朱金輝
(上海倫恩科貿(mào)有限公司,上海 201611)
基因芯片技術(shù)是目前生物學(xué)領(lǐng)域非常重要的研究工具,目前已經(jīng)在臨床疾病診斷、藥物篩選和新藥開發(fā)、基因功能研究、環(huán)境保護(hù)、農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)應(yīng)用、軍事和司法應(yīng)用、生物芯片自動(dòng)化研究和生物信息研究等方面[1]?;蛐酒s交,是指標(biāo)記的樣品與芯片上的靶序列進(jìn)行結(jié)合,產(chǎn)生待測(cè)信號(hào)的過(guò)程[2]。芯片雜交僅靠手動(dòng)操作,繁瑣易出錯(cuò),而且無(wú)法同時(shí)進(jìn)行大量樣品的同時(shí)檢測(cè);為了能夠進(jìn)行大批量芯片的同時(shí)檢測(cè),降低基因芯片雜交對(duì)雜交環(huán)境的要求,提高雜交效率,減少人為影響,本文設(shè)計(jì)了基因雜交開放式反應(yīng)倉(cāng),并建立開放式板式溫控體系和雜交結(jié)果的CCD成像體系。
開放式反應(yīng)倉(cāng)采用單玻片雙反應(yīng)倉(cāng)設(shè)計(jì),分別為A反應(yīng)倉(cāng)和B反應(yīng)倉(cāng)。C處可用于粘貼二維碼,對(duì)芯片內(nèi)容進(jìn)行說(shuō)明。本反應(yīng)倉(cāng)設(shè)計(jì)尺寸為12mm×20mm。如圖1所示。
反應(yīng)倉(cāng)溫度的控制過(guò)程貫穿于生物芯片的雜交過(guò)程,如圖2所示,反應(yīng)倉(cāng)溫度控制對(duì)生物芯片雜交是否成功起到至關(guān)重要的用。因此,下面對(duì)開放式板式加熱平臺(tái)加熱源的排布特點(diǎn)及其板內(nèi)溫度分布均勻性進(jìn)行探討。
圖2 生物芯片雜交步驟
本溫控物理模型由制冷片、加熱平臺(tái)、散熱平臺(tái)和風(fēng)扇組成,如圖3所示,具體參數(shù)如下:
制冷片規(guī)格:XH-C1210 C系列工業(yè)大功率120W制冷片,其參數(shù)為:
尺寸:40×40×3.5;
電壓:DC12V;
電流:10A;
制冷片數(shù)量:5片;
加熱平臺(tái):材質(zhì):6061,表面尺寸:410mm×80mm,重量:0.852kg;
散熱平臺(tái):材質(zhì)6061,表面尺寸:410mm×80mm,重量0.324kg;
風(fēng)扇:數(shù)量,5個(gè),規(guī)格:80×80×25,電壓24V。
圖3 開放式板式溫控物理模型
2.2.1 測(cè)試工具
1)鎧裝PT100傳感器;
2)水銀溫度計(jì)0~50℃;
3)水銀溫度計(jì)50~100℃;
4)水域加熱器。
2.2.2 測(cè)試步驟
步驟1:加熱器裝入清水,開始加熱。
步驟2:水沸騰后,放入PT100傳感器,同時(shí)放入水銀溫度計(jì)(量程50℃~100℃)。
步驟3:關(guān)閉加熱器,開始記錄數(shù)據(jù)。
步驟4:溫度降到50℃后更換量程為0~50℃的水銀溫度計(jì)。繼續(xù)記錄數(shù)據(jù)。
2.2.3 測(cè)試結(jié)果及其分析
圖4為水銀溫度計(jì)的測(cè)試結(jié)果和傳感器的測(cè)試結(jié)果,并對(duì)其結(jié)果做線性擬合??芍獋鞲衅鞯臏y(cè)試結(jié)果和水銀溫度計(jì)的測(cè)試結(jié)果線性擬合斜率為0.975,并且R2=0.999。圖5表示傳感器測(cè)試溫度和水銀測(cè)試溫度的溫度偏差值分析。偏差值最大1.6,最小0,隨溫度下降偏差值下降。
圖4 測(cè)試結(jié)果
圖5 傳感器溫度和水銀溫度計(jì)偏差
加熱平臺(tái)表面溫度均一性測(cè)試如下所述。
在不放置反應(yīng)倉(cāng)的情況下,先對(duì)加熱平臺(tái)表面的溫度進(jìn)行測(cè)試。鎧裝PT100的溫度作為參考溫度。
將鎧裝PT100溫控器溫度設(shè)定為50℃,開啟溫控器。等溫度穩(wěn)定后,使用貼片式PT100傳感器,對(duì)模具表面多點(diǎn)進(jìn)行溫度測(cè)量。
分別取當(dāng)溫度設(shè)定值為50℃、40℃、30℃時(shí)的三組數(shù)據(jù),如表1和圖6所示。分析如下:
1)加熱平臺(tái)表面的溫度中央比兩邊要高。隨著溫度降低,整體的溫度均一性提高,如圖6所示。
50℃時(shí),表面溫度平均為48.7°,表面溫差+0.52以及-0.48℃。
40℃時(shí),表面溫度平均為39.5°,表面溫差+0.2以及-0.3℃。
30℃時(shí),表面溫度平均為29.6°,表面溫差+0.2以及-0.1℃。
2)加熱平臺(tái)內(nèi)部測(cè)量值與表面值的溫差,如圖7所示。
50℃時(shí),表面溫度平均為48.72°,平均溫差1.28℃。
40℃時(shí),表面溫度平均為39.53°,平均溫差0.47℃。
30℃時(shí),表面溫度平均為29.6°,平均溫差0.39℃。
圖6 加熱平臺(tái)溫度均一性測(cè)試結(jié)果柱狀圖
表1 加熱平臺(tái)溫度均一性測(cè)試結(jié)果
圖7 加熱平臺(tái)溫度偏差測(cè)試結(jié)果柱狀圖
圖8 CCD成像體系
CCD成像體系由工業(yè)相機(jī)、遠(yuǎn)心鏡頭、濾光片和同軸光源組成,如圖8所示。其配置如表2所示。由于生物芯片上點(diǎn)樣點(diǎn)顏色為透明液體,為了凸顯透明液體的邊界特征,選擇500萬(wàn)像素的CCD,如表3所示,其配套的遠(yuǎn)心鏡頭選型如表4所示,鏡頭參數(shù)如表5所示,所以其視野范圍(mm×mm):17.6X13.2。同軸光源選型:紅色光源HCL50。同軸光源主要由高密度LED和分光鏡組成。LED發(fā)出光經(jīng)過(guò)分光鏡后,跟CCD和相機(jī)在同一軸線上,可以有效消除圖像的重影,適合光潔物體表面劃痕的檢測(cè)。濾光片選擇635紅光濾波片,消除雜光對(duì)成像效果的影響。
表2 CCD成像體系組成
表3 工業(yè)相機(jī)參數(shù)
表4 鏡頭參數(shù)
表5 鏡頭尺寸
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生物芯片雜交具體試驗(yàn)步驟分為清洗一、雜交、清洗二、抗體、清洗三、顯色、清洗和烘干。進(jìn)出反應(yīng)倉(cāng)液體采用人工進(jìn)液和出液的方式。測(cè)試平臺(tái)為開放式板式溫控平臺(tái)。試驗(yàn)結(jié)果采用CCD成像體系進(jìn)行讀取。如圖9和圖10所示。
圖9 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1)生物芯片雜交反應(yīng)倉(cāng)可以采用開放式設(shè)計(jì)。
2)開放式板式溫控物理模型適用于生物芯片的雜交反應(yīng)。
圖10 試驗(yàn)結(jié)果的CCD成像效果
3)由CCD成像體系由工業(yè)相機(jī)、遠(yuǎn)心鏡頭、濾光片和同軸光源組成的CCD成像體系能夠有效對(duì)生物芯片的雜交結(jié)果進(jìn)行讀取。
[1]上海東方工程咨詢有限公司.生物芯片上海國(guó)家工程研究中心可研報(bào)告[M].上海醫(yī)藥工業(yè)設(shè)計(jì)院,2002,8.
[2]上海東方工程咨詢有限公司.常見食源性致病菌的基因芯片鑒定技術(shù)[M].上海市出入境檢疫局,2005,2.