蔡樹美,徐四新,張翰林,張德閃,呂衛(wèi)光,顧富家,諸海燾*
(1上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院生態(tài)環(huán)境保護(hù)研究所,上海 201403;2上海市設(shè)施園藝技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 201403;3 農(nóng)業(yè)部上海農(nóng)業(yè)環(huán)境與耕地保護(hù)科學(xué)觀測實(shí)驗(yàn)站,上海 201403;4申農(nóng)(上海)生態(tài)農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,上海 202150)
我國耕地資源緊缺,灘涂是重要的后備土地資源,有著巨大的開發(fā)潛力和利用價(jià)值。然而灘涂土壤并非農(nóng)用耕地,惡劣的灘涂生態(tài)環(huán)境仍是制約人們更深層次利用這片資源的瓶頸。其限制因子主要包括土壤結(jié)構(gòu)差、含鹽量高、有機(jī)質(zhì)和全氮含量低等問題[1-3]。因此,如何合理利用和開發(fā)這片極具價(jià)值的土壤后備資源,已經(jīng)成為緩解當(dāng)前農(nóng)業(yè)用地日益緊缺矛盾、助推農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的難點(diǎn)之一。
面對灘涂資源生態(tài)不斷惡化的現(xiàn)實(shí),以生物利用為核心的生物改良技術(shù)近年來日趨受到重視。通過紫云英等綠肥種植和農(nóng)田耕翻輪作等模式,提升土壤有機(jī)質(zhì)、增加碳匯、培肥地力,已經(jīng)成為近年來灘涂土壤生物改良的新趨勢。目前對灘涂紫云英-水稻輪作生物改良技術(shù)的試驗(yàn)研究,大多集中在土壤類型、水分、施肥、植被等非微生物學(xué)因素方面[4-8],對固氮菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性等微生物學(xué)因素方面的野外試驗(yàn)研究相對較少。雖有報(bào)道顯示紫云英-水稻輪作能提高根際土壤和水稻根內(nèi)生微生物多樣性[9-10],但對紫云英-水稻輪作生物改良行為下灘涂土壤特殊生理類群微生物群落結(jié)構(gòu)的響應(yīng)機(jī)制仍不清楚,制約了灘涂土壤土地利用效率和土壤改良效率的提高。
本研究通過分析紫云英-水稻輪作模式對灘涂土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)和土壤環(huán)境因子的影響,并通過土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)和土壤環(huán)境因子的相關(guān)性分析,比較固氮菌群落和土壤環(huán)境對紫云英-水稻輪作模式的響應(yīng),為灘涂鹽堿地的生物改良技術(shù)提供參考。
試驗(yàn)于2011年10月至2015年6月在上海崇明島東灘優(yōu)質(zhì)水稻種植功能區(qū)進(jìn)行(121o51′E,31o36′N)。該區(qū)域位于上海崇明東灘上實(shí)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)范圍內(nèi),屬北亞熱帶季風(fēng)海洋性氣候,年均日照時(shí)數(shù)2 104 h,日照百分率47%,全年無霜期229 d,平均氣溫15.3 ℃,年均降水量 1 022 mm。由于園區(qū)位處新近形成的潮灘濕地,1990年才開始進(jìn)行大面積圍墾,土壤普遍存在鹽堿較重、肥力偏低等問題。在前期對200份土壤樣品的調(diào)查數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn),pH>7.5的土壤占比95.5%,其中pH>8.5的堿性土壤占比24.0%;鹽分>1 g/kg的土壤占比77.5%,部分土壤鹽分含量高達(dá)6 g/kg以上;有機(jī)質(zhì)含量<10 g/kg的土壤占比40.5%,部分土壤有機(jī)質(zhì)含量低于2 g/kg。故此采取播種水稻、水稻-綠肥輪作等方式對園區(qū)土壤進(jìn)行洗鹽改造。
供試水稻為當(dāng)?shù)刂髟云贩N“花優(yōu) 14”,系上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育的優(yōu)質(zhì)超高產(chǎn)、耐鹽性強(qiáng)的水稻新品種,供試紫云英為余江大葉籽,供試土壤為長江泥沙淤積而成的鹽漬沙壤土。試驗(yàn)區(qū)土壤地力偏低,地勢平坦。0~20 cm耕層土壤性質(zhì)為:全氮0.48 g/kg,全磷0.61 g/kg,全鉀16.4 g/kg,速效氮36.3 mg/kg,有效磷22.3 mg/kg,速效鉀198.2 mg/kg,有機(jī)質(zhì)4.42 g/kg,pH 8.55,全鹽 2.46 g/kg,EC 214.3 μS/cm。
試驗(yàn)設(shè)置水稻-紫云英輪作區(qū)和水稻-冬季休閑區(qū),每區(qū)面積66.7 m2。紫云英于每年10月5日播種,播種量為2.5 kg/667m2,于4月底全量翻壓還田。
試驗(yàn)從2011年起連續(xù)進(jìn)行4年,共計(jì)有4茬綠肥、4茬水稻。田間按照常規(guī)施肥方式進(jìn)行水肥管理,商品有機(jī)肥用量為3 000 kg/hm2,化肥用量折算為純N 270 kg/hm2,P2O5120 kg/hm2,K2O 150 kg/hm2。氮肥分4次施用:基肥50%,蘗肥(苗期)20%,拔節(jié)肥10%,穗肥占20%;磷肥100% 作基肥;鉀肥分為基肥 50% 與拔節(jié)期追肥 50%?;势贩N選用尿素(N 46%)、復(fù)合肥(15∶15∶15)、氯化鉀(K2O 60%)。田間管理按常規(guī)方法進(jìn)行。
選擇水稻-休閑和水稻-紫云英輪作改良 4年以上的田塊(編號分別為“1”、“2”),分別采集土壤樣品。用土鉆采集剖面土壤樣品,采樣深度分別為0~10 cm(編號“a”)、10~20 cm(編號“b”)、20 ~40 cm(編號“c”)和 40~80 cm(編號“d”)。每個(gè)采樣點(diǎn)按連續(xù)“S”形采樣法均勻布10~15個(gè)點(diǎn),用土鉆采集不同剖面深度土樣,將10~15個(gè)點(diǎn)土樣混合成1個(gè)混合樣品,每個(gè)樣地各取3個(gè)平行,共得24個(gè)混合土壤樣品。將樣品裝入已標(biāo)記的自封袋中帶回實(shí)驗(yàn)室,去除石塊、昆蟲殘?bào)w、植物殘根等雜質(zhì)后待用。
參照土壤農(nóng)業(yè)化學(xué)分析方法,有機(jī)質(zhì)采用重鉻酸鉀容量法測定;土壤樣品經(jīng)H2SO4-H2O2消煮后,全氮用蒸餾定氮法測定,全磷用釩鉬黃比色法測定,全鉀用火焰光度計(jì)測定,速效氮用蒸餾定氮法測定,有效磷用鉬藍(lán)比色法測定,速效鉀用火焰光度計(jì)法測定,土壤全鹽用質(zhì)量法測定,EC用電導(dǎo)率法測定,pH用電位法測定[11]。另取部分新鮮土樣放入已滅菌的 2 ml 離心管中,并置于-80 ℃ 冰箱保存,用PCR-DGGE法分析土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)分析[12-13],具體步驟如下:
1)采用Mobio Powersoil Isolation Kit試劑盒抽提土壤基因組DNA,固氮菌nifH 基因的 PCR 擴(kuò)增采用 Nested-PCR 程序。
2)第一次 PCR:所用引物為固氮菌 nifH 基因的引物 FGPH 19 和 Po1R,反應(yīng)體系為:BioLinker2× Taq Mix 20 μl,每種引物 1 μl,10 倍稀釋的土壤總 DNA提取液 1 μl,加 ddH2O 至反應(yīng)終體積 40 μl。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃ 預(yù)變性 2 min;25 個(gè)循環(huán):94 ℃變性30 s,56.4℃ 退火 30 s,72 ℃ 延伸 30 s;最后 72 ℃延伸 5 min。
3)第二次 PCR:反應(yīng)體系與第一次相同,模板為第一次 PCR 產(chǎn)物,擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃ 預(yù)變性 2 min;20 個(gè)循環(huán):94 ℃ 變性 30 s,56.4℃ 退火 30 s,72 ℃ 延伸 30 s;最后一步 72 ℃延伸 5 min,獲得約 320 bp(包括 40 bp 的 GC 夾)的基因片段。
4)Reconditioning PCR:繼續(xù)進(jìn)行 Reconditioning PCR以消除擴(kuò)增產(chǎn)物中異二聚體。反應(yīng)體系為:BioLinker2×Taq Mix 20 μl,每種引物 2 μl,巢氏擴(kuò)增產(chǎn)物 4 μl,加 ddH2O 至反應(yīng)終體積 40 μl。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃ 預(yù)變性 2 min;5 個(gè)循環(huán):94℃ 變性 30 s,56.4℃ 退火 30 s,72 ℃ 延伸 30 s;最后72 ℃延伸 5 min。
5)DGGE 分析:采用 BIO-RAD DcodeTM突變檢測系統(tǒng)(Bio-Rad Laboratories,美國)進(jìn)行固氮菌 nifH 基因的 DGGE分析。聚丙烯酰胺凝膠濃度為 8%,變性劑梯度為 53%~75%(100% 的變性劑含有 7 mol/L尿素和40%(v /v)的去離子甲酰胺,電泳緩沖液為 1×TAE buffer。60 ℃、70 V 電壓下電泳 15 h。電泳結(jié)束后,用Biolinker DNA Red染色液進(jìn)行染色40 min,然后用 Bio-Rad 凝膠成像分析系統(tǒng)觀察樣品的電泳條帶并拍照。
采用 Canoco for Windows 4.5 軟件對物種數(shù)據(jù)和相關(guān)環(huán)境因子數(shù)據(jù)進(jìn)行典范對應(yīng)分析(CCA)。物種數(shù)據(jù)采用固氮菌群落結(jié)構(gòu)多樣性指數(shù)(香農(nóng)指數(shù)Shannon-Weaver、均勻度指數(shù)Pielou Evenness和豐富度指數(shù) Richness),用 lg(x+1) 進(jìn)行處理使之更趨于正態(tài)分布[14]。
表 1顯示了土壤環(huán)境因子在不同輪作方式下的空間變化特征。在水稻-休閑方式下,0~10 cm和10 ~20 cm土壤剖面中總氮 (TN)、NH+4-N、有機(jī)質(zhì) (SOM)含量較高,隨著剖面深度加深,TN、NH4+-N、SOM含量下降趨勢明顯。在水稻-紫云英方式下,剖面深度對 TN、NH4+-N、SOM含量的影響比水稻-休閑方式下的影響小。總體來看,水稻-紫云英輪作可以降低土壤電導(dǎo)率 (EC),并且使灘涂土壤中0~10 cm和10~20 cm土壤剖面的pH下降。
表1 不同輪作方式下灘涂土壤理化性質(zhì)Table 1 Soil physical and chemical properties under different rotation patterns
為進(jìn)一步明確土壤環(huán)境因子之間的關(guān)系,對各環(huán)境因子進(jìn)行典范對應(yīng)分析(表2),結(jié)果可見,土壤環(huán)境因子之間存在著相關(guān)性。TN和NH4+-N典型相關(guān)系數(shù)最高,與pH和有效磷(Olsen-P)的相關(guān)性次之;EC與、NO-3-N、Olsen-P之間的典型相關(guān)系數(shù)較高;pH與速效鉀(NH4OAc-K)的典型相關(guān)性高于其他土壤環(huán)境因子。
表2 環(huán)境因子之間的典型相關(guān)分析Table 2 Correlation coefficients between different environmental factors
2.2.1 nifH基因的DGGE分析圖譜 采用Quantity one 4.6.2 對DGGE圖譜進(jìn)行條帶識別及相似性分析,每條泳道不同位置的條帶為土壤樣品中被分離的 PCR產(chǎn)物片段,屬于不同的固氮菌類群。從圖 1可以看出,DGGE電泳圖中各泳道條帶數(shù)目、強(qiáng)度、遷移率均存在一定差異,兩種輪作方式下40~80 cm土壤剖面中條帶數(shù)目均較少。水稻-紫云英輪作的土壤固氮菌群落豐富度高于水稻-休閑。水稻-紫云英輪作方式下,10~20 cm土壤剖面中條帶數(shù)目最多。
2.2.2 nifH基因的多樣性指數(shù) 群落多樣性通常與物種的豐富度和均勻度密切相關(guān)。本研究采用豐富度指數(shù)Richness、香農(nóng)指數(shù)Shannon-Weaver、均勻度指數(shù)Pielou Evenness對固氮菌群落多樣性進(jìn)行分析。香農(nóng)指數(shù)可反映群落結(jié)構(gòu)的復(fù)雜程度,均勻度指數(shù)用于反映群落均勻度。從表3可以看出,水稻-紫云英輪作方式下,不同剖面深度土壤的固氮菌多樣性指數(shù)總體上高于水稻-休閑;10~20 cm土層水稻-紫云英輪作方式中土壤固氮微生物群落多樣性表現(xiàn)為最高,固氮菌群落組成復(fù)雜,群落多樣性高于水稻-休閑。此外,對比兩種輪作方式發(fā)現(xiàn),水稻-休閑40~80 cm土層土壤固氮微生物群落的多樣性顯著低于水稻-紫云英。
為進(jìn)一步研究土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)的關(guān)系,將DGGE指紋圖譜中每一條帶的光密度值作為物種數(shù)據(jù),使用 CANOCO軟件將固氮菌群落與土壤理化性質(zhì)做典范對應(yīng)分析(表4)。結(jié)果顯示,固氮菌群落多樣性 CCA排序軸與環(huán)境因子相關(guān)。在前 3個(gè)排序軸中,固氮菌群落多樣性與環(huán)境的相關(guān)性分別為 0.983、0.946和 0.971,固氮菌群落多樣性與環(huán)境關(guān)系的變化累計(jì)比例分別為24.3%、41.6% 和 56.4%。前 3 個(gè)排序軸的固氮菌群落多樣性與環(huán)境關(guān)系方差累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到72.7%,排序結(jié)果可行有效,能較好地解釋固氮菌群落與環(huán)境之間的相關(guān)關(guān)系。
圖1 不同輪作模式下灘涂土壤nifH基因的DGGE分析圖譜Fig. 1 DGGE profiles of soil nifH genes under different rotation patterns
表3 不同輪作方式下土壤nifH基因的多樣性指數(shù)Table 3 Diversity indexes of soil microbial nifH genes under different rotation patterns
采用典范對應(yīng)分析,將樣本與環(huán)境因子在同一個(gè)二維圖上反映出來,可以直觀地看出群落分布、物種分布與環(huán)境變量之間的關(guān)系。環(huán)境因子用箭頭表示,箭頭所處的象限表示環(huán)境因子與排序軸間的正負(fù)相關(guān)性,箭頭連接長度代表該環(huán)境因子與樣本分布相關(guān)程度的大小,而箭頭連線間的夾角代表環(huán)境因子間的相關(guān)性大小[15-16]。從圖2可見,第 1 象限與 NO-3-N、pH呈正相關(guān),與 TN、 NH4+-N、NH4OAC-K、SOM呈負(fù)相關(guān);第 2 象限與 EC、Olsen-P表現(xiàn)為正相關(guān);第 3 象限與 TN、 NH4+-N、NH4OAC-K、SOM表現(xiàn)出正相關(guān),與 NO-3-N、pH為負(fù)相關(guān);第 4 象限與EC、Olsen-P為負(fù)相關(guān)。其中,SOM與NO-3-N、EC與Olsen-P之間兩兩距離較近,說明在不同固氮菌群落分布的影響下,這兩組土壤環(huán)境因子兩兩之間的變異情況較為相似。從箭頭的連線長度可以看出影響土壤固氮菌群落的重要環(huán)境因子依次為SOM、NH4+-N、Olsen-P>TN>pH>NH4OAC-K>EC> NO-3-N。
表 4 CCA排序圖特征值及群落多樣性與環(huán)境的典型相關(guān)分析Table 4 Eigenvalues of CCA ordination diagram and correlations between special axes and environmental axes
固氮菌是一類植物根際促生細(xì)菌,不僅具有固氮、溶磷、解鉀等作用,還能分泌植物生長激素、抗生素類物質(zhì),促進(jìn)植物生長,在維持農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)健康穩(wěn)定、物質(zhì)轉(zhuǎn)換和能量流動等方面發(fā)揮著重要作用[17-18]。作為生態(tài)系統(tǒng)中一類重要的功能菌群,固氮菌的分布特征和數(shù)量通常與土壤氮、碳循環(huán)密切相關(guān),直接影響土壤肥力。Poly等[19-20]借助 RFLPPCR技術(shù)研究了植被覆蓋、土壤的管理制度以及土壤理化性質(zhì)對nifH基因群落結(jié)構(gòu)的影響,通過主成分分析發(fā)現(xiàn)管理制度是影響土壤nifH基因多樣性的主因,理化性質(zhì)和植被覆蓋的影響次之。Bannert等[22]運(yùn)用定量 PCR和T-RFLP技術(shù)研究了中國浙江慈溪地區(qū)潮灘濕地與水稻田土壤固氮菌數(shù)量和結(jié)構(gòu)的多樣性差異,結(jié)果表明,土壤pH的改變使得50 a稻齡水稻田的固氮菌數(shù)量比潮灘濕地大大增加。
圖2 固氮菌多樣性與土壤環(huán)境因子的CCA二維排序圖Fig. 2 Two dimensional ordination diagram of CCA of nitrogen microbial diversity and environmental variables
盡管固氮菌在不同生境中的群落結(jié)構(gòu)及其多樣性成為近年來國際上的研究熱點(diǎn),但在灘涂綠肥-水稻輪作這一特殊生境中固氮菌的相關(guān)研究還未見報(bào)道,對灘涂土壤綠肥-水稻輪作改良過程中固氮菌的分布和變化特征了解甚少,對其適應(yīng)和響應(yīng)機(jī)制的研究尚有待深入。本研究以灘涂土壤為研究對象,分析了灘涂紫云英-水稻輪作這一特殊生境中土壤剖面理化性質(zhì)、固氮菌群落結(jié)構(gòu)的變化及它們之間的關(guān)系,初步探討了固氮菌群落在紫云英-水稻輪作過程中對灘涂土壤改良所起到的作用。研究結(jié)果表明,經(jīng)過4年的連續(xù)紫云英-水稻輪作改良,土壤的理化性質(zhì)得到了一定的提高,土壤的有機(jī)質(zhì)含量增加、電導(dǎo)率和pH降低。受土壤理化性質(zhì)改善的影響,土壤固氮菌群落也有了積極的響應(yīng),生物量及多樣性增加,能夠促進(jìn)土壤氮素循環(huán)、活化土壤養(yǎng)分、提高土壤肥力和營養(yǎng)元素有效性,確保作物健康生長。因此,在固氮菌的根際促生調(diào)節(jié)功能下,通過紫云英-水稻輪作,土壤環(huán)境得到明顯的改良,而土質(zhì)的改良又能穩(wěn)定固氮菌的群落結(jié)構(gòu),提高土壤-作物-微生物之間的協(xié)同互作作用。
已有對不同生態(tài)系統(tǒng)土壤中固氮菌群落結(jié)構(gòu)組成的研究顯示,環(huán)境因子和種植制度對固氮菌群落結(jié)構(gòu)存在影響。相關(guān)研究表明通過種植綠肥來改良灘涂,可以疏松土壤,減輕板結(jié),增強(qiáng)土壤透水透氣性,減少表面土壤的積鹽,功能微生物的根際活動可以激活土壤中 CaCO3并加速其溶解,從而改善土壤理化性質(zhì)并加速土壤脫鹽[23-24]。紫云英-水稻輪作由于改良措施成本低、對環(huán)境擾動小、改良效果顯著的特征而被廣泛應(yīng)用于灘涂鹽堿地生態(tài)修復(fù)工程中。在本研究中,不同輪作方式對灘涂土壤環(huán)境有著不同的改良效果,對比水稻-休閑方式,水稻-紫云英輪作對10 ~20 cm土壤剖面中電導(dǎo)率、pH、固氮菌群落的改善作用最為顯著。兩種輪作方式下,土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)受環(huán)境因子變化的影響有較大差異,不同土壤剖面深度的固氮菌群落結(jié)構(gòu)也因受環(huán)境因子影響不同而存在差異。對土壤固氮菌群落影響較大的主要環(huán)境因子為有機(jī)質(zhì)、NH4+-N和有效磷。
1)灘涂改良過程中土壤理化性質(zhì)變化規(guī)律存在著一定差異。其中,總氮和NH4+-N的相關(guān)性最高,與pH、有效磷的相關(guān)性次之;EC與NO-3-N、有效磷之間的相關(guān)性較高;pH與速效鉀的典型相關(guān)性高于其他土壤環(huán)境因子。
2)水稻-紫云英輪作的土壤固氮菌豐富度指數(shù)高于水稻-休閑,采用水稻-紫云英輪作方式更能提高灘涂土壤0~10 cm和10~20 cm剖面中固氮菌的Shannon-Weaver 多樣性指數(shù)及其均勻度。
3)典范對應(yīng)分析表明,水稻-紫云英輪作方式與水稻-休閑方式下,灘涂土壤固氮菌群落結(jié)構(gòu)受環(huán)境因子變化的影響有較大差異,對土壤固氮菌群落影響較大的主要環(huán)境因子為有機(jī)質(zhì)、NH4+-N和有效磷。
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