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        多重RT—PCR檢測蝴蝶蘭3種病毒CymMV、ORSV和CMV

        2017-04-15 10:35:10涂小云董小艷郭春梅何俊平
        江蘇農業(yè)科學 2017年5期
        關鍵詞:蝴蝶蘭檢測方法

        涂小云++董小艷 +郭春梅 何俊平 +鮑恩亞

        摘要:根據建蘭花葉病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)、齒蘭輪斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)和黃瓜花葉病毒(cucumber mosaic virus,CMV)3種病毒外殼蛋白基因序列保守序列設計特異性引物,以病毒侵染的蝴蝶蘭總RNA反轉錄的cDNA為模板進行擴增,建立了三重RT-PCR同時檢測該3種病毒的方法。CymMV、ORSV和CMV 3種病毒特異擴增的片段分別為561、433、306 bp。用該方法對17個疑似病毒感染的蝴蝶蘭樣品進行檢測,結果13個材料檢測出CymMV特異帶,2個材料檢測出ORSV病毒特異帶,1個材料檢測出CMV病毒特異帶,1個材料同時檢測出CymMV和ORSV病毒2條特異帶,所檢測的17個蝴蝶蘭材料未發(fā)現(xiàn)3種病毒復合侵染的情況。

        關鍵詞:蝴蝶蘭;多重RT-PCR;建蘭花葉病毒;齒蘭輪斑病毒;黃瓜花葉病毒;檢測方法

        中圖分類號: S436.8+1文獻標志碼: A

        文章編號:1002-1302(2017)05-0091-02

        蘭花是一種高價值的觀賞花卉,但一旦感染病毒,其觀賞價值和經濟價值將受到嚴重影響。近年來,隨著蘭花國內外貿易和種質交流頻率的增加,蘭花病毒病的發(fā)生有蔓延趨勢。目前,至少有28種病毒可感染蘭科植物,其中我國蘭科植物感染的病毒以建蘭花葉病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)、齒蘭輪斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)為主,且這2種病毒復合感染占多數,也有少數蝴蝶蘭感染黃瓜花葉病毒(cucumber mosaic virus,CMV)[1]。CymMV和ORSV主要借助機械性傷口進行傳播,CMV 可借汁液傳染,也可通過蚜蟲傳播。這3種病毒病感染蘭花后可迅速擴散,且無有效防治藥劑;因此,有必要建立多種病毒的高效檢測方法,盡早檢出感病植株并實施銷毀,避免蘭園大面積受損。

        目前檢測植物體內病毒的主要方法有電鏡法、血清學鑒定和PCR技術等。其中PCR技術,尤其是多重PCR,具有快速、便捷、靈敏度高和特異性強等顯著優(yōu)點,現(xiàn)已廣泛用于病原微生物的檢測。多重PCR是在同一反應體系中,利用一對或多對引物同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,比普通單重PCR更為高效、經濟和簡便。鄭軒等在一個PCR體系中成功對5種病毒復合侵染的煙草材料進行多重擴增,建立了能同時檢測煙草花葉病毒、黃瓜花葉病毒、煙草蝕紋病毒、馬鈴薯Y病毒和煙草脈帶花葉病毒的多重PCR檢測體系[2]。張威等[3]和羅文彬等[4]分別建立了可同時檢測馬鈴薯3種病毒和5種病毒的多重PCR方法。

        多重PCR在蘭花病毒檢測的利用主要集中于CymMV和ORSV的雙重檢測[5-9],如鄭國華等利用2對特異引物在同一個PCR反應體系進行擴增的方法,建立了二溫式多重 RT-PCR同時檢測CymMV和ORSV 2種病毒的方法[8];章鵬程等利用1對簡并引物,通過一步式IC-RT-PCR可以同時檢測CymMV和ORSV復合感染情況[10]。鳳仙花壞死斑病毒(impatiens necrotic spot virus,INSV)和CymMV 2種病毒也可以通過雙重RT-PCR同時檢測[11]。樊榮輝等通過優(yōu)化三重PCR反應條件,一次擴增能同時檢測文心蘭CymMV、ORSV和菜豆黃花葉病毒(bean yellow mosaic virus,BYMV)的特異片段[12]。CymMV、ORSV和蘭花斑點病毒(orchid fleck virus,OFV)的三重PCR檢測體系最近也已有報道[13]。但CymMV、ORSV和CMV的三重PCR檢測體系目前還未見報道。本研究根據CymMV、ORSV和CMV外殼蛋白基因序列保守區(qū)域設計特異性引物,建立了三重RT-PCR檢測該3種病毒的方法,可準確快速、簡便、經濟地檢測出蝴蝶蘭帶毒情況,為盡早發(fā)現(xiàn)、消除病害,減少經濟損失提供了技術支持。

        1材料與方法

        1.1材料

        CymMV、ORSV和CMV 3種病毒2013年采自江蘇省連云港振興實業(yè)集團有限公司的蘭花基地。其他供試蝴蝶蘭材料來源于連云港當地花卉市場。

        1.2引物設計

        1.3cDNA獲取

        取蝴蝶蘭新鮮葉片,液氮研磨成粉狀,用Trizol RNA試劑盒提取葉片總RNA,然后用Prime Script 1st Strand cDNA Synthesis Kit(TaKaRa)將RNA反轉錄為cDNA第一鏈,隨即保存于-20 ℃?zhèn)溆?。所有操作均按試劑盒說明書進行。

        1.4單重RT-PCR確定產物的特異性

        采用Vazyme Taq DNA聚合酶進行PCR擴增,20 μL反應體系的組成如下:2× Vazyme mix buffer 10.0 μL,10 μmol/L上游引物和下游引物各 1.0 μL,cDNA模板1.0 μL,無菌水 7 μL。PCR反應程序如下:95 ℃預變性3 min;93 ℃變性 30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。取5 μL PCR產物經1%瓊脂糖凝膠電泳分析。

        1.5多重RT-PCR檢測的建立

        在單重PCR基礎上,將上述3種cDNA模板等量混合,保持其他條件不變,分別對模板濃度、退火溫度、引物濃度和循環(huán)參數進行優(yōu)化,最后確定多重PCR最優(yōu)反應體系。采用Vazyme Taq DNA聚合酶進行PCR擴增,20 μL反應體系的組成如下:2× Vazyme mix Buffer 10.0 μL,10 μmol/L CymMV上游引物和下游引物各 0.8 μL,10 μmol/L ORSV上游引物和下游引物各 0.8 μL,10 μmol/L CMV上游引物和下游引物各 0.5 μL,稀釋10倍的cDNA模板1.0 μL,無菌水4.8 μL。PCR反應程序如下:95 ℃預變性3 min;93 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。取5 μL PCR產物經1%瓊脂糖凝膠電泳分析。

        2結果與分析

        2.1單重RT-PCR檢測體系

        分別單獨采用1對引物對獲得的蝴蝶蘭cDNA樣品進行PCR擴增,3對引物均能在相對于的樣品中獲得預期大小的擴增產物(擴增產物分別為561、433、306 bp),電泳呈單一明亮條帶(圖1),陰性水對照沒有陽性條帶,表明檢側結果是特異性的,適合用于病毒檢側。

        2.2三重RT-PCR檢測體系

        擴增CymMV、ORSV和CMV的3對引物按等量濃度混合,對蝴蝶蘭cDNA混合樣品進行擴增,效果不理想。經過系列優(yōu)化后,擴增CymMV、ORSV和CMV的3對引物的濃度比例為CymMV ∶[KG-*3]ORSV ∶[KG-*3]CMV= 1.6 ∶[KG-*3]1.6 ∶[KG-*3]1,蝴蝶蘭cDNA混合樣品稀釋10倍,可以在同一個PCR反應體系中成功擴增出3個利用優(yōu)化后RT-PCR體系,檢測疑似病毒侵染的17個蝴蝶蘭材料,結果如圖3所示:13個(1~3、5~7、10~13、15~17)材料檢測出CymMV特異帶,2個(4、9號)材料檢測出ORSV病毒特異帶,1個(8號)材料檢測出CMV病毒特異帶,1個(14號)材料檢測出CymMV和ORSV病毒2條特異帶,陰性水對照(18號)無CymMV、ORSV或CMV特異帶。所檢測的17個蝴蝶蘭材料未發(fā)現(xiàn)3種病毒復合侵染的情況。

        3討論

        普通單重RT-PCR可以對單一病毒進行有效檢測,但CymMV、ORSV等病毒廣泛分布于世界各地商業(yè)生產的蘭花中,感染30多種蘭屬花卉,且這些病毒還易于形成復合侵染,嚴重降低蘭花的商業(yè)價值[14]。同時檢測2種或多種主要蘭花病毒的雙重或多重PCR技術已有多個成功的報道,它們可以降低檢測成本,縮短病毒檢測時間,提高檢測效率,包括針對CymMV和ORSV的雙重PCR檢測[5-10],針對INSV和CymMV雙重PCR檢測[11],針對CymMV、ORSV和BYMV的三重檢測[12],針對CymMV、ORSV和OFV的三重PCR檢測體系[13]等。對于病毒的檢測,并非所有的病毒都可以用同一種方法檢測,也沒有一種方法可以檢測出所有的病毒,應根據所研究的病毒特性及具體的試驗條件、科研水平和操作人員的技[CM(25]術水平選用合適的方法。本研究針對蝴蝶蘭CymMV、

        ORSV和CMV 3種病毒,成功建立了RT-PCR三重檢測技術,該項技術的關健是要選用合適的引物,在保證引物特異性的前提下,避免引物之間的互作干擾。本研究中所涉及3種病毒外殼蛋白基因序列同源性較高,因而用PCR方法對其進行檢測可獲得較穩(wěn)定可靠的結果。

        參考文獻:

        [1]蘇俊明,張友強. 蝴蝶蘭病毒病發(fā)生與防治(二)[N]. 中國花卉報,2008-05-24(003).

        [2]鄭軒,成巨龍,趙震,等. 五種煙草病毒TMV、CMV、TEV、PVY及TVBMV的多重RT-PCR同步檢測[J]. 植物病理學報,2011,41(2):146-153.

        [3]張威,白艷菊,范國權,等. 應用三重RT-PCR技術檢測三種馬鈴薯病毒[J]. 中國馬鈴薯,2015(3):162-166.

        [4]羅文彬,李華偉,湯浩,等. 馬鈴薯5種病毒多重PCR檢測技術的建立及應用[J]. 園藝學報,2015,42(2):280-288.

        [5]曾燕君,莫饒,劉志昕,等. 蘭花兩種主要病毒雙重RT-PCR檢測方法的建立[J]. 江西農業(yè)學報,2009,21(7):12-14.

        [6]張妙彬,潘麗晶,肖楊,等. 雙重RT-PCR同時檢測蘭花兩種主要病毒的研究[J]. 廣東農業(yè)科學,2010,37(5):166-167,180.[HJ1.75mm]

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        [8]鄭國華,明艷林,林德欽,等. 二溫式多重RT-PCR同時檢測兩種主要蘭花病毒的研究[J]. 植物保護,2007,33(2):113-115.

        [9]周國輝,陳曉琴,李梅輝,等. 雙重一步法RT-PCR同時檢測蘭花上的兩種主要病毒[J]. 農業(yè)生物技術學報,2004,12(6):743-744.[ZK)]

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        [12]樊榮輝,黃敏玲,鐘淮欽,等. 文心蘭3種主要病毒多重RT-PCR檢測體系的建立[J]. 福建農業(yè)學報,2015(7):697-700.

        [13]Ali R,Dann A,Cross P,et al. Multiplex RT-PCR detection of three common viruses infecting orchids[J]. Archives of Virology,2014,159(11):3095-3099.

        [14]萬晴姣,李欲軻,馬駿,等. 貴州齒蘭環(huán)斑病毒的分子鑒定[J]. 貴州農業(yè)科學,2014(8):96-98.

        [FQ)]

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