段國(guó)珍,白玉娥,伊如漢,白淑蘭
(內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 林學(xué)院,呼和浩特 010019)
云杉屬(PiceaDietr)植物是北方針葉林和亞高山針葉林的重要組成部分,分布范圍極廣,生長(zhǎng)環(huán)境差異較大[1],全球約40種[2],但被定名的云杉屬物種僅有34種[3]。沙地云杉(Piceamongolica(H. Q. Wu)W. D. Xu.)分布于中國(guó)內(nèi)蒙古渾善達(dá)克沙地東緣,形成中國(guó)罕見而壯觀的沙地針葉樹森林草原景觀,它對(duì)中國(guó)北方土地荒漠化防治,保護(hù)京津冀地區(qū)的周邊生態(tài)環(huán)境,具有十分重要的意義[4]。但沙地云杉種的確定是植物分類學(xué)界一直爭(zhēng)論不休的問題。中國(guó)著名植物分類學(xué)家鄭萬鈞在《中國(guó)植物志》[2]和《中國(guó)樹木志》[5]等著作中,談到能適應(yīng)沙地生長(zhǎng)的云杉在中國(guó)只有紅皮云杉(PiceakoraiensisNakai),認(rèn)為白音敖包云杉林就是紅皮云杉林。1983年徐文鐸等[6]通過形態(tài)學(xué)鑒定、植物地理分布及水熱條件等分析,認(rèn)為該云杉是白杄(PiceameyeriRehd. et Wils.)。1986年烏弘奇[7]在徐文鐸研究的基礎(chǔ)上進(jìn)行鑒定,認(rèn)為此種云杉是白杄的地方種,即蒙古云杉(PiceameyeriRehd.et Wils. var.mongolicaH. Q. Wu)。隨著研究的深入,1994年徐文鐸等[8]通過對(duì)該云杉、紅皮云杉和白杄的形態(tài)解剖的比較、同工酶測(cè)定、染色體核型分析、栽培試驗(yàn)觀察及種群生態(tài)地理分析等研究認(rèn)為此種云杉是一新種,并在1998年召開了沙地云杉新種鑒定會(huì),定名為沙地云杉。但它的定名并未得到學(xué)術(shù)界的普遍接受[9-10],爭(zhēng)議還在繼續(xù)。
基因組原位雜交(Genomic In Situ Hybridization,GISH)是20世紀(jì)80年代末,由熒光原位雜交(Fluorescence In Situ Hybridization,F(xiàn)ISH)改良而來的一種重要技術(shù)[11],隨著該技術(shù)的不斷改進(jìn)、拓展和完善,在植物基因組研究領(lǐng)域中發(fā)揮著愈來愈重要的作用[12-14]。GISH不僅能鑒定出遠(yuǎn)緣雜種中染色體的來源、重組以及外源滲入染色體片段的大小和位置,同時(shí)在不同物種之間的親緣關(guān)系比較、物種的起源與進(jìn)化中也被廣泛應(yīng)用[15],如Schwarzacher等[16]首次從Secaleafricanum×Hordeumchilense基因組中成功區(qū)分兩親本的染色體。沙地云杉的歸屬問題雖然有過諸多探討,但卻沒有從基因組水平上分析沙地云杉與其近緣種的關(guān)系,而且也沒有研究關(guān)注沙地云杉是否可能為爭(zhēng)議最大的白杄和紅皮云杉的雜交種。因此,本試驗(yàn)應(yīng)用GISH技術(shù)對(duì)白杄與沙地云杉、紅皮云杉與沙地云杉進(jìn)行基因組原位雜交分析,排除或確定沙地云杉是否為雜交種,同時(shí)確定3種云杉在基因組水平上的親緣關(guān)系,為沙地云杉種的確定、種質(zhì)資源的保護(hù)和合理利用提供研究基礎(chǔ),同時(shí)也為裸子植物分子細(xì)胞遺傳學(xué)方面的研究提供研究方法和理論依據(jù)。
本試驗(yàn)中沙地云杉種子采自于分布最為集中的白音敖包自然保護(hù)區(qū);白杄采自于主要分布區(qū)的山西龐泉溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū);紅皮云杉采于吉林省延吉市林業(yè)局帽兒山林場(chǎng),是紅皮云杉集中分布區(qū)之一。
1.2.1染色體標(biāo)本制備將沙地云杉種子經(jīng)過消毒處理置于23 ℃培養(yǎng)箱中萌發(fā),根長(zhǎng)達(dá)到1~1.5 cm時(shí),切取根尖進(jìn)行染色體制片,具體參照陳瑞陽等[17]的方法,略作修改。具體如下:0.1%秋水仙素+1% DMSO混合液黑暗預(yù)處理6.5 h,無水乙醇∶冰乙酸=3∶1固定24 h,2%纖維素酶+1%果膠酶37 ℃解離70 min,采用壓片法制片,在壓好的制片上滴加適量Giemsa Stain室溫下襯染3~5 min,蒸餾水洗去染色液,自然晾干后保存?zhèn)溆?,選擇30個(gè)完整染色體標(biāo)本備用。
1.2.2探針DNA及封阻DNA的制備采用改良的CTAB法[18]提取云杉基因組DNA,將白杄基因組DNA和紅皮云杉基因組DNA利用高壓滅菌剪切法剪切成合適片段(200~500 bp),用1%瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,用Dig-High Prime DNA Labeling and Detection starter Kit I標(biāo)記基因組DNA,點(diǎn)印跡法檢測(cè)標(biāo)記效果。封阻DNA片段獲取方法同上。
1.2.3基因組原位雜交基因組原位雜交過程參照鄧輝勝[19]的方法并加以修改。1)變性。在制備好的染色體標(biāo)本充分干燥后,滴100 μg/mL Rnase A 37 ℃條件下孵育40~60 min,2×SSC輕洗3次×5 min,0.1%胃蛋白酶37 ℃孵育1 h,1×PBS輕洗3次×5 min,4%多聚甲醛37 ℃固定10 min,2×SSC沖洗3次×5 min,70%去離子甲酰胺80 ℃變性2 min,75%、95%和100%乙醇逐級(jí)脫水,每級(jí)脫水5 min,晾干,鏡檢。2)基因組原位雜交。將40 μL雜交液(表1)滴在染色體標(biāo)本上,80 ℃共變性10 min,37 ℃雜交過夜。3) 洗脫與雜交信號(hào)檢測(cè)。2×SSC漂去雜交制片的蓋玻片,2×SSC(含有0.1% SDS)和0.2×SSC(含有0.1% SDS)37 ℃下各洗3次×5 min,2×SSC室溫洗滌2次,洗脫和雜交嚴(yán)謹(jǐn)度約為80%。加40~50 μL 5% BSA,37 ℃下封阻1 h,加40 μL Anti-DIG-Rhodamine,37 ℃溫育1 h,1×PBS 37 ℃洗滌3次×5 min,30~40 μL熒光染色劑DAPI染色5 min,襯染后1×PBS沖洗3次×3 min,加少量抗熒光衰減劑封片。
表1 雜交混合液配制標(biāo)準(zhǔn)
注:雜交溶液配好后在渦旋混合器上完全混勻,97 ℃條件下變性10 min后迅速轉(zhuǎn)到0 ℃中冷卻10 min
Note: The hybrid solution was mixed well on the vortex mixer and denatured 10 min at 97 ℃, and transferred to 0 ℃ quickly for cooling 10 min
采用熒光顯微鏡 (LeicaMC170HD) 觀察雜交信號(hào)強(qiáng)度,獲得原位雜交圖象,采用Spot和Photoshop軟件進(jìn)行圖像處理。
選擇染色體標(biāo)本中分散度適中、長(zhǎng)度收縮理想的中期分裂相在顯微鏡下進(jìn)行觀察、測(cè)量分析,共統(tǒng)計(jì)110個(gè)分裂相。紅皮云杉、白杄、沙地云杉Giemsa Stain染色后的中期分裂相觀察結(jié)果如圖1。
3種云杉的核型測(cè)量結(jié)果及核型模式圖分別見表2和圖2,它們的染色體數(shù)目均為2n=24,沒有發(fā)現(xiàn)多倍體及變異的現(xiàn)象。3種云杉染色體中,紅皮云杉7、8號(hào)染色體分別有1個(gè)隨體,白杄2、4、5號(hào)染色體各有1個(gè)隨體,而沙地云杉在3、4、5號(hào)染色體各有1個(gè)隨體,與白杄的染色體形狀較為相似。3種云杉大部分為亞中部著絲粒染色體,染色體核型類型1A型,是最對(duì)稱的染色體核型。白杄和紅皮云杉的染色體核型不對(duì)稱系數(shù)相近,而兩者與沙地云杉的差別較大,這說明白杄與紅皮云杉的進(jìn)化水平比沙地云杉更原始。3種云杉中,白杄與沙地云杉的核型公式相同,說明白杄與沙地云杉的親緣關(guān)系比紅皮云杉與沙地云杉更為接近。
物種Species核型公式Karyotypeformula相對(duì)長(zhǎng)度Relativelength/%臂比Armratio核型不對(duì)稱系數(shù)As.k/%類型Type紅皮云杉P.koraiensis2n=24=20m(4sat)+4sm6.33~11.061.09~1.8757.641A白杄P.meyeri2n=24=22m(6sat)+2sm5.67~10.851.05~1.9357.781A沙地云杉P.mongolica2n=24=22m(6sat)+2sm5.97~10.771.14~1.9758.751A
A.紅皮云杉;B.白杄;C.沙地云杉圖2 3種云杉染色體核型模式圖A. P. koraiensis; B. P. meyeri; C. P. mongolicaFig.2 Karyotype patterns of three Picea species
以白杄基因組DNA為探針,以紅皮云杉基因組DNA為封阻,對(duì)沙地云杉染色體進(jìn)行基因組原位雜交,雜交結(jié)果和信號(hào)如圖3,A1、A2。白杄基因組DNA在沙地云杉14條染色體上顯示有明顯的雜交信號(hào),其中1、2條染色體雜交信號(hào)位于著絲粒區(qū);3、4、13、14條染色體信號(hào)位點(diǎn)位于染色體長(zhǎng)、短臂或覆蓋著絲粒區(qū);7和8條染色體雜交信號(hào)位于染色體著絲粒區(qū)至次縊痕處;9、10條染色體雜交信號(hào)位于染色體短臂及至次縊痕處;5、6條染色體的著絲粒至次縊痕處顯示雜交信號(hào);19、20條染色體雜交信號(hào)位于著絲粒區(qū)及長(zhǎng)臂。雜交信號(hào)主要分布于染色體短臂、著絲粒區(qū)和次縊痕處,雜交信號(hào)強(qiáng)度均較強(qiáng),說明白杄與沙地云杉的同源性較高。
以紅皮云杉基因組DNA為探針,以白杄基因組DNA為封阻,與沙地云杉染色體進(jìn)行原位雜交,雜交結(jié)果和信號(hào)如圖3,B1、B2。紅皮云杉基因組DNA在沙地云杉的12條染色體上顯示有明顯的雜交信號(hào),其中3、4條染色體雜交信號(hào)位于染色體長(zhǎng)臂及著絲粒,7、8條染色體雜交信號(hào)位于著絲粒區(qū)至次縊痕處,11、12條染色體短臂及著絲粒有雜交信號(hào),13、14條染色體上的長(zhǎng)臂上顯示有雜交信號(hào),15、16條染色體長(zhǎng)臂和著絲粒區(qū)有雜交信號(hào),23、24條染色體的雜交信號(hào)位于長(zhǎng)臂和近端部,信號(hào)強(qiáng)度較強(qiáng)。所有雜交信號(hào)有強(qiáng)有弱,信號(hào)分布范圍較少,說明紅皮云杉和沙地云杉的同源性相比白杄較低。
圖3 白杄(A1、A2)和紅皮云杉(B1、B2)基因組DNA與沙地云杉染色體的GISH和核型分析Fig.3 GISH of genomic DNA probes of P. meyeri (A1, A2)and P. koraiensis (B1, B2) on metaphase chromosomes of P. mongolica
植物核型分析是現(xiàn)代植物分類和遺傳研究的重要手段之一[20]。根據(jù)李懋學(xué)[21]有關(guān)植物核型分析的研究發(fā)現(xiàn),沙地云杉、紅皮云杉、白杄的染色體數(shù)目均為24,屬于二倍體(2n=24),未發(fā)現(xiàn)染色體非整倍和多倍體現(xiàn)象,說明3種云杉的遺傳相對(duì)穩(wěn)定,這與其他學(xué)者對(duì)云杉屬植物研究結(jié)果一致[22-24]。本研究結(jié)果中3種云杉染色體核型均為1A,其中沙地云杉核型分析與徐文鐸等[25]、白玉娥等[26]的研究結(jié)果一致,白杄和紅皮云杉核型與劉玉紅[27]、李林初[28]的研究結(jié)果略有差異,這可能與試驗(yàn)材料來源有關(guān)。染色體核型不對(duì)稱系數(shù)(As.k%)越接近50%,表明著絲粒越接近中點(diǎn),染色體越對(duì)稱[29],著名植物遺傳與進(jìn)化學(xué)家Stebbins提出自然界系統(tǒng)演化過程中,較對(duì)稱的核型一般處于較古老或原始地位的植物中,而不對(duì)稱的核型則出現(xiàn)在較進(jìn)化或特化的植物中[30],本研究中白杄和紅皮云杉的As.k% 相近,并且小于沙地云杉的As.k%,可以判斷白杄和紅皮云杉相對(duì)于沙地云杉更原始,這與王米力[31]的研究結(jié)果相似。
根據(jù)雜交信號(hào)的強(qiáng)弱和多少可推測(cè)基因組間的相似程度,物種間的親緣關(guān)系越近,其基因組間相似性越高,“雜交”位點(diǎn)出現(xiàn)越多,“雜交”位點(diǎn)信號(hào)表現(xiàn)越強(qiáng)[32]。本試驗(yàn)使用白杄和紅皮云杉基因組DNA分別與沙地云杉染色體進(jìn)行基因組原位雜交,結(jié)果顯示沙地云杉部分染色體上均有明顯的雜交信號(hào)出現(xiàn),但雜交信號(hào)的強(qiáng)弱和分布范圍有顯著的區(qū)別。白杄基因組DNA在沙地云杉14條染色體雜交信號(hào)較強(qiáng),主要分布在著絲粒區(qū)、染色體短臂及次縊痕處,其中著絲粒區(qū)與染色體短臂信號(hào)最強(qiáng),而紅皮云杉在沙地云杉12條染色體上顯示較強(qiáng)信號(hào),主要分布在著絲粒、染色體長(zhǎng)臂及次縊痕處,其中染色體長(zhǎng)臂的信號(hào)最強(qiáng)。同時(shí),白杄基因組DNA與沙地云杉染色體雜交的每一條染色體所產(chǎn)生的信號(hào)分布范圍比紅皮云杉基因組DNA與沙地云杉染色體雜交時(shí)分布更廣,且明顯雜交信號(hào)位于部分同源染色體的對(duì)數(shù)較多,強(qiáng)度較強(qiáng),說明這2個(gè)物種都與沙地云杉有著較近的親緣關(guān)系,且白杄更近,這與形態(tài)學(xué)、分子標(biāo)記的研究結(jié)果一致[33-36]。關(guān)于沙地云杉是否為白杄和紅皮云杉的種間雜交種,本研究通過基因組原位雜交發(fā)現(xiàn)白杄基因組DNA或紅皮云杉基因組DNA與沙地云杉的雜交信號(hào)均分布于部分染色體的部分區(qū)域,與GISH鑒定雜交種所得試驗(yàn)結(jié)果有所不同,如Schwarzacher等對(duì)Secaleafricanum×Hordeumchilense基因組組成進(jìn)行鑒定,能清晰地將來自兩親本的染色體用不同顏色區(qū)分,同樣的結(jié)果還出現(xiàn)在小麥[37]、水稻[38]、枳橙[39]、沙田柚宜昌橙雜種[40]中,因此,推斷沙地云杉不是白杄和紅皮云杉的雜交種,部分染色體出現(xiàn)的雜交信號(hào)僅能說明白杄和紅皮云杉與沙地云杉之間均存在著較高的同源性,與寧順斌等[41]、Cao等[42]采用GISH對(duì)不同種與其近緣種分析結(jié)果趨同。
沙地云杉及其近緣種的基因組原位雜交分析,為沙地云杉的分類地位的確定又提供了一個(gè)強(qiáng)有力的證據(jù),至于沙地云杉是否為白杄的變種或是一個(gè)獨(dú)立的并且有特異生態(tài)位的進(jìn)化譜系或物種,研究團(tuán)隊(duì)將會(huì)結(jié)合遺傳機(jī)制、生理生態(tài)與基因組原位雜交進(jìn)一步研究確定。
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