李文濱,馮 雷,宋 偉,羅 健,畢文雙,劉 月,徐玲秀,趙 雪
大豆脂肪酸含量積累動(dòng)態(tài)及亞麻酸代謝候選基因篩選
李文濱,馮 雷,宋 偉,羅 健,畢文雙,劉 月,徐玲秀,趙 雪
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆研究所,大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)業(yè)部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150030)
大豆脂肪酸5種組分中亞麻酸含量是影響大豆品質(zhì)主要因素之一,與其他4種脂肪酸比例直接影響大豆油脂品質(zhì)特性及貯運(yùn)加工,大豆油具有適宜亞油酸與亞麻酸比例。文章通過高效氣相色譜法對(duì)品種‘合豐25’(高亞麻酸含量品種,5.94%)與加拿大穩(wěn)定品系‘L-5’(低亞麻酸含量品種,2.75%)及其組配重組自交系群體中選取高/低亞麻酸品系各2份,盆栽試驗(yàn)分析脂肪酸組分及含量。結(jié)合KEGG中大豆脂肪酸代謝途徑篩選與不飽和脂肪酸代謝相關(guān)候選基因,對(duì)篩選RIL群體后代品系發(fā)育各時(shí)期作實(shí)時(shí)定量PCR,分析其在‘合豐25’和‘L-5’及后代品系中表達(dá)模式。結(jié)果表明,相同基因在不同品種之間對(duì)亞麻酸含量調(diào)控機(jī)制不同,不同時(shí)期基因表達(dá)量對(duì)亞麻酸積累量具有不同程度影響。研究結(jié)果為探索大豆亞麻酸積累規(guī)律及其候選基因影響,選育理想脂肪酸組分比例大豆新品種提供參考。
大豆;脂肪酸;氣相色譜;實(shí)時(shí)定量PCR
大豆是重要油料作物之一,是食用植物油主要來源[1-2]。大豆脂肪酸組分配比直接影響大豆油脂營養(yǎng)價(jià)值及貯運(yùn)加工等環(huán)節(jié),為決定大豆油脂品質(zhì)最重要因素[3-4]。大豆脂肪酸由5種脂肪酸組成,包括飽和脂肪酸:棕櫚酸、硬脂酸;不飽和脂肪酸:油酸、亞油酸、亞麻酸[5-7]。飽和脂肪酸無不飽和鍵,能量低、不易被人體消化吸收,利于大豆油貯存,不飽和脂肪酸以亞油酸為主(約55%),含有兩個(gè)雙鍵,易于吸收,是人體必需脂肪酸[8];亞麻酸(C18∶3)因高度不飽和性易使大豆油氧化變質(zhì),營養(yǎng)價(jià)值低[9]。因此,降低大豆脂肪酸組分中亞麻酸含量成為重要育種目標(biāo)之一。
大豆脂肪酸遺傳受多基因控制且易受環(huán)境影響[10-12],脂肪酸組分含量遺傳涉及主效基因和多基因[13],亞麻酸含量主效基因遺傳率低,棕櫚酸、硬脂酸、油酸和亞油酸主效基因遺傳率均在70%以上[14-15]。Tang等分離獲得5個(gè)FAD2基因拷貝[16]。Δ15-脂肪酸脫氫酶(FAD3),為一種微粒體ω-3脫氫酶,是決定亞麻酸產(chǎn)量關(guān)鍵酶,Li等從大豆基因組中克隆并分離出4個(gè)編碼亞麻酸脫氫酶功能基因,與低亞麻酸含量密切相關(guān)[17]。Δ12-脂肪酸脫氫酶(FAD2),是決定亞油酸含量關(guān)鍵酶[18]。傳統(tǒng)育種方法改良大豆脂肪酸遺傳進(jìn)展緩慢。目前,國內(nèi)外大豆育種家利用分子標(biāo)記挖掘多個(gè)與大豆油酸和亞麻酸含量相關(guān)QTL[19-21]。宋萬坤等采用QTL元分析方法獲得定位在10個(gè)連鎖群上19個(gè)QTLs[22],鄒筱等利用QTL定位發(fā)現(xiàn)11個(gè)與油酸、亞麻酸相關(guān)標(biāo)記[23],南金平等利用回交導(dǎo)入系群體檢測(cè)到47個(gè)QTLs[24],但大豆各發(fā)育時(shí)期亞麻酸積累及相關(guān)基因各時(shí)期表達(dá)量分析鮮見報(bào)道。
本研究通過高效氣相色譜法對(duì)品種‘合豐25’(高亞麻酸含量品種,5.94%)與加拿大穩(wěn)定品系‘L-5’(低亞麻酸含量品種,2.75%)及其組配重組自交系群體中選取高/低亞麻酸品系各2份,通過盆栽試驗(yàn)分析脂肪酸組分、含量及相關(guān)性,同時(shí)篩選具代表性高/低亞麻酸含量大豆品系,分析不同生育時(shí)期亞麻酸含量動(dòng)態(tài)變化,結(jié)合KEGG數(shù)據(jù)庫中大豆脂肪酸代謝途徑篩選與不飽和脂肪酸代謝相關(guān)基因,分析其表達(dá)模式,為探索大豆亞麻酸積累規(guī)律及選育理想脂肪酸組分比例大豆新品種提供參考。
合豐25(高亞麻酸含量品種,5.94%)、加拿大穩(wěn)定品系L-5(低亞麻酸含量品種,2.75%)、雜交組配RIL重組自交系群體F7代。
1.2.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
試驗(yàn)于2015年在東北農(nóng)業(yè)大學(xué)向陽試驗(yàn)實(shí)習(xí)基地進(jìn)行,從檢測(cè)群體中選取高/低亞麻酸品系,高亞麻酸品系JY182、JY142,低亞麻酸品系JY20、JY83作盆栽試驗(yàn),定期定量澆水,施肥,生長(zhǎng)條件一致環(huán)境下發(fā)育至成熟。盆栽材料定期取樣,測(cè)定亞麻酸含量,分析籽粒中亞麻酸積累動(dòng)態(tài),作熒光定量分析。
1.2.2 儀器試劑
Trizol試劑、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、RT-PCR試劑盒SYBR?ExScriptTM RT-PCR Kit、DNA Marker購自天根公司;抗壞血酸購自天津市瑞金特化學(xué)品有限公司;DEPC處理水購自上海生工;LightCycler 480系統(tǒng)96孔板、安捷倫N6980氣相色譜儀購自美國安捷倫公司;LightCycler 480 Sealing Foil購自自羅氏診斷公司;電泳瓊脂糖購自西班牙;Light ABI Prism 7500 SDS購自美國;熒光定量PCR儀、低溫冷凍離心機(jī)和臺(tái)式高速低溫離心機(jī)購自Beckman公司;三洋-80℃超低溫冰箱購自日本;-20℃低溫冰箱,超凈工作臺(tái)等。
1.2.3 取樣方法
自始粒期R5開始,每7 d取一次樣,幼莢(R5)直至完熟期(R8),取樣10次,每株僅取樣一次,第1~2次取樣對(duì)應(yīng)始粒期,第3~6次取樣對(duì)應(yīng)鼓粒期,第7~8次取樣對(duì)應(yīng)黃熟期,第9~10次取樣對(duì)應(yīng)完熟期。從主莖頂端第二、三個(gè)節(jié)位取樣,樣品分兩份,一份于105℃烘箱殺青5 min后,50℃烘箱烘干至恒重,測(cè)定籽粒亞麻酸組分含量;另一份樣品莢皮與籽粒迅速分開放入-80℃冰箱保存,提取RNA,作熒光定量分析,檢測(cè)已篩選出與亞麻酸代謝相關(guān)基因各時(shí)期表達(dá)量,參照文獻(xiàn)[24-26]方法。
1.2.4 樣品脂肪酸提取及提取方法
各時(shí)期待測(cè)樣品大豆籽粒,去除雜質(zhì),每個(gè)樣品取5~10粒,粉碎并通過0.25 mm孔徑樣品篩,稱取0.5 g豆粉,加入10 mL離心管中,向離心管中加入5 mL 1%甲醇-氫氧化鈉溶液,斡旋震蕩15 s,充分混勻,靜置30 min。向離心管中滴入5滴10%乙酸,加入3 mL正庚烷,充分震蕩。靜置2 min,吸取上清液,經(jīng)過濾滅菌器過濾,取1.5 mL上機(jī)測(cè)定。進(jìn)樣1 μL,乙酸乙酯沖洗微量進(jìn)樣器。樣品脂肪酸提取方法參照文獻(xiàn)[4]。
1.2.5 樣品脂肪酸測(cè)定
研究所用材料RIL群體為大田取樣,群體第7代及親本為盆栽取樣。采用安捷倫N6980氣相色譜儀測(cè)定樣本脂肪酸含量,脂肪酸組分?jǐn)?shù)值計(jì)算參照文獻(xiàn)[27-29]方法。
1.2.6 熒光定量分析
1.2.6.1 候選基因篩選與引物設(shè)計(jì)
根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫中大豆脂肪酸代謝途徑篩選與脂肪酸代謝相關(guān)基因[30-32],依據(jù)基因注釋及前人報(bào)道,選擇與脂肪酸代謝相關(guān)基因(見表1)作實(shí)時(shí)熒光定量分析。篩選出基因設(shè)計(jì)引物,根據(jù)引物設(shè)計(jì)原則選擇實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物。數(shù)據(jù)分析采用2-ΔΔCt法作相對(duì)定量分析,計(jì)算過程:分別計(jì)算每組ΔΔCt=ΔCt目的基因-ΔCt內(nèi)參基因,根據(jù)ΔΔCt求出2-ΔΔCt。采用 Light cycler480 羅氏熒光定量?jī)x作實(shí)時(shí)熒光定量PCR。熒光定量程序;94℃,2 min,94℃、30 s,60℃,30 s,72℃,30 s,72℃,10 min,38個(gè)循環(huán)。
表1 篩選出基因及對(duì)應(yīng)引物Table 1 The screened genes and the corresponding primers
1.2.6.2 待測(cè)樣品RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
按照RNA提取試劑盒說明書操作提取RNA。將各時(shí)期待測(cè)樣在液氮中研磨后加入1 mL Trizal混勻振蕩,室溫下靜置5 min使樣品RNA與其他物質(zhì)分離,再加入200 μL氯仿渦旋振蕩,充分乳化,使蛋白質(zhì)與RNA分離,室溫靜置5 min后,1 2000 r·min-1, 4 ℃離心15 min,吸上清液600 μL于新管中,加入等體積異丙醇混勻,室溫靜置10 min,使RNA沉淀,12 000 r·min-1,4℃離心10 min后去上清液,加入1 mL 75%乙醇清洗,進(jìn)一步提純。離心干燥,加入DEPC水溶解RNA。樣品RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA保存,供熒光定量使用。
樣品表型值采用SPASS17.0作統(tǒng)計(jì)分析。
對(duì)2015年收獲180份RIL群體后代作氣相色譜分析,測(cè)量后代脂肪酸各組分含量(見表2)。根據(jù)亞麻酸含量結(jié)果篩選JY142與JY182兩份材料作為亞麻酸高值載體,JY20與JY83兩份材料為亞麻酸低值載體作盆栽試驗(yàn)。
表2 RILL群體后代中亞麻酸高/低值載體篩選結(jié)果Table 2 RILL group of descendants of linolenic acid high/low value carrier screening results
由圖1可知,棕櫚酸與硬脂酸在始粒期(R5期)合成,積累量逐漸降低,在鼓粒期(R6期)至完熟期(R8期)積累量降到最低,合成總量基本保持不變;始粒期(R5期)油酸積累量逐漸上升,鼓粒期(R6期)大豆籽粒中油酸組分積累量除合豐25以外持續(xù)上升,其他材料油酸積累量下降,鼓粒后期合豐25積累量與其他材料同時(shí)下降,完熟期(R8期)降到最低;亞油酸積累量始粒期(R5期)至完熟期(R8期)一直上升。鼓粒期,合豐25與JY20亞油酸積累量出現(xiàn)波動(dòng)。始粒期亞麻酸積累量最高,始粒期后逐漸降低,成熟期開始趨于平穩(wěn),完熟期亞麻酸積累量保持不變,鼓粒期合豐25亞麻酸積累量出現(xiàn)波動(dòng),亞麻酸積累量降至最低后再上升,成熟期趨于平穩(wěn)。
由圖2可知,基因Glyma.14G194300、Glyma.07G046200、 Glyma.20G245500、 Glyma.13G068600在合豐25、L-5、JY20、JY83、JY142、JY182中,始粒期表達(dá)量逐漸增加,始粒期亞麻酸積累量達(dá)到最大后開始逐漸下降。鼓粒期基因Glyma.14G194300表達(dá)量達(dá)到最大后逐漸下降,此時(shí)亞麻酸積累量降到最低并趨于平穩(wěn)?;騁lyma.20G158300、 Glyma.07G151300、 Glyma.07G254500在合豐25、JY20、JY83中,始粒期開始表達(dá)量逐漸降低或不表達(dá),始粒期亞麻酸積累量達(dá)到最大后逐漸下降。鼓粒期基因Glyma.07G151300、Glyma.07G254500表達(dá)量開始增加,此時(shí)亞麻酸積累量降到最低并趨于平穩(wěn)。
材料各生育期亞麻酸含量與基因表達(dá)量相關(guān)性分析結(jié)果顯示,基因Glyma.14G194300、Glyma.20G245500表達(dá)量與HF25、JY20亞麻酸含量呈正相關(guān),與JY83亞麻酸含量呈負(fù)相關(guān),基因 Glyma.20G158300、 Glyma.16G003500、 Glyma.07G151300、Glyma.07G254500 表 達(dá) 量 與 HF25、JY20、JY83亞麻酸含量呈負(fù)相關(guān),基因Glyma.07G046200、 Glyma.13G068600 表 達(dá) 量 與 HF25、JY83亞麻酸含量呈負(fù)相關(guān),與JY20亞麻酸含量呈正相關(guān)。
圖1 大豆籽粒高/低值載體脂肪酸含量積累動(dòng)態(tài)曲線Fig.1 Accumulation curves of fatty acids in soybean kernels with high or low values
圖2 實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果Fig.2 Real time quantitative PCR results
表3 亞麻酸含量與基因表達(dá)量相關(guān)性分析Table 3 Correlation analysis of linolenic acid content and gene expression
本研究選擇RIL重組自交系親本,成熟時(shí)期亞麻酸含量差異較大,其他4種組分含量,基本一致,親本組配群體后代表現(xiàn)較大性狀分離幾率,有助于選擇高油酸且低亞麻酸品系。利用氣相色譜法及實(shí)時(shí)熒光定量PCR測(cè)定大豆籽粒各生育期脂肪酸組分,結(jié)果顯示,大豆籽粒中亞麻酸積累量從始粒期開始迅速上升,進(jìn)入鼓粒期逐漸降低,成熟期趨于平穩(wěn)直到完熟期保持不變,與徐杰等在大豆籽粒發(fā)育過程中脂肪酸組分積累動(dòng)態(tài)研究結(jié)果一致[33]。結(jié)果表明,大豆脂肪酸組分含量積累趨勢(shì)普遍一致,但亞麻酸積累動(dòng)態(tài)在鼓粒期表現(xiàn)顯著差異,鼓粒期測(cè)定亞麻酸含量可選擇優(yōu)良品系。
大豆籽粒脂肪酸組分積累在各生長(zhǎng)發(fā)育期受自然環(huán)境影響,溫度對(duì)亞麻酸與棕櫚酸影響較大,莊炳昌等采用人工氣候箱研究表明,夜間溫度升高棕櫚酸含量升高,亞麻酸含量降低[34]。水分與光照對(duì)大豆籽粒發(fā)育過程中脂肪酸組分積累影響較大,米景春等研究表明,大豆籽粒脂肪酸組分積累在干旱條件下不同程度降低[35]。劉兵等遮蔭研究表明,大豆生殖生長(zhǎng)期遮蔭,影響脂肪酸積累[36]。與前人研究相比,本研究采用室外盆栽,為保證生長(zhǎng)條件一致,試驗(yàn)過程中盆栽以混合均勻等量自然土作營養(yǎng)基質(zhì),水分等量澆灌,溫度、光照與自然條件相同。與大田相比盆栽可保證土壤均一,營養(yǎng)均衡,避免大田中地力不均影響。水分等量避免極端干旱氣候影響,溫度、光照均為自然條件,避免人為因素影響。
實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果、亞麻酸含量與基因表達(dá)量相關(guān)性分析結(jié)果表明,基因Glyma.07G046200、Glyma.20G245500、Glyma.13G068600為明顯雙峰分布,在始粒期與黃熟期出現(xiàn)兩個(gè)表達(dá)高峰,基因Glyma.16G003500表達(dá)呈典型多峰分布,表明在大豆籽粒發(fā)育過程中亞麻酸積累量受多基因調(diào)控,在不同生育期基因表達(dá)量對(duì)亞麻酸積累量影響不同?;騁lyma.14G194300、Glyma.20G245500在HF25、JY20中對(duì)亞麻酸積累量有正調(diào)控作用,在JY83基因?qū)喡樗岱e累量有負(fù)調(diào)控作用?;騁lyma.20G158300、Glyma.16G003500、Glyma.07G 151300、Glyma.07G254500 在 HF25、JY20、JY83中對(duì)亞麻酸含量有負(fù)調(diào)控作用。但大豆始粒期至完熟期亞麻酸含量表達(dá)量相對(duì)較低,對(duì)大豆籽粒亞麻酸積累量影響較小。
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Accumulation dynamics of fatty acid in soybean seed and screening of candidate gene related to linolenic acid metabolism/LI Wenbin,FENG Lei,
SONG Wei,LUO Jian,BI Wenshuang,LIU Yue,XU Lingxiu,ZHAO Xue
(Institute of Soybean Research,Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese of Ministry Education,Key Laboratory of Soybean Biology and Breeding(Genetics)of Agriculture Ministry,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)
Linolenic acid content,as one of thefive fatty acid components in soybean,is one of the important factors affecting the quality of soybean,its composition and ratio is also directly related to the quality of soybean oil,storage and processing etc.In comparison with other plant oil,soybean oil has better linoleic acid content and linolenic acid ratio.This study analyzed fatty acid content and proportion of'Hefeng 25'(high linolenic acid content of 5.94%varieties,Canada)and stable strains'L-5'(low linolenic acid content of 2.75%varieties),two lines from recombinant inbred lines derived from'Hefeng 25'and'L-5'through gas chromatography method.Additionally,combined with the metabolic pathways of KEGG in soybean fattyacids were screened and unsaturated fatty acid metabolism related candidate genes and screening lines produced during different developmental stages were analyzed by real-time quantitative PCR in'Hefeng 25'and'L-5'expression patterns.The results showed that the same gene in different varieties of linolenic acid content of different regulatory mechanisms,both positive and negative regulations of gene expression regulation in different periods had different degrees of influence on the accumulation of linolenic acid.The results,for exploring the regularity of soybean linolenic acid accumulation and the influence of its candidate genes,for breeding the ideal fatty acid composition and proportion of new soybean varieties,provided theoretical reference.
soybean;fatty acid;gas chromatography;real-time quantitative PCR
S565.1
A
1005-9369(2017)11-0001-08
時(shí)間2017-12-6 12:03:11 [URL]http://kns.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20171206.1203.002.html
李文濱,馮雷,宋偉,等.大豆脂肪酸含量積累動(dòng)態(tài)及亞麻酸代謝候選基因篩選[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2017,48(11):1-8.
Li Wenbin,Feng Lei,Song Wei,et al.Accumulation dynamics of fatty acid in soybean seed and screening of candidate gene related to linolenic acid metabolism[J].Journal of Northeast Agricultural University,2017,48(11):1-8.(in Chinese with English abstract)
2017-08-27
農(nóng)業(yè)部大豆產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-04-PS04);國家十二五科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2011BAD35B06);黑龍江省自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(C2015011);國家自然基金項(xiàng)目(31671717)
李文濱(1958-),教授,博士,博士生導(dǎo)師,研究方向?yàn)榇蠖惯z傳育種。E-mail:wenbinli@neau.edu.cn