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        侵染甘薯的DNA病毒研究進(jìn)展

        2017-06-05 14:20:15劉起麗張建新李學(xué)成石明旺歐行奇
        植物保護(hù) 2017年3期
        關(guān)鍵詞:檢測

        劉起麗, 張建新, 李學(xué)成, 石明旺, 歐行奇

        (1. 河南科技學(xué)院資源與環(huán)境學(xué)院, 新鄉(xiāng) 453003; 2. 河南師范大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院, 新鄉(xiāng) 453007; 3. 河南天方藥業(yè)有限公司, 駐馬店 463000)

        侵染甘薯的DNA病毒研究進(jìn)展

        劉起麗1, 張建新2, 李學(xué)成3, 石明旺1, 歐行奇1

        (1. 河南科技學(xué)院資源與環(huán)境學(xué)院, 新鄉(xiāng) 453003; 2. 河南師范大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院, 新鄉(xiāng) 453007; 3. 河南天方藥業(yè)有限公司, 駐馬店 463000)

        甘薯是重要的糧食作物和食品加工及工業(yè)原料。我國是世界上最大的甘薯生產(chǎn)國。病毒病是甘薯上的重要病害,目前世界上已報(bào)道的侵染甘薯的DNA病毒主要?dú)w屬于雙生病毒科Geminiviridae和花椰菜花葉病毒科Caulimoviridae。近年來,雙生病毒等DNA病毒嚴(yán)重影響我國甘薯的產(chǎn)量、品質(zhì)以及食品加工產(chǎn)業(yè)。本文簡介了甘薯在我國的重要地位和種植情況;具體介紹了侵染甘薯的菜豆金色花葉病毒屬Begomovirus、玉米線條病毒屬M(fèi)astrevirus及桿狀DNA病毒屬Badnavirus的病毒特征、分子變異、分類現(xiàn)狀和檢測方法。結(jié)合甘薯生產(chǎn)的實(shí)際情況,提出了目前甘薯DNA病毒研究中存在的問題及思考。本文旨在為我國甘薯DNA病毒病的綜合防控提供理論依據(jù)。

        甘薯; DNA病毒; 菜豆金色花葉病毒屬; 玉米線條病毒屬; 桿狀DNA病毒屬

        甘薯Ipomoeabatatas是世界上重要的糧食作物和食品加工及工業(yè)原料。據(jù)聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)統(tǒng)計(jì),世界上栽培甘薯的國家一共有50多個,主要分布在亞洲、非洲的多個發(fā)展中國家,其次為拉丁美洲,歐洲的種植面積極少[1]。我國是世界上甘薯種植面積最大的國家[2],近年來隨著雙生病毒科菜豆金色花葉病毒屬的病毒等多種DNA病毒在世界范圍內(nèi)多種作物上的擴(kuò)展和肆虐,我國的甘薯產(chǎn)業(yè)也面臨著多種DNA病毒的威脅,甘薯產(chǎn)量和品質(zhì)受到嚴(yán)重影響。鑒于最近幾年來國內(nèi)外報(bào)道的侵染甘薯的DNA病毒種類不斷增多、國際病毒分類委員會(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)及病毒分類權(quán)威專家關(guān)于DNA病毒分類標(biāo)準(zhǔn)的不斷變化和改進(jìn),本文結(jié)合我國甘薯產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀和病害發(fā)生情況,對侵染甘薯的DNA病毒的種類、特征、分子變異和檢測方法等進(jìn)行了綜述,旨在為我國甘薯DNA病毒病的綜合防控提供參考和依據(jù)。

        1 我國的甘薯種植現(xiàn)狀

        甘薯又稱紅薯、地瓜、山芋等,是旋花科Convolvulaceae甘薯屬Ipomoea一年生或多年生蔓生草本植物[3],總產(chǎn)量居世界糧食產(chǎn)量的第7位[4]。中國一直是世界上最大的甘薯生產(chǎn)國[2]。21世紀(jì)以來中國甘薯種植總面積緩慢下降,2001年為5.507×106hm2,2010年為3.684×106hm2,年遞減率約為5%,導(dǎo)致中國甘薯種植面積占世界總面積的比例從60.0%一直下降到45.0%[5-6]。2011年中國甘薯面積為4.6×106hm2,占世界總種植面積的1/2以上。盡管中國甘薯的種植面積緩慢下降,但單產(chǎn)量卻逐年不斷提高,甘薯產(chǎn)量一直保持在22.5 t/hm2,鮮薯總產(chǎn)量約為1.0×108t[7]。

        甘薯在我國的種植范圍較廣,從內(nèi)蒙古自治區(qū)到海南島,自西藏自治區(qū)至浙江省都有種植,尤其在我國黃河流域和長江流域各省份,甘薯的集中區(qū)域化種植非常突出[8-9]。據(jù)統(tǒng)計(jì),目前甘薯種植面積超過1.0×104hm2的省份約有16個[10-11]。依據(jù)耕作制度和氣候條件的不同,我國甘薯主要分為三大主產(chǎn)區(qū)[12]:北方薯區(qū)(主要有河北、山東、安徽、河南和江蘇共5個省份)、長江流域產(chǎn)區(qū)(主要有四川、湖北和重慶共3個省、直轄市)和南方薯區(qū)(主要有海南、廣東和福建共3個省份)。

        病毒病是甘薯上的重要病害,在世界各甘薯產(chǎn)區(qū)廣泛存在[13]。截至2012年,世界上已報(bào)道的能夠侵染甘薯的DNA病毒一共有16種[14],分別歸屬于雙生病毒科Geminiviridae和花椰菜花葉病毒科Caulimoviridae[14]。其中雙生病毒科病毒對甘薯的生長危害較重,可造成26%~63%的產(chǎn)量損失[15]。

        2 侵染甘薯的DNA病毒種類

        2.1 侵染甘薯的雙生病毒科Geminiviridae病毒

        雙生病毒科病毒是植物病毒中數(shù)目最多的一類DNA病毒,截至2017年3月11日,經(jīng)國際病毒分類委員會(ICTV)確定的已達(dá)369個種[16-17]。ICTV第十次病毒分類報(bào)告中,根據(jù)雙生病毒的基因組結(jié)構(gòu)特征、寄主范圍大小和傳播介體的不同,將雙生病毒科Geminiviridae劃分為9個屬[16],分別為:菜豆金色花葉病毒屬Begomovirus、玉米線條病毒屬M(fèi)astrevirus、甜菜曲頂病毒屬Curtovirus、番茄偽曲頂病毒屬Topocuvirus、伊朗甜菜曲頂病毒屬Becurtovirus、蕪菁曲頂病毒屬Turncurtovirus、畫眉草條紋病毒屬Eragrovirus、孔雀大戟潛隱病毒屬Capulavirus和葡萄紅斑病毒屬Grablovirus,其中孔雀大戟潛隱病毒屬Capulavirus和葡萄紅斑病毒屬Grablovirus是新建立的兩個屬[18]。已報(bào)道的侵染甘薯的雙生病毒科病毒僅限于菜豆金色花葉病毒屬Begomovirus和玉米線條病毒屬M(fèi)astrevirus的病毒。

        2.1.1 菜豆金色花葉病毒屬Begomovirus

        Begomovirus是雙生病毒科中成員最多的屬,截至2017年3月11日已確立322個正式種[17]。目前已報(bào)道的侵染甘薯的雙生病毒大部分屬于Begomovirus。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),侵染甘薯的Begomovirus病毒分離物聚成一簇,與舊世界病毒和新世界病毒處于不同分支,且與侵染其他植物的雙生病毒明顯分離開來,因此又被稱為“sweepoviruses”[19]。目前世界上已發(fā)現(xiàn)的sweepoviruses總共有11個種[17],分別為:甘薯曲葉病毒Sweetpotatoleafcurlvirus(SPLCV)、甘薯中國曲葉病毒SweetpotatoleafcurlChinavirus(SPLCCNV)、甘薯喬治亞曲葉病毒SweetpotatoleafcurlGeorgiavirus(SPLCGV)、甘薯加納利曲葉病毒SweetpotatoleafcurlCanaryvirus(SPLCCV)、甘薯圣保羅曲葉病毒SweetpotatoleafcurlSaoPaulovirus(SPLCSPV)、甘薯南卡羅萊納曲葉病毒SweetpotatoleafcurlSouthCarolinavirus(SPLCSCV)、甘薯烏干達(dá)曲葉病毒SweetpotatoleafcurlUgandavirus(SPLCUV)、甘薯斑駁病毒Sweetpotatomosaicvirus(SPMoV)、甘薯河南曲葉病毒SweetpotatoleafcurlHenanvirus(SPLCHnV)、甘薯四川曲葉病毒1SweetpotatoleafcurlSichuanvirus1(SPLCSiV-1)和甘薯四川曲葉病毒2SweetpotatoleafcurlSichuanvirus2(SPLCSiV-2)。

        2.1.2 玉米線條病毒屬M(fèi)astrevirus

        雙生病毒科中的玉米線條病毒屬M(fèi)astrevirus病毒也能夠侵染甘薯。目前已報(bào)道的僅有甘薯無癥病毒1 Sweet potato symptomless virus 1(SPSMV-1)[14,20]。

        2.2 侵染甘薯的花椰菜花葉病毒科Caulimoviridae病毒

        截至2016年,已報(bào)道的能夠侵染甘薯的花椰菜花葉病毒科Caulimoviridae的病毒有3個種[14],分別為:桿狀DNA病毒屬Badnavirus的Sweetpotatopakakuyvirus(SPPV),也稱為 Sweet potato badnavirus A and B (SPBV-A和SPBV-B);木薯脈花葉病毒屬Cavemovirus的Sweetpotatocollusivevirus,也稱為Sweet potato caulimo-like virus;以及Solendovirus屬的Sweetpotatoveinclearingvirus。

        3 甘薯DNA病毒的基因組特征

        3.1 Sweepoviruses的基因組特征及其變異

        Sweepoviruses絕大多數(shù)都屬于典型的舊世界病毒,即只發(fā)現(xiàn)了DNA-A組分,大小約為2.8 kb,其病毒正義鏈包含2個ORFs(編碼AV1和AV2基因);病毒互補(bǔ)鏈包含4個ORFs(編碼AC1~AC4基因),大多數(shù)學(xué)者的研究均未發(fā)現(xiàn)DNA-B組分以及伴隨的衛(wèi)星DNA分子的存在[21]。但值得關(guān)注的是,2013年Swapna Geetanjali等[22]在I.purpurea上發(fā)現(xiàn)了SPLCV的兩個不同的β衛(wèi)星(betasatellites):Croton yellow vein mosaic betasatellite (CroYVMβ)和Papaya leaf curl betasatellite (PaLCuβ),這是目前唯一的發(fā)現(xiàn)sweepoviruses的基因組伴隨有β衛(wèi)星的報(bào)道。2016年,Hassan等[23]發(fā)現(xiàn)了伴隨sweepoviruses的δ衛(wèi)星(deltasatellites);Gloria等[24]報(bào)道了非編碼DNA satellites的存在。

        目前sweepoviruses的變異研究相對較多,且主要集中于重組變異。Zhang等[15]報(bào)道了在美國發(fā)現(xiàn)的1個自然重組病毒:Sweet potato golden vein-associated virus,重組分析發(fā)現(xiàn),該病毒極有可能是由SPLCV和SPLCGoV兩個種自然重組而來,重組位點(diǎn)位于復(fù)制起點(diǎn)與AC2和AC4基因之間。Paprotk等[25]認(rèn)為侵染巴西甘薯的sweepoviruses的重組位點(diǎn)主要位于發(fā)卡結(jié)構(gòu)的結(jié)合處。Albuquerque等[26]發(fā)現(xiàn)巴西sweepoviruses的重組事件主要發(fā)生在IR區(qū)及AC1的中間部位。重組位點(diǎn)的多樣性表明該類病毒的變異可能發(fā)生在不同的位點(diǎn)。

        3.2 甘薯無癥病毒1(SPSMV-1)的基因組特征

        侵染甘薯的甘薯無癥病毒1(SPSMV-1)的結(jié)構(gòu)非常獨(dú)特,與其他mastreviruses病毒相比,它有一個比同屬病毒小得多的復(fù)制酶基因 (replicase gene)[14]。Mastreviruses的C1和C2蛋白質(zhì)通過選擇性剪接(圖1,在C2白色方框所示的內(nèi)含子的位置),使其具有相同的N-末端和不同的C-末端。SPSMV-1基因組比其他mastreviruses基因組小得多,且缺乏選擇性剪接的C2蛋白。此外,預(yù)測在SPSMV-1基因組的大型非編碼區(qū)可能存在兩個莖-環(huán)結(jié)構(gòu)(圖1)。

        圖1 SPSMV-1 與其他玉米線條病毒屬病毒基因組結(jié)構(gòu)比較(引自Clark[14])Fig. 1 Comparison of the organization of SPSMV-1 genome with genome typical of other plant mastreviruses(cited from Clark[14])

        3.3 甘薯?xiàng)U狀DNA病毒sweet potato badnavirus的基因組特征

        2009年,侵染甘薯的桿狀DNA病毒(SPBV)首次被發(fā)現(xiàn)。Badnaviruses病毒是一類環(huán)狀雙鏈DNA(double-stranded DNA,dsDNA)類逆轉(zhuǎn)錄病毒(pararetrovirus)[27]。病毒粒體桿狀,大小為(25~30) nm×(60~900) nm[28]。病毒基因組大小約為7.1~8.0 kb,核酸變異很大[29-34]。典型的Badnavirus病毒包含有3個ORFs[35](圖2)。侵染甘薯的桿狀DNA病毒(SPBV)包含SPBV-A和SPBV-B[36]。SPBV-A和SPBV-B均含5個ORFs,前2個ORFs和最后1個ORF均編碼3個小的假定蛋白(hypothetical protein);ORF3a編碼運(yùn)動蛋白和外殼蛋白(SPBV-A: 1 437~5 006 bp; SPBV-B: 1 486~4 998 bp);ORF3b編碼天冬氨酸蛋白酶域(aspartic protease domain; SPBV-A的ORF3b編碼)或天冬氨酸蛋白酶(aspartic protease, AP; SPBV-B的ORF3b編碼)、逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase,RT)和RNA酶H (ribonuclease H,Rnase H)[36]。

        圖2 桿狀DNA病毒基因組結(jié)構(gòu)(引自Kreuze[36])Fig.2 Viral genome structure of badnavirus(cited from Kreuze[36])

        4 侵染性克隆的構(gòu)建

        構(gòu)建侵染性克隆是研究病毒致病性的重要途徑,目前侵染甘薯的DNA病毒中,僅有sweepoviruses侵染性克隆的報(bào)道,其構(gòu)建原則與雙生病毒的侵染性克隆構(gòu)建原則一致,即需構(gòu)建一個具有1.3~2.0個拷貝的正向重復(fù)的雙生病毒基因組重組質(zhì)粒,且該正向重復(fù)序列中必須包括2個完整的CR區(qū)[37-38]。目前國內(nèi)外僅報(bào)道了兩個侵染性克隆。Trenado等[37]2011年成功構(gòu)建了Sweet potato leaf curl Lanzarote virus (SPLCLaV)的侵染性克隆,并研究了該侵染性克隆對不同種類植物及植物品種的致病性和癥狀表現(xiàn)。2012年,Bi等[38]構(gòu)建了甘薯曲葉病毒江蘇分離物(SPLCV-JS)的侵染性克隆,農(nóng)桿菌介導(dǎo)的病毒接種試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),單獨(dú)的SPLCV-JS侵染性克隆只能使本氏煙出現(xiàn)輕微癥狀和病毒DNA的微量積累,而將該侵染性克隆與一個異源衛(wèi)星DNA分子TYLCCNV-Y10的DNAβ共同接種本氏煙后,本氏煙發(fā)病癥狀更加明顯,病毒DNA的積累量也大大增加。侵染性克隆為這類病毒的致病性和基因功能的深入研究奠定了基礎(chǔ)。

        5 甘薯DNA病毒的分布

        5.1 Sweepoviruses的分布

        1985年,甘薯曲葉病在中國臺灣被發(fā)現(xiàn)[39]。1994年,研究者從美國一種觀賞甘薯上首次獲得了甘薯曲葉病毒Sweetpotatoleafcurlvirus(SPLCV)[40]。目前,以色列[41]、美國[40]、日本[42]、西班牙[43]、意大利[44]、秘魯[45]、肯尼亞[46]、韓國[47]、中國[48]和印度[49]等國家和地區(qū)均有sweepoviruses研究的報(bào)道。Sweepoviruses的多樣性和基因組變異已初步被人們認(rèn)知。在中國,sweepoviruses分離物僅在臺灣[39]、遼寧[21,48]、江蘇和浙江[38]、河北[50]、廣東[51]、四川[52]和河南[53]等省份或地區(qū)有正式的報(bào)道,包括5個種:甘薯中國曲葉病毒(SPLCCNV)、甘薯曲葉病毒(SPLCV)、甘薯喬治亞曲葉病毒(SPLCGV)、甘薯河南曲葉病毒(SPLCHnV)和甘薯四川曲葉病毒1(SPLCSiV-1)。

        5.2 甘薯無癥病毒1(SPSMV-1)的分布

        甘薯無癥病毒1(SPSMV-1)已經(jīng)從采自秘魯[36]、坦桑尼亞[52]、幾個中美洲和亞洲國家(CIP, unpublished)的甘薯樣品上檢測到,但是其檢出率遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于花椰菜花葉病毒科其他桿狀DNA病毒。坦桑尼亞和秘魯?shù)腟PSMV-1分離物的CP-MP區(qū)域相似性為100%[14],說明該病毒的CP-MP區(qū)域具有較高的保守性。國內(nèi)關(guān)于甘薯無癥病毒1的研究和報(bào)道非常少。2015年,Wang等[53]從采自中國14個省份的128份甘薯樣品中,利用檢測SPSMV-1的通用引物[52]檢測到2個來自不同省份的陽性樣品,所獲得的甘薯無癥病毒1(SPSMV-1)核酸序列與秘魯和坦桑尼亞報(bào)道的分離物匹配核酸序列區(qū)域的相似性達(dá)到了99%~100%。這是SPSMV-1在中國甘薯上的首次報(bào)道。

        6 甘薯DNA病毒的檢測方法

        6.1 血清學(xué)檢測

        目前尚未有在生產(chǎn)中廣泛應(yīng)用的檢測甘薯DNA病毒的特異性抗體的報(bào)道。喬貞貞等[54]2012年在大腸桿菌中成功高效表達(dá)了甘薯曲葉病毒江蘇分離物(SPLCV-JS)的CP基因;李學(xué)成等[55]2016年在大腸桿菌中高效表達(dá)了SPBV-B CP基因的部分片段,這些工作為該病毒的抗體制備和血清學(xué)檢測方法的建立奠定了基礎(chǔ)。

        6.2 PCR檢測

        目前用于檢測甘薯DNA病毒各組分的PCR引物較多。Briddon等[56]設(shè)計(jì)了BM-V/BM-C引物,可擴(kuò)增到sweepoviruses的DNA-A組分的基因組近全長序列。對于衛(wèi)星分子DNAβ的檢測,Briddon等[57]根據(jù)SCR序列設(shè)計(jì)的通用引物Beta 01/Beta 02被研究者們普遍采用。檢測甘薯無癥病毒1的通用引物SPSMV-1F/SPSMV-1R(目標(biāo)片段726 bp)和MastvkF/MastvsR(目標(biāo)片段426 bp)主要用于擴(kuò)增甘薯無癥病毒1的運(yùn)動蛋白和衣殼蛋白部分序列[52-53]。在甘薯?xiàng)U狀病毒(SPBV)的PCR檢測方法中,檢測SPBV-A的通用引物BadnaBKF/BadnaBsR[52]和檢測SPBV-B的通用引物rt-badB-F/rt-badB-R[58]已成功應(yīng)用。

        6.3 siRNA深度測序

        siRNA深度測序技術(shù)作為一種新的DNA測序技術(shù),能夠一次性處理大量樣品,大大提高了測序效率。2009年Kreuze[36]在用siRNA深度測序時除了獲得了SPFMV和SPCSV病毒序列之外,還獲得了2個新的桿狀DNA病毒(sweet potato badnavirus A和sweet potato badnavirus B)和1個玉米線條病毒(sweeptotato symptomless mastrevirus 1),并且發(fā)現(xiàn)這2個桿狀DNA病毒和1個玉米線條病毒與之前報(bào)道的badnaviruses和mastreviruses分離物的核酸相似性很高[36]。在坦桑尼亞,一種新的PCR與siRNA深度測序相結(jié)合的檢測技術(shù)被用來檢測SPSMV-1和SPPV[52]。siRNA深度測序的成本也越來越便宜,當(dāng)前制約siRNA深度測序技術(shù)的瓶頸主要是樣品處理耗時及后期生物信息數(shù)據(jù)分析方面存在的問題。

        7 我國甘薯DNA病毒研究存在的問題和展望

        (1)一直以來,我國對甘薯病毒病的研究主要集中于甘薯羽狀斑駁病毒Sweetpotatofeatherymottlevirus(SPFMV)等RNA病毒,對DNA病毒則缺乏全面系統(tǒng)的鑒定和研究。分子變異是致病性變異的基礎(chǔ),而中國甘薯DNA病毒的種類、分布、分子變異等情況一直都還不清楚,這直接導(dǎo)致了甘薯DNA病毒病的預(yù)警和防治工作缺乏科學(xué)依據(jù)。(2)侵染性克隆是研究病毒特性的重要途徑,但目前國際上只有Trenado等[37]構(gòu)建了SPLCLaV的侵染性克隆,國內(nèi)僅Bi等[38]構(gòu)建了SPLCV的侵染性克隆,其他種類的甘薯DNA病毒的侵染性克隆構(gòu)建及生物學(xué)特性研究均尚未見報(bào)道。這部分工作亟待深入開展。(3)在檢測方法上,目前許多引物在檢測甘薯DNA病毒的工作中起到了重要作用,但特異性檢測甘薯DNA病毒的血清學(xué)方法研究極少,這可能與近些年來國內(nèi)外對甘薯病毒病的研究尚不夠重視有關(guān);多重PCR技術(shù)非常適合用來檢測復(fù)合侵染現(xiàn)象較多的甘薯DNA病毒,但是目前已報(bào)道的多重PCR引物及方法很少;深度測序技術(shù)在甘薯DNA病毒檢測中的應(yīng)用的報(bào)道相對來說還比較少。制備高效的特異性抗體、多重PCR和深度測序技術(shù)均能夠大大提高病毒的檢測效率,在大量樣品的檢測工作中發(fā)揮重要作用,是值得重視的研究方向。(4)甘薯種苗的調(diào)運(yùn)與管理對病毒病的防控具有一定意義。在非洲,甘薯種苗在大陸的調(diào)運(yùn)是在CIP-Sweetpotato Action for Security and Health in Africa (SASHA)項(xiàng)目的指導(dǎo)下進(jìn)行的,為了保證這項(xiàng)工作的順利開展,肯尼亞、莫桑比克和加納檢疫中心的檢測容量和相關(guān)設(shè)施都在不斷改善。同時,這些檢疫中心也建立了甘薯知識門戶網(wǎng)站(http:∥sweetpotatoknowledge.org/)[14],這些好的做法都值得我們學(xué)習(xí)和借鑒。(5)在防治策略方面,目前對甘薯病毒病最為有效的防治方法就是利用莖尖分生組織培養(yǎng)技術(shù)培育脫毒甘薯;江蘇、山東、河南等省均對多個主栽品種進(jìn)行了脫毒研究并大面積示范推廣,取得了顯著效果[13]。在培育脫毒甘薯的基礎(chǔ)上,大力摸索快速高效的檢測方法、加強(qiáng)病毒病田間檢測;實(shí)行甘薯種薯和薯苗嚴(yán)格管理審批、有序調(diào)運(yùn);做好田間防蟲治蟲工作、減少病毒傳播的介體,這些都將為甘薯病毒病的有效防控起到積極作用。

        [1] 吳雨華. 世界甘薯加工利用新趨勢[J]. 食品研究與開發(fā), 2003(10): 5-8.

        [2] Tairo F, Mukasa S B, Jones R A C, et al. Unravelling the genetic diversity of the three main viruses involved in sweet potato virus disease (SPVD), and its practical implications[J]. Molecular Plant Pathology, 2005, 6(2): 199-211.

        [3] 陳萬祥, 楊金龍. 甘薯生產(chǎn)的現(xiàn)狀及開發(fā)利用的途徑[J]. 農(nóng)業(yè)裝備技術(shù), 2008(4): 32-36.

        [4] 劉慶昌. 甘薯在我國糧食和能源安全中的重要作用[J]. 科技導(dǎo)報(bào), 2004(9): 21-22.

        [5] 農(nóng)業(yè)部科技教育司, 財(cái)政部教科文司. 中國農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展報(bào)告(2009年度)[R]. 北京: 中國農(nóng)業(yè)出版社, 2010.

        [6] 農(nóng)業(yè)部科技教育司, 財(cái)政部教科文司. 中國農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展報(bào)告(2010年度)[R]. 北京: 中國農(nóng)業(yè)出版社, 2011.

        [7] 馬代夫, 李強(qiáng), 曹清河, 等. 中國甘薯產(chǎn)業(yè)及產(chǎn)業(yè)技術(shù)的發(fā)展與展望[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào), 2012(5): 969-973.

        [8] Zhang Liming, Wang Qingmei, Liu Qingchang, et al. Sweetpotato in China [M]∥Loebenstain G, Thottappilly G. Biology and biotechnology of sweetpotato. Netherland: Springer, 2009.

        [9] Gao Feng, Gong Yifu, Zhang Pinbo. Production and employment of virus-free sweet potato in China[J]. Crop Protection, 2000, 19: 105-111.

        [10]陸漱韻, 劉慶昌, 李惟基. 甘薯育種學(xué)[M]. 北京: 中國農(nóng)業(yè)出版社, 1998.

        [11]江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院, 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院. 中國甘薯栽培學(xué)[M]. 上海: 上??茖W(xué)技術(shù)出版社, 1984.

        [12]Xie Y P, Xing J Y, Li X Y, et al. Survey of sweetpotato viruses in China [J]. Acta Virologica, 2013, 57(1): 81-84.

        [13]張振臣, 馬淮琴, 張桂蘭. 甘薯病毒病研究進(jìn)展[J]. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué), 2000(9): 19-22.

        [14]Clark C A, Davis J A, Abad J A, et al. Sweetpotato viruses: 15 years of progress on understanding and managing complex diseases [J]. Plant Disease, 2012, 96: 168-185.

        [15]Zhang S C, Ling K. Genetic diversity of sweet potato begomoviruses in the United States and identification of a natural recombinant betweenSweetpotatoleafcurlvirusandSweetpotatoleafcurlGeorgiavirus[J]. Archives of Virology, 2011, 156(6): 955-968.

        [16]Zerbini F M, Briddon R W, Idris A, et al. ICTV virus taxonomy profiles:Geminiviridae[J]. Journal of General Virology, 2017, 98: 131-133.

        [17]ICTV. ICTV-Master-Species-List-2016[EB/OL]https: ∥talk. ictvonline. org/files/master-species-lists/m/msl/6776.

        [18]Varsani A, Roumagnac P, Fuchs M, et al.CapulavirusandGrablovirus: two new genera in the familyGeminiviridae[J]. Archives of Virology, 2017, doi: 10. 1007/s00705-017-3268-6.

        [19]Clark C A, Valverde R A, Fuentes S, et al. Research for improved management of sweetpotato pests and diseases: cultivar decline [J]. Acta Horticulturae, 2002, 583: 103-112.

        [20]ICTV.ICTV-Master-Species-List-2013 [EB/OL](2014-06-30).http:∥talk. ictvonline.org/files/ictv_documents/m/msl/4911.

        [21]Luan Y S, Zhang J, Liu D M, et al. Molecular characterization ofSweetpotatoleafcurlvirusisolate from China (SPLCV-CN) and its phylogenetic relationship with other members of theGeminiviridae[J]. Virus Genes, 2007, 35(2): 379-385.

        [22]Swapna Geetanjali A, Shilpi S, Mandal B. Natural association of two different betasatellites withSweetpotatoleafcurlvirusin wild morning glory (Ipomoeapurpurea) in India [J]. Virus Genes, 2013, 47(1): 184-188.

        [23]Hassan I, Orílio A F, Fiallo-Olivé E, et al. Infectivity, effects on helper viruses and whitefly transmission of the deltasatellites associated with sweepoviruses (genusBegomovirus, familyGeminiviridae)[J]. Scientific Reports, 2016, 6: 30204.

        [24]Lozano G, Trenado H P, Fiallo-Olivé E, et al. Characterization of non-coding DNA satellites associated with sweepoviruses (genusBegomovirus,Geminiviridae)-definition of a distinct class ofBegomovirus-associated satellites [J]. Frontiers in Microbiology, 2016, 7: 162-167.

        [25]Paprotka T, Boiteux L S, Fonseca M E N, et al. Genomic diversity of sweet potato geminiviruses in a Brazilian germplasm bank [J]. Virus Research, 2010, 149(2): 224-233.

        [26]Albuquerque L C, Inoue-Nagata A K, Pinheiro B, et al. Genetic diversity and recombination analysis of sweepoviruses from Brazil [J]. Virology Journal, 2012, 9: 241.

        [27]King A M Q, Adams M J, Carstcns E B, et al. Virus Taxonomy-9th Report of the ICTV [R]. San Diego: Elsevier/Academic Press, 2012.

        [28]Su L, Gao S, Huang Y, et al. Complete genomic sequence of Dracaena mottle virus, a distinct badnavirus [J]. Virus Genes, 2007, 35(2): 423-429.

        [29]費(fèi)繼鋒, 肖火根, 李華平, 等. 香蕉線條病毒病研究進(jìn)展[J]. 病毒學(xué)報(bào), 2001, 17(4): 381-385.

        [30]Geering A D W, McMichael L A, Dietzgen R G, et al. Genetic diversity among Banana streak virus isolates from Australia[J]. Phytopathology, 2000, 90(8): 921-927.

        [31]Harper G, Hart D, Moult S, et al. Banana streak virus is very diverse in Uganda [J]. Virus Research, 2004, 100(1): 51-56.

        [32]Harper G, Hart D, Moult S, et al. The diversity of Banana streak virus isolates in Uganda[J]. Archives of Virology, 2005, 150(12): 2407-2420.

        [33]Jaufeerally-Fakim Y, Khorugdharry A, Harper G. Genetic variants of Banana streak virus in Mauritius [J]. Virus Research, 2006, 115(1): 91-98.

        [34]Muller E, Sackey S. Molecular variability analysis of five new complete Cacao swollen shoot virus genomic sequences [J]. Archives of Virology, 2005, 150(1): 53-66.

        [35]Tzafrir I, Ayala-Navarrete L, Lockhart B E L, et al. The N-terminal portion of the 216-kDa polyprotein of commelina yellow mottle badnavirus is required for virus movement but not for replication [J]. Virology, 1997, 232(2): 359-368.

        [36]Kreuze J F, Perez A, Untiveros M, et al. Complete viral genome sequence and discovery of novel viruses by deep sequencing of small RNAs: A generic method for diagnosis, discovery and sequencing of viruses [J]. Virology, 2009, 388(1): 1-7.

        [37]Trenado H P, Orílio A F, Márquez-Martín B, et al. Sweepoviruses cause disease in sweet potato and relatedIpomoeaspp.: Fulfilling Koch's postulates for a divergent group in the genusBegomovirus[J]. PLoS ONE, 2011, 6(11): e27329.

        [38]Bi H, Zhang P. Molecular characterization of two sweepoviruses from China and evaluation of the infectivity of cloned SPLCV-JS inNicotianabenthamiana[J]. Archives of Virology, 2012, 157(3): 441-454.

        [39]Chung M L, Liao C H, Chen M J, et al. The isolation transmission and host range of sweet potato leaf curl disease agent in Taiwan [J]. Plant Protection Bulletin, 1985, 27: 333-341.

        [40]Lotrakul P, Valverde R A, Clark C A, et al. Detection of a geminivirus infecting sweet potato in the United States [J]. Plant Disease, 1998, 82: 1253-1257.

        [41]Cohen J, Milgram M, Antignus Y, et al. Ipomoea crinkle leaf curl caused by a whitefly-transmitted gemini-like virus[J]. Annals of Applied Biology, 1997, 131: 273-282.

        [42]Onuki M, Hanada K. PCR amplification and partial nucleotide sequences of three dicot-infecting geminiviruses occurring in Japan[J]. Annals of the Phytopathological Society of Japan, 1998, 64: 116-120.

        [43]Banks G K, Bedford I D, Beitia F J, et al. A novel geminivirus ofIpomoeaindica(Convolvulacae) from Southern Spain[J]. Plant Disease, 1999, 83: 486.

        [44]Briddon R W, Bull S E, Bedford I D. Occurrence ofSweetpotatoleafcurlvirusin Sicily [J]. Plant Pathology, 2006, 55: 286.

        [45]Fuentes S, Salazar L F. First report ofSweetpotatoleafcurlvirusin Peru [J]. Plant Disease, 2003, 87: 98.

        [46]Miano D W, LaBonte D R, Clark C A, et al. First report of a begomovirus infecting sweetpotato in Kenya[J]. Plant Disease, 2006, 90: 832.

        [47]Kwak H R, Kim M K, Chung M N, et al. Virus disease incidences of sweet potato in Korea [J]. The Plant Pathology Journal, 2006, 22: 239-247.

        [48]Luan Y S, Zhang J, An L J. First report ofSweetpotatoleafcurlvirusin China [J]. Plant Disease, 2006, 90 (8): 1111.

        [49]Prasanth G, Hegde V. Occurrence ofSweetpotatofeatherymottlevirusandSweetpotatoleafcurlGeorgiaviruson sweet potato in India [J]. Plant Disease, 2008, 92: 311.

        [50]Qin Y H, Zhang Z Z, Qiao Z, et al. First report ofSweetpotatoleafcurlGeorgiaviruson sweet potato in China [J]. Plant Disease, 2013, 97(10): 1388.

        [51]湯亞飛, 何自福, 韓利芳, 等. 侵染廣東甘薯的甘薯曲葉病毒分子檢測與鑒定[J]. 植物保護(hù), 2013, 39(4): 25-28.

        [52]Liu Qili, Zhang Zhenchen, Qi Qiao, et al. Complete genome sequence of a novel monopartite begomovirus infecting sweet potato in China [J]. Virus Genes, 2013,47(3):591-594.

        [53]Liu Qili, Zhang Zhenchen, Li Jianqiang et al. Complete genome sequence of a novel monopartite begomovirus infecting sweet potato in China [J]. Archives of Virology, 2014,159(6):1537-1540.

        [54]Mbanzibwa D R, Tairo F, Gwandu C, et al. First report ofSweetpotatosymptomlessvirus1 andSweetpotatovirusAin sweetpotatoes in Tanzania[J]. Plant Disease, 2011, 95(2): 224.

        [55]Wang Y J, Zhang D S, Zhang Z C, et al. First Report onSweetpotatosymptomlessvirus1(genusMastrevirusfamilyGeminiviridae) in sweetpotato in China[J]. Plant Disease, 2015, 99(7): 1042.

        [56]喬貞貞, 秦艷紅, 喬奇, 等. 甘薯卷葉病毒江蘇分離物基因組全長序列測定及其外殼蛋白基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué), 2012(4): 86-89.

        [57]李學(xué)成, 張振臣, 喬奇, 等. 甘薯?xiàng)U狀DNA病毒B的分子檢測及外殼蛋白CP基因的原核表達(dá)[J]. 植物保護(hù)學(xué)報(bào), 2016,43(2): 345-346.

        [58]Briddon R W, Markham P G. Universal primers for the PCR amplification of dicot-lnfecting geminiviruses [J]. Molecular Biotechnology, 1994, 1(2): 202-205.

        [59]Briddon R W, Bull S E, Mansoor S, et al. Universal primers for the PCR-mediated amplification of DNAβ[J]. Molecular Biotechnology, 2002, 20(3): 315-318.

        [60]Kashif M, Pietil? S, Artola K. Detection of viruses in sweetpotatoes from Honduras and Guatemala augmented by deep-sequencing of small-RNAs[J]. Plant Disease, 2012, 96(10): 1430-1437.

        (責(zé)任編輯:楊明麗)

        Advances in research of DNA virus infecting sweet potato

        Liu Qili1, Zhang Jianxin2, Li Xuecheng3, Shi Mingwang1, Ou Xingqi1

        (1. College of Resource and Environmental Science, Henan Institute of Science and Technology,Xinxiang 453003, China; 2. College of Fisheries, Henan Normal University, Xinxiang 453007, China;3. Henan Top Found Pharmaceutical Co. Ltd, Zhumadian 463000, China)

        Sweet potato is an important food crops and food processing and industrial raw materials. China is the largest producer of sweet potato in the world. Virus diseases were the important diseases on sweet potato. The reported viruses infecting sweet potato mainly belonged toGeminiviridaeandCaulimoviridae. In recent years, begomoviruses and other DNA viruses became serious threats to planting industry of sweet potato in China and influenced the yield, quality of sweet potato and the food processing industry. In order to know more about the DNA viruses infecting sweet potato, the important status and planting situation of sweet potato in China were briefly introduced, and the characteristics, molecular variation, classification situation and detection methods of these viruses belonged toBegomovirus,MastrevirusandBadnaviruswere concretely described in this review. Combining with the actual situation of sweet potato planting in China, the existing problems and thinking in the research of DNA viruses infecting sweet potato were brought up. The objects of this paper were to provide the theoretical basis for the comprehensive prevention and control for sweet potato diseases infected by DNA viruses.

        sweet potato; DNA virus;Begomovirus;Mastrevirus;Badnavirus

        2016-06-29

        2016-08-05

        國家自然科學(xué)基金(31372105);國家十三五重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2016YFD0201000);河南科技學(xué)院高層次人才科研啟動項(xiàng)目(2015028)

        S 435.31

        A

        10.3969/j.issn.0529-1542.2017.03.006

        聯(lián)系方式 E-mail: liuqili2002@163.com

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