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        牛NF-κB1基因的原核表達(dá)與蛋白純化

        2016-10-26 06:28:30高學(xué)軍李姍姍于萌萌李冬
        關(guān)鍵詞:融合

        高學(xué)軍,李姍姍,于萌萌,李冬

        (東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省高校農(nóng)業(yè)生物功能基因重點實驗室,哈爾濱 150030)

        牛NF-κB1基因的原核表達(dá)與蛋白純化

        高學(xué)軍,李姍姍,于萌萌,李冬

        (東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省高校農(nóng)業(yè)生物功能基因重點實驗室,哈爾濱150030)

        NF-κB1是一類重要核轉(zhuǎn)錄因子,參與多種基因表達(dá)調(diào)控。NF-κB1能與奶牛乳腺中乳合成調(diào)控相關(guān)基因結(jié)合,發(fā)揮泌乳調(diào)節(jié)作用。研究應(yīng)用PCR方法擴增奶牛NF-κB1基因編碼序列,通過Eco RⅠ和XhoⅠ酶切位點將其定向插入pGEX-4T-1載體中,構(gòu)建原核表達(dá)重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-NF-κB1,轉(zhuǎn)化大腸埃希氏菌BL21 (DE3)。經(jīng)酶切和測序鑒定正確后,異丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)大量誘導(dǎo)表達(dá),8 mol·L-1尿素裂解包涵體,裂解后上清經(jīng)GST-Sepharose 4B親和純化,SDS-PAGE和Western blotting鑒定。結(jié)果表明,原核表達(dá)載體pGEX-4T-1-NF-κB1構(gòu)建成功,SDS-PAGE證實NF-κB1融合蛋白存在于包涵體內(nèi),純化后得到GST-NF-κB1融合蛋白,為進一步研究NF-κB1蛋白在奶牛泌乳中作用提供試驗依據(jù)。

        奶牛;NF-κB1;克?。辉吮磉_(dá);純化

        高學(xué)軍,李姍姍,于萌萌,等.牛NF-κB1基因的原核表達(dá)與蛋白純化[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2016,47(9):33-38.

        Gao Xuejun,Li Shanshan,Yu Mengmeng,et al.Prokaryotic expression and protein purification of gene bovineNF-κB1[J]. Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(9):33-38.(in Chinese with English abstract)

        NF-κB(Nuclear transcription factor-kappa B)是一類重要核轉(zhuǎn)錄因子,多種信號傳導(dǎo)途徑匯聚點[1]。其不僅參與介導(dǎo)免疫應(yīng)答、炎癥反應(yīng)、病毒復(fù)制、細(xì)胞凋亡和增殖等多種基因的表達(dá)調(diào)控,且與腫瘤發(fā)生及炎性相關(guān)疾病的發(fā)病機制密切相關(guān)[2-5]。NF-κB家族主要包括NF-κB1(p50)、NF-κB2(p52)、Rel A(p65)、Rel B及c-Rel等,大部分可相互結(jié)合成同源/異源二聚體。最常見是p65 與p50組成的異二聚體,含量最多、功效最大[6-7]。

        當(dāng)細(xì)胞受到細(xì)胞因子、B細(xì)胞抗原受體(B cell receptor,BCR)的同源抗原、T細(xì)胞抗原受體(T cell receptor,TCR)的同源抗原與氧化應(yīng)激等誘導(dǎo)活化,一系列信號級聯(lián)反應(yīng)活化IκB蛋白激酶(IκB kinase,Iκκ)復(fù)合物,IκB磷酸化和泛素化,在蛋白酶體作用下降解,釋放與之結(jié)合的NFκB,最終NF-κB轉(zhuǎn)錄因子進入細(xì)胞核并與靶基因啟動子結(jié)合而調(diào)節(jié)靶基因轉(zhuǎn)錄,這些靶基因產(chǎn)物參與調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)、免疫應(yīng)答及免疫細(xì)胞發(fā)育、增殖、分化和調(diào)亡[8-9]。

        本研究前期發(fā)現(xiàn)奶牛乳腺上皮細(xì)胞(Bovine mammary epithelial cells,BMECs)中,NF-κB1與mTOR、STAT5、CSN2等基因啟動子結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控乳蛋白合成[10]。pGEX-4T-1是表達(dá)GST融合蛋白原核高效表達(dá)載體,存在IPTG誘導(dǎo)啟動子,表達(dá)的蛋白產(chǎn)物在N端存在GST序列,融合蛋白產(chǎn)物可通過GST層析柱快速、簡便純化,進行后續(xù)蛋白質(zhì)相互作用、結(jié)構(gòu)分析等研究。為深入研究NF-κB1在奶牛乳腺泌乳中信號調(diào)節(jié)作用,本研究利用分子克隆技術(shù)構(gòu)建原核表達(dá)載體pGEX-4T-NF-κB1,在大腸埃希氏菌BL21(DE3)中誘導(dǎo)表達(dá)、純化融合蛋白,為研究其在乳腺中泌乳調(diào)節(jié)功能奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1載體和細(xì)胞

        載體pGEX-4T-1和大腸埃希氏菌BL21(DE3)由東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)生物功能基因重點實驗室提供;奶牛乳腺上皮細(xì)胞樣品取自哈爾濱市雙城區(qū)連發(fā)屠宰場,健康泌乳期中國荷斯坦奶牛,牛被放血宰殺后,常規(guī)手術(shù)取乳腺組織,組織塊法分離BMECs,經(jīng)純化培養(yǎng)后于液氮中保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2試劑與儀器

        TRIzol RNA提取試劑購于Life technologies,In?vitrogen公司(美國);Prime ScriptTMRT reagent kit、Reverse Transcriptase M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、限制性內(nèi)切酶(Eco RⅠ、XhoⅠ)、Taq DNA聚合酶、T4DNA連接酶、DNA Marker(DL5000、DL10000)購于TaKaRa公司(大連);引物片段合成及核酸測序均由哈爾濱博仕生物技術(shù)有限公司完成;瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、質(zhì)粒DNA小量試劑盒購于Axygen生物技術(shù)公司(美國);GST抗體購于碧云天生物技術(shù)有限公司(北京);NF-κB1抗體購于Cell Signaling Technology(CST)公司(美國);HRP標(biāo)記的二抗購于中杉金橋生物技術(shù)有限公司(北京);ECL試劑購于普利萊基因技術(shù)有限公司(北京);GST Microspin Purification kit購于中科晨宇生物科技公司(北京);其他試劑均為進口或國產(chǎn)分析純。

        CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱(Thermo,美國);DYY-5型穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀(北京六一);Nano-Drop 2000超微量分光光度計(Thermo,美國);PowerLook 2100XL掃描儀(Umax公司,韓國);DYCZ-23A型穩(wěn)壓電泳槽(六一,北京);空氣浴振蕩器(HZQ-C型,哈爾濱東明);數(shù)控超聲波清洗器(KQ-500DE,昆山超聲儀);凝膠成像系統(tǒng)(GDS-8000,UVP,美國);PCR儀(T-Gradient 96 Thermoblock Modul,Biometra);恒溫金屬浴(CHB-100,杭州博日);冷凍離心機(Z300-K,德國HERMLE)。

        1.3方法

        1.3.1RNA提取及反轉(zhuǎn)錄

        純化后BMECs用含10%胎牛血清的DMEM/ F12培養(yǎng)至90%單層匯合時,收集細(xì)胞,采用TRIzol法提取細(xì)胞總RNA。Nano-Drop 2000檢測RNA濃度,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析總RNA質(zhì)量。根據(jù)Reverse Transcriptase M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶說明書操作步驟反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。

        1.3.2NF-κB1全長編碼區(qū)基因擴增

        根據(jù)NCBI上公布的牛NF-κB1基因mRNA序列(GI:115497301),采用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計1對可用于序列擴增的專一性引物。上游引物:5'CGGAATTCATGGCAGAAGACGACCCGTAT TT 3',下游引物:5'CCGCTCGAG AATTTTGCCTT CTATAGGTCCTTCC 3',擴增片段長度2 909 bp。以BMECs的cDNA為模板作PCR擴增。建立25 μL PCR反應(yīng)體系,反應(yīng)條件為:98℃預(yù)變性3 min,98℃變性10 s,60℃退火10 s,72℃延伸2.5 min,32次循環(huán)后72℃延伸10 min。擴增產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,膠回收試劑盒回收約2 909 bp的PCR產(chǎn)物。PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)膠回收純化得到目的片段。

        1.3.3pGEX-4T-1-NF-κB1表達(dá)載體構(gòu)建

        將pGEX-4T-1載體和膠回收后的NF-κB1 PCR產(chǎn)物分別用Eco RⅠ和XhoⅠ雙酶切,電泳檢測并分別回收目的片段,T4DNA連接酶于恒溫金屬浴16℃連接過夜,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,37℃培養(yǎng)過夜,以primer-NF-κB1引物作PCR鑒定,陽性克隆按1%比例擴大培養(yǎng),擴增后提取質(zhì)粒,用Eco RⅠ和XhoⅠ雙酶切鑒定重組質(zhì)粒,測序驗證。

        1.3.4重組蛋白在原核細(xì)胞中的誘導(dǎo)表達(dá)及包涵體變性溶解

        將測序鑒定正確的重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-NF-κB1陽性克隆及pGEX-4T-1空載體接種到含有100 μg·mL-1氨芐青霉素LB培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)過夜后,將菌液按1∶50接種到含有10 μg·mL-1氨芐青霉素50 mL LB培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至A600達(dá)0.6~0.8,加入IPTG至終濃度為1 mmol·L-1,30℃誘導(dǎo)培養(yǎng)4 h[11]。同時對含GST蛋白的pGEX-4T-1空載體誘導(dǎo)表達(dá),IPTG終濃度為1 mmol·L-1,設(shè)為對照。誘導(dǎo)后的菌液在4℃、5 000 r·min-1離心10 min后收集菌體,加入1 mL細(xì)菌裂解液充分重懸,室溫孵育10 min,反復(fù)凍融(-80℃10 min,37℃快速融解)3次,冰上超聲破碎,超聲條件為:5 s超聲,5 s間歇,30 min超聲。超聲破碎后菌液4℃10 000 r·min-1離心10 min,收集上清及粗包涵體沉淀。按質(zhì)量體積比1/40,向粗包涵體中加入PBS(含1%Trition X-100)緩沖溶液洗滌沉淀,重復(fù)洗滌3次。然后向沉淀中分別加入適量8 mol·L-1尿素,4℃繼續(xù)裂解,收集上清。分別取20 μL菌液上清及裂解沉淀后上清與上樣緩沖液1∶1混合,沸水煮10 min,超聲3次,每次15 s,樣品SDSPAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色2 h,37℃脫色液脫色2 h,檢測誘導(dǎo)表達(dá)結(jié)果。

        1.3.5融合蛋白GST-NF-κB1純化

        將誘導(dǎo)表達(dá)及鑒定正確的剩余上清與500 μL PBS重懸的GST-Sepharose 4B小顆粒4℃顛倒混勻4 h,3 000 r·min-1低速離心收集GST-Sepharose 4B小顆粒,500 μL PBS洗脫3次,除去未結(jié)合蛋白質(zhì),利用還原型谷胱甘肽洗脫緩沖液少量多次洗脫珠子上GST-NF-κB1,收集樣品。一部分SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色檢測純化結(jié)果,另一部分作Western blotting初步檢測。4℃75 V恒壓轉(zhuǎn)移至NC膜上2 h,用含5%脫脂奶粉37℃封閉1.5 h,分別加入GST抗體(1∶500),4℃過夜,TBST洗膜3次,每次5 min,加入HRP標(biāo)記的相應(yīng)二抗(1∶2 000),37℃孵育1 h,TBST洗膜3次,每次10 min。ECL顯色,拍照。

        1.3.6目的蛋白鑒定

        將IPTG誘導(dǎo)的GST-NF-κB1與一次過柱、二次過柱純化后GST-NFκB1融合蛋白作8%SDSPAGE電泳,利用特異性NF-κB1抗體作Western blotting分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1NF-κB1基因克隆

        以BMECs細(xì)胞cDNA為模板,PCR擴增NF-κB1基因,PCR產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳,可見特異性片段大小約2 909 bp(見圖1),與預(yù)期結(jié)果相符。

        圖1 PCR擴增NF-κB1基因Fig.1PCR amplification of NF-κB1 gene

        2.2重組表達(dá)載體pGEX-4T-1-NF-κB1構(gòu)建與測序

        將NF-κB1基因的PCR產(chǎn)物與pGEX-4T-1載體連接、轉(zhuǎn)化,擴大培養(yǎng)后得到陽性克隆pGEX-4T-1-NF-κB,Eco RⅠ和XhoⅠ雙酶切后分別得到兩條清晰條帶,分別約為2 909 bp處NF-κB1基因和4 969 bp處pGEX-4T-1載體(見圖2),與預(yù)期結(jié)果相符。測序結(jié)果顯示插入片段為2 909 bp,與NCBI公布的NF-κB1基因mRNA序列完全匹配,兩者同源性100%,且含有pGEX-4T-1質(zhì)粒序列,證明重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-NF-κB1構(gòu)建成功。

        2.3融合蛋白GST-NF-κB1誘導(dǎo)表達(dá)及鑒定

        利用IPTG分別對pGEX-4T-1-NF-κB1重組載體及含有GST蛋白的pGEX-4T-1空載體作誘導(dǎo)表達(dá),發(fā)現(xiàn)NF-κB1表達(dá)的蛋白在上清中含量較少,主要以包涵體形式存在。采用8 mol·L-1尿素溶解沉淀,收集上清,作SDS-PAGE電泳分析??捡R斯亮藍(lán)染色結(jié)果表明,132 ku處存在大量目的蛋白表達(dá),上清中目的蛋白條帶處表達(dá)量較少,而沉淀中存在大量融合蛋白。8 mol·L-1尿素溶解包涵體上清中,目的條帶處融合蛋白含量較多,可進一步純化。

        圖2 重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-NF-κB1酶切鑒定Fig.2Identification of recombination plasmid pGEX-4T-1-NF-κB1 by restriction enzyme digestion of XhoⅠand Eco RⅠ

        圖3 GST-NFκB1融合蛋白包涵體破碎后產(chǎn)物SDS-PAGE電泳鑒定Fig.3SDS-PAGE result of recombinant protein GST-NFκB1 in the cracked inclusions

        2.4融合蛋白GST-NF-κB1純化

        用GST-Sepharose 4B親和珠純化得到融合蛋白,還原型谷胱甘肽洗脫緩沖液少量多次洗脫,收集洗脫液,利用GST標(biāo)簽單克隆抗體作Western blotting分析。

        結(jié)果顯示,作為對照的空載體表達(dá)產(chǎn)物在目的蛋白位置未檢測到免疫信號;經(jīng)誘導(dǎo)的包涵體上清中及過柱純化后洗脫液中蛋白在132 ku(目的蛋白分子質(zhì)量與標(biāo)簽載體分子質(zhì)量之和)處均能被兔抗GST單抗特異性識別,表明純化蛋白極可能為GST-NF-κB1融合蛋白(見圖4A)??捡R斯亮藍(lán)染色結(jié)果也表明,在目的蛋白位置出現(xiàn)陽性條帶。但經(jīng)一次過柱純化的蛋白雜帶較多,二次純化后的融合蛋白在目的條帶處僅一條單鏈,且無雜帶(見圖4B、C)。

        2.5目的蛋白鑒定

        為進一步確定上述誘導(dǎo)純化蛋白即GST-NF-κB1融合蛋白,利用特異性NF-κB1抗體作West?ern blotting分析,在132 ku處,誘導(dǎo)及純化后融合蛋白GST-NF-κB1均與NF-κB1抗體有免疫反應(yīng)特異性(見圖5),表明誘導(dǎo)、純化得到的融合蛋白即為GST-NF-κB1蛋白。

        圖4 Western blotting及SDS-PAGE電泳鑒定純化的融合蛋白GST-NF-κB1Fig.4SDS-PAGE and Western blotting result of recombinant protein GST-NF-κB1 after purification

        圖5 目的蛋白的Western blotting鑒定Fig.5Western blotting result of GST-NF-κB1 recombinant protein

        3 討論

        本研究成功構(gòu)建pGEX-4T-1-NF-κB1載體,利用IPTG對其大量誘導(dǎo)表達(dá),純化獲得目的蛋白。pGEX-4T-1載體是一種常用原核表達(dá)載體,其多克隆位點區(qū)域含有多個內(nèi)切酶位點序列,且全序列中含GST標(biāo)簽序列,是一種高效蛋白表達(dá)載體。誘導(dǎo)后的融合蛋白產(chǎn)物可通過GST層析柱快速、簡便純化,且在運載序列后含有蛋白酶切割位點,通過凝血酶X因子等切割后快速釋放該融合蛋白[12-13]。

        本課題組前期確定處理該融合蛋白最佳IPTG作用濃度、時間及誘導(dǎo)溫度,分別為1 mmol·L-1、4 h、30℃。重組蛋白在宿主系統(tǒng)中高水平表達(dá)時,易形成包涵體。大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)的外源基因產(chǎn)物常以不可溶包涵體形式存在[14]。本試驗發(fā)現(xiàn)NF-κB1表達(dá)蛋白也主要存在于包涵體,包涵體的溶解和純化成為試驗難點[15-16]。Yang指出在一步法變性和復(fù)性過程中,6 mol·L-1鹽酸胍或8 mol· L-1尿素變性劑用于溶解存在于包涵體中的蛋白[17]。本試驗選用8 mol·L-1尿素溶解包涵體,足以用于后續(xù)試驗純化。由于大腸桿菌有些外膜蛋白在4~8 mol·L-1尿素中具有蛋白水解酶活性,包涵體溶解和復(fù)性過程會降解重組蛋白質(zhì)[18],產(chǎn)生不同大小蛋白片段,導(dǎo)致一次過GST-Sepharose 4B柱純化后雜帶較多。但鑒于目標(biāo)蛋白含量較其他蛋白含量多,誘導(dǎo)蛋白適量稀釋經(jīng)二次純化過柱后,得到較純目的蛋白可直接進行后續(xù)試驗。

        本研究獲得融合蛋白GST-NF-κB1,可為后期與其有關(guān)的其他上游蛋白質(zhì)同NF-κB1相互作用機制研究提供底物NF-κB1蛋白,并為NF-κB1及其家族其他成員結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能研究,探索NF-κB1在蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄過程中新功能研究提供依據(jù)。

        4 結(jié)論

        本研究成功構(gòu)建原核表達(dá)載體pGEX-4T-1-NF-κB1,利用最佳濃度的IPTG誘導(dǎo)獲得高水平表達(dá)重組蛋白。發(fā)現(xiàn)大量表達(dá)的蛋白多存在于包涵體中,在尿素進一步處理下,可獲得足量融合蛋白用于目的蛋白純化,經(jīng)過適量稀釋與二次GST過柱純化獲得NF-κB1蛋白。

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        Prokaryotic expression and protein purification of gene bovineNF-κB1

        GAO Xuejun,LI Shanshan,YU Mengmeng,LI Dong
        (Key Laboratory of Agricultural Biological Functional Gene Laboratory of Heilongjiang Province,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)

        As an important nuclear transcription factor,NF-κB1 is involved in regulating the expression of lots of genes.Recent research found that NF-κB1 has important regulatory effect on milk synthesis by binding to many gens involved in the regulation of milk synthesis.BovineNF-κB1 coding sequence was amplified by polymerase chain reaction(PCR)and was cloned intoEcoR I andXhoI sites of pGEX-4T-1 vector to construct the recombinant plasmid pGEX-4T-1-NF-κB1.The recombinant plasmid was identified by restriction enzyme digestion and sequencing.Then it was transformed intoEcoliBL21(DE3),induced by IPTG and purified the inclusion bodies was cracked with 8 mol·L-1urea,and GST-NFκB1 was purified by GST-Sepharose 4B beads,identified by SDS-PAGE and Western blotting analysis.Results showed that the prokaryotic expression vector pGEX-4T-1-NF-κB1 was successfully constructed.Western blotting and SDSPAGE confirmed the recombinant protein GST-NF-κB1 were expressed and purified.This study provided the experimental basis for the further research on the protein function of bovineNF-κB1.

        bovine;NF-κB1;cloning;prokaryotic expression;purification

        Q786

        A

        1005-9369(2016)09-0033-06

        2016-06-13

        國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)項目(2013AA102504-03)

        高學(xué)軍(1969-),男,教授,博士,博士生導(dǎo)師,研究方向為乳業(yè)生物技術(shù)。E-mail:gaoxj5390@sina.com

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