郝東利++楊順瑛++黃亞楠++蘇彥華
摘要:在生理?xiàng)l件下,植物銨的吸收主要由定位于細(xì)胞膜上的銨轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(ammonium transporter,AMT)介導(dǎo)完成,研究模式植物擬南芥AMT的功能特性及調(diào)控機(jī)制對(duì)于解析植物的銨吸收過程具有重要意義。本研究克隆了擬南芥AtAMT1.3并將其在蛙卵異源系統(tǒng)中表達(dá),電生理結(jié)果表明,AtAMT1.3 是一個(gè)典型的對(duì)銨有高度選擇性、高親和的銨吸收系統(tǒng)[Km =(25.5 ± 3.2) μmmol/L]。同時(shí),AtAMT1.3也能介導(dǎo)銨的同系物甲基銨的吸收[Km =(3.3±0.2) mmmol/L],對(duì)銨和甲基銨的吸收具有濃度依賴性和電壓依賴性。 AtAMT1.3的銨轉(zhuǎn)運(yùn)能力不受pH值調(diào)控,它的轉(zhuǎn)運(yùn)底物是NH4+,運(yùn)輸機(jī)制是NH4+單向運(yùn)輸。
關(guān)鍵詞:擬南芥;銨轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白AtAMT1.3;介導(dǎo);電生理;功能特征;銨吸收系統(tǒng);運(yùn)輸機(jī)制
中圖分類號(hào): S184;Q946.1文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2017)08-0036-05
銨態(tài)氮是植物能夠直接吸收的重要無機(jī)氮素形態(tài)。模式植物擬南芥是一種喜銨植物,在相同濃度供應(yīng)下,銨態(tài)氮的吸收速率高達(dá)硝態(tài)氮的20倍[1],植物對(duì)銨的吸收主要是由銨轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(AMT)介導(dǎo)的[2-4]。擬南芥基因組中一共有6個(gè)AMT,即AtAMT1.1、AtAMT1.2、AtAMT1.3、AtAMT1.4、AtAMT1.5、AtAMT2[5]。除了AtAMT1.4 專一地在花粉和花粉管中表達(dá)外[6],其他5個(gè)AMT在根部均有表達(dá)[5,7]。擬南芥突變體試驗(yàn)證明,3個(gè)AtAMT1(AtAMT1.1、AtAMT1.2、AtAMT1.3)貢獻(xiàn)了約90%的銨吸收,其中AtAMT1.1和AtAMT1.3各貢獻(xiàn)了約30%[3,5],AtAMT1.2貢獻(xiàn)率略?。?8%~26%)[5]。AtAMTS 通過時(shí)空定位以及對(duì)銨親和力的差異來滿足擬南芥生長合適的氮素需要[5]。簡單來說,AtAMT1.1、AtAMT1.3 和AtAMT1.5主要定位于表皮細(xì)胞,其對(duì)銨的親和力很強(qiáng),三者負(fù)責(zé)將銨從土壤溶液中吸收到根內(nèi)并通過共質(zhì)體途徑運(yùn)輸;而AtAMT1.2主要定位于內(nèi)皮層,且對(duì)銨的親和力相對(duì)較低,通過質(zhì)外體途徑運(yùn)輸?shù)匿@受阻于凱氏帶,此時(shí)AtAMT1.2將其運(yùn)進(jìn)細(xì)胞,進(jìn)入共質(zhì)體途徑,最終完成同化或木質(zhì)部的輸送。由于植物體的復(fù)雜,將單個(gè)銨轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在異源系統(tǒng)中表達(dá)更有利于研究其轉(zhuǎn)運(yùn)、調(diào)控機(jī)制。酵母和蛙卵是2種常用的表達(dá)系統(tǒng),酵母銨吸收缺失突變體31019b 不能在 <5 mmol/L NH4+作為唯一氮源的培養(yǎng)基上生長[8-9],轉(zhuǎn)入任意一個(gè)AtAMT1 均能使其恢復(fù)生長,再次證實(shí)了它們直接吸銨的功能[5-6,10-11]。蛙卵系統(tǒng)除了能夠驗(yàn)證其吸銨功能外,還有一個(gè)重要的作用就是可以用來解析其轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)理。雖然植物AMT1之間同源性很高,但是其轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)理卻大不相同[12],目前對(duì)于AtAMT1.3的蛙卵電生理功能特征研究尚缺少。本試驗(yàn)克隆了AtAMT1.3并將其在蛙卵系統(tǒng)中進(jìn)行表達(dá),通過電生理技術(shù)研究其離子選擇性,對(duì)銨及其同系物甲基銨的親和性、pH值響應(yīng),初步闡明了AtAMT1.3的運(yùn)輸機(jī)制及功能特征。
1材料與方法
1.1材料
擬南芥(Arabidopsis)、大腸桿菌 DH5α和蛙卵表達(dá)載體 pCI 由筆者所在實(shí)驗(yàn)室保存,非洲爪蟾由筆者所在實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng);PCR擴(kuò)增高保真酶PrimeSTAR購自TaKaRa 公司;T4連接酶、限制性內(nèi)切酶 EcoRⅠ和XbaⅠ購自 NEB公司;引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;膠原酶A 購自 Roche 公司;電生理用試劑購自Ameresco 公司;雙電極電壓鉗設(shè)備購自Axon公司。放大器型號(hào)為pClamp 900A,數(shù)模轉(zhuǎn)換型號(hào)為Digidata 1440,質(zhì)粒注射儀器型號(hào)為 Nanoliter 2000。
1.2AtAMT1.3開放閱讀框的擴(kuò)增及表達(dá)載體的構(gòu)建
取凍存的擬南芥樣品約100 mg,液氮研磨,根據(jù)說明書提取RNA。利用反轉(zhuǎn)錄試劑合成cDNA第1鏈,AtAMT1.3序列登錄號(hào)為At3g24300.1。以cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物序列:P1,5′-GTCGAATTCATGTCAGGAGCAATAACATGC-3′;P2,5′-GTCTCTAGATTAAACGCGAGGAGGAGTAGC-3′。PCR擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃ 1 min,53 ℃ 1 min,72 ℃ 1.67 min,24個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。割膠回收,將產(chǎn)物“3′-”端加A尾后連到 PMD19-T vector,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α,陽性克隆送往華大基因科技有限公司測(cè)序。用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和XbaⅠ將測(cè)序正確地克隆切下來,通過T4連接酶連入蛙卵表達(dá)載體pCI。
1.3注射蛙卵及電生理檢測(cè)
首先,將蛙卵從非洲爪蟾中取出,用 1 mg/mL 膠原酶A 消解1.5~2.0 h,然后挑選健康的單個(gè)蛙卵保存于ND96溶液中,其中ND96溶液成分包括96 mmol/L NaCl、2 mmol/L KCl、1.8 mmol/L CaCl2、1 mmol/L MgCl2、5 mmol/L HEPES(用NaOH調(diào)pH值至7.4)。將59.8 nL的質(zhì)粒pCI-OsAMT1.3注射進(jìn)入健康的蛙卵,同等體積的無菌水注射進(jìn)入蛙卵,作為對(duì)照。將蛙卵置于ND96溶液(2.5 mmol/L丙酮酸鈉)中,19 ℃ 培養(yǎng)3 d,檢測(cè)。蛙卵鉗置于-70 mV中,利用連續(xù)ramp記錄。膜電位施加程序的電壓為-140~20 mV,與之前的報(bào)道一樣,注射水的蛙卵對(duì)1 mmol/L NH4+ 或 10 mmol/L MeA+ 不敏感[12]。電生理用基本溶液成分包括100 mmol/L NaCl、2 mmol/L CaCl2、2 mmol/L MgCl2、4 mmol/L Tris (用MES調(diào)pH值至7.4),NH4Cl或者M(jìn)eACl 根據(jù)圖表的指示添加。在做離子選擇性試驗(yàn)時(shí),基本溶液中的 NaCl 換成相同濃度的CholineCl。
2結(jié)果與分析
2.1AtAMT1.3-pCI載體的構(gòu)建
以擬南芥cDNA為模板,以 P1、P2為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得長度為1 497 bp 目的片段(圖1),割膠回收,連入 PMD19-T vector 載體,經(jīng)轉(zhuǎn)化、篩選、測(cè)序得到正確的AtAMT1.3-PMD19-T,用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切 AtAMT1.3-PMD19-T和 pCI,割膠回收AtAMT1.3片段和pCI大片段,通過T4 連接酶連接目的片段和大載體片段,轉(zhuǎn)化后篩選獲得陽性質(zhì)粒AtAMT1.3-pCI,酶切驗(yàn)證正確后濃度濃縮至>1 μg/μL,備用 (圖2),AtAMT1.3-pCI 質(zhì)粒構(gòu)成見圖3。
2.2AtAMT1.3 的氨基酸序列分析
氨基酸序列分析表明,AtAMT1.3 在進(jìn)化上與AtAMT1.5親緣關(guān)系最近,AtAMT1.1次之 (圖4)。它們都屬于 AMT-1亞家族,其中AtAMT1.3 與 AtAMT1.2之間的親緣關(guān)系在該亞家族內(nèi)部最遠(yuǎn)(圖4)?;?AtAMT1.1 和 AtAMT1.2 已較
為明了的功能特征[11,13-15]進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示,AtAMT1.3在功能特征方面的表現(xiàn)與 AtAMT1.1相近,而與 AtAMT1.2 差異較大。
2.3AtAMT1.3的離子選擇性
在-70 mV 下添加 1 mmol/L堿性陽離子Li+、Na+、K+、Rb+、Cs+入電生理基本溶液,對(duì)AtAMT1.3介導(dǎo)的電流沒有明顯影響,而用 1 mmol/L NH4+ 灌流能產(chǎn)生大幅內(nèi)向的電流(圖5-a),說明 AtAMT1.3是一個(gè)高度選擇性的銨吸收系統(tǒng)。這種高度銨的選擇性在整個(gè)電壓區(qū)間內(nèi)(-140 ~20 mV)皆是如此(圖5-b),說明 AtAMT1.3 對(duì)銨吸收的高度選擇性是不依賴于膜電位的。
2.4AtAMT1.3的銨濃度響應(yīng)
在-70 mV 下,AtAMT1.3 介導(dǎo)的內(nèi)向銨電流隨著銨濃度的增加而增加,在<400 μmol/L 的銨濃度下,電流急劇增大;而在1 000 μmol/L 下,接近飽和,說明AtAMT1.3介導(dǎo)的銨吸收具有濃度依賴性(圖6-a);AtAMT1.3介導(dǎo)的內(nèi)向銨電流睡著膜電位的增加而增加,說明AtAMT1.3的銨吸收具
有電壓依賴性(圖6-b)。通過米氏方程擬合得到AtAMT1.3 介導(dǎo)的銨吸收在 1 mmol/L左右達(dá)到飽和(圖6-c)。在 -140 mV 下,Km值(達(dá)到1/2最大吸收速率時(shí)的銨濃度)為(18.1±2.8) μmol/L;在-130 mV下,Km值為(21.4±3.01) μmol/L;在-120 mV下,Km值為(25.5±3.2) μmol/L;在-110 mV下,Km值為(28.2±3.5) μmol/L;在-100 mV下,Km值為(35.0±3.5) μmol/L;在-90 mV下,Km值為(44.6±4.0) μmol/L;在-80 mV下,Km值為(57.8±5.2) μmol/L,由此可見Km值具有電壓依賴性,即膜電位越正,Km值越大,說明銨是以離子的形態(tài)進(jìn)入細(xì)胞膜的(圖6-d)。假設(shè)在膜內(nèi)有1個(gè)NH4+的結(jié)合位點(diǎn),則這個(gè)位點(diǎn)應(yīng)位于整個(gè)膜電場(chǎng)52%的位置。
2.5AtAMT1.3的甲基銨濃度響應(yīng)
甲基銨是銨的同系物,廣泛應(yīng)用于AMT的功能研究。在-70 mV 下,AtAMT1.3 介導(dǎo)的內(nèi)向甲基銨電流也具有濃度依賴性,即隨著甲基銨濃度的增加而增加,在銨濃度<7.5 mmol/L 下,電流急劇增大;而在胺濃度為10 mmol/L 下,電流接近飽和(圖7-a)。AtAMT1.3介導(dǎo)的內(nèi)向甲基銨具有電壓依賴性,即膜電位越負(fù),電流越大(圖7-b)。通過米氏方程擬合得到甲基銨親和力常數(shù)Km值在毫摩爾級(jí):在 -140 mV 下,Km =(2.5±0.1) mmol/L;在-130 mV下,Km =(2.9±0.1) mmol/L;在-120 mV下,Km=(3.3±0.2) mmol/L;在-110 mV下,Km=(3.8±0.2) mmol/L;在-100 mV下,Km=(4.4±0.2) mmol/L;在-90 mV下,Km=(5.1±0.3) mmol/L;在-80 mV下,Km=(5.7±0.4) mmol/L。Km值具有電壓依賴性,即膜電位越正,Km值越大(圖7-c),說明甲基銨是以離子的形態(tài)進(jìn)入細(xì)胞膜的。假設(shè)在膜內(nèi)有1個(gè)MeA+的結(jié)合位點(diǎn)的話,則這個(gè)位點(diǎn)應(yīng)位于整個(gè)膜電場(chǎng)34%的位置。
2.6AtAMT1.3的pH值響應(yīng)
在-70 mV 下,AtAMT1.3介導(dǎo)的銨電流不受外界pH值調(diào)控,即酸性條件和接近中性的pH值對(duì)銨電流基本沒有影響(圖8-a)。在不同膜電位下,AtAMT1.3介導(dǎo)的銨電流皆不受pH值調(diào)控(圖8-b、圖8-c)。
3結(jié)論與討論
在同一氮素水平供應(yīng)下,擬南芥對(duì)銨的吸收速率是硝的20倍[1],說明銨態(tài)氮對(duì)其生長極其重要,植物的銨吸收是由AMT介導(dǎo)完成的[2-4]。AtAMT1.3雖然貢獻(xiàn)于根部的銨吸收,但是其功能特征如對(duì)銨吸收專一與否、對(duì)膜電位的響應(yīng)、不同電壓下的親和力、運(yùn)輸機(jī)理等還不清楚。本研究結(jié)果表明,AtAMT1.3 是一個(gè)典型的高度選擇性的、高親和銨吸收系統(tǒng) (圖5、圖6),其 Km 值為25 μmol/L,與AtAMT1.1 的Km 值很接近[13],但與AtAMT1.2差距很大[11]。AtAMT1.3與AtAMT1.1親緣性近,而與AtAMT1.2遠(yuǎn)(圖4),再根據(jù)結(jié)構(gòu)決定功能的原理可知,這種Km 值的差異反映了AtAMT1.3與AtAMT1.1的相似性。 AtAMT1.3不僅能通透NH4+,也能通透NH4+的同系物MeA+,但其對(duì)MeA+的通透性要低,親和力降低了約100倍(圖7),這與大多數(shù)報(bào)道的AMT-1亞家族的銨轉(zhuǎn)運(yùn)類似[11,16-17]。AMT既能通透NH4+、又能通透MeA+的種特性有利于對(duì)AMT功能特征的研究,如在酵母表達(dá)系統(tǒng)中,通過14C標(biāo)記的MeA來研究AMT的吸收以及親和特征[18-19]。
盡管AMTs在結(jié)構(gòu)上同源性很高,但其轉(zhuǎn)運(yùn)底物和轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)理卻大不相同[12],甚至對(duì)相同的AMT提出不同的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。Khademi等通過解析大腸桿菌EcAmtB晶體結(jié)構(gòu)提出該蛋白結(jié)合的是NH4+,但是最終運(yùn)輸?shù)氖荖H3[20]。因?yàn)橛涗浀玫搅穗x子態(tài)的NH4+內(nèi)流,這個(gè)NH3運(yùn)輸?shù)挠^點(diǎn)受到挑戰(zhàn)[21]。對(duì)于植物AMT,研究者們根據(jù)一系列的試驗(yàn)證據(jù)提出了4種運(yùn)輸機(jī)制:如番茄LeAMT1.1、水稻OsAMT1.1的運(yùn)輸機(jī)制是NH4+單向運(yùn)輸[16-17];擬南芥AtAMT1.2、小麥TaAMT1.1的運(yùn)輸機(jī)制是NH3/H+共運(yùn)[22-23];菜用大豆的PvAMT1.1運(yùn)輸機(jī)制是 NH4+/H+同向運(yùn)輸[24];擬南芥AtAMT2的運(yùn)輸機(jī)制是NH3運(yùn)輸[25]。本研究解析出AtAMT1.3的運(yùn)輸機(jī)制是NH4+單向運(yùn)輸,原因如下:(1)酵母功能互補(bǔ)證明了AtAMT1.3 具有吸銨功能[5],電生理記錄得到了NH4+產(chǎn)生的電流(圖3),說明進(jìn)入蛙卵的銨形態(tài)是離子態(tài)的(因分子進(jìn)入不會(huì)產(chǎn)生電流),排除了NH3運(yùn)輸?shù)臋C(jī)制。(2)AtAMT1.3介導(dǎo)的銨內(nèi)流不受pH值調(diào)控(圖8),排除了NH4+/H+同向運(yùn)輸和NH3/H+共運(yùn)2種可能,因?yàn)槿绻沁@2種機(jī)制的話,外界pH值改變(pH 值由5.4 轉(zhuǎn)變到 74)使得溶液中H+的濃度減小100倍,即其中的一個(gè)底物量急劇減少,勢(shì)必會(huì)對(duì)其運(yùn)輸產(chǎn)生巨大的影響。事實(shí)上,AtAMT1.3介導(dǎo)的銨內(nèi)流不受外界pH影響(圖8),那么AtAMT1.3的銨運(yùn)輸機(jī)理只可能是NH4+單向運(yùn)輸。(3)吸收動(dòng)力學(xué)擬合得到AtAMT1.3的希爾吸收等于1,說明只有1種底物(圖6)。通過擬合Km值對(duì)電壓的依賴性,得到這個(gè)底物的結(jié)合位點(diǎn)位于整個(gè)膜電場(chǎng)52%的位置;進(jìn)一步說明AtAMT1.3的運(yùn)輸機(jī)制是 NH4+單向運(yùn)輸。AtAMT1.3運(yùn)輸機(jī)制與AtAMT1.1相同,而與AtAMT1.2不同;在同源性上前兩者之間也比AtAMT1.3與AtAMT1.2之間近 (圖4)。由此推測(cè),決定AtAMT1.3與AtAMT1.2 運(yùn)輸機(jī)制不同的很可能是與AtAMT1.1相同、而與AtAMT1.2差異較大的氨基酸區(qū)域,這個(gè)猜想需要進(jìn)一步的試驗(yàn)證實(shí)。
擬南芥中AtAMT1.3缺失突變體引起的側(cè)根分化差異表型,只能由AtAMT1.3 補(bǔ)回,而不能由AtAMT1.1補(bǔ)回[26]。AtAMT1.3在基本功能特征上與AtAMT1.1很相似,如對(duì)銨的高度選擇性和很高的親和力,NH4+作為轉(zhuǎn)運(yùn)底物,不受pH值調(diào)控 (圖5至圖7)。功能如此相似,表型卻不能被相似的AtAMT1.1恢復(fù),進(jìn)一步說明AtAMT1.3 在植物體內(nèi)除了養(yǎng)分吸收外還扮演其他的角色,如影響側(cè)根分化。
總體來說,本試驗(yàn)通過研究擬南芥的AtAMT1.3電生理功能特征,證明該蛋白是典型的高度選擇性的高親和銨吸收系統(tǒng),其對(duì)銨的親和力在微摩爾級(jí),而對(duì)甲基銨的親和力至少低了10倍。AtAMT1.3介導(dǎo)的銨內(nèi)流不受外界pH值調(diào)控,其運(yùn)輸機(jī)制是NH4+單向運(yùn)輸。
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