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        蛋白質(zhì)組學(xué)與精準(zhǔn)醫(yī)療

        2016-11-08 11:26:15陳樞青
        科學(xué)24小時(shí) 2016年11期
        關(guān)鍵詞:分析

        陳樞青

        隨著生物醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步和人們對健康期望的提高,人類開始步入精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代。

        何為精準(zhǔn)治療

        精準(zhǔn)醫(yī)療是在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ)上,隨著對核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子進(jìn)行深入研究,開始在基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的水平上把握疾病的發(fā)生、發(fā)展規(guī)律,從而建立起來的個(gè)體化精準(zhǔn)診斷、精準(zhǔn)治療和精準(zhǔn)預(yù)防的技術(shù)體系。精準(zhǔn)醫(yī)療類似于個(gè)體化醫(yī)療,又不同于個(gè)體化醫(yī)療。個(gè)體化醫(yī)療只強(qiáng)調(diào)不同個(gè)體需要不同治療方案,但其治療靶標(biāo)和有效物質(zhì)等都可以是模糊綜合的,如中醫(yī)的藥方雖然是因人而異的,是個(gè)體化的,但這不是精準(zhǔn)醫(yī)療。而精準(zhǔn)醫(yī)療是建立在對個(gè)體基因組信息和病變細(xì)胞體細(xì)胞突變信息以及相應(yīng)的蛋白質(zhì)組信息基礎(chǔ)上的,強(qiáng)調(diào)個(gè)體、疾病、靶標(biāo)和藥物有效成分的精準(zhǔn)性。它是在分子水平上全面把握控制疾病的發(fā)生、發(fā)展與轉(zhuǎn)歸的一系列精準(zhǔn)預(yù)防、精準(zhǔn)診斷和精準(zhǔn)治療的技術(shù)體系;是建立在對人、病、藥物深度認(rèn)識基礎(chǔ)上采取的高水平醫(yī)療技術(shù)。這就比個(gè)體化醫(yī)療更重視“病”的深度特征和“藥”的高度精準(zhǔn)性。人類期待精準(zhǔn)醫(yī)療能夠推動難治性疾病,如腫瘤、糖尿病和心血管疾病等的治療水平,進(jìn)一步提高人類生活質(zhì)量,延長人類預(yù)期壽命。有專家預(yù)測精準(zhǔn)醫(yī)療有可能讓人類健康生活到120歲。

        精準(zhǔn)醫(yī)療研究是一個(gè)巨大的工程,不僅需要強(qiáng)大的生物化學(xué)與分子生物學(xué)技術(shù),而且還需要強(qiáng)大的計(jì)算技術(shù)和大數(shù)據(jù)處理技術(shù)。設(shè)想一下:平均每個(gè)成人擁有幾十萬億個(gè)細(xì)胞,每個(gè)細(xì)胞平均擁有幾百到幾萬種蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)分子個(gè)數(shù)成千上萬。每一個(gè)細(xì)胞都有“喜怒哀樂”,每一個(gè)分子都有生老病死,都會“談情說愛”。因此,從微觀上看,我們的體內(nèi)存在著細(xì)胞“社會”和分子“社會”。每一個(gè)細(xì)胞都是一個(gè)分子王國,各種各樣的分子在這個(gè)王國里扮演著各自的角色。DNA就像王國的圖書館,它編碼了所有的蛋白質(zhì)分子。蛋白質(zhì)是王國的功能執(zhí)行者,就像具有不同職業(yè)的“臣民”,“工人”、“農(nóng)民”、“教師”、“醫(yī)生”、“律師”等等,根據(jù)需要都有一定的數(shù)量要求。如一個(gè)細(xì)胞最基本的需要是物質(zhì)代謝和能量代謝,葡萄糖分子進(jìn)入細(xì)胞被代謝成二氧化碳和水,同時(shí)釋放細(xì)胞所需要的能量。這個(gè)過程需要一系列蛋白質(zhì)分子催化反應(yīng),如葡萄糖激酶等,這些蛋白質(zhì)就像細(xì)胞內(nèi)的農(nóng)民,他們的職業(yè)是生產(chǎn)細(xì)胞需要的能量。另一些蛋白質(zhì)催化合成核酸和蛋白質(zhì)的反應(yīng),他們像工人,在消耗能量的同時(shí),為細(xì)胞生存生長(分裂)制造必要的配件,如DNA 聚合酶等。所有蛋白質(zhì)分子都是由基因編碼的,是在信使RNA指導(dǎo)下合成的。只是,它們剛合成出來時(shí)只是一條多肽鏈,這條多肽鏈還需要進(jìn)一步折疊成熟而形成高級結(jié)構(gòu)才能表現(xiàn)功能。這個(gè)過程中需要一種蛋白質(zhì)幫助其折疊成熟,這類蛋白質(zhì)分子就像教師,如熱休克蛋白。類似于律師的蛋白質(zhì)如轉(zhuǎn)錄因子,則調(diào)控著基因的表達(dá)。為保持王國有秩序地運(yùn)轉(zhuǎn),其實(shí)還需要一個(gè)“國王”,幾十個(gè)“大臣”,以及大量行使各種職能的“公務(wù)員”。而這類蛋白質(zhì)分子是最難被研究和監(jiān)測的,因?yàn)槲覀兡壳暗谋O(jiān)測技術(shù)還不夠靈敏。

        何為蛋白質(zhì)組學(xué)

        那什么是蛋白質(zhì)組學(xué)呢?蛋白質(zhì)組學(xué)就是能夠分析一個(gè)樣本里面的所有蛋白質(zhì)成分的技術(shù),這個(gè)樣本可以是器官的一部分,如心肌、肝臟等,也可以是一群細(xì)胞,如腫瘤細(xì)胞等,也可以是單個(gè)細(xì)胞。只要分析技術(shù)足夠靈敏,我們不僅能夠像宏觀經(jīng)濟(jì)學(xué)一樣分析各行各業(yè)的就業(yè)狀況,甚至能夠監(jiān)測到“大臣”和“國王”是否在認(rèn)真工作!人體有2.6萬個(gè)基因,按照一個(gè)基因可以表達(dá)2-10種蛋白質(zhì)計(jì)算,人體約有20-30萬種蛋白質(zhì)。這些蛋白質(zhì)分布在幾百條信號通路的各個(gè)節(jié)點(diǎn)上,有條不紊地工作,實(shí)現(xiàn)正常的生理過程。人體的疾病本質(zhì)上是蛋白質(zhì)的疾病,是由蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、活性,蛋白質(zhì)的數(shù)量、比例,蛋白質(zhì)的運(yùn)動等發(fā)生錯(cuò)誤造成的。少數(shù)蛋白質(zhì)的變化可以用常規(guī)的生化分析方法測定,如體檢中可通過白蛋白、球蛋白檢測肝臟功能,而堿性磷酸酶與肝癌、甲狀腺功能亢進(jìn)有關(guān),肌酸激酶與急性心肌梗塞、病毒性心肌炎、腦炎等有關(guān)。因?yàn)槿梭w是一個(gè)成千上萬種蛋白質(zhì)相互作用的、復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),許多疾病是逐漸發(fā)展的,特別是一些疑難癥、退行性疾病有復(fù)雜的病因、病理,常常不能用一個(gè)指標(biāo)或幾個(gè)指標(biāo)說明。需要測定幾十種、幾百種、幾千種蛋白質(zhì)的數(shù)量、修飾和相互作用,直至發(fā)現(xiàn)病灶細(xì)胞出現(xiàn)的異常狀況,才能準(zhǔn)確地診斷疾病,并找到精準(zhǔn)的治療方法,這就需要蛋白質(zhì)組分析。

        如何精準(zhǔn)治療

        精準(zhǔn)醫(yī)療的一個(gè)重要前提是要有高靈敏的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)主要有雙向電泳和雙向高效液相色譜,以及質(zhì)譜分析技術(shù)。雙向電泳是利用蛋白質(zhì)分子帶有不同電荷的特性,通過其在電場中泳動的快慢來分離蛋白,可以達(dá)到納克級的分析靈敏度。通常第一向是等電聚焦,第二向是SDS-PAGE。雙向電泳可以讓分離后的蛋白質(zhì)點(diǎn)分布在平板凝膠上,通過機(jī)械手切割凝膠,用質(zhì)譜分析來鑒定蛋白質(zhì)。雙向高效液相色譜的第一向通常為離子交換色譜,第二向?yàn)榉聪嗌V。由于高效液相色譜技術(shù)的高度精密化,比起雙向電泳技術(shù)分離來得更高效、重復(fù)更好。質(zhì)譜分析是先將蛋白酶解成多肽片段,再使多肽電離,然后測定其核質(zhì)比,并通過數(shù)據(jù)庫確定其氨基酸序列,通過氨基酸序列推算蛋白質(zhì)種類。應(yīng)用質(zhì)譜可以進(jìn)行蛋白質(zhì)的定量和定性分析,也可以進(jìn)行蛋白質(zhì)的變異、修飾分析。

        那么,蛋白質(zhì)組學(xué)分析如何可以幫助精準(zhǔn)治療呢?以腫瘤為例,所有的腫瘤都是體細(xì)胞突變造成的,而且不同個(gè)體體細(xì)胞突變的位點(diǎn)很少會一樣?;蛲蛔儧Q定了相應(yīng)的蛋白質(zhì)也會發(fā)生突變,蛋白質(zhì)突變會產(chǎn)生新生抗原。我們針對新生抗原的抗體就能夠區(qū)分正常細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞,因此,可以用于制備抗體偶聯(lián)藥物,也可以制備特異性CAR-T細(xì)胞進(jìn)行治療,這種療法可以治療腫瘤而不傷及正常細(xì)胞,為腫瘤的精準(zhǔn)治療帶來很大希望。

        綜上所述,傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)是人們長期生活過程中無數(shù)經(jīng)驗(yàn)的積累,是類似哲學(xué)的一類感悟。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)是建立在解剖學(xué)和生理學(xué)基礎(chǔ)上的科學(xué),是大量科學(xué)研究的結(jié)晶。精準(zhǔn)醫(yī)療是建立在基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等學(xué)科上的技術(shù),是利用大數(shù)據(jù)手段分析病因、病理,并針對性地設(shè)計(jì)解決方案。精準(zhǔn)醫(yī)療將把人類的醫(yī)療事業(yè)推進(jìn)到一個(gè)全新的高度。

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