張力力 王樹(shù)水 辛穎 張智偉 李渝芬
1南方醫(yī)科大學(xué)(廣州 510515);2廣東省人民醫(yī)院,廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院,廣東省心血管病研究所心兒科(廣州 510080)
特發(fā)性心肌病是原發(fā)于心肌病變的心臟結(jié)構(gòu)和功能的異常,包括擴(kuò)張型心肌病(dilated cardio?myopathy,DCM)、肥厚型心肌?。╤ypertrophic car?diomyopathy,HCM)、左室心肌致密化不全(left ventricular noncompaction,LVNC)等。DCM表現(xiàn)為心臟擴(kuò)大,心室收縮功能減退,伴或不伴有充血性心力衰竭,常有心律失常,可伴發(fā)栓塞、猝死等并發(fā)癥。HCM是以不能解釋的心室肥厚為特征的心肌疾病,早期伴心臟舒張功能不全,晚期收縮功能亦受影響,左室流出道梗阻是該病的常見(jiàn)特征,它是最常見(jiàn)的年輕人心源性猝死的原因之一。LVNC是以心室內(nèi)疏松的肌小梁和深陷的隱窩為特征的心肌病,常累積左室,又稱海綿狀心肌、竇狀心肌持續(xù)狀態(tài)等。近年來(lái),隨著二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,從基因?qū)用嬖\斷疾病,分析基因突變與臨床表型的關(guān)系已成為研究熱點(diǎn)[1]。本文對(duì)我院接診的43例無(wú)血緣關(guān)系的特發(fā)性心肌病兒科患者進(jìn)行心肌病相關(guān)基因進(jìn)行研究,系首次對(duì)特發(fā)性心肌病患兒進(jìn)行多達(dá)91個(gè)心肌病相關(guān)基因的測(cè)序分析,以明確特發(fā)性心肌病患兒致病基因及其突變特點(diǎn),初步分析基因突變與臨床表型的關(guān)系,探討基因突變?cè)谛募〔≡\斷、預(yù)后判斷、指導(dǎo)治療方面的作用。
1.1 一般資料 廣東省人民醫(yī)院從2015年1月至2017年3月共收治43例無(wú)血緣關(guān)系心肌病患兒(DCM 14例,HCM12例,LVNC17例),全部病例經(jīng)酶學(xué)及串聯(lián)質(zhì)譜檢查等排除代謝性心肌病,經(jīng)臨床、超聲心動(dòng)圖檢查確診。DCM中,男8例,女6例,年齡0.3~14(6.4±5.4)歲。HCM中,男4例,女8例,年齡0.3~14(6.3±4.9)歲。LVNC中,男7例,女10例,年齡0.2±13(4.0±4.5)歲。本研究經(jīng)廣東省人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究倫理委員會(huì)批準(zhǔn),所有患兒及直系親屬,均由其本人或監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。
1.2 基因測(cè)序分析
1.2.1 二代基因測(cè)序 抽取靜脈血2 mL,采用QIAamp DNA提取試劑盒(QIAGEN公司)抽提基因組DNA。提取的DNA用DNA酶片段化后用磁珠法進(jìn)行純化,隨后進(jìn)行PCR擴(kuò)增并連接上接頭序列,使用 TruSight One Sequencing Panel(illumina Inc,USA)試劑盒經(jīng)2次捕獲及純化,再經(jīng)PCR擴(kuò)增和純化后獲得的最終文庫(kù)在Nextseq500測(cè)序儀(illumina Inc,USA)上進(jìn)行外顯子區(qū)及外顯子與內(nèi)含子交接區(qū)的二代測(cè)序。
1.2.2 數(shù)據(jù)分析 根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道[2-4]和HGMD(Human Gene Mutation Database)、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Men)等數(shù)據(jù)庫(kù)選取與心肌病相關(guān)或可能相關(guān)的91個(gè)基因進(jìn)行分析。該91個(gè)基因?yàn)?AARS2、ABCC9、ACTC1、ACTN2、AGK、ANKRD1、BAG3、CALR3、CASQ2、CAV3、CHRM2、COX15、 CRYAB、 CSRP3、 CTF1、 DES、 DMD、DNAJC19、DOLK、DSC2、DSG2、DSP、DTNA、ELAC2、EMD、EYA4、FHL1、FHL2、FKTN、FLT1、FOXD4、FXN、GATAD1、GLA、ILK、ISL1、JPH2、JUP、KLF10、LAMA2、LAMA4、LAMP2、LDB3、LMNA、MAP2K2、MRPL3、MTO1、MURC、MYBPC3、MYH6、MYH7、MYL2、MYL3、MYLK2、MYO6、MYOM1、MYOZ2、MYPN、NDUFAF1、NDUFS7、NEBL、NEXN、PDLIM3、PKP2、PLN、PRKAG2、PSEN1、PSEN2、RBM20、RYR2、SCN5A、SGCA、SGCD、SLC25A3、SLC25A4、SRI、SYNE1、SYNM、TAZ、TCAP、TGFB3、TMEM43、TMPO、TNNC1、TNNI3、TNNT2、TPM1、TTN、TTR、TXNRD2、VCL。用BWA算法比對(duì)到參考序列(UCSC hg19),采用儀器默認(rèn)設(shè)置,使用ANNOVAR工具對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行注釋。使用千人基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)庫(kù)、ESP6500數(shù)據(jù)庫(kù)、HGMD數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行篩選、注釋;使用SIFT、Polyphen?2軟件進(jìn)行錯(cuò)義變異的生物信息學(xué)分析。綜合各個(gè)基因變異的頻率、基因功能、遺傳方式、文獻(xiàn)報(bào)道等信息,并結(jié)合患兒的臨床表型信息,篩選候選突變。根據(jù)2015年“美國(guó)遺傳學(xué)與基因組學(xué)會(huì)(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)”提出的指南得出致病性判斷,基因突變的致病性程度分為5檔,即致病突變、可疑致病突變、臨床意義未明、可能無(wú)害、無(wú)害[5]。
1.2.3 Sanger測(cè)序驗(yàn)證 針對(duì)候選突變的位點(diǎn),用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,對(duì)其中收集到靜脈血的一代親屬進(jìn)行相應(yīng)位點(diǎn)的Sanger測(cè)序驗(yàn)證。
2.1 特發(fā)性心肌病基因突變情況 43例患兒(DCM 14例,HCM 12例,LVNC 17例)中,20例(46.5%)檢測(cè)到 ACTC1、DSG2、ELAC2、FKTN、HCN4、LAMA2、LMNA、MTO1、MYBPC3、MYH6、MYH7、NEBL、NEXN、NKX2?5、PLN、PSEN2、RAF1、SCN5A、TNNI3、TNNT2、TPM1、TTN、VCL等 23個(gè)基因上的致病突變和可疑致病突變,共檢測(cè)到28個(gè)致病突變或可疑致病突變位點(diǎn),未見(jiàn)有重復(fù)出現(xiàn)的突變位點(diǎn)(表1)。其中6例患兒同時(shí)檢測(cè)到2個(gè)基因上致病突變或可疑致病突變,2例患兒同時(shí)檢測(cè)到1個(gè)基因的2個(gè)致病突變或可疑致病突變。對(duì)其中24個(gè)突變位點(diǎn)進(jìn)行父母測(cè)序驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),由父或母遺傳的有19個(gè),新發(fā)突變5個(gè)。致病突變和可疑致病突變中,突變方式以錯(cuò)義突變?yōu)橹?,?0.0%,其次為移碼突變(17.8%)、無(wú)義突變(14.3%)、剪接突變(10.7%)、外顯子和內(nèi)含子交接區(qū)的微小缺失突變(3.5%)。此外,19例(44.1%)患兒檢測(cè)到臨床意義未明的突變位點(diǎn)。
2.2 DCM與基因突變 14例DCM患兒中,5例(35.7%)檢測(cè)到7個(gè)基因上的8個(gè)致病突變及可疑致病突變位點(diǎn),余9例均檢測(cè)到臨床意義未明的突變。1例DCM患兒中檢測(cè)到FKTN基因上的2個(gè)位點(diǎn)的突變,F(xiàn)KTN?L166P來(lái)自于父親,F(xiàn)KTN?F369fs來(lái)自于母親,父母均無(wú)心臟擴(kuò)大或心力衰竭的表現(xiàn),但該患兒就診時(shí)即有嚴(yán)重的心力衰竭。
2.3 HCM與基因突變 12例HCM患兒中的7例(58.3%)檢測(cè)到10個(gè)基因上的11個(gè)致病及可疑致病突變位點(diǎn),3例檢測(cè)臨床意義未明的突變。對(duì)其中1例有暈厥史,且就診2年后因心力衰竭死亡的患兒(病例17,圖1)進(jìn)行家系分析發(fā)現(xiàn),其母親、妹妹、外婆攜帶致病突變MYH7?R663C,其父親、伯父攜帶可疑致病突變MYH7?R1050*,均未患病,其姐姐診斷為HCM已于4歲猝死,未能檢測(cè)到其姐姐基因。1例患兒父親不明原因猝死,后發(fā)現(xiàn)該患兒心肌肥厚且檢測(cè)到致病突變TNNT2?R130C,患兒母親未攜帶此突變。還有1例HCM患兒檢測(cè)到PKP2基因上的R284G位點(diǎn)突變,該位點(diǎn)根據(jù)ACMG指南判斷為臨床意義未明,但通過(guò)患兒家系驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),該位點(diǎn)為新發(fā)突變,其父、母均未攜帶此突變位點(diǎn)。
表1 特發(fā)性心肌病基因型與臨床表型Tab.1 Genotype and phenotype of cadiomyopathy
2.4 LVNC與基因突變 在17例LVNC的患兒中,8例(47%)檢測(cè)到9個(gè)基因上的9個(gè)致病及可疑致病突變位點(diǎn)。7例檢測(cè)到臨床意義未明的突變,2例患兒僅檢測(cè)到無(wú)害和可能無(wú)害的突變位點(diǎn)。對(duì)1例(病例9,圖2)患兒進(jìn)行家系分析發(fā)現(xiàn),該患兒攜帶的突變ACTC1?c.616+1G>C為新發(fā)突變,其兄長(zhǎng)、父、母均不攜帶此突變。1例合并有竇性心動(dòng)過(guò)緩的患兒檢測(cè)到致病突變HCN4?G482R。
本文首次對(duì)特發(fā)性心肌病患兒進(jìn)行多達(dá)91個(gè)心肌病相關(guān)基因的測(cè)序分析,明確特發(fā)性心肌病患兒致病基因及其突變特點(diǎn),初步分析基因突變與臨床表型的關(guān)系,探討基因突變?cè)谛募〔≡\斷、預(yù)后判斷、指導(dǎo)治療方面的作用。研究發(fā)現(xiàn)DCM與48個(gè)基因的突變有關(guān),40%~50%的家族性DCM可以檢測(cè)到基因突變[6],其中最常見(jiàn)的突變基因?yàn)門TN,約占20%,其次為L(zhǎng)MNA(6%),MYH7(4.2%),MYH6(3 ~ 4%),SCN5A(2 ~ 4%)等[7],本研究中14例DCM患兒中5例檢測(cè)到致病基因突變和可疑致病突變,大部分為非家族性的DCM,我們檢測(cè)到常見(jiàn)基因LMNA,還檢測(cè)到TPM1、VCL、PLN、DSG、PSEN2、FKTN 等致病基因。在HCM中,已經(jīng)報(bào)道了26個(gè)致病基因,50%~60%的家族性HCM,20%~30%的非家族性HCM可以檢測(cè)到基因突變[8]。研究表明在HCM的致病基因中 MYH7、MYBPC3約各占 40%,TNNI3、TNNT2約各占 5%,TPM1約占 2%[9],本研究在12例HCM患兒中7例檢測(cè)到致病突變及可疑致病突變。我們也同樣檢測(cè)到MYH7、MYBPC3、TNNT2、TNNI3上的突變位點(diǎn),與文獻(xiàn)報(bào)道相符。此 外 ,還 檢 測(cè) 到 TTN、RAF1、PSEN2、LAMA2、NEXN、MTO1等基因的突變位點(diǎn)。LVNC與15個(gè)基因突變相關(guān),15% ~50%的LVNC為家族遺傳[10]。常見(jiàn)的LVNC致病基因有DTNA、MIB1、PRDM16、TNNT2、TAZ等[11]。本研究檢測(cè)到的致病基因包括 ACTC1、ELAC2、HCN4、LMNA、MYH6、NEBL、NKX2?5、SCN5A、TTN。
圖1 1例HCM患兒超聲心動(dòng)圖及基因測(cè)序圖Fig.1 Images for a patient of HCM
圖2 1例LVNC患兒超聲心動(dòng)圖及基因測(cè)序圖Fig.2 Images for a patient of LVNC
根據(jù)既往文獻(xiàn)報(bào)道和相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)選擇了與心肌病相關(guān)或可能相關(guān)的91個(gè)基因進(jìn)行測(cè)序分析[1-3]。在本研究的43例特發(fā)性心肌病患兒中,20例(46.5%)檢測(cè)到致病或可疑致病突變位點(diǎn),19例(44.1%)檢測(cè)到目前臨床意義尚未明確的突變位點(diǎn)。這些研究結(jié)果提示,將心肌病相關(guān)基因檢測(cè)用于協(xié)助診斷特發(fā)性心肌病是可行的。特發(fā)性心肌病患兒中大部分都能檢測(cè)到突變位點(diǎn),但其中存在臨床意義未明的位點(diǎn),我們的研究結(jié)果顯示,這些臨床意義目前尚未明確的突變位點(diǎn)很可能與患兒的發(fā)病密切相關(guān),需要今后進(jìn)一步的分析。本研究中,1例HCM患兒檢測(cè)到PKP2基因上的R284G位點(diǎn)突變。雖然根據(jù)目前的判斷標(biāo)準(zhǔn),該突變尚定義為臨床意義未明的突變位點(diǎn),但該位點(diǎn)為新發(fā)突變,具有較強(qiáng)的致病證據(jù),很可能與HCM發(fā)病相關(guān)。在既往研究中,PKP2?R284位點(diǎn)未見(jiàn)有引起HCM的報(bào)道,但PKP2基因的突變影響橋粒功能,是引起右室心肌病的常見(jiàn)致病基因,因而我們懷疑R284G為新發(fā)現(xiàn)的HCM的致病位點(diǎn),需要進(jìn)行下一步的驗(yàn)證。
文獻(xiàn)報(bào)道,部分基因突變位點(diǎn)與病變程度相關(guān)。有研究結(jié)果顯示攜帶一個(gè)基因上的雙突變位點(diǎn)是患兒預(yù)后不良的標(biāo)志[12-13]。本研究中1例DCM患兒攜帶FKTN的雙突變位點(diǎn),其分別來(lái)自于父母,該患兒父母無(wú)心臟擴(kuò)大或心力衰竭等表現(xiàn),但患兒就診時(shí)即有嚴(yán)重的心力衰竭,且治療后未見(jiàn)明顯好轉(zhuǎn),支持其預(yù)后不良的特點(diǎn)。另1例HCM患兒攜帶有MYH7的雙突變,她是本研究HCM病例中唯一一例死亡的患者,該患兒10歲時(shí)就有胸痛、心衰等表現(xiàn),12歲因心力衰竭死亡,其姐姐在4歲因HCM猝死,支持文獻(xiàn)報(bào)道的該類病例具有病情重、預(yù)后差的特點(diǎn)。因此,對(duì)于檢測(cè)到一個(gè)基因上雙突變位點(diǎn)的病例,應(yīng)密切隨訪,并早期告知家屬其預(yù)后情況。HCM中,TNNT2的突變位點(diǎn)R92Q,R92W,R130C等引起的心肌肥厚不嚴(yán)重,但易引發(fā)心源性猝死[14]。本研究中檢測(cè)到的TNNT2?R130C的突變的患兒心肌肥厚亦不嚴(yán)重,其母親未攜帶此突變,父親已于30歲猝死,高度懷疑其猝死與此突變相關(guān),該患兒目前無(wú)臨床癥狀,但根據(jù)其基因型與家族猝死史,臨床應(yīng)予以密切關(guān)注,加強(qiáng)隨訪,必要時(shí)應(yīng)早期應(yīng)用置入性心臟除顫器預(yù)防猝死。MILANO等[15]曾發(fā)現(xiàn)HCN4?G482R突變的LVNC患者常合并有竇性心動(dòng)過(guò)緩,本研究中有1例LVNC患兒也檢測(cè)到了HCN4?G482R突變,該患兒同樣具有顯著的心動(dòng)過(guò)緩,而本文中其他LVNC病例均不合并明顯的竇性心動(dòng)過(guò)緩。
由于受到研究經(jīng)費(fèi)、研究時(shí)間等方面的限制,本研究尚有一些突變位點(diǎn)目前未能明確是否致病,突變位點(diǎn)與臨床表型的關(guān)系也未得到大樣本的驗(yàn)證。今后,將對(duì)研究病例進(jìn)行長(zhǎng)期隨訪、擴(kuò)大樣本量,以上述問(wèn)題進(jìn)行深入研究。
[1]WALDM LLER S,SCHROEDER C,STURM M,et al.Target?ed 46?gene and clinical exome sequencing for mutations causing cardiomyopathies[J].Mol Cell Probe,2015,29(5):308?314.
[2]中華醫(yī)學(xué)會(huì)心血管病學(xué)分會(huì),中華心血管病雜志編輯委員會(huì).遺傳性心臟離子通道病與心肌病基因檢測(cè)中國(guó)專家共識(shí)[J].中華心血管病雜志,2011,39(12):1073?1082.
[3]ACKERMAN M J,PRIORI S G,WILLEMS S,et al.HRS/EH?RA expert consensus statement on the state of genetic testing for the channelopathies and cardiomyopathies:this document was developed as a partnership between the Heart Rhythm Soci?ety(HRS)and the European Heart Rhythm Association(EH?RA)[J].Europace,2011,13(8):1077?1109.
[4]TEEKAKIRIKUL P,KELLY M A,REHM H L,et al.Inherit?ed cardiomyopathies:molecular genetics and clinical genetic testing in the postgenomic era[J].J Mol Diagn,2013,15(2):158?170.
[5]RICHARDS S,AZIZ N,BALE S,et al.Standards and guide?lines for the interpretation of sequence variants:a joint consen?sus recommendation of the American College of Medical Genet?ics and Genomics and the Association for Molecular Pathology[J].Genet Med,2015,17(5):405?424.
[6]HERSHBERGER R,MORALES A.Dilated Cardiomyopathy Overview [EB/OL]. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK 1309,2015?09?24.
[7]HERSHBERGER R E,HEDGES D J,MORALES A.Dilated cardiomyopathy:the complexity of a diverse genetic architecture[J].Nat Rev Cardiol,2013,10(9):531.
[8]CIRINO A,HO C.Hypertrophic Cardiomyopathy Overview[EB/OL].http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1768,2017?3?10.
[9]KAPPLINGER J D,LANDSTROM A P,BOS J M,et al.Distin?guishing Hypertrophic Cardiomyopathy?Associated Mutations from Background Genetic Noise[J].J Cardiovasc Transl,2014,7(3):347?361.
[10]OECHSLIN E,JENNI R.Left ventricular non?compaction revis?ited:a distinct phenotype with genetic heterogeneity?[J].Eur Heart J,2011,32(12):1446?1456.
[11]BENNETT C E,F(xiàn)REUDENBERGER R.The current approach to diagnosis and management of left ventricular noncompaction cardiomyopathy:review of the literature[J].Cardiol Res Prac?tice,2016,2016:1?7.
[12]FOUREY D,CARE M,SIMINOVITCH K A,et al.Prevalence and Clinical Implication of Double Mutations in Hypertrophic Cardiomyopathy.CLINICAL PERSPECTIVE[J].Circulation:Cardiovascular Genetics,2017,10(2):e001685.
[13]WANG J,XU S,ZHOU H,et al.A Novel Mutation of the Beta Myosin Heavy Chain Gene Responsible for Familial Hypertro?phic Cardiomyopathy[J].Clin Cardiol,2009,32(9):E16?E21.
[14]SONG L,ZOU Y,WANG J,et al.Mutations profile in Chinese patients with hypertrophic cardiomyopathy[J].Clin Chim Ac?ta,2005,351(1?2):209?216.
[15]MILANO A,VERMEER A M,LODDER E M,et al.HCN4 mutations in multiple families with bradycardia and left ventricu?lar noncompaction cardiomyopathy[J].J Am Coll Cardiol,2014,64(8):745?756.