從1989年初新竹地檢署高新武檢察官偵辦“司法院”高官吳天惠及其妻子蘇岡律師行賄司法官員的“吳蘇案”、桃園地檢署彭紹謹檢察官偵查時任“法務(wù)部長”蕭天贊“關(guān)說案”，到1991年臺南地方法院年輕法官謝說容拒絕院長“關(guān)說”事件，再到1994年時任國民黨黨主席的李登輝干涉司法的“上上級事件”。這一系列案件中，新一代司法官員用自己的行動推動著臺灣地區(qū)司法風(fēng)氣的自新，同時也在不斷推進司法改革、檢察獨立的進程。

隨著司法界“道德自新運動”，行政當(dāng)局欲在“立法院”推動新“法官法”，借機剝奪檢察官的司法官屬性，以此來削弱檢察獨立、加強行政控制。為此，1998年由13名檢察官組織“檢察官改革協(xié)會”（簡稱檢改會），拉開了檢察改革運動的序幕。

2003年出臺的《檢察官守則》，增加了許多堅守司法道德、抗擊“關(guān)說”的要求；另一方面是2006年修訂“法院組織法”，設(shè)立了以檢察官代表為主的“檢察官人事審議委員會”，防止“法務(wù)部長”或行政部門以控制檢察人事權(quán)來掌控檢察機關(guān)、影響檢察官偵查權(quán)獨立；此外，在法律層面，嚴格限制“法務(wù)部長”的外部指令權(quán)。由此，檢察官作為一整體，對外則更具獨立性。