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        甘藍(lán)型油菜BnFAD2-C5基因啟動(dòng)子及內(nèi)含子在表達(dá)水平的功能分析

        2016-10-19 04:14:07劉睿洋劉芳張振乾官春云
        作物學(xué)報(bào) 2016年10期
        關(guān)鍵詞:內(nèi)含子油酸擬南芥

        劉睿洋劉 芳張振乾 官春云

        湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院 / 國家油料改良中心湖南分中心, 湖南長沙 410128

        甘藍(lán)型油菜BnFAD2-C5基因啟動(dòng)子及內(nèi)含子在表達(dá)水平的功能分析

        劉睿洋**劉 芳**張振乾 官春云*

        湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院 / 國家油料改良中心湖南分中心, 湖南長沙 410128

        富含油酸的菜籽油具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值, 使得高油酸育種及油酸形成機(jī)制成為熱點(diǎn)。油酸脫氫酶基因(FAD2基因)是控制油酸含量的關(guān)鍵酶基因。本文針對(duì)BnFAD2-C5基因展開研究, 根據(jù)油菜和甘藍(lán)的同源性, 克隆了1257 bp啟動(dòng)子序列, 利用 GUS和 GFP作為報(bào)告基因分別構(gòu)建含有不同片段長度的啟動(dòng)子和內(nèi)含子的缺失載體并轉(zhuǎn)化擬南芥, 經(jīng)GUS染色檢測發(fā)現(xiàn)-319 ~-1 bp為該研究中最小啟動(dòng)子; 采用Western blot技術(shù)分析啟動(dòng)子和內(nèi)含子不同區(qū)域的功能, 發(fā)現(xiàn)BnFAD2-C5啟動(dòng)子區(qū)域-1257 ~-1020 bp和-319 ~-1 bp能夠誘導(dǎo)報(bào)告基因在轉(zhuǎn)基因擬南芥種子發(fā)育中期高效表達(dá), BnFAD2-C5內(nèi)含子具有增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄水平的功能, 該功能主要由+631~ +1033 bp區(qū)域調(diào)控。

        甘藍(lán)型油菜; BnFAD2-C5基因; 內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng); 擬南芥

        菜籽油在我國食用成品油市場占有重要地位,高油酸菜籽油不容易被氧化, 保鮮更持久[1-3], 具有重要的商業(yè)價(jià)值[4]。因此, 油酸含量的高低也成為評(píng)判油菜品質(zhì)的重要指標(biāo), 同時(shí), 高油酸育種及形成相關(guān)機(jī)理也成為目前各油料作物研究的熱點(diǎn)[5-6]。

        目前在高油酸育種方面, 通過傳統(tǒng)育種的手段,官春云等[7]用60Co輻射誘變獲得油酸含量高達(dá)93.5%的材料, 和江明等[8]利用 EMS誘變油菜小孢子獲得油酸含量為80.34%的材料。油酸脫氫酶基因(fatty acid desaturase, FAD2)作為控制油酸、亞油酸和亞麻酸含量的主要基因[9-10], 其功能主要是將油酸磷脂膽堿去飽和成亞油酸磷脂膽堿。Stoutjesdijk等[10]通過共抑制法沉默甘藍(lán)型油菜 FAD2基因, 將油酸含量提高至89%; Peng等[11]通過RNAi技術(shù)將甘藍(lán)型油菜FAD2基因和FAE1基因共同沉默, 使油酸含量提高至85.34%。然而, 與高油酸油菜育種相比, 油酸形成機(jī)制的研究則比較落后。詳細(xì)探究脂肪酸代謝路徑中的關(guān)鍵酶基因(FAD2基因)的調(diào)控機(jī)制, 將有助于充分利用 FAD2基因?yàn)楦哂退嵊N提供參考。2006年, Kim等[12]通過缺失分析的手段,對(duì)芝麻FAD2基因(SeFAD2)上游調(diào)控序列分析研究,發(fā)現(xiàn)在上游5′端非翻譯區(qū)(untranslated region, UTR)內(nèi)部存在一個(gè)1131 bp長度的內(nèi)含子, 并且具有增強(qiáng)啟動(dòng)子功能的效應(yīng), 而啟動(dòng)子區(qū)域則主要含有一些起到負(fù)調(diào)控作用的順式作用元件。同時(shí)證實(shí)脫落酸(abscisic acid, ABA)可以促進(jìn)芝麻FAD2啟動(dòng)子的啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄功能, 增強(qiáng)SeFAD2基因的表達(dá), 并確定了ABA應(yīng)答元件在啟動(dòng)子上的大致區(qū)域。Xiao等[13]通過對(duì)甘藍(lán)型油菜 BnFAD2-A5基因研究, 預(yù)測并分析了該啟動(dòng)子及內(nèi)含子上的順式作用元件,通過檢測轉(zhuǎn)基因擬南芥中 GUS活力, 證明BnFAD2-A5啟動(dòng)子屬于組成型啟動(dòng)子, 其內(nèi)含子同樣具有增強(qiáng)基因表達(dá)的功能。BnFAD2-A5啟動(dòng)子的活性受 ABA的誘導(dǎo)出現(xiàn)高表達(dá)現(xiàn)象, 并且定位到ABA在啟動(dòng)子上的順式作用結(jié)合位點(diǎn) ABRE所處的位置。

        本實(shí)驗(yàn)室前期已克隆到甘藍(lán)型油菜 BnFAD2基因的4個(gè)拷貝(BnFAD2-A5、BnFAD2-C5、BnFAD2-A1 和BnFAD2-C1), 初步分析了BnFAD2-A5[13]和BnFAD2-C1[14]在轉(zhuǎn)錄水平的功能, 而BnFAD2-A1則是假基因(待發(fā)表), 因此本研究針對(duì) BnFAD2-C5基因展開研究, 克隆 BnFAD2-C5啟動(dòng)子, 采用生物信息學(xué)分析啟動(dòng)子及內(nèi)含子的順式作用元件, 通過PCR技術(shù)構(gòu)建啟動(dòng)子及內(nèi)含子的缺失載體并轉(zhuǎn)化擬南芥, 分析BnFAD2-C5啟動(dòng)子和內(nèi)含子的功能, 旨在為高油酸油菜分子育種在表達(dá)水平提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        甘藍(lán)型油菜湘油15和擬南芥(Arabidopsis thaliana Col)由國家油料改良中心湖南分中心提供。大腸桿菌 trans-T1購自北京全式金公司, pCAMBIA1303載體和農(nóng)桿菌 GV3101均由湖南省作物基因工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室陳信波教授贈(zèng)予。

        1.2 克隆BnFAD2-C5啟動(dòng)子區(qū)域

        本實(shí)驗(yàn)室已通過RACE技術(shù)克隆了BnFAD2-C5基因的全長序列, 確定轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn), 且發(fā)現(xiàn)在5′UTR內(nèi)部含有一個(gè)內(nèi)含子序列(圖1)。在此基礎(chǔ)上, 本研究根據(jù)油菜與甘藍(lán)的同源性, 依據(jù)甘藍(lán)數(shù)據(jù)庫信息(http://ocri-genomics.org/bolbase),在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游約 1700 bp處設(shè)計(jì)正向引物PBn-F1 (5′-AAATGAAATGAAAATCATGGTAGGTG-3′), 在該基因編碼區(qū)內(nèi)部設(shè)計(jì)反向引物CDS-R (5′-GCTTGATGTTGTGTCGGTTTCAGACTT-3′), 通過PCR技術(shù)從甘藍(lán)型油菜基因組DNA中擴(kuò)增BnFAD2-C5啟動(dòng)子區(qū)域, 然后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌并測序。

        圖1 BnFAD2-C5序列結(jié)構(gòu)示意圖Fig.1 Model of BnFAD2-C5 gene structure

        1.3 生物信息學(xué)分析

        利用 PLACE (http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/ PLACE)和PlantCARE (http://www.intra.psb.ugent.be:8080/PlantCARE)網(wǎng)站對(duì) BnFAD2-C5啟動(dòng)子及內(nèi)含子序列預(yù)測分析。

        1.4 啟動(dòng)子及內(nèi)含子缺失表達(dá)載體構(gòu)建及擬南芥的轉(zhuǎn)化

        缺失載體構(gòu)建過程中所用引物見表1。采用PBn-F1和IBn-r引物從基因組中克隆啟動(dòng)子+內(nèi)含子片段, 經(jīng) Hind III/Nco I雙酶切處理, 連接到pCAMBIA1303載體, 構(gòu)建表達(dá)載體 Bn-1, 導(dǎo)入大腸桿菌保存。以含有Bn-1載體的大腸桿菌菌液為模板, 分別以引物 PBn-F1/PBn-R、PBn-F2/PBn-R、 PBn-F3/PBn-R、PBn-F4/PBn-R、PBn-F5/PBn-R克隆啟動(dòng)子缺失片段, 經(jīng) Hind III/Nco I雙酶切處理后,按照上述方法, 將其連接到 pCAMBIA1303載體,構(gòu)建啟動(dòng)子缺失表達(dá)載體 BnP-1、BnP-2、BnP-3、BnP-4和BnP-5 (圖2)。

        同樣以含有 Bn-1載體的大腸桿菌菌液為模板,以IBn-F/IBn-r引物進(jìn)行擴(kuò)增; 以IBn-R1、IBn-R2、IBn-R3和IBn-R4為反向引物, IBn-F1為正向引物,進(jìn)行 PCR擴(kuò)增, 各取 3 μL PCR產(chǎn)物與 3 μL IBn-F/IBn-r產(chǎn)物進(jìn)行融合 PCR, 反應(yīng)體系含緩沖液4 μL、dNTPs 2 μL、HS Taq聚合酶0.5 μL、ddH2O 7.5 μL; 反應(yīng)條件為95 ℃ 5 min ; 95 ℃ 50 s, 58℃ 50 s,72 ℃ 4 min, 15個(gè)循環(huán)。取2 μL融合產(chǎn)物作為模板,以IBn-F1/IBn-r為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增, 擴(kuò)增程序?yàn)?5℃ 5 min; 95 ℃ 50 s, 58℃ 50 s, 72 ℃ 4 min, 25個(gè)循環(huán); 72 ℃ 10 min。將融合產(chǎn)物克隆到大腸桿菌并測序。選擇測序正確的菌株搖菌, 提取質(zhì)粒并進(jìn)行Hind III/Nco I雙酶切, 然后將酶切后的產(chǎn)物純化并連 接 到經(jīng) Hind III/Nco I 雙酶 切 處理 的pCAMBIA1303載體, 構(gòu)建內(nèi)含子缺失載體BnI-1、BnI-2、BnI-3和BnI-4 (圖2)。以含有CaMV35S啟動(dòng)子的 pCAMBIA1303載體為陽性對(duì)照, 去除CaMV35S啟動(dòng)子的作為陰性對(duì)照。

        表1 不同長度BnFAD2-C5啟動(dòng)子片段和引物序列Table1 Different fragments of the BnFAD2-C5 promoter and the primer sequences

        圖2 缺失載體構(gòu)建模式圖Fig.2 Construction pattern diagram of deleted vector

        將構(gòu)建好的表達(dá)載體通過凍融法導(dǎo)入農(nóng)桿菌GV3101, 將轉(zhuǎn)化后的農(nóng)桿菌菌液涂到含有慶大霉素(GM)和卡那霉素(Kan)的YEB固體平板篩選, 挑選單菌落進(jìn)行PCR檢測, 并將陽性菌液保存于-80℃。在轉(zhuǎn)化擬南芥前, 將含有目的表達(dá)載體的農(nóng)桿菌畫線接種于含有50 mg L-1GM+50 mg L-1Kan的YEB固體平板, 28℃倒置培養(yǎng)2 d, 挑取單菌落于10 mL含有50 mg L-1GM+50 mg L-1Kan的YEB液體培養(yǎng)基搖過夜, 取2 mL接種于50 mL含有50 mg L-1GM+50 mg L-1Kan的YEB液體培養(yǎng)基, 待其OD600為0.4~0.6時(shí), 收集菌體(5000轉(zhuǎn) min-1, 5 min), 用5 mL 10 mmol L-1MgSO4溶液重懸, 加入5 μL乙酰丁香酮(200 μmol L-1)于暗光下靜置 1.5 h。隨后加入100 mL滲透培養(yǎng)基, 通過花序浸染法轉(zhuǎn)化擬南芥。

        1.5 GUS染色及GFP蛋白相對(duì)表達(dá)量分析

        參照 Jefferson等[15]GUS組織化學(xué)檢測的方法檢測轉(zhuǎn)基因擬南芥種子不同發(fā)育時(shí)期(4、7、10和13 d) GUS表達(dá)情況。以GFP為報(bào)告基因, 以Actin為內(nèi)參, 通過Western blot技術(shù)對(duì)GFP和Actin顯影,利用 Quality One軟件將 Western雜交斑點(diǎn)數(shù)字化,以GFP含量比Actin含量所得的數(shù)值表示GFP蛋白的相對(duì)含量, 以此確定不同缺失載體啟動(dòng)報(bào)告基因GFP的功能大小。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 啟動(dòng)子區(qū)域的克隆及 BnFAD2-C5基因上游序列的生物信息學(xué)分析

        根據(jù)油菜和甘藍(lán)的同源性, 同源克隆了1257 bp啟動(dòng)子序列, 與甘藍(lán)基因組序列僅有 2個(gè)堿基的差異。利用PLACE和PlantCARE網(wǎng)站對(duì)BnFAD2-C5基因啟動(dòng)子和內(nèi)含子區(qū)域預(yù)測分析(圖3), 發(fā)現(xiàn)在啟動(dòng)子區(qū)域存在核心啟動(dòng)子必備的元件 TATA box (-139 bp)和CAAT box (-61 bp), 同時(shí)還存在一些控制基因高效轉(zhuǎn)錄的元件(CCAATT box, GATA, 5′UTR Py-rich), 激素應(yīng)答元件(TCA motif、CGTCA motif、ABRE、MYB、MYC和GARE), 根毛特異性元件(root hair specific element, RHE), 光調(diào)控元件(GAG,G-boxGT-1 consensus合Dof), 花粉特異性表達(dá)元件(GTGA), 胚乳特異性表達(dá)元件(ACGT), 以及具有正、負(fù)調(diào)控功能的元件CACA。

        在內(nèi)含子區(qū)域, 同樣存在 TATA box和 CAAT box, 分別位于+1241 bp和+1040 bp處。另外, 內(nèi)含子區(qū)域也包含一些順式作用元件, 如胚乳特異性表達(dá)原件(ACGT, Skn-1motif), 激素應(yīng)答原件(MYB、MYC、GARE), 分生組織特異性原件(CAT box), 抗性原件(W-box), 光控原件(G-box、GT-1consensus),熱激蛋白原件(heatshockprotein element, HSE)以及Dof和E-box。

        2.2 BnFAD2-C5啟動(dòng)子功能分析

        由GUS染色結(jié)果(圖4)可知, 當(dāng)BnFAD2-C5啟動(dòng)子缺失掉大部分區(qū)域, 僅保留-136 ~ +137 bp區(qū)域時(shí)(BnP-5), GUS染色結(jié)果與陰性對(duì)照相同, 該部分序列不能發(fā)揮啟動(dòng)子功能, 而 BnP-1、BnP-2、BnP-3和BnP-4均有不同程度的著色。將含有BnP-1、BnP-2、BnP-3和BnP-4的轉(zhuǎn)基因擬南芥發(fā)育中的種子進(jìn)行蛋白相對(duì)定量檢測, 將 Western blot結(jié)果經(jīng)Quality軟件數(shù)字化后, 以GFP含量比Actin含量所得的數(shù)值表示 GFP蛋白的相對(duì)含量, 結(jié)果如圖5。BnP-1和BnP-4的GFP蛋白相對(duì)含量高于BnP-2和BnP-3, 而BnP-2和BnP-3的相對(duì)蛋白含量較為接近,說明在缺失的-1257 ~-1020 bp區(qū)間存在調(diào)控基因高表達(dá)的正調(diào)控元件, 在-581 ~-319 bp區(qū)間存在抑制基因表達(dá)的負(fù)調(diào)控元件, 且主要是抑制-319 ~-1 bp區(qū)間的順式作用元件的功能發(fā)揮。BnP-1和BnP-4在種子發(fā)育中期出現(xiàn)表達(dá)高峰, 而 BnP-2和 BnP-3在整個(gè)種子發(fā)育過程中表達(dá)量變化較為平緩, 說明在-1257~-1020 bp和-319~-1 bp區(qū)間存在某些調(diào)控元件誘導(dǎo)報(bào)告基因GFP在種子發(fā)育中期高效表達(dá)。

        2.3 BnFAD2-C5內(nèi)含子功能分析

        由圖5-A中BnP-1轉(zhuǎn)基因擬南芥種子GFP蛋白相對(duì)含量與圖6-A中Bn-1比較可知, BnFAD2-C5內(nèi)含子具有增強(qiáng)啟動(dòng)子功能的效應(yīng), 為了研究發(fā)揮這一增強(qiáng)效應(yīng)的內(nèi)含子區(qū)域, 本研究將內(nèi)含子區(qū)間缺失并轉(zhuǎn)化擬南芥驗(yàn)證。分別采用GUS染色和Western blot方法檢測轉(zhuǎn)基因擬南芥不同發(fā)育時(shí)期(4、7、10 和13 d)種子中報(bào)告基因GUS/GFP的含量。GUS染色結(jié)果顯示, 隨著內(nèi)含子片段的逐步缺失, 染色有不同程度的變化(圖7), 說明內(nèi)含子不同區(qū)域發(fā)揮著一定的功能。利用Quality One軟件將Western雜交斑點(diǎn)數(shù)字化后繪制曲線(圖6), 發(fā)現(xiàn)當(dāng)缺失+631~+1033 bp區(qū)域后, GFP蛋白相對(duì)含量大幅下降, 當(dāng)繼續(xù)缺失+526 ~ +631 bp時(shí), GFP相對(duì)蛋白含量幾乎降至零, 但下降幅度減小, 說明在+631 ~ +1033 bp區(qū)域存在正調(diào)控元件促進(jìn)基因的高效表達(dá), 在+526 ~+631 bp區(qū)域也存在正調(diào)控元件, 但功能較弱。隨著進(jìn)一步的缺失, BnI-3和BnI-4 GFP蛋白相對(duì)含量逐漸上升, 說明在缺失掉的+266 ~ +526 bp區(qū)間, 含有負(fù)調(diào)控元件抑制啟動(dòng)子的功能。因此, 推測內(nèi)含子的增強(qiáng)效應(yīng)主要取決于+631 ~ +1033 bp區(qū)域順式作用元件的功能發(fā)揮。

        圖5 轉(zhuǎn)基因擬南芥種子中BnFAD2-C5啟動(dòng)子的功能分析Fig.5 Functional analysis of BnFAD2-C5 promoter in transgenic Arabidopsis seed

        圖6 轉(zhuǎn)基因擬南芥種子中BnFAD2-C5內(nèi)含子功能分析Fig.6 Functional analysis of BnFAD2-C5 intron in transgenic Arabidopsis seed

        3 討論

        圖7 含有BnFAD2-C5內(nèi)含子片段的轉(zhuǎn)基因擬南芥種子GUS染色結(jié)果Fig.7 Histochemical staining of GUS in transgenic Arabidopsis seed with BnFAD2-C5 intron

        3.1 內(nèi)含子具有增強(qiáng)BnFAD2-C5表達(dá)水平的功能

        BnFAD2-C5基因的全長序列已克隆, 發(fā)現(xiàn)長度為1123 bp的內(nèi)含子位于5′UTR內(nèi)部。類似的序列特征在玉米[16]、大豆[17]、擬南芥[12]、芝麻[12]和油菜[13]中均有報(bào)道, 且發(fā)現(xiàn)這些內(nèi)含子通常具有增強(qiáng)效應(yīng)。本文也證實(shí)該內(nèi)含子具有增強(qiáng)BnFAD2-C5基因表達(dá)水平的功能。一般而言, 內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)由內(nèi)含子剪切模式[18]、內(nèi)含子的長度[19]以及內(nèi)含子的特殊元件決定, 但是Parra等[20]認(rèn)為內(nèi)含子剪切模式不足以對(duì)啟動(dòng)子功能產(chǎn)生增強(qiáng)效應(yīng), Carola等[21]證實(shí)內(nèi)含子的長度越長其增強(qiáng)效應(yīng)越強(qiáng)。在本研究中, 缺失掉大部分內(nèi)含子序列的BnI-4其GFP蛋白相對(duì)含量卻比BnI-3和BnI-4有所增加, 那么, 認(rèn)為內(nèi)含子的長度并不是導(dǎo)致該內(nèi)含子發(fā)揮增強(qiáng)效應(yīng)的原因,該內(nèi)含子的增強(qiáng)效應(yīng)極有可能是特殊的調(diào)控元件與啟動(dòng)子區(qū)域互作引起的。當(dāng)內(nèi)含子+631~ +1033 bp區(qū)域缺失后, GFP蛋白相對(duì)含量明顯下降, 而隨著進(jìn)一步缺失并沒有再次引起GFP蛋白相對(duì)含量的大幅下降(圖5-A), 說明內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)區(qū)域主要存在于+631 ~ +1033 bp區(qū)域, 而不是整個(gè)內(nèi)含子區(qū)間。Parra等[20]認(rèn)為, 內(nèi)含子的增強(qiáng)效應(yīng)元件主要存在于內(nèi)含子的5′端, 而不是內(nèi)含子的3′端, 在5′UTR和編碼區(qū)也會(huì)大量出現(xiàn)。如果內(nèi)含子含有大量 CGATT拷貝, 則會(huì)大幅增加基因的表達(dá)量。在油菜BnFAD2-C5內(nèi)含子的5′端+262 ~ +266 bp處存在一個(gè)CGATT,并且BnI-4 GFP蛋白相對(duì)含量高于BnI-1、BnI-2和BnI-3, 所以當(dāng)+266 ~ +631 bp區(qū)間的負(fù)調(diào)控元件被解除后, CGATT元件極有可能增強(qiáng)了基因的表達(dá)水平, 導(dǎo)致BnI-4中GFP蛋白相對(duì)含量增加。Kim等[12]發(fā)現(xiàn)芝麻 FAD2基因的內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)區(qū)域?yàn)?791 ~+1517 bp, 處于遠(yuǎn)離內(nèi)含子5′端的位置, 并推測內(nèi)含子中具有增強(qiáng)功能的元件與增強(qiáng)子的作用方式相近,并不受距離的影響, 可以在遠(yuǎn)距離發(fā)揮增強(qiáng)作用。本研究中BnFAD2-C5內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)的主效元件位于+631 ~ +1033 bp區(qū)域, 也遠(yuǎn)離內(nèi)含子 5′端, 推測該內(nèi)含子功能的發(fā)揮不受距離的影響, 發(fā)揮功能的元件可以遠(yuǎn)距離增強(qiáng)啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄水平。

        Rose[22]研究發(fā)現(xiàn), 內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)主要是富含U的序列導(dǎo)致, 內(nèi)含子的 5′和 3′剪切位點(diǎn)和分支點(diǎn)突變時(shí), 會(huì)影響內(nèi)含子的剪切, 但不一定會(huì)引起內(nèi)含子增強(qiáng)效應(yīng)的減弱。我們分析了+631 ~ +1033 bp區(qū)域, 其中存在 38.7%的 U序列, 同時(shí)還存在ABRE/MYB/MYC、E-box、GARE元件, 研究發(fā)現(xiàn)這些元件在油菜種子napA啟動(dòng)子和擬南芥中, 當(dāng)植物受到干旱刺激和病原菌危害時(shí)能夠增強(qiáng)相應(yīng)啟動(dòng)子的功能, 誘導(dǎo)基因的高表達(dá)[23-24]。

        3.2 BnFAD2-C5啟動(dòng)子具有誘導(dǎo)基因表達(dá)的功能

        從圖4-C可知, 含有BnP-1和BnP-4的轉(zhuǎn)基因擬南芥種子發(fā)育至7 d時(shí), 出現(xiàn)高表達(dá)現(xiàn)象, 具有典型誘導(dǎo)表達(dá)的特點(diǎn), BnP-2和BnP-3則呈現(xiàn)組成型表達(dá)的特點(diǎn), 在種子發(fā)育的各個(gè)時(shí)期蛋白含量變化微弱。因此我們認(rèn)為-1020 ~-319區(qū)域存在控制基因組成型表達(dá)的相關(guān)元件。在BnP-1的-1257 ~-1020 bp和BnP-4的-319 ~-1 bp中存在某些元件在種子發(fā)育至7 d時(shí)可以被激活, 誘導(dǎo)該基因的表達(dá), 通過PLACE和 PlantCARE網(wǎng)站預(yù)測可知, 在-1257~-1020 bp和-319~-1 bp分別含有 2 Dof, 3 GT-1consensus、BoxII、TCA motif、GAG和GATA、G-box、3GT-1consensus、4 Dof、GAG、GC-motif、CGTCA motif、TATA-box和CAAT-box。GT-1consensus在病原菌和NaCl的誘導(dǎo)下會(huì)促進(jìn)SCaM-4基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄[25], TCA motif是水楊酸應(yīng)答元件, 抑制iMyAP基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄[26]。Dof、BoxII、GAG是光誘導(dǎo)調(diào)控元件, 感受光刺激誘導(dǎo)基因的表達(dá), Dof蛋白結(jié)合Dof調(diào)控位點(diǎn)增強(qiáng)cyPPDK基因和PEPC基因的轉(zhuǎn)錄[27]。CGTCA motif是茉莉酸應(yīng)答元件,當(dāng)植物體內(nèi)茉莉酸含量上升時(shí), 誘導(dǎo)相關(guān)基因的表達(dá)[26,28]。GATA元件, 具有增強(qiáng)cab基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄水平的功能[29]。CAAT-box能提高轉(zhuǎn)錄起始頻率, 并且參與基因表達(dá)量的調(diào)控[30]。因此, 下一步工作可以針對(duì)-1257 ~-1020 bp和-319 ~-1 bp區(qū)域展開研究, 探索對(duì)BnFAD2-C5基因發(fā)揮誘導(dǎo)功能的主效區(qū)域及主效元件。

        4 結(jié)論

        克隆了 BnFAD2-C5啟動(dòng)子序列, 其-1257~-1020 bp和-319~-1 bp區(qū)域具有誘導(dǎo)基因表達(dá)的功能; BnFAD2-C5內(nèi)含子具有增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄水平的效應(yīng),這一功能主要由+631~ +1033 bp區(qū)域調(diào)控。

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        Functional Analysis of BnFAD2-C5 Promoter and Intron at Expression Level in Brassica napus

        LIU Rui-Yang**, LIU Fang**, ZHANG Zhen-Qian, and GUAN Chun-Yun*

        College of Agriculture, Hunan Agricultural University / National Oilseed Crops Improvement Center in Hunan, Changsha 410128, China

        High oleic rapeseed breeding and the formation mechanism of oleic acid have become a central issue after finding the important economic value of rapeseed oil with high oleic acid.The fatty acid dehydrogenase gene (FAD2) is a key enzyme gene to control oleic acid content, but the regulation of FAD2 gene is not well understood.According to the homology between rapeseed and oleracea, the BnFAD2-C5 promoter sequence of 1257 bp was cloned.Promoter and intron of BnFAD2-C5 gene were analyzed using β-glucuronidase (GUS) reporter and green fluorescent protein (GFP) reporter system to construct deleted vectors and transform Arabidopsis thaliana.Deletion analysis of BnFAD2-C5 promoter through GUS stainning revealed that-319 to-1 bp was the minimum promoter region.And deletion analysis of BnFAD2-C5 promoter and intron through GFP reporter system using western technique showed that-1257 to-1020 bp and-319 to-1 bp regions of BnFAD2-C5 promoter could induce expression of reporter genes effectively in transgenic Arabidopsis seed in the mid stage of seed development, while BnFAD2-C5 intron could confer the enhancement of promoter’s function and the intron-mediated enhancement region was mainly located in +631 to +1033 bp.

        Brassica napus; BnFAD2-C5 gene; Intron-mediated enhancement; Arabidopsis thalina

        10.3724/SP.J.1006.2016.01471

        本研究由湖南省科技創(chuàng)新項(xiàng)目(CX2013A012)和國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃項(xiàng)目(2015CB150200)資助。

        This study was supported by the Science and Technology Innovation Project of Hunan Province (CX2013A012) and the National Basic Research Program of China (2015CB150200).

        (Corresponding author): 官春云, E-mail: guancy2011@aliyun.com

        聯(lián)系方式: E-mail: ruiyang_liu2007@126.com**同等貢獻(xiàn)(Contributed equally to this work)

        Received(): 2016-02-16; Accepted(接受日期): 2016-05-09; Published online(網(wǎng)絡(luò)出版日期): 2016-06-06.

        URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20160606.0855.002.html

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