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        采煤沉陷區(qū)草魚(yú)混養(yǎng)系統(tǒng)細(xì)菌數(shù)量變動(dòng)與區(qū)系組成研究

        2018-01-02 10:31:42柳炳俊
        科學(xué)與財(cái)富 2018年31期

        柳炳俊

        摘 要: 為了解采煤沉陷區(qū)不同草魚(yú)(Ctenopharyngodonidellus)混養(yǎng)模式區(qū)系組成,通過(guò)圍網(wǎng)養(yǎng)殖對(duì)3個(gè)不同混養(yǎng)模式的水體、底泥以及腸道內(nèi)區(qū)系組成進(jìn)行研究。結(jié)果表明,從各模式中分離出的菌株進(jìn)行16S rDNA序列分析,結(jié)果分屬于45個(gè)屬,其中水體中細(xì)菌多樣性高于底泥和腸道。不同模式之間比較,草魚(yú)單養(yǎng)模式弧菌比例最高,而草魚(yú)、鰱和鯉魚(yú)合理混養(yǎng)模式菌群Shannon-wieners多樣性指數(shù)最高(p<0.05),弧菌比例最低。這說(shuō)明草魚(yú)、鰱魚(yú)和鯉魚(yú)的三元合理混養(yǎng)能使系統(tǒng)中微生物的結(jié)構(gòu)和功能得到優(yōu)化,細(xì)菌群落的組成更趨于豐富化和多樣化。

        關(guān)鍵詞: 采煤沉陷;異養(yǎng)菌;弧菌;混養(yǎng);草魚(yú);鰱;鯉魚(yú)

        草魚(yú)(Ctenopharyngodon idella)是四大家魚(yú)之一,是我國(guó)淡水養(yǎng)殖產(chǎn)量最大的一個(gè)種,在淡水養(yǎng)殖中占有重要地位[1]。目前,全國(guó)大部分地區(qū)都能養(yǎng),2016年我國(guó)的草魚(yú)養(yǎng)殖產(chǎn)量是589.88萬(wàn)噸,占淡水魚(yú)養(yǎng)殖總產(chǎn)量的20.45%。然而,對(duì)草魚(yú)的研究已涉及到生態(tài)養(yǎng)殖、病害防治、微生態(tài)制劑等多個(gè)方面,但是,草魚(yú)養(yǎng)殖過(guò)程中仍然遭受細(xì)菌、病毒和寄生蟲(chóng)等引發(fā)各種各樣的疾病,這些都制約草魚(yú)集約化養(yǎng)殖發(fā)展[2]。本研究將系統(tǒng)的研究草魚(yú)養(yǎng)殖體系中水、底泥和草魚(yú)腸道內(nèi)微生物群落組成及其多樣性,了解致病菌比例,探索草魚(yú)混養(yǎng)模式,為草魚(yú)病害的防治提供理論基礎(chǔ)和現(xiàn)實(shí)意義。

        1 材料與方法

        1.1放養(yǎng)情況

        1.2

        1.3 16S rDNA細(xì)菌鑒定

        PCR模板的制備即煮沸法[3],16S rDNA擴(kuò)增正向引物27F:5-AGAGTTTGATCCTGG CTCAG-3,反向引物1492R:5-GGTTACCTTGTTACGACTT-3。 PCR產(chǎn)物送上海生工進(jìn)行測(cè)序,獲得的序列用Blast程序與數(shù)據(jù)庫(kù)中已存在的細(xì)菌16S rDNA核酸序列進(jìn)行比對(duì),對(duì)菌株定屬。

        2 結(jié)果

        本研究從養(yǎng)殖水體中共分離得到279株菌,分屬于41個(gè)屬。其中,草魚(yú)單養(yǎng)模式的優(yōu)勢(shì)菌屬為弧菌屬(Vibrio)、芽孢桿菌屬(Bacillus)和短波單胞菌屬(Brevundimonas),分別占的21.74%、14.51%和10.01%;草魚(yú)和鰱魚(yú)二元混養(yǎng)模式的優(yōu)勢(shì)菌屬依次為弧菌屬、短波單胞菌屬和鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium),其比例分別為18.92%、13.96%和10.11%;草魚(yú)、鰱魚(yú)、鯉魚(yú)三元混養(yǎng)模式的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為芽孢桿菌屬、弧菌屬和不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter),其比例分別為12.28%、10.90%和9.52%。不難看出,弧菌屬為各養(yǎng)殖模式水體中共有的優(yōu)勢(shì)種,其中單養(yǎng)模式中比例最高,為21.74%,三元混養(yǎng)模式的比例最低,為12.28%。

        從養(yǎng)殖底泥中分離出287株菌,分屬于33個(gè)屬。其中,單養(yǎng)模式中的優(yōu)勢(shì)菌屬分別是芽孢桿菌屬、弧菌屬和假單胞菌屬,其比例分別為21.83%、19.12%和15.22%;二元混養(yǎng)模式優(yōu)勢(shì)屬依次為芽孢桿菌屬、弧菌屬和假單胞菌屬,其比例分別為22.24%、14.15%和12.13%;在三元混養(yǎng)模式中芽孢桿菌屬、假單胞菌屬和奈瑟菌屬(Neisseria)為優(yōu)勢(shì)菌種,其比例分別為20.18%、12.75%和11.38%。從三個(gè)模式致病菌弧菌屬所占比例分析,以草魚(yú)單養(yǎng)模式比例較高,占到19.31%,三元混養(yǎng)模式最低,為6.63%。

        從各模式草魚(yú)腸道中共分離出225株菌,分屬于28個(gè)屬。其中,草魚(yú)單養(yǎng)模式優(yōu)勢(shì)屬分別是弧菌屬、芽孢桿菌屬和葡萄球菌屬(Staphylococcus),所占比例其為44.78%、10.58%和8.78%;草魚(yú)和鰱二元混養(yǎng)模式優(yōu)勢(shì)菌屬依次為弧菌屬、芽孢桿菌屬和黃桿菌屬(Flavobacterium),其比例分別為29.88%、18.56%和8.59%;而芽孢桿菌屬、弧菌屬和氣單胞菌屬(Aeromonas)為草魚(yú)、鰱魚(yú)和鯉魚(yú)三元混養(yǎng)模式的優(yōu)勢(shì)菌屬,其比例分別為16.12%、14.33%和9.15%。各模式弧菌屬所占比例為,草魚(yú)單養(yǎng)模式最高,達(dá)到了44.78%,而三元混養(yǎng)模式最低,為14.33%。

        3 結(jié)論

        眾所周知,草魚(yú)為活動(dòng)在水體中下層以草為食的雜食性魚(yú)類,鰱魚(yú)喜歡生活在水體中上層,是典型以濾食藻類為食的魚(yú)類,而鯉魚(yú)為水體底部的雜食性魚(yú)類,有重要的擾動(dòng)作用。通過(guò)三種魚(yú)類的生態(tài)位不同,將三種魚(yú)類混養(yǎng),旨在探索一種科學(xué)的養(yǎng)殖模式。本研究結(jié)果表明,將三者混養(yǎng),不僅可以在生態(tài)位上達(dá)到互補(bǔ),充分利用水體空間,而且有利于促進(jìn)養(yǎng)殖環(huán)境中微生物的多樣性,優(yōu)化菌群結(jié)構(gòu)。三個(gè)模式之間綜合比較,草魚(yú)、鰱魚(yú)和鯉魚(yú)混養(yǎng)三元模式細(xì)菌多樣性顯著高于其它兩個(gè)模式(p<0.05);不論水體、底泥還是草魚(yú)腸道,草魚(yú)、鰱和鯉魚(yú)三元混養(yǎng)模式中弧菌比例為最低,而草魚(yú)單養(yǎng)模式則為最高或較高。同時(shí),草魚(yú)單養(yǎng)模式中弧菌屬、葡萄球菌屬、氣單胞菌屬和假單胞菌屬在水體、底泥和草魚(yú)腸道中均占比較大比例,而這些菌屬大多是條件致病菌。通過(guò)研究我們了解到,養(yǎng)殖期間草魚(yú)單養(yǎng)模式中草魚(yú)的死亡率要明顯高于其兩個(gè)模式,盡管引起草魚(yú)死亡的確切原因需進(jìn)一步研究,但本研究從某種程度上證明了草魚(yú)、鰱和鯉魚(yú)按照一定比例混養(yǎng)能優(yōu)化環(huán)境菌群區(qū)系,促進(jìn)了系統(tǒng)中的物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng),具有在理論上的合理性和實(shí)踐上的優(yōu)越性。

        參考文獻(xiàn)

        [1]Wu S, Ren Y, Peng C, et al. Metatranscriptomic discovery of plant biomass-degrading capacity from grass carpintestinal microbiomes [J]. FEMS Microbiology Ecology,2015, 91(10): 107-111.

        [2]黃燦,張忠海等.益生芽孢桿菌對(duì)草魚(yú)腸黏膜結(jié)構(gòu)的保護(hù)作用[J].水生生物學(xué)報(bào),2017,41(4):774-775.

        [3]陽(yáng)桂丹,張巨源,陳雯莉. 模板制備方法的改進(jìn)[J]. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2016,35(6):44-51.

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