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        海島棉GbTCP14基因的克隆與表達(dá)分析

        2018-04-26 02:02:38蔡永生賀宏偉曲延英倪志勇陳全家
        西北植物學(xué)報(bào) 2018年3期

        蔡永生,鄭 凱,王 怡,賀宏偉,曲延英,倪志勇,陳全家

        (新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,烏魯木齊 830052)

        棉花提供了世界上絕大部分的天然纖維,而且是一種重要的可再生資源[1]。中國(guó)是世界上棉花生產(chǎn)和消費(fèi)大國(guó),棉花在經(jīng)濟(jì)作物種植面積中占有舉足輕重的地位,棉纖維提供紡織工業(yè)的原材料[2]。如今,隨著植物發(fā)育生物學(xué)研究的迅猛發(fā)展,許多重要的發(fā)育機(jī)制在分子水平上得到闡明,但因?yàn)槊藁ㄊ撬谋扼w,基因組龐大、生長(zhǎng)周期較長(zhǎng)、遺傳關(guān)系復(fù)雜等因素,所以棉花發(fā)育生物學(xué)研究進(jìn)展較為緩慢。

        植物轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)調(diào)控下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),不僅成為整個(gè)生命活動(dòng)的重要控制者,而且作為功能基因組學(xué)的重要組成部分。轉(zhuǎn)錄因子又稱反式作用因子,能夠與真核基因啟動(dòng)子區(qū)域DNA序列特異結(jié)合的一類蛋白質(zhì)分子,一般具有激活或抑制基因轉(zhuǎn)錄的功能,直接或間接參與代謝過(guò)程[3]。在1999年,最早發(fā)現(xiàn)的幾個(gè)TCP家族成員分別為玉米teosintebranched1(TB1)、金魚(yú)草cycloidea(CYC)和水稻PCF1、PCF2基因,TCP家族名稱由這幾個(gè)基因首字母所命名[4]。通過(guò)對(duì)這4個(gè)基因序列比較發(fā)現(xiàn),序列中均含有一個(gè)保守區(qū)域,也就是TCP結(jié)構(gòu)域(TCP domain)。TCP結(jié)構(gòu)域是由59個(gè)氨基酸組成的高度保守的區(qū)域,可以形成一個(gè)非典型的堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)(noncanonical basic-Helix-Loop-Helix(bHLH)structure)[5]。研究表明,bHLH中的堿性區(qū)提供與DNA相作用的表面,推測(cè)蛋白可能參與核定位信號(hào)、蛋白質(zhì)的二聚化和與 DNA 結(jié)合的功能,在TCP結(jié)構(gòu)域中包含與DNA識(shí)別區(qū)域,刪除該區(qū)域則導(dǎo)致DNA結(jié)合活性喪失[6]。除了bHLH結(jié)構(gòu)外,CYC和TB1還有一個(gè)保守的富含極性氨基酸的區(qū)域,大約有18個(gè)氨基酸組成,可以形成一個(gè)親水α螺旋的R結(jié)構(gòu)區(qū)[7]。根據(jù)TCP結(jié)構(gòu)域序列的特點(diǎn),TCP家族又被分成2個(gè)亞族ClassⅠ和ClassⅡ,主要差異在于NLS序列完整性差異和R結(jié)構(gòu)區(qū)的存在與否。

        在擬南芥中已基本確定具有24個(gè)TCP轉(zhuǎn)錄因子[8]。研究表明,擬南芥AtTCP1基因參與調(diào)控植物莖的生長(zhǎng)[9]。擬南芥AtTCP11基因參與擬南芥維管束發(fā)育和木質(zhì)部導(dǎo)管分子的分化和形成[10]。擬南芥AtTCP16基因?qū)υ缙诨ǚ鄣陌l(fā)育有重要作用[11]。擬南芥AtTCP20融合EAR抑制子的異位表達(dá)引起很特殊的表型,表明TCP家族基因在細(xì)胞分裂、伸長(zhǎng)和分化調(diào)控中起到重要作用[12]。

        TCP家族轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與不同植物的整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育之中,目前,與棉花纖維發(fā)育相關(guān)的TCP轉(zhuǎn)錄因子研究處于興起階段。海島棉纖維品質(zhì)優(yōu)良,具有優(yōu)異的基因資源,已成為棉花品質(zhì)改良、抗性遺傳及雜種優(yōu)勢(shì)利用等研究重要的資源材料[13]。然而海島棉優(yōu)異纖維形成的分子機(jī)制尚未解析,使利用優(yōu)異基因變得十分困難。新疆海島棉育種歷經(jīng)多個(gè)階段,現(xiàn)已育成37個(gè)海島棉品種,‘新海21號(hào)’目前已成為南疆海島棉主要栽培品種之一,具有結(jié)鈴性強(qiáng),豐產(chǎn)性好,適應(yīng)性強(qiáng),產(chǎn)量高而穩(wěn)定等優(yōu)點(diǎn)[14]。本研究將從海島棉‘新海21號(hào)’棉纖維中克隆1個(gè)TCP轉(zhuǎn)錄因子,分析該基因的氨基酸序列和表達(dá)模式并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄激活驗(yàn)證,為后期研究提供理論指導(dǎo)。

        1 材料和方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        供試品種‘新海21號(hào)’種植于阿克蘇地區(qū)農(nóng)一師十六團(tuán)新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院試驗(yàn)基地。以開(kāi)花當(dāng)天記作0 DPA(開(kāi)花后0 d),依次摘取0 DPA的胚珠和5 DPA、10 DPA、15 DPA、20 DPA、25 DPA、30 DPA、35 DPA的棉花纖維,以及0 DPA時(shí)期的花瓣、花萼和花托,置于液氮中速凍,保存于-80 ℃冰箱中備用。

        于2016年10月20日收獲田間種子,室內(nèi)種植‘新海21號(hào)’種子擺放在紙床發(fā)芽盒中,28 ℃暗培養(yǎng)取下胚軸,部分移栽入土中繼續(xù)生長(zhǎng),待第一片真葉展平時(shí),取主根、須根、莖、葉,置于液氮中速凍,保存于-80 ℃冰箱中備用。

        1.2 方 法

        1.2.1植物總RNA的提取和cDNA第一鏈的合成采用RNAprep Pur多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(天根試劑公司),參照說(shuō)明書(shū),提取開(kāi)花當(dāng)天的胚珠、花瓣、花萼、花托及根、莖、葉、下胚軸的總RNA, 以及不同時(shí)期棉纖維等的總RNA。用RNase-Free DNasee 1(天根試劑公司)去除基因組DNA污染,用Thermo Scietific(NanoDrop 1000)分光光度計(jì)檢測(cè)RNA質(zhì)量濃度和質(zhì)量,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA的完整性。將RNA保存在-80 ℃冰箱中備用。

        將不同時(shí)期棉纖維(0 DPA為胚珠)和不同組織的總RNA,使用First strand cDNA Synthesis試劑盒(Thermo試劑公司)反轉(zhuǎn)錄合成單鏈cDNA,反應(yīng)體系參照說(shuō)明書(shū)。反轉(zhuǎn)錄合成單鏈cDNA保存在-80 ℃冰箱備用。

        1.2.2海島棉GbTCP14基因的克隆以擬南芥AtTCP14基因(AT3G47620)的核苷酸序列作為參比序列,使用本地Blast在陸地棉基因組序列中進(jìn)行比對(duì),獲得1條屬于TCP家族基因的陸地棉全長(zhǎng)cDNA序列。根據(jù)該序列最大開(kāi)放閱讀框(open reading frame)用Oligo7軟件進(jìn)行設(shè)計(jì)引物,獲得GbTCP14-F和GbTCP14-R(表1)2條引物。

        用引物GbTCP14-F和GbTCP14-R,以‘新海21號(hào)’5 DPA棉纖維合成的cDNA第一鏈作為模板,用高保真Taq聚合酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增。采用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,使用紫外凝膠成像儀觀察后切下目的片段。利用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒 (天根試劑公司)按說(shuō)明書(shū)步驟,純化回收PCR產(chǎn)物,連接至pMD19-T載體,轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞(全式金公司)。采用菌液PCR的方法鑒定出陽(yáng)性克隆,送至深圳華大基因有限公司測(cè)序。

        1.2.3生物信息學(xué)分析將測(cè)序結(jié)果采用GenBank和Blast的Blast程序進(jìn)行同源性分析,采用NCBI的ORF程序在線(http://w ww.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)查找基因的開(kāi)放閱讀框并得到氨基酸序列。利用ProtParam(http://expas y.org/tools/protparam.html)在線計(jì)算氨基酸理化性質(zhì)。利用PredictProtein(http://www.predictprotein.org/)在線預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)以及蛋白質(zhì)的障礙和靈活性。利用DNAMA軟件和SMARTBLAS(https://blast.Ncbi.nl m.ni h.gov/blast/smartblast/)在線進(jìn)行氨基酸多重序列比對(duì)和一致性分析。利用ClustalX和MEGA6.0軟件比對(duì)氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        1.2.4GbTCP14基因酵母轉(zhuǎn)化以克隆出的GbTCP14基因作為模板,使用Oligo 7軟件設(shè)計(jì)1對(duì)包含酶切位點(diǎn)引物pGBKT7-GbTCP14-F和pGBKT7-GbTCP14-R(表1)。擴(kuò)增GbTCP14完整的ORF編碼區(qū),純化回收。采用推薦最佳反應(yīng)體系用NcoⅠ和EcoRⅠ兩種限制性內(nèi)切酶,雙酶切PCR產(chǎn)物和空質(zhì)粒pGBKT7(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)生物技術(shù)重點(diǎn)研究室提供)。純化回收目的片段,用T4DNA連接酶連接載體與目的片段,轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂在含有卡那霉素的LB固體培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)12 h后挑取單克隆,提取質(zhì)粒雙酶切篩選陽(yáng)性單克隆后送測(cè)序,驗(yàn)證載體構(gòu)建的正確性。按照Frozen-EZ Yeast Transformation II 試劑盒(ZYMO RESEARCH)說(shuō)明書(shū)操作步驟,將pGBKT7-GbTCP14和pGBKT7質(zhì)粒轉(zhuǎn)化酵母菌株AH109,將轉(zhuǎn)化的感受態(tài)細(xì)胞接種色氨酸缺陷平板(SD/-Trp),30 ℃培養(yǎng)3 d,將轉(zhuǎn)化的陽(yáng)性對(duì)照、pGBKT7-GbTCP14和pGBKT7質(zhì)粒的菌液分別鋪SD/-Trp和SD/-Leu/-Trp/-His培養(yǎng)基平板,30 ℃ 培養(yǎng)3~5 d后觀察菌落的生長(zhǎng)。

        1.2.5GbTCP14基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR根據(jù)已獲得的目的基因序列,設(shè)計(jì)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)引物GbTCP14-qF和GbTCP14-qR(表1),以棉花的Ubiquitin7(UBQ7, GenBank 登錄號(hào)為DQ116441)基因序列設(shè)計(jì)內(nèi)參引物,引物序列為UBQ7-F和UBQ7-F(表1)。熒光定量PCR儀器為Applied Biosystems 7500實(shí)時(shí)定量PCR儀(美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)。將‘新海21號(hào)’不同時(shí)期的棉纖維和不同組織的cDNA用ddH2O稀釋10倍后作為模板,檢測(cè)GbTCP14基因在不同時(shí)期棉纖維和不同組織中的表達(dá)情況,用內(nèi)參基因檢測(cè)擴(kuò)增效率一致性。RT-PCR擴(kuò)增體系參照說(shuō)明書(shū)。試驗(yàn)進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù),采用2-ΔCt法分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)分析采用Excel和DPS 10.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析和作圖。

        表1 引物序列

        2 結(jié)果與分析

        2.1 海島棉GbTCP14基因的克隆與生物信息學(xué)分析

        測(cè)序結(jié)果在NCBI上進(jìn)行同源性分析表明,所得的片段(圖1)為GbTCP14,該基因編碼區(qū)序列長(zhǎng)1 221 bp。利用Prot Param分析得出(圖2),表明該基因可編碼一個(gè)由406個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),分子式C1892H2950N572O620S16,預(yù)測(cè)分子量為44.134 6 kD,等電點(diǎn)為6.88,脂肪系數(shù)55.49,總平均親水性是-0.708,不穩(wěn)定系數(shù)56.58。利用SMART軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的保守功能域(http://smart.embl-heidelberg.de/)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果(圖2)發(fā)現(xiàn),GbTCP14蛋白序列不包含非常保守的R-domain,但位于第89位到261位氨基酸之間有一個(gè)TCP家族特有保守結(jié)構(gòu)域,且結(jié)構(gòu)域符合ClassⅠ型TCP家族基因所特有。推測(cè)該基因?qū)儆诿藁═CP轉(zhuǎn)錄因子中ClassⅠ類轉(zhuǎn)錄因子,蛋白親水性差,脂溶性強(qiáng),為不穩(wěn)定蛋白。

        利用PredictProtein(http://www.predictprotein.org/)在線預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖3。圖3的上方所表示為氨基酸序列,下方所表示為其所對(duì)應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu),其中e代表延伸鏈(extended strand),t代表β-轉(zhuǎn)角(beta turn),c代表無(wú)規(guī)則卷曲(random coil),h代表α-螺旋(alpha helix)。分析結(jié)果為,GbTCP14蛋白由406個(gè)氨基酸組成,其中59個(gè)氨基酸可能成型α-螺旋,主要位于第139位至146位氨基酸、第215位至264位氨基酸以及第359位至364位氨基酸之間。33個(gè)氨基酸可能形成β-折疊和78個(gè)氨基酸可能形成延伸鏈,分別散布在整個(gè)蛋白質(zhì)之中。236個(gè)氨基酸可能無(wú)規(guī)則卷曲,作為蛋白質(zhì)的主要結(jié)構(gòu)大量存在于蛋白質(zhì)中。GbTCP14蛋白的α-螺旋主要是TCP保守結(jié)構(gòu)域形成,無(wú)規(guī)則卷曲分散于整個(gè)蛋白中,共同形成一個(gè)非典型的堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu),與bHLH轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)相符合,推測(cè)可能是TCP的大量結(jié)構(gòu)元件,以bHLH結(jié)構(gòu)類似的方式與DNA結(jié)合參與植物的DNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程。

        M. Marker; 1. GbTCP14圖1 棉花GbTCP14 基因PCR產(chǎn)物電泳分析Fig.1 Electrophoresis of PCR product of cotton GbTCP14 genes

        A. GbTCP14蛋白的氨基酸序列;B. 蛋白結(jié)構(gòu)示意圖,方框部分代表TCP結(jié)構(gòu)域圖2 GbTCP14蛋白的氨基酸序列以及蛋白結(jié)構(gòu)示意圖A. Amino acid sequence of GbTCP14; B. Schematic diagram of GbTCP14, Box part represents TCP domain structureFig.2 GbTCP14 protein amino acid sequence and protein structure diagram

        e.延伸鏈;c.無(wú)規(guī)則卷曲;t.β-轉(zhuǎn)角; h.α-螺旋圖3 GbTCP14蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)e.Extended strand;c.Random coil;t.Beta turn;h.Alpha helixFig.3 Secondary structure prediction of GbTCP14 protein

        GaTCP14.亞洲棉(XP_017636574.1);GhTCP14.陸地棉(XP_016736368.1);GrTCP14.雷蒙德氏棉(XP_012438750.1);AtTCP14.擬南芥(NP_190346.2);NtTCP14.煙草(XP_016472329.1);OsTCP14.水稻(XP_015624016.1);ZmTCP14.玉米(XP_008646257.1);GmTCP14.大豆(XP_003549670.1);TcTCP14.可可(XP_007037311.2);CarTCP14.鷹嘴豆(XP_007037311.2);GbTCP14.海島棉圖4 GbTCP14與其他TCP14氨基酸序列比對(duì)分析GaTCP14. Gossypium arboreum(XP_017636574.1);GhTCP14. Gossypium hirsutum(XP_016736368.1);GrTCP14. Gossypium raimondii(XP_012438750.1);AtTCP14. Arabidopsis thaliana(NP_190346.2);NtTCP14.Nicotiana tabacum(XP_016472329.1);OsTCP14. Oryza sativa Japonica Group(XP_015624016.1);ZmTCP14. Zea mays(XP_008646257.1);GmTCP14. Glycine max(XP_003549670.1);TcTCP14. Theobroma cacao(XP_007037311.2);CarTCP14. Cicer arietinum(XP_007037311.2);GbTCP14. Gossypium barbadenseFig.4 Comparison of GbTCP14 with other TCP14 amino acid sequences

        借助DNAMAN軟件將海島棉GbTCP14與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中的木本棉(Gossypiumarboreum)、陸地棉(Gossypiumhirsutum)、雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii)、擬南芥(Arabidopsisthaliana)、煙草(Nicotianatabacum)、水稻(OryzasativaJaponica Group)、玉米(Zeamays)、大豆(Glycinemax)、可可(Theobromacacao)、鷹嘴豆(Cicerarietinum) TCP14蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比較,結(jié)果(圖4)表明,與海島棉GbTCP14相似程度最高的是木本棉(98.28%),其次為雷蒙德氏棉(95.32%)、陸地棉(95.57%)、可可(84.88%)、煙草(63.01%)、大豆(59.27%)、鷹嘴豆(60.09%),較低的為擬南芥(38.65%)、玉米(42.19%)、水稻(40.97%)。表明這些TCP蛋白的氨基酸序列中都包含1個(gè)高度保守的TCP domain,其他區(qū)域的相似性較低。

        2.2 海島棉GbTCP14系統(tǒng)進(jìn)化分析

        利用MEGA 6.0軟件對(duì)上述物種的TCP氨基酸進(jìn)行同源性比較并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖5)表明,GaTCP14和GhTCP14聚集在同一分支上,表明在生物進(jìn)化過(guò)程中,GbTCP14基因與木本棉的同類基因親緣關(guān)系較近。

        2.3 GbTCP14轉(zhuǎn)錄激活活性分析

        將pGBKT7-GbTCP14 和pGBKT7轉(zhuǎn)化酵母菌株AH109后,涂布單缺SD/-Trp 營(yíng)養(yǎng)型缺陷培養(yǎng)基,以pGBKT7-GbTCP5作為陽(yáng)性對(duì)照,pGBKT7作為陰性對(duì)照,觀察酵母菌落的生長(zhǎng)情況。圖6顯示,轉(zhuǎn)化pGBKT7-GbTCP5、GbTCP14-pGBKT7 和pGBKT7的酵母菌落都能正常生長(zhǎng),說(shuō)明上述3個(gè)質(zhì)粒均已轉(zhuǎn)化到酵母中。而在含有X-gal的三缺SD/-Trp/-His/-Ade 營(yíng)養(yǎng)型缺陷培養(yǎng)基上,轉(zhuǎn)化GbTCP14-pGBKT7的酵母菌落和陰性對(duì)照pGBKT7的酵母菌落均不能正常生長(zhǎng),陽(yáng)性對(duì)照酵母正常生長(zhǎng),菌落呈現(xiàn)藍(lán)色。說(shuō)明GbTCP14轉(zhuǎn)錄因子不具有轉(zhuǎn)錄激活活性,推測(cè)GbTCP14可能是一個(gè)轉(zhuǎn)錄抑制子。

        2.4 GbTCP14表達(dá)模式分析

        為了進(jìn)一步分析GbTCP14基因在棉花不同纖維時(shí)期的表達(dá)模式,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法分析GbTCP14基因表達(dá)情況。由圖7,A可知,GbTCP14基因在開(kāi)花后棉纖維發(fā)育中均有表達(dá)。其中第15天時(shí)相對(duì)表達(dá)量達(dá)到最高,其次相對(duì)表達(dá)量由高到低分別為第10、5、20天以及開(kāi)花當(dāng)天,而在開(kāi)花后第25天后相對(duì)表達(dá)量較低。圖7,B顯示,GbTCP14基因在棉花組織中均具有表達(dá)量,但不同棉花組織間相對(duì)表達(dá)量差異明顯,在花瓣和花萼中相對(duì)表達(dá)量比其他組織高,其次相對(duì)表達(dá)量高低分別為莖、主根、須根、下胚軸、花托和葉。其中在花瓣中表達(dá)量最高,葉中表達(dá)量最低。一般認(rèn)為棉花開(kāi)花后大約第5~20天為棉纖維伸長(zhǎng)分化的關(guān)鍵時(shí)期,在棉纖維代謝最旺盛時(shí)期GbTCP14基因較高表達(dá),暗示該基因可能參與調(diào)控控制棉纖維生長(zhǎng)發(fā)育的重要階段。在棉花的花器官中高表達(dá),可能參與花的生長(zhǎng)分化過(guò)程。

        圖5 GbTCP14蛋白與其他植物相關(guān)蛋白序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.5 Phylogenetic analysis of GbTCP14 protein with other related proteins in different plants

        圖6 GbTCP14轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄激活實(shí)驗(yàn)Fig.6 Transcriptional activation ability assay of the GbTCP14 transcription factor

        3 討 論

        棉花纖維是棉花種子的種皮毛,是由胚珠外珠被上的表皮細(xì)胞發(fā)育而成的單細(xì)胞毛狀體。生長(zhǎng)發(fā)育和持續(xù)的時(shí)間受棉花的基因型和環(huán)境控制而呈現(xiàn)不一致。自1992年第一個(gè)纖維特異表達(dá)基因E6基因克隆以來(lái),至今已經(jīng)獲得了大批棉花纖維發(fā)育相關(guān)的基因和表達(dá)序列標(biāo)簽[15]。然而這些基因在棉纖維中的功能還有待于進(jìn)一步研究,絕大部分基因在纖維細(xì)胞中所起的功能尚不明確,至今纖維細(xì)胞的發(fā)育科學(xué)界仍然沒(méi)有很好地揭示控制棉纖維細(xì)胞伸長(zhǎng)的真正機(jī)制。

        圖7 GbTCP14基因在不同時(shí)期棉纖維和不同組織中的相對(duì)表達(dá)量Fig.7 The relative expression of GbTCP14 genes in different periods of cotton fiber and different tissues

        棉花纖維細(xì)胞的分化與發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜有序的過(guò)程,分化發(fā)育過(guò)程分為4個(gè)階段,即纖維原細(xì)胞分化突起、纖維伸長(zhǎng)、次生壁增厚和脫水成熟,各個(gè)時(shí)期具有不同特點(diǎn)但又相互重疊[16]。從轉(zhuǎn)錄水平分析,TCP家族轉(zhuǎn)錄因子在棉花中表達(dá)模式不同。葛宗鶴研究組從海島棉纖維的cDNA文庫(kù)中分離出編碼344個(gè)氨基酸的I類TCP轉(zhuǎn)錄因子(指定為GbTCP),GbTCP優(yōu)勢(shì)在開(kāi)花后5~15 d在延長(zhǎng)的棉纖維中表達(dá)[17]。海島棉GbTCP15基因在棉花的莖部和第15天纖維中表達(dá)量較高[18]。GhTCP14主要在棉纖維細(xì)胞中表達(dá),特別是在纖維細(xì)胞的起始和延長(zhǎng)期[19]。GbTCP14基因在棉花發(fā)育過(guò)程中表達(dá)模式與現(xiàn)有研究比較具有異同點(diǎn),在棉纖維發(fā)育中表達(dá)時(shí)間更長(zhǎng),組織中表達(dá)部位更多。棉纖維發(fā)育前三階段作為生長(zhǎng)分化的關(guān)鍵時(shí)期,發(fā)育的狀況直接關(guān)系到棉纖維成熟后,棉纖維的產(chǎn)量與品質(zhì),暗示可能在棉纖維生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起到一定的作用。TCP基因中CYC類主要控制花的對(duì)稱性,與花青素的合成有關(guān),屬于TCP家族轉(zhuǎn)錄因子中ClassⅡ類。GbTCP14基因在棉花的花器官中具有顯著的相對(duì)表達(dá)量。已有研究證明TCP基因之間具有相互催化或抑制的作用,在參與花的發(fā)育中,該基因是直接調(diào)控下游基因轉(zhuǎn)錄還是與其他蛋白互作間接參與代謝活動(dòng),有待于進(jìn)一步研究蛋白的生物學(xué)性質(zhì),初步推測(cè)可能參與棉花花的分化與形成。

        基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是復(fù)雜的過(guò)程,轉(zhuǎn)錄因子作為植物中重要的調(diào)控因子,以不同方式參與調(diào)控植物表皮毛、根毛和生殖器官的發(fā)育以及光形態(tài)建成,調(diào)節(jié)次生代謝物等。本研究從‘新海21號(hào)’克隆出的TCP家族轉(zhuǎn)錄因子基因即GbTCP14,屬于TCP轉(zhuǎn)錄因子家族的ClassⅠ類。一般認(rèn)為該類具有促進(jìn)植物的生長(zhǎng)和分芽生殖。在最早發(fā)現(xiàn)的4個(gè)基因中,水稻PCF1和PCF2基因?qū)儆贑lassⅠ類能夠促進(jìn)分生組織中PCNA基因的啟動(dòng)子組織特異性表達(dá),主要使細(xì)胞核蛋白基因的啟動(dòng)子在G1期到S期被激活[20]。在擬南芥中,AtTCP14基因能促進(jìn)細(xì)胞分裂素誘導(dǎo)的有絲分裂因子CyclinB1的轉(zhuǎn)錄活性,調(diào)節(jié)擬南芥花和葉對(duì)細(xì)胞分裂素的敏感程度[21]。在棉花中,夏桂先研究組從陸地棉中克隆了1個(gè)GhTCP14轉(zhuǎn)錄因子,在纖維早期發(fā)育階段生長(zhǎng)素上調(diào)GhTCP14的表達(dá),在擬南芥中異源表達(dá)GhTCP14影響擬南芥生長(zhǎng)素水平和分配,從而影響根和表皮的細(xì)胞的起始和伸長(zhǎng)[19]。關(guān)于GbTCP14基因編碼的蛋白生物學(xué)功能。酵母系統(tǒng)轉(zhuǎn)錄激活分析表明,該基因不具有自身轉(zhuǎn)錄激活活性,推測(cè)可能是一個(gè)轉(zhuǎn)錄抑制子或與其他蛋白互作時(shí)才具有轉(zhuǎn)錄激活活性。GbTCP14是否與同類家族基因具有類似或新功能還有待于進(jìn)一步探究。

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