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        草莓根腐病的病原菌分離鑒定及拮抗菌CM3的抑制作用研究

        2018-03-14 02:08:24陳哲黃靜趙佳郝耀山梁宏
        生物技術(shù)通報(bào) 2018年2期
        關(guān)鍵詞:根腐病鐮刀根部

        陳哲 黃靜 趙佳 郝耀山 梁宏

        (山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心,太原 030031)

        草莓是全世界范圍內(nèi)種植的最重要的水果作物之一。近年來,我國的草莓產(chǎn)業(yè)發(fā)展十分迅速,隨之而來的就是草莓病害,尤其是連續(xù)種植所帶來的土傳病害,對草莓產(chǎn)量影響大,嚴(yán)重時幾乎絕產(chǎn)[1]。草莓根腐病是一類土傳根部病害的統(tǒng)稱,可以導(dǎo)致嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。從草莓根腐病的患病根部可以分離出多達(dá)20個屬的真菌,包括鐮刀菌屬(Fusariumsp.)、 炭 疽 菌 屬(Colletotrichumsp.)、 絲 核 菌 屬(Rhizoctoniasp.)、疫霉菌屬(Phytophthorasp.)和擬盤多毛孢菌屬(Pestalotiopsissp.)等[2-3]。由于病原菌多種多樣,防治根腐病就是一個難以解決問題,至今沒有強(qiáng)有效的方法手段。傳統(tǒng)的土壤輪作方法已被證明能有效的控制許多土傳疾病,但這種方法很難適應(yīng)集約化種植系統(tǒng);而化學(xué)試劑熏蒸的方法出于人類健康及環(huán)境的考慮,也逐漸被取代。因此,以微生物制劑為主的生物防治方法將會成為預(yù)防草莓根腐病的一種常見手段[4-5]。

        目前報(bào)道過的根腐病生防菌包括芽孢桿菌(Bacillus)[6]、 木 霉 菌(Trichoderma)[7]、 鏈 霉 菌(Streptomyces)[8]等,梁銀等[9]研究發(fā)現(xiàn)利用生防菌與有機(jī)肥復(fù)配制成生物有機(jī)肥,既可以提高土壤肥力,又可以調(diào)節(jié)土壤微生物區(qū)系,減少病原菌數(shù)量。越來越多的人將目光聚焦到生防菌的開發(fā)利用,具有拮抗功能的菌種資源越豐富,挑選出優(yōu)良菌株的幾率也就越大,而且隨著研究的發(fā)展,人們更愿意篩選具有多種作用的功能性菌株去制備菌劑,例如同時具備抗病和促生兩種作用的菌株[10]。

        本文針對當(dāng)?shù)販厥页R姷牟葺?,從發(fā)病草莓根部中分離出兩株病原菌-尖孢鐮刀菌,并研究前期篩選到的解淀粉芽孢桿菌CM3[11-12]對此病原菌的抑制作用,同時通過盆栽實(shí)驗(yàn)探索菌株CM3對根腐病的防治效果,旨在為草莓根腐病的防治提供菌種資源和理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 試驗(yàn)材料 供試拮抗菌CM3由山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心微生物課題組自行鑒定并保存。供試病原真菌炭疽病菌、灰霉病菌、西瓜枯萎病菌、西葫蘆枯萎病菌、西葫蘆根腐病菌由山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心微生物課題組保存。1.1.2 培 養(yǎng) 基 PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯 200 g,葡萄糖 20 g,瓊脂 15-20 g,自來水 1 000 mL,自然pH。

        1.2 方法

        1.2.1 病原菌分離鑒定

        1.2.1.1 病原菌的分離 將發(fā)病草莓植株的根部洗凈,瀝干水分備用。在超凈臺內(nèi)選取帶有病健交界處的根部,在病變組織處用手術(shù)刀切取長度約為5 mm 的根段,用 75%的酒精浸 30 s,再用 0.1%升汞水溶液處理 3-5 min,而后用無菌水沖洗 3 次,置于PDA培養(yǎng)基中,28℃條件下培養(yǎng) 3-4 d;菌落直徑約為 1 cm 時,在無菌的條件下用消毒的接種鉤挑取菌落邊緣的菌絲體,再次接到 PDA 培養(yǎng)基中央,進(jìn)行多次的分離純化,直至菌落生長整齊一致沒有雜菌出現(xiàn)。

        1.2.1.2 病原菌的鑒定 形態(tài)鑒定:將分離菌株接種在PDA平板上 25℃ 下培養(yǎng),觀察氣生菌絲生長狀況、菌落顏色和質(zhì)地,是否產(chǎn)生孢子和菌核等培養(yǎng)性狀。分子生物學(xué)鑒定:將分離純化到的菌株進(jìn) 行 18S rDNA、EF-1α(Translation elongation factor 1 alpha)、IGS(Nuclear ribosomal intergenic spacer region)和 mtSSU(Mitochondrial small subunit)基因序列測序,其中18S rDNA鑒定是真菌鑒定中常用的方法,后三者則都是鐮刀菌分類鑒定中常用基因手段[13-14]。測序后獲得的DNA序列在 NCBI 網(wǎng)站用Blast 進(jìn)行序列比對分析,最后使用軟件 MEGA 6.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.2.2 解淀粉芽孢桿菌CM3對尖刀鐮孢菌的抑制作用研究

        1.2.2.1 解淀粉芽孢桿菌CM3的抑菌譜測定 采用平板對峙法,在 PDA 平板中心接種直徑為 8 mm的病原菌(包括分離的根腐病病菌FC2016-3和FC2016-7、草莓炭疽病菌、草莓灰霉病菌、西瓜枯萎病菌、西葫蘆枯萎病菌和西葫蘆根腐病菌),在距菌塊 3 cm 處接種菌株CM3,對照為只接種病原菌的平板,28℃ 培養(yǎng) 3-5 d,重復(fù)3次,觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果。1.2.2.2 解淀粉芽孢桿菌CM3對尖刀鐮孢菌的預(yù)防效果 選擇草莓進(jìn)行盆栽防治實(shí)驗(yàn)。盆栽實(shí)驗(yàn)使用無菌土,將蛭石和土以 1∶1 比例(w∶w)混合,160℃ 干熱滅菌5 h。選取生長一致的草莓匍匐莖幼苗,移栽于處理好的營養(yǎng)缽(10 cm×10 cm)中,緩苗 15 d 后,對幼苗進(jìn)行刀片傷根處理(同時設(shè)置無傷處理),然后開始進(jìn)行實(shí)驗(yàn)[15]。

        實(shí)驗(yàn)設(shè)置4個處理組,處理組1:接種拮抗菌CM3(濃度為1×108CFU/mL),48 h后接種病原菌孢子懸液(濃度為1×106CFU/mL)。處理組2:接種病原菌孢子懸液(濃度為1×106CFU/mL),48 h后接種拮抗菌CM3(濃度為1×108CFU/mL)。處理組3:只接種病原菌孢子懸液(濃度為1×106個/mL)。處理組4:只接種拮抗菌CM3(濃度為1×108CFU/mL)。處理組5:同樣量的無菌水。每組10株草莓苗,重復(fù)3次。

        移栽后對每種作物進(jìn)行正常的栽培管理,10 d后開始進(jìn)行病害觀察,30 d后進(jìn)行病害調(diào)查以及指標(biāo)檢測。檢測指標(biāo)包括病情指數(shù)和防治效果,還有植株的株高、葉片面積、葉柄長和鮮重,其中葉片面積和葉柄長度統(tǒng)計(jì)選擇草莓心葉外第三片葉子。

        草莓根腐病發(fā)病程度參考Vestberg等[16]的方法,分為6級:0級為根系未發(fā)??;1級為根系發(fā)病率≤30%,葉片正常;2級為30%< 根系發(fā)病率 ≤60%,葉片正常;3級為60%< 根系發(fā)病率≤80%,葉片變黃;4級為根系發(fā)病率 80%以上,葉片枯萎;5級為整株死亡,葉片干枯。

        病情指數(shù)計(jì)算公式為:

        病情指數(shù)(DSI)=100×∑(病害的級別 × 該級別的植株數(shù))/(總株數(shù) × 病害的最高級別)

        防治效果 = 100% ×(對照發(fā)病指數(shù)-處理發(fā)病指數(shù))/對照發(fā)病指數(shù)

        2 結(jié)果

        2.1 草莓根腐病的病原菌分離與鑒定

        2.1.1 病原菌分離及形態(tài)鑒定 在發(fā)病草莓的根部(圖1)分離純化到了2株病原菌,將其命名為FC2016-3和 FC2016-7。菌株FC2016-3 在 28℃ 的PDA 培養(yǎng)基上,菌落為白色,平均日生長量為12 mm,氣生菌細(xì)絲絨毛狀,為白色,培養(yǎng)基不變色(圖2-A、B)。菌株FC2016-7,菌落為白色,中心處漸漸變?yōu)樽仙?,平均日生長量為11 mm,氣生菌絲絮狀茂密,培養(yǎng)基背面會變深紫色(圖2-C、D)。

        圖1 發(fā)病草莓根部橫切圖

        2.1.2 病原菌分子鑒定 菌株FC2016-3和FC2016-7的 18S rDNA、EF-1α、IGS和 mtSSU 基因序列在GenBank 數(shù)據(jù)庫GenBank 中分別進(jìn)行比對發(fā)現(xiàn),兩個菌株與尖孢鐮刀菌的基因序列同源性都達(dá) 99%以上,說明分離到的菌株FC2016-3和FC2016-7均為尖孢鐮刀菌。每個基因序列分別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-圖6)。

        圖2 菌株FC2016-3和FC2016-7在PDA培養(yǎng)基上生長狀態(tài)

        2.2 解淀粉芽孢桿菌CM3對根腐病病原菌的抑制作用

        菌株CM3對于根腐病病原菌的抑菌效果見圖7,明顯看出CM3對多種常見的土傳病害均有良好的效果,尤其是對草莓和瓜類的病害。同時,針對灰霉病這種既可以通過土壤傳播又可以通過水、空氣等途徑傳播的病害,菌株CM3同樣有抑制作用。說明菌株CM3不僅能防治土壤中的病害,還能制備成噴施微生物制劑進(jìn)行病害防治。

        2.3 解淀粉芽孢桿菌CM3對根腐病的防治效果

        根據(jù)分離病原菌的出現(xiàn)頻率及生長狀態(tài),選擇病原菌FC2016-7進(jìn)行盆栽防治實(shí)驗(yàn),在接種7 d后草莓葉片邊緣開始變色,15 d地上莖部開始變色,逐漸干枯,30 d后地上植株完全干枯。此時將草莓根部小心撥出,洗去附著在根系的泥土,發(fā)現(xiàn)有70%的根系完全變黑,剩余沒有完全變黑的根上存在黑褐色的病斑;切開根莖部發(fā)現(xiàn)其內(nèi)部變色明顯(圖8),與健康根部比較幾乎全部變色,有1/3的部分已經(jīng)變成了深紅褐色,病情與在大田中發(fā)現(xiàn)的病株一致。對此病根進(jìn)行分離,仍可分離出病原菌FC2016-7。

        圖3 根據(jù)2株病原菌18S rDNA基因序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖4 根據(jù)2株病原菌EF-1α基因序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖5 根據(jù)2株病原菌IGS基因序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        從表1中看出,尖孢鐮刀菌FC2016-7對于草莓的致病性較強(qiáng),處理組3的病情指數(shù)達(dá)到了58.57%,各項(xiàng)指標(biāo)均顯著低于對照水平。先接種病原菌后接種CM3的處理組1的病情指數(shù)為44.33%,防治效果達(dá)到了37.14%,但是植株生長狀態(tài)明顯受到了抑制,各項(xiàng)指標(biāo)均低于對照組,但是仍好于只接種病原菌的處理組3;而先接種CM3后接種病原菌的處理組2,病情指數(shù)則降低到了26.09%,防治效果可以達(dá)到64.86%,草莓的生長狀態(tài)要優(yōu)于處理1,幾乎和對照組持平。說明只要預(yù)先用菌株CM3對栽培基質(zhì)進(jìn)行處理,就能夠達(dá)到預(yù)防病原菌FC2016-7的效果,否則會影響其防治效果。

        圖6 根據(jù)2株病原菌mtSSU基因序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖7 拮抗菌CM3對多種病原菌的抑制效果

        圖8 盆栽實(shí)驗(yàn)草莓根部圖

        從促進(jìn)生長的角度來看,只用菌株CM3處理的處理組4可以促進(jìn)草莓生長。株高、根部鮮重和地上鮮重比對照組有顯著提高,分別提高了17.51%、16.08%、9.06%;葉柄長度和葉面積的增加則不顯著。說明解淀粉芽孢桿菌CM3不僅有防治病原菌的能力,還有一定的促生長能力,十分適合作為微生物制劑進(jìn)行開發(fā)利用。

        表1 解淀粉芽孢桿菌CM3對尖刀鐮孢菌FC2016-7的防治效果及生長影響

        3 討論

        研究植物病害首先就要進(jìn)行病原菌的分離鑒定,使用分子技術(shù)對病原菌進(jìn)行鑒定已經(jīng)成為一種常用、快速、靈敏且準(zhǔn)確可靠的手段[17-18]。本研究根據(jù)2個菌株的18S rDNA、EF-1α、IGS和mtSSU 4個基因序列的分析結(jié)果,再結(jié)合病原菌的形態(tài)特征,將分離到的菌株 FC2016-3和FC2016-7 確定為尖孢鐮刀菌,結(jié)果準(zhǔn)確可信。盆栽實(shí)驗(yàn)顯示,菌株FC2016-7的致病性較強(qiáng),發(fā)病率能夠達(dá)到80%,病情指數(shù)也高達(dá)58.57%。張陽等[19]從草莓根腐病株中分離到41個菌株,通過形態(tài)學(xué)、分子生物學(xué)手段對菌株的分類地位進(jìn)行了鑒定發(fā)現(xiàn),尖孢鐮刀菌占菌株總量的9.75%,并且其致病力較強(qiáng),可達(dá)90%。比較蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)[20],不同毒力的尖孢鐮刀菌株的蛋白質(zhì)組是有顯著性差異的,部分蛋白僅僅存在于高毒力菌株中,還有一些蛋白質(zhì)在高毒力菌株中的含量較高,這些蛋白質(zhì)主要與菌株的代謝、抗氧化、電子傳遞、細(xì)胞周期和轉(zhuǎn)錄活動有關(guān)。

        解淀粉芽孢桿菌CM3本實(shí)驗(yàn)室在前期研究中篩選到的一株有抑菌效果的菌株,可以有效的預(yù)防草莓灰霉病和番茄灰霉病的發(fā)生,抑菌成分有穩(wěn)定的性能及較強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)性。本研究發(fā)現(xiàn)菌株CM3同樣可以抑制土傳病害的病原菌,如根腐病、枯萎病和炭疽病;盆栽實(shí)驗(yàn)也顯示其能夠有效的防治尖孢鐮刀菌引起的根腐病的發(fā)生,防治效果達(dá)到了64.86%,而且越早加入,防治的效果會越好;同時也發(fā)現(xiàn)菌株CM3可以促進(jìn)草莓植株的生長發(fā)育,株高、根鮮重以及地上鮮重分別提高了17.51%、16.08%、9.06%。Shen等[4]證實(shí)吸水鏈霉菌BOF-B04可以顯著增加草莓植物的鮮重并且降低根腐病的發(fā)生率,盆栽防治效果達(dá)到了63.35%;同時菌株也改變了微生物根際土壤的群落結(jié)構(gòu),土壤中的真菌數(shù)量顯著減少,比對照組降低了82.43%。

        在整個植物發(fā)育階段,由于土壤環(huán)境的復(fù)雜性,只具有單一功能的微生物已經(jīng)無法滿足實(shí)際生產(chǎn)的需求,所以許多學(xué)者開始關(guān)注具有多種功能的有益微生物。這類微生物會產(chǎn)生抗生素,通過與病原菌競爭營養(yǎng)物質(zhì)或誘導(dǎo)宿主植物的系統(tǒng)性抗性來抵抗病原菌;還可能生產(chǎn)植物激素,通過促進(jìn)植物根部對養(yǎng)分的吸收而達(dá)到促進(jìn)植物生長的能力[21]。Mukta等[22]發(fā)現(xiàn)兩株植物益生菌鏈霉菌StenotrophomonasBph-4和蒼白桿菌OchrobacterumBTLK6a均可以顯著增加草莓果實(shí)產(chǎn)量,與對照組相比分別增加了56%和43%,進(jìn)一步研究揭示了它們不僅可以分泌生長激素吲哚乙酸,同時也能分析抗生素抑制致病微生物的生長。梁曉琳等[23]將Bacillus amyloliquefaciensSQR9制成了復(fù)合微生物肥料進(jìn)行實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),復(fù)合微生物肥料集化肥速效、有機(jī)肥長效和生物肥增效等優(yōu)勢為一體,能明顯促進(jìn)番茄的生長,在總養(yǎng)分 100 g/kg和140 g/kg 施肥水平下,番茄增產(chǎn)幅度分別達(dá) 37.73% 和 44.77%。

        本實(shí)驗(yàn)中解淀粉芽孢桿菌 CM3不僅可以防治草莓根腐病的發(fā)生,也促進(jìn)了草莓植株的生長,綜合前期研究積累,可以說菌株CM3是一株多功能微生物菌株,滿足了開發(fā)微生物制劑的條件,可以將其應(yīng)用于草莓土傳病害的生物防治中。若能將其開發(fā)成新型微生物復(fù)合肥料,不僅可以提供作物生長所需的全面營養(yǎng),促進(jìn)植物生長,提高其抗逆性,免受病原菌的侵害,還能改善土壤結(jié)構(gòu),增加肥力,改善農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì),提高產(chǎn)量。同時,能達(dá)到減少化肥用量,保護(hù)生態(tài)環(huán)境的效果。

        4 結(jié)論

        本研究從草莓根腐病根部分離到了2株病原菌,根據(jù) 18S rDNA、EF-1α、IGS和 mtSSU 4個基因序列的分析結(jié)果和菌株形態(tài)特征,將這兩株菌株鑒定為尖孢鐮刀菌,分別命名為FC2016-3和FC2016-7。解淀粉芽孢桿菌CM3對菌株FC2016-3和FC2016-3在內(nèi)的多株土傳病害病原菌有明顯的抑制作用。盆栽實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,菌株CM3對尖孢鐮刀菌FC2016-7引起的草莓根腐病有良好的生物防治效果,防治效果分別為64.86%,同時也發(fā)現(xiàn)菌株CM3可以促進(jìn)草莓植株的生長發(fā)育,株高、根鮮重以及地上鮮重分別提高了17.51%、16.08%、9.06%。

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