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        組蛋白化學(xué)修飾改變對(duì)c-Myb結(jié)合的影響及其在職業(yè)性苯中毒患者造血損傷中的作用*

        2016-06-06 06:51:21施益芬陳晶晶
        中國(guó)病理生理雜志 2016年5期

        施益芬, 陳晶晶, 俞 康

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院血液科, 浙江 溫州 325015)

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        組蛋白化學(xué)修飾改變對(duì)c-Myb結(jié)合的影響及其在職業(yè)性苯中毒患者造血損傷中的作用*

        施益芬,陳晶晶,俞康△

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院血液科, 浙江 溫州 325015)

        [摘要]目的: 研究職業(yè)性苯中毒造血損傷患者中與拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱα啟動(dòng)子調(diào)控因子c-Myb結(jié)合的組蛋白化學(xué)修飾改變, 證實(shí)組蛋白乙?;揎椝礁淖?cè)诼殬I(yè)性苯中毒造血損傷中發(fā)揮一定的作用。方法: 25例職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者為病例組,25例正常人為對(duì)照組,提取骨髓單個(gè)核細(xì)胞,用染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)探討與c-Myb結(jié)合的組蛋白乙?;图谆降母淖儯琑T-PCR法檢測(cè)c-Myb的mRNA表達(dá)水平,組蛋白去乙酰化酶(HDAC)試劑盒檢測(cè)HDAC活性的變化。結(jié)果: 與正常對(duì)照組相比,職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者c-Myb與乙酰化組蛋白H4、H3結(jié)合的水平下降(P<0.01), 而與甲基化組蛋白H3K4和H3K9結(jié)合的水平無(wú)明顯改變,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性。與正常對(duì)照組相比,職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者c-Myb的mRNA表達(dá)水平降低,HDAC活性明顯升高,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(P<0.05)。結(jié)論: 拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱα啟動(dòng)子調(diào)控因子c-Myb可能通過(guò)組蛋白乙?;揎椀母淖?cè)诼殬I(yè)性苯中毒造血損傷中發(fā)揮作用。

        [關(guān)鍵詞]苯; c-Myb; 組蛋白乙?;?組蛋白甲基化; 染色質(zhì)免疫沉淀; 組蛋白去乙?;?/p>

        苯是一種具有血液毒性和遺傳毒性的重要化工原料。急慢性苯中毒病例報(bào)道屢見(jiàn)不鮮。衛(wèi)生部2010年職業(yè)病防治工作和2011年重點(diǎn)工作情況通報(bào)中,苯中毒均位列慢性職業(yè)中毒前3位。對(duì)造血系統(tǒng)損害的表現(xiàn)是慢性苯中毒的主要特征,長(zhǎng)期過(guò)量接觸苯可以導(dǎo)致白細(xì)胞和血小板減少、再生障礙性貧血和白血病[1-2]。2012年,國(guó)際癌癥研究所重申苯為人類(lèi)致癌物,能導(dǎo)致急性白血病、骨髓增生異常綜合征、淋巴瘤等。

        苯所致造血毒性和白血病的分子機(jī)制尚未被闡明。拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoismerase,TOPO)的研究近年來(lái)受到關(guān)注[3-4]。本課題組的前期研究顯示,苯及其代謝物影響骨髓單個(gè)核細(xì)胞TOPOⅡα啟動(dòng)子組蛋白的化學(xué)修飾改變,導(dǎo)致TOPOⅡα表達(dá)及活性下降可能參與了苯所致的造血毒性[3, 5-6]。c-Myb是TOPOⅡα啟動(dòng)子的重要調(diào)控因子,能明顯增加TOPOⅡα的表達(dá)[7]。本研究探討職業(yè)性苯中毒造血損傷中c-Myb的改變及與組蛋白化學(xué)修飾變化的關(guān)系,通過(guò)檢測(cè)職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者組蛋白去乙酰化酶(histonedeacetylase,HDAC)活性的改變,證實(shí)c-Myb可能通過(guò)組蛋白乙?;揎椀母淖?cè)诼殬I(yè)性苯中毒造血損傷中發(fā)揮作用,為進(jìn)一步認(rèn)識(shí)苯中毒造血損傷的發(fā)病機(jī)制提供依據(jù)。

        材料和方法

        1對(duì)象

        實(shí)驗(yàn)組的骨髓標(biāo)本25份取自職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者,男性9例,女性16例,平均年齡32.5歲(20~56歲),平均觸苯時(shí)間≥6月(6月~5年)。工作環(huán)境中平均苯濃度為87mg/m3(50~1 000mg/m3),遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)美國(guó)政府工業(yè)衛(wèi)生專家協(xié)會(huì)規(guī)定的最高時(shí)間加權(quán)平均容許濃度(permissibleconcentration-timeweightedaverage,PC-TWA)及短時(shí)間接觸容許濃度(pemissibleconcentration-shorttermexposurelimit,PC-STEL)。對(duì)照組的骨髓標(biāo)本25份取自年齡、吸煙、飲酒習(xí)慣等匹配的健康志愿者,男性11例,女性14例;平均年齡33.8歲(19~58歲)。苯中毒再生障礙性貧血患者根據(jù)GBZ68-2002《職業(yè)性苯中毒診斷標(biāo)準(zhǔn)》診斷。本研究已通過(guò)溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院倫理委員會(huì)的認(rèn)證。所有骨髓捐獻(xiàn)者均簽署知情同意書(shū)。

        2主要試劑

        RPMI-1640培養(yǎng)基(Gibco);淋巴細(xì)胞分離液(天津TBD生物技術(shù)發(fā)展中心);染色質(zhì)免疫沉淀(chromatinimmunoprecipiation,ChIP) 分析試劑盒、抗乙?;M蛋白H3抗體、抗乙?;M蛋白H4抗體、抗二甲基組蛋白H3(K9)抗體和抗三甲基組蛋白H3(K4)抗體(Upstate);體積分?jǐn)?shù)為37%的甲醛(Sigma);蛋白酶抑制劑(Calbiochem);TRIzol和PlatinumRPCRSuperMix(Invitrogen);RT-PCR試劑盒、GeneRulerTM50bpDNALadder(MBIFermentas);核蛋白提取試劑盒(Thermo);HDAC活性測(cè)定試劑盒(Millipore);BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(碧云天生物技術(shù)研究所)。

        3主要方法

        3.1骨髓單核細(xì)胞懸液的制備取職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者及健康志愿獻(xiàn)髓員的骨髓5mL,肝素(5×104U/L)抗凝,骨髓標(biāo)本與RPMI-1640液1∶1混勻后,淋巴細(xì)胞分離液密度梯度離心法(2 000r/min離心10min)分離單個(gè)核細(xì)胞層,制備成單個(gè)核細(xì)胞懸液。臺(tái)盼蘭染色檢測(cè)活細(xì)胞率,要求拒染率達(dá)95%以上。骨髓單個(gè)核細(xì)胞懸浮培養(yǎng),調(diào)整細(xì)胞終濃度為1×109/L。

        3.2ChIP檢測(cè)ChIP檢測(cè)按ChIP分析試劑盒產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。分別在培養(yǎng)液中直接加入37 %的甲醛,使最終濃度為1 %,37 ℃固定10min, 以交聯(lián)組蛋白和DNA。加入含有蛋白酶抑制劑的SDS細(xì)胞裂解液200μL重懸細(xì)胞, 冰上孵育10min,用超聲將DNA打碎成250~1 000bp(此處提取的DNA片段命名為inputDNA)。用特異性抗體[抗乙?;M蛋白H3抗體、抗乙酰化組蛋白H4抗體、抗二甲基組蛋白H3(K9)抗體、抗三甲基組蛋白H3(K4)抗體]沉淀DNA-蛋白復(fù)合物, 用蛋白A瓊脂吸附復(fù)合物, 低鹽免疫復(fù)合體洗液、高鹽免疫復(fù)合體洗液、LiCl免疫復(fù)合體洗液、TE緩沖液洗去非特異性吸附后, 加入5moL/LNaCl65 ℃置4h以解除蛋白/DNA交聯(lián),沉淀的DNA片段-20 ℃保存?zhèn)溆?此DNA片段命名為ChIPedDNA)。ChIPedDNA通過(guò)PCR法對(duì)目標(biāo)基因(c-Myb)進(jìn)行分析。

        3.3c-MybDNA水平的檢測(cè)針對(duì)c-Myb的DNA序列設(shè)計(jì)引物(表1)。將各組得到的ChIPedDNA分別加入上述引物進(jìn)行PCR反應(yīng),反應(yīng)體系為:PCRSuperMix12μL,調(diào)控因子上游引物 0.5μL,調(diào)控因子下游引物 0.5μL,上述制得的模板DNA2μL。反應(yīng)條件為:94 ℃ 5min;94 ℃ 30s,62 ℃ 30s,72 ℃ 1min,35個(gè)循環(huán);72 ℃10min,4 ℃ 30min。反應(yīng)完成后用1.8%瓊脂糖凝膠電泳并照相,QuantityOne圖像分析系統(tǒng)分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。c-Myb水平變化=(IP苯中毒組/Input苯中毒組)/(IP對(duì)照組/Input對(duì)照組)。

        3.4c-Myb的mRNA水平檢測(cè)(1)RNA的提取及cDNA合成:采用TRIzoL法提取總RNA,紫外分光光度計(jì)測(cè)RNA的純度及濃度(A260/A280居于1.8~2.0之間認(rèn)為合格)。采用隨機(jī)引物法合成cDNA。(2)針對(duì)撲異構(gòu)酶Ⅱα啟動(dòng)子調(diào)控因子c-Myb的mRNA序列設(shè)計(jì)引物,引物與GenBank基因序列核對(duì)無(wú)誤;采用β2-微球蛋白(β2-microglobulin,β2-MG)作為內(nèi)參照(表1)。(3)PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為:PCRSuperMix12μL,上游引物 0.5μL,下游引物 0.5μL,cDNA2μL。反應(yīng)條件為:95 ℃ 5min;95 ℃ 30s,53 ℃(c-Myb)或52 ℃(β2-MG) 30s,72 ℃ 30s,35個(gè)循環(huán);72 ℃10min。經(jīng)1.5%的瓊脂糖凝膠電泳后,QuantityOne圖像分析系統(tǒng)分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。以目標(biāo)基因與β2-MG擴(kuò)增產(chǎn)物吸光度值的比值計(jì)算表達(dá)水平。

        表1 引物序列

        3.5核蛋白的提取分別收集實(shí)驗(yàn)組及對(duì)照組的骨髓單個(gè)核細(xì)胞,等滲PBS液洗2遍;按照Thermo核蛋白提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行抽提,骨髓單個(gè)核細(xì)胞離心沉淀后,依次加入CERⅠ液、CERⅡ液劇烈振蕩、冰浴后離心,棄上清,加NER液劇烈振蕩、冰浴后離心,上清液系胞核蛋白。提取的核蛋白用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定濃度后-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        3.6HDAC活性測(cè)定按照HDAC活性測(cè)定試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,使用試劑盒所配套的96孔板,各孔加入 2×HDAC assay buffer 10 μL,各待測(cè)樣品、陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照各20 μL,吹打混勻后加入4 mmoL/L HDAC substrate 10 μL,37 ℃孵育60~70 min;稀釋activator solution 液20 μL,37 ℃放置10~20 min。在酶標(biāo)儀405 nm波長(zhǎng)處讀取吸光度值(A值)。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,設(shè)復(fù)孔3個(gè),取平均值為最終結(jié)果。HDAC的活性=(實(shí)驗(yàn)組A值-空白對(duì)照A值)/蛋白含量(μg)。

        4統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        用SPSS 16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析。數(shù)據(jù)均采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,t檢驗(yàn)來(lái)確定兩組之間的差異。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié)果

        1苯中毒對(duì)c-Myb結(jié)合的組蛋白化學(xué)修飾改變的影響

        1.1與乙?;M蛋白H4結(jié)合的c-Myb水平臨床苯中毒病例組c-Myb與乙?;M蛋白H4結(jié)合的水平較正常對(duì)照組明顯下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(P<0.01),見(jiàn)圖1、3。

        1.2與乙?;M蛋白H3結(jié)合的c-Myb水平臨床苯中毒病例組c-Myb與乙?;M蛋白H3結(jié)合的水平較正常對(duì)照組明顯下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(P<0.01),見(jiàn)圖1、3。

        1.3與甲基化組蛋白H3K4結(jié)合的c-Myb水平臨床苯中毒病例組c-Myb與甲基化組蛋白H3K4結(jié)合的水平較正常對(duì)照組無(wú)明顯改變,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性,見(jiàn)圖2、3。

        1.4與甲基化組蛋白H3K9結(jié)合的c-Myb水平臨床苯中毒病例組c-Myb與甲基化組蛋白H3K9結(jié)合的水平較正常對(duì)照組無(wú)明顯改變,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性,見(jiàn)圖2、3。

        2苯中毒對(duì)c-Myb mRNA表達(dá)水平的影響

        臨床苯中毒病例組c-Myb的mRNA表達(dá)水平較對(duì)照組降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(P<0.05),見(jiàn)圖4。

        Figure 1.The levels of c-Myb binding to acetylated histone detected by ChIP analysis. M: marker; 1: input control; 2: IP control; 3: input benzene; 4: IP benzene.

        圖1乙酰化組蛋白結(jié)合的c-Myb

        Figure 2.The levels of c-Myb binding to methylated histone detected by ChIP analysis. M: marker; 1: input control; 2: IP control; 3: input benzene; 4: IP benzene.

        圖2甲基化組蛋白結(jié)合的c-Myb

        Figure 3.Changes of c-Myb binding levels to histones modified by acetylation and methylation. Mean±SD. n=5.**P<0.01 vs control.

        圖3c-Myb 結(jié)合的組蛋白乙?;图谆揎椝降淖兓?/p>

        Figure 4.The mRNA expression of c-Myb detected by RT-PCR. Mean±SD. n=5.*P<0.05 vs control.

        圖4RT-PCR檢測(cè)c-Myb 的mRNA水平

        3苯中毒對(duì)HDAC活性的影響

        臨床苯中毒病例組HDAC活性較對(duì)照組升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(P<0.05),見(jiàn)圖5。

        Figure 5.HDAC activity of bone marrow mononuclear cells. Mean±SD.n=10.*P<0.05 vs control.

        圖5骨髓單個(gè)核細(xì)胞HDAC活性

        討論

        近年來(lái),苯所致造血毒性已得到廣泛的重視,但其毒性機(jī)制仍遠(yuǎn)未闡明,脂質(zhì)過(guò)氧化、細(xì)胞凋亡、DNA損傷、細(xì)胞微環(huán)境受損、免疫異常均是其可能機(jī)制之一[8-10]。自1996年Frantz等首次提出苯的活性代謝產(chǎn)物抑制TOPOⅡ活性開(kāi)始,TOPO在苯所致造血毒性中的作用日漸明確[3-4]。

        表觀基因機(jī)制在腫瘤的發(fā)生機(jī)制中有著與基因突變機(jī)制同等重要的作用。組蛋白的共價(jià)修飾是表觀基因機(jī)制的重要內(nèi)容, 參與調(diào)控多種生物學(xué)事件,主要包括組蛋白乙?;⒔M蛋白甲基化、DNA甲基化和染色質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)中其它成分的修飾。組蛋白乙酰化、甲基化可直接影響一系列細(xì)胞核內(nèi)生物過(guò)程,包括基因轉(zhuǎn)錄、DNA修復(fù)、DNA復(fù)制和染色體組裝,調(diào)控基因的表達(dá)[11]。組蛋白乙?;c基因轉(zhuǎn)錄激活有關(guān)[12],去乙?;R?jiàn)基因轉(zhuǎn)錄沉默[13],而組蛋白甲基化的功能則因氨基酸殘基類(lèi)別和它們?cè)诮M蛋白尾端的位置不同而不盡相同[12],組蛋白H3K4甲基化與基因轉(zhuǎn)錄活化相關(guān),而組蛋白H3K9甲基化常見(jiàn)基因轉(zhuǎn)錄沉默[14]。

        ChIP技術(shù)是一種在體內(nèi)研究DNA和蛋白質(zhì)相互作用的方法,能夠較真實(shí)地反映體內(nèi)染色質(zhì)與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的結(jié)合情況,被大量應(yīng)用于其它轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子如CRE結(jié)合蛋白[15]及c-Myc等對(duì)其靶基因表達(dá)的調(diào)控分析。我們的前期研究發(fā)現(xiàn)苯所致造血毒性與TOPOⅡα的表達(dá)(含量、活性)下降相關(guān),而TOPOⅡα啟動(dòng)子組蛋白乙?;?、甲基化化學(xué)修飾改變是其表達(dá)下降的機(jī)制之一[3,5-6]。在此基礎(chǔ)上,本課題組借助ChIP技術(shù)進(jìn)一步研究TOPOⅡα啟動(dòng)子調(diào)控因子組蛋白化學(xué)修飾改變?cè)诼殬I(yè)性苯中毒造血損傷機(jī)制中發(fā)揮的作用[16]。

        c-Myb是TOPOⅡα啟動(dòng)子重要的調(diào)控因子,在TOPOⅡα啟動(dòng)子近端的5’區(qū)存在c-Myb的結(jié)合位點(diǎn)[17],c-Myb通過(guò)與c-Myb結(jié)合位點(diǎn)(-16至-11位點(diǎn))結(jié)合,激活TOPOⅡα的表達(dá)[7]。我們針對(duì)c-Myb設(shè)計(jì)了相應(yīng)的適合ChIP后產(chǎn)物的引物,來(lái)觀察其水平的改變。研究發(fā)現(xiàn),職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者c-Myb結(jié)合的組蛋白乙?;揎椝浇档?,c-Myb的mRNA表達(dá)水平下降,提示c-Myb結(jié)合的組蛋白乙?;降母淖兛赡軈⑴c了TOPOⅡα表達(dá)的降低。

        組蛋白乙?;绞且粋€(gè)動(dòng)態(tài)平衡狀態(tài),由HDAC和組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(histoneacetyltransferases,HAT)共同調(diào)控。Sonnemann等[18]通過(guò)臨床收集各種血液腫瘤標(biāo)本,進(jìn)行HDAC活性測(cè)定,研究發(fā)現(xiàn)體內(nèi)低乙?;脚cHDAC活性增高有關(guān),而與HAT活性降低關(guān)系不大。因此,本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了HDAC活性檢測(cè)。研究結(jié)果顯示職業(yè)性苯中毒再生障礙性貧血患者HADC活性較對(duì)照組明顯升高,提示苯及其代謝產(chǎn)物不僅影響染色質(zhì)的表觀遺傳學(xué)及后續(xù)的基因表達(dá),也切實(shí)影響了表觀遺傳學(xué)調(diào)控酶的活性,與組蛋白化學(xué)修飾改變平行,為c-Myb結(jié)合的組蛋白乙?;礁淖儏⑴cTOPOⅡα表達(dá)減低提供了一定的依據(jù),極大地支持并論證了本課題組提出的組蛋白化學(xué)修飾水平改變?cè)诼殬I(yè)性苯中毒造血損傷中發(fā)揮作用的假說(shuō)。

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        (責(zé)任編輯: 林白霜, 羅森)

        Effects of c-Myb binding levels to histones modified by acetylation and methylation on hematopoietic damnification in occupational benzene poisoning patients

        SHI Yi-fen, CHEN Jing-jing, YU Kang

        (Department of Hematology, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou 325015, China. E-mail: yukang62@126.com)

        [ABSTRACT]AIM: To investigate the role of histone modification in the changes of topoisomerase Ⅱα promoter regulatory factor c-Myb binding to histone in the occupational benzene poisoning patients with hematopoietic damnification.METHODS: The bone marrow samples were collected from 25 aplastic anemia patients caused by occupational benzene poisoning and 25 healthy controls. The binding levels of c-Myb to the histone with acetylation or methylation were detected by the technique of chromatin immunoprecipitation (ChIP). The mRNA expression of c-Myb was detected by RT-PCR. The activity of histone deacetylase (HDAC) was measured by the colorimetric HDAC assay kit.RESULTS: Compared with the controls, the binding levels of c-Myb to the acetylated histone H4 and acetylated histone H3 in the occupational benzene poisoning patients decreased (P<0.01), while those to the methylated histone H3K4 and methylated histone H3K9 didn’t obviously change. The mRNA expression of c-Myb in the occupational benzene poisoning patients was significantly down-regulated compared with the controls (P<0.05).The HDAC activity of the bone marrow mononuclear cells in the occupational benzene poisoning patients increased obviously (P<0.05).CONCLUSION: Topoisomerase Ⅱα promoter regulatory factor c-Myb may play an important role in the hematopoietic toxicities of benzene through histone acetylation modification.

        [KEY WORDS]Benzene; c-Myb; Histone acetylation; Histone methylation; Chromatin immunoprecipitation; Histone deacetylase

        [文章編號(hào)]1000- 4718(2016)05- 0907- 05

        [收稿日期]2016- 01- 18[修回日期] 2016- 03- 02

        *[基金項(xiàng)目]國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No. 81172613;No. 81502793);溫州市科委基金資助項(xiàng)目(No. Y20120004; No. Y20150034)

        通訊作者△Tel: 0577-55579489; E-mail: yukang62@126.com

        [中圖分類(lèi)號(hào)]R135.1; R363.2

        [文獻(xiàn)標(biāo)志碼]A

        doi:10.3969/j.issn.1000- 4718.2016.05.023

        雜志網(wǎng)址: http://www.cjpp.net

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