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        地稔根際根腐線蟲(chóng)的形態(tài)和分子鑒定

        2018-05-14 14:44:49王宏洪黃少彬楊曉朱廖金鈴
        熱帶作物學(xué)報(bào) 2018年9期
        關(guān)鍵詞:短尾根際線蟲(chóng)

        王宏洪 黃少彬 楊曉朱 廖金鈴

        摘 要 2013—2016年,廣東和廣西植物線蟲(chóng)種類調(diào)查期間,從地稔(Melastoma dodecandnun)根部和根際土壤中分離到一種根腐線蟲(chóng)。經(jīng)形態(tài)學(xué)觀察、rDNA (LSU D2D3和ITS) 序列分析和系統(tǒng)發(fā)育分析,將其鑒定為最短尾短體線蟲(chóng)(Pratylenchus brachyurus)。最短尾短體線蟲(chóng)是全球最重要的11種根腐線蟲(chóng)之一。地稔是最短尾短體線蟲(chóng)的新寄主。地稔根際線蟲(chóng)類群調(diào)查與鑒定,可為地稔線蟲(chóng)病害的發(fā)生與控制提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。

        關(guān)鍵詞 地稔;最短尾短體線蟲(chóng);根腐線蟲(chóng);形態(tài)學(xué);新寄主

        中圖分類號(hào) S432 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

        Abstract A species of root lesion nematode was isolated from the root of Melastoma dodecandrum and the rhizosphere soil during the survey of plant nematodes in Guangdong and Guangxi. Combined morphological study, sequence analysis of rDNA (LSU D2D3 and ITS) and phylogenetic analyses revealed the species was Pratylenchus brachyurus. P. brachyurus is one of the 11 most important root lesion nematodes in the world. M. dodecandrum is a new host record for P. brachyurus. The investigation and identification of plant nematodes assocated with M. dodecandnun can provide a basis for controlling the diseases.

        Keywords Melastoma dodecandrum; Pratylenchus brachyurus; root-lesion nematode; morphology; new host record

        DOI 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.09.021

        短體線蟲(chóng)(Pratylenchus spp.)是遷移性根內(nèi)寄生線蟲(chóng),通常被稱作根腐線蟲(chóng),能夠穿刺和取食皮層薄壁細(xì)胞,引起根部壞死,阻礙水分和營(yíng)養(yǎng)的吸收與運(yùn)輸,導(dǎo)致根系統(tǒng)功能喪失[1]。由根腐線蟲(chóng)引起的損傷可作為病原菌侵入的通道,致使寄主根部的大面積腐爛,形成更加嚴(yán)重的復(fù)合病害[2]。根腐線蟲(chóng)種類繁多,形態(tài)多樣,寄主廣泛,是一類危害僅次于根結(jié)線蟲(chóng)(Meloidogyne spp.)和孢囊線蟲(chóng)(Heterodera spp. 和Globodera spp.)的植物寄生線蟲(chóng)[3]。

        地稔(Melastoma dodecandnun Lour.)為野牡丹科植物,俗名山地稔、地葡萄、鋪地錦、落地稔和地茄等,分布于廣東、廣西、貴州、湖南、江西、浙江、福建等地區(qū),生于酸性土壤的山坡路旁[4]。地稔有良好的藥用價(jià)值,味甘、澀,性另外,地稔還被認(rèn)涼,具有活血止血、消腫祛瘀和清熱解毒的功效[5]。為是一種優(yōu)良的野生觀花地被植物[6-7]。目前,尚未見(jiàn)地稔病蟲(chóng)害的報(bào)道[8]。2013—2016年,廣東和廣西植物線蟲(chóng)的調(diào)查期間,在地被植物地稔根際采集了6個(gè)土壤樣品,其中2個(gè)樣品中發(fā)現(xiàn)根腐線蟲(chóng),本研究通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察和分子生物學(xué)分析將其鑒定到種。

        1 材料與方法

        1.1 種群來(lái)源

        樣品采自廣東石門(mén)國(guó)家森林公園(2016年6月,廣州市從化區(qū))和廣西農(nóng)墾國(guó)有新光農(nóng)場(chǎng)(2013年6月,欽州市靈山縣)。用小鐵鏟在成片地稔中央挖取根系,以及表層10 cm根際土壤約500 g。樣品裝于塑料自封袋,寫(xiě)好標(biāo)簽,做好GPS定位,廣東種群SMDL(23°39′10.25″N,113°45′16.30″E)和廣西種群GX630(22°17′ 25.52″N,108°53′ 30.06″E)。

        1.2 方法

        1.2.1 線蟲(chóng)分離、標(biāo)本制作、形態(tài)觀察與測(cè)量 土壤混勻后稱取200 mL,根系剪成0.5 cm小段后稱取2 g,經(jīng)改進(jìn)的貝曼漏斗法分離24~48 h。在體式顯微鏡下,將根系和土壤樣品中的分離到的根腐線蟲(chóng)挑入裝有清水的指形管中。經(jīng)熱殺死(60~65 ℃水浴2~3 min)、4%甲醛固定和甘油酒精法脫水后,用蠟圈法進(jìn)行標(biāo)本制作[9]。利用尼康科研級(jí)正置顯微鏡(ECLIPSE 90i,Nikon,日本)對(duì)線蟲(chóng)標(biāo)本進(jìn)行形態(tài)觀察、數(shù)據(jù)測(cè)量和拍照[10]。

        1.2.2 DNA抽提、擴(kuò)增和測(cè)序 采用蛋白酶K法進(jìn)行單條線蟲(chóng)DNA抽提[11]。LSU D2D3擴(kuò)增引物為D2A(5′-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGT-3′)和D3B (5′-TCGGAAGGAACCAGCTACTA-3′) [12],ITS擴(kuò)增引物為18S (5′-TTGATTACGTCCCTG-CCCTTT-3′)和26S(5′-TTTCACTCGCCGTTA-CTAAGG-3′)[13]。PCR反應(yīng)體系參照Ex Taq酶說(shuō)明書(shū)(Ex Taq?,TAKARA,日本),50 μL PCR體系中DNA模板為4 μL。PCR程序:95 ℃ 預(yù)變性5 min,(95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1.5 min)39個(gè)循環(huán),72 ℃ 10 min。PCR結(jié)果用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),試劑盒切膠回收PCR產(chǎn)物(EasyPure PCR Purification Kit,全式金生物,北京)。純化的rDNA片段克隆到T載體(PMD-18T vector,TAKARA,日本),再轉(zhuǎn)化到DH5α菌株后,挑取陽(yáng)性克隆送至艾基生物技術(shù)(廣州)有限公司測(cè)序。利用Lasergene 7.0軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析和拼接,然后上傳至GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),序列號(hào)分別為MG745329(廣東種群 28S rDNA D2D3)、MG745330 (廣西種群

        28S rDNA D2D3)、MG738355(廣東種群 rDNA- ITS)和MG738356(廣西種群 rDNA-ITS)。

        1.2.3 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析 參考已發(fā)表的短體線蟲(chóng)系統(tǒng)發(fā)育研究文獻(xiàn)[14-16],下載短體線蟲(chóng)rDNA (LSU D2D3和ITS)序列。利用MEGA 6.0進(jìn)行序列比對(duì),PAUP 4.0和Modeltest 3.7選擇核酸替代模型,MrBayes 3.2構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)、Treeview 1.6打開(kāi)和編輯系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[10]。基于28S rDNA D2D3區(qū)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的外組選擇參考Wang等[11],基于rDNA-ITS區(qū)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的外組選擇刻痕短體線蟲(chóng)[Pratylenchus crenatus Loof, 1960 (FJ712912)]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 形態(tài)鑒定

        形態(tài)特征圖片見(jiàn)圖1,形態(tài)測(cè)量值見(jiàn)表1。

        雌蟲(chóng)(SMDL種群):熱殺死后蟲(chóng)體略腹彎。唇區(qū)略縊縮,前緣明顯呈角狀,唇環(huán)兩個(gè)。側(cè)區(qū)四條側(cè)線,偶爾中帶多出一條線紋,寬5.6~ 8.8 μm。頭骨架強(qiáng),骨化部分延伸至體部?jī)蓚€(gè)環(huán)紋??卺槾謮眩L(zhǎng)18~19.2 μm,基部球大,圓球形,寬4~4.9 μm,高2.7~3.8 μm。食道腺覆蓋腸道的腹面,覆蓋長(zhǎng)度為35.8~68.6 μm,排泄孔緊靠于半月體后,略后于食道腺與腸連接位置,至體前端距離為89.7~107.9 μm。卵母細(xì)胞單行排列,受精囊不清楚,卵巢長(zhǎng)度為141.3~231.2 μm。后陰子宮囊短,長(zhǎng)11.6~22.9 μm,小于最大體寬。陰門(mén)位置相對(duì)靠后,V值為83.9~87.9。尾圓柱形或亞圓柱形,末端寬圓或平,光滑,有時(shí)角質(zhì)層增厚,側(cè)尾腺口位于尾中部,至尾末端距離為15.5~20.6 μm。

        雄蟲(chóng):未發(fā)現(xiàn)。

        寄主:地稔(Melastoma dodecandnun Lour.)。

        經(jīng)形態(tài)學(xué)特征和測(cè)量值比較,地稔根際的根腐線蟲(chóng)(廣東種群SMDL和廣西種群GX630)與最短尾短體線蟲(chóng)基本吻合,故將地稔根際的兩個(gè)短體線蟲(chóng)種群均鑒定為最短尾短體線蟲(chóng)[17]。

        2.2 分子鑒定

        廣東種群SMDL的LSU D2D3區(qū)和ITS序列長(zhǎng)度為780 bp(圖2),與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)最短尾短體線蟲(chóng)序列的一致性為97.2%~99.6%;ITS區(qū)序列長(zhǎng)度為920 bp(圖2),與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)最短尾短體線蟲(chóng)序列的一致性為93.7%~99.0%。廣西種群GX630的LSU D2D3區(qū)序列長(zhǎng)度為780 bp,與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)最短尾短體線蟲(chóng)序列的一致性為97.1%~99.9%;ITS區(qū)序列長(zhǎng)度為919 bp,與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)最短尾短體線蟲(chóng)序列的一致性為93.1%~99.8%。廣東種群SMDL和廣西種群GX630的LSU D2D3區(qū)序列一致性為98.8%,ITS序列一致性為98.9%。

        分子序列分析結(jié)果表明,地稔根際的根腐線蟲(chóng)(廣東種群SMDL和廣西種群GX630)均為最短尾短體線蟲(chóng)。

        2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果

        基于LSU rDNA D2D3和rDNA-ITS的短體線蟲(chóng)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖3,圖4)均顯示,本研究獲得的最短尾短體線蟲(chóng)序列與已發(fā)表的同物種序列聚為高度支持的分支(PP=100),進(jìn)一步證明本研究獲得的短體線蟲(chóng)種群為最短尾短體線蟲(chóng)。

        3 討論

        地稔作為一種地被植物,具有良好的園林觀賞應(yīng)用價(jià)值,其藥用活性成分也有待開(kāi)發(fā),但人工栽培的地稔尚未有病蟲(chóng)害發(fā)生相關(guān)報(bào)道[8]。本文首次報(bào)道了地稔根際線蟲(chóng)類群,地稔是最短尾短體線蟲(chóng)的新寄主,其對(duì)地稔的致病性有待進(jìn)一步研究。

        最短尾短體線蟲(chóng)是11種重要短體線蟲(chóng)之一,寄主植物種類豐富,嚴(yán)重影響植物的生長(zhǎng)[3]。我國(guó)已有最短尾短體線蟲(chóng)的報(bào)道[18-19]。地稔可生長(zhǎng)在山坡地或者陽(yáng)光照射到的林間和田間的酸性土壤中,生長(zhǎng)迅速[4],廣西種群GX630采自星光農(nóng)場(chǎng)的荔枝果園,最短尾短體線蟲(chóng)也危害荔枝[3]。因此,在一些能夠受到最短尾短體線蟲(chóng)危害的農(nóng)作物周圍,應(yīng)該及時(shí)鏟除地稔,以阻止地稔攜帶的最短尾短體線蟲(chóng)傳播。

        短體線蟲(chóng)種內(nèi)ITS區(qū)變異較大[15-16],一般情況下為1%~3%,部分種類達(dá)到6%~8%。例如:玻利維亞短體線蟲(chóng)(P. bolivianus Corbett, 1983)、地中海短體線蟲(chóng)(P. mediterraneus Corbett, 1983)和假咖啡短體線蟲(chóng)(P. pseudocoffeae Mizukubo, 1992)為1%;扁豆短體線蟲(chóng)(P. lentis Troccoli, De Luca, Handoo & Di Vito, 2008)為5%;桑尼短體線蟲(chóng)(P. thornei Sher & Allen, 1953)和鈴蘭短體線蟲(chóng)(P. convallariae Seinhorst, 1959)為6%;傷殘短體線蟲(chóng)(P. vulnus Allen & Jensen, 1951)為6%[15]或7%[16];落選短體線蟲(chóng)[P. neglectus (Rensch, 1924) Filipjev & Schuurmans Stekhoven, 1941]和刻痕短體線蟲(chóng)為 7%;穿刺短體線蟲(chóng)[P. penetrans (Cobb, 1917) Filipjev & Schuurmans Stekhoven, 1941]、敏捷短體線蟲(chóng)(P. agilis Thorne & Malek, 1968)和最短尾短體線蟲(chóng)的ITS變異就達(dá)到8%[15] 。本研究中,廣東種群GX630的ITS區(qū)序列與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)最短尾短體線蟲(chóng)序列的一致性為93.1%~99.8%,ITS區(qū)變異達(dá)到了6.9%,在最短尾短體線蟲(chóng)種內(nèi)ITS變異范圍之內(nèi)。據(jù)報(bào)道,短體線蟲(chóng)ITS區(qū)種內(nèi)變異大的原因有兩個(gè),一是短體線蟲(chóng)ITS1和ITS2的堿基序列和長(zhǎng)度變異大,二是短體線蟲(chóng)的ITS序列是有記錄的植物線蟲(chóng)中最短的[16],在870~1 250 bp之間。堿基序列變異越大或者ITS序列越短,相對(duì)變異越大。而最短尾短體線蟲(chóng)的ITS序列僅有920 bp,屬于較短ITS序列的短體線蟲(chóng)。

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