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        甘藍(lán)型油菜莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外模型構(gòu)建

        2018-03-10 06:06:11陳雪萍劉世堯尹能文荊凌云魏麗娟林吶肖陽徐新福李加納劉列釗
        中國農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年4期
        關(guān)鍵詞:模型

        陳雪萍,劉世堯,尹能文,荊凌云,魏麗娟,林吶,肖陽,徐新福,李加納,劉列釗

        (1西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院/重慶市油菜工程技術(shù)研究中心,重慶400715;2西南大學(xué)園藝園林學(xué)院,重慶400715)

        0 引言

        【研究意義】甘藍(lán)型油菜(Brassica napus L.)作為世界性的油料作物,是食用油和蛋白質(zhì)飼料的重要來源,也是加工業(yè)及生物能源的重要原料[1]。纖維組分是植物細(xì)胞壁的主要成分,在油菜莖稈中與植株抗病抗倒伏密切相關(guān)[2-3],籽粒中纖維組分含量高低直接影響餅粕的飼用價(jià)值[4],木質(zhì)素單體G/S與油菜抗病存在顯著相關(guān)[5]。植物纖維組分含量測定方法有 Van Soest法、王玉萬法以及高效液相色譜法等[6],木質(zhì)素單體含量測定方法有酸解法、硫代酸解法和高錳酸鹽氧化法等[7]。這些傳統(tǒng)的化學(xué)測定方法耗時(shí)長、操作過程繁瑣、成本高,不能滿足大批量測定的需求,較為新穎的高效液相色譜法雖然結(jié)果準(zhǔn)確,但設(shè)備昂貴,同樣不適合推廣。近紅外光譜分析技術(shù)(near infrared spectroscopy,NIRS)具有快速、無損、低成本、準(zhǔn)確、無污染的優(yōu)點(diǎn),無需對樣品進(jìn)行復(fù)雜的預(yù)處理,就能完成樣品中多種組分的定量測定[8-9]。【前人研究進(jìn)展】近紅外光譜技術(shù)在木本植物及草本植物纖維組分含量檢測中被廣泛應(yīng)用。毛竹、杉木、桉樹、玉米、苜蓿干草、小麥和水稻等植物中纖維素、半纖維素和木質(zhì)素近紅外模型已經(jīng)建立并用來快速分析其含量[10-15]。近紅外光譜分析技術(shù)在油菜品質(zhì)育種中的應(yīng)用也十分廣泛,其中籽粒品質(zhì)研究居多。20世紀(jì)80年代初,加拿大谷物實(shí)驗(yàn)室利用近紅外光譜成功預(yù)測了油菜籽粒中油分、蛋白質(zhì)和硫苷含量[16-17]。VELASCO等[18]建立了油菜籽粒脂肪酸組分的NIRS分析定標(biāo)方程。FONT等[19-20]先后建立油菜籽粒ADL近紅外模型,然而該模型未能用于其他纖維組分含量的測定。直到2012年,WITTKOP等[21]構(gòu)建了適用于甘藍(lán)型油菜籽粒纖維組分含量分析的NDF、ADF和ADL近紅外模型。單子葉植物的木質(zhì)素由G、S和H型木質(zhì)素單體組成,而雙子葉植物主要是由G型木質(zhì)素單體和S型木質(zhì)素單體組成[22]。國外已開始對木質(zhì)素單體比例近紅外預(yù)測模型可行性進(jìn)行探究,在硬木、軟木、禾本科以及豆科植物中建立了S/G單體比例多變量的化學(xué)預(yù)測模型[23-24]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前,國內(nèi)外已構(gòu)建了預(yù)測含油量、蛋白質(zhì)、硫苷、芥酸、脂肪酸、纖維組分等油菜籽粒品質(zhì)指標(biāo)的NIRS數(shù)學(xué)模型,而油菜莖稈纖維組分含量及木質(zhì)素單體G/S預(yù)測模型尚未見報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問題】采集供試材料的近紅外光譜,通過內(nèi)部交叉驗(yàn)證和外部驗(yàn)證研究近紅外光譜法在纖維組分含量、木質(zhì)素單體G/S測定中應(yīng)用的可能性,旨在為甘藍(lán)型油菜抗病、抗倒伏遺傳育種提供參考工具。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 供試材料 莖稈纖維組分含量供試材料 376份,由200份資源材料和176份重組自交系材料組成。木質(zhì)素單體G/S供試材料105份(資源材料70份,重組自交系35份),分別在2011和2013年種植于重慶市油菜工程技術(shù)研究中心。樣品集分為校正集和檢驗(yàn)集,校正集用于建立模型及模型的內(nèi)部交叉驗(yàn)證,檢驗(yàn)集用于模型的外部驗(yàn)證。本研究根據(jù)光譜學(xué)特征選取化學(xué)成分、含量具有代表性且3次重復(fù)精度較高的103份纖維組分含量和75份木質(zhì)素單體G/S材料作為校正集,分別選取40份、30份化學(xué)值已知樣本作為驗(yàn)證集。

        1.1.2 樣品準(zhǔn)備 試驗(yàn)所用材料均為甘藍(lán)型油菜品系,每個(gè)材料隨機(jī)選取健康植株5株,距離地面20 cm處截取長度約30 cm的主莖,曬干后于60℃烘箱中烘干(約48 h),用FW80-1粉碎機(jī)徹底粉碎,充分混勻,收集至自封袋,樣品重約40 g,密閉于干燥器中保存以采集近紅外光譜。

        1.2 纖維組分含量及木質(zhì)素單體G/S的化學(xué)測定

        纖維組分含量測定參照 VAN SOEST等[25]的方法。

        木質(zhì)素單體測定參照ROLANDO等的方法[26]。稱取莖稈風(fēng)干樣品5 mg于15 mL反應(yīng)瓶中,加入1 mL新鮮反應(yīng)液(終濃度為2.5% BF3和10% EtSH溶于二氧雜環(huán)乙烷),100℃條件下反應(yīng)4 h,冰上冷卻5 min,加入200 μL內(nèi)標(biāo),調(diào)pH至3—4。加入2 mL超純水和1 mL CH2Cl2,渦旋后靜置,收集下層有機(jī)相,用無水 Na2SO4干燥,氮吹儀吹干。揮干物重新溶于CH2Cl2中,加入50 μL嘧啶和100 μL的BSA,25℃靜置4 h,進(jìn)行GC分析,重復(fù)3次,取其平均值。色譜條件:RTX-5MS型彈性石英毛細(xì)管色譜柱(30 mm×0.25 mm×0.25 μm);FID檢測器:載氣為高純氦氣,載氣流速為1.19 mL·min-1,進(jìn)樣口溫度250℃;分流比20:1,進(jìn)樣量2 μL;柱升溫程序:初始溫度為50℃,以 35℃·min-1升溫至 220℃,再以 0.5℃·min-1升溫至230℃,最后以50℃·min-1升溫到280℃,保留7 min。質(zhì)譜條件:EI離子源,離子源溫度200℃,電子能量70 eV,接口溫度250℃;溶劑延遲5 min。

        1.3 近紅外模型的建立和檢驗(yàn)

        1.3.1 近紅外掃描光譜的采集 將粉碎的樣品置于室內(nèi)環(huán)境24 h后,裝入小圓型樣品杯壓實(shí),樣品量約為2.7 g。采用FOSS NIR Systems 5000型近紅外光譜分析儀進(jìn)行吸收光譜的采集,掃描范圍為 1 100—2 498 nm,掃描次數(shù)為64次,分辨率為8 cm-1,為減少儀器波動(dòng)和裝樣對光譜掃描的干擾,每個(gè)樣品重復(fù)掃描3次,用光譜處理軟件合并成平均光譜用于建模。

        1.3.2 近紅外檢測模型的構(gòu)建、篩選與檢驗(yàn) 將化學(xué)測定值導(dǎo)入與近紅外檢測儀配套的化學(xué)計(jì)量學(xué)軟件WinISI Ⅲ,剔除馬氏距離GH(Global H)值大于3.0的超常樣品,將馬氏距離小于0.8的樣品定義為相似樣品,剩余的樣品構(gòu)成定標(biāo)樣品。使用無散射處理(None)、標(biāo)準(zhǔn)正?;?散射處理(SNV+Detrend)、標(biāo)準(zhǔn)正常化處理(standard normal variant,SNV)、去散射處理(Detrend Only)、標(biāo)準(zhǔn)化多元散射校正(Stand and MSC)、加權(quán)散射校正(Weighted MSC)和反相多元離散校正(Inverse MSC)來消除同一樣品多次裝樣掃描結(jié)果產(chǎn)生的偏差。采用主成分回歸法(PCR)、修正偏最小二乘法(MPLS)和偏最小二乘法(PLS)建立校正模型,模型的優(yōu)劣采用內(nèi)部交叉驗(yàn)證和外部驗(yàn)證評(píng)價(jià),以校正標(biāo)準(zhǔn)差(SEC)、交叉驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)差(SECV)、定標(biāo)相關(guān)系數(shù)(RSQ)、交叉驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)(1-VR)和預(yù)測標(biāo)準(zhǔn)差(SEP)等統(tǒng)計(jì)指標(biāo)對模型進(jìn)行綜合評(píng)估。

        2 結(jié)果

        2.1 纖維組分含量及木質(zhì)素單體G/S的測定

        木質(zhì)素單體 G/S樣品的硫代硫酸解產(chǎn)物經(jīng)GC-MS分析后,依據(jù)H、G和S型木質(zhì)素單體的分子離子峰做定性鑒定。如圖 1所示,定標(biāo)樣品 GM13L和GN280L的木質(zhì)素單體含量差異較為顯著,木質(zhì)素單體組分在50 min內(nèi)完全出峰,分離較為完全。由于H型木質(zhì)素含量極低,本文僅統(tǒng)計(jì)G和S型木質(zhì)素單體含量,其中GM13L單體G/S為0.804,GN280L樣品中單體G/S為 1.180。纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外模型的校正集和檢驗(yàn)集樣品數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果見表 1。莖稈材料的 NDF含量范圍在 64.04%—85.34%,平均值75.55%;ADF含量范圍在47.57%—64.02%,平均值 56.97%;ADL含量范圍 6.31%—17.13%,平均值10.98%;木質(zhì)素單體G/S范圍在0.46—1.60,平均值 0.74。定標(biāo)樣品分布范圍較廣,差異明顯,說明具有一定的代表性。

        表1 油菜莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S的測定Table 1 Measurement of stem fiber component content and lignin monomer G/S in rapeseed

        2.2 近紅外光譜的采集

        近紅外分析光譜的基礎(chǔ)是樣品的化學(xué)組成官能團(tuán)在近紅外區(qū)有特征吸收,吸光度與樣品中成分含量大小有關(guān)。圖 2所示為纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S樣品在1 100—2 498 nm的近紅外漫反射光譜圖,全波長范圍內(nèi)存在多個(gè)吸收峰。在1 450和1 940 nm處是水的特征吸收峰,分別為 O-H鍵一級(jí)倍頻與合頻吸收帶,2 100 nm處吸收峰為O-H和C-O分子鍵二級(jí)倍頻合頻振動(dòng)。不同樣品在近紅外光譜區(qū)吸收光譜特征基本一致,全光譜呈現(xiàn)低中高的變幅范圍,說明樣品主要成分基本相同,但各成分相對含量不同。

        圖1 樣品GM13L和GN280L硫代硫酸解產(chǎn)物的主要?dú)庀嗌V峰Fig. 1 Typical chromatograms for thioacidolysis products for GM13L and GN280L

        2.3 近紅外模型的建立

        當(dāng)回歸方法采用修正偏最小二乘法(MPLS),光譜預(yù)處理分別采用None、SNV Only、Weighted MSC和SNV+Detrend時(shí),構(gòu)建的近紅外預(yù)測模型其定標(biāo)相關(guān)系數(shù)和交叉驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)最大,校正標(biāo)準(zhǔn)差和交叉驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)差最小。由表2可知,纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外模型內(nèi)部交叉驗(yàn)證效果較好,1-VR分別為 0.864、0.861、0.872和 0.920,SECV分別為1.093、0.932、0.456和0.057,說明模型的預(yù)測準(zhǔn)確性較好。

        表2 近紅外模型校正、內(nèi)部交叉驗(yàn)證結(jié)果參數(shù)Table 2 The statistic parameters of calibration, cross-validation for NIRS models

        圖2 油菜莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S的近紅外吸收光譜圖Fig. 2 NIRS spectra of stem fiber component content and lignin monomer G/S in rapeseed

        2.4 近紅外模型的檢驗(yàn)

        選取未參與定標(biāo)的莖稈樣品對所建纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S模型進(jìn)行驗(yàn)證。如圖3所示,模型的預(yù)測值與化學(xué)值擬合存在較好的線性關(guān)系。相對誤差反映測量結(jié)果偏離真值的實(shí)際大小,由表3可知,相對誤差較小,說明預(yù)測結(jié)果較為準(zhǔn)確。其中RSQ分別為0.837、0.818、0.870和0.935,SEP分別為0.680、0.636、0.348和0.054,表明纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外模型的預(yù)測準(zhǔn)確度較好,能滿足物質(zhì)品質(zhì)分析中對準(zhǔn)確度的要求。

        表3 近紅外模型外部驗(yàn)證結(jié)果Table 3 External validation statistics for NIRS models

        3 討論

        近紅外光譜分析技術(shù)是一種新型的分析技術(shù),它具有快速、高效、無損和適合在線分析等特點(diǎn),在農(nóng)業(yè)、制藥和化石等領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用[27-28]。近紅外光譜主要是含氫基團(tuán)的伸縮振動(dòng)的倍頻吸收譜帶及伸縮振動(dòng)和搖擺振動(dòng)的合頻吸收。植物纖維素主要由纖維素、半纖維素和木質(zhì)素組成,其中纖維素為均一聚糖,半纖維素為兩種或兩種以上糖基的復(fù)合聚糖,都含有大量羥基,而木質(zhì)素的基本結(jié)構(gòu)單元是苯丙烷,苯環(huán)上具有甲氧基和羥基,可見這些成分在近紅外光譜區(qū)都有較強(qiáng)的吸收。本試驗(yàn)中定標(biāo)樣品由資源材料和重組自交系材料組成。其中資源材料間存在較大差異,纖維組分含量及木質(zhì)素單體比例分布范圍較廣,具有廣泛的代表性;為提高模型準(zhǔn)確性和可靠性,選取部分待測重組自交系材料參與建模,符合近紅外建模的需要。本研究采用修正偏最小二乘法(MPLS)、偏最小二乘法(PLS)和主成分回歸(PCR)的化學(xué)計(jì)量學(xué)方法進(jìn)行分析建立定標(biāo)模型,將校正模型進(jìn)行對比研究可知,采用修正偏最小二成法建立回歸方程最佳,這與李玉等[29]的研究結(jié)果一致。

        圖3 近紅外模型檢驗(yàn)集化學(xué)值與預(yù)測值的關(guān)系Fig. 3 The relationship between the predicted and measured values in validation set for NIRS models

        在甘藍(lán)型油菜的研究中,纖維組分含量化學(xué)測定復(fù)雜,準(zhǔn)確的化學(xué)值測定難度較大,因此國內(nèi)外少有關(guān)于纖維組分含量近紅外模型構(gòu)建的報(bào)道。姜訓(xùn)鵬等[30]基于近紅外光譜技術(shù)對不同飼料原料的 NDF和ADF預(yù)測方法進(jìn)行了研究,在近紅外譜區(qū)中觀察到1 450 nm、1 940 nm和2 100 nm處有明顯吸收峰。本試驗(yàn)中在1 100—2 498 nm范圍內(nèi)主要有4個(gè)吸收峰,出峰位置分別為1 450 nm、1 940 nm、2 100 nm和2 274 nm,這與前人研究結(jié)果一致[30-32]。毛竹、杉木、桉樹、玉米、苜蓿干草、小麥和水稻等中纖維素、半纖維素和木質(zhì)素近紅外模型已被建立并用來快速分析其含量[10-15]。WITTKOP等[21]建立甘藍(lán)型油菜籽粒NDF、ADF和ADL近紅外模型,外部檢驗(yàn)相關(guān)系數(shù)分別為0.62,0.70和0.81,表明近紅外光譜是一種有效檢測油菜纖維組分含量的方法,但精確度還有待提高。本試驗(yàn)構(gòu)建了甘藍(lán)型油菜莖稈 NDF、ADF、ADL近紅外分析模型,其外部檢驗(yàn)相關(guān)系數(shù)分別為0.837、0.818、0.870,表明所建定標(biāo)模型能快速地預(yù)測莖稈纖維組分含量,但效果并不十分理想。由于試驗(yàn)中中性洗滌過程受殘留雜質(zhì)的影響,過濾比較困難且耗時(shí)較多,而隨著中性洗滌、酸性洗滌和硫酸消化處理,影響建模準(zhǔn)確性的雜質(zhì)被徹底去除,因而ADL近紅外模型精度相對較高,這與陳賢情等[33]研究結(jié)果一致。國內(nèi)外關(guān)于木質(zhì)素單體組分近紅外模型構(gòu)建的研究較少且主要集中在木本植物。ROBINSON等[23]建立白楊木質(zhì)素單體近紅外分析模型,其中S和G型木質(zhì)素單體具有較高的預(yù)測準(zhǔn)確性,H型木質(zhì)素單體模型預(yù)測能力較差。在此基礎(chǔ)上SUN等[24]建立硬木、軟木、禾本科、豆科植物 S/G單體比例多變量化學(xué)預(yù)測模型,能夠快速準(zhǔn)確的測定木質(zhì)素單體比例。本研究構(gòu)建的甘藍(lán)型油菜莖稈木質(zhì)素單體G/S分析模型,內(nèi)部交叉驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)和外部檢驗(yàn)相關(guān)系數(shù)分別為0.920和0.935。

        上述研究結(jié)果表明莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外模型均可應(yīng)用于后續(xù)的試驗(yàn)和分析,但要使之成為完善成熟的模型仍然需要改進(jìn)。近紅外光譜分析結(jié)果的準(zhǔn)確性受多種因素影響,因此深入了解近紅外光譜分析的各種影響因素,降低負(fù)影響,是今后建立近紅外模型中提高效率減少誤差的關(guān)鍵[34]。另外,試驗(yàn)中使用定標(biāo)樣品不夠多,而中國油菜品種多樣,不具備普遍代表性,今后工作還需不斷補(bǔ)充不同產(chǎn)地和年份的材料,增加樣品品種和數(shù)量,進(jìn)行模型補(bǔ)充校正和升級(jí)優(yōu)化。

        4 結(jié)論

        本研究運(yùn)用多種光譜預(yù)處理方法、化學(xué)計(jì)量學(xué)方法及內(nèi)部交叉驗(yàn)證,篩選出1-VR值最高和SECV值最低的最佳莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體G/S近紅外預(yù)測的模型。其交叉驗(yàn)證相關(guān)系數(shù)(1-VR)分別為0.864、0.861、0.872和0.920,用驗(yàn)證集樣品檢驗(yàn)?zāi)P?,其外部檢驗(yàn)相關(guān)系數(shù)(RSQ)分別為 0.837、0.818、0.870和0.935,說明所建模型定標(biāo)效果較好,能快速測量莖稈纖維組分含量和木質(zhì)素單體 G/S,可應(yīng)用于甘藍(lán)型油菜抗病抗倒伏育種和相關(guān)性狀的遺傳改良。

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