1989年2月9日，手冢治蟲因胃癌于日本東京都千代田區(qū)麹町半藏門醫(yī)院逝世，享年60歲。

他在去世前，依然堅(jiān)守在工作崗位上，留下了《火之鳥》等未完成的篇章。

在其晚年時(shí)，曾創(chuàng)作了《我與孫悟空》等作品，來講述他和中國之間的緣分，講述中國動畫對其幼年時(shí)期的影響。其一生中來訪過中國，并與其偶像——萬籟鳴有過會面。

手塚治蟲一生給日本社會留下了巨大的寶貴財(cái)富，作品深刻而內(nèi)涵豐富。從他開始，刷新了以往日本社會對于漫畫、動畫的認(rèn)識，并使動畫走入日本普通百姓的電視，走進(jìn)普通家庭。可以說，沒有他就沒有日本動畫的現(xiàn)在，也沒有日本引以為傲的世界獨(dú)一無二的二維電視動畫制作及播放模式。是他革命性地推進(jìn)了動畫大量制作的手段，開創(chuàng)了日本漫畫改編電視動畫的先河?？梢哉f，正是因?yàn)橛辛耸謮V治蟲，才有了如今的日本動畫，才有了日本“動畫王國”的美譽(yù)。