丁 赫 ,宮永勝,王 軍,呂文發(fā)
(吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,吉林省反芻動物繁育生物技術(shù)與健康養(yǎng)殖工程實驗室,吉林長春 130118)
初情期是指雌性動物初次發(fā)情并排出卵子的過程,是動物獲得繁殖能力的標志,其啟動時間的早晚影響著養(yǎng)羊業(yè)的經(jīng)濟效益[1-2]。下丘腦-垂體-性腺(Hypothalamic-Pituitary-Gonadal,HPG)軸在初情期啟動過程中具有重要的作用,下丘腦促性腺激素釋放激素(Gonadotropin-releasing Hormone,GnRH)脈沖式釋放,調(diào)節(jié)垂體促卵泡素和促黃體素的分泌,最終實現(xiàn)初情期的啟動[3-4]。初情期啟動的機制復(fù)雜,主要與環(huán)境、表觀遺傳機制等密切相關(guān)。DNA甲基化是目前研究較多的一種表觀遺傳修飾方式,多發(fā)生在富含CpG島和CpG位點區(qū)域,啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)影響著基因的轉(zhuǎn)錄[5-7]。有研究表明,DNA甲基化升高可抑制基因的表達[8-9],在初情期啟動過程中DNA甲基化改變可能影響下丘腦中的特定基因的表達,從而調(diào)節(jié)初情期的啟動[10-11]。本實驗利用亞硫酸氫鹽測序(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)技術(shù)研究了GnRH啟動子區(qū)富含CpG島和CpG位點的1 000 bp區(qū)域的甲基化狀態(tài),通過實時熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)研究了GnRHmRNA表達量,并分析初情期啟動過程中小尾寒羊下丘腦GnRH基因表達與其啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)的關(guān)系。
1.1 樣品采集與保存 采集初情期前(90日齡)、臨近初情期(120日齡)、初情期(130日齡)小尾寒羊的下丘腦組織,每個階段選取小尾寒羊3只,采集的下丘腦樣本為前端止于視交叉,后端止于乳頭體,樣品采集做好標記后,放入液氮中保存,待取樣結(jié)束全部置入-80℃冰箱中保存。
1.2 BSP測序 取組織樣品,利用DNA提取試劑盒(天根生化科技有限公司,中國)按說明書操作進行基因組DNA提取,1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,用NAS-99測定樣品中DNA濃度。隨后根據(jù)樣品濃度,抽取500 μg DNA進行DNA亞硫酸氫鹽修飾,根據(jù)試劑盒EZ DNA Methylation-Gold Kit(ZYMO公司catlog D5006)進行具體操作。在Ensembl(http://asia.ensembl.org/index.html)上查找并下載GnRH啟動子序列,將序列在在線引物設(shè)計軟件methprimer(http://www.urogene.org/cgi-bin/methprimer/methprimer.cgi) 中轉(zhuǎn)化為亞硫酸氫鹽修飾后的序列,利用軟件Primer5設(shè)計GnRH啟動子甲基化位點擴增引物,引物序列送至北京優(yōu)博蘭基因技術(shù)有限公司進行合成,引物信息見表1。PCR擴增體系半巢式第1輪:1 μL修飾后DNA模板,1 μLGnRH-F(10 μmol/L),1 μLGnRH-OR(10 μmol/L),0.5 μL dNTP(10 mmol/L),1 μL Mg2+(50 mmol/L),2.5 μL 10×PCR Buffer,0.1 μL Taq酶,ddH2O至25 μL。半巢式第2輪:1 μL 第 1 輪 PCR 產(chǎn)物,1 μLGnRH-F(10 μmol/L),1 μLGnRH-R(10 μmol/L),0.5 μL dNTP(10 mmol/L),1 μL Mg2+(50 mmol/L),2.5 μL 10×PCR Buffer,0.1 μL Taq酶,ddH2O至25 μL,使用Taq酶Platinum?Taq DNA Polymerase, High Fidelity(Thermocatlog11304-029)進行擴增。半巢式第1輪擴增程序:94℃ 2 min,94℃ 30 s、57℃ 30 s、72℃ 40 s、30個 循 環(huán),72℃延伸5 min。半巢式第2輪擴增程序為:94℃ 2 min,94℃ 30 s、60℃ 降 到 53℃( 每 個 循 環(huán) 降 1℃)30 s、72℃ 30 s、7 個循環(huán),94℃ 30 s、50℃ 30 s、72℃ 30 s、33個循環(huán),72℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖檢測后,切膠,使用DNA純化回收試劑盒(天根生化科技有限公司,DP209-03)純化產(chǎn)物。利用P-Easy T1 Cloning載體連接試劑盒(北京全式金生物技術(shù)有限公司CT101-02)進行連接轉(zhuǎn)化。利用試劑盒(Omega bio-tek,美國)提取質(zhì)粒,將質(zhì)粒每段序列至少選擇10個,送至北京優(yōu)博蘭基因技術(shù)有限公司進行測序,利用BiQ Analyzer對測序結(jié)果進行整理并分析甲基化狀態(tài),每個基因甲基化程度以所測得的CpG位點的甲基化數(shù)占所測的甲基化位點總數(shù)的百分率表示。
1.3 實時熒光定量PCR檢測 采用Trizol法提取下丘腦組織的總RNA,取冷凍保存的下丘腦,提取腦組織總RNA進行反轉(zhuǎn)錄為cDNA,用于實時熒光定量PCR實驗, 根據(jù)TaKaRa的反轉(zhuǎn)錄試劑盒要求,利用RNA的OD值計算反轉(zhuǎn)20 μL的cDNA所需的RNA量。本實驗所需的GnRH基因引物序列見表2。引物序列利用Prime 5.0自行設(shè)計,由上海生工生物技術(shù)有限公司合成,并利用PCR儀進行引物驗證,摸索引物的最適反應(yīng)條件。利用熒光定量PCR儀對初情期前、臨近初情期和初情期母羊下丘腦中GnRH基因進行定量分析,反應(yīng)體系:SYBR Premix Ex Taq Ⅱ 10 μL、Forward primer 0.8 μL、Reverse primer 0.8 μL、ROX reference DyeⅡ 0.4 μL、cDNA 2 μL、ddH2O 至 20 μL。反應(yīng)條件:95℃ 預(yù)變性 30 s;95℃ 變性 5 s,40 個循環(huán);57℃ 退火34 s,擴增40個循環(huán);95℃ 變性15 s,57℃ 退火60 s,95℃ 變性 15 s。
1.4 統(tǒng)計分析 采用SPSS17.5 軟件進行χ2檢驗比較組間差異性,數(shù)據(jù)用平均值±標準差表示,P<0.05表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 初情期啟動過程中甲基化狀態(tài) 利用BiQ Analyzer對測序結(jié)果進行整理分析,得到GnRH啟動子區(qū)靠近第1外顯子1 000 bp內(nèi)4個CpG位點甲基化狀態(tài)結(jié)果,將得到的結(jié)果繪制成空點圖(圖1-A)和柱狀圖(圖1-B)。結(jié)果表明,在初情期前到臨近初情期,甲基化狀態(tài)變化不明顯(P>0.05);當(dāng)?shù)竭_初情期時,GnRH啟動子所檢測區(qū)域總體甲基化水平呈降低趨勢,初情期甲基化水平達33.33%,與初情期前差異極顯著(P<0.01)。隨著初情期的到來,在GnRH啟動子區(qū)-570位點,甲基化程度顯著降低(P<0.01)。這些結(jié)果表明,初情期啟動過程中GnRH啟動子區(qū)特定位點的甲基化水平顯著降低。
表1 甲基化位點擴增引物序列
表2 基因引物合成情況
圖 1 GnRH 基因啟動子區(qū)域甲基化狀態(tài)
2.2 初情期啟動過程GnRH基因表達量 如圖2所示,熔解曲線呈單一峰值,且峰尖而窄,未出現(xiàn)雜峰,說明擴增較好。由圖3可知,隨著初情期的啟動,GnRHmRNA表達量在下丘腦中呈上升趨勢,GnRH在初情期的 mRNA表達量與其余2個時期差異極顯著(P<0.01)。結(jié)合GnRH甲基化結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著初情期的到來,GnRH甲基化呈降低趨勢,并伴隨著GnRHmRNA表達量升高。
圖2 GnRH的熔解曲線
圖3 GnRH的mRNA表達量
近年來,研究甲基化與基因表達量關(guān)系的報道越來越多。啟動子區(qū)CpG位點甲基化可抑制轉(zhuǎn)錄因子與啟動子的結(jié)合,從而抑制基因的表達。CpG位點可以通過改變甲基化狀態(tài)調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄[7,12-13]。Lomniczi等[14]向雌性小鼠注射DNA甲基化酶抑制劑(5-AZA),發(fā)現(xiàn)實驗組陰道口開啟的時間較對照組顯著延遲,同時延遲了卵巢的成熟,說明向雌性小鼠體內(nèi)注射5-AZA抑制甲基化時,初情期啟動受到抑制。而Terasawa等[15]研究獼猴GnRH神經(jīng)元細胞成熟過程中表觀遺傳學(xué)的變化,發(fā)現(xiàn)mRNA表達量上升的同時GnRH基因5'端CpG島甲基化呈降低趨勢。同樣,Kurian等[16]通過體外培養(yǎng)GnRH神經(jīng)元發(fā)現(xiàn),在體外成熟的過程中GnRHmRNA表達量顯著上升,同時GnRH5'端14個CpG位點中有8個位點甲基化水平顯著下降。GnRH甲基化狀態(tài)與mRNA表達量變化趨勢與本研究結(jié)果一致。通過利用免疫熒光雙標記技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),甲基化CpG結(jié)合蛋白(MeCP2)和GnRH在母羊下丘腦視前區(qū)和弓狀核中存在共表達,且共表達陽性細胞數(shù)在初情期顯著高于初情期前和臨近初情期,說明DNA甲基化對GnRH表達可能存在一定的影響[17]。最近宮永勝研究發(fā)現(xiàn),DNA甲基轉(zhuǎn)移酶 1(Dnmt 1)和GnRH在下丘腦視前區(qū)和弓狀核均有表達,同樣呈現(xiàn)共表達模式(未發(fā)表數(shù)據(jù))。這些研究進一步說明了GnRH甲基化程度可能會影響著GnRHmRNA表達量,最終影響母羊初情期的啟動。
本研究對初情期啟動過程中小尾寒羊下丘腦GnRH表達量變化與其啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)相關(guān)性進行了初步研究,其對初情期啟動的作用機制尚需進一步研究。
母羊初情期啟動過程中GnRH表達調(diào)控機制目前尚不清楚,DNA甲基化作為一種重要的基因表達調(diào)控方式,可能通過影響GnRH表達來調(diào)控母羊初情期的啟動。本研究結(jié)果顯示,隨著小尾寒羊初情期的啟動,GnRH基因mRNA表達量呈上升趨勢,同時GnRH啟動子區(qū)甲基化水平降低,由此可知小尾寒羊下丘腦中GnRH甲基化狀態(tài)與其基因表達量及初情期啟動有一定的關(guān)系。
參考文獻:
[1] 田園, 宋敏, 方富貴. 動物初情期表觀遺傳調(diào)控的研究進展[J]. 家畜生態(tài)學(xué)報, 2015(4): 6-9.
[2] 邢鳳, 廖秋萍. 哺乳動物初情期啟動相關(guān)基因研究進展[J].家畜生態(tài)學(xué)報, 2017(7): 1-4.
[3] Zeydabadi Nejad S, Ramezani Tehrani F, Zadeh-Vakili A. The role of kisspeptin in female reproduction[J]. Int J Endocrinol Metab, 2017, 15(3): e44337.
[4] Thompson I R, Kaiser U B. GnRH pulse frequency-dependent differential regulation of LH and FSH gene expression[J]. Mol Cell Endocrinol, 2014, 385(1-2): 28-35.
[5] 李曉雨, 劉秋月, 胡文萍, 等. DNA甲基化調(diào)控動物季節(jié)性行為和繁殖的研究進展[J]. 家畜生態(tài)學(xué)報, 2016(12): 1-5,12.
[6] Bird A. DNA methylation patterns and epigenetic memory[J].Genes Dev, 2002, 16(1): 6-21.
[7] Nabel C S, Kohli R M. Molecular biology. Demystifying DNA demethylation[J]. Science, 2011, 333(6047): 1229-1230.
[8] Chen Z, Luo J, Zhang C,et al. Mechanism of prolactin inhibition of miR-135b via methylation in goat mammary epithelial cells[J]. J Cell Physiol, 2018, 233(1): 651-662.
[9] Qiang M, Denny A, Chen J,et al. The site specific demethylation in the 5'-regulatory area of NMDA receptor 2B subunit gene associated with CIE-induced up-regulation of transcription[J]. PLoS One, 2010, 5(1): e8798.
[10] Lomniczi A, Wright H, Ojeda S R. Epigenetic regulation of female puberty[J]. Front Neuroendocrinol, 2015, 36: 90-107.
[11] Yang C, Ye J, Li X,et al. DNA methylation patterns in the hypothalamus of female pubertal goats[J]. PLoS One, 2016,11(10): e0165327.
[12] Ito S, Shen L, Dai Q,et al. Tet proteins can convert 5-methylcytosine to 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine[J]. Science,2011, 333(6047): 1300-1303.
[13] Nagaaju G P, El-Rayes B F. SPARC and DNA methylation:possible diagnostic and therapeutic implications in gastrointestinal cancers[J]. Cancer Lett, 2013, 328(1): 10-17.
[14] Lomniczi A, Loche A, Castellano J M,et al. Epigenetic control of female puberty[J]. Nat Neurosci, 2013, 16(3): 281-289.
[15] Terasawa E, Kurian J R, Guerriero K A,et al. Recent discoveries on the control of gonadotrophin-releasing hormone neurones in nonhuman primates[J]. J Neuroendocrinol, 2010,22(7): 630-638.
[16] Kurian J R, Keen K L, Terasawa E. Epigenetic changes coincide with in vitro primate GnRH neuronal maturation[J].Endocrinology, 2010, 151(11): 5359-5368.
[17] 宮永勝, 苑志宇, 張濤, 等. 初情期啟動過程中MeCP2和GnRH在母羊下丘腦的分布定位[J]. 中國畜牧雜志, 2017,53(12): 53-55.