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        長穗偃麥草EeHKT1;4基因的克隆與植物表達載體構建

        2017-09-20 07:01:12李杉杉毛培春田小霞
        草原與草坪 2017年4期
        關鍵詞:植物

        張 琳,郭 強,李杉杉,毛培春,田小霞,孟 林

        (北京市農林科學院,北京草業(yè)與環(huán)境研究發(fā)展中心,北京 100097)

        長穗偃麥草EeHKT1;4基因的克隆與植物表達載體構建

        張 琳,郭 強,李杉杉,毛培春,田小霞,孟 林

        (北京市農林科學院,北京草業(yè)與環(huán)境研究發(fā)展中心,北京 100097)

        采用RT-PCR方法從長穗偃麥草(Elytrigiaelongata)中克隆得到高親和K+轉運蛋白基因,命名為EeHKT1;4,全長cDNA序列為1 977 bp,開放閱讀框1 722 bp,編碼573個氨基酸,與一粒小麥(Triticummonococcum)TmHKT1;4-A2的氨基酸同源性為94%。系統(tǒng)進化樹分析結果顯示,EeHKT1;4與單子葉植物HKT1;4親緣關系較近。利用In-Fusion技術,成功構建了pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos植物表達載體,為長穗偃麥草EeHKT1;4的耐鹽功能鑒定奠定基礎。

        長穗偃麥草;高親和K+轉運蛋白(HKT);In-Fusion技術;載體構建

        長穗偃麥草(Elytrigiaelongata)又名長穗薄冰草,是禾本科偃麥草屬小麥族(TriticeaeDumort)多年生根莖疏叢型草本植物,生境為海濱和鹽堿草甸,具有較強的耐鹽性。既是重要的優(yōu)質牧草資源,又是防風固沙、水土保持、改良鹽堿地的理想植物[1-2],同時是小麥(Triticumaestivum)的近緣種,可成為改良小麥不可缺少的野生基因庫[3-5]。

        高親和性K+轉運蛋白(High Affinity K+Transporter,HKT)是植物遭受鹽脅迫傷害時,提高植物耐鹽的關鍵[6-7]。Schachtman和Schroeder首次從小麥(Triticumaestivum)中克隆得到TaHKT2;1蛋白[7],隨后相繼在其他植物中也發(fā)現(xiàn)了HKT類蛋白[7-14]。根據(jù)異源表達結果將HKT轉運蛋白分為家族I和家族II[15],其中HKT I類蛋白家族是Na+選擇性的轉運體,主要參與木質部Na+的卸載及韌皮部中Na+回流[16-18],以降低植物地上部Na+濃度,維持植株地上部K+的穩(wěn)態(tài),提高植物地上部的K+/Na+,避免植物葉片遭受鹽脅迫的傷害[19]。HKT Ⅱ類蛋白家族,是K+/Na+共轉運體,在K+、Na+選擇性吸收中起重要的作用[6]。有研究表明,擬南芥(Arabidopsisthaliana)AtHKT1;1的作用是從植株葉木質部導管中將Na+卸載到其周圍的薄壁細胞組織中,通過韌皮部再循環(huán)至根,降低葉片中Na+濃度[16]。水稻(Oryzasativa)OsHKT1;5的主要功能是從植株根木質部中卸載Na+,從而參與Na+的再循環(huán)[20]。一粒小麥(Triticummonococcum)TmHKT1;5主要參與根木質部中的Na+卸載,以降低植株地上部Na+的積累,從而維持較高的K+/Na+[21];TmHKT1;4能夠從葉鞘和根木質部汁液中卸載Na+,從而防止葉片中的Na+積累至毒害水平[22]。

        長穗偃麥草具有極強的抗逆性,蘊含豐富的抗逆性基因,又是小麥的近緣種,既可以改良鹽堿地,又可以成為改良小麥的野生基因庫。有研究報道,HKT1;4具有較強的耐鹽性,與植物耐鹽機制密切相關[6-7,25],為了深入了解長穗偃麥草EeHKT1;4的生物學特性和耐鹽機制,采用RT-PCR方法從長穗偃麥草(Elytrigiaelongata)中克隆HKT蛋白基因cDNA,利用In-Fusion技術構建植物表達載體,通過PCR方法實現(xiàn)載體線性化,自由克隆基因,實現(xiàn)完美的無縫連接,成功構建EeHKT1;4植物表達載體,為繼續(xù)深入研究其生物學特性和耐鹽機制奠定科學基礎和技術支持。

        1 材料和方法

        1.1試驗材料

        以4 周齡長穗偃麥草幼苗的鮮根為植物材料,種子采自北京市農林科學院小湯山草資源試驗基地,感受態(tài)E.coliCompetent Cells DH5α購自TaKaRa公司,植物表達載體pBI121購自鼎國生物技術有限公司。

        1.2主要試劑

        TaKaRa Tks Gflex DNA Polymerase(貨號:R060A),限制性內切酶,In-Fusion○RHD Cloning Kit(貨號:639649)購自寶生物工程(大連)有限公司。SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒(貨號:B518131-0050),SanPrep柱式質粒DNA小量抽提試劑盒(貨號:B518191-0050)等均購自生工生物工程(上海)股份有限公司。其他生化試劑均為進口或國產分析純。

        1.3試驗方法

        1.3.1 總RNA的提取與cDNA的合成 從4周齡長穗偃麥草幼苗的鮮根(經200 mmol/L NaCl處理24 h)中提取總RNA,參照TaKaRa總RNA提取試劑盒(貨號:9769)操作。cDNA第1鏈的合成按照TaKaRa試劑盒(貨號:6110A)操作進行。

        1.3.2EeHKT1;4基因目的片段的獲得 通過Primer 5軟件設計特異引物ORF-F、ORF-R,采用PCR進行擴增長穗偃麥草EeHKT1;4基因,使用TaKaRa Tks Gflex DNA Polymerase,PCR反應程序為:94℃ 1 min;98℃ 10 s,55℃ 15 s,68℃ 1 min,30循環(huán)。使用1.2%瓊脂糖凝膠檢測PCR擴增產物,進行膠回收。將膠回收產物連接到pUCm-T載體上,轉化到E.coliDH5α中,在含有50 μg/mL氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基平板上進行藍白斑篩選,挑取轉化白斑菌株,經質粒PCR鑒定確認為陽性克隆后,送至上海生工測序。

        引物信息:

        ORF-F:5′-ACGGGGGACTCTAGAATGCAAC TCCCAAGTCATAA-3′

        ORF-R:5′-AGGGACTGACCACCCGGGCTAA CTAAGCTTCCAGGTCC-3′

        1.3.3 pBI121載體片段獲得 將pBI121質粒進行XbaⅠ、SmaⅠ雙酶切,酶切體系:pBI121 10 μL,10×T Buffer 5 μL,0.1% BSA 5 μL,XbaⅠ (10 U/μL) 1.5 μL,SmaI (10 U/μL) 1.5 μL,dH2O 27 μL,Total 50 μL。酶切條件為:37℃酶切4 h。使用1%凝膠電泳檢測酶切產物,并回收載體片段,命名為pBI121 Vector。

        1.3.4 重組載體獲取 使用In-Fusion○R HD Cloning Kit試劑盒進行無縫連接。In-Fusion反應體系:5×In-Fusion HD Enzyme Premix 2 μL,pBI121 Vector 1 μL,EeHKT1;4 3 μL,dH2O 4 μL,Total 10 μL。In-Fusion反應條件:50℃孵育15 min,于冰上終止反應。命名為pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos。

        1.3.5 重組載體pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos的轉化 將重組載體pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos轉化到E.coliCompetent Cells DH5α中,將轉化體涂布于含有Kan(50 mg/L)的LB培養(yǎng)基平板上,37℃過夜培養(yǎng),挑選陽性菌株,PCR檢測陽性菌株,以pBI121F1/5’HKT1;4WR1為引物,使用SanPrep柱式質粒DNA小量抽提試劑盒提取陽性菌株質粒,使用XbaⅠ、SmaⅠ對陽性菌株進行雙酶切檢測,以保證構建載體的準確性。

        引物信息:

        pBI121F1:5′-ATCTCCACTGACGTAAGG-3′

        HKT1;4WR1:5′-GTCTCATCATCGGCGGTA GTCG-3′。

        1.3.6 生物信息學分析 序列的比較、翻譯和系統(tǒng)進化樹分析分別在DNAMAN 6.0、Primer 5.0和MEGA 6.0軟件上進行。

        2 結果與分析

        2.1EeHKT1;4基因目的片段獲得

        以長穗偃麥草幼苗根部mRNA為模板,使用ORF框引物,通過RT-PCR方法克隆EeHKT1;4,測序結果表明,得到含1 722 bp的EeHKT1;4開放閱讀框(圖1)。

        2.2EeHKT;4基因生物信息學分析

        圖1 EeHKT1;4基因PCR片段Fig.1 PCR products of EeHKT1;4 fragment

        克隆EeHKT1;4獲得1 722 bp的開放閱讀框,可以編碼573個氨基酸,推測分子質量為62.92 ku,等電點為9.73。經多重序列比較表明,EeHKT1;4與其他植物HKT1氨基酸序列同源性達65%以上,其中與一粒小麥TmHKT1;4-A2、硬粒小麥TdHKT1;4-1的氨基酸同源性分別為94%、85%;特別是,長穗偃麥草EeHKT1;4氨基酸序列上存在編碼P-loop A區(qū)域的一段保守序列LFFTAVSAATVSSMSTV,紅色箭頭所指的S(絲氨酸)為P-loop A區(qū)域特異選擇性位點,與Na+轉運功能相關(圖2)。系統(tǒng)進化樹分析發(fā)現(xiàn),長穗偃麥草EeHKT1;4與單子葉植物HKT1;4親緣關系較近,而與其他植物HKT2類蛋白親緣關系較遠(圖3)。以上結果表明,EeHKT1;4編碼高親和性K+轉運蛋白。

        圖2 長穗偃麥草EeHKT1;4與一粒小麥TmHKT1;4-A2、硬粒小麥TdHKT1;4-1氨基酸的多重比較Fig.2 Amino acid sequence alignment of EeHKT1;4 with those from TmHKT1;4-A2,TdHKT1;4-1注:箭頭所指的S(絲氨酸)為P-loop A區(qū)域特異選擇性位點

        2.2線性載體pBI121獲得

        使用XbaⅠ與SmaⅠ雙酶切植物真核表達載體pBI121,待雙酶切反應結束后,用1%凝膠電泳檢測酶切產物,獲得pBI121線性載體(圖4),大小14 745 bp的片段,將pBI121線性載體進行膠回收純化。

        2.3pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos重組載體獲得

        根據(jù)In-Fusion無縫連接技術將EeHKT1;4基因片段與pBI121線性載體連接,得到pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos重組載體,將重組載體轉化到大腸桿菌E.coliCompetent Cells DH5α中,將得到的陽性菌株進行pBI121F1/5’HKT1;4WR1引物PCR檢測以及XbaⅠ、SmaⅠ雙酶切檢測,PCR檢測產物與雙酶切產物如圖2.5,2.6所示,經測序結果分析顯示,該單克隆菌為帶有EeHKT1;4目的基因的陽性克隆,證實已成功獲取重組載體pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos。

        3 討論

        圖3 EeHKT1;4與其他植物HKT1;4的系統(tǒng)進化樹Fig.3 Phylogenetic tree of EeHKT1;4 and HKT 1;4 from other plants注:AtHKT1(擬南芥,Arabidopsis thaliana);BdHKT1;4、BdHKT1;5(二穗短柄草,Brachypodium distachyon);EcHKT1(桉樹,Eucalyptus)EeHKT1;4(長穗偃麥草,Elytrigia elongata);GmHKT1;5(大豆,Glycine max);HvHKT1;4、HvHKT2;1(大麥,Hordeum vulgare);OsHKT1;4、OsHKT1;5、OsHKT2(水稻,Oryza sativa);PhaHKT1;5(蘆葦,Phragmites australis);PtHKT1;5(毛果楊,Populus trichocarpa);PutHKT2;1(小花堿茅,Puccinellia tenuiflora);SbHKT1;4(高粱,Sorghum bicolor);SiHKT1;4、SiHKT1;5(小米,Setaria italica);SsHKT1(鹽地堿蓬,Suaeda salsa);TaHKT2;1(小麥,Triticum aestivumLinn);TdHKT1;4-1(硬粒小麥,Triticum durum);TmHKT1;4-A2、TmHKT1;5(一粒小麥,Triticum monococcum);ZmHKT1(玉米,Zea mays)。

        圖4 pBI121載體酶切產物Fig.4 Enzyme-digested product of pBI121 vector

        圖5 pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos載體PCR鑒定Fig.5 PCR identification of pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos vector.Note: 3~6 : PCR products

        隨著土壤鹽漬化日益加劇,鹽脅迫給植物生長造成的傷害主要是Na+毒害[26-28]。在面臨環(huán)境脅迫的條件下,植物通過限制Na+內流、Na+外排、Na+區(qū)域化等防御手段穩(wěn)定植物細胞內較低濃度的Na+及高K+/Na+比以抵制Na+毒害,從而提高植物的耐鹽性[16,20,29-37]。相關研究報道,HKT在植物耐鹽中發(fā)揮著重要作用[6],其中HKT I類蛋白主要是Na+選擇性轉運候選基因,在植物體內主要參與木質部Na+的卸載以及韌皮部Na+的回流[17-18]。有研究表明,擬南芥AtHKT1;1通過木質部Na+卸載、韌皮部Na+向根部的回流,降低植物內部Na+濃度,以提高植物耐鹽性[38]。小麥TaHKT1是高親和K+/Na+同向轉運載體[39],主要介導Na+內流,參與根部Na+的吸收,植物主要通過降低其表達量來限制Na+內流,從而降低植物體內Na+濃度[40]。硬粒小麥耐鹽品系149由Nax1與Nax2通過調控木質部Na+外排來減少Na+從根部向地上部的運輸,同時也可促進K+的吸收,另外Nax1 主要通過消除葉鞘(葉片末端)木質部中Na+的聚集,阻止Na+在葉片中過量積累[41]。一粒小麥中Nax1與Nax2的候選基因TmHKT1;4、TmHKT1;5通過木質部Na+外排,阻止Na+過量積累[42]。水稻OsHKT1;5主要在植物根中表達,是Na+的轉運蛋白,主要特異性調節(jié)Na+的內流,可以從根的木質部中將過多的Na+卸載到周圍薄壁細胞中,促進Na+的卸載,提高植株地上部組織中的K+/Na+[43-44]。經研究發(fā)現(xiàn),OsHKT1;5的功能與AtHKT1;1的功能一致[16]。因此,HKT I類蛋白主要通過限制根部Na+的吸收,增加Na+外排,以維持植物體內,特別是地上部低的Na+濃度和高的K+/Na+比,是高等植物耐鹽性的關鍵[45]。

        此次研究從長穗偃麥草中克隆出EeHKT1;4基因,經多重序列比較發(fā)現(xiàn),EeHKT1;4與其他植物HKT1;4核酸序列的同源性均在85%以上,而氨基酸序列的同源性則在80%以上,特別是與一粒小麥TmHKT1;4 氨基酸同源性高達94%。研究表明,HKT1類蛋白第1個P-loop區(qū)域含有一段高度保守片段(FFTAVSAATVSSMS),均具有一個絲氨酸離子選擇性位點[46]。長穗偃麥草EeHKT1;4的P環(huán)結構中也存在LFFTAVSAATVSSMSTV片段,且有絲氨酸位點,系統(tǒng)進化樹分析表明,EeHKT1;4主要與單子葉植物HKT1;4親緣關系較近。這表明,EeHKT1;4是一個特異的Na+離子轉運蛋白,可能將Na+從葉鞘組織及根木質部汁液中卸載,以防止植物光合組織中的Na+積累至毒害水平,從而在維持植株地上部K+、Na+穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮著重要的作用。

        4 結論

        長穗偃麥草是小麥的近緣種,經過長期的研究發(fā)現(xiàn),其自身蘊含了豐富的耐鹽基因,可作為小麥改良中的野生基因庫,也是改良鹽堿地的理想植物。研究利用In-Fusion技術成功構建了pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos植物表達載體。為EeHKT1;4耐鹽功能鑒定及遺傳穩(wěn)定性的評價奠定基礎,進而揭示EeHKT1;4在長穗偃麥草Na+轉運中的作用,這將對農作物和優(yōu)良牧草的耐鹽遺傳改良提供理論依據(jù)和應用價值。

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        GenecloningandconstructionofplantexpressionvectorofEeHKT1;4inElytrigiaelongata

        ZHANG Lin,GUO Qiang,LI Shan-shan,MAO Pei-chun,TIAN Xiao-xia,MENG Lin

        (BeijingResearchandDevelopmentCenterforGrassandEnvironment,BeijingAcademyofAgricultureandForestryScience,Beijing100097,China)

        A high-affinity K+transporter gene was cloned fromElytrigiaelongatausing the RT-PCR technique.This Gene was designated asEeHKT1;4,and contained a 1 722 bp open reading frame and encoded 573 amino acids residues.The length of cDNA was 1 977 bp.The gene shared 94% of homology withTmHKT1;4-A2 from wheat (Triticummonococcum).The gene has a closer genetic relationship with the HKT1;4 from other monocotyledons using phylogenetic tree analyzing.In addition,the pBI121-35S-EeHKT1;4-Nos vector was constructed successfully using the In-Fusion technology.This would provide the important basis for further study in salt tolerance ofEeHKT1;4 inElytrigiaelongata.

        Elytrigiaelongata;high-affinity K+transporter gene;In-Fusion technology;construction of expression vector

        2016-12-27;

        :2017-01-04

        國家自然科學基金項目(31272489);北京市農林科學院科技創(chuàng)新能力建設專項(KJCX20140103)資助

        張琳(1988-),女,河北邱縣人,碩士研究生。 E-mail:zl827935831@126.com 孟林為通訊作者。

        S 512

        :A

        :1009-5500(2017)04-0001-07

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