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        大數(shù)據(jù)概念在醫(yī)學影像中的應用探索

        2016-12-16 18:18:47劉義王霄英
        放射學實踐 2016年12期
        關(guān)鍵詞:醫(yī)學影像領(lǐng)域

        劉義, 王霄英

        ·影像信息學專題·

        大數(shù)據(jù)概念在醫(yī)學影像中的應用探索

        劉義, 王霄英

        大數(shù)據(jù)(big data)概念的興起是隨著信息技術(shù)和統(tǒng)計技術(shù)的發(fā)展而來的,在商業(yè)和社會科學領(lǐng)域展現(xiàn)了一定的應用價值,在健康領(lǐng)域的應用也初步得到認可。但由于醫(yī)學影像專業(yè)的特點,大數(shù)據(jù)的應用仍處于初步探索階段。本文對大數(shù)據(jù)在醫(yī)學影像學領(lǐng)域的應用進展作一綜述。

        大數(shù)據(jù); 影像信息學; 醫(yī)學影像學

        “大數(shù)據(jù)(big data)”是近十年來被信息、商業(yè)領(lǐng)域廣泛提及的一個概念,是近年來數(shù)據(jù)存儲和計算能力、統(tǒng)計分析能力顯著提高而衍生出的數(shù)據(jù)處理、獲得利益的能力。大數(shù)據(jù)概念的興起是隨著信息技術(shù)和統(tǒng)計技術(shù)的發(fā)展而來的,在商業(yè)和社會科學領(lǐng)域展現(xiàn)了一定的應用價值,在健康領(lǐng)域的應用也初步受到認可。但由于醫(yī)學影像專業(yè)的特點,大數(shù)據(jù)的應用仍處于初步探索階段。

        大數(shù)據(jù)基本概念

        通常認為大數(shù)據(jù)是具有以下特征的數(shù)據(jù)集:體量大(volume)、種類多(variety)、生成速度快(velocity)、有潛在挖掘價值(veracity)。處理大數(shù)據(jù)超過傳統(tǒng)數(shù)據(jù)分析技術(shù)的能力,需很強的存儲、計算能力,數(shù)據(jù)統(tǒng)計和結(jié)果呈現(xiàn)也異于傳統(tǒng)方法。實際上,現(xiàn)階段對大數(shù)據(jù)的定義尚未得到公認,這個概念有很強的商業(yè)意味,在不同的應用場景下、對不同的人有不同的含義,大數(shù)據(jù)通常被用來描述和定義信息爆炸時代產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù),并命名與之相關(guān)的技術(shù)發(fā)展與創(chuàng)新。在大數(shù)據(jù)理念中,數(shù)據(jù)被認為是有價值(價格)的資源,大數(shù)據(jù)的關(guān)鍵價值是新的應用,技術(shù)的關(guān)鍵要素是云技術(shù)和開源性分析工具(如人工智能、Hadoop[1]和數(shù)據(jù)挖掘工具)等。

        與傳統(tǒng)科學研究的"數(shù)據(jù)"概念不同,大數(shù)據(jù)不追求精確度和因果關(guān)系,而是承認混雜性,探索相關(guān)關(guān)系,使用數(shù)據(jù)的直接目的是開發(fā)新產(chǎn)品和新服務。隨著計算效率的指數(shù)級提升、數(shù)據(jù)的數(shù)量、深度和廣度的增加、數(shù)據(jù)分析理論的進步以及現(xiàn)代社會對于個性化的追求,新的產(chǎn)業(yè)應運而生,全社會及每個人的決策等都會受到影響。無形的數(shù)據(jù)與有形的礦產(chǎn)、石油等資源一樣,在合理利用的情況下,具有成為巨大經(jīng)濟資產(chǎn)的可能,帶來全新的創(chuàng)業(yè)方向、商業(yè)模式和投資機會。

        大數(shù)據(jù)在健康領(lǐng)域的應用

        大數(shù)據(jù)在健康領(lǐng)域應用的第一個著名案例是2009年Google成功預測了甲型H1N1流感病毒的爆發(fā)[2],在流感爆發(fā)前幾周,研究論文已發(fā)表在《Nature》雜志上。研究論文不僅預測了全美國范圍內(nèi)將要傳播的冬季流感,而且具體到特定的地區(qū)和州。這項研究使用的預測依據(jù)與傳統(tǒng)流行病學檢測疾病的方式完全不同,并未使用任何醫(yī)學檢測手段(如血清化驗檢查、病原學檢查等),而是分析了大眾在網(wǎng)上搜索的詞條。Google把數(shù)千萬條美國人最頻繁檢索的詞條與近年來流感傳播時期的數(shù)據(jù)進行了對比,處理了上億個模型,挖掘出了特定檢索詞條的頻繁使用與流感之間的聯(lián)系。由于其龐大的數(shù)據(jù)資源、處理能力和統(tǒng)計技術(shù),預測流感的結(jié)果與疾控中心數(shù)據(jù)的相關(guān)性達97%。更重要的是,與傳統(tǒng)流行病學數(shù)據(jù)的發(fā)布不同,這篇文章是在流感爆發(fā)前預測了疫情的發(fā)生,而傳統(tǒng)的疾控數(shù)據(jù)是在疫情爆發(fā)之后一兩周才能得到。由于Google保存了多年來所有的搜索記錄,而且每天都會收到來自全球超過30億條的搜索指令,正是由于龐大的數(shù)據(jù)資源以及相應的處理能力才能支撐它完成這項工作[3]。這個大數(shù)據(jù)應用的案例引起了公共衛(wèi)生專家的極大關(guān)注,此后,大數(shù)據(jù)在健康領(lǐng)域的應用逐漸增多,其優(yōu)勢逐漸被認識。

        隨著醫(yī)學技術(shù)的進步,不同尺度的生物和臨床數(shù)據(jù)以前所未有的速度和規(guī)模產(chǎn)生并被收集起來,用于健康管理[4]。在微觀領(lǐng)域,新一代基因測序技術(shù)每天可以處理數(shù)十億的DNA序列數(shù)據(jù);在宏觀領(lǐng)域,廣泛應用的電子健康病歷(electric health record,EHR)可記錄大量患者個體及人群的數(shù)據(jù)。面對迅速產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù),傳統(tǒng)的方法不具備處理能力,而大數(shù)據(jù)為生命科學領(lǐng)域的研究者提供了從中挖掘規(guī)律的工具[5]。以IBM Watson為代表的健康大數(shù)據(jù)分析工具已應用于藥物研發(fā)和輔助制訂臨床決策[6]。在患者就診過程中,大數(shù)據(jù)分析可以幫助臨床醫(yī)師做出治療決策[7]。在住院過程中,大數(shù)據(jù)分析工具可以實時記錄監(jiān)護患者(如新生兒)的大量生命體征數(shù)據(jù)進行分析,及時發(fā)現(xiàn)患者的異常,以便針對性地采取措施,能明顯改善患者的預后[8]。出院后,大數(shù)據(jù)管理工具可以幫助患者監(jiān)測健康狀態(tài),將患者健康信息反饋給管理中心,對患者的服藥、就診等進行提示[9]??傊?,在實際應用方面,大數(shù)據(jù)在健康領(lǐng)域快速滲透,在過去的幾年里有許多新的發(fā)現(xiàn)和方法獲得推廣;在學科方面,大數(shù)據(jù)對以下幾個生物醫(yī)學領(lǐng)域的發(fā)展有重要促進作用:生物信息學、臨床信息學、影像信息學和公共衛(wèi)生信息學。

        大數(shù)據(jù)在醫(yī)學影像領(lǐng)域的應用探索

        大數(shù)據(jù)可用于醫(yī)學影像專業(yè)問題的解決和流程優(yōu)化。醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)主要分兩類:物理世界測量的數(shù)據(jù)(如圖像和檢查過程信息)和人類活動產(chǎn)生的影像解讀數(shù)據(jù)(如報告)。與其它領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)比較,醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)的特點是客觀性強、內(nèi)容復雜、體量大、獲取成本高和復用性強等。大數(shù)據(jù)分析方法的主要應用方向:1)實現(xiàn)個性化圖像解讀;2)促進研發(fā)新的成像技術(shù);3)量化影像服務的價值;4)優(yōu)化影像工作流程。

        大數(shù)據(jù)在醫(yī)學影像領(lǐng)域的最早應用是衛(wèi)生經(jīng)濟學分析。醫(yī)學影像檢查在整體醫(yī)療費用里占了很大比例[10-11],所以從降低費用、提升價值的角度引起了廣泛的關(guān)注[12-13],業(yè)界提出了“Value-based radiology”的概念[14],影像的收費不應基于檢查數(shù)量,而是基于影像信息對患者診治的作用,且對患者和付費者公開透明[15]。大數(shù)據(jù)研究分析了人群中大量影像檢查的項目、費用和結(jié)果,提出影像檢查對患者整體診治結(jié)局、整體花費的影響,為影像檢查適應證的制訂提供幫助:在申請過程中,可基于數(shù)據(jù)分析提示申請者應選擇何種檢查方法及相關(guān)的費用情況[16],對中風、腫瘤患者的合理化檢查建議已獲得較好的評價[17-18]。市場中已有不少相關(guān)產(chǎn)品,典型的如美國放射學會(ACR)發(fā)布的Appropriateness Criteria,根據(jù)大量循證醫(yī)學證據(jù)和專家意見,對影像診斷、介入治療的適應證給出了較全面的建議[19-20]。

        大數(shù)據(jù)在醫(yī)學影像業(yè)務領(lǐng)域的應用也在廣泛探索中。因影像檢查已基本數(shù)字化,所以天然具有能進行大數(shù)據(jù)處理的可能。但在醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)的探索過程中,要解決三類問題。第一,影像檢查的數(shù)據(jù)量極大,要求極高的存儲、處理和分析能力,進行大數(shù)據(jù)研究的前提是有功能足夠強大的硬件和軟件的支撐,更需要有IT和統(tǒng)計專業(yè)人士的參與[21]。第二,在數(shù)據(jù)利用過程中,簡單的數(shù)據(jù)堆積不能進行有效的處理,需要按一定邏輯,從微觀到宏觀進行數(shù)據(jù)加工后方可挖掘其內(nèi)在規(guī)律。在數(shù)據(jù)加工過程中,首先應從單個病例的影像中提取出關(guān)鍵信息(如美國國立衛(wèi)生研究院的common data element,CDE),實現(xiàn)圖像中數(shù)據(jù)元素的標準化、結(jié)構(gòu)化[22],其次應開展高質(zhì)量、大范圍和長期的注冊研究和臨床試驗[23],并且將影像數(shù)據(jù)與臨床數(shù)據(jù)、實驗室檢查、病理和基因組信息等整合在一起[17],基于特定的假設(shè)和目標[24-25]進行大數(shù)據(jù)分析,才能得到有意義的結(jié)果。第三,醫(yī)學影像研究的思路應改變,傳統(tǒng)的醫(yī)學研究是先提出研究假設(shè)(如假設(shè)某種因果關(guān)系的存在),以臨床觀察或?qū)φ张R床試驗的形式驗證假設(shè)或拒絕假設(shè),研究數(shù)據(jù)通常是有目的收集,數(shù)據(jù)質(zhì)量很高。但在大數(shù)據(jù)研究中,應允許數(shù)據(jù)有瑕疵,在不能確知因果關(guān)系之前,接受以相關(guān)關(guān)系來替代因果關(guān)系輔助決策,以整體數(shù)據(jù)預測個體結(jié)局[26-27]。只有逐步適應這些研究思路的改變,醫(yī)學影像研究者才能更好地利用大數(shù)據(jù)理念,并使其逐步完善。在完成實際任務的過程中,上述三類問題常常是互相疊加的,尚沒有很簡單的應對措施。所以總體上講,大數(shù)據(jù)在醫(yī)學影像業(yè)務領(lǐng)域的探索還是非常初步的,理論意義大于實際意義。

        醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)工作的困難和解決方向

        雖然當今醫(yī)學影像的數(shù)據(jù)總量很大,但只有極小的一部分能被整合、理解和分析,面對海量數(shù)據(jù)研究的困難在于數(shù)據(jù)量極大、數(shù)據(jù)源過多、數(shù)據(jù)格式不統(tǒng)一以及瑕疵數(shù)據(jù)充斥數(shù)據(jù)庫。在大數(shù)據(jù)處理過程中,統(tǒng)計理論和機器學習的技術(shù)非常重要,但醫(yī)學影像專家對IT技術(shù)所知有限,而IT技術(shù)專家則不易理解醫(yī)學問題的實質(zhì),跨學科人才稀缺。

        為了克服醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)工作的困難,應研發(fā)適應影像信息存儲、處理和挖掘的規(guī)范、技術(shù)和工具。為了更好地利用醫(yī)學影像大數(shù)據(jù),應提高數(shù)據(jù)對使用者的透明度和方便性,提高數(shù)據(jù)使用效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量,對影像數(shù)據(jù)進行定量化、結(jié)構(gòu)化地分析和挖掘[28-29]。具體地說,應在保障患者隱私和數(shù)據(jù)安全的基礎(chǔ)上,建立不依賴于廠家的存儲和分析平臺,使用統(tǒng)一的術(shù)語,發(fā)展定量的影像組學、影像共享、數(shù)據(jù)挖掘和人工智能工具等[30]。

        為了克服醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)工作的困難,應盡快培養(yǎng)跨學科人才,特別是領(lǐng)軍人才。大數(shù)據(jù)工作是系統(tǒng)工程,從確定任務、采集數(shù)據(jù)、計算分析到?jīng)Q策應用,是一個很長的流水線。在這個流水線上的每一個環(huán)節(jié),都存在嚴重的人才空缺。領(lǐng)導大數(shù)據(jù)工作的醫(yī)學影像專家則應當努力成為理解、掌控整個流水線的綜合性人才,并在醫(yī)學影像工作團隊中推廣大數(shù)據(jù)的概念和方法。在商業(yè)環(huán)境中,大數(shù)據(jù)的推廣應用有一個明確的過程,包括四個階段:教育、探索、參與和執(zhí)行[31]。我們可以參考這個過程,在本部門中宣傳大數(shù)據(jù)的相關(guān)理念,與IT技術(shù)人員合作,從解決單項明確任務起始,鼓勵大數(shù)據(jù)的研究、開發(fā)和利用,進而廣泛推廣,使醫(yī)學影像學科整體借助大數(shù)據(jù)技術(shù)得到充分的發(fā)展。

        總之,醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)是資源,與實體物資(自然資源、人力資源)一樣,具有價值和價格,大數(shù)據(jù)研究和應用將帶來醫(yī)學實踐的改變。在醫(yī)學影像發(fā)展歷史上的多次技術(shù)躍進中,我們都是跟隨者。此次以提升影像價值為導向的技術(shù)革新中,中國與世界前沿的距離并不大,我們完全有創(chuàng)新甚至局部領(lǐng)先的可能性。中國醫(yī)學影像從業(yè)者應積極參與到技術(shù)革新中,有勇氣去接受挑戰(zhàn),引領(lǐng)行業(yè)的發(fā)展。

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        100034 北京,北京大學第一醫(yī)院醫(yī)學影像科

        劉義(1989-),女,河北石家莊人,博士研究生,主要從事影像診斷研究工作。

        王霄英,E-mail: cjr.wangxiaoying@vip.163.com

        R814.4

        A

        1000-0313(2016)12-1124-03

        10.13609/j.cnki.1000-0313.2016.12.003

        ??回日期:2016-11-22)

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