李毳,馬轉(zhuǎn)轉(zhuǎn),喬沙沙,劉晉仙,柴寶峰,
1. 山西財(cái)經(jīng)大學(xué)環(huán)境經(jīng)濟(jì)學(xué)院,山西 太原 030006;2. 山西大學(xué)黃土高原研究所,山西 太原 030006;3. 山西大學(xué)綠色發(fā)展中心,山西 太原 030006
群落的生物多樣性及時(shí)空格局是生態(tài)學(xué)研究的中心議題之一(Tedersoo et al.,2012)。傳統(tǒng)生態(tài)位理論(Gause,1934)認(rèn)為,物種對資源的競爭所導(dǎo)致的生態(tài)位分化是維持群落多樣性的主要機(jī)制,最經(jīng)典的案例是Lack在Galapagos群島上對達(dá)爾文鶯(Coerebini)的研究,鳥嘴的形態(tài)反映了鳥類食性的分化,是生態(tài)位分化的直接證據(jù)。另外,熱帶森林土壤營養(yǎng)的可利用性對群落結(jié)構(gòu)的決定作用,以及溫帶森林中的物種聚集(aggregation)與環(huán)境因子的相關(guān)性,這些都說明群落結(jié)構(gòu)受到環(huán)境因子的影響(Kaiser et al.,2010;Kraft et al.,2008)。由此認(rèn)為,群落的結(jié)構(gòu)特征可以通過環(huán)境因子得以預(yù)測,是一個(gè)確定性過程(deterministic processes)。近年來備受關(guān)注的中性理論(Whitfield,2002),承認(rèn)群落內(nèi)物種對資源的競爭,但認(rèn)為群落內(nèi)所有處于同一營養(yǎng)級的物種的屬性是等價(jià)的,遷入、遷出和成種過程對群落結(jié)構(gòu)具有決定作用,是一個(gè)隨機(jī)性過程(stochastic processes)(Hubbell,2006),并得到一些野外實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的支持(Volkov et al.,2004;Zhou et al.,2008)。Gravel et al.(2006)將以上兩種觀點(diǎn)整合為連續(xù)體(continuum)假說,認(rèn)為生態(tài)位理論和中性理論是一個(gè)連續(xù)體的兩個(gè)極端,現(xiàn)實(shí)的自然群落位于連續(xù)體中的一個(gè)特定位點(diǎn),所以目前的焦點(diǎn)集中于確定性過程和隨機(jī)性過程在群落構(gòu)建中的相對重要性(Dumbrell et al.,2010)。已有的數(shù)據(jù)大多基于植物和動(dòng)物,而針對微生物群落的研究起步較晚(Guo et al.,2015)。微生物群落結(jié)構(gòu)和功能的研究近年來備受關(guān)注(Fuhrman,2009;Zhou et al.,2012)。有觀點(diǎn)認(rèn)為,微生物群落構(gòu)建不存在擴(kuò)散限制(Finlay,2002),環(huán)境選擇決定了微生物群落的構(gòu)建過程(Gulay et al.,2016),也有學(xué)者質(zhì)疑此觀點(diǎn),認(rèn)為微生物群落的相似度隨地理距離增加而衰減(Nemergut et al.,2013;Zinger et al.,2014),如叢枝菌根真菌、子囊真菌(Martiny et al.,2011)。在全球尺度上對 4個(gè)熱帶森林和區(qū)域尺度上對3個(gè)溫帶森林的外生菌根真菌的研究,也證實(shí)擴(kuò)散限制影響了真菌群落的構(gòu)建(Hazard et al.,2013)。這些相互矛盾的觀點(diǎn)說明,微生物群落生態(tài)學(xué)的理論亟待進(jìn)一步完善。
土壤微生物種類豐富,數(shù)量多,且有極強(qiáng)的擴(kuò)散能力,是驗(yàn)證中性理論的理想材料。山西龐泉溝不同海拔高度的森林土壤真菌群落中,子囊菌門和擔(dān)子菌門居多,子囊菌多為腐生菌,可分解難降解的有機(jī)質(zhì);紅蓋傘屬和紅菇屬是重要的外生菌根,與多種樹種共生,這些真菌在不同植被類型的土壤微生物群落中占據(jù)的比例不同(喬沙沙等,2017)。本文利用 PCR-DGGE技術(shù)和微宇宙實(shí)驗(yàn),對龐泉溝5種典型森林的土壤真菌群落結(jié)構(gòu)開展研究,分析局域環(huán)境因子和區(qū)域源群落的多樣性對溫帶森林土壤真菌群落構(gòu)建的影響,為揭示微生物群落多樣性維持機(jī)制提供支持。
龐泉溝國家自然保護(hù)區(qū)位于呂梁山脈中段( 37°48'~37°56'N , 111°24'~111°32'E ), 面 積 為10443.5 hm2,屬暖溫帶大陸性季風(fēng)氣候,年均降水量822.6 mm,年均溫4.3 ℃。試驗(yàn)樣地包括高海拔的華北落葉松(Larix gmelinii var.principis-rupprechtii),低海拔的華北落葉松、油松(Pinus tabulaeformis)、白杄(Picea meyeri)、青杄(P. wilsonii)、白樺(Betula platyphylla)和紅樺(B.albosinensis)林等。樣地分布及具體信息見表1。
1.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
微宇宙實(shí)驗(yàn)參照Bell(2010)的方法。土壤樣品取自保護(hù)區(qū)內(nèi)不同海拔、不同植被類型的10個(gè)樣地(表 1),作為區(qū)域土壤微生物物種庫;在 10個(gè)樣地固定樣方(1 m×1 m)中按對角線取0~15 cm厚度土壤混合,再從每個(gè)樣地的土壤樣品中各取50 g,充分混勻,加入1 L滅菌水,振蕩10 min,滅菌濾紙過濾后得到接種液。根據(jù)海拔高度和群落類型,選擇1、2、3、4、8、9共6個(gè)樣地,每個(gè)樣地取15 cm深處土壤,混勻后稱取15 g,滅菌處理,然后噴灑5 mL接種液,混合均勻,置于50 mL無菌離心管中,0.22 μm濾膜封口,作為微生物的源群落,分別置于相應(yīng)的6個(gè)樣地,呈45°斜角埋于土壤15 cm深處,原地培養(yǎng)12個(gè)月,帶回實(shí)驗(yàn)室,同時(shí)取樣地土壤樣品為對照。
1.3.1 土壤理化性質(zhì)測定
用 HANNA HI3221(msoil∶Vwater=1∶2.5)測定土壤pH值;用vario MACRO cube元素分析儀測定土壤總碳(TC)和總氮(TN)含量;用CleverChem 380全自動(dòng)間斷化學(xué)分析儀測定速效磷(AP)、NH4+的含量;用重鉻酸鉀容量法(魯如坤,2000)測定土壤有機(jī)質(zhì)(SOM);用激光衍射粒度分析儀(Matersizer 3000 Laser Diffraction Particle Size Analyzer,UK)測定土壤粒度;參照關(guān)松蔭的方法測定蔗糖酶的酶活性(關(guān)松萌,1986)。
表1 樣地土壤和植物群落概況Table 1 The information of soil and plant communities in samples of this study
1.3.2 土壤宏基因組提取和PCR擴(kuò)增
用 E.Z.N.A.Soil DNA Kit試劑盒(Omega Bio-tek,Inc.)提取土壤宏基因組,用特異性引物NS1:GTAGTCATATGCTTGTCTC 和 GCFung:5'-CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCG CCCCC GCCCCATTCCCCGTTACCCGTTG-3'擴(kuò)增真菌 18S rDNA 片段。PCR反應(yīng)體系:2.5 μL 10×EasyTaq Buffer;0.25 U Taq 酶(500 U);2 μL 2.5 mmol dNTPs;2 μL DNA(10 ng 左右);引物(10 μmol·L-1)各 0.3 μL;加滅菌雙蒸水至 25 μL。RCR反應(yīng)條件:94 ℃ 4 min,94 ℃ 30 s,58 ℃ 20 s,72 ℃ 20 s,30次循環(huán),72 ℃ 7 min,10 ℃保存。
1.3.3 變性梯度凝膠電泳分析
變性梯度凝膠電泳(DGGE),采用8%的聚丙烯酰胺凝膠,變性劑的質(zhì)量分?jǐn)?shù)范圍為26%~31%。電泳條件:1×TAE電泳緩沖液,60 V,60 ℃,電泳12 h。銀染液染色,獲得DGGE條帶圖譜。利用Quantity One(version 4.52)軟件分析圖譜,用條帶數(shù)和條帶灰度值計(jì)算 Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H′)、Pielou均勻度指數(shù)(J)和豐富度。
式中,ni是第 i條條帶的多度;n為樣品中所有條帶的總多度;S為樣品中的總條帶數(shù)(Magurran et al.,2011)。
運(yùn)用SPSS 19.0中的單因素方差分析法比較真菌群落多樣性指數(shù)、均勻度指數(shù)及豐富度,采用LSD檢驗(yàn)進(jìn)行多重比較;運(yùn)用Canoco 5軟件進(jìn)行主坐標(biāo)分析;運(yùn)用Gephi 0.9.1分析群落種間網(wǎng)絡(luò)關(guān)系;運(yùn)用Ri386 3.3.1進(jìn)行Mantel分析和偏Mantel分析。
6個(gè)微宇宙樣地的土壤真菌群落 α-多樣性見表2。LpMC1中真菌群落Shannon指數(shù)和豐富度均為最大,而BMC中真菌群落多樣性指數(shù)均為最小,LpMC1、LpMC2及PwMC的Shannon指數(shù)、均勻度指數(shù)均沒有顯著差異(P<0.05)。各樣地微宇宙土壤真菌群落的 3個(gè)多樣性指數(shù)總體上均大于樣地土壤,微宇宙土壤真菌Shannon多樣性、豐富度和均勻度的平均值分別為 2.59、18.14和0.89,而對照樣地分別為2.35、14.65、0.88。微宇宙真菌群落多樣性指數(shù)均有所提高,說明源群落對新形成的真菌群落結(jié)構(gòu)有影響,區(qū)域物種遷移過程可能影響局域群落結(jié)構(gòu),即真菌群落結(jié)構(gòu)受到擴(kuò)散限制的影響。
微宇宙土壤的真菌群落的 β-多樣性平均值為0.51(0.62~0.44),而6個(gè)對照樣地的平均值為0.54(0.75~0.36)。樣地 LpMC1 和 PmMC 最大,為 0.75,LpMC1和PwMC最小,為0.36,LpMC1和LpMC2之間、LpMC2和PwMC之間的β-多樣性值分別為0.38和0.40。由此可見,微宇宙土壤的α多樣性顯著提高,而β多樣性減小,在一定程度上表現(xiàn)出趨同效應(yīng),可見“種源”對微宇宙土壤真菌群落結(jié)構(gòu)的影響。由此說明,環(huán)境因子驅(qū)動(dòng)群落發(fā)生趨異效應(yīng)的能力是有限的,群落的形成歷史(種源)對群落結(jié)構(gòu)的形成具有重要作用。
表2 置于不同樣地土壤中的“微宇宙”土壤真菌群落多樣性Table 2 Diversity of fungal communities in microcosm soils in different plant communities
微宇宙試驗(yàn)忽略了空間變量對微生物群落的影響,土壤真菌群落的相對豐度與環(huán)境因子及植物優(yōu)勢度呈顯著正相關(guān)(表3)。整體而言,微宇宙土壤真菌群落結(jié)構(gòu)受到土壤營養(yǎng)狀況、溫度、水分、pH以及地表植被優(yōu)勢度的影響,相關(guān)性最大的為土壤有機(jī)質(zhì)(SOM,Rm=0.5908,P=0.001),其次為有效磷(Rm=0.476,P=0.001)、土壤含水量(Rm=0.388,P=0.001),它們均對其具有極顯著的影響,另外,土壤 pH、蔗糖酶和溫度亦對其有顯著影響。對于樣地土壤真菌群落,土壤有機(jī)質(zhì)的影響也是較大的(R=0.6595,P=0.001),但土壤有效磷(R=0.613,P=0.001)和土壤含水量(R=0.5664,P=0.001)的影響更為顯著。植被優(yōu)勢度對樣地真菌的影響顯著(R=0.3256,P=0.003),而對微宇宙土壤真菌的影響不顯著。總體而言,土壤因子和植被對樣地土壤和微宇宙土壤真菌群落均有一定的影響。Mantel分析(表4)表明,土壤環(huán)境因子和植被因子均對微宇宙土壤真菌群落有極顯著影響(P<0.01),R值分別為0.4936、0.2652。偏Mantel分析表明,控制植被變量后,土壤變量對真菌群落的影響仍是極顯著的(Rm=0.4862,R=0.464)。
用中介中心性(betweenness centrality,BC)分析土壤真菌群落不同類群間的相互關(guān)系(圖1),有顯著相關(guān)性的真菌類群共有 160對(B1~B160)。對照樣地土壤真菌類群間相互關(guān)系總體表現(xiàn)為排斥大于共存(圖1a),共有6個(gè)關(guān)鍵類群,分別為B1、B11、B12、B17、B22、B23;而微宇宙土壤真菌類群間相互關(guān)系則明顯表現(xiàn)出共存大于排斥(圖1b),共有5個(gè)關(guān)鍵類群,分別為B14、B16、B32、B30、B8。這 5個(gè)關(guān)鍵類群不是存在于所有微宇宙土壤中,如類群B16、B30均存在于高海拔落葉松林,低海拔落葉松林、青杄林、白杄林的微宇宙土壤中,類群B8出現(xiàn)在高海拔、低海拔落葉松林及白杄林的微宇宙土壤中。總體而言,微宇宙土壤真菌群落間相互作用比對照樣地土壤更為簡單,且關(guān)鍵類群數(shù)減少,這可能是因?yàn)橐纬梢粋€(gè)穩(wěn)定的微生物群落需要經(jīng)歷更長的時(shí)間,而微宇宙土壤微生物群落代表的是群落形成初期(1 a)的狀態(tài)。
表4 真菌群落結(jié)構(gòu)與不同變量因子的Mantel檢驗(yàn)Table 4 Mantel test analysis of the relationship between the structure of fungal communities and soil and plant variables
微宇宙試驗(yàn)表明,環(huán)境因子(包括土壤理化因素和植被因素)及生物因素(種間作用)在驅(qū)動(dòng)土壤真菌群落動(dòng)態(tài)過程中具有重要作用,但群落歷史或區(qū)域過程對群落結(jié)構(gòu)的形成也有一定的影響。
局域環(huán)境分揀(species sorting effect)與區(qū)域擴(kuò)散限制(dispersal limitation)的相對重要性是微生物群落生態(tài)學(xué)研究的一個(gè)焦點(diǎn)(Chase,2010;Ricklefs,1987),我們認(rèn)為這兩種過程對土壤真菌群落結(jié)構(gòu)都具有重要的影響。(1)低海拔華北落葉松土壤真菌群落的Shannon指數(shù)和豐富度指數(shù)都低于高海拔華北落葉松(表 2),與 Siles et al.(20016)的研究結(jié)果一致,高海拔土壤真菌群落的豐度和Shannon指數(shù)較高,且多樣性指數(shù)與土壤pH呈顯著正相關(guān)。細(xì)菌群落多樣性隨海拔升高而降低是因?yàn)楦吆0吾樔~林林土壤中,盡管總碳和腐殖質(zhì)含量較高,但多數(shù)為難分解物質(zhì),而真菌偏好低營養(yǎng)、難分解以及高碳氮比的有機(jī)物,對不良環(huán)境的耐受能力遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于細(xì)菌,而且真菌更適應(yīng)于寒冷環(huán)境(Robinson,2001)。不過也有研究顯示,隨著海拔升高,真菌群落物種多樣性呈下降趨勢(Bahramm et al.,2012)。(2)土壤溫度、水分、pH值等是影響微生物群落結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵因子(BBahram et all.,2015),本研究結(jié)果表明,環(huán)境因素在驅(qū)動(dòng)真菌群落構(gòu)建過程中具有非常重要的作用(表3),土壤溫度、含水量、有機(jī)質(zhì)、pH值、總碳、總氮、有效磷、以及植被優(yōu)勢度對樣地及微宇宙土壤真菌群落相對豐度均具有顯著影響(P<0.05)。(3)關(guān)于環(huán)境因子對微生物群落結(jié)構(gòu)的影響,一般認(rèn)為,土壤微生物群落結(jié)構(gòu)在海拔梯度上主要受地表植被類型的影響(Chenn et al.,20177)。一些真菌類群如叢枝菌根菌可與植物共生,進(jìn)而影響其他微生物類群。也有研究提出,植被本身不直接影響土壤微生物群落的結(jié)構(gòu),但可通過影響環(huán)境因子間接影響群落結(jié)構(gòu)(Tedersooet al.,20144)。本研究結(jié)果與Ping et all.(2017)的研究結(jié)果一致,森林土壤真菌群落結(jié)構(gòu)同時(shí)受到土壤環(huán)境因子和空間格局的影響,環(huán)境因素對其影響更為明顯。
表3 真菌群落結(jié)構(gòu)與土壤環(huán)境因子關(guān)系的Mantel檢驗(yàn)Table 3 Mantel test analysis of the relationship between structure of fungal communities and soil edaphic factors
圖1 樣地土壤(a)和微宇宙土壤(b)真菌群落類群間關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 1 Thee network map of iinterspecific relationships of fungalcommunities
微生物因具有極強(qiáng)的擴(kuò)散能力而呈全球性分布,即“everything is everywwhhere,but theenvironmentt seleects”,這一假設(shè)引起了廣泛爭論(Wit et al.,20006)。Tedersooo et al.(20014)就土壤真菌的全球多樣性和生物地理格局進(jìn)行了研究,認(rèn)為在全球尺度上真菌大多具有較強(qiáng)的生物地理格局,且很可能是由擴(kuò)散限制和環(huán)境因子所驅(qū)動(dòng)的。Raapoport法則指出大型動(dòng)植物物種多樣性呈現(xiàn)緯度梯度,之后發(fā)現(xiàn)該法則同樣適用于海洋細(xì)菌(Sul etal.,2013)。利用轉(zhuǎn)接實(shí)驗(yàn)研究微生物擴(kuò)散到新環(huán)境中的群落構(gòu)建方式,探討在相同環(huán)境條件下,不同來源的微生物群落是否呈現(xiàn)趨同現(xiàn)象,或是經(jīng)過人為擴(kuò)散的微生物群落由于起始群落組成的差異,發(fā)生趨異現(xiàn)象。有研究認(rèn)為其在科水平呈現(xiàn)趨同效應(yīng),而在種水平則呈現(xiàn)趨異效應(yīng),起始群落組成的差異是導(dǎo)致類群分化的主要原因(Karrayanni et al.,2017)。本研究針對不同海拔高度的幾種植被類型土壤真菌群落,利用微宇宙轉(zhuǎn)接實(shí)驗(yàn),將整個(gè)區(qū)域的土壤微生物作為源群落,將其分別置于不同的土壤生境中達(dá)一年以上,發(fā)現(xiàn)微宇宙土壤真菌群落α多樣性顯著提高,而β多樣性減小,趨同效應(yīng)明顯。認(rèn)為區(qū)域真菌源群落對微宇宙土壤真菌群落的結(jié)構(gòu)具有顯著的影響,群落歷史對群落結(jié)構(gòu)的形成具有重要的作用。
除環(huán)境因子,生物間共存模式對群落結(jié)構(gòu)也有影響,擴(kuò)散的真菌類群受到新的環(huán)境條件和種間競爭的雙重影響。微生物群落中的種間作用方式以及關(guān)鍵類群的改變會(huì)對群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生影響(Barberan et al.,2012)。BC分析顯示,與源樣地土壤相比,人為擴(kuò)散的微宇宙土壤真菌類群間的關(guān)系發(fā)生了改變,關(guān)鍵類群減少(圖1b),類群間共存作用大于排斥作用,在一定程度上影響局域真菌群落的構(gòu)建過程。
在局域尺度上,確定性過程在溫帶森林土壤真菌群落構(gòu)建過程中占主導(dǎo)作用,而隨機(jī)性過程具有重要影響。土壤因子和生物因素作為確定性因素決定了真菌群落的結(jié)構(gòu),擴(kuò)散限制一定程度上對真菌群落的結(jié)構(gòu)產(chǎn)生影響。人為擴(kuò)散的真菌群落的結(jié)構(gòu)和多樣性受到源群落的多樣性特征和環(huán)境因子的雙重影響。
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