馬 芹,王元智,陸濤峰,李智昊,楊春文,陳洪巖*
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所,黑龍江省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與比較醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150009; 2.牡丹江師范學(xué)院,黑龍江 牡丹江 157011)
在野生嚙齒類動(dòng)物棕背鼠 平(Myodesrufocanus)的生態(tài)學(xué)研究中,對(duì)其進(jìn)行性別鑒別是分析其種群動(dòng)態(tài)的一項(xiàng)基本工作[1]。因棕背鼠 平是流行性出血熱病毒、森林腦炎病毒及普馬拉病毒等人獸共患病病原體的天然宿主[2-3],本實(shí)驗(yàn)室已開(kāi)展棕背鼠 平的實(shí)驗(yàn)室繁育[4],擬將其培育成實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,以便構(gòu)建人獸共患病感染動(dòng)物模型,同時(shí)豐富實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源。但在其實(shí)驗(yàn)室繁育過(guò)程中,因其性別不易判斷,嚴(yán)重影響著分籠與繁殖。目前對(duì)棕背鼠 平的性別鑒定多依據(jù)肛門到尿生殖孔的距離及被毛、性情、乳頭及外部生殖器官等指標(biāo)[5-6]進(jìn)行判斷(圖1),但棕背鼠 平活動(dòng)敏捷、性情不溫順,不易抓??;幼齡時(shí)期的棕背鼠 平外部生殖器官又未顯現(xiàn),不能從外表準(zhǔn)確區(qū)分雌雄;從肛門到尿生殖孔的距離及被毛進(jìn)行觀察,主觀性較強(qiáng),很難做到正確的性別分離。
注:A:4周齡;B:成年雄性;C:成年雌性。圖1 棕背鼠 平性別的表型判斷Note. A: A 4-week-old grey red-backed vole; B: An adult male grey red-backed vole; C: An adult female grey red-backed vole.Fig.1 Phenotypic identification of the gender of grey red-backed voles
隨著對(duì)性別決定理論的深度研究,用于動(dòng)物性別鑒定的方法也在同步發(fā)展,尤其在分子生物學(xué)領(lǐng)域取得了較大進(jìn)展。Page等[7]發(fā)現(xiàn)在Y染色體上存在一種可編碼鋅指蛋白的高度保守的基因序列,即鋅指結(jié)構(gòu)基因(zinc-finger Y,ZFY),該序列可能與性別決定有關(guān);Schneider-G?dicke[8]在哺乳動(dòng)物X染色體上也發(fā)現(xiàn)了與ZFY高度同源的基因,即ZFX基因,在無(wú)ZFY表達(dá)的小鼠上,睪丸的分化不受影響,因此,ZFY/ZFX基因不能決定性別。Sinclair等[9]發(fā)現(xiàn)在Y染色體短臂靠近常染色體的35 kb區(qū)域存在性別決定區(qū)(sex-determining region of the Y chromosome),即SRY基因。Koopman等[10]將SRY基因注入到雌性小鼠胚胎中,后期小鼠發(fā)育成雄性,證明了SRY基因?yàn)椴溉閯?dòng)物的性別決定基因。目前已在東北虎、黑熊、貓、牛等動(dòng)物[1, 11-13]上用SRY基因進(jìn)行了性別鑒定,正確率100%。本實(shí)驗(yàn)在棕背鼠 平實(shí)驗(yàn)室繁育研究[4]的基礎(chǔ)上,利用PCR技術(shù),以棕背鼠 平的新鮮毛囊為實(shí)驗(yàn)材料,從毛囊中提取DNA,利用SRY基因和ZFY/ZFX基因的雙重PCR擴(kuò)增對(duì)棕背鼠 平的性別進(jìn)行鑒定,建立一種快速、準(zhǔn)確、簡(jiǎn)便的性別鑒定方法。
于黑龍江省牡丹江地區(qū)牡丹峰林地捕獲的野生棕背鼠 平若干只,經(jīng)隔離檢疫后,飼養(yǎng)在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所負(fù)壓隔離環(huán)境感染動(dòng)物實(shí)驗(yàn)設(shè)施內(nèi) [SYXK (黑) 2017-009],選取6只雄性成年、3只雌性成年及14只4周齡左右棕背鼠 平用于PCR方法鑒定棕背鼠 平性別;10只SPF級(jí)Wistar大鼠(5只雄性,體重310~320 g;5只雌性,體重230~240 g;9周齡)和8只SPF級(jí)BALB/c小鼠(5只雌性和3只雄性,體重21~23 g,6周齡),購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司 [SCXK (京) 2016-0011],飼養(yǎng)在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所負(fù)壓隔離環(huán)境感染動(dòng)物實(shí)驗(yàn)設(shè)施內(nèi)。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中按實(shí)驗(yàn)動(dòng)物使用的3R原則給予人道主義關(guān)懷。
Chelex-100 resin購(gòu)于Sigma公司,蛋白酶K和2× EasyTaq SuperMix購(gòu)于全式金生物技術(shù)有限公司,PCR儀購(gòu)于杭州博日科技有限公司,DK-8D型電熱恒溫水槽購(gòu)于上海精宏實(shí)驗(yàn)有限公司,凝膠成像分析系統(tǒng)購(gòu)于北京賽智創(chuàng)業(yè)科技有限公司,其他常規(guī)試劑為分析純。
1.3.1 棕背鼠 平基因組DNA的提取
用鑷子夾取棕背鼠 平被毛,挑選帶有毛囊的5根,保留被毛根部,剪去其余部分,放入0.5 mL EP管中,加入0.3 mL ddH2O洗一次,然后加入30 μL 5%的Chelex-100和5 μL 5 mg/mL的蛋白酶K,置于56℃恒溫水浴保溫6 h。取出后振蕩,100℃保溫8 min,充分振蕩,13 000 r/min離心3 min,DNA存在于上清中,-20℃保存上清備用。
1.3.2 引物合成
[14]設(shè)計(jì)并合成擴(kuò)增ZFY/ZFX基因片段的引物:P1∶5’-ATAATCACATGGAGAGCCACAA GCT-3’,P2∶5’-GCACTTCTTTGGTATCTGAGAAA GT-3’;針對(duì)鼠的SRY基因設(shè)計(jì)并合成用于性別鑒定的引物:P3∶5’-TGTGGTCTCGTGGTCAGAGG-3’,P4∶5’-CGGCTTCTGTAAGGCGTTTC-3’。引物均由哈爾濱博仕生物技術(shù)有限公司合成。
1.3.3 PCR擴(kuò)增
以提取的毛囊DNA為模板,分別構(gòu)建ZFY/ZFX基因和SRY基因PCR擴(kuò)增體系50 μL:2× EasyTaq PCR SuperMix 25 μL,DNA模板1 μg,P1(P3)引物1 μL,P2(P4)引物1 μL,ddH2O 22 μL。反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸60 s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),擴(kuò)增條帶大小與目的條帶一致時(shí)進(jìn)行測(cè)序分析。
1.3.4 雙重PCR擴(kuò)增
將擴(kuò)增ZFY/ZFX基因和SRY基因的引物同時(shí)加入到一個(gè)PCR反應(yīng)體系內(nèi),建立雙重PCR擴(kuò)增方法。擴(kuò)增體系為:2× EasyTaq PCR SuperMix 25 μL,DNA模板1 μg,P1引物1 μL,P2引物1 μL,P3引物0.6 μL,P4引物0.6 μL,ddH2O 20.6 μL。反應(yīng)程序同PCR擴(kuò)增。同時(shí)優(yōu)化退火溫度、引物濃度及瓊脂糖凝膠濃度,確定最佳的雙重PCR擴(kuò)增條件。當(dāng)擴(kuò)增片段僅有一個(gè)(ZFY/ZFX445/447 bp)時(shí),說(shuō)明該棕背鼠 平不存在SRY基因位點(diǎn),性別為雌性;當(dāng)擴(kuò)增片段有兩個(gè)(ZFY/ZFX445/447 bp和SRY108 bp)時(shí),說(shuō)明該棕背鼠 平的性別為雄性;當(dāng)沒(méi)有擴(kuò)增片段時(shí),說(shuō)明PCR擴(kuò)增體系構(gòu)建失敗,不能對(duì)棕背鼠 平的性別進(jìn)行鑒定。
1.3.5 性別鑒定
選取23只棕背鼠 平(表型判斷為6只雄性,3只雌性,其余鼠性別經(jīng)解剖結(jié)果進(jìn)行判斷)、10只Wistar大鼠(5只雄性,5只雌性)和8只BALB/c小鼠(3只雄性,5只雌性),獲取其帶有毛囊的新鮮被毛,Chelex-100提取基因組DNA。利用上述建立的雙重PCR擴(kuò)增方法進(jìn)行性別鑒定。
選取雄性、雌性棕背鼠 平各一只,利用Chelex-100提取毛囊中DNA,分別以雄、雌DNA為模板,P1和P2為引物建立PCR反應(yīng)體系,擴(kuò)增ZFY/ZFX基因片段,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳顯示,雌、雄性棕背鼠 平均有擴(kuò)增條帶(圖2),片段大小與ZFY/ZFX目的片段一致,經(jīng)測(cè)序后分析為ZFX基因。同時(shí),以P3和P4為引物,擴(kuò)增SRY基因片段,結(jié)果顯示雄性有與SRY基因目的片段大小一致的條帶,測(cè)序分析為鼠的SRY基因,而雌性未擴(kuò)增出條帶(圖2)。
注:M:DL 2000 DNA Marker;泳道1和2:ZFY/ZFX基因擴(kuò)增;泳道3和4:SRY基因擴(kuò)增。泳道1和3:雌性棕背鼠 平;泳道2和4:雄性棕背鼠 平。圖2 棕背鼠 平SRY基因和ZFY/ZFX基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果Note. M: DL 2000 DNA Marker; Lane 1 and 2: PCR products of the ZFY/ZFX gene; Lane 3 and 4: PCR products of the SRY gene. Lane 1 and 3: Female voles; Lane 2 and 4: Male voles.Fig.2 PCR amplification products of the SRY and ZFY/ZFX genes in grey red-backed voles
分別以雄性、雌性棕背鼠 平毛囊DNA為模板,構(gòu)建ZFY/ZFX基因和SRY基因雙重PCR擴(kuò)增體系,結(jié)果顯示雄性可擴(kuò)增出兩條片段(ZFX445 bp和SRY108 bp);而雌性只擴(kuò)增出一條片段(ZFX445 bp),未擴(kuò)增出SRY基因片段;陰性對(duì)照無(wú)條帶(圖3)。實(shí)驗(yàn)重復(fù)操作3次,擴(kuò)增結(jié)果一致,穩(wěn)定性較好,雙重PCR擴(kuò)增體系構(gòu)建成功。通過(guò)對(duì)擴(kuò)增條件的優(yōu)化,退火溫度為55℃時(shí)擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物在3%瓊脂糖凝膠電泳下觀察效果最佳。
注:M:DL 2000 DNA Marker;泳道1~3:分別為陰性對(duì)照、雄性棕背鼠 平、雌性棕背鼠 平。圖3 雌、雄性棕背鼠 平SRY基因和ZFY/ZFX基因的雙重PCR擴(kuò)增結(jié)果Note. M: DL 2000 DNA Marker; Lane 1-3: Negative control, male and female grey red-backed voles, respectively.Fig.3 Amplification products of the SRY and ZFY/ZFX genes in male and female grey red-backed voles by the double PCR assay
獲取23只棕背鼠 平、10只Wistar大鼠及8只BALB/c小鼠的新鮮毛囊,提取基因組DNA,利用本實(shí)驗(yàn)建立的ZFY/ZFX基因和SRY基因雙重PCR擴(kuò)增方法,對(duì)23只棕背鼠 平進(jìn)行性別鑒定,結(jié)果(圖4)顯示前9只已知性別的棕背鼠 平檢測(cè)結(jié)果與表型判斷
一致,其中6只同時(shí)擴(kuò)增出ZFY/ZFX基因和SRY基因片段,為雄性;3只僅擴(kuò)增出ZFY/ZFX基因片段,沒(méi)有擴(kuò)增出SRY基因片段,為雌性;其余未知性別的14只棕背鼠 平,鑒定為結(jié)果顯示7只為雄性,7只為雌性,與解剖結(jié)果一致(圖5)。PCR擴(kuò)增結(jié)果顯示10只Wistar大鼠中5只為雄性,5只為雌性;8只BALB/c小鼠中5只為雌性,3只為雄性,與解剖結(jié)果一致,說(shuō)明建立的雙重PCR擴(kuò)增方法同樣適用于大鼠和小鼠的性別鑒定。
對(duì)動(dòng)物進(jìn)行性別鑒定時(shí),大多數(shù)PCR方法以動(dòng)物的組織為實(shí)驗(yàn)材料,對(duì)于一些性情兇猛、活動(dòng)敏捷、不易抓取和固定的動(dòng)物,獲取其組織材料比較困難。另外,從動(dòng)物福利的角度出發(fā),我們應(yīng)盡量減少對(duì)動(dòng)物的傷害。已有文獻(xiàn)證實(shí)以動(dòng)物被毛為材料進(jìn)行性別鑒定是完全可靠的,正確率100%[1]。本實(shí)驗(yàn)以棕背鼠 平的被毛為實(shí)驗(yàn)材料,利用Chelex-100提取毛囊中的DNA,并以提取的DNA作為PCR擴(kuò)增的模板,該方法不僅不損害研究對(duì)象,采樣和DNA的提取也更加快捷,實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確可靠,還可以降低實(shí)驗(yàn)成本。
注:M:DL 2000 DNA Marker;泳道1和35:陰性對(duì)照;泳道2~24:分別為棕背鼠 平樣品1~23;泳道25~34:分別為Wistar大鼠樣品1~10;泳道36~43:分別為BALB/c小鼠樣品1~8。圖4 棕背鼠 平、Wistar大鼠和BALB/c小鼠的性別鑒定Note. M: DL 2000 DNA Marker; Lane 1 and 35: Negative control; Lane 2-24: Samples 1-23 taken from grey red-backed voles, respectively; Lane 25-34: Samples 1-10 taken from Wistar rats, respectively; Lane 36-43: Samples 1-8 taken from BALB/c mice, respectively.Fig.4 Gender identification of the grey red-backed voles, Wistar rats and BALB/c mice
注:A:雌性;B:雄性。圖5 棕背鼠 平性別的解剖結(jié)果Note. A: Female; B: Male.Fig.5 Autopsy results demonstrating the gender identification of grey red-backed voles
與常規(guī)PCR方法(只針對(duì)雄性特異性基因進(jìn)行一次擴(kuò)增)不同,本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了ZFY/ZFX基因和SRY基因的雙重PCR擴(kuò)增,以ZFY/ZFX基因作為PCR擴(kuò)增的內(nèi)參照,防止因PCR擴(kuò)增SRY基因失敗造成假陰性,該方法提高了準(zhǔn)確率,同時(shí)也增加了
模板的利用率。本實(shí)驗(yàn)針對(duì)ZFY/ZFX基因和SRY基因建立的雙重PCR方法,能夠?qū)ψ乇呈?平的性別做出正確判斷,具有快速、準(zhǔn)確、簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),可廣泛應(yīng)用于野生動(dòng)物研究領(lǐng)域以及實(shí)驗(yàn)室繁育中的性別鑒定。該方法也可能存在一些局限性,對(duì)一些性別與正常情況不同,如Y染色體SRY基因缺失個(gè)體、染色體組型為XXY、XXX等個(gè)體,該方法不能做出正確鑒定,但這種情況在自然狀態(tài)下發(fā)生的幾率非常小[1],可以忽略。通過(guò)利用針對(duì)ZFY/ZFX基因和SRY基因建立的雙重PCR擴(kuò)增方法,可以對(duì)棕背鼠 平的性別做出正確判斷,合理安排分籠和繁殖,將對(duì)棕背鼠 平的實(shí)驗(yàn)室繁育有重要影響。
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