丁歡歡,李曉輝,戶克云,韋鵬飛
(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院鄭州450002)
黃瓜霜霉病抗性遺傳分析
丁歡歡,李曉輝,戶克云,韋鵬飛
(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院鄭州450002)
以華北型黃瓜霜霉病抗病自交系‘HNAU0023’、霜霉病感病自交系‘IL112’通過自交、雜交、回交所構(gòu)建的P1、P2、F1、F2、B1、B26個(gè)世代作為研究材料,使用6世代聯(lián)合分離分析軟件(SEA-G 6)對(duì)黃瓜霜霉病抗性進(jìn)行遺傳分析。結(jié)果表明,抗性遺傳的最佳模型為E-0模型,即“2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因”混合遺傳模型。2對(duì)主基因加性效應(yīng)相同,均為13.05;顯性效應(yīng)為負(fù)值,分別為-30.34、-15.88。B1、B2、F2的主基因遺傳率分別為68.63%、76.36%、87.15%,多基因遺傳率分別為0、7.25%、0,各分離世代主基因遺傳率明顯大于多基因遺傳率。因此,在黃瓜霜霉病抗性育種中應(yīng)優(yōu)先考慮主基因。
黃瓜;霜霉??;分離分析;遺傳分析
黃瓜(Cucumis sativus L.),也稱胡瓜、青瓜,在我國(guó)栽培歷史悠久,屬于葫蘆科一年生蔓生草本。霜霉病是黃瓜生產(chǎn)過程中一種常見的真菌性病害,一般自下而上發(fā)病,靠氣流傳播,再侵染頻繁,病害發(fā)生迅速,嚴(yán)重影響黃瓜的產(chǎn)量和品質(zhì)。而抗病自交系、感病自交系與病原菌分別發(fā)生非親和互作、親和互作反應(yīng),抗病品種發(fā)病輕,可以把霜霉病造成的危害控制在一定范圍內(nèi),所以培育并使用抗病品種無疑是減輕該病危害的最安全的有效措施[1]。
黃瓜霜霉病抗性遺傳規(guī)律作為抗病育種的重要理論依據(jù),具有重要的實(shí)踐意義。自1868年首次報(bào)道以來,不少學(xué)者投身于霜霉病抗性遺傳研究中,目前主要存在的有單基因抗性、多基因抗性2種結(jié)論:孟攀奇[2]的試驗(yàn)中,134株F2分離群體中抗病、中間型、感病3者比例基本符合1∶2∶1的比例,證明了抗性由隱性單基因控制,感病為不完全顯性基因控制;丁國(guó)華等[3]通過對(duì)F3單株進(jìn)行霜霉病抗病性鑒定,同樣證實(shí)了霜霉病抗性由單個(gè)隱性基因控制;而張素勤[4]的研究結(jié)果表明:黃瓜霜霉病抗性由2對(duì)加性效應(yīng)較強(qiáng)、顯性效應(yīng)較弱的主基因控制,遺傳力高,同時(shí)還受微效多基因控制;張勝菊[5]的研究結(jié)果同樣表明,黃瓜霜霉病抗性至少受2對(duì)基因控制,且加性效應(yīng)比顯性效應(yīng)大。隨著黃瓜全基因組測(cè)序的完成,大部分關(guān)于黃瓜霜霉病抗性遺傳規(guī)律的研究轉(zhuǎn)到了分子方面[6]:Pang、Zhang、Yosh?ioka、Szczechura等[7-10]在試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)了多個(gè)抗性相關(guān)QTL;2016年,Wang等[11]在研究中發(fā)現(xiàn)了2個(gè)霜霉病抗性主效QTL,同年,日本學(xué)者Khin ThandaWin等[12]采用田間自然鑒定法發(fā)掘了3個(gè)QTL。
試驗(yàn)材料、抗性鑒定方法、鑒定標(biāo)準(zhǔn)等的不同,導(dǎo)致黃瓜霜霉病抗性遺傳規(guī)律至今尚無定論,定位出的抗性相關(guān)QTL位點(diǎn)的數(shù)目與位置也不同,不能較好地應(yīng)用于黃瓜霜霉病抗性育種[13]。在遺傳研究方面,分離分析法與QTL定位各有獨(dú)特之處,雖然采用分子標(biāo)記進(jìn)行QTL定位是準(zhǔn)確獲得基因所在位置信息的最有效手段,但是分離分析法也是一種非常有效的數(shù)量性狀遺傳分析方法,目前已有多位學(xué)者采用分離分析法對(duì)數(shù)量性狀的遺傳規(guī)律進(jìn)行分析[4,14-15]。
筆者采用6世代聯(lián)合分離分析法[16-17]對(duì)P1、P2、F1、B1、B2、F26世代群體進(jìn)行霜霉病抗性遺傳分析,以期在前人研究的基礎(chǔ)上進(jìn)一步明確黃瓜霜霉病抗性遺傳規(guī)律,對(duì)黃瓜抗性QTL定位與抗性育種帶來實(shí)際的指導(dǎo)意義。
1.1 材料
以河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院黃瓜課題組提供的華北型黃瓜霜霉病感病自交系‘IL112’,霜霉病抗病自交系‘HNAU0023’分別為親本,以及通過這2份材料雜交、自交、回交所得的P1、P2、F1、F2、B1、B2共6個(gè)世代為抗性遺傳研究材料。
1.2 方法
1.2.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)2016年3—6月在河南農(nóng)業(yè)大學(xué)毛莊科技園區(qū)的塑料大棚內(nèi)進(jìn)行抗性鑒定試驗(yàn)。整個(gè)試驗(yàn)采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),各世代設(shè)3次重復(fù)。田間采用寬窄雙行定植,寬行行距80 cm,窄行行距40 cm,株距25 cm,試驗(yàn)材料與感病品種(病源)相間而種,并在棚前棚后各種植2行感病品種作為保護(hù)行,以保證在其他田間條件一致的情況下,病害在整個(gè)試驗(yàn)環(huán)境中均勻發(fā)生。定植后的管理參照春季大棚黃瓜田間常規(guī)管理方法,及時(shí)防治各種病蟲害的發(fā)生。霜霉病病斑初顯后,每隔3 d大水均勻漫灌1次,使田間發(fā)病均勻。連續(xù)漫灌3次后,每株材料隨機(jī)選擇3片葉進(jìn)行調(diào)查統(tǒng)計(jì),4 d調(diào)查1次,共調(diào)查4次。P1、P2、F1各調(diào)查45株,B1(54)、B2(54)、F2(360)全部調(diào)查。
1.2.2 分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)參考1983年Jenkins和Wehner的分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)將病害發(fā)病等級(jí)分為9級(jí):0級(jí),病斑面積為0;1級(jí),病斑面積占總面積的0~3%;2級(jí),病斑面積占總面積的3%~6%;3級(jí),病斑面積占總面積的6%~12%;4級(jí),病斑面積占總面積的12%~ 25%;5級(jí),病斑面積占總面積的25%~50%;6級(jí),病斑面積占總面積的50%~75%;7級(jí),病斑面積占總面積的75%~87%;8級(jí),病斑面積占總面積的87%~100%;9級(jí),病斑面積占總面積的100%;病情指數(shù)的計(jì)算公式為:
抗性分級(jí)標(biāo)準(zhǔn):高抗(HR)為0<DI≤15;抗?。≧)為15<DI≤35;中抗(MR)為35<DI≤55;感?。⊿)為55<DI≤75;高感為(HS)為DI>75。
遺傳分析采用章元明教授提供的數(shù)量性狀分離分析軟件(P1、P2、F1、B1、B2、F26世代聯(lián)合分離分析軟件SEA-G 6)和方法:即在24種遺傳模型中根據(jù)AIC值進(jìn)行候選遺傳模型的選擇,并通過對(duì)分布平均數(shù)U12、二階原點(diǎn)矩U22、二階中心矩U32等數(shù)字特征進(jìn)行的均勻性檢驗(yàn),以及對(duì)分布的整體參數(shù)進(jìn)行的Smirnov檢驗(yàn)、Kolmogorov檢驗(yàn)選出最佳遺傳模型,最后估計(jì)該模型的一階、二階遺傳參數(shù)。
2.1 各分離世代霜霉病抗性水平分布
由表1可以看出,P1平均病情指數(shù)為86.19,表現(xiàn)為高感;P2平均病情指數(shù)為4.39,表現(xiàn)為高抗:2親本間存在明顯的抗感差異。F1發(fā)病情況介于2親本之間,偏向感病親本,表明抗病性為隱性基因控制。P1、P2、F13個(gè)世代的病情指數(shù)變化范圍小,變異系數(shù)較小,表型性狀較穩(wěn)定。分離世代B1、B2、F2變異幅度大:B1集中分布于感病、高感水平,偏向感病親本‘IL112’;B2集中分布于高抗、抗病水平,偏向抗病親本‘HNAU0023’;F2代變化幅度最大,包含了高抗、抗病、中抗、感病、高感5個(gè)抗感水平,位于中抗、感病水平的植株數(shù)最多(圖1)。從表2可以看出,分離世代峰度、偏度的絕對(duì)值均小于1,表明黃瓜霜霉病抗性屬于數(shù)量性狀遺傳,可以用數(shù)量性狀分離分析方法進(jìn)行遺傳分析。
表1 各分離世代病情指數(shù)的比較
表2 分離世代正態(tài)性檢驗(yàn)
圖1 B1、B2、F2各分離世代抗性水平分布
2.2 黃瓜霜霉病抗性“主基因+多基因”遺傳模型的分析
表3顯示,AIC值較低的遺傳模型是B-1(2對(duì)加性-顯性-上位性主基因模型)、E-1(2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因模型)、E-0(2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因模型)模型,AIC值依次為5 041.179 1、5 051.444 4、5 054.237 3,可作為黃瓜霜霉病抗性遺傳分析的候選模型。
表3 各遺傳模型極大似然值和AIC值
2.3 候選模型的適合性檢驗(yàn)
表4檢驗(yàn)結(jié)果表明,B-1模型、E-1模型中分別有4個(gè)、3個(gè)統(tǒng)計(jì)量達(dá)到顯著水平,與分離群體的分布是不一致的;E-0模型中沒有統(tǒng)計(jì)量達(dá)到顯著水平,吻合度100%,為最佳遺傳模型。
表4 候選遺傳模型的適合性檢驗(yàn)
2.4 最佳模型的一階、二階遺傳參數(shù)估計(jì)
根據(jù)最小二乘法對(duì)最佳混合遺傳模型進(jìn)行一階、二階遺傳參數(shù)進(jìn)行估計(jì)。如表5、表6所示,“2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因”的遺傳模型中,第1對(duì)主基因的加性效應(yīng)為13.05、顯性效應(yīng)為-30.34、顯性度為-2.33;第2對(duì)主基因的加性效應(yīng)為13.05、顯性效應(yīng)為-15.88、顯性度為-1.22,且ha/da與hb/db的絕對(duì)值都大于1,顯性效應(yīng)值大于相應(yīng)的加性效應(yīng)值,表明這2對(duì)主基因的遺傳以顯性效應(yīng)為主;在上位性效應(yīng)中,2對(duì)主基因間的顯性×加性互作效應(yīng)較小,其余的互作效應(yīng)較大。從二階遺傳參數(shù)可以看出:B1、B2、F2的主基因遺傳率分別為68.63%、76.36%、87.15%,多基因遺傳率分別為0、7.25%、0,各分離世代主基因遺傳率均明顯大于多基因遺傳率,表明黃瓜霜霉病抗性以主基因遺傳為主,且在F2早期進(jìn)行選擇具有較高的效率。
表5 一階遺傳參數(shù)估計(jì)
表6 二階遺傳參數(shù)估計(jì)
本試驗(yàn)結(jié)果表明,黃瓜霜霉病抗性屬于數(shù)量性狀遺傳,易受環(huán)境影響,采用主基因+多基因分離分析法可以降低試驗(yàn)誤差,使結(jié)果更可靠。張素勤[4]對(duì)2個(gè)抗感雜交組合(K3×K6,K5×K6)進(jìn)行遺傳研究,所得最優(yōu)模型分別為E-1-0(2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因)、E-1-4(2對(duì)等加性主基因+加性-顯性多基因),分離世代主基因遺傳率高。龐欣[18]以黃瓜高抗霜霉病漸滲系‘IL52’與‘長(zhǎng)春密刺’2親本所構(gòu)建的4世代群體為材料,對(duì)荷蘭與南京2地所種材料進(jìn)行抗性遺傳分析,結(jié)果表明,在不同時(shí)間與地點(diǎn),抗性遺傳均符合E-1-1(2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因)模型,分離世代F2主基因遺傳率高,分別為91.78%、94.11%。本研究結(jié)果表明,‘HNAU0023’霜霉病抗性遺傳受“2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因”控制,與張素勤、龐欣2人的研究結(jié)果略有差異,材料的不同是主要原因,抗性鑒定方法及鑒定環(huán)境條件的不同也可能導(dǎo)致差異的存在。黃瓜霜霉病抗性遺傳機(jī)制復(fù)雜,但是從以上試驗(yàn)中,可以得出黃瓜霜霉病抗性遺傳中存在共同點(diǎn):在遺傳模型方面,共同表明黃瓜霜霉病抗性遺傳受2對(duì)主基因+多基因共同控制;在遺傳效應(yīng)上分離世代都以主基因遺傳為主。因此,在進(jìn)行抗性材料育種時(shí),應(yīng)在早期進(jìn)行選擇,優(yōu)先考慮主基因。本次試驗(yàn)材料可在F2早期進(jìn)行抗病材料篩選,效率高,結(jié)果可靠,同時(shí)也應(yīng)注意多基因的積累,使抗性穩(wěn)定持久[4,18]。此外,Wang等[11]發(fā)現(xiàn)了2個(gè)霜霉病抗性相關(guān)主效QTL和3個(gè)微效QTL位點(diǎn),在分子水平驗(yàn)證了黃瓜霜霉病抗性由“主基因+多基因”共同控制的結(jié)論。
因黃瓜霜霉病抗性易受環(huán)境的影響,在單因素環(huán)境下進(jìn)行抗性研究,雖具有一定的指導(dǎo)意義,但不全面,之后將在多因素環(huán)境條件下對(duì)‘HNAU0023’抗性遺傳規(guī)律進(jìn)行探究及驗(yàn)證,并以F2群體為材料進(jìn)行黃瓜霜霉病抗性QTL初步定位,以期在對(duì)結(jié)論進(jìn)行驗(yàn)證的同時(shí),找出主效基因在染色體上的具體位置與所關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,實(shí)現(xiàn)分子標(biāo)記輔助選擇育種。
[1]李建武.黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因篩選及過敏性抗病機(jī)制[D].武漢:華中農(nóng)業(yè)大學(xué),2010.
[2]孟攀奇,蔡麗靜,張桂華,等.與黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因連鎖的分子標(biāo)記研究[J].長(zhǎng)江蔬菜,2014(8):12-14.
[3]丁國(guó)華,秦智偉,周秀艷,等.黃瓜霜霉病抗病基因的RAPD及SCAR標(biāo)記[J].西北植物學(xué)報(bào),2007,27(9):1747-1751.
[4]張素勤,顧興芳,張圣平,等.黃瓜霜霉病抗性遺傳分析[J].西北植物學(xué)報(bào),2007,27(12):2416-2420.
[5]張勝菊,司龍亭.黃瓜霜霉病抗性的遺傳表現(xiàn)與基因效應(yīng)分析[J].北方園藝,2009(4):71-72.
[6]HUANG S,LI R,ZHANG Z,et al.The genome of the cucumber,CucumissativusL.[J].NatureGenetics,2009,41(12):1275-1281.
[7]PANG X,ZHOU X H,WAN H J,et al.QTL mapping of downy mildew resistance in an introgression line derived from interspecific hybridization between cucumber and Cucumis hystrix[J].Journal of Phytopathology,2013,161(7/8):536-543.
[8]ZHANG S P,LIU M M,MIAO H,et al.Chromosomal mapping and QTL analysis of resistance to downy mildew in Cucumis sativus[J].Plant Disease,2013,97(2):245-251.
[9]YOSHIOKA Y,SAKATA Y,SUGIYAMA M,et al.Identification of quantitative trait loci for downy mildew resistance in cucumber (Cucumis sativus L.)[J].Euphytica,2014,198(2):265-276.[10]SZCZECHURA W,STANIASZEK M,KLOSINSKA U,et al.Mo?lecular analysis of new sources of resistance to Pseudoperonospora cubensis(Berk.et Curt.)Rostovzev in cucumber[J].Russian Jour?nal of Genetics,2015,51(10):974-979.
[11]WANG Y,VANDEMLANGENBEG K,WEHNER T C,et al.QTL mapping for downy mildew resistance in cucumber inbred line WI7120(PI 330628)[J].Theoretical and Applied Genetics,2016,129(8):1493-1505.
[12]WIN K T,VEGAS J,ZHANG C Y,et al.QTL mapping for downy mildew resistance in cucumber via bulked segregant analysis us?ing next-generation sequencing and conventional methods[J].The? oretical&Applied Genetics,2016,130(1):199-211.
[13]熊艷,王鶴冰,向華豐,等.黃瓜霜霉病研究進(jìn)展[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2016,32(1):130-135.
[14]蓋鈞鎰,章元明,王建康.植物數(shù)量性狀遺傳體系[M].北京:科學(xué)出版社,2003:340-341.
[15]路緒強(qiáng),高磊,趙勝杰,等.西瓜果實(shí)番茄紅素含量的遺傳分析[J].中國(guó)瓜菜,2016,29(12):6-9.
[16]曹錫文,劉兵,章元明.植物數(shù)量性狀分離分析Windows軟件包SEA的研制[J].南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2013,36(6):1-6.
[17]蓋鈞鎰.植物數(shù)量性狀遺傳體系的分離分析方法研究[J].遺傳,2005,27(1):130-136.
[18]龐欣.黃瓜/酸黃瓜漸滲系抗霜霉病QTLs定位及其與霜霉菌早期互作的表達(dá)譜分析[D].南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2013.
Genetic analysis for downy mildew resistance in cucumber
DING Huanhuan,LI Xiaohui,HU Keyun,WEI Pengfei
(College of Horticulture,Henan Agricultural University,Zhengzhou 450002,Henan,China)
Six generation of P1,P2,F(xiàn)1,B1,B2,F(xiàn)2derived from a crossing between parent‘IL112’,a susceptible to downy mildew(DM),and parent‘HNAU0023’,a high resistant to DM,were used for genetic analysis of downy mildew resistance(DMR)in cucumber by SEA-G 6.The results showed that the best model was“E-0 model”,“two pair of additive-dominant-epistasis major gene+additive-dominance-epistasis interaction polygene”.The additive effects of two major genes were 13.05;dominance effect of the major gene were-30.34,-15.88.Heritability of the major gene in B1,B2,F(xiàn)2population was 68.63%,76.36%,87.15%;Heritability of the polygene was 0,7.25%,0.Heritability of the major gene was higher than the polygene,obviously.Therefore,in the breeding of resistance to cucumber downy mildew,major gene should be high priority.
Cucumber;Downy mildew;Segregation analysis;Genetic analysis
2017-03-10;
:2017-04-11
河南省科技攻關(guān)計(jì)劃(農(nóng)業(yè)領(lǐng)域)項(xiàng)目(142102110052)
丁歡歡,女,在讀碩士研究生,研究方向?yàn)槭卟诉z傳育種與分子生物學(xué)。E-mail:13938471389@163.com