決登偉,桑雪蓮,舒 波,劉麗琴,王一承,石勝友
(中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶果樹(shù)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 湛江 524091)
玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子非生物脅迫的表達(dá)分析
決登偉,桑雪蓮,舒 波,劉麗琴,王一承,石勝友
(中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶果樹(shù)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 湛江 524091)
WRKY蛋白是一類植物特異的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物響應(yīng)病害及非生物脅迫中起重要作用。通過(guò)生物信息學(xué)方法,從玉米基因組中得到3個(gè)WRKY家族基因序列(ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like、ZmWRKY62-like),預(yù)測(cè)表明3個(gè)蛋白都定位于細(xì)胞核。熒光定量PCR分析表明,3個(gè)基因在玉米的不同器官中都有表達(dá),但具有組織表達(dá)特異性。ZmWRKY14-like和ZmWRKY62-like在幼果中的表達(dá)量均顯著高于在其他組織中的表達(dá)量,ZmWRKY25-like基因在葉、穗絲和幼果中的表達(dá)量高于在其他組織中的表達(dá)量。鹽脅迫下,ZmWRKY25-like基因呈上調(diào)表達(dá),ZmWRKY62-like基因呈下調(diào)表達(dá);干旱脅迫下,ZmWRKY62-like基因出現(xiàn)下調(diào)表達(dá);低溫脅迫下,ZmWRKY25-like基因呈上調(diào)表達(dá)。結(jié)果表明,ZmWRKY25-like可能參與了植物對(duì)鹽和低溫脅迫的響應(yīng),ZmWRKY62-like基因則可能參與了植物對(duì)鹽和干旱脅迫的響應(yīng)。
玉米;WRKY轉(zhuǎn)錄因子;干旱;鹽脅迫;低溫
WRKY是植物體中最大的轉(zhuǎn)錄因子之一,廣泛分布于植物中,與其他轉(zhuǎn)錄因子一樣,WRKY蛋白通過(guò)特異性結(jié)合啟動(dòng)子區(qū)域的W-Box來(lái)調(diào)控基因表達(dá)[1]。1994年,第1個(gè)WRKY轉(zhuǎn)錄因子(SPF1)從甘薯中被鑒定出來(lái)[2],隨后陸續(xù)在眾多植物中發(fā)現(xiàn),且其數(shù)目從低等植物到高等植物呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。例如,油菜 (Brassica napus L.)中有46個(gè)WRKY轉(zhuǎn)錄因子成員[3],黃瓜(Cucumis sativus)中有57個(gè)[4],麻風(fēng)樹(shù)(Jatropha curcas)中有58個(gè)[5],蓖麻(Ricinus communis L.)中有58個(gè)[6],擬南芥(Arabidopsis thaliana)中有72個(gè)[7],白梨(Pyrus bretschneideri)中有103個(gè)[8],白楊(Populus trichocarpa)有105個(gè)[9],谷子(Setaria italica)有105個(gè)[10],水稻(Oryza sativa)中有109個(gè)[11],棉花(Gossypium)中有109~112個(gè)[12],玉米(Zea may L.)中有136個(gè)[13],大豆(Glycine max)中有197個(gè)[14]。
WRKY蛋白都包含1個(gè)或者兩個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域,包括N-端高度保守的WRKYGQK七肽及C-端的鋅指結(jié)構(gòu)(Cx4-7Cx22-23HxH/ C)。根據(jù)WRKY結(jié)構(gòu)域的數(shù)目及鋅指結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)可將WRKY蛋白劃分為3個(gè)主要類型。第Ⅰ類有兩個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)類型為C2H2,第Ⅱ、Ⅲ類只含有1個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域。其中,第Ⅲ類成員的鋅指結(jié)構(gòu)類型為C2HC,而第Ⅱ類為C2H2。根據(jù)進(jìn)化關(guān)系及WRKY結(jié)構(gòu)域中某些氨基酸基序不同,第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子又可細(xì)分為5個(gè)小類(a~e)[15]。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與植物多種生理生化過(guò)程,如應(yīng)對(duì)生物和非生物脅迫,參與葉片衰老、發(fā)育和次生代謝等[16]。植物在受到外界傷害后,通過(guò)SA和JA等防衛(wèi)反應(yīng)信號(hào)途徑激活植物防衛(wèi)基因的表達(dá),從而對(duì)逆境脅迫產(chǎn)生抗性反應(yīng)。大量證據(jù)表明,SA和JA分別介導(dǎo)活體營(yíng)養(yǎng)型病原菌和死體型病原菌兩條不同的防衛(wèi)應(yīng)答信號(hào)途徑,多數(shù)情況下這兩種信號(hào)途徑是相互拮抗的,有時(shí)也存在協(xié)同作用,有些WRKY蛋白處于兩種信號(hào)途徑的調(diào)節(jié)交叉點(diǎn)上,如AtWRKY70既可以激活SA介導(dǎo)的抗病信號(hào)途徑,同時(shí)也能抑制JA介導(dǎo)的信號(hào)途徑,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)擬南芥抗病反應(yīng)的調(diào)控[17]。同樣,WRKY家族基因在響應(yīng)植物非生物脅迫中也發(fā)揮重要作用。在擬南芥中,AtWRKY25和AtWRKY33呈現(xiàn)鹽促進(jìn)表達(dá),且異源表達(dá)這兩個(gè)基因增強(qiáng)了植物對(duì)NaCl的耐性[18-19]。在水稻中,過(guò)表達(dá)OsWRKY45促進(jìn)擬南芥對(duì)干旱的耐性,OsWRKY8異源表達(dá)促進(jìn)擬南芥對(duì)滲透的耐性,OsWRKY72的異源表達(dá)則會(huì)影響根的生長(zhǎng)和逆境耐性[20]。另外,OsWRKY89的過(guò)表達(dá)促進(jìn)植株對(duì)紫外線的抵御[21],過(guò)表達(dá)OsWRKY11增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株對(duì)高溫的耐性[19]。在白梨的103 WRKY基因中,44個(gè)PbWRKY在干旱處理下呈上調(diào)表達(dá)[8]。高粱(Panicum miliaceum L.)中,10個(gè)PmWRKY基因的表達(dá)受到干旱脅迫誘導(dǎo),16個(gè)PmWRKY基因的表達(dá)受到低溫脅迫誘導(dǎo)[22]。
玉米是當(dāng)今世界重要的糧食作物之一,亦是重要的飼料和工業(yè)原料作物,在世界糧食總產(chǎn)量中居首位[23]。中國(guó)作為世界第二大玉米生產(chǎn)國(guó),近30多年來(lái)玉米生產(chǎn)發(fā)展非常迅速,總產(chǎn)量也呈逐年上升趨勢(shì)。世界糧農(nóng)組織統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)庫(kù)(FAOSTAT)顯示,2012 年玉米產(chǎn)量超過(guò)稻谷產(chǎn)量,成為中國(guó)第一大糧食作物[24]。2013年,中國(guó)玉米常年種植面積達(dá)3 510 萬(wàn)hm2,總產(chǎn)量約2.17 億t,占糧食總產(chǎn)量的1/3。但在實(shí)際生產(chǎn)中,玉米常常會(huì)因受到諸多不利環(huán)境因素的影響而大面積減產(chǎn),如干旱、鹽脅迫和低溫等。目前,已有研究表明玉米基因組中有136個(gè)WRKY家族基因,但還鮮有玉米WRKY基因在植物響應(yīng)非生物脅迫中作用的相關(guān)報(bào)道。本研究中,我們利用生物信息學(xué)技術(shù)從玉米的基因組發(fā)現(xiàn)3個(gè)WRKY家族基因,ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like、ZmWRKY62-like都含有WRKY轉(zhuǎn)錄因子典型的WRKY結(jié)構(gòu)域及鋅指結(jié)構(gòu)。利用熒光定量PCR方法,進(jìn)一步對(duì)3個(gè)基因在玉米不同組織、干旱、鹽脅迫及低溫脅迫的表達(dá)進(jìn)行分析,以期了解該基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育和不同逆境下的作用,為挖掘玉米抗逆基因和豐富E2蛋白在不同作物中的功能研究提供一定的理論和試驗(yàn)依據(jù)。
1.1 試驗(yàn)材料
試驗(yàn)材料為玉米自交系B73,玉米組織根、莖、葉、穗、幼果和穗絲取自大田種植的玉米植株,采樣時(shí)期為乳熟期。供試植物RNA提取試劑盒購(gòu)自北京華越洋生物公司,反轉(zhuǎn)錄試劑及Realtime PCR試劑盒購(gòu)自寶生物工程有限公司,引物由北京賽百盛基因技術(shù)有限公司合成,其他試劑購(gòu)自上海生物工程有限公司。Realtime PCR反應(yīng)儀器為Roche的LightCycler480。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 材料處理 逆境處理所用材料為B73種子萌發(fā)的幼苗,種子萌發(fā)后,轉(zhuǎn)入1/2 Hoagland培養(yǎng)液,在培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng),生長(zhǎng)條件為28(±2)℃、14 h光照、10 h黑暗。3周后,選擇長(zhǎng)勢(shì)均一的幼苗進(jìn)行后續(xù)模擬脅迫處理試驗(yàn)。每個(gè)處理具體如下:(1)鹽脅迫處理,將幼苗放入含200 mmol/L NaCl的1/2 Hoagland培養(yǎng)液中培養(yǎng),按0、1、6、24 h時(shí)間點(diǎn)取樣;(2)干旱脅迫處理,將幼苗放入含20% PEG6000的1/2 Hoagland培養(yǎng)液中培養(yǎng),按0、1、6、24 h時(shí)間點(diǎn)取樣;(3)低溫脅迫處理,將幼苗放入溫度設(shè)置為4℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),按0、1、6、24 h時(shí)間點(diǎn)取樣。試驗(yàn)設(shè)3次重復(fù),取樣部位為葉片。所有取樣剪成2 cm左右的小段,立即放入液氮速凍并轉(zhuǎn)入-80℃冰箱中保存、備用。
1.2.2 ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like序列分析 ZmWRKY14-like、
ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like 3個(gè)基因序列從PLAZA 3.0 (http://bioinformatics.psb. ugent.be/plaza/versions/plaza/)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得,并在玉米基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(MaizeGDB,http://www. maizegdb.org/)中進(jìn)行驗(yàn)證。3個(gè)基因的ORF、氨基酸長(zhǎng)度和染色體定位信息從PLAZA 3.0數(shù)據(jù)庫(kù)獲得。應(yīng)用在線軟件SMART (http://smart.emblheidelberg.de/)預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)域,蛋白的等電點(diǎn)和分子量在ExPASy (http://expasy. org/tools/)上進(jìn)行分析,蛋白的亞細(xì)胞定位通過(guò)Plant-mPLoc (http://www.csbio.sjtu.edu.cn/cgibin/ PlantmPLoc.cgi)在線預(yù)測(cè),3個(gè)基因的外顯子內(nèi)含子結(jié)構(gòu)利用Gene Structure Display Server(GSDS)(http://gsds.cbi.pku.edu. cn/)在線軟件分析。用Clustal X進(jìn)行序列多重序列對(duì)比,同時(shí)利用MEGA 5軟件進(jìn)行氨基酸序列同源性分析及系統(tǒng)發(fā)育分析,構(gòu)建Neighbor-Joining進(jìn)化樹(shù),1 000次重復(fù),其他均為默認(rèn)設(shè)置。
1.2.3 植物總RNA提取及Realtime PCR分析 用植物RNA提取試劑盒提取不同材料的葉片RNA,然后用TAKARA公司的PrimeScript RT試劑盒反轉(zhuǎn)錄cDNA后作為模板,具體操作步驟參照說(shuō)明書(shū)。根據(jù)已知玉米基因組中ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like 3個(gè)基因的CDS序列設(shè)計(jì)Realtime PCR引物,并以玉米的actin基因?yàn)閮?nèi)參基因,具體引物序列見(jiàn)表1。
PCR反應(yīng)體系為20 mL,其中模板2 μL,上、下游引物各1 μL,SYBR Green Master Mix 10 μL,H2O 6 μL。反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃ 10 s、58℃ 20 s、72℃ 30 s,40 個(gè)循環(huán)后作熔解曲線(95℃→ 65℃,0.1℃/s)。在分析基因的表達(dá)時(shí),上調(diào)或者下調(diào)大于2倍時(shí)認(rèn)為存在差異,所有試驗(yàn)3次重復(fù)。
表1 ZmWRKY基因定量PCR所用引物序列
2.1 ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like 3個(gè)基因生物信息學(xué)分析
以WRKY轉(zhuǎn)錄因子保守區(qū)氨基酸序列在PLAZA 3.0和MaizeGDB進(jìn)行BLASTP搜索,獲得3個(gè)在進(jìn)化關(guān)系上很接近的玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族基因,根據(jù)PLAZA 3.0數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)這3個(gè)基因的描述,分別將其命名為ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like。3個(gè)基因的信息見(jiàn)表2和圖1(封二)。其中,ZmWRKY14-like基因序列開(kāi)放閱讀框?yàn)? 143 bp,編碼的蛋白具有380個(gè)氨基酸,其分子量為40.89 ku,理論等電點(diǎn)為6.67,位于玉米第Ⅰ染色體;ZmWRKY25-like基因序列開(kāi)放閱讀框?yàn)?21 bp,編碼的蛋白具有306個(gè)氨基酸,其分子量為31.91 ku,理論等電點(diǎn)為9.74,位于玉米第Ⅳ染色體;ZmWRKY62-like基因序列開(kāi)放閱讀框?yàn)?01 bp,編碼的蛋白具有266個(gè)氨基酸,其分子量為28.96 ku,理論等電點(diǎn)為6.54,位于玉米第Ⅶ染色體。預(yù)測(cè)表明3個(gè)基因都定位于細(xì)胞核。對(duì)3個(gè)基因的氨基酸序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like都含有1個(gè)WRKY結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)同為C-X5-C-X23-H-X1-H型,根據(jù)WRKY轉(zhuǎn)錄因子分類原則,屬于第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子。
表2 ZmWRKY基因信息
進(jìn)一步分析ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like與其他植物WRKY蛋白間的親緣關(guān)系,發(fā)現(xiàn)ZmWRKY14-like與玉米的ZmWRKY14 (NP_001149833.1)、二穗短柄草的BdWRKY14 (XP_014752000.1)、短花藥野生稻的ObWRKY14 (XP_006650925.1),ZmWRKY25-like與玉米的ZmWRKY25 (NP_001151889.1)、小米的SiWRKY14 (XP_004972520.1)、短花藥野生稻的ObWRKY17 (XP_015691793.1),ZmWRKY62-like與小米的SiWRKY18-like(XP_004956832.1)分別聚到同一分支,即與禾本科植物的WRKY蛋白親緣較近,具有較高同源性(圖 2)。
2.2 玉米不同組織 ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like的表達(dá)分析
圖2 玉米WRKY轉(zhuǎn)錄因子與其他物種WRKY蛋白的進(jìn)化關(guān)系分析
用Realtime PCR技術(shù)分析ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like 3個(gè)基因在玉米幼苗根、莖、葉、穗、幼果和穗絲中的表達(dá)情況。結(jié)果(圖3)顯示,3個(gè)基因在玉米不同組織中都檢測(cè)到表達(dá),但存在差異表達(dá)情況。其中,ZmWRKY14-like和ZmWRKY62-like在幼果中的表達(dá)量均顯著高于在其他組織中的表達(dá)量,特別是ZmWRKY14-like在幼果中的表達(dá)量達(dá)到了穗絲中表達(dá)量的80倍。ZmWRKY25-like基因在葉、穗絲和幼果中的表達(dá)量高于在其他組織中的表達(dá)量,分別是在莖中表達(dá)量的36、48、25倍。
圖3 玉米WRKY基因的組織表達(dá)分析
2.3 不同非生物逆境脅迫下ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like的表達(dá)分析
用Realtime PCR技術(shù)分析ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like 3個(gè)基因在鹽、干旱和低溫處理下表達(dá)情況。如圖4~圖6所示,鹽脅迫下,ZmWRKY14-like基因在6 h時(shí)出現(xiàn)下調(diào)表達(dá),為對(duì)照的0.48倍,在24 h時(shí)恢復(fù)到對(duì)照水平;ZmWRKY25-like基因的表達(dá)在1 h時(shí)為對(duì)照的2.4倍,6 h時(shí)恢復(fù)到本底水平,24 h時(shí)上調(diào)為對(duì)照的3.3倍; ZmWRKY62-like基因在處理時(shí)間內(nèi)呈現(xiàn)下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),6 h和24 h時(shí)的表達(dá)量分別為對(duì)照的0.42、0.48倍。干旱脅迫下,ZmWRKY14-like基因的表達(dá)量在處理時(shí)間內(nèi)未出現(xiàn)顯著變化;ZmWRKY25-like基因的表達(dá)量在處理1 h時(shí)上升為對(duì)照的2.6倍,但在6 h時(shí)下調(diào)為對(duì)照的0.1倍,24 h時(shí)恢復(fù)對(duì)照水平;ZmWRKY62-like基因在6、24 h時(shí)出現(xiàn)下調(diào)表達(dá),分別為對(duì)照的0.44、0.38倍。低溫脅迫下,ZmWRKY25-like基因的表達(dá)量在24 h時(shí)上升為對(duì)照的3.2倍。上述結(jié)果表明,ZmWRKY25-like可能參與了植物對(duì)鹽和低溫脅迫的響應(yīng),ZmWRKY62-like基因則可能參與了植物對(duì)鹽和干旱脅迫的響應(yīng)。
圖4 玉米ZmWRKY14-like基因的逆境表達(dá)分析
圖5 玉米ZmWRKY25-like基因的逆境表達(dá)分析
圖6 玉米ZmWRKY62-like基因的逆境表達(dá)分析
WRKY是植物中一類重要的轉(zhuǎn)錄因子家族,也是植物轉(zhuǎn)錄因子中最大的家族之一[25],在甘薯、水稻、擬南芥、棉花、大麥等植物中都有研究報(bào)道。在玉米基因組中有119個(gè)WRKY基因,編碼136 WRKY蛋白[13]。但目前鮮有關(guān)于單個(gè)玉米WRKY的功能研究報(bào)道,對(duì)其在玉米生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫響應(yīng)中的具體作用還所知甚少。在本研究中,我們通過(guò)生物信息學(xué)方法從MaizeGDB數(shù)據(jù)庫(kù)中得到3個(gè)玉米WRKY家族基因:ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like。這3個(gè)基因都具有相似的WRKY保守結(jié)構(gòu)域和鋅指結(jié)構(gòu),都屬于第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與植物生長(zhǎng)發(fā)育及形態(tài)構(gòu)成,不同的WRKY基因的表達(dá)可能具有組織特異性。37個(gè)擬南芥WRKY基因中有12個(gè)在根的成熟區(qū)細(xì)胞特異表達(dá),表明這些WRKY基因可能參與調(diào)控?cái)M南芥根細(xì)胞的成熟[7];在擬南芥中過(guò)表達(dá)OsWRKY72會(huì)減少側(cè)根數(shù),而且比野生型顯著增加分支數(shù)[26];過(guò)表達(dá)OsWRKY31抑制了水稻不定根的形成[27];過(guò)表達(dá)OsWRKY89基因則導(dǎo)致早期階段性生長(zhǎng)延遲,節(jié)間長(zhǎng)度和細(xì)胞壁酚類化合物減少,莖部木質(zhì)化著色增加[21];AtWRKY6參與葉片衰老過(guò)程[28];蓖麻的58個(gè)WRKY基因在不同組織中也呈現(xiàn)出差異表達(dá)模式,比如RcWRKY14只在雄花中有微量表達(dá),RcWRKY21和RcWRKY27只在葉中表達(dá)[29]。在本研究中,ZmWRKY14-like、ZmWRKY25-like和ZmWRKY62-like基因在玉米不同組織中都檢測(cè)到表達(dá),但表達(dá)存在差異。其中,ZmWRKY14-like和 ZmWRKY62-like基因在葉片中的表達(dá)量最低,ZmWRKY25-like基因在莖中的表達(dá)量最低。ZmWRKY14-like和ZmWRKY62-like在幼果中的表達(dá)量都顯著高于其他組織,特別是ZmWRKY14-like在幼果中的表達(dá)量達(dá)到了葉片中表達(dá)量的83倍。ZmWRKY25-like基因在葉、穗絲和幼果中的表達(dá)量高于在其他組織中的表達(dá)量。這種差異表達(dá)模式表明,3個(gè)基因可能參與了玉米不同組織器官的生長(zhǎng)發(fā)育,特別是果實(shí)的發(fā)育。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)中發(fā)揮了重要作用。主要的非生物脅迫有高溫、低溫、干旱、鹽脅迫等,它們不但影響細(xì)胞的離子和滲透平衡,還會(huì)損壞細(xì)胞代謝平衡,導(dǎo)致活性氧(ROS)的積累。在擬南芥中有近2 000個(gè)干旱響應(yīng)基因,其中就包含編碼WRKY基因[30]。AtWRKY25和AtWRKY33受鹽脅迫的促進(jìn)表達(dá),而它們的異源表達(dá)增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株對(duì)NaCl耐性[31]。AtWRKY25、AtWRKY28、AtWRKY40和AtWRKY70受鹽害、冷害和高鹽脅迫的誘導(dǎo)[32]。遏藍(lán)菜TcWRKY53基因受鹽害、冷害和滲透脅迫的誘導(dǎo)[33]。與這些研究報(bào)道類似,本研究中3種非生物逆境脅迫下,ZmWRKY25-like基因?qū)}和低溫處理出現(xiàn)響應(yīng),在處理24 h時(shí)表達(dá)量分別上升為對(duì)照的3.3、3.2倍。ZmWRKY62-like基因則在鹽和干旱處理下出現(xiàn)下調(diào)表達(dá),在處理后24 h時(shí)分別下降為對(duì)照的0.48、0.38倍。ZmWRKY14-like基因的表達(dá)在3種脅迫處理下均出現(xiàn)顯著變化。上述結(jié)果表明,ZmWRKY25-like可能參與了植物對(duì)鹽和低溫脅迫的響應(yīng),ZmWRKY62-like基因則可能參與了植物對(duì)鹽和干旱脅迫的響應(yīng)。
隨著對(duì)植物基因組研究的深入,對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子的研究成為現(xiàn)今植物基因功能研究的重點(diǎn)之一。本研究結(jié)果表明,ZmWRKY14-like和ZmWRKY62-like基因在果實(shí)中的表達(dá)量最高,說(shuō)明這兩個(gè)基因可能在玉米果實(shí)發(fā)育過(guò)程中起到一定作用,而ZmWRKY25-like基因可能參與葉、穗絲和幼果的發(fā)育形成過(guò)程。另外,鹽、干旱和低溫脅迫試驗(yàn)結(jié)果表明,ZmWRKY25-like可能參與了植物對(duì)鹽和低溫脅迫的響應(yīng),ZmWRKY62-like基因則可能參與了植物對(duì)鹽和干旱脅迫的響應(yīng)。該研究對(duì)解析WRKY轉(zhuǎn)錄因子在玉米中的生物學(xué)功能及挖掘逆境應(yīng)答基因具有一定意義。
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(責(zé)任編輯 崔建勛)
Expression analysis of maize WRKY transcription factor genes under abiotic stress
JUE Deng-wei,SANG Xue-lian,SHU Bo,LIU Li-qin,WANG Yi-cheng,SHI Sheng-you
(Institute of South Subtropical Corp Research,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences/
Key Laboratory of Tropical Fruit Biology,Ministry of Agriculture,Zhanjiang 524091,China)
WRKY proteins are large family of plant-specific transcription factors (TFs),play essential roles in regulating plant responses to pathogens and abiotic stress. In this study,we identified three WRKY transcription factor (TF)genes (ZmWRKY14-like,ZmWRKY25-like,ZmWRKY62-like)in maize by using bioinformatics method. Plant-mPLoc predicted that these three proteins were all localized in nucleus. Real-time qPCR assay showed that ZmWRKY14-like,ZmWRKY25-like,ZmWRKY62-like expressed in all tested maize tissues,but had differential expression. The expression levels of ZmWRKY14-like and ZmWRKY62-like in young fruit were significantly higher than those in other tissues,while the expression level of ZmWRKY25-like gene in leaf,spike and young fruit was higher than that in other tissues. The expression levels of three genes under different abiotic stress were also analyzed by real-time qPCR. The expression of ZmWRKY25-like was up-regulated,while ZmWRKY62-like was down-regulated under salt stress. The expression of ZmWRKY62-like was down-regulated under drought stress. Under low temperature stress,the expression level of ZmWRKY25-like was up-regulated. These results indicated that ZmWRKY25-like may be involved into plant response to salt and low temperature stress,and ZmWRKY62-like may be involved into plant response to drought and salt stress.
maize;WRKY TFs;drought stress;salt stress;low temperature stress
S513.01;Q786
A
1004-874X(2017)01-0015-08
2016-10-26
海南省自然科學(xué)基金(20163111);國(guó)家自然科學(xué)基金(31572087)
決登偉(1986-),男,博士,助理研究員,E-mail:juedengwei@126.com
石勝友(1970-),男,博士,研究員,E-mail:ssy7299@163.com
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