汪文娟周繼勇汪聰穎蘇菁封金奇陳炳馮愛(ài)卿楊健源陳深朱小源,*
(1廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所/廣東省植物保護(hù)新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州510640;2廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站,廣州510520;*通訊聯(lián)系人,E-mail:zhuxy@gdppri.com)
八個(gè)抗稻瘟病基因在華南秈型雜交水稻中的分布
汪文娟1周繼勇2汪聰穎1蘇菁1封金奇1陳炳1馮愛(ài)卿1楊健源1陳深1朱小源1,*
(1廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所/廣東省植物保護(hù)新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州510640;2廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站,廣州510520;*通訊聯(lián)系人,E-mail:zhuxy@gdppri.com)
【目的】已克隆的稻瘟病抗性基因Pi1、Pik-p、Pik-h、Pi2、Pi9、Piz-t、Pita、Pii對(duì)不同稻區(qū)的稻瘟病菌表現(xiàn)較廣譜的抗性,被廣泛應(yīng)用于水稻抗瘟性育種。為了明確上述抗性基因在華南稻區(qū)雜交稻組合中的分布及其組合的抗病有效性,【方法】利用上述8個(gè)抗病基因的功能標(biāo)記,對(duì)華南328個(gè)雜交稻組合進(jìn)行了抗瘟基因型分子檢測(cè)?!窘Y(jié)果】抗性基因Pita和Pii分布頻率最高,在測(cè)試組合中檢出率分別為84.76%與67.68%;其次是Pi2與Pik-p,分別為22.87%與13.72%;檢出頻率較低的是Pi1、Piz-t和Pik-h,分別為5.18%、3.35%與2.13%,檢測(cè)的品種都不攜帶抗性基因Pi9。在單個(gè)雜交稻組合中,檢出的抗瘟基因數(shù)量最多是4個(gè)。抗病性評(píng)價(jià)結(jié)果表明,雜交稻組合中檢出的抗病基因數(shù)量越多,其表現(xiàn)為抗病品種的頻率就越高;含4個(gè)抗病基因的雜交稻組合中,抗病品種所占比率達(dá)91.67%。含有不同抗瘟基因的組合表現(xiàn)出不同水平的抗瘟性,其中Pi2與Pi1對(duì)華南稻區(qū)稻瘟病的抗病性貢獻(xiàn)最大,其他抗病基因的貢獻(xiàn)大小依次是Pik-h、Pik-p、Pita、Pii與Piz-t?!窘Y(jié)論】本研究為華南稻區(qū)雜交稻抗病品種基因型的合理布局以及抗瘟基因的應(yīng)用提供了科學(xué)依據(jù)。
雜交稻組合;抗病基因;稻瘟??;基因型分析;分子標(biāo)記
水稻(Oryza sativa)是世界上重要的糧食作物,全球半數(shù)以上的人口以稻米作為主食[1]。由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病是威脅水稻糧食生產(chǎn)的最具毀滅性的病害之一[2],發(fā)病輕時(shí)導(dǎo)致減產(chǎn),嚴(yán)重時(shí)局部田塊甚至顆粒無(wú)收[3]。稻瘟病也是華南水稻生產(chǎn)中最重要的病害,近年來(lái)在華南發(fā)生日益嚴(yán)重,如華南稻區(qū)的天優(yōu)998、五優(yōu)308、天優(yōu)368等主栽品種的抗性相繼衰退或喪失,在部分稻區(qū)發(fā)生了稻瘟病大面積流行或暴發(fā),對(duì)糧食的生產(chǎn)安全造成了嚴(yán)重影響[4,5]。目前,選育和種植抗病水稻品種是防治稻瘟病最經(jīng)濟(jì)、環(huán)保及有效的措施[6]。因此,摸清主栽品種與新選育的抗病品種的抗瘟基因型,是抗病品種科學(xué)應(yīng)用的首要前提。
20世紀(jì)60年代中期,日本率先對(duì)水稻稻瘟病的抗病基因開(kāi)展了系統(tǒng)的研究。隨后,源自不同水稻品種的90多個(gè)主效抗稻瘟病基因被鑒定[7]。近年來(lái),國(guó)內(nèi)研究者對(duì)已鑒定的部分抗稻瘟病基因進(jìn)行了抗性有效性評(píng)價(jià)。李進(jìn)斌等[8]分析了22個(gè)抗瘟基因在云南省3個(gè)稻區(qū)的抗性情況,發(fā)現(xiàn)Pi9和Piz5在云南稻區(qū)具有較好的抗性;楊健源等[9]的研究表明,華南稻區(qū)目前有效的抗性基因主要為Pi1、Pi2、Pita等;并且發(fā)現(xiàn)目前華南秈稻區(qū)育種者利用的抗瘟基因多為Pi1與Pi2[10,11];張國(guó)民等[12]分析了24個(gè)抗瘟基因在我國(guó)寒地稻區(qū)的抗性情況,發(fā)現(xiàn)Pi9對(duì)該稻區(qū)的稻瘟病菌表現(xiàn)出廣譜抗性。然而,我國(guó)大部分稻區(qū)水稻品種的抗瘟基因型仍不清晰,有待分析與研究;該方面研究滯后的原因,主要是缺乏基因型快速有效的檢測(cè)技術(shù)。迄今,已經(jīng)成功克隆出Pib、Pi9、Pi2、Piz-t、Pik、Pik-p、Pik-h、Pi1、Pita、Pii、Pi50和Pi64等26個(gè)稻瘟病抗性基因[13,14]。利用基因序列信息,發(fā)展特異性功能標(biāo)記,可快速檢測(cè)品種的抗稻瘟病基因型[15,16],這對(duì)全面了解我國(guó)水稻抗稻瘟病的基因型及其合理布局與輪換有著重要意義。
我們利用Pi1、Pik-p、Pik-h、Pi2、Pi9、Piz-t、Pita、Pii等8個(gè)抗病基因功能性分子標(biāo)記,對(duì)華南稻區(qū)328個(gè)雜交水稻組合進(jìn)行了抗瘟基因型檢測(cè),旨在摸清該稻區(qū)雜交稻組合的基因型,為華南稻區(qū)抗病品種的合理布局及進(jìn)一步選育新型的抗瘟雜交稻組合提供依據(jù)。
1.1 植物材料
本研究所用材料包括328個(gè)近5年推廣及新參試的華南秈型雜交稻組合,其種子由廣東省省級(jí)水稻品種區(qū)域試驗(yàn)主持單位提供。
水稻種子經(jīng)0.5%強(qiáng)氯精消毒5 min,25℃清水浸泡24 h,濾干種子,置于35℃培養(yǎng)箱中催芽24 h。萌芽的種子以4行×6列的間隔穴播于盛有栽培泥土的瓷盤(pán)里(規(guī)格30 cm×20 cm×5 cm),每天澆水1~2次。待秧苗長(zhǎng)至1葉1心期,每盆施0.5 g硫酸銨,每間隔3 d施用一次,共施3次。待植株長(zhǎng)至2.5~3.0葉齡,進(jìn)行標(biāo)樣的采集。
1.2 病原菌材料、培養(yǎng)及接種調(diào)查
1.2.1 菌株來(lái)源
室內(nèi)抗譜測(cè)定選用的50~64個(gè)菌株為單孢分離菌株,均采自主栽品種。這些菌株來(lái)源于廣東、廣西、福建等地,主要是根據(jù)當(dāng)年或上一年稻瘟病菌生理小種的致病性測(cè)定情況挑選出的代表性菌株,對(duì)稻瘟病單基因系的致病性上具有豐富的多樣性;所有菌株均保存于廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所。
1.2.2 菌株活化、繁殖及產(chǎn)孢
將保存的菌株轉(zhuǎn)移至酵母固體培養(yǎng)基,放于生化培養(yǎng)箱中,活化培養(yǎng)7 d以上;然后將菌絲體轉(zhuǎn)移到高溫高壓濕熱滅菌的玉米培養(yǎng)基上繁殖,在生化培養(yǎng)箱中培養(yǎng)約13 d。產(chǎn)孢:先用滅菌過(guò)的無(wú)菌水洗去玉米粒表面的菌絲,再將玉米粒置于已消毒的搪瓷盤(pán)中(25 cm×19 cm×2 cm)鋪開(kāi),并在上面覆蓋一層濕紗布,然后在日光燈下光照培養(yǎng)3~4 d進(jìn)行產(chǎn)孢。以上菌株的活化、繁殖及產(chǎn)孢均在25℃下進(jìn)行。
1.2.3 接種調(diào)查
用無(wú)菌水將附在玉米粒上的分生孢子洗下,用2層塑料細(xì)紗網(wǎng)隔去玉米殘?jiān)?,?00倍顯微鏡下鏡檢,選取濃度為5×105個(gè)/mL的孢子懸浮液進(jìn)行人工噴霧接種;接種后的稻苗置于自制的相對(duì)濕度達(dá)95%以上的培養(yǎng)箱中暗培養(yǎng)24 h,溫度控制在25℃左右。之后轉(zhuǎn)至玻璃溫室中,接種7 d后進(jìn)行調(diào)查。病級(jí)調(diào)查按照國(guó)際水稻所稻瘟病圃苗瘟分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行:0~3級(jí)為抗,4~9級(jí)為感??剐灶l率(%)為無(wú)毒的菌株數(shù)目與總測(cè)定菌株數(shù)目之比。
1.2.4 抗病性綜合評(píng)價(jià)
依據(jù)田間病圃鑒定與室內(nèi)抗譜測(cè)定,綜合評(píng)價(jià)雜交稻組合的抗性。田間病圃分別設(shè)在廣東稻區(qū)的曲江、從化、龍川、陽(yáng)江、信宜等5個(gè)自然病區(qū)。室內(nèi)抗譜測(cè)定選用的菌株來(lái)源于廣東、廣西、福建等地,稻瘟病菌株均為單孢分離菌株,接種菌株數(shù)為50~64個(gè)。依據(jù)雜交稻組合在病區(qū)的穗瘟病級(jí)以及室內(nèi)抗譜測(cè)定的數(shù)據(jù),對(duì)組合做出綜合抗性評(píng)判,抗性級(jí)別由高至低排序?yàn)椋焊呖埂⒖?、中抗、中感、感、高感?個(gè)級(jí)別。調(diào)查與評(píng)價(jià)方法參照朱小源等[17]和馮愛(ài)卿等[18]的方法。
1.3 標(biāo)樣采集及DNA提取
每個(gè)品種采集2個(gè)單株的葉片,混合收集于2.0 mL的離心管中,經(jīng)液氮速凍后,置于-80℃的冰箱內(nèi)儲(chǔ)藏備用。
首先將裝有水稻葉片的離心管放在液氮中浸泡約5 min,隨后用快速組織破碎儀磨碎葉片,再用百泰克生物技術(shù)(北京)有限公司的新型快速植物基因組DNA提取試劑盒,提取水稻葉片總DNA。
1.4 抗病基因Pi2、Pi9、Pita等8個(gè)基因特異性分子標(biāo)記與檢測(cè)
1.4.1 抗病基因Pi2、Pi9、Pita等8個(gè)基因特異性分子標(biāo)記
本研究中Pik-p、Pik-h與Pi1基因特異性分子標(biāo)記是Zhai等[19]與Hua等[20]開(kāi)發(fā)的Pik簇復(fù)等位基因間特異性分子標(biāo)記。首先,基于日本晴參考序列與Pik簇等位基因序列間的較大差異,開(kāi)發(fā)了K1標(biāo)記,用于區(qū)分水稻品種含有的K型(Kusabue/K60)與N型(日本晴)兩種基因型[19,21];其次,通過(guò)對(duì)Pik-m/Pik-p/Pik/Pi1及日本晴的感病等位基因編碼區(qū)進(jìn)行序列比對(duì),找出各等位基因特異的SNP,利用dCAPS Finder 2.0軟件(http://helix.wustl.edu/dcaps/dcaps.html)[22],針對(duì)包含該SNP位點(diǎn)的序列,在其兩翼設(shè)計(jì)引物,開(kāi)發(fā)出能區(qū)分Pik簇復(fù)等位基因Pik-p、Pik-h與Pi1的dCAPS標(biāo)記。Pii特異性CAPS標(biāo)記是Takagi等[23]根據(jù)Pii供體品種Hitomeborn與日本晴中pii感病等位基因序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)在PvuⅡ酶切位點(diǎn)處存在SNP多態(tài)性而開(kāi)發(fā)的Pii-CAPS標(biāo)記。Pi2、Pi9與Piz-t特異性分子標(biāo)記依據(jù)華麗霞等[24]設(shè)計(jì)的標(biāo)記。Pita基因特異性標(biāo)記是通過(guò)將Pita全基因序列與日本晴的感病等位基因進(jìn)行比對(duì),找出特異的SNP,開(kāi)發(fā)出能特異性地檢測(cè)Pita基因的dCAPS標(biāo)記(未發(fā)表資料)。各標(biāo)記的具體信息見(jiàn)表1。
1.4.2 抗病基因Pi2、Pi9、Pita等8個(gè)基因特異性分子標(biāo)記的檢測(cè)
利用開(kāi)發(fā)的Pi2、Pi9、Pita等8個(gè)基因特異性分子標(biāo)記,對(duì)328個(gè)華南稻區(qū)雜交稻組合分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并利用相應(yīng)的限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切,檢測(cè)各雜交稻組合的基因型。分子標(biāo)記PCR擴(kuò)增:反應(yīng)總體積為20μL,其中包括水稻基因組DNA(20~30 ng/μL)1 μL,10× PCR緩沖液10 μL,各1 μL正反向引物(10 μmol/L),ddH2O 7 μL。PCR程序如下:94℃下預(yù)變性3 min;94℃下變性30 s,55℃~60℃下退火30 s,72℃下延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。PCR儀上擴(kuò)增結(jié)束后,以各單管的PCR產(chǎn)物為模板,利用相應(yīng)的限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行酶切,酶切體系為10 μL,其中,包括PCR產(chǎn)物10 μL,10×酶切緩沖液1 μL,限制性?xún)?nèi)切酶0.3 μL,ddH2O 3.7 μL。各單管酶切混合液,在相應(yīng)內(nèi)切酶最適宜的酶切溫度下(一般是37℃)酶切3 h,產(chǎn)物加入載樣緩沖液后,在6%~8%的聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行電泳檢測(cè),電泳條件為120 V,2.5~3.0 h。
表1 各基因特異標(biāo)記檢測(cè)引物Table 1.Specific marker detecting primers for each gene.
圖1 基于特異性SNP分子標(biāo)記的水稻品種抗瘟基因檢測(cè)Fig.1.Detection of R genes in rice cultivars with specific SNP markers.
2.1 雜交稻組合的抗瘟基因型及其分布
本研究先利用能區(qū)別Pik位點(diǎn)K型/N型結(jié)構(gòu)的引物K1,對(duì)328個(gè)雜交稻組合進(jìn)行了抗瘟基因檢測(cè),結(jié)果在211個(gè)雜交稻組合中檢測(cè)到含有K型的Pik等位基因簇;再利用Pik等位基因簇的Pik-p、Pik-h與Pi1的特異性SNP標(biāo)記,對(duì)這211個(gè)K型品種進(jìn)行Pik-p、Pik-h與Pi1基因型分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),其中有45個(gè)品種含有Pik-p,有17個(gè)品種含有Pi1,有7個(gè)品種含有Pik-h。此外,利用Pi2、Pi9、Piz-t、Pita及Pii基因特異性SNP標(biāo)記,分別對(duì)該328個(gè)雜交稻組合進(jìn)行了抗瘟基因型檢測(cè)。結(jié)果表明,在這些雜交稻組合中絕大部分能檢測(cè)到Pi2、Pi9、Piz-t、Pita及Pii等抗病基因及其感病等位基因,部分基因特異性分子標(biāo)記的檢測(cè)結(jié)果如圖1所示。
在檢測(cè)的雜交稻組合中,抗性基因Pita和Pii分布頻率最高,在測(cè)試組合中的檢出率分別為84.76%與67.68%;其次是抗性基因Pi2和Pik-p,分別為22.87%與13.72%。在這些雜交稻組合中,檢出頻率較低的抗性基因是Pi1、Piz-t與Pik-h,分別為5.18%、3.35%與2.13%。檢測(cè)的328個(gè)雜交稻組合都不攜帶抗性基因Pi9(圖2)。
2.2 雜交稻組合聚合的抗瘟基因數(shù)量分析
對(duì)328個(gè)雜交稻組合檢出的抗瘟基因數(shù)量進(jìn)行分析,裕優(yōu)132、恒豐優(yōu)華占、吉豐優(yōu)華占與金稻優(yōu)618等12個(gè)雜交稻組合檢出了4個(gè)抗瘟基因,是檢出抗瘟基因數(shù)量最多的雜交稻組合,占總檢測(cè)組合的比率是3.66%。這12個(gè)組合中除都檢出了Pi2、Pii、Pita基因外,其中有5個(gè)組合檢出了Pi1基因,有7個(gè)組合檢出了Pik-p基因。天優(yōu)613、天優(yōu)173、永豐優(yōu)9802與榮優(yōu)華占等76個(gè)雜交稻組合檢出了3個(gè)抗瘟基因,占總檢測(cè)組合的比率是23.17%。在這76個(gè)雜交稻組合中,絕大多數(shù)品種都檢出了抗瘟基因Pii與Pita;檢出的另一個(gè)基因?yàn)镻i2、Piz-t、Pi1、Pik-p、Pik-h之一?;浟純?yōu)778、華兩優(yōu)78、珍豐優(yōu)9822與美優(yōu)9802等155個(gè)雜交稻組合檢出了2個(gè)抗瘟基因,占總檢測(cè)組合的比率為47.25%;其中,大多數(shù)組合檢出的抗瘟基因是Pii與Pita。另外,部分雜交稻組合只檢測(cè)出1個(gè)抗瘟基因,其比率為20.73%,還有5.18%的組合未檢測(cè)到該8個(gè)抗瘟基因中的任何一個(gè)(圖3)。
2.3 檢出的抗瘟基因數(shù)量、類(lèi)型與雜交稻組合的抗病相關(guān)性分析
為了探明雜交稻組合的抗瘟基因類(lèi)型或數(shù)量與品種抗病性間的相關(guān)性,本研究對(duì)328個(gè)雜交稻組合進(jìn)行了稻瘟病抗譜測(cè)定及田間病圃鑒定,結(jié)合兩組數(shù)據(jù)對(duì)這些組合進(jìn)行了抗瘟性綜合評(píng)價(jià)。在選取的328個(gè)雜交稻組合中,高感、感、中感、中抗、抗、高抗的組合所占比例分別為17.07%、16.46%、16.16%、16.77%、16.77%、16.77%,各抗性水平的雜交稻分布較均衡(圖4)。隨著雜交稻組合檢出的抗病基因數(shù)量的增多,為抗病品種的比率也隨之上升;其中,在含有4個(gè)抗病基因的雜交稻組合中,抗病品種比率達(dá)91.67%,在含有3個(gè)、2個(gè)與1個(gè)抗病基因的雜交稻組合中,抗病品種比率分別為76.32%、45.6%與35.29%。上述結(jié)果表明,一個(gè)品種(組合)中含有的抗病基因數(shù)量越多,其抗性品種的出現(xiàn)頻率可以得到相應(yīng)提升。
根據(jù)稻瘟病抗性綜合評(píng)價(jià)的結(jié)果,進(jìn)一步分析含Pi1、Pik-p、Pik-h、Pi2、Pi9、Piz-t、Pita、Pii等不同的抗性基因?qū)μ嵘酒贩N(組合)抗性頻率的貢獻(xiàn)。結(jié)果顯示,不同的抗性基因?qū)μ嵘酒贩N的抗病性貢獻(xiàn)表現(xiàn)出顯著差異;其中,攜帶了抗性基因Pi2的雜交稻組合,表現(xiàn)為抗病品種的頻率為93.33%;其次是Pi1、Pik-h和Pik-p,分別為88.24%、71.43%和60.0%;在攜帶Pita、Pii與Piz-t基因的雜交稻組合中,表現(xiàn)為抗病品種的頻率分別為55.03%、49.55%與27.27%。上述結(jié)果表明,Pi2與Pi1在華南秈稻區(qū)表現(xiàn)出良好的抗瘟性,對(duì)該稻區(qū)稻瘟病的抗瘟性貢獻(xiàn)最大,其他抗瘟基因的抗病性貢獻(xiàn)大小依次是Pik-h、Pik-p、Pita、Pii與Piz-t。
了解病原菌的無(wú)毒基因以及品種抗病基因的構(gòu)成是利用抗病品種控制稻瘟病的基礎(chǔ)。單基因系的建立便于人們利用單基因鑒別系統(tǒng)鑒定稻瘟病菌無(wú)毒基因型,隨著越來(lái)越多的抗稻瘟病基因被克隆,為利用特異性標(biāo)記分析品種抗病基因型奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。國(guó)內(nèi)學(xué)者利用抗稻瘟病單基因系對(duì)我國(guó)秈稻區(qū)稻瘟病菌的致病性進(jìn)行了測(cè)定,研究表明華南稻瘟病菌與主效抗瘟基因的互作表現(xiàn)出豐富的多樣性,但亦可把互作歸類(lèi)為幾個(gè)主成份類(lèi)型,即分別以Pi1、Pi2、Pita2、Pish、Piz、Pi9、Pik-h、Pik-p、Pii等9個(gè)基因與病原互作的9個(gè)互作類(lèi)型[9,25]。本研究以上述基因?yàn)橹饕獧z測(cè)對(duì)象,試圖探明上述基因在華南雜交稻的分布以及與抗病性間的相關(guān)性,為本地區(qū)抗病品種基因型的合理布局提供科學(xué)依據(jù)。
近年來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)水稻品種的抗瘟基因型相繼開(kāi)展了研究。時(shí)克等[26]利用基因自身的功能標(biāo)記檢測(cè)了58個(gè)水稻品種的Pita和Pib基因情況及其分布狀況;何重等[15]利用Pi-ta和Pi-b功能標(biāo)記,對(duì)40個(gè)粳稻品種和665個(gè)粳稻新品系進(jìn)行了基因型檢測(cè),明確了抗性基因Pi-ta和Pi-b在江蘇粳稻品種中具有一定的分布,其中Pi-b的分布頻率較高。馬軍韜等[27]對(duì)6個(gè)主要水稻品種含有的抗瘟基因型進(jìn)行了分析,共檢測(cè)到11個(gè)抗瘟基
因,Pi1基因出現(xiàn)頻率最高。本研究利用Pi1、Pik-p、Pik-h、Pi2、Pi9、Piz-t、Pita、Pii等8個(gè)基因功能性標(biāo)記,對(duì)來(lái)自華南稻區(qū)不同遺傳背景的328個(gè)雜交稻組合進(jìn)行了基因篩查,發(fā)現(xiàn)在這些品種中分布頻率最高的基因是Pita和Pii,這可能是華南稻區(qū)選用的育種材料中多含有Pita和Pii基因的緣故。檢出率較低的抗病基因是Pi1、Piz-t和Pik-h,在這些品種中均未檢測(cè)到Pi9基因,這一結(jié)果與Tian等[28]的研究認(rèn)為抗病基因Pi9尚未在中國(guó)秈稻品種中廣泛應(yīng)用相符;說(shuō)明Pi9基因在華南稻區(qū)的抗病品種選育及生產(chǎn)上具有重要的應(yīng)用潛力。本研究亦表明,一個(gè)雜交稻組合中檢出的抗病基因數(shù)量最多是4個(gè),檢出3個(gè)或4個(gè)雜交稻組合的的抗瘟性是否一定優(yōu)于聚合了2個(gè)或單個(gè)抗性基因的組合,還有待擴(kuò)大水稻的檢測(cè)群體開(kāi)展進(jìn)一步的研究。
本研究分析了檢測(cè)的8個(gè)抗病基因?qū)﹄s交稻組合的抗病性貢獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)Pi2與Pi1對(duì)華南稻作區(qū)稻瘟病的抗性貢獻(xiàn)最大,這2個(gè)抗病基因也是在華南稻區(qū)抗病育種工作中應(yīng)用較多的廣譜抗瘟基因。王豐等[29]將稻瘟病廣譜抗病基因Pi1和香味基因fgr聚合到恢復(fù)系R290中,顯著提高了該恢復(fù)系的抗瘟性及稻米的香味品質(zhì);柳武革等[30]將Pi1、Pi2基因?qū)氲奖3窒禈s豐B中,利用其配組的雜交稻組合表現(xiàn)出優(yōu)良的稻瘟病抗性和豐產(chǎn)性。近年來(lái),由于自然界中稻瘟病菌的快速變異,生產(chǎn)上已出現(xiàn)了含有廣譜抗病基因Pi2與Pi1的品種抗病性衰退或喪失的事件[4,5,31]。據(jù)報(bào)道,雜交稻天優(yōu)998嚴(yán)重感病是由于廣東省稻瘟病菌稀有小種ZB3上升為優(yōu)勢(shì)小種所致,該型小種可致使攜帶Pi1及其等位基因的水稻品種嚴(yán)重感病[4];五優(yōu)308在我國(guó)南方多個(gè)稻作區(qū)嚴(yán)重感病,侵染該組合的稻瘟病菌可侵染Pita(Pita2)、Pii、Pish等抗瘟基因[5]。目前,與天優(yōu)998及五優(yōu)308抗瘟基因類(lèi)型相近的雜交稻組合有湘豐優(yōu)827、雙優(yōu)228、金昌優(yōu)3550、深優(yōu)9521、美優(yōu)116、五豐優(yōu)587、五豐優(yōu)165等,這些組合在上述兩個(gè)組合感病的稻區(qū)應(yīng)避免種植;另外,與天優(yōu)998及五優(yōu)308不同類(lèi)型的雜交稻組合有五豐優(yōu)9802、五優(yōu)華占、五豐優(yōu)116、Y兩優(yōu)187、珍豐優(yōu)9822、美優(yōu)9802、天優(yōu)華占等,這些組合在天優(yōu)998和五優(yōu)308感病的稻區(qū)可考慮因地制宜地輪換種植。
雖然,本研究分析的抗性基因是目前華南稻區(qū)重要的抗瘟基因型,但是,隨著新的抗瘟基因不斷鑒定、引入及應(yīng)用,今后仍十分有必要拓展對(duì)不同類(lèi)型的抗瘟基因開(kāi)展深入分析與研究。
[1]Liu J L,Wang X J,Mitchell T,Hu YJ,Liu X L,Dai L Y, Wang G L.Recent progress and understanding of the molecular mechanisms of the rice-Magnaporthe oryzae interaction.Mol Plant Pathol,2010,11(3):419-427.
[2]Ou S H.Rice Disease.2nd edn.Kew:Commonwealth Mycological Institute,1985:109-201.
[3]Miah G,Rafii M Y,Ismail M R,Puteh A B,Rahim H A, Asfaliza R,Latif M A.Blast resistance in rice:A review of conventional breeding to molecular approaches.Mol Biol Rep,2013,40(3):2369-2388.
[4]朱小源,楊健源,陳玉托,楊維新,陳喜勞,曾列先,陳深.引致天優(yōu)998抗性喪失的稻瘟病菌小種鑒定及其致病性測(cè)定.廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2008(12):84-86. Zhu X Y,Yang J Y,Chen Y T,Yang W X,Chen X L, Zeng L X,Chen S.Race identification and pathogenicity test of the blast fungus causing the resistance breakdownof hybrid rice Tianyou 998.Guangdong Agric Sci, 2008(12):84-86.(in Chinese with English abstract)
[5]汪文娟,韋小燕,陳凱玲,陳尉芹,陳珍,楊健源,朱小源.源自雜交稻組合五優(yōu)308稻瘟病菌致病性分析.廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,14:70-73. Wang W J,Wei X Y,Chen K L,Chen W Q,Chen Z, YangJY,ZhuXY.Pathogenicityanalysison Magnaporthe grisea of hybrid combination Wuyou 308. Guangdong Agric Sci,2015,14:70-73.(in Chinese with English abstract)
[6]Fjellstrom R,Conaway-Bormans C A,McClung A M, Marchetti M A,Shank A R,Park W D.Development of DNA markers suitable for marker assisted selection of threePigenesconferringresistancetomultiple Pyricularia grisea pathotypes.Crop Sci,2004,44: 1790-1798.
[7]Liu W D,Liu J L,Triplett L,Leach J E,Wang G L. Novel insights into rice innate immunity against bacterial and fungal pathogens.Annu Rev Phytopathol,2014,52: 213-241.
[8]李進(jìn)斌,李成云,陳艷,雷財(cái)林,凌忠專(zhuān).二十二個(gè)抗稻瘟病基因在云南的利用價(jià)值評(píng)價(jià).植物保護(hù)學(xué)報(bào), 2005,32(2):113-119. Li J B,Li C Y,Chen Y,Lei C L,Ling Z Z.Evaluation of twenty-two blast resistance genes in Yunnan using monogenetic rice lines.Acta Phytophyl Sin,2005,32(2): 113-119.(in Chinese with English abstract)
[9]楊健源,陳深,曾列先,李亦龍,陳珍,朱小源.稻瘟病主效抗性基因?qū)V東省秈稻稻瘟病菌的抗性評(píng)價(jià).中國(guó)水稻科學(xué),2008,22(2):190-196. Yang J Y,Chen S,Zeng L X,Li Y L,Chen Z,Zhu X Y. Evaluation on resistance of major rice blast resistance genes to Magnaporthe grisea isolates collected from indica rice in Guangdong Province,China.Chin J Rice Sci,2008,22(2):190-196.(in Chinese with English abstract)
[10]柳武革,王豐,金素娟,朱小源,李金華,劉振榮,廖亦龍,朱滿(mǎn)山,黃慧君,符福鴻,劉宜柏.利用分子標(biāo)記輔助選擇聚合Pi-1和Pi-2基因改良兩系不育系稻瘟病抗性.作物學(xué)報(bào),2008,34(7):1128-1136. Liu W G,Wang F,Jin S J,Zhu X Y,Li J H,Liu Z R, Liao Y L,Zhu M S,Huang H J,Fu F H,Liu Y B. Improvement of rice blast resistance in TGMS Line by pyramidingofPi-1andPi-2throughmolecular marker-assisted selection.Acta Agron Sin,2008,34(7): 1128-1136.(in Chinese with English abstract)
[11]李進(jìn)波,夏明元,戚華雄.水稻抗稻瘟病基因Pi1和Pi2聚合系的獲得及其抗性評(píng)價(jià).安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2015, 43(5):12-14,31. Li J B,Xia M Y,Qi H X.Development and evaluation of disease resistance of pyramided lines with blast resistance genes Pi1 and Pi2 in rice.J Anhui Agric Sci,2015,43(5): 12-14,31.(in Chinese with English abstract)
[12]張國(guó)民,馬軍韜,肖佳雷,劉迎雪,辛愛(ài)華,任洋,張麗艷,劉東風(fēng).已知抗瘟基因在黑龍江省寒地稻區(qū)的評(píng)價(jià)與利用.植物病理學(xué)報(bào),2011,41(1):72-79. Zhang G M,Ma J T,Xiao J L,Liu Y X,Xin A H,Ren Y, Zhang L Y,Liu D F.Evaluation and utilization of value of twenty-four blast resistance genes in north cold region, Heilongjiang.Acta Phytopathol Sin,2011,41(1):72-79. (in Chinese with English abstract)
[13]Ma J,Lei C L,Xu X T,Hao K,Wang J,Cheng Z,Ma X, Ma J,Zhang X,Guo X,Wu F,Lin Q,Wang C,Zhai H, Wan J.Pi64,encoding a novel CC-NBS-LRR protein, confers resistance to leaf and neck blast in rice.Mol Plant Microbe Interact,2015,28(5):558-568.
[14]Su J,Wang W J,Han J L,Chen S,Wang C Y,Zeng L X, Feng A Q,Yang J Y,Zhou B,Zhu X Y.Functional divergence of duplicated genes results in a novel blast resistance gene Pi50 at the Pi2/9 locus.Theor Appl Genet, 2015,128(11):2213-2225.
[15]何重,陳濤,張亞?wèn)|,朱鎮(zhèn),趙慶勇,周麗慧,于新,王才林.江蘇部分粳稻品種和品系中稻瘟病抗性基因Pi-ta和Pi-b的基因型分析.江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2014,30(5): 921-927. He C,Chen T,Zhang Y D,Zhu Z,Zhao Q Y,Zhou L H, Yu X,Wang C L.Genotypic analysis of blast resistance genes Pi-ta and Pi-b for japonica rice varieties and lines in Jiangsu Province.Jiangsu Agric Sci,2014,30(5): 921-927.(in Chinese with English abstract)
[16]程芳艷,李春光,劉永巍,孫翊軒,孟昭河,徐正進(jìn).水稻抗瘟基因Pi-b與Pi-5的分子檢測(cè)及外引抗源的利用評(píng)價(jià).核農(nóng)學(xué)報(bào),2016,30(1):11-18. Cheng F Y,Li C G,Liu Y W,Sun Y X,Meng Z H,Xu Z J.Molecular detection of blast resistance genes Pi-b and Pi-5 in northeast rice varieties and utilization evaluation of introduced resistant donors.J Nuclear Agric Sci,2016, 30(1):11-18.(in Chinese with English abstract)
[17]朱小源,楊健源,劉景梅,司徒志謀,康金平,胡學(xué)應(yīng),朱敏記,羅森輝,楊祁云,林佩珍,曾列先,姜先芽,陳深.廣東水稻品種抗稻瘟病性分析與利用策略.廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2006(5):34-37. Zhu X Y,Yang J Y,Liu J M,Situ Z M,Kang J P,Hu X Y,Zhu M J,Luo S H,Yang Q Y,Lin P Z,Zeng L X, Jiang X Y,Chen S.Evaluation on resistance of rice varieties in Guangdong to rice blast and strategy for its utilization.Guangdong Agric Sci,2006(5):34-37.(in Chinese with English abstract)
[18]馮愛(ài)卿,楊健源,陳深,曾列先,楊祁云,蘇菁,汪文娟,朱小源.水稻資源對(duì)稻瘟病質(zhì)量抗性及數(shù)量抗性評(píng)價(jià).廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,42(12):27-32. Feng A Q,Yang J Y,Chen S,Zeng L X,Yang Q Y,Su J, Wang W J,Zhu X Y.Evaluation on qualitative and quantitative resistance of rice germplasm to Magnaporthe oryzae.2015.Guangdong Agric Sci,2015,42(12):27-32. (in Chinese)
[19]Zhai C,Lin F,Dong Z Q,He X,Yuan B,Zeng X,Wang L,Pan Q.The isolation and characterization of Pik,a rice blastresistancegenewhichemergedafterrice domestication.New Phytol,2011,189(1):321-334.
[20]Hua L X,Wu J Z,Chen C X,Wu W H,He X Y,Lin F, Wang L,Ashikawa I,Matsumoto T,Wang L,Pan Q H. The isolation of Pi1,an allele at the Pik locus which confers broad spectrum resistance to rice blast.Theor Appl Genet,2012,125:1047-1055.
[21]Yuan B,Zhai C,Wang W J,Zeng X S,Xu X K,Hu H Q, Lin F,Wang L,Pan Q H.The Pik-p resistance to Magnaporthe oryzae in rice is mediated by a pair of closely linked CC-NBS-LRR genes.Theor Appl Genet, 2011,122:1017-2108.
[22]Neff M M,Turk E,Kalishman M.Web-based primer design for single nucleotide polymorphism analysis. Trends Genet,2002,18(12):613-615.
[23]Takagi H,Uemura A,Yaegashi H,Tamiru M,Abe A, MitsuokaC,UtsushiH,NatsumeS,KanzakiH, Matsumura H,Saitoh H,Yoshida K,Cano L M,Kamoun SO,TerauchiR.MutMap-Gap:Whole-genome sequencing of mutant F2progeny bulk combined with de novo assembly of gap regions identifies the rice blast resistance gene Pii.New Phytol,2013,200(1):276-283.
[24]華麗霞,汪文娟,陳深,汪聰穎,曾烈先,楊健源,朱小源,蘇菁.抗稻瘟病Pi2/9/z-t基因特異性分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā).中國(guó)水稻科學(xué),2015,29(3):305-310. Hua L X,Wang W J,Shen C,Wang C Y,Zeng L X, Yang J Y,Zhu X Y,Su J.Development of specific DNA markers for detecting the rice blast resistance gene alleles Pi2/9/z-t.Chin J Rice Sci,2015,9(3):305-310.(in Chinese with English abstract)
[25]朱小源,楊祁云,楊健源,雷財(cái)林,王久林,凌忠專(zhuān).抗稻瘟病單基因系對(duì)秈稻稻瘟病菌小種鑒別力分析.植物病理學(xué)報(bào),2004,34(4):361-368. Zhu X Y,Yang Q Y,Yang J Y,Lei C L,Wang J L,Ling Z Z.Differentiation ability of monogenic lines to Magnaporthe grisea in indica rice.Acta Phytopathol Sin, 2004,34(4):361-368.(in Chinese with English abstract)
[26]時(shí)克,雷財(cái)林,程治軍,許興濤,王久林,萬(wàn)建民.稻瘟病抗性基因Pita和Pib在我國(guó)水稻主栽品種中的分布.植物遺傳資源學(xué)報(bào),2009,10(1):21-26. Shi K,Lei C L,Cheng Z J,Xu X T,Wang J L,Wan J M. Distribution of two blast resistance genes Pita and Pib in major rice cultivars in China.J Plant Genet Res,2009, 10(1):21-26.(in Chinese with English abstract)
[27]馬軍韜,張國(guó)民,辛愛(ài)華,張麗艷,鄧凌韋,任洋.水稻品種抗稻瘟病分析及基因聚合抗性改良.植物保護(hù)學(xué)報(bào),2016,43(2):177-183. Ma J T,Zhang G M,Xin A H,Zhang L Y,Deng L W, Ren Y.Resistance analysis and improvement of rice varieties by gene pyramiding.Acta Phytophyl Sin,2016, 43(2):177-183.(in Chinese with English abstract)
[28]Tian D G,Chen Z J,Chen Z Q,Zhou Y C,Wang Z H, WangF,ChenSB.Allele-specificmarker-based assessment revealed that the rice blast resistance genes Pi2 and Pi9 have not been widely deployed in Chinese indicaricecultivars.Rice,2016,9(1):19.doi: 10.1186/s12284-016-0091-8.
[29]王豐,柳武革,劉振榮,朱小源,李金華,廖亦龍,朱滿(mǎn)山,黃慧君,楊健源.利用分子標(biāo)記輔助選擇聚合Pi-1和fgr基因改良水稻恢復(fù)系.雜交水稻,2010(S1): 237-244. Wang F,Liu W G,Liu Z R,Zhu X Y,Li J H,Liao Y L, Zhu M S,Huang H J,Yang J Y.Pyramiding Pi1 and fgr genes to improve rice restorer lines by molecular marker-assistedselection.HybridRice,2010(S1): 237-244.(in Chinese with English abstract)
[30]柳武革,王豐,劉振榮,朱小源,李金華,黃慧君,廖亦龍,朱滿(mǎn)山,付崇允,陳建偉.利用分子標(biāo)記技術(shù)聚合Pi-1和Pi-2基因改良三系不育系榮豐A的稻瘟病抗性.分子植物育種,2012,10(5):575-582. Liu W G,Wang F,Liu Z R,Zhu X Y,Li J H,Huang H J, Liao Y L,Zhu M S,Fu C Y,Chen J W.Improvement of rice blast resistance in CMS line Rongfeng A by pyramidingPi-1andPi-2withmolecularmarker techniques.Mol Plant Breeding,2012,10(5):575-582. (in Chinese with English abstract)
[31]汪文娟,蘇菁,張杰,李亦龍,陳深,曾列先,楊健源,朱小源.源于粵晶絲苗2號(hào)穗瘟的稻瘟病菌致病性分析.廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2012,23:59-61. Wang W J,Su J,Zhang J,Li Y L,Chen S,Zeng L X, Yang J Y,Zhu X Y.Pathogenicity analysis of the rice blastfungusisolatedfromtheblastpaniclesof Yuejingsimiao 2.Guangdong Agric Sci,2012,23:59-61. (in Chinese)
Distribution of Eight Rice Blast Resistance Genes in indica Hybrid Rice in China
WANG Wenjuan1,ZHOU Jiyong2,WANG Congying1,SU Jing1,FENG Jinqi1,CHEN Bing1,FENG Aiqing1, YANG Jianyuan1,CHEN Shen1,ZHU Xiaoyuan1,*
(1Plant Protection Research Institute,Guangdong Academy of Agricultural Sciences/Guangdong Provincial Key Laboratory of High Technology for Plant Protection,Guangzhou 510640,China;2Guangdong Agricultural Technology Extension Station,Guangzhou 510520,China;*Corresponding author,E-mail: zhuxy@gdppri.com)
【Objective】The cloned rice blast resistant genes,Pi1,Pik-p,Pik-h,Pi2,Pi9,Piz-t,Pita and Pii,which showed broad-spectrum blast resistance in different rice growing regions,have been widely used in rice breeding for blast resistance.To clarify the distribution of these genes in hybrid rice in South China,【Method】the genotypes of resistance genes Pi1,Pik-p,Pik-h,Pi2,Pi9,Piz-t,Pita and Pii in 328 hybrid rice combinations were detected with functional markers.【Result】The distribution frequency of Pita and Pii was the highest,reaching 84.76%and 67.68%in the tested rice combinations,respectively;followed by Pi2 and Pik-p with the proportion of 22.87%and 13.72%, respectively;Pi1,Piz-t and Pik-h had the lowest distribution frequency,accounting for 5.18%,3.35%and 2.13%of total; all of these varieties didn’t carry resistance gene Pi9.The number of blast resistance genes detected in hybrid rice combinations were at most four.The resistance evaluation showed that the frequency of resistant varieties rose with increasing number of resistance genes in hybrid combinations.In a hybrid combinations with four resistance genes,the distribution frequency of resistant varieties was 91.67%.Blast resistance contribution assay of the eight resistance genes revealed that Pi2 and Pi1 displayed the greatest resistance contribution in the local rice in South China,followed by Pik-h,Pik-p,Pita,Pii and Piz-t.【Conclusion】This study provided a scientific basis for the rational distribution of resistant varieties with different genotypes in South China.
hybrid rice combinations;resistance gene;rice blast;genotype analysis;molecular marker
S435.111.4+1;S511.034
:A
:1001-7216(2017)03-0299-08
2016-07-26;修改稿收到日期:2016-11-05。
國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0300700);廣東省科技計(jì)劃資助項(xiàng)目(2015B020231003;2016B090918116;2016A050502030);國(guó)家水稻產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系資助項(xiàng)目(CARS-01-24)。