李抒昊,關(guān)海鷗,于 崧,馬曉丹,李偉凱,鄭雯璐
(黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) a.信息技術(shù)學(xué)院;b.農(nóng)學(xué)院,黑龍江 大慶 163319)
早在20世紀70年代,隨著計算機軟硬件及性能的不斷提升,虛擬現(xiàn)實技術(shù)得以實現(xiàn),從而建立了虛擬植物模型,在計算機上展現(xiàn)植物生長發(fā)育過程的三維立體圖像初步進入大眾的視野[1]。如今,隨著現(xiàn)代信息技術(shù)的不斷研究及發(fā)展,信息技術(shù)與農(nóng)業(yè)相結(jié)合成為了國內(nèi)外未來研究農(nóng)業(yè)方向的重要組成部分之一[2]。農(nóng)業(yè)加以信息技術(shù)結(jié)合分析產(chǎn)生了諸多科研成果,依托信息技術(shù)對植物進行三維可視化研究成為國內(nèi)外研究農(nóng)業(yè)信息化的熱點[3]。
玉米作為世界范圍內(nèi)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)種植的重要谷類作物之一,有極高的營養(yǎng)價值、食療價值、工業(yè)價值及藥用價值等等。然而,在生長發(fā)育過程中會受到環(huán)境因素、傳因子和噪聲變量等影響[1,3],從而影響長勢,因此對玉米三維重建至關(guān)重要。在國內(nèi),郭焱最早對虛擬植物進行研究[4],應(yīng)用了三位數(shù)字化儀,對玉米不同生產(chǎn)期的冠層形態(tài)結(jié)構(gòu)進行了精準的測量,并建立了玉米的虛擬結(jié)構(gòu)。李輝、王傳宇等人[5]采用平面模板法、基于雙目立體視系統(tǒng)立體拼接重建出的部分葉片三維曲面,并獲得葉片參數(shù)。楊亮等人[6]等基于立體視覺通過對玉米葉片邊緣恢復(fù)進行三維重建。牛曉靜[7]開發(fā)了點云精簡、去噪平滑和重構(gòu)系統(tǒng)。對玉米的三維點云數(shù)據(jù)進行精簡,然后采用分步處理策略對點云模型進行去噪和平滑,最后使用Delaunay三角剖分方法對三維點云數(shù)據(jù)進行三維重構(gòu)。傳統(tǒng)方法對玉米進行的三維重建大多都是研究玉米的根莖及葉片,很好地反映了玉米部分器官的生理構(gòu)造特征,但對整株玉米鮮有報道且應(yīng)用范圍比較窄。本文應(yīng)用FastSCAN三維掃描儀對玉米整株在三葉期至撥節(jié)期進行三維重構(gòu),在靜態(tài)虛擬玉米的基礎(chǔ)上動態(tài)重建玉米,能夠精準地構(gòu)造玉米的三維形態(tài),反映玉米整株的中前期的生長規(guī)律,為預(yù)測玉米未來的生長發(fā)育提供了良好的基礎(chǔ)。
1.1田間實驗
田間實驗于2016年6-8月在黑龍江省大慶市薩爾圖區(qū)黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)大田進行。該實驗田屬北溫帶大陸性季風(fēng)氣候區(qū),生長期降水量在350~480mm之間。育苗的健壯與籽粒的大小與播種深淺有極大的關(guān)系。實驗地墑情較好,土壤濕度、松粘適中,在距地面深度5cm處種植5株玉米,每株間距為0.5m。對玉米定期進行人工除草及水肥處理,確保實驗無人為干擾與強風(fēng)影響玉米冠層結(jié)構(gòu)[8]。供試儀器采用美國pollemus公司生產(chǎn)的FastSCAN三維掃描儀。玉米在生長中主要經(jīng)歷以下4個時期:①出苗期;②三葉期至撥節(jié)期;③穗期;④開粒期[9]。實驗起始日期于2016年6月1日。本實驗選擇第2時期對玉米進行動態(tài)三維重構(gòu)。
1.2玉米整株三維重構(gòu)與數(shù)據(jù)獲取
在玉米整株三維重建與數(shù)據(jù)獲取中采用的實驗儀器為FastSCAN三維掃描儀,其特點是準確、快捷、方便[10],能夠清晰地捕捉到玉米葉片的細節(jié)特點,并呈現(xiàn)出三維立體模型結(jié)構(gòu)。然而,其最大掃描距離為750mm,隨著玉米整株長度超出最大掃描距離,超出部分捕捉不到。因此,本實驗選擇重點掃描記錄時期為玉米整株的出苗期、三葉期至拔苗期。種植5組實驗組,從出苗期起每隔約7天長出1片葉片,掃描1次,直至拔苗期部分玉米葉片邊緣三維無法重構(gòu),完成動態(tài)虛擬。通過FastSCAN自帶修復(fù)功能重建的整株玉米如圖1所示。
圖1 三維掃描儀重構(gòu)不同時期整株玉米
在用FastSCAN三維掃描儀重構(gòu)玉米整株三維模型需注意電磁參照體(Transmitter)與掃面對象處于相對靜止?fàn)顟B(tài),且掃描過程中物體不能發(fā)生任何偏移。為了提高掃描質(zhì)量,在掃描過程中將手持設(shè)備(Wand)與被掃描對象保持垂直,且最佳距離為10~15cm,小于8cm或大于22cm則會影響數(shù)據(jù)的精度。通常情況下,FastSCAN三維掃描儀正常工作時的數(shù)據(jù)捕獲精度是0.5mm,隨著手柄滑過物體表面的速度不同精度也發(fā)生變化[11]?;瑒拥乃俣扰c精度成反比,因此勻速緩慢掃描整株玉米。最后,掃描植株的準確性受外界環(huán)境的影響,如有外界有磁場及光照過強,會干擾掃描,因此要避免在金屬物體附近及強光照射下采集三維模型。FastSCAN三維掃描儀可調(diào)節(jié)自身靈敏度,因此根據(jù)環(huán)境中光線的強弱選擇激光的強度。本實驗將靈敏度調(diào)制5重構(gòu)玉米整株三維模型。
2.1玉米特征模型建立
為獲取玉米整株株高、株寬、莖粗等特征參數(shù),實驗通過Geomagic Spark建立玉米整株特征模型,如圖4所示。以y坐標為軸,選取不同時期玉米整株最高點為定點,擬合球與地面相切,獲取擬合球半徑距離為玉米高度特征參數(shù)。以x坐標與y坐標建立的平面,選取玉米在該平面最大距離的兩點,獲取擬合球半徑距離為玉米的寬度特征參數(shù)。以玉米莖部一端為軸向玉米莖部另一端擬合圓柱,分別擬合玉米莖的上部、中部、基部,擬合圓柱半徑距離為玉米的莖粗特征參數(shù)。
圖 2 玉米整株高度寬度測量方法
2.2玉米特征模型建立
為計算擬合球與擬合圓柱的半徑,進而獲取玉米目標特征參數(shù),本文采用最小二乘方法[12]對玉米的株高、株寬、株莖的幾何特征做出計算。
擬合球面任意點Pi到球心的距離函數(shù)為
d(s,Pi)=‖c-Pi‖
(1)
其中,c=(s1,s2,s3)T表示球心坐標。
根據(jù)上述特征計算方法,計算球表面任意點到球心距離即為擬合球半徑,獲取玉米在三葉期至撥節(jié)期高度寬度的特征參數(shù),如表1所示。
表1玉米整株三葉期至撥節(jié)期高度寬度平均值
Table 1Whole plant corn trilobites period to dial the feast average height width
玉米整株時期平均高度/m平均寬度/m三葉期0.07000.0936四葉期0.12210.1690五葉期0.18360.2492六葉期0.24650.3379七葉期0.30280.3926八葉期0.47240.5711最終期0.71640.6033
最后一次掃描時期稱最終期。
可見,玉米在三葉期至撥節(jié)期平均株高比平均株寬漲幅較高,且平均株高范圍0.070 0~0.716 4m,平均株寬范圍0.093 6~0.603 3m。
擬合圓柱體上表面任意一點Pi到圓心的距離方程為
(2)
其中,q0=(s1,s2,s3)T表示圓心坐標;a0=(s1,s2,s3)為圓柱面軸線的單位方向向量。
根據(jù)上述特征計算方法,計算擬合圓柱體上表面任意點到圓心的距離,即為玉米莖粗。獲取玉米在三葉期至撥節(jié)期莖粗的特征參數(shù),如表2所示。
表2玉米整株三葉期至撥節(jié)期高度莖粗平均值
Table 2Whole plant corn trilobites period to dial the feast average height stem diameter
玉米整株時期莖粗/cm上部中部基部三葉期0.30270.39470.4392四葉期0.66100.70440.8512五葉期0.76350.84691.0544六葉期0.80890.89881.1993七葉期1.02921.12791.2281
續(xù)表2
最后一次掃描時期稱最終期。
由表2可見:玉米在三葉期至撥節(jié)期平均莖粗基處漲幅最高,中部其次,上部最低;平均株高范圍0.070 0~0.716 4m,平均株寬范圍0.093 6~0.603 3m,平均莖粗范圍0.302 7~2.441 3cm。
2.3直接測量和掃描測量精度比較
圖3為玉米整株的直接測量和間接測量回歸分析。結(jié)果顯示:實測數(shù)據(jù)和3D掃描測量的平均高度(R2=0.96,P<0.01)、平均寬度(R2=0.97,P<0.01)和平均莖粗(R2=0.96,P<0.01)呈現(xiàn)良好的直線回歸關(guān)系;株高、株寬和莖粗實測數(shù)據(jù)和掃描測量數(shù)據(jù)的直線斜率分別為0.962 4、0.978 6和0.965 9,接近于1,截距分別為0.018 1、0.151 8和0.109 5,接近于0,是一條近似通過原點的直線。精度分析結(jié)果表明,三維掃描測量值與實測值擬合度很高。
圖3 玉米整株的直接測量和三維測量回歸分析
FastSCAN三維掃描儀能夠快速、準確、方便地掃描整株玉米,無論是室內(nèi)或是室外都有很強的適用性,對于復(fù)雜植株的葉片紋理及其果實等三維重構(gòu)的獲取應(yīng)用價值極大。在應(yīng)用FastSCAN三維掃描儀掃描時也發(fā)現(xiàn)一些問題。FastSCAN三維掃描儀獲取植株時對植株有一定的條件限制,應(yīng)選擇葉片與葉片之間無遮擋且各器官之間結(jié)構(gòu)較為明顯的植株進行三維重構(gòu),以避免由于植物自身器官或群體植物之間相互遮擋,從而影響手柄發(fā)出的激光掃面。其次,由于植株反射激光有限,光照過強或植物自身顏色干擾,可能會造成掃描有缺陷或落點,因此可以將泥土與水混合噴灑植株表面,人為進行處理,以便植物的三維重建。本文重構(gòu)了在三葉期至撥節(jié)期玉米整株的動態(tài)三維模型,無需破壞實驗對象,保護了玉米生長的連續(xù)性,并通過擬合曲面的方法計算了玉米的高度、寬度、莖粗等特征參數(shù),為測量玉米其他特征參數(shù)及預(yù)測玉米未來長勢提供了新思路。
參考文獻:
[1]夏寧,李愛雙,蘇柱華,等.虛擬植物生長技術(shù)及其農(nóng)業(yè)應(yīng)用[J].廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2009(9):218-223.
[2]文丹楓.現(xiàn)代信息技術(shù)推進我國農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究[D].武漢:華中師范大學(xué),2015.
[3]李輝. 基于虛擬雙目視覺的玉米葉片三維重建方法[J]. 科技通報,2016(5):96-101.
[4]Guo Y,Li B G. New advances in virtual plant research [J].Chiesnese Science Bulletin,2001,46(11):888-894.
[5]王傳宇,郭新宇,吳升,等. 基于計算機視覺的玉米果穗三維重建方法[J]. 農(nóng)業(yè)機械學(xué)報,2014 (9):274-279.
[6]楊亮,郭新宇,趙春江,等. 基于立體視覺的玉米葉片形態(tài)測量與三維重建[J]. 計算機應(yīng)用,2008(10):2661-2663.
[7]牛曉靜.玉米植株三維點云處理及重構(gòu)方法研究[D].楊凌:西北農(nóng)林科技大學(xué),2016.
[8]程錦,勞彩蓮. 基于分段曲率的玉米植株三維結(jié)構(gòu)的重建[J]. 中國農(nóng)學(xué)通報,2009(24):538-543.
[9]熱孜亞·木太力甫. 兩種玉米各生長期不同部位營養(yǎng)成分分配規(guī)律及優(yōu)質(zhì)飼料調(diào)制方法研究[D].烏魯木齊:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué),2013.
[10]魏學(xué)禮,肖伯祥,郭新宇,等.三維激光掃描技術(shù)在植物掃描中的應(yīng)用分析[J].中國農(nóng)學(xué)通報,2010(20):373-377.
[11]王劍,周國民.利用激光掃描儀獲取植物三維模型的方法[J]. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2008(1):104-106.
[12]劉元朋,趙輝,陳良驥,等. 基于有向點云數(shù)據(jù)的二次曲面擬合算法[J].機床與液壓,2008(8):27-29.
[13]王傳宇,趙明,閻建河,等. 基于雙目立體視覺技術(shù)的玉米葉片三維重建[J]. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報,2010(4):198-202.