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        CSFV的反向遺傳系統(tǒng)

        2018-02-24 05:07:28趙妍
        關鍵詞:豬瘟

        趙妍

        【摘 要】對于家豬和野豬來說,豬瘟是一種具有極高傳染力及高致死率的烈性傳染病。豬瘟是由豬瘟病毒(Classic Swine Fever Virus, CSFV)引起的病毒性傳染病,CSFV屬于黃病毒科,瘟病毒屬,是一種單股正義RNA病毒。在CSFV的研究當中,反向遺傳學應用十分廣泛,論文主要介紹幾種比較成熟的CSFV反向遺傳系統(tǒng)。近年來,反向遺傳學在CSFV的研究方面得到不斷發(fā)展,論文就CSFV的幾種反向遺傳系統(tǒng)進行系統(tǒng)闡述,以期為CSFV的研究及防控提供參考。

        【關鍵詞】CSFV;豬瘟;反向遺傳學

        【Keywords】CSFV; classical swine fever; reverse genetics

        【中圖分類號】S852.65? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?【文獻標志碼】A? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?【文章編號】1673-1069(2018)12-0182-02

        1 引言

        反向遺傳學是利用病毒的全長基因組來產生完整病毒的方法,是現(xiàn)在病毒學研究中最強有力的工具。反向遺傳學通常用于研究病毒復制、感染、蛋白功能、病毒與宿主的相互作用、抗病毒及疫苗研究[1]。近年來,反向遺傳學在CSFV的研究方面得到不斷發(fā)展,本文就CSFV的幾種反向遺傳系統(tǒng)進行系統(tǒng)闡述,以期為CSFV的研究及防控提供參考。據統(tǒng)計,我國每年因豬瘟造成的經濟損失已超過100億元。豬瘟嚴重阻礙養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展,并對食品安全造成威脅。因此,對該病進行全面、綜合防控,具有必要的現(xiàn)實意義。本文對CSFV及功能相關基因、蛋白的研究進展進行介紹,為全面了解CSFV、全方位防控豬瘟提供理論支持。

        2 CSFV的幾種反向遺傳系統(tǒng)

        2.1 T7 RNA聚合酶介導的體外轉錄反向遺傳學系統(tǒng)

        T7 RNA聚合酶,是一種高度特異識別T7啟動子序列的DNA依賴的5'→3'RNA聚合酶。T7 RNA Polymerase可以催化單鏈或雙鏈DNA T7啟動子下游NTP的摻入,合成與T7啟動子下游的模板DNA互補的RNA[2]。

        Meyers(Meyers et al., 1996)首先對CSFV 5到3進行了全基因組鑒定,將CSFV全基因組克隆到低拷貝質粒中,并在基因組3端加入T7啟動子,利用Srf I將質粒線性化后,在T7 RNA聚合酶作用下體外轉錄得到RNA,并轉染進SK6細胞系中拯救病毒,這一方法在現(xiàn)在的CSFV研究中依然應用十分廣泛。Fan(Fan et al., 2009)將上述方法進行了改進,將由T7 RNA聚合酶體外轉錄產生的vRNA轉染到BHK21細胞系中,培養(yǎng)一段時間后,將含有病毒的上清感染PK15細胞,用此方法得到的CSFV病毒滴度是之前的8倍左右。

        2.2 T7 RNA聚合酶介導的體內轉錄反向遺傳學系統(tǒng)

        Gennip(Gennip et al., 1999)建立了一種更方便、高效的體內轉錄反向遺傳系統(tǒng)。首先他建立了可以穩(wěn)定表達T7 RNA聚合酶的SK6細胞系SK6-T7 RNA pol,將線性化的CSFV cDNA轉染該細胞系,轉錄過程在細胞中完成并得到病毒RNA,產生CSFV病毒,該方法大大提高了病毒滴度,其滴度約為體外轉錄的200倍[3]。Bergeron(Bergeron, 2002)通過在CSFV 3端插入了HDV核酶及T7終止子,構建了一種新型的基于T7 RNA聚合酶的體內轉錄反向遺傳學系統(tǒng),該系統(tǒng)不需要Srf I就能在CSFV末端形成精確的3NCR,節(jié)約了構建成本。

        2.3 II型RNA聚合酶介導的反向遺傳學系統(tǒng)

        Li(Li et al., 2013)在CSFV 5NCR加入CMV啟動子、T7啟動子和HamRZ,在3NCR加入HdvRZ,T7終止子和SV40 polyA,HamRZ與HdvRZ可以生成正確的5NCR及 3NCR,且能在T7 RNA聚合酶或者II型RNA聚合酶的作用下進行轉錄,該方法拯救的病毒滴度是體外轉錄的120倍。

        2.4 I型RNA聚合酶介導的反向遺傳學系統(tǒng)

        本實驗室在上述基礎上,構建了一種新的依賴pol Ⅰ拯救病毒的CSFV cDNA克隆,我們在PK15細胞基因組中擴增得到豬的啟動子,并參照文獻合成在哺乳動物細胞中具有極高終止效率的鼠終止子,分別插入CSFV 5NCR之前和3NCR之后。該系統(tǒng)能直接將質粒轉染到細胞中,拯救出CSFV病毒,這種基于pol Ⅰ啟動子的反向遺傳操作系統(tǒng)能產生具有精確末端基因組的CSFV,且具有更高的拯救效率,為后續(xù)修飾性減毒活疫苗和標記疫苗的研發(fā)奠定了堅實的基礎。

        3 帶有標記的CSFV反向遺傳系統(tǒng)

        基于傳統(tǒng)的反向遺傳系統(tǒng),具有標記或定量功能的CSFV cDNA克隆被設計出來,如在Li實驗組建立了一種簡化的中和抗體試驗,用于檢測CSFV,首先在Npro后插入了EGFP基因,在病毒產生的同時合成EGFP,從而省去熒光染色,達到檢測病毒的目的[4]。本實驗室在1.4中的反向遺傳系統(tǒng)的基礎上,在Npro后面加入了Rluc基因,得到了可以用于定量實驗的CSFV反向遺傳系統(tǒng),即可以通過收集Rluc氧化過程中釋放的生物熒光,定量地檢測轉錄因子與目的基因的相互作用。

        帶有標記的CSFV反向遺傳系統(tǒng)在傳統(tǒng)的反向遺傳系統(tǒng)的基礎上,進一步簡化了實驗步驟,在達到實驗目的的同時,使反應更加快速,簡便,增加了方法的實用性,為后續(xù)開展修飾性減毒活疫苗和標記疫苗的研發(fā)做了很好的鋪墊。

        4 展望

        反向遺傳操作系統(tǒng)為RNA 病毒研究提供了一個強有力的平臺,能夠恢復具有全長病毒基因組的病毒[5]。利用這個平臺,人們可以通過基因重組、基因突變等 手段來研究病毒的復制、感染,病毒蛋白的功能、病毒與宿主細胞之間的關系??共《静呗院蜆擞浺呙绲陌l(fā)展也離不開反向遺傳操作,如找出與毒力相關性基因,對其進行缺失或修飾處理,從而得到新的無毒或減毒毒株,以此制備新型的減毒活疫苗,同時可以制備嵌合抗體,開發(fā)多價疫苗[6]。反向遺傳系統(tǒng)作為動物病毒的研究方法,已廣泛應用于動物疫苗、CSFV毒力機制及蛋白功能研究中,極大地推動了動物病毒的研究發(fā)展,為疾病的研究及防控起著重要作用。

        【參考文獻】

        【1】Bergeron, L.J. Development and comparison of procedures for the selection of delta ribozyme cleavage sites within the hepatitis B virus[J]. Nucleic Acids Research, 2002(30): 4682-4691.

        【2】Fan, Y.F., Zhao, Q.Z., Zhao, Y., etc. Recovery of the Infectious Classical Swine Fever Virus from the Cloned cDNA of Low Temperature Attenuated Thiverval Strain[J]. Chinese Journal of Animal & Veterinary Sciences,2009(40), 1420-1425.

        【3】Gennip, H.G.P.v., Rijn, P.A.v., Widjojoatmodjo, M.N., etc.Recovery of infectious classical swine fever virus (CSFV) from full-length genomic cDNA clones by a swine kidney cell line expressing bacteriophage T7 RNA polymerase[J]. Journal of Virological Methods, 1999(78): 117.

        【4】Li, C., Huang, J., Li, Y., etc. Efficient and stable rescue of classical swine fever virus from cloned cDNA using an RNA polymerase II system[J]. Archives of Virology ,2013(158): 901-907.

        【5】Meyers, G., Thiel, H.J., Rümenapf, T . Classical swine fever virus: recovery of infectious viruses from cDNA constructs and generation of recombinant cytopathogenic defective interfering particles[J]. Journal of Virology,1996(70): 1588-1595.

        【6】WU C W, CHIEN M S, HUANG C. Characterization of the swine U6 promoter for short hairpin RNA expression and its application to inhibition of virus replication[J]. J Biotechnol, 2013,168(1):78-84.

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