《帝企鵝日記》記錄的是在南極大陸上生活的帝企鵝的生存和繁衍的故事。

在一片冰川、荒涼孤寂的南極洲上，生存著一群不畏寒冷的族類(lèi)：皇帝企鵝。這終年寒冷的地方，每年三月便開(kāi)始進(jìn)入寒冬，并將持續(xù)九個(gè)月的時(shí)間。于是每年的三月，成千上萬(wàn)的帝企鵝離開(kāi)它們的海洋家園，以輕巧的動(dòng)作躍上岸，一開(kāi)始以圓滾滾的肚皮在地面滑行數(shù)十公尺，最終用蹣跚的雙腳在冰面上行走。為了尋找一個(gè)安全的環(huán)境，以便繁衍后代，延續(xù)種族生存，企鵝們不得不放棄海里的悠然生活，冒著昏天黑地的冰風(fēng)暴，踉踉蹌蹌、如嬰兒學(xué)步一般開(kāi)始一段漫長(zhǎng)而艱辛的旅程。

在天性和南十字星座的引導(dǎo)下，它們準(zhǔn)確無(wú)誤地向著自己的出生地前進(jìn)。伴隨著一系列難以理解的舞蹈和嘶鳴一樣令人入迷的不和諧音調(diào)，企鵝們開(kāi)始了求愛(ài)儀式，很快它們就會(huì)形成一對(duì)一對(duì)的“夫婦”。

白天越來(lái)越短，氣候也越來(lái)越惡劣，雌性企鵝會(huì)停下來(lái)一段時(shí)間生蛋。之后，筋疲力盡的它還不能休息，必須立即啟程繼續(xù)趕路，返回大海尋找食物并恢復(fù)體力，而企鵝爸爸則會(huì)留下來(lái)保護(hù)那些珍貴的企鵝蛋，它們將蛋孵在自己的腳掌上面以保持溫暖……水盡糧絕的境遇下，這種看起來(lái)柔弱笨拙的動(dòng)物表現(xiàn)出了頑強(qiáng)的生命力。經(jīng)過(guò)多個(gè)月的覓食，企鵝媽媽終于安全回來(lái)與家人團(tuán)聚，接著與爸爸的身份調(diào)換，媽媽來(lái)照顧孩子，爸爸則外出覓食，它們會(huì)輪流工作，直到小企鵝長(zhǎng)大后，一群帝企鵝又再次長(zhǎng)征，返回家園，待下一年繼續(xù)另一個(gè)新的旅程……