趙 琳,李 萌,羅 靜,王承民,王玉田,趙寶華,何宏軒*
(1.河北師范大學(xué),河北石家莊 050024;2.中國科學(xué)院動物研究所,北京 100101;3.北京畜牧總站,北京 100101)
綿羊痘病毒的檢測與遺傳進(jìn)化分析
趙 琳1,2,李 萌2,羅 靜2,王承民2,王玉田3,趙寶華1*,何宏軒2*
(1.河北師范大學(xué),河北石家莊 050024;2.中國科學(xué)院動物研究所,北京 100101;3.北京畜牧總站,北京 100101)
羊痘是全球最嚴(yán)重的動物傳染性痘病。近年來,羊痘病毒在非洲北部和中部、中東、亞洲大部分地區(qū)廣泛流行,給養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。論文對4只疑似羊痘病毒感染綿羊進(jìn)行診斷,通過臨床觀察,病理剖檢,病理組織學(xué)觀察,實驗室檢測,確定該病為綿羊痘,并對分離的病毒主要基因進(jìn)行PCR擴增及遺傳進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)此毒株屬于亞洲系,且我國流行株基因比較穩(wěn)定,變異不大。這不僅為綿羊痘病的診斷提供了技術(shù)手段,還豐富了我國羊痘病毒感染的流行病學(xué)資料,為進(jìn)一步研究羊痘病毒的變異等提供數(shù)據(jù)支持。
羊痘;臨床癥狀;病理組織學(xué)檢查;PCR擴增;進(jìn)化分析
羊痘病毒(Capripox virus,CaPV)屬于痘病毒科(Poxviridae),羊痘病毒屬[1]。羊痘是由羊痘病毒引起的一種高致病動物源性傳染病,是所有動物痘病中最嚴(yán)重的一種,其發(fā)病率高達(dá)50%,病死率可達(dá)100%。臨床上,羊痘包括山羊痘(Goat poxvirus,SPP)、綿羊痘(Sheep poxvirus,GTP)和牛結(jié)節(jié)性疹(Lumpy skin disease,LSDV)等幾種類型,主要通過皮膚接觸、呼吸道和蚊蟲叮咬在牛、羊等動物之間傳播[2],以發(fā)熱、全身皮膚和內(nèi)臟痘狀病變及淋巴結(jié)腫大為特征[3],受感染的羊群極易流產(chǎn),產(chǎn)奶量、體重、毛品質(zhì)大大降低,給養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響國際貿(mào)易和養(yǎng)羊業(yè)的發(fā)展[4]。
羊痘最早報道于13世紀(jì)的英國,后來陸續(xù)在世界其他地區(qū)發(fā)現(xiàn),現(xiàn)在主要分布在亞洲、非洲、歐洲部分地區(qū)和印度次大陸[5]。近年來,我國的西北、華南、華中等地羊痘分布廣泛,且部分地區(qū)呈暴發(fā)性流行[6]。
羊痘的主要防控措施包括早期診斷、撲殺感染動物或與其接觸緊密的動物、限制動物的遷移范圍、檢疫和消毒、疫苗免疫等。其中疫苗免疫是最有效控制羊痘傳播的方法,相應(yīng)的弱毒苗可以成功防控羊痘的大規(guī)模暴發(fā)[7]。目前由于缺乏免費的、持續(xù)的接種疫苗的措施,以及無效的流動限制,造成了羊痘傳播難以控制[8]。
本研究通過對患病綿羊的臨床癥狀、病理觀察,分子生物學(xué)檢測及進(jìn)化分析一例綿羊痘暴發(fā)情況,不僅豐富我國羊痘病毒感染的流行病學(xué)資料,為羊痘病毒的變異等提供數(shù)據(jù)支持,同時為羊痘的診斷和防控提供理論依據(jù)。
1.1.1 樣品處理 通過對北京市畜牧總站提供的患病綿羊的臨床觀察,懷疑該患病綿羊為羊痘病毒感染。在生物安全柜中無菌采集病畜內(nèi)臟,皮膚等病變明顯部位。
1.2.1 臨床觀察 通過獸醫(yī)臨床診斷對患病羊進(jìn)行體溫,呼吸,脈搏和臨床癥狀進(jìn)行觀察,同時對患病綿羊進(jìn)行剖檢,觀察其內(nèi)臟器官的病理變化,并進(jìn)行記錄。
1.2.2 病理診斷 用100 mL/L福爾馬林對患病綿羊的皮膚、胃、肺等組織進(jìn)行固定,制作病理組織切片,進(jìn)行觀察。
1.2.3 分子生物學(xué)診斷 采集綿羊患病組織,用研磨器研磨,加入滅菌的磷酸緩沖鹽溶液(phosphate-buffered saline,PBS)制成組織懸液,反復(fù)凍融2次~3次,取上清,使用北京科龍生物醫(yī)學(xué)技術(shù)有限公司的病毒基因組提取試劑盒提取病毒的基因組DNA,提取步驟按照試劑盒說明書進(jìn)行。參照文獻(xiàn)[9]中羊痘病毒基因設(shè)計引物,由華大基因合成,進(jìn)行特異性檢測,10 g/L的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,用紫外檢測儀觀察PCR擴增結(jié)果。引物序列如下:SPPV-F:5′-GCCAGGAACTTTATATTCG- ATG-3′;GTPV-F:5′-GATATAGAATAGGGC- TAGTTGCAG-3′; SPPV(GTPV)-R:5′-CATCAAAAATGACATCTACATATATAGC-3′。
PCR反應(yīng)體系為50 μL,即2×Taqmix 25 μL,模板(病毒提取的基因)2 μL,引物F、R各1 μL,補超純水至50 μL。反應(yīng)條件為:95℃ 5 min;95℃ 30 s,63℃ 30 s,72℃,30 s,35個循環(huán);72℃ 7 min。
1.2.4 遺傳進(jìn)化分析 選取羊痘病毒RNA聚合酶亞基(RNA polymerase subunit,RPO30)和G蛋白偶聯(lián)趨化因子受體(G-protein-coupled receptors,GPCR)基因進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,參照Chen[1]文獻(xiàn),設(shè)計特異性引物,由華大基因合成。引物序列如下:RPO30-F:5′-CTC TGT TCC AAA CTA AAT CAT-3′;RPO30-R:5′-TTT TTG TAT TAC CAA TTT CTG-3′;GPCR-F:5′-TTT ATC AGC ACT AGG TCA TTA TCT-3′; GPCR-R:5′-TAT CAC TCC CTT CCA TTT TTA T-3′。
PCR反應(yīng)體系為50 μL,即2×Taqmix 25 μL,模板(病毒提取的基因)2 μL,引物F、R各1 μL,補超純水至50 μL。反應(yīng)條件為:95℃ 5 min;95℃ 30 s,53℃ 30 s,72℃ 1 min,35個循環(huán);72℃ 10 min。
將擴增的RPO30、GPCR基因送華大基因公司測序,其他羊痘病毒的RPO30、GPCR基因序列通過GenBank獲取,然后利用Clustal W比對這些序列,并通過MEGA 5程序以Hasegawa-Kishino-Yano和Tajima-Nei模型構(gòu)建Maximum Likelihood進(jìn)化樹,進(jìn)化樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)以1 000的Bootstrap進(jìn)行分析。
通過臨床癥狀觀察,發(fā)現(xiàn)發(fā)病綿羊具有以下的共同臨床特征:體溫升高,脈搏和呼吸加速,精神萎靡,廢食,喜臥。眼結(jié)膜潮紅、腫脹、鼻液黏稠。部分病羊無毛或毛少的部位出現(xiàn)紅色圓形斑點,有的已經(jīng)變成黃豆或蠶豆大的丘疹,觸感較硬,甚至結(jié)痂成黑色(圖1A),或破潰脫痂,形成紅色潰瘍(圖1B)。進(jìn)一步對病死綿羊剖檢觀察,發(fā)現(xiàn)患病綿羊的主要病變集中于胃部和肺部。具體來說,胃漿膜上出現(xiàn)了大量的黃豆粒乃至扁豆大的白色結(jié)節(jié),觸感堅硬,突出表面(圖1C)。肺部表面亦有多量灰白色豌豆大小的痘斑,突出表面,觸感堅硬,同時肺部局部嚴(yán)重出血 (圖1D)。其余部位,如心、肝、脾、腸等部位未見明顯異常,以上病變均為綿羊痘的典型病理變化。
根據(jù)臨床癥狀及剖檢變化,初步懷疑病、死綿羊源于羊痘病毒感染。為進(jìn)一步驗證我們的判斷,我們?nèi)〉湫筒∽儾课徊〗〗唤缣幗M織,制作病理切片,通過HE染色,鏡檢,我們發(fā)現(xiàn)病死綿羊肺泡內(nèi)多量炎性細(xì)胞滲出,肺泡壁明顯增生,肺泡結(jié)構(gòu)消失(圖2A);肺出血、水腫(圖2B);在皮下組織出現(xiàn)多量炎性細(xì)胞滲出、聚集,此外皮膚結(jié)節(jié)典型的組織病理變化(圖2C)。
A.口鼻部位結(jié)痂;B.尾部痘疹、潰瘍;C.胃部多量結(jié)節(jié);D.肺結(jié)節(jié)及出血 A.Scab on mouth and nose; B.Pox on tail; C.Nodules in stomach; D.Nodules and hemorrhage in lungs
A.肺泡壁增生;B.肺水腫;C.皮膚結(jié)痂 A.Thickened alveolar walls; B.Pulmonary edema ; C.Scab on skin
根據(jù)剖檢癥狀及組織病理學(xué)觀察,初步診斷病、死綿羊為羊痘病毒感染。之后,采集典型病變部位病健交界處組織,提取病毒基因組DNA,進(jìn)一步驗證羊痘病毒。設(shè)計羊痘病毒特異性引物對樣品進(jìn)行分子生物學(xué)檢測。結(jié)果顯示(圖3),綿羊的肺和皮膚組織的基因檢測產(chǎn)生條帶均為293 bp和133 bp,與預(yù)期條帶大小一致[9],表明病羊確屬羊痘病毒感染。
M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000 ;1.肺;2.皮膚;3.胃
M.DNA Marker DL 2 000; 1.Lung; 2.Skin; 3.Stomach
圖3綿羊痘病毒基因PCR擴增結(jié)果
Fig.3 PCR amplification of sheep poxvirus gene
通過對病、死羊的臨床觀察、病理學(xué)檢查和分子生物學(xué)檢測,確診該致病毒株為羊痘病毒。為了分析此株羊痘病毒的遺傳進(jìn)化關(guān)系,對羊痘病毒GPRC基因和RPO30基因進(jìn)行擴增。Blast比對分析發(fā)現(xiàn)此毒株的GPCR基因和RPO30基因與已報道的羊痘病毒基因的同源性很高,分別為95%~99%和93%~96%。
基于此毒株的RPO30和GPCR基因序列使用MEGA5軟件構(gòu)建進(jìn)化樹,2個進(jìn)化樹均顯示相同的拓?fù)浼軜?gòu),即羊痘病毒分為3個主要的分支,即LSDV、SPPV、GTPV。本研究分離到的毒株與SPPV屬于同一個分支,并且都聚集在了亞洲系(圖4和圖5)。系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系發(fā)現(xiàn)本研究分離毒株與中國其他地方報道的綿羊痘病毒進(jìn)化關(guān)系較近,表明目前我國SPPV的流行株比較穩(wěn)定,基因的變異不大。
“●”為本試驗分離毒株序列 “●”Represents the isolate of this study
“●”為本試驗分離毒株序列 “●”Represents the isolate of this study
羊痘是一個古老的動物疫病,1879年Hanse在挪威首次報道羊痘病毒[10]。之后在一戰(zhàn)期間,馬其頓發(fā)生暴發(fā)性羊痘流行病,病死率高達(dá)15%[11]。目前這種疾病主要發(fā)生在亞洲、非洲和歐洲,但是在世界其他地方也有報道,流行較為嚴(yán)重。羊痘被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)列為法定報告的傳染病,我國將其列為一類動物疫病,可造成羊群大批死亡[12]。
羊痘病毒傳播快,病死率高,大多是通過呼吸道進(jìn)入宿主,且大部分感染是由于直接或間接接觸病畜。羊痘的傳播方式還包括皮膚的摩擦和昆蟲的接觸,如廄螫蠅和舌蠅[13]?;疾游锏闹饕R床癥狀一般為高熱、厭食、呼吸困難、鼻腔和眼有黏液膿性排出物,偶發(fā)腹瀉,在病畜的眼、鼻、嘴、耳和腹部也會有皮膚損傷和結(jié)痂等。所有品種、性別和年齡的羊群均可感染羊痘,羔羊較成齡羊敏感,病死率高,該病主要流行于冬末春初,寒冷、潮濕、飼料營養(yǎng)水平低下和管理不當(dāng)?shù)纫蛩乜纱偈拱l(fā)病或加重病癥,并且對養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)效益及養(yǎng)殖者身體安全均有較大危害[14]。
羊痘病毒可分為綿羊痘病毒(SPPV)、山羊痘病毒(GTPV)和牛結(jié)節(jié)性疹病毒(LSDV),病毒的感染一般為特異性,但后來的研究發(fā)現(xiàn)它們之間也存在交叉感染,且它們的臨床癥狀都是由發(fā)熱發(fā)展為皮膚斑疹,使得初始診斷很容易,然而區(qū)分這3種病毒卻很困難[15]。隨著遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的發(fā)展,研究發(fā)現(xiàn)羊痘病毒的GPCR基因可以抵御宿主的炎癥免疫反應(yīng)[16-17],其RPO30基因和牛痘病毒E4L同源,可以編碼一個30 ku的RNA聚合酶亞基,這兩個基因都可以用來區(qū)分SPPV和GTPV和LSDV[18-19]。因此本研究通過對病畜中分離的病毒GPCR、RPO30這兩個基因進(jìn)行PCR擴增及遺傳進(jìn)化分析,確診此毒株為SPPV,屬于亞洲系。
綿羊痘是家畜痘病中最為嚴(yán)重的一種,該病經(jīng)常引起綿羊的大批感染或死亡,病死率可達(dá)100%[20],不僅給養(yǎng)羊業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失,還嚴(yán)重阻礙了養(yǎng)羊業(yè)的發(fā)展。本研究憑借遺傳分析對該病毒重要基因進(jìn)行分子進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)該毒株屬于SPPV,與中國報道的毒株關(guān)系較近,表明我國的SPPV的流行毒株未發(fā)生大的基因變異。這不僅為羊痘感染的流行病學(xué)積累資料,同時為進(jìn)一步研究羊痘病毒的變異等提供數(shù)據(jù)支持。
[1] Zhou T,Jia H,Chen G,et al.Phylogenetic analysis of Chinese sheeppox and goatpox virus isolates[J].Virol J,2012,9(1):25-28.
[2] Tian H,Chen Y,Wu J,et al.Serodiagnosis of sheeppox and goatpox using an indirect ELISA based on synthetic peptide targeting for the major antigen P32[J].Virol J,2010,7(1):245-248.
[3] 施程洪,蘭虎云,朱明旺,等.羊痘病毒的研究進(jìn)展[J].中國獸藥雜志,2014,48(9):61-65.
[4] Bandyopadhyay S K,Rao T V S.A comprehensive review of goat pox and sheep pox and their diagnosis[J].Animal Health Res Rev,2000,1(2):127-136.
[5] 史宗勇,史新濤,袁建琴,等.羊痘研究進(jìn)展[J].中國畜牧獸醫(yī),2011,38(1)186-188.
[6] 顏新敏,吳國華,李 健,等.羊痘在中國的流行現(xiàn)狀分析[J].中國農(nóng)學(xué)通報,2010,26(24):6-9.
[7] Carn V.Control of capripoxvirus infections [J].Vaccine,1993,11(13):1275-1279.
[8] 劉 霞.羊痘防控難點及綜合防治理念[J].中國畜牧獸醫(yī),2016,32(5):167.
[9] Venkatesan G,Balamurugan V,Bhanuprakash V.Multiplex PCR for simultaneous detection and differentiation of sheeppox,goatpox and orf viruses from clinical samples of sheep and goats[J].J Virol Meth,2014,195(1):1-8.
[10] Rafyi A,Ramyar H.Goat pox in Iran:serial passage in goats and the developing egg,and relationship with sheep pox[J].J Comp Pathol Therapeutics,1959,69(2):141-147.
[11] Blanc G,Melanidi C,Stylianopoulo M.Variola in goat in Greece[J].Cited Tropic Vet Bull,1929,17(2):129-140.
[12] 康文玉,徐自忠,高 洪,等.羊痘病毒[J].中國畜牧獸醫(yī),2004,31(12):33-36.
[13] Tuppurainen E S,Venter E H,Shisler J L,et al.Review:Capripoxvirus diseases:current status and opportunities for control[J].Transb Emerg Dis,2015,63(1).
[14] 楊 軍.綿羊痘和山羊痘的防治[J].草業(yè)與畜牧,2012(8):54-55.
[15] Babiuk S,Bowden T R,Boule D B,et al.Capripoxviruses:an emerging worldwide threat to sheep,goats and cattle[J].Transb Emerg Dis,2008,55(7):263-272.
[16] Chensue S W.Molecular machinations:chemokine signals in host-pathogen interactions[J].Clin Microbiol Rev,2001,14(4):821-835.
[17] Seet B T,McFadden G.Viral chemokine-binding proteins[J].J Leukocyte Biol,2002,72(1):24-34.
[18] Ahn B Y,Gershon P D,Jones E V,et al.Identification of rpo30,a vaccinia virus RNA polymerase gene with structural similarity to a eucaryotic transcription elongation factor[J].Mol Cell Biol,1990,10(10):5433-5441.
[19] Tulman E R,Afonso C L,Lu Z,et al.The genomes of sheeppox and goatpox viruses[J].J Virol,2002,76(12):6054-6061.
[20] Bhanuprakash V,Indrani B K,Hosamani M,et al.The current status of sheep pox disease[J].Comp Immunol Microbiol Infect Dis,2006,29(1):27-60.
2017-02-27
中國科學(xué)院戰(zhàn)略生物資源科技支撐體系運行專項(CZBZX-1)
趙 琳(1990-),女,河北保定人,碩士研究生,主要從事動物疫病研究。*
S852.654
A
1007-5038(2017)12-0009-06