張勃,趙春海,霍寧波
(1.乳山市漁政監(jiān)督管理站,山東威海264500;2.濱州職業(yè)學(xué)院,山東濱州256603)
隨著世界環(huán)境污染的日益嚴(yán)重和能源危機(jī)的不斷加劇,節(jié)能環(huán)保的科技項(xiàng)目日益受到重視,結(jié)合我國在全國范圍內(nèi)推行新舊動能轉(zhuǎn)換,提升企業(yè)發(fā)展的科技水平。根據(jù)目前淀粉的應(yīng)用領(lǐng)域和范圍分析,低溫淀粉酶可以在生產(chǎn)中替代中溫和高溫淀粉酶的應(yīng)用領(lǐng)域,同時降低反應(yīng)條件,避免了在酶解中對生產(chǎn)原料和其中不耐高溫物質(zhì)的破壞同時低溫淀粉酶的工作環(huán)境也在一定程度上降低了對溫度即能源的需求,使得低溫淀粉酶在大規(guī)模生產(chǎn)領(lǐng)域優(yōu)勢明顯,同時低溫淀粉酶的活性條件容易實(shí)現(xiàn),在環(huán)境處理中是一種高效生物治理方法[1]。
淀粉酶在以糖為原料的工業(yè)生產(chǎn)中應(yīng)用非常廣泛,可應(yīng)用于多種酒類及酒精發(fā)酵,發(fā)酵食品中的催熟劑和動物飼養(yǎng)等行業(yè)。同時糖化酶在輕工、食品、醫(yī)藥、發(fā)酵等行業(yè)中具有廣泛的應(yīng)用價值,受到國內(nèi)外學(xué)者的高度重視。隨著研究的深入對其酶學(xué)結(jié)構(gòu)、作用機(jī)理、結(jié)構(gòu)功能相關(guān)性等問題有了一定的了解,其應(yīng)用領(lǐng)域和范圍更加廣泛[3-4]。
基于黃河三角洲區(qū)域特點(diǎn),蘊(yùn)育著獨(dú)特的微生物資源,為了充分開發(fā)和利用本地區(qū)的微生物資源,發(fā)酵生產(chǎn)低溫淀粉酶,有利于拓寬低溫淀粉酶的生產(chǎn)來源,豐富低溫淀粉酶家族成員,有利于對低溫淀粉酶酶學(xué)性質(zhì)的研究,不論是應(yīng)用還是理論研究都具有重要意義。
樣品:濱州本地區(qū)土樣、水樣。
1)0.1 mol/L醋酸緩沖溶液(pH5.0~6.0)。
2)Somogyi氏試劑(酒石酸鉀鈉、Na2CO3、NaHCO3、CuSO4、鉬酸銨、砷酸氫二鈉)國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
GTR16-2高速低溫離心機(jī):北京時代北利離心機(jī)有限公司;FA1004B電子分析天平:上海平軒科學(xué)儀器有限公司;CX21BIM-SET5顯微鏡:上海譜騫光學(xué)儀器有限公司;T6紫外分光光度計:上海添時科學(xué)儀器有限公司;ABI-2720PCR 儀:Applied Biosystems,美國。
平板篩選培養(yǎng)基:可溶性淀粉2%,蛋白胨2%,酵母膏1%,瓊脂2%,pH自然,115℃滅菌,30 min。
發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖1%,可溶性淀粉1%,蛋白胨2%,酵母粉1%,瓊脂2%,pH自然,115℃滅菌30 min。
1.5.1 菌株的初篩
樣品→選擇性培養(yǎng)基平板分離→最適生長溫度測定→搖瓶篩選→菌株獲得→酶活測定[2]
1.5.2 菌株的復(fù)篩
初篩的純菌種培養(yǎng)于250 mL三角瓶中,發(fā)酵培養(yǎng)基72 h,進(jìn)行酶活測定。
1.5.3 粗酶分離及酶活測定
淀粉酶活力測定是通過測定還原糖的增加進(jìn)行測定。將經(jīng)過震蕩培養(yǎng)48 h后的發(fā)酵液離心,收集上清液測定酶活。將用醋酸緩沖溶液(pH5.0)制備的淀粉溶液作為底物。按照粗酶液與底物體積比1∶10比例混勻,50℃水解30 min后沸水浴中5 min終止反應(yīng)。以Nelson—Somogyi方法測定還原糖濃度。酶解產(chǎn)生1.0 μmol葡萄糖所需的酶量定義為1個酶活性單位(U/mL)[5]。
1.5.4 最適溫度的選擇
將分離的菌種接種在篩選平板上,將平板放置于不同溫度條件下培養(yǎng),3 d~4 d后觀察,并在生長較為理想的平板上滴加碘液,根據(jù)顯色挑出菌落在35℃繼續(xù)培養(yǎng),根據(jù)水解圈直徑和菌落直徑比值,確定發(fā)酵復(fù)篩的菌株。
1.5.5 菌種的鑒定[5]
1.5.5.1 形態(tài)觀察
通過菌落形態(tài)、細(xì)胞形態(tài)進(jìn)行初步鑒定。
將平板分離的單個菌落通過電子顯微鏡下觀察細(xì)胞形狀、大小、繁殖方式。
1.5.5.2 糖發(fā)酵測試
選擇葡萄糖、半乳糖、乳糖、麥芽糖、蜜二糖、蔗糖和棉子糖進(jìn)行試驗(yàn)。將質(zhì)量體積百分含量為10.0%的糖溶液10 mL裝在管中滅菌后使用,用注射器去定量的糖液分裝于杜氏管,接種于試管中25℃~28℃下培養(yǎng)觀察。菌種發(fā)酵糖后產(chǎn)氣就會在杜氏小管頂端出現(xiàn)空管現(xiàn)象,既可以判定為陽性(+),反之為(-)。
1.5.5.3 碳源同化
測試碳源選擇葡萄糖、半乳糖、乳糖、麥芽糖、蜜二糖、蔗糖、棉子糖、纖維二糖、海藻糖、D-阿拉伯糖、L-阿拉伯糖、D-木糖、山梨糖和可溶性淀粉等。將菌種分別接種在含有0.5%唯一同化碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)液中,25℃~28℃下培養(yǎng),以葡萄糖和不加任何碳源的空白分別作對照,凡是能生長的判定為陽性(+),反之為陰性(-)[5]。
1.5.5.4 分子生物學(xué)鑒定
通過分離菌株的基因組中ITS測序結(jié)果,在GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行同源比對與分析,并進(jìn)行進(jìn)化樹繪制。
1.5.6 發(fā)酵條件的優(yōu)化
進(jìn)行菌種生長規(guī)律的測定,單因子發(fā)酵條件試驗(yàn),并進(jìn)行菌種產(chǎn)酶時間的探索研究。
2.1.1 平板菌落與淀粉水解
將初篩菌株分別接種在含有淀粉的平板上,28℃培養(yǎng)觀察淀粉水解情況,結(jié)果如圖1~圖2所示。
圖1 菌株Bz-11與Bz-25菌落與水解圈Fig.1 The colony and hydrolytic circle of Bz-11and Bz-25
圖2 Bz-38與Bz-73菌落與水解圈Fig.2 The colony and hydrolytic circle of Bz-38 and Bz-73
圖1、圖2中分離的不同菌株在固體平板上都出現(xiàn)了水解圈,證明這些菌株可以生產(chǎn)胞外淀粉酶,但是菌株是否同時可以合成胞內(nèi)淀粉酶、而且這些胞外酶是否為低溫淀粉酶還需要進(jìn)一步驗(yàn)證[7-8]。
部分初篩菌株在不同生長溫度的透明圈與菌落直徑比值見表1。
表1 不同菌株在不同溫度下水解圈與菌落直徑比值Table1 The ratio of hydrolytic circle to colony diameter from different strains at different temperatures
由表1 可知,Bz38 酶活最高,Bz11、Bz25、Bz38、Bz73相似;這些菌最適生長溫度均在20℃左右,較常規(guī)報道使用的產(chǎn)酶微生物的培養(yǎng)溫度低,與文獻(xiàn)報道的產(chǎn)低溫淀粉酶的低溫微生物生長溫度一致[9]。
2.1.2 發(fā)酵復(fù)篩結(jié)果
經(jīng)過初篩得到 Bz11、Bz25、Bz38、Bz73,根據(jù)水解圈與菌落直徑比值,選擇了其中Bz11、Bz38兩株相對較高菌株在20℃搖瓶液體發(fā)酵48 h,取發(fā)酵液離心后收集上清液即為粗酶液,進(jìn)行酶活測定,結(jié)果如表2所示。
表2 2菌株發(fā)酵復(fù)篩結(jié)果Table 2 Rescreening results of strain fermentation
搖瓶液體發(fā)酵酶活分別為590 U/mL和660 U/mL,從平板固體培養(yǎng)與搖瓶液體發(fā)酵試驗(yàn)都證明了Bz38菌株產(chǎn)酶活性較高,因此選擇野生型菌株Bz38作為產(chǎn)酶試驗(yàn)對象,進(jìn)行鑒定與發(fā)酵研究。
為了驗(yàn)證淀粉酶的水解作用,分別以單糖、二糖、三糖為對照,以淀粉水解液為待測樣品,進(jìn)行層析色譜分析,結(jié)果如圖3所示。
圖3 葡萄糖淀粉酶酶解淀粉層析圖Fig.3 The chromatography from glucoamylase hydrolyzed starch
由圖3可知,淀粉酶水解層析試驗(yàn),通過層析結(jié)果表明,分離菌株產(chǎn)生的淀粉酶可以將淀粉水解成不同大小分子[10-11]。
2.2.1 生理和生化鑒定
將分離菌株劃線于平板上,進(jìn)行菌落觀察如圖4(A)所示,菌落表明光滑、整齊、濕潤成乳白色;將分離菌株細(xì)胞在顯微鏡下觀察圖4(B)所示,部分細(xì)胞呈現(xiàn)大小兩個連在一起的現(xiàn)象,典型酵母菌出芽生殖特征。
圖4 Bz38菌落形態(tài)與細(xì)胞形態(tài)Fig.4 Bz38 colony morphology and cell morphology
酵母菌生理生化特性鑒定指標(biāo)有碳源發(fā)酵測試、碳源同化、本試驗(yàn)篩選葡萄糖、麥芽糖等7種糖進(jìn)行發(fā)酵試驗(yàn)(表3),選擇葡萄糖、麥芽糖等12種糖進(jìn)行碳源同化試驗(yàn),結(jié)果見表3和表4。
表3 酵母菌BZ38的糖發(fā)酵試驗(yàn)結(jié)果Table 3 The results of BZ38 sugar fermentation test
表4 產(chǎn)酶菌株BZ38碳源同化試驗(yàn)Table 4 Carbon source assimilation test of strain Z38
酵母菌BZ38不能發(fā)酵利用常見糖類(表3),但是可以通過同化方式利用葡萄糖糖、麥芽糖、蔗糖(表4)等,與常見酵母菌碳源發(fā)酵、碳源同化結(jié)果一致。
2.2.2 分子生物學(xué)鑒定試驗(yàn)結(jié)果
為了進(jìn)一步掌握確定菌株的分離地位,提取酵母BZ38菌株的基因組DNA,如圖5所示,平行提取5組進(jìn)行電泳檢測,并通過酵母通用引物測定了其26S rDNA序列結(jié)果如圖6所示,擴(kuò)增片段大小為500 bp左右。將這個序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中其它酵母菌的26S rDNA序列進(jìn)行比[5]。
圖5 BZ38基因組DNA(1kb maker)Fig.5 The genome DNA of BZ38(1kb maker)
圖6 26SrDNA PCR擴(kuò)增結(jié)果(D2000maker)Fig.6 PCR amplification results from 26SrDNA(D2000maker)
為了進(jìn)一步確定分離獲得的菌株B38在微生物中的分類地位,在NCBI數(shù)據(jù)庫和CBS菌種庫中尋找出各個物種菌株的rDNA序列,與菌株的ITS序列經(jīng)比對后,用MEGA6.0軟件通過Neughbor-Joining法構(gòu)建進(jìn)化樹,見圖7。
圖7 菌株BZ38 26S rDNA序列進(jìn)化樹結(jié)果Fig.7 Sequence evolution tree results of strain BZ38 26S rDNA
通過與已知鑒定的酵母菌標(biāo)準(zhǔn)菌株菌落和細(xì)胞形態(tài)相比,菌株BZ38解脂耶羅威亞酵母(Yarrowia lipolytica)接近,通過ITS序列進(jìn)行比對與進(jìn)化樹的結(jié)果進(jìn)一步驗(yàn)證了形態(tài)與生理生化方法對株菌的鑒定,BZ38與解脂亞羅酵母(Yarrowia lipolytica)親緣關(guān)系最為相近,下一步研究以BZ38為研究對象[12-13]。
2.3.1 生長曲線的測定
生產(chǎn)曲線是單細(xì)胞微生物特有的生長規(guī)律,為了準(zhǔn)確掌握BZ38生長階段規(guī)律變化,進(jìn)行了生長曲線的測定,結(jié)果如圖8所示。
圖8 Bz38菌株成長曲線Fig.8 Growth curve of Bz38 strain
對菌種Bz38在YPD培養(yǎng)基上進(jìn)行了生長曲線的測定,從圖8可以看出生長規(guī)律基本符合單細(xì)胞微生物群體生長規(guī)律,生長曲線表明菌體12 h左右進(jìn)入穩(wěn)定期,為進(jìn)一步發(fā)酵條件的優(yōu)化奠定了基礎(chǔ)。
2.3.2 單因子試驗(yàn)
2.3.2.1 碳源對產(chǎn)酶發(fā)酵的影響
在只改變原培養(yǎng)基碳源的情況下,以葡萄糖、蔗糖、乳糖、麥芽糖、甘露醇5種糖做單一碳源時,濃度分別選10、15、20 g/L 3個濃度,考查不同碳源對產(chǎn)酶活性的影響,結(jié)果見表5。
表5 不同碳源條件對比酶活的影響Table 5 Effects of different carbon source conditions on enzyme activity
由表5可知,以酶OD值為主要指標(biāo),試驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示蔗糖酶為碳源時酶活性較大,其次是葡萄糖,麥芽糖、乳糖、甘露醇3種物質(zhì)為碳源產(chǎn)酶時,酶濃度較低。結(jié)果也表明碳源對Bz38 Yarrowia lipolytica發(fā)酵的淀粉酶有很大影響[14]。
不同碳源種類試驗(yàn)中也表明同一種碳源不同濃度也會對酶活產(chǎn)生影響,選擇了對酶活影響比較大的蔗糖和葡萄糖進(jìn)行試驗(yàn)見圖9。
圖9 兩種碳源不同濃度對產(chǎn)酶的影響Fig.9 Effects of different concentrations of two carbon sources on enzyme production
由圖9所示,在一定濃度范圍內(nèi)隨著碳源濃度增加,酶活力也隨之提高,到了30 g/L,酶活性開始降低,可能是高濃度的糖,增加了發(fā)酵液的濃稠度,影響了菌體對氧氣的利用,進(jìn)而影響酶的合成和活性,補(bǔ)料發(fā)酵可以避免上述情況的發(fā)生。蔗糖對應(yīng)的酶活比葡萄糖的高,成本又低,應(yīng)選擇蔗糖??紤]到20 g/L與25 g/L的酶活差不多,為了節(jié)省成本,所以選擇20 g/L蔗糖。
2.3.2.2 氮源對產(chǎn)酶發(fā)酵的影響
有機(jī)氮源來源充足,但是微生物生長和很多大分子物質(zhì)合成所必需,又是在酶代謝合成中,雖然有機(jī)氮源被微生物利用緩慢,但對培養(yǎng)基組成意義重大。
通過搖瓶試驗(yàn)已初步確定出碳源,所以把此試驗(yàn)結(jié)果用于優(yōu)化氮源的試驗(yàn)中,即碳源改為25 g/L蔗糖。在選擇有機(jī)氮源的試驗(yàn)中,分別選用了牛肉膏、酵母膏、蛋白胨、尿素、酪蛋白胨、硫酸銨6種有機(jī)氮源。試驗(yàn)結(jié)果見表6。
表6 不同氮源對酶活的影響Table 6 Effects of different nitrogen sources on enzyme activity
從表6可以看出,選擇酵母膏、牛肉膏作為氮源時酶活相對較高,其它幾種有機(jī)氮源的酶活較低,確定酵母膏為有機(jī)氮源,同時考慮到微生物對氮源的利用分為遲效率氮源,和速效氮源,進(jìn)一步增加硫酸銨作為下一步有機(jī)氮源配合使用的備選氮源。
通過對黃河三角洲地區(qū)的土樣中微生物的采集、分離獲得了4株產(chǎn)葡萄糖淀粉較高的菌株:Bz11、Bz25、Bz38、Bz73,經(jīng)過復(fù)篩最終選擇產(chǎn)酶相對較高的Bz38作為研究對象進(jìn)行研究,通過平板菌落觀察、顯微鏡細(xì)胞觀察,碳源發(fā)酵與同化試驗(yàn)、26srDNA分子生物學(xué)鑒定,最終確定為Bz38為解脂亞羅酵母菌。通過生長曲線測定掌握菌株生長規(guī)律的基礎(chǔ)上,進(jìn)行單因子碳源、氮源試驗(yàn)酶活達(dá)到960 U/mL,為全面應(yīng)用葡萄糖淀粉酶奠定了堅實(shí)的力量基礎(chǔ),也極大的豐富了本地區(qū)對微生物種植資源的開發(fā)和利用。
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