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        由4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸構筑的過渡金屬配合物的合成、晶體結(jié)構及與DNA作用

        2017-08-07 15:00:28嚴世承胡未極沈金杯趙國良
        無機化學學報 2017年8期
        關鍵詞:噻二唑八面體鍵長

        嚴世承 胡未極 沈金杯 趙國良*,,

        由4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸構筑的過渡金屬配合物的合成、晶體結(jié)構及與DNA作用

        嚴世承1胡未極2沈金杯2趙國良*,1,2

        (1浙江師范大學行知學院,金華 321004)
        (2浙江師范大學化學與生命科學學院,金華 321004)

        以4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸(C4H4N2O2S,HL)分別與硫酸鈷(CoSO4·7H2O)、氯化銅(CuCl2·2H2O)、硝酸銀(AgNO3)反應合成了3個配合物[Co(L)2(H2O)4]·2H2O(1)、[CuNa(L)3]n(2)和[AgL]n(3),用元素分析、紅外光譜、熱重分析進行表征,用單晶X射線衍射測定了產(chǎn)物的結(jié)構。配合物1屬于三斜晶系,空間群P1,Co2+的配位數(shù)為6,形成一個略為拉長的CoN2O4八面體,與理想的正八面體非常接近。配合物2屬于三斜晶系,空間群P1。Cu2+離子的配位數(shù)為4,構成變形的平面四邊形結(jié)構,Na+離子的配位數(shù)為6,構成一個略微變形的八面體結(jié)構,最終形成三維網(wǎng)狀結(jié)構。配合物3屬于單斜晶系,空間群P21/c,銀離子為三配位,構成變形的平面三角形構型,具有二維網(wǎng)狀結(jié)構。用溴化乙錠熒光探針法測定了配體和配合物與DNA作用的熒光光譜。

        2-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸;過渡金屬配合物;晶體結(jié)構;DNA作用

        配位聚合物花樣繁多、結(jié)構新穎、性能優(yōu)異,在磁性、熒光、非線性光學、吸附、催化、分離、主客體化學、生物化學和生物制藥等諸多領域有著廣泛的潛在應用,因而倍受國內(nèi)外化學家和材料學家的關注和重視[1-4]。配位聚合物的結(jié)構和功能的體現(xiàn)主要依賴于中心金屬離子和配體的調(diào)控,因此,人們可以根據(jù)自己的設計思想來合成具有各種各樣結(jié)構和功能的配位聚合物。

        噻唑及其衍生物是一類重要的含N、S原子的雜環(huán)化合物,具有廣泛的生物活性,表現(xiàn)出良好的抗菌、抗病毒、抗腫瘤、除草和調(diào)節(jié)植物生長等多種生物活性,在人類和其他生物的新陳代謝等過程中起到了重要的調(diào)節(jié)作用。該雜環(huán)系統(tǒng)具有豐富的電子,可與金屬離子配位,易形成氫鍵、芳香堆積、靜電和疏水作用等多種非共價鍵相互作用。這種結(jié)構賦予了噻唑類化合物許多特殊的性能,在農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥、生命科學、材料等領域具有廣泛的潛在應用[5-13]。鈷和銅作為機體的必需微量元素具有重要的生理作用[14];銀的生理活性也為人們所熟知。銀離子的配位數(shù)可以從2到7,有很大的彈性,表現(xiàn)出豐富的幾何構型[15-16],所以銀配位聚合物也是超分子化學和配位化學研究的熱點之一。本文報道了4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸(HL)的鈷、銅和銀配合物,并對其進行了晶體結(jié)構分析;同時測定了配體和配合物與DNA的作用,以期為過渡金屬離子與生物活性物質(zhì)作用及相應配合物有關性質(zhì)的后續(xù)研究提供相關信息。

        1 實驗部分

        1.1 儀器與試劑

        金屬含量用重量法測定,碳、氫、氮含量用德國Elementar公司Vario ELⅢ型元素分析儀測定;單晶X射線衍射用德國Bruker公司APEXⅡCCD單晶衍射儀測定;美國Nicolet公司NEXUS 670型傅立葉變換紅外光譜儀(FTIR),KBr壓片,測定范圍為400~4 000 cm-1;美國Perkin Elmer公司的LS-55型熒光光譜儀。

        HL用赫德-莫里法[17]制備。硫酸鈷、氯化銅、硝酸銀、氫氧化鈉、氨水等試劑均為市售分析純試劑,用前未做進一步處理。小牛胸腺DNA為生化試劑。

        1.2 配合物的合成

        1.2.1 配合物[Co(L)2(H2O)4]·2H2O(1)的合成

        稱取0.288 g(2.0 mmol)HL溶于15 mL去離子水中,用0.5 mol·L-1氫氧化鈉溶液調(diào)節(jié)溶液的pH值為6~7;另稱取0.281 g(1.0 mmol)七水硫酸鈷溶于10 mL去離子水中,將其逐滴加入上述溶液中,室溫攪拌反應4 h。將少許不溶物過濾,粉紅色濾液于室溫下自然揮發(fā),40 d后得到適合于單晶分析的塊狀粉色晶體,過濾、洗滌、干燥收集產(chǎn)品。產(chǎn)率:41% (以金屬鹽計)。對產(chǎn)物(C8H18CoN4O10S2,Mr=453.33)進行元素分析,實驗值(%):C,21.10;H,3.89;N,12.27;Co,12.77。計算值(%):C,21.19;H,4.00;N,12.36;Co,13.00。IR(KBr,cm-1):3 435(w),1 590(vs),1 352(vs),1 283(m),1 203(m),1 026(m),851(m),787(s),651(w),579(w),489(w)。

        1.2.2 配合物[CuNa(L)3]n(2)的合成

        稱取0.288 g(2.0 mmol)HL溶于15 mL去離子水中,用0.5 mol·L-1氫氧化鈉溶液調(diào)節(jié)溶液的pH值為7~8,室溫攪拌2 h,另稱取0.170 g(1.0 mmol)氯化銅溶于5 mL去離子水中,將其逐滴加入上述溶液中,室溫攪拌反應8 h。將不溶物過濾,藍色濾液于室溫下自然揮發(fā),3 d后得到適合于單晶分析的塊狀藍色晶體,過濾、洗滌、干燥收集產(chǎn)品。產(chǎn)率:41%(以氯化銅計)。對產(chǎn)物 (C12H9CuN6NaO6S3,M r= 515.96)進行元素含量測定,實驗值(%):C,27.71;H,1.72;N,16.12;Cu,12.17。計算值 (%):C,27.93;H,1.76;N,16.29;Cu,12.32。IR(cm-1):1 632(vs),1 502(w),1 442(w),1 387(vs),1 283(m),1 203(m),1 021(m),849(m),782(s),498(w)。

        1.2.3 配合物[AgL]n(3)的合成

        稱取0.170 g(1.0 mmol)AgNO3溶于5 mL去離子水中,不斷攪拌下逐滴加入3 mol·L-1氨水,直到最初生成的沉淀剛好溶解為止。另稱取0.144 g(1.0 mmol)HL并加入3 mol·L-1氨水10 mL使其溶解,然后將其逐漸滴入上述溶液中,室溫攪拌1 h,得到無色透明溶液,將濾液置于暗處緩慢揮發(fā)溶劑,1個月后得到無色單晶,產(chǎn)率:57%(以硝酸銀計)。對產(chǎn)物(C4H3N2O2SAg,Mr=251.01)進行元素含量測定,實驗值(%):C,19.25;H,1.25;N,11.27;Ag,43.11。計算值(%):C,19.14;H,1.20;N,11.16;Ag,42.97。IR(cm-1):1 640(vs),1 499(w),1 435(w),1 381(vs),1 288(m),1 205(m),1 027(m),843(m),788(s),650(w),487(w)。

        1.3 配合物與DNA作用的熒光光譜

        將小牛胸腺DNA(ct-DNA)用0.1 mol·L-1的NaCl溶液配成200μg·mL-1(cDNA=3.72×10-4mol·L-1),經(jīng)純度測定A260/A280=1.8~2.0,符合實驗測試要求,置于4℃溫度下保存,在4 d之內(nèi)使用;Tris-HCl緩沖溶液(5 mmol·L-1Tris-HCl/50 mmol·L-1NaCl)按常規(guī)方法配制,其中 Tris-HCl的濃度為 0.0l mol·L-1,pH= 7.40。

        在10 mL比色管中加入1.0 mL 200μg·mL-1的DNA溶液、1.0 mL 200μg·mL-1EB溶液以及2.0 mL pH=7.40的Tris-HCl緩沖溶液,在室溫下放置2 h。然后向混合溶液中依次加入不同量的濃度為5× 10-4mol·L-1化合物溶液,用Tris緩沖溶液定容,在4℃下反應4 h后,在美國Perkin Elmer公司的LS-55型熒光光譜儀上,激發(fā)波長λex=251 nm,掃描混合溶液在520~700 nm范圍的熒光光譜。

        1.4 晶體結(jié)構分析方法

        選用大小適宜的配合物單晶,在德國Bruker SMART APEXⅡCCD單晶衍射儀上進行衍射實驗。用Mo Kα射線(λ=0.071 073 nm)在設定的2θ范圍內(nèi)收集衍射數(shù)據(jù)。衍射數(shù)據(jù)用程序SADABS[18]進行經(jīng)驗吸收校正,晶體結(jié)構用SHELXS-97[19]程序由直接法解出,對所有非氫原子坐標及其各向異性溫度因子用SHELXL-97程序[20]進行全矩陣最小二乘法修正至收斂。除水上的氫原子外,其余氫原子均為理論加氫,水上的氫原子通過差值 Fourier合成得到。主要晶體學數(shù)據(jù)列于表1,主要的鍵長和鍵角列于表2~4。

        CCDC:1526276,1;1526277,2;1434529,3。

        表1 配合物的晶體學數(shù)據(jù)Table 1 Crystallographic data for the complexes

        表2 配合物1的主要鍵長(nm)和鍵角(°)Table 2 Selected bond lengths(nm)and bond angles(°)of complex 1

        續(xù)表2

        表3 配合物2的主要鍵長(nm)和鍵角(°)Table 3 Selected bond lengths(nm)and bond angles(°)of complex 2

        表4 配合物3的主要鍵長(nm)和鍵角(°) Table 4 Selected bond lengths(nm)and bond angles(°)of complex 3

        2 結(jié)果與討論

        2.1 配合物的晶體結(jié)構

        2.1.1 配合物[Co(L)2(H2O)4]·2H2O(1)的晶體結(jié)構

        圖1為配合物的配位環(huán)境圖,其晶體結(jié)構單元由1個4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸根和2個配位水分子,1個游離水分子所組成,其它的部分可由晶體學上的倒反對稱中心操作產(chǎn)生,整個化合物是電中性結(jié)構。每個Co都處于結(jié)晶學上的倒反中心,與2個4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸根中噻二唑環(huán)上的2個N原子和4個配位水上的O原子配位,形成一個完美的CoN2O4八面體幾何構型。來自配位水分子的4個O原子(O1W,O1WA,O2W,O2WA)處于八面體的赤道平面,鍵長范圍為0.205 5(2)~0.206 2(2)nm,∠O1W-Co1-O2WA=∠O1WA-Co1-O2W= 89.88(8)°,∠O1W-Co1-O2W=∠O1WA-Co1-O2WA= 90.12(8)°,4個鍵角之和等于360°,可見這4個O原子與金屬Co原子共平面并構成了一個平行四邊形;同時,軸向位置被2個噻二唑環(huán)上的N原子占據(jù)(dCo1-N1=dCo1-N1A=0.218 1(2)nm),∠O1W-Co1-O1WA=∠O2W-Co1-O2WA=∠N1-Co1-N1A=180.0°,說明O1W,Co1,O1WA;O2W,Co1,O2WA;N1,Co1,N1A各組內(nèi) 3個原子分別處于同一條直線上。因此,CoN2O4配位多面體是個略為拉長的八面體,與理想的正八面體非常接近,也與文獻報道的相似配體鈷配合物的基本情況相近[21-24]。

        圖1 配合物1的配位環(huán)境圖Fig.1 Coordination environment of complex 1

        表5 配合物1中的氫鍵數(shù)據(jù)Table 5 Hydrogen bond geometry of complex 1

        配合物是具有層狀結(jié)構的三維超分子體系,如圖2所示。在每一層結(jié)構中,通過羧基上的氧原子與配位水以O-H…O氫鍵(表5)將獨立的結(jié)構單元與周圍4個結(jié)構單元相連,形成類似等號形狀的二維平面結(jié)構。其中,獨立的結(jié)構單元中的配位水分子存在2種連接方式:處于對角關系的一對水分子分別與其周圍的一個結(jié)構單元通過1個O-H…O氫鍵相連,而另一對水分子均與其周圍的晶格水O3W和一個結(jié)構單元通過2個O-H…O氫鍵相連;晶格水O3W通過O-H…O,O-H…N氫鍵噻唑甲酸根上的2個氧原子和1個氮原子相連,從而得到了一個由O-H…O,O-H…N氫鍵連接起來的三維超分子體系。

        圖2 配合物1沿a軸方向的三維層狀結(jié)構圖Fig.2 Three dimensional layered structure of complex 1 viewed along a axis

        2.1.2 配合物[CuNa(L)3]n(2)的晶體結(jié)構

        [CuNa(L)3]n的最小不對稱單元包括晶體學獨立的 1個 Cu離子,1個 Na離子,3個 4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸根配體。如圖3所示,Cu2+離子處于四配位的環(huán)境中,由4個噻二唑甲酸根離子提供的3個氧原子(O2,O4,O6)和1個氮原子(N5)構成變形的平面四邊形結(jié)構。Cu-O鍵長范圍在0.191 7~0.194 2 nm,Cu-N鍵長為0.200 8 nm,與文獻[25]報道的銅配合物接近,中心離子Cu偏離四邊形平面0.007 2 nm。金屬Na離子為八配位結(jié)構,與來自6個配體的3個羧基氧原子(O1,O3,O5)和3個氮原子(N2,N4,N6)配位形成一個略微變形的八面體構型。其中,O1,O3,O5和N6處于八面體的赤道位置,中心鈉原子偏離赤道平面0.008 99 nm,N2,N4處于八面體的軸向位置,N2-Na1-N4的鍵角為173.61(1)°,接近于直線。Na-N鍵的距離為0.257 0(5)~0.261 5(5)nm,Na-O鍵的距離為0.227 5(4)~0.240 6(4)nm,鍵長略長于文獻[26]報道的鈉配合物的相應鍵長,明顯短于另一文獻[27]報道的有關鍵長。

        圖3 配合物2的配位環(huán)境圖Fig.3 Coordination environment of complex 2

        在配合物2中,配體L-中的羧基都是去質(zhì)子化的,并以2種不同的配位方式(圖3)和金屬Na、Cu離子配位:第一種方式是配體通過1個氮原子和羧基上的2個氧原子三齒橋連2個Na離子和1個Cu離子,該類配體間的夾角為4.712(2)°,幾乎相互平行;第二種方式為配體通過2個氮原子和羧基上的2個氧原子四齒橋連2個Na離子和2個Cu離子,該類配體間的夾角為0°,與第一類配體之間的夾角為86.65(3)°,幾乎相互垂直。Cu離子與相鄰 2個 Na離子之間的距離分別為0.381 2(6)nm和0.399 5(7)nm。

        另外,相鄰噻二唑環(huán)間的距離為:0.348 49 nm,質(zhì)心距離為:0.369 2 nm,存在著強的π-π堆積作用。配體通過2種首尾連接的配位方式連接相鄰的金屬Cu,Na離子,最終形成一個從a,b,c三個軸向看,如同“井”字形的二維層狀結(jié)構(圖4),孔道大小0.778 1 nm×0.833 4 nm。從拓撲角度分析,該配合物可以簡化為一個雙節(jié)點的(4,6)-連接的三維拓撲網(wǎng)絡(圖5)。

        圖4 配合物2的二維層狀結(jié)構Fig.4 Two dimensional layer of complex 2

        2.1.3 配合物[AgL]n(3)的晶體結(jié)構

        圖5 配合物2的三維拓撲網(wǎng)絡Fig.5 Three dimensional topology network of complex 2

        圖6 配合物3的配位環(huán)境圖Fig.6 Coordination environment of complex 3

        配合物3屬于單斜晶系,中心對稱,P21/c空間群,具有二維網(wǎng)狀結(jié)構,其最小不對稱單元包括1個Ag離子,1個4-甲基-1,2,3-噻二唑-5-甲酸根離子(L-)。銀離子為三配位,分別與來自3個噻二唑甲酸根離子中的1個氮原子和2個氧原子配位,構成變形的平面三角形構型(圖6)。中心離子Ag偏離由N1、O2和O1所構成的平面三角形0.037 78 nm。Ag-O鍵長為0.224 3(3)~0.229 7(3)nm,Ag-N鍵長是0.237 4(3)nm,N-Ag-O、O-Ag-O的鍵角范圍是89.35(7)°~150.15(11)°,與文獻[28-30]報道的銀配合物相近;相鄰Ag…Ag間的距離為0.306 6(6)nm,未超過它們間的范德華力半徑之和(0.344 nm),表明存在弱的金屬鍵作用。

        由于沒有氫鍵給體,因此配合物中不存在典型的氫鍵,但是由于配合物存在較多的噻唑環(huán),且相鄰噻唑環(huán)所在平面的夾角為 0°,平均距離為0.343 0(3)nm,質(zhì)心距為0.373 1(2)nm,所以噻唑環(huán)之間存在著較強的π-π堆積作用。在π-π堆積作用下,二維格子狀層面結(jié)構形成了波形三維超分子結(jié)構(圖8)。

        圖7 配合物3的4-連接的二維拓撲結(jié)構Fig.7 Four-connected 2D topology structure of complex 3

        圖8 配合物3的三維波形堆積圖Fig.8 Three dimensional wave-like framework of complex 3

        2.2 配合物的紅外光譜

        游離配體中羧基的伸縮振動出現(xiàn)在1 703 cm-1處,當形成配合物后此峰消失,分別出現(xiàn)了羧基的反對稱伸縮振動νas(COO-)和對稱伸縮振動νs(COO-)峰。配合物1中羧基的2個振動峰出現(xiàn)在1 582和1 352 cm-1處,與配體鈉鹽的振動峰相近,說明羧基并未參與配位;3 435和579 cm-1處的振動峰表明有水。配合物2中羧基的2個振動峰出現(xiàn)在1 632和1 442 cm-1處,說明羧基以單齒方式與中心金屬離子配位。配合物3中羧基的振動峰出現(xiàn)在1 640和1 499 cm-1處,說明羧基以雙齒橋式與中心金屬離子配位[31]。這些均與單晶結(jié)構分析結(jié)果相吻合。

        2.3 配合物的熱重分析

        圖9為配合物的熱重(TG)曲線,從圖中可知:配合物1在72~160℃之間有1個大失重臺階,質(zhì)量損失為23.62%,與理論值(23.72%)相吻合;從212℃之后配體逐漸氧化分解,至452℃左右基本分解完全,期間總的質(zhì)量損失率為59.90%,理論失重59.83%,推斷殘余物可能是CoO,最終殘留量為16.48%,(理論值:16.46%)。配合物2在239℃之前無任何失重,說明產(chǎn)物不含溶劑分子,這與單晶結(jié)構結(jié)果一致,之后配體逐漸氧化分解,至458℃左右基本分解完全,期間總的質(zhì)量損失率為74.09%,理論失重74.31%,推斷殘余物可能是CuO+Na2CO3,最終殘留量為25.91%,(理論值:25.69%)。配合物3在168℃之前也無任何失重,說明產(chǎn)物中也無溶劑分子,之后配體逐漸氧化分解,至545℃ 左右基本分解完全,期間總的質(zhì)量損失率為55.90%,理論失重57.03%,推斷殘余物可能是Ag,最終殘留量為44.10%,(理論值:42.97%)。

        圖9 配合物的熱重曲線Fig.9 TG curves of the complexes

        2.4 配體、配合物與DNA作用

        圖10是化合物(配體和配合物)與DNA濃度的比值 r分別為 0,0.13,0.27,0.40,0.54,0.67的情況下,化合物對EB-DNA復合體系的熒光猝滅圖。由圖可見,在590 nm處,EB-DNA體系能發(fā)出強烈的熒光,隨著所加的化合物濃度的增加,EB-DNA復合體系的熒光發(fā)生了不同程度的猝滅。由此假設,在EB-DNA復合體系中,由于配體分子中的噻唑環(huán)的嵌入,使嵌入DNA中的部分EB由結(jié)合態(tài)變成自由態(tài)。根據(jù)實驗數(shù)據(jù),結(jié)合Stem-Volmer方程[32],算出這4個化合物與DNA作用的結(jié)合常數(shù)Ksq分別為0.24,0.43,0.31,0.13。Ksq的大小定量地反映了化合物與DNA插入作用的強弱。通過比較結(jié)合常數(shù)我們可以看出,配合物1和2的插入作用強于配體,而配合物3的作用不如配體。

        圖10 化合物對DNA-EB復合體系的熒光猝滅圖Fig.10 Influence ofthe compounds on the fluorescence spectra of EB-DNA system

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        Syntheses,Crystal Structures and DNA Binding of Transition Metal Complexes Constructed by 4-Methyl-1,2,3-thiadiazol-5-carboxylic Acid

        YAN Shi-Cheng1HU Wei-Ji2SHEN Jin-Bei2ZHAO Guo-Liang*,1,2
        (1Xingzhi College,Zhejiang Normal University,Jinhua,Zhejiang 321004,China)
        (2College of Chemistry and Life Science,Zhejiang Normal University,Jinhua,Zhejiang 321004,China)

        Three transition metalcomplexes[Co(L)2(H2O)4]·2H2O(1),[CuNa(L)3]n(2)and[AgL]n(3)were synthesized from 4-methyl-1,2,3-thiadiazol-5-carboxylic acid(C4H4N2O2S,HL),CoSO4·7H2O,CuCl2·2H2O,and AgNO3.They were characterized by elemental analysis,infrared spectrum,thermogravimetricanalysis (TGA).The crystal structures of the complexes were confirmed by single X-ray diffraction method.Complex 1 crystallizes in triclinic system with space group P1,Co2+ion is six-coordinated to constitute a slightly deformation octahedral structure. Complex 2 crystallizes in triclinic system with space group P1.Cu2+ion is four-coordinated to form a quadrilateral plane structure deformation,and Na+ion is six-coordinated to constitute a slightly deformation octahedralstructure, eventually forming a three-dimensional network structure.Complex 3 crystallizes in monoclinic system with space group P21/c,and its coordination number is three,forming a deformation plane triangle configuration with 2D network structure.In addition,DNA-binding of the ligand and complexes was studied by EtBr fluorescent probe method.CCDC:1526276,1;1526277,2;1434529,3.

        4-methyl-1,2,3-thiadiazol-5-carboxylic acid;transition metalcomplex;crystalstructure;DNA-binding

        O614.81+2;O614.121;O614.122

        A

        1001-4861(2017)08-1381-09

        10.11862/CJIC.2017.177

        2017-01-20。收修改稿日期:2017-06-28。

        浙江省公益性技術應用研究計劃項目(No.2014C32014)資助。

        *通信聯(lián)系人。E-mail:sky53@zjnu.cn

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