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        北京地區(qū)中國荷斯坦牛體細(xì)胞評分差值變化規(guī)律及遺傳力估計

        2018-06-07 07:51:59史良玉張瑞強SerafinoMusaAbdelkarimAugustinoMuhammadZahoorKhan唐韶青王雅春
        畜牧獸醫(yī)學(xué)報 2018年5期
        關(guān)鍵詞:產(chǎn)犢荷斯坦遺傳力

        史良玉,張瑞強,李 想,Serafino Musa Abdelkarim Augustino,Muhammad Zahoor Khan,劉 林,肖 煒,唐韶青,張 毅,王雅春,俞 英*

        (1.中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,北京 100193;2. 北京市奶牛中心,北京 100085;3. 北京市畜牧總站,北京 100029)

        隱性乳房炎是泌乳奶牛最常見、危害最大的疾病之一,全世界奶牛群發(fā)病率50%左右,我國約48%~70%[1-2]。奶牛隱性乳房炎缺乏明顯臨床特征,且易發(fā)展成為臨床乳房炎,其嚴(yán)重程度與奶牛先前的健康狀況有關(guān)[3]。奶牛生產(chǎn)性能測定(Dairy herd improvement,DHI)中的牛奶體細(xì)胞數(shù)(Somatic cell count,SCC)初步反映了牛奶質(zhì)量及牛只的健康狀況,常作為評估隱性及臨床乳房炎的間接指標(biāo)[4]。

        研究表明,管理良好與否、環(huán)境病原菌狀況、季節(jié)變化以及奶牛自身生理特征均是影響牛奶中SCC值的重要因素[5-10]。因此,僅依據(jù)每月測定一次DHI數(shù)據(jù)的SCC值,并不能及時反映奶牛乳房健康的變化狀況。I.Zwertvaegher等[11]研究發(fā)現(xiàn),SCC值增加可作為炎性反應(yīng)的一個有效指標(biāo)。本研究團(tuán)隊前期研究發(fā)現(xiàn),隨著前后兩個相鄰測定日之間SCC差值的增加,奶牛產(chǎn)奶量損失也相應(yīng)加大[12-13]。因此,相鄰兩個月SCC差值變化對隱性乳房炎具有較好的警示作用。

        由于SCC值呈偏態(tài)分布且方差不同質(zhì),通常將其轉(zhuǎn)化為接近正態(tài)分布的體細(xì)胞評分(Somatic cell score,SCS)進(jìn)行遺傳統(tǒng)計分析。本研究擬針對同一奶牛相鄰兩月SCS差值,利用北京地區(qū)近19年來大群中國荷斯坦牛的DHI數(shù)據(jù),進(jìn)行SCS差值規(guī)律研究及遺傳力估計,以期找到適合的奶牛群乳房健康狀況的變化規(guī)律及遺傳參數(shù),為奶牛隱性乳房炎抗病育種提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源

        本研究所用數(shù)據(jù)均來自北京奶牛中心,覆蓋121個牛場的78 386頭中國荷斯坦牛,時間為1998-2016 年,共計1 967 310次DHI測定記錄。數(shù)據(jù)內(nèi)容包括個體號、胎次、產(chǎn)犢日期、測定日期、產(chǎn)奶量、乳脂量、乳脂率、乳蛋白量、乳蛋白率和SCC。

        1.2 數(shù)據(jù)整理

        SCS差值計算方法為,對于同一頭奶牛的同一胎次內(nèi)相鄰兩月SCS相減(當(dāng)月SCS減去上一個月SCS),取測定記錄時間間隔在5~50 d的數(shù)據(jù)集。根據(jù)不同胎次內(nèi)不同產(chǎn)犢月齡母牛的分布情況,對產(chǎn)犢月齡進(jìn)行取舍,定義第1胎為23~33月齡;第2胎為35~49月齡;第3胎為48~62月齡;對場內(nèi)泌乳牛頭數(shù)過少的場(<200頭)予以剔除,以保證數(shù)據(jù)的平衡性[18]。剔除后,共得到101個場的936 375條DHI記錄。同時根據(jù)場內(nèi)泌乳牛頭數(shù)對場規(guī)模進(jìn)行劃分,其中,200~400頭產(chǎn)奶牛為小型奶牛場(Small),400~800頭產(chǎn)奶牛為中型奶牛場(Medium),大于800頭產(chǎn)奶牛為大型奶牛場(Large)。

        1.2.1 影響SCS差值的非遺傳因素分析 采用SAS 9.2 軟件中GLM過程分析了場規(guī)模、當(dāng)前測定年、當(dāng)前測定季節(jié)、胎次、產(chǎn)犢季節(jié)、當(dāng)前泌乳月等6個非遺傳因素對SCS差值的影響,將上一泌乳月SCS作為協(xié)變量,并進(jìn)行Duncan多重比較分析,模型:

        Yijklsmo=μ+Hi+TYj+TSk+Pl+Cs+Lm+bS+eijklsmo

        其中,Yijklsmo為SCS差值;μ為總體均值;Hi為場規(guī)模效應(yīng);TYj為當(dāng)前測定年份;TSk為當(dāng)前測定季節(jié);Pl為胎次效應(yīng);Cs為產(chǎn)犢季節(jié);Lm為SCS差值計算時的當(dāng)前泌乳月;S為上一泌乳月SCS協(xié)變量;b為對應(yīng)協(xié)變量的回歸系數(shù);eijklsmo為隨機殘差,服從N(0,e)分布。

        1.2.2 遺傳參數(shù)估計 使用DMUv6 R5.2 中的DMUAI模塊,采用平均信息限制最大似然法(Average Information Restricted Maximum Likelihood, AI-REML)結(jié)合期望最大化(Expectation Maximisation, EM)算法對中國荷斯坦牛SCS差值進(jìn)行方差組分估計,最后根據(jù)估計結(jié)果對遺傳參數(shù)進(jìn)行計算。場規(guī)模、當(dāng)前測定年、當(dāng)前測定季節(jié)、胎次、產(chǎn)犢季節(jié)、當(dāng)前泌乳月劃為遺傳參數(shù)估計的6個固定效應(yīng),隨機效應(yīng)考慮加性遺傳效應(yīng)、永久環(huán)境效應(yīng)及殘差隨機效應(yīng),并將上一泌乳月SCS作為協(xié)變量。

        Yijklsmno=μ+Hi+TYj+TSk+Pl+Cs+Lm+An+bS+Pen+eijklsmno

        其中,Yijklsmno為SCS差值;μ為總體均值;Hi為場規(guī)模效應(yīng);TYj為當(dāng)前測定年份;TSk為當(dāng)前測定季節(jié);Pl為胎次效應(yīng);Cs為產(chǎn)犢季節(jié);Lm為SCS差值計算時當(dāng)前泌乳月;S為上一泌乳月SCS協(xié)變量;b為對應(yīng)協(xié)變量的回歸系數(shù);An為個體n的加性遺傳效應(yīng);Pen為個體永久環(huán)境效應(yīng);eijklsmno為隨機殘差,服從N(0,e)分布。

        2 結(jié) 果

        2.1 中國荷斯坦牛SCS差值分析

        北京地區(qū)中國荷斯坦牛各胎次SCC、SCS 、SCC差值及SCS差值分布如圖1所示,其基本統(tǒng)計量見表1。根據(jù)偏度與峰度的結(jié)果,SCC與SCC差值不符合正態(tài)分布,SCS及SCS差值基本符合正態(tài)分布,由于SCS差值更能反映相鄰兩月牛奶體細(xì)胞變化趨勢,故選擇SCS差值進(jìn)行后續(xù)分析。

        A. SCC分布;B. SCS分布;C. SCC 差值分布;D. SCS 差值分布A. SCC distribution; B. SCS distribution; C. SCC difference distribution; D. SCS difference distribution圖1 北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCC、SCS及其相鄰兩月差值數(shù)據(jù)分布Fig.1 The distribution of SCC, SCS and their differences in Chinese Holstein cattle in Beijing

        表1 SCC、SCS、SCC差值、SCS差值基本統(tǒng)計量Table 1 The basic statistics for SCC, SCS, SCC difference, SCS difference

        2.2 非遺傳因素對北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCS差值影響的分析

        應(yīng)用GLM過程分析了場規(guī)模、當(dāng)前測定年、當(dāng)前測定季節(jié)、胎次、產(chǎn)犢季節(jié)、當(dāng)前泌乳月等6個非遺傳因素對北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCS差值的影響。結(jié)果表明,場規(guī)模、當(dāng)前測定年、當(dāng)前測定季節(jié)、胎次、產(chǎn)犢季節(jié)、當(dāng)前泌乳月對SCS差值均有極顯著的影響(P<0.01,表2)。

        表2 影響SCS差值的非遺傳因素的GLM方差分析Table 2 GLM variance analysis of non-genetic factors affecting SCS difference

        2.3 北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCS差值的多重比較

        影響SCS差值的各因素之間的Duncan比較結(jié)果表明(圖2),小規(guī)模牛場與大中型牛場間SCS差值差異顯著(P<0.05,圖2A),且小規(guī)模奶牛場SCS差值最高;除1998年外,其他所有年份SCS差值均高于0,且1998年與其他年份差異顯著(P<0.05,圖2B);經(jīng)產(chǎn)牛SCS差值顯著高于頭胎牛(P<0.05),而經(jīng)產(chǎn)牛間SCS差值差異不顯著(P>0.05,圖2C);當(dāng)前泌乳月1、2月與其他泌乳月間差異顯著(P<0.05),而3~11泌乳月間差異不顯著(P>0.05),且從第3泌乳月開始,SCS差值大于0(圖2D)。

        字母相異表示差異顯著(P<0.05),字母相同表示差異不顯著(P>0.05)Different letters mean significant difference between the treatments(P<0.05), the same letter means no significant difference between the treatments(P>0.05)圖2 SCS 差值各影響因素均值折線圖Fig.2 The line charts of different influence factors for SCS difference

        2.4 北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCS差值遺傳力估計結(jié)果

        北京地區(qū)中國荷斯坦牛SCS差值的遺傳力為(0.054±0.003),低于0.1,屬于低遺傳力性狀(表3),表明SCS差值易受環(huán)境影響。其中,永久環(huán)境效應(yīng)占表型變異的比例約為7.7%。各胎次遺傳力中,一胎次遺傳力最高,二胎次遺傳力最低,三胎次遺傳力居中但標(biāo)準(zhǔn)誤稍大。

        表3 SCS差值方差組分和遺傳參數(shù)Table 3 SCS difference variance components and genetic parameters

        3 討 論

        奶牛生產(chǎn)性能測定(DHI)對提高奶牛養(yǎng)殖水平發(fā)揮著重要的參考作用,是奶牛群體遺傳改良的基礎(chǔ)。生產(chǎn)實踐證明,有效利用DHI數(shù)據(jù)不僅可以提高產(chǎn)奶水平,也可以提高奶牛乳房健康水平[19]。但是僅依據(jù)當(dāng)月測定的DHI記錄中SCC值及對數(shù)轉(zhuǎn)換后的SCS并不能有效反映奶牛乳房健康狀況的變化情況,本研究中所針對的當(dāng)月SCS與上一月SCS的差值則能夠簡明且及時地反映其變化狀況。本研究結(jié)果表明,牧場管理人員應(yīng)該對SCS差值為正值的奶牛予以及時關(guān)注,防止這樣的奶牛發(fā)展為隱性、慢性或臨床乳房炎牛而帶來經(jīng)濟(jì)損失。

        本研究中,200~400頭的小規(guī)模牛場SCS差值顯著高于400頭以上的大中型牛場SCS差值(P<0.05),與R.Skrzypek等[20]報道結(jié)果相符。奶牛頭胎SCS差值最低,均值為0.022,與經(jīng)產(chǎn)牛SCS差值差異顯著(P<0.05),第2、3胎SCS差值分別為0.087、0.090,其可能原因為隨著奶牛胎次的增加, 乳房功能逐步下降,病原微生物更易進(jìn)入乳房內(nèi)部, 并由此導(dǎo)致乳中體細(xì)胞數(shù)增加,從而導(dǎo)致SCS差值增加[21]。另外, 隨著年齡和胎次的增加,尤其頭胎奶牛與經(jīng)產(chǎn)奶牛相比,經(jīng)產(chǎn)奶牛對各種疾病的抵抗力下降, 患病率增加,這也可能是導(dǎo)致乳中體細(xì)胞數(shù)增加的因素[22-25]。但是二胎和三胎牛間SCS差值變化不明顯(P>0.05),可能由于胎次接近,乳腺組織生理機能差異小,機體免疫機能差異也較小,故對環(huán)境中致病菌等因素抵抗能力相對接近[26]。

        影響SCS差值變化的因素較多。由于細(xì)胞的脫落及更新,會造成SCS值的增加,因此隨著泌乳月增加,SCS差值呈上升趨勢。其中,1~4月,SCS差值上升幅度較大且差異顯著,4~11月,SCS差值趨于平穩(wěn),且從第3個泌乳月開始,SCS差值為正值。前人研究表明,隨著泌乳月的增加,SCS值呈上升趨勢,且上升幅度較大,乳腺上皮細(xì)胞及與產(chǎn)奶相關(guān)的細(xì)胞由0增加至7%[27-29]。此外,統(tǒng)計年北京地區(qū)的極端氣候環(huán)境也可能會影響SCS差值的變化。據(jù)歷年天氣及環(huán)境記錄調(diào)研發(fā)現(xiàn),2000年北京地區(qū)沙塵暴等極端天氣出現(xiàn)次數(shù)較多,可能會造成SCS差值均值較大;而2014年平均氣溫較為舒適,可能是導(dǎo)致2014年SCS差值平均值較小的原因(圖3B)。

        SCS作為監(jiān)控牛群乳房健康狀態(tài)的指標(biāo),能夠精確檢測臨床乳房炎,且SCS具有區(qū)分隱性乳房炎的潛力,但是SCS不能判定奶牛隱性乳房炎發(fā)病趨勢[30-31]。鑒于SCS差值是SCC值對數(shù)轉(zhuǎn)化后的差值,對奶牛隱性乳房炎乃至金黃色葡萄球菌乳房炎有較好的警示作用,且符合正態(tài)分布,從而能夠進(jìn)行遺傳統(tǒng)計分析和抗病育種應(yīng)用[32]。

        4 結(jié) 論

        綜上,本研究發(fā)現(xiàn),場規(guī)模、當(dāng)前測定年、當(dāng)前測定季節(jié)、胎次、產(chǎn)犢季節(jié)、當(dāng)前泌乳月因素對北京地區(qū)1998-2016年中國荷斯坦牛SCS差值具有顯著性影響(P<0.01)。盡管SCS差值的遺傳力低于相同牛群SCS的遺傳力(0.106±0.04),但是由于SCS差值能夠?qū)崟r地、明確地檢測隱性乳房炎的發(fā)生,提示SCS差值遺傳力的估計及應(yīng)用對中國荷斯坦??闺[性乳房炎選擇具有重要作用。

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