小鼠血糖水平的升高[33].
炎癥是胰島素抵抗和Ⅱ型糖尿病代謝紊亂的基礎,Ⅱ型糖尿病小鼠肝臟呈現(xiàn)炎癥狀態(tài),炎癥通路NF-κB被激活,并促進炎癥因子表達增多,異鼠李素(M114)抑制NF-κB p65和炎性細胞因子的產生,并且對NF-κB信號通路具有負調控作用,抑制NF-κB介導的炎癥反應,從而有利于腎損害的恢復[34].山奈酚(M123)可調節(jié)肝臟炎癥,提高胰島素敏感性,其機制與抑制糖尿病大鼠肝臟NF-κB信號有關[35].大量文獻報道炎癥因子TNF-a、IL-6等可干擾胰島素信號通路,包括干擾胰島素受體和胰島素受體底物的酪氨酸磷酸化,結果失去對葡萄糖代謝酶包括GK、G6Pase及PEPCK的調控,導致肝臟葡萄糖輸出增加,最終促進高血糖的形成.益母草堿 (M135)抑制NF-κB炎癥通路,進一步抑制炎癥介質的表達,有恢復胰島素(P01308)信號的作用,使葡萄糖代謝酶正常表達而起到降低血糖作用[32].3-Butylidene phthalide(M16)、阿魏酸可協(xié)同抑制LPS誘導的RAW264.7細胞炎性因子NO、前炎因子IL-1β、TNF-a的釋放及iNOS、COX-2基因及蛋白的表達發(fā)揮抗炎作用[36].
GLUT 4易位和表達水平與胰島素介導的葡萄糖穩(wěn)態(tài)有關,適度增加GLUT 4的表達是治療Ⅱ型糖尿病IR的良好方法,豆甾醇(M47)有助于促進GLUT 4在細胞中的表達,糾正胰島素介導的GLUT 4易位缺陷,從而減輕KK-Ay小鼠的IR[37].芹菜素(M87)能明顯改善Ⅱ型糖尿病大鼠的糖脂代謝受損和胰島素抵抗,減輕糖尿病大鼠的血管病變,改善血管內皮功能,其機制是誘導胰島素的產生,抑制NO生成和NF-κB介導的內皮細胞炎癥反應[38].
Ⅱ型糖尿病中存在胰島β細胞凋亡,糖尿病患者體內β細胞凋亡頻率明顯增高,凋亡速度會增加 3~10倍,但增生、復制功能正常[39].糖皮質激素能上調細胞凋亡因子Bax表達,誘導胰島β細胞凋亡,益母草堿(M135)激活糖皮質激素受體(P04150)與糖皮質激素結合,可減少糖皮質激素的量進而保護胰島β細胞[40].發(fā)現(xiàn)水蘇堿(M124)通過調節(jié)SIRT 1的表達和活性,抑制高糖對內皮細胞的細胞毒作用[41],減少藥對毒副作用的發(fā)生.
圖2D-T-J網(wǎng)絡分析結果表明,氨基-二肽酰肽酶IV(P27487)、β-1腎上腺素能受體(P08588)、凋亡因子Bcl-2(P10415)及單胺氧化酶MAO-A(P21397)和MAO-B(P27338)在藥對治療Ⅱ型糖尿病中發(fā)揮主要作用.凋亡因子Bcl-2(P10415)由239個氨基酸及3個外顯子和2個內含子組成,它能對抗各種凋亡的刺激而對細胞有保護作用,Bcl-2通過阻斷凋亡的最后通路而抑制凋亡[39],或通過參與信號傳遞而抑制細胞凋亡[42].氨基-二肽酰肽酶IV(P27487)(DPP-IV)升高胰升糖素樣多肽1(GLP-1)的活性水平,GLP-1有刺激胰島素基因表達、增強β細胞的功能,抑制胰升糖素的分泌,提高飽食感,抑制攝食和延緩胃排空,這些均有助于血糖恢復正常[43].β-1腎上腺素能受體(P08588)是調節(jié)心臟功能及血壓的主要受體,與高血壓等密切相關,如血壓水平較高時,β-1腎上腺素能受體水平也很高;β-1腎上腺素能受體水平降低時,血壓隨之降低[44].單胺氧化酶(monoamine oxidase )為催化單胺氧化脫氨反應的酶,縮寫MAO,也稱為含黃素胺氧化酶,可分為MAO-A(P21397)和MAO-B(P27338)兩種亞型.據(jù)報道,糖尿病患者的單胺氧化酶活性升高,高血壓病人血小板內MAO活性升高[45].我們研究發(fā)現(xiàn)該藥對活性成分和上述靶點存在一定的聯(lián)系,M32、M77、M73、M87、M123、M132能作用于細胞凋亡因子Bcl-2,可能減少胰島β細胞凋亡.M76、M77、M83、M87、M114、M117、M123、M132能與氨基-二肽酰肽酶作用,可能與激活DPP-IV,保護胰島功能,調節(jié)Ⅱ型糖尿病患者的血糖值有關.M9、M13、M16、M47、M51、M59、M85、M117、M119、M129、M133可能抑制β-1腎上腺素能受體的活性,使糖尿病患者血壓降低.M9、M16、M34、M35、M47、M48、M72、M85、M95、M97、M117、M119、M133可以和MAO-A(P21397)作用,上述化合物可能抑制MAO活性,較好地發(fā)揮治療作用.這些可成為治療Ⅱ型糖尿病的新靶標、新機制,為新藥開發(fā)提供依據(jù).
綜上所述,“當歸-益母草”藥對治療Ⅱ型糖尿病是分子間的協(xié)同作用,通過干涉分子網(wǎng)絡、生物過程和途徑使機體恢復平衡,具有多成分、多靶點的特點.“當歸-益母草”藥對治療糖尿病主要是活血化淤,抗炎,調節(jié)機體血糖、血壓和胰島素平衡,改善微循環(huán)等,與目前抗Ⅱ型糖尿病的作用機制相符合.
我們利用網(wǎng)絡藥理學分析手段,篩選“當歸-益母草”藥對的活性成分,并預測其可能的直接作用靶點.進一步構建了D-T-D網(wǎng)絡及分析,確定了“當歸-益母草”藥對Ⅱ型糖尿病的物質基礎及關鍵調控靶點,并采用現(xiàn)有文獻挖掘方法為藥對治療Ⅱ型糖尿病的分子機制提供理論依據(jù).我們的研究對以“當歸-益母草”藥對為基礎方的復方,如補血益母顆粒、八珍益母丸、四物益母丸等進行深度挖掘、開發(fā)有重要意義.此外,我們將進一步研究 “當歸-益母草”藥對治療婦科疾病的網(wǎng)絡機制,并采用分子生物學、代謝組學等經(jīng)典方法,揭示“當歸-益母草”藥對治療婦科疾病的物質基礎及機理.